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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5261 | 2025-10-06 |
Novel Aortic Dissection Model Links Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration
2025-Jun-20, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326230
PMID:40365676
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术构建了携带FBN1基因新型错义突变的自发性主动脉夹层小鼠模型,揭示了内皮功能障碍与免疫细胞浸润在疾病发生中的关键作用 | 首次将非综合征性家族性主动脉夹层患者中发现的FBN1 p.G234D突变引入小鼠模型,并系统阐明了该突变导致TGFβ信号下调及免疫细胞浸润的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类患者中验证相关发现;样本量相对有限 | 探究主动脉夹层的分子触发机制和病理进展过程 | 携带Fbn1G234D/G234D突变的基因编辑小鼠 | 分子病理学 | 主动脉夹层 | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 电子显微镜, 同步辐射成像, Western blot | 基因编辑小鼠模型 | 基因测序数据, 组织图像, 蛋白质印迹数据 | Fbn1G234D/G234D突变小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5262 | 2025-10-06 |
SM22α-Lineage Perivascular Stromal Cells Contribute to Abdominal Aortic Aneurysm
2025-Jun-20, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325750
PMID:40371535
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研究论文 | 本研究揭示了SM22α谱系血管周围基质细胞通过PGC-1α/YAP信号通路调控腹主动脉瘤发展的机制 | 首次发现SM22α谱系血管周围基质细胞在腹主动脉瘤中的作用机制,并证实PGC-1α通过调控YAP信号通路影响细胞分化平衡 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究血管周围脂肪组织在腹主动脉瘤发病机制中的作用 | 年轻和老年小鼠的血管周围基质细胞、人类动脉瘤样本 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,功能获得和缺失实验,转录组分析 | NA | 基因表达数据,影像数据 | 年轻(2-3月)和老年(18-20月)小鼠,人类动脉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序,放射组学分析 | NA | NA |
5263 | 2025-10-06 |
Multidimensional bioinformatics analysis of chondrosarcoma subtypes and TGF-β signaling networks using big data approaches
2025-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02931-3
PMID:40526169
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和生物信息学方法分析软骨肉瘤的细胞亚型及TGF-β信号网络 | 首次在软骨肉瘤中应用单细胞RNA测序技术揭示细胞异质性,重建细胞间相互作用网络,并利用机器学习模型进行基因表达模式分类 | 未提及样本数量限制或技术验证的局限性 | 解析软骨肉瘤的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 临床和实验软骨肉瘤样本 | 生物信息学 | 软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 机器学习模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5264 | 2025-10-06 |
Exploring genetic causal relationships between spinal cord injury and glioma: a Mendelian randomization study
2025-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02919-z
PMID:40526188
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研究论文 | 使用孟德尔随机化方法探索脊髓损伤与胶质瘤之间的遗传因果关系 | 首次采用孟德尔随机化方法系统研究脊髓损伤与胶质瘤之间的遗传因果关系,并结合多种数据分析方法进行验证 | 研究结果显示无显著因果关系,存在中度异质性,样本量有限 | 探究脊髓损伤与胶质瘤之间的潜在遗传因果关系 | 脊髓损伤和胶质瘤患者 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 孟德尔随机化,RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习 | MR Egger回归,逆方差加权,加权模式 | 遗传数据,基因表达数据 | FinnGen R11发布数据集,TCGA和GEO数据库数据,GSE131928单细胞RNA测序数据 | NA | RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
5265 | 2025-10-06 |
Roles of ACSL4/GPX4 and FSP1 in oxalate-induced acute kidney injury
2025-Jun-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02557-y
PMID:40527896
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了草酸盐诱导急性肾损伤中铁死亡的关键调控机制 | 首次在草酸盐诱导的急性肾损伤模型中证实ACSL4/GPX4和FSP1在肾小管细胞铁死亡中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究铁死亡关键基因在草酸盐诱导急性肾损伤中的调控作用和机制 | 小鼠急性肾损伤模型和鼠肾小管上皮细胞系(MTECs) | 单细胞测序分析 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5266 | 2025-10-06 |
