单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
5261 2025-01-05
Aging-induced immune microenvironment remodeling fosters melanoma in male mice via γδ17-Neutrophil-CD8 axis
2024-Dec-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序揭示了雄性小鼠中,衰老如何通过γδ17-中性粒细胞-CD8轴促进肿瘤转移 揭示了衰老通过γδ17-中性粒细胞-CD8轴促进肿瘤转移的新机制,并提出了潜在的治疗策略 研究仅限于雄性小鼠,未涉及雌性小鼠或人类样本 研究衰老免疫系统如何促进肿瘤转移 雄性小鼠 免疫学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 雄性小鼠
5262 2025-01-05
Tppp3 is a novel molecule for retinal ganglion cell identification and optic nerve regeneration
2024-Dec-29, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本文研究了Tppp3在视网膜神经节细胞(RGCs)神经保护和轴突再生中的作用,使用啮齿动物的视神经挤压(ONC)模型 首次揭示了Tppp3在哺乳动物轴突再生中的作用,并开发了一种新的治疗策略用于RGC神经保护和轴突再生 研究仅限于啮齿动物模型,尚未在人类中进行验证 识别促进轴突再生的分子调节剂,减少中枢神经系统损伤的长期影响 视网膜神经节细胞(RGCs) 再生医学 中枢神经系统损伤 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA RNA测序数据 小鼠、猕猴和人类的RGCs
5263 2025-01-05
Microdissection and Single-Cell Suspension of Neocortical Layers From Ferret Brain for Single-Cell Assays
2024-Dec-20, Bio-protocol IF:1.0Q3
研究论文 本文描述了一种从活体脑切片中微解剖发育中的大脑皮层各层,并通过酶解和机械解离生成单细胞悬液的方法,适用于高通量单细胞分析 该方法提高了大脑皮层遗传分析的分辨率,并促进了比小鼠更能模拟人类皮层发育的实验室动物模型(如雪貂)的研究 NA 研究大脑皮层发育过程中的遗传复杂性 雪貂大脑的发育中的大脑皮层 生物医学 NA scRNA-seq, scATAC-seq, TrackerSeq NA 单细胞数据 胚胎期和早期出生后的雪貂大脑皮层
5264 2025-01-05
Decoding aging in the heart via single cell dual omics of non-cardiomyocytes
2024-Dec-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过单细胞双组学技术(scRNA-seq和scATAC-seq)研究了小鼠心脏非心肌细胞在不同年龄阶段的衰老过程 首次在单细胞水平上揭示了心脏非心肌细胞在衰老过程中的异质性和动态变化,并识别了与衰老相关的基因表达、转录因子活性和基序变异 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本 解析心脏衰老的细胞和分子机制,为治疗衰老相关心脏疾病提供潜在治疗途径 小鼠心脏非心肌细胞(非CMs) 单细胞组学 心血管疾病 scRNA-seq, scATAC-seq NA 单细胞RNA测序数据, 单细胞ATAC测序数据 年轻、中年和老年小鼠的心脏非心肌细胞
5265 2025-01-05
S100A8 promotes tumor progression by inducing phenotypic polarization of microglia through the TLR4/IL-10 signaling pathway in glioma
2024-Dec, Journal of the National Cancer Center IF:7.6Q1
研究论文 本研究探讨了S100A8在胶质瘤进展中的表达模式及其功能作用,揭示了其通过TLR4/IL-10信号通路诱导小胶质细胞表型极化促进肿瘤进展的机制 首次揭示了S100A8通过TLR4/IL-10信号通路诱导小胶质细胞M2极化,从而促进胶质瘤进展的新机制 研究主要基于体外实验和动物模型,临床样本量相对有限,需要进一步的大规模临床研究验证 全面评估S100A8在胶质瘤进展中的表达模式及功能作用 胶质瘤组织及细胞系 肿瘤生物学 胶质瘤 免疫组化(IHC)、Transwell实验、伤口愈合实验、CCK8实验、单细胞测序、共免疫沉淀(Co-IP) NA 组织样本、细胞系、公共数据库数据 98例胶质瘤患者组织样本
5266 2025-01-05
Deciphering the Role of SLFN12: A Novel Biomarker for Predicting Immunotherapy Outcomes in Glioma Patients Through Artificial Intelligence