Pathway-based cancer transcriptome deciphers a high-resolution intrinsic heterogeneity within bladder cancer classification
2025-Jun-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06682-1
PMID:40528211
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研究论文 | 本研究通过基于通路的癌症转录组分析,揭示了膀胱癌内在异质性并建立了新的分子分型系统 | 首次利用单细胞转录组数据识别纯肿瘤细胞,建立了不受肿瘤微环境干扰的膀胱癌内在分子分型系统 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证分型的临床适用性 | 探索膀胱癌内在基因表达谱对患者分类和预后的贡献程度及机制 | 膀胱癌患者样本 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法 | 多种机器学习算法 | 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据 | GSE135337和TCGA膀胱癌数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
5267 | 2025-10-06 |
Decoding hippocampal subfield and glial responses in ischemia using single-cell transcriptomics
2025-Jun-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06738-2
PMID:40528218
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术解析缺血条件下海马不同亚区和胶质细胞的分子响应特征 | 首次在单细胞水平揭示海马CA1和CA3-DG区域在缺血后胶质细胞和血管细胞的异质性响应,发现新的少突胶质细胞亚型及区域特异性周细胞变化 | 研究仅使用大鼠模型,样本量有限,且未验证功能机制 | 探究全脑缺血条件下海马不同亚区的细胞分子变化机制 | Sprague-Dawley大鼠海马CA1和CA3-DG区域细胞 | 单细胞组学 | 脑缺血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四血管阻塞模型大鼠与正常对照大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5268 | 2025-10-06 |
Mechanical tension-induced Dalrd3 elevation enhances osteogenic differentiation of bone suture stem cells by upregulating Id3 translation
2025-Jun-17, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04380-9
PMID:40528244
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研究论文 | 本研究揭示了机械张力通过上调Dalrd3表达增强骨缝干细胞成骨分化的分子机制 | 首次发现机械张力通过Dalrd3调控tRNA m3C修饰进而促进Id3翻译激活骨缝干细胞成骨分化 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究机械张力调控颅颌面骨缝重塑的分子机制 | 小鼠骨缝干细胞 | 单细胞生物学 | 颅面畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠快速上颌扩张模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5269 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptome analyses reveal MAZ(+) NPC-like clusters as key role contributing to glioma recurrence and drug resistance
2025-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06706-w
PMID:40524155
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示MAZ(+) NPC样细胞簇在胶质瘤复发和耐药中的关键作用 | 首次在单细胞和空间转录组水平系统揭示MAZ(+) NPC样细胞簇是胶质瘤替莫唑胺耐药的关键细胞群体,并阐明MAZ通过上调FOXM1增强干细胞特性和DNA修复能力的分子机制 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证;机制研究主要在细胞水平,缺乏动物模型验证 | 探究胶质瘤替莫唑胺耐药的细胞异质性机制和潜在治疗策略 | 胶质瘤患者肿瘤样本(替莫唑胺治疗前后) | 数字病理 | 胶质瘤 | 单细胞测序, 空间转录组, 批量RNA测序 | 细胞聚类分析, 转录因子活性分析, 药物敏感性分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | 替莫唑胺治疗前后的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
5270 | 2025-10-06 |
The high efficacy of claudin18.2-targeted CAR-T cell therapy in advanced pancreatic cancer with an antibody-dependent safety strategy
2025-Jun-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.01.012
PMID:39797399
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研究论文 | 本研究报道了使用表达tEGFR的claudin18.2靶向CAR-T细胞治疗晚期胰腺癌患者的疗效和安全性 | 首次报道claudin18.2靶向CAR-T细胞在晚期胰腺癌中的临床应用,并采用抗体依赖性安全开关策略控制脱靶毒性 | 样本量较小(仅3例患者),需要更大规模研究验证 | 评估claudin18.2靶向CAR-T细胞治疗晚期胰腺癌的疗效和安全性 | 3例晚期胰腺癌患者 | 肿瘤免疫治疗 | 胰腺癌 | CAR-T细胞治疗,单细胞转录组测序,T细胞受体测序 | NA | 临床数据,单细胞测序数据 | 3例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5271 | 2025-10-06 |
The release of NETs during SFTSV infection downregulates the specific inflammatory factors that lead to liver and spleen damage
2025-Jun-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf053
PMID:40275780
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研究论文 | 本研究探讨了严重发热伴血小板减少综合征病毒感染期间中性粒细胞胞外诱捕网释放对特定炎症因子的下调作用及其导致的肝脾损伤机制 | 首次发现SFTSV感染可触发NETosis过程,并通过单细胞测序和转录组分析揭示了NETs对炎症因子的下调作用及其与器官损伤的关联 | 研究提出的机制仍处于假设阶段,需要进一步实验验证 | 探究SFTSV感染过程中NETs释放对炎症因子表达和器官损伤的影响机制 | SFTSV感染患者样本、细胞模型和动物模型 | 传染病学 | 病毒感染性疾病 | 单细胞测序, 转录组测序 | 细胞模型, 动物模型 | 基因表达数据 | SFTSV患者单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
5272 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Reveals Fibroblast-Derived Migrasomes as CXCL12 Carriers Promoting Skin Wound Repair
2025-Jun, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70112
PMID:40527746
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现成纤维细胞来源的迁移体可作为CXCL12载体促进皮肤伤口修复 | 首次报道迁移体在组织修复中的作用,发现成纤维细胞来源的迁移体通过传递CXCL12促进伤口愈合 | NA | 探究迁移体在皮肤伤口修复过程中的功能机制 | 人类和大鼠皮肤、口腔黏膜、成纤维细胞、HaCaT细胞 | 单细胞分析 | 皮肤伤口 | 超分辨率共聚焦显微镜、聚焦离子束扫描电子显微镜、多重免疫荧光染色、活细胞成像、单细胞测序 | NA | 图像、测序数据 | 人类和大鼠皮肤及口腔黏膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5273 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics from pancreas and local draining lymph node tissue reveals a lymphotoxin-β signature in human type 1 diabetes
2025-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654940
PMID:40475580
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析1型糖尿病患者胰腺和引流淋巴结组织,揭示了淋巴毒素-β特征 | 首次在1型糖尿病自然史中整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,揭示了胰腺和引流淋巴结中不同的炎症特征 | 样本量相对有限,未详细探讨所有观察到的转录变化的生物学机制 | 探索1型糖尿病发病机制中胰腺和引流淋巴结的炎症反应特征 | 1型糖尿病患者、非糖尿病患者和高易感性非糖尿病自身抗体阳性个体的胰腺和胰腺引流淋巴结组织 | 空间转录组学 | 1型糖尿病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 包括非糖尿病患者和高易感性非糖尿病自身抗体阳性个体的胰腺和引流淋巴结样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
5274 | 2025-10-06 |
Identification of core genes in acute kidney injury: evidence from multi-omics human transcriptomic data and in vivo models
2025-May-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2024-677
PMID:40529024
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研究论文 | 本研究通过整合多组学人类转录组数据和体内实验验证,识别了急性肾损伤的核心基因 | 首次将人类多组学数据与小鼠模型验证相结合,识别出SUGCT作为与肾小管线粒体代谢和免疫平衡相关的新型AKI核心基因 | 样本量相对有限(67例AKI患者和20例对照),需要在更大队列中进一步验证 | 识别急性肾损伤的核心基因并探索其机制 | 急性肾损伤患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 转录组测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, RT-qPCR, Western blot, 免疫组织化学 | 列线图模型, WGCNA | 转录组数据, 基因表达数据 | 67例AKI患者和20例对照的人类样本,以及小鼠模型 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
5275 | 2025-10-06 |
Development of a prognostic model for overall survival in neuroblastoma based on Schwann cell-specific genes, clinical predictors, and MYCN amplification
2025-May-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-2048
PMID:40530123