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过人工智能方法识别了SLFN12作为预测胶质瘤患者抗PD-1免疫治疗效果的生物标志物 首次将SLFN12基因与胶质瘤患者的免疫治疗效果联系起来,并通过单细胞RNA测序和大规模转录组数据分析验证其预测价值 研究结果需要进一步在更大规模的患者群体中进行验证,以确认SLFN12作为生物标志物的普适性 探索和验证能够预测胶质瘤患者免疫治疗效果的生物标志物 胶质瘤患者 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序, 转录组数据分析 人工智能方法 RNA测序数据, 转录组数据 超过3000名患者的数据
5267 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文研究了阿尔茨海默病(AD)的发病机制,特别是血管功能障碍在AD中的作用 使用新型敲入小鼠模型(EOAD和LOAD)结合空间转录组学技术(Stereo-seq)研究AD的血管功能障碍 研究局限于小鼠模型,可能无法完全反映人类AD的复杂性 研究AD的血管功能障碍及其在AD发病机制中的作用 早发性AD(EOAD)和晚发性AD(LOAD)小鼠模型 数字病理学 老年病 空间转录组学(Stereo-seq) 敲入小鼠模型 基因表达数据 EOAD小鼠(3、6、9个月)和LOAD小鼠(4、8、12个月),以及年龄匹配的C57BL/6J小鼠作为对照
5268 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过整合东亚和欧洲的基因组数据,进行了一项关于阿尔茨海默病的meta-GWAS研究,并利用单细胞转录组数据识别了受变异影响的差异表达基因 本研究首次在包括更多东亚人群的meta-GWAS中识别出与SORL1相关的显著SNPs,这些关联可能由于欧洲人群的低次要等位基因频率而在之前的研究中未被发现 研究样本主要来自韩国和欧洲,可能限制了结果的普遍性 探索阿尔茨海默病的遗传风险因素,特别是与β-淀粉样蛋白(Aβ)沉积相关的基因变异 阿尔茨海默病患者及健康对照 基因组学 阿尔茨海默病 GWAS, 单细胞转录组分析 NA 基因组数据, 单细胞转录组数据 发现数据集包括3,387名韩国参与者,复制数据集包括606名独立韩国参与者,以及来自13个队列的多民族淀粉样蛋白PET GWAS的汇总统计数据
5269 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过体外大鼠神经共培养模型,研究了细胞相互作用变化如何改变神经细胞类型对神经退行性相关因子的转录反应 使用单细胞RNA-seq技术,结合多条件实验设计,揭示了神经细胞类型组成变化对神经退行性相关基因表达的影响 研究主要基于体外模型,可能无法完全模拟体内复杂环境 探讨阿尔茨海默病(AD)中神经退行性变的具体机制 大鼠神经细胞共培养模型 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA-seq, CRISPR-Cas9 NA 转录组数据 约12k细胞的转录组数据,多条件实验产生约40k转录组数据
5270 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过单核RNA测序和空间转录组学分析,研究了阿尔茨海默病中特定细胞类型的变化和丢失,揭示了疾病进展中的细胞和分子变化 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了阿尔茨海默病中易受损细胞类型的空间分布及其与病理蛋白的关系 研究样本仅限于阿尔茨海默病捐赠者,可能无法完全代表所有患者群体 研究阿尔茨海默病中细胞类型的变化及其与病理蛋白的关系,以揭示疾病的发生和进展机制 阿尔茨海默病捐赠者的脑组织 数字病理学 老年病 单核RNA测序(snRNAseq),空间转录组学 NA RNA测序数据,空间转录组数据 阿尔茨海默病捐赠者的脑组织样本
5271 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究通过比较人类和小鼠模型,揭示了阿尔茨海默病(AD)的共享分子变化,增进了对该疾病潜在机制的理解,并提高了有效治疗的前景 采用多组学方法整合空间转录组学和单核RNA测序数据,进行跨物种差异表达分析和多尺度共表达网络分析,揭示了进化保守的AD转录变化 研究主要依赖于死后组织样本,可能无法完全反映活体中的动态变化 揭示阿尔茨海默病的共享分子变化,增进对疾病机制的理解,并提高治疗前景 人类和小鼠的前额叶皮层组织,包括唐氏综合症(DS)中的AD病理 数字病理 老年病 空间转录组学(ST)、单核RNA测序(snRNA-seq)、荧光淀粉样成像 BayesSpace、hdWGCNA RNA测序数据、图像数据 人类和小鼠的前额叶皮层组织样本
5272 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文介绍了一种现代化的方法,用于优化人脑标本的收集和处理,以支持最新的单细胞和空间分子技术 开发了一种结合快速神经成像、半脑嵌入、薄片切割和交替固定或冷冻的现代化方法,用于优化脑组织质量和解剖精度 研究仅限于特定时间范围内收集的捐赠者大脑,排除了额颞叶变性病例 优化人脑标本的收集和处理方法,以支持现代分子细胞类型和通路分析 人脑标本,特别是阿尔茨海默病(AD)神经病理学进展的脑区 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞组学、空间转录组学、数字病理学分析 NA 脑组织样本、数字病理图像 84个捐赠者大脑,包括从无认知障碍到痴呆的不同阶段
5273 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文探讨了ABCA7和APOE Christchurch变异在阿尔茨海默病动物模型中的保护机制 通过CRISPR-Cas9技术引入ABCA7 V1613M和APOE R136S变异,揭示了这些变异在减少Ab生成和调节胶质细胞反应中的保护作用 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类临床试验 研究阿尔茨海默病的发病机制及治疗策略 小鼠模型(5xFAD和PS19) 基础科学 阿尔茨海默病 CRISPR-Cas9, 单细胞空间转录组学和蛋白质组学 小鼠模型 组织学、生物化学、转录组学和蛋白质组学数据 NA
5274 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过单细胞测序技术研究了阿尔茨海默病(AD)外周免疫系统的表观遗传和转录变化 揭示了AD外周免疫细胞中开放染色质的显著数量,并发现了与CXC基序趋化因子受体3基因启动子共可及的顺式调控DNA元件,以及在单核细胞中发现了新的RELA转录因子结合位点 NA 研究阿尔茨海默病(AD)外周免疫系统的表观遗传和转录变化 阿尔茨海默病(AD)患者的外周免疫细胞 表观遗传学 阿尔茨海默病 单细胞测序,包括转座酶可及染色质测定和RNA测序 NA 基因表达数据 NA
5275 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过整合单细胞基因组学和细胞重编程技术,研究了阿尔茨海默病(AD)病理背景下小胶质细胞的转录组和表观基因组 结合单细胞基因组学和CRISPR介导的扰动技术,揭示了小胶质细胞在AD中的炎症转录程序的动态变化 研究主要基于死后人脑样本,仅提供了疾病转录机制的静态快照 研究阿尔茨海默病(AD)病理背景下小胶质细胞的转录组和表观基因组,以揭示疾病相关的转录程序 小胶质细胞 基因组学 阿尔茨海默病 单细胞转录组学、CRISPR、细胞重编程 NA 转录组数据、表观基因组数据 超过400个死后人脑样本,生成超过150,000个独特的小胶质细胞转录组
5276 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过优化人脑细胞核分离技术,增加脑血管细胞的代表性,并对健康与阿尔茨海默病(AD)捐赠者的顶叶皮层进行单细胞核转录组分析,揭示了脑血管功能障碍在AD中的作用 优化了人脑细胞核分离技术,增加了脑血管细胞的代表性,并整合了新的单细胞核转录组数据与公共数据集,创建了一个全面的脑血管图谱 研究样本主要来自澳大利亚脑库网络,可能限制了结果的普遍性 探讨脑血管功能障碍在阿尔茨海默病中的作用及其机制 健康与阿尔茨海默病捐赠者的顶叶皮层 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞核转录组测序(snRNA-seq),空间转录组分析 NA 转录组数据 72个大脑样本
5277 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文研究了阿尔茨海默病(AD)中神经元周围网络(PNNs)的作用及其与淀粉样斑块形成的关系 研究发现PNNs在防止淀粉样斑块积累和维持小胶质细胞对斑块的正常反应中起关键作用 研究仅基于5xFAD小鼠模型,未涉及人类样本 探讨PNNs在阿尔茨海默病中的作用及其对淀粉样斑块形成的影响 5xFAD小鼠模型中的神经元周围网络(PNNs)和淀粉样斑块 神经科学 阿尔茨海默病 免疫组织化学和空间转录组学 5xFAD小鼠模型 图像和基因表达数据 每组4-6只小鼠,分别在4个月和8个月龄时采集样本
5278 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文探讨了外周循环中的免疫蛋白如何影响阿尔茨海默病(AD)中淀粉样蛋白β(Aβ)的积累速率 首次揭示了外周免疫蛋白与AD病理进展之间的关系,并识别了特定的外周免疫介质 研究样本量有限,且主要基于观察性数据,无法确定因果关系 研究外周免疫蛋白对AD病理进展的影响 阿尔茨海默病患者及健康对照 神经科学 阿尔茨海默病 11C-PiB PET, tau-PET, 单细胞RNA测序 NA 血浆蛋白数据、PET成像数据、基因数据 BLSA研究(n = 196),ARIC研究(n = 272, n = 11,596, n = 4,288)
5279 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过重新处理10个公开的单核RNA测序数据集,并与SEA-AD的多模态单细胞图谱整合,研究了阿尔茨海默病(AD)相关的分子和细胞变化 首次统一处理并整合多个公开数据集,使用SEA-AD的多模态单细胞图谱进行跨研究比较,识别出与AD一致的细胞变化 研究依赖于公开数据集的质量和临床元数据的一致性,可能存在数据预处理和分析策略的差异 研究阿尔茨海默病(AD)相关的分子和细胞变化,识别一致的细胞变化 780名捐赠者的4.3百万个细胞,来自背外侧前额叶皮层(DLPFC) 数字病理学 阿尔茨海默病 单核RNA测序(snRNA-seq),单核ATAC测序(snATAC-seq),空间转录组学(MERFISH) NA 单细胞RNA测序数据,单细胞ATAC测序数据,空间转录组数据 780名捐赠者的4.3百万个细胞
5280 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文探讨了阿尔茨海默病(AD)中神经免疫反应的复杂性,特别是小胶质细胞的激活和外周免疫细胞的浸润 首次结合荧光激活核分选和单核RNA测序技术,全面描绘AD大脑中的免疫细胞图谱,并利用成像质谱流式技术提供空间背景 目前样本量有限,未来需要增加样本数量以验证初步发现 揭示AD发病机制中免疫细胞的复杂相互作用 人类新鲜冷冻和福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的死后脑组织样本 数字病理学 阿尔茨海默病 荧光激活核分选、单核RNA测序、成像质谱流式技术 NA RNA测序数据、成像数据 来自英国脑库的所有Braak分期的样本
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