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研究论文 | 开发基于雪旺细胞特异性基因、临床预测因子和MYCN扩增的神经母细胞瘤总体生存预后模型 | 首次将肿瘤微环境中雪旺细胞特异性基因与临床因素和分子标志物整合构建神经母细胞瘤预后模型 | 样本量相对有限,训练集和测试集患者年龄分布存在差异 | 提高神经母细胞瘤总体生存预测准确性 | 神经母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,Cox回归分析 | 预后预测模型 | 基因表达数据,临床数据 | 训练集238例,测试集106例,单细胞数据16例患者(160,910个细胞) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5276 | 2025-10-06 |
Tolerance and heteroresistance to echinocandins in Candida auris: conceptual issues, clinical implications, and outstanding questions
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00161-25
PMID:40237528
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综述 | 探讨耳念珠菌对棘白菌素的耐受性和异质性耐药现象及其临床意义 | 首次系统阐述耳念珠菌对棘白菌素的耐受性与异质性耐药概念差异及其临床关联 | 临床意义尚不明确,缺乏与治疗失败相关的数据支持 | 阐明耳念珠菌对棘白菌素的适应性耐药机制及其临床影响 | 耳念珠菌及其对棘白菌素的耐药表型 | 微生物耐药性研究 | 真菌感染 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5277 | 2025-10-06 |
3D organoids containing endothelial and neural cells generation by serial inductions of differentiation on human iPSC-derived embryoid bodies
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.20.653559
PMID:40475416
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研究论文 | 通过在人iPSC衍生的胚状体上连续诱导分化,生成包含内皮细胞和神经细胞的3D类器官 | 开发了同时包含神经细胞和内皮细胞的3D脑类器官模型,模拟体内神经和内皮细胞发育过程 | 未明确说明类器官的长期稳定性和功能成熟度 | 研究大脑发育和神经感染性疾病中内皮细胞与神经细胞的相互作用 | 人诱导多能干细胞(iPSC)衍生的3D类器官 | 发育生物学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), RNA测序(RNA-Seq), 免疫染色, siRNA抑制 | 3D类器官模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
5278 | 2025-10-06 |
Efficient profiling of total RNA in single cells with STORM-seq
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.03.14.484332
PMID:40475517
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研究论文 | 开发了一种名为STORM-seq的单细胞总RNA测序技术,能够高效分析单细胞中的非编码转录本和全长RNA | 提出了首个使用随机六聚体引物和核糖体RNA去除的单细胞总RNA测序方案,无需专业液体处理设备即可构建迄今为止复杂度最高的单细胞RNA测序文库 | 未明确说明技术验证的样本规模和适用范围 | 开发更准确、易用的单细胞总RNA测序技术以解决现有方法的局限性 | 单细胞中的总RNA,包括非编码转录本、转座子元件和增强子RNA | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞总RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | STORM-seq | 基于随机六聚体引物的核糖体RNA去除单细胞总RNA测序方案 |
5279 | 2025-10-06 |
Pseudoassembly of k-mers
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.11.653354
PMID:40463286
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研究论文 | 提出一种基于着色de Bruijn图的基因组序列变异识别方法 | 开发了名为klue的伪组装方法,能够将k-mer组装成与变异感知伪比对扩展兼容的序列 | NA | 识别基因组序列中的变异 | 小鼠黑色素瘤模型的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 着色de Bruijn图 | 基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5280 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome atlas of spontaneous dry age-related macular degeneration in macaques
2025-May, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.02.028
PMID:40528953
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研究论文 | 构建了老年非人灵长类自发性干性年龄相关性黄斑变性的单细胞视网膜转录图谱 | 首次在非人灵长类模型中建立SD-AMD的单细胞转录图谱,揭示了铁死亡在疾病发病机制中的新作用 | 研究基于非人灵长类模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 阐明自发性干性年龄相关性黄斑变性的发病机制 | 老年非人灵长类(猕猴)的视网膜组织 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年猕猴视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |