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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5241 | 2025-10-06 |
N-MYC impairs innate immune signaling in high-grade serous ovarian carcinoma
2024-05-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj5428
PMID:38748789
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研究论文 | 本研究揭示N-MYC通过抑制STING和RIG-I样受体信号通路,削弱高级别浆液性卵巢癌的先天免疫应答 | 首次发现N-MYC通过抑制STING寡聚化和MAVS线粒体定位,双重抑制I型干扰素信号通路 | 研究主要基于细胞系和单细胞测序数据,需要更多体内实验验证 | 探究N-MYC在高级别浆液性卵巢癌免疫抑制中的作用机制 | 高级别浆液性卵巢癌细胞系和临床样本 | 癌症免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类临床HGSC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5242 | 2025-10-06 |
Toolkit for mapping the clonal landscape of tumor-infiltrating B cells
2024-03, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2024.101864
PMID:38301345
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综述 | 本文概述了用于绘制肿瘤浸润B细胞克隆景观的工具包,包括现有技术总结及其在B细胞研究中的应用 | 首次系统整合单细胞多组学、B细胞特异性鉴定和B细胞受体深度分析技术,提出综合研究肿瘤微环境中B细胞克隆功能的新范式 | 主要基于现有技术综述,缺乏原始实验数据验证 | 提升对肿瘤微环境中B细胞行为的理解和管理能力 | 肿瘤浸润B细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学、空间转录组学、基因组学、蛋白质组学、B细胞受体谱分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
5243 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics defines injury-specific microenvironments in the adult mouse kidney and novel cellular interactions in regeneration and disease
2023-Nov-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.22.568217
PMID:38045285
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研究论文 | 本研究应用单细胞空间转录组学技术分析小鼠肾脏缺血再灌注损伤,揭示损伤特异性微环境和细胞间相互作用 | 首次使用空间转录组学技术揭示肾脏损伤中空间依赖的基因表达模式和持续损伤的近端小管细胞与成纤维细胞间的分子相互作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探索肾脏损伤和修复过程中的分子通路和细胞相互作用 | 成年小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
5244 | 2025-10-06 |
The promising role of new molecular biomarkers in prostate cancer: from coding and non-coding genes to artificial intelligence approaches
2022-09, Prostate cancer and prostatic diseases
IF:5.1Q1
DOI:10.1038/s41391-022-00537-2
PMID:35422101
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综述 | 本文系统综述了前列腺癌新型分子标志物(包括编码和非编码基因)及人工智能方法的最新研究进展 | 整合了转录组学、基因组学和人工智能方法在前列腺癌生物标志物发现中的协同应用 | NA | 概述通过转录组学、基因组学和人工智能发现新型分子标志物的最新进展,以改善前列腺癌患者的临床管理 | 前列腺癌相关分子标志物和人工智能分析方法 | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 全基因组测序, RNA测序, 外显子组测序, 空间转录组学 | 机器学习, 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 全基因组测序, 外显子组测序, RNA测序 | NA | NA |
5245 | 2025-10-06 |
Tracing the origin of disseminated tumor cells in breast cancer using single-cell sequencing
2016-12-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-016-1109-7
PMID:27931250
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术追踪乳腺癌中播散肿瘤细胞的起源 | 首次结合单细胞基因组测序和肿瘤内遗传异质性分析,系统追踪骨髓中播散肿瘤细胞的克隆起源 | 样本量较小(仅6名患者),仅分析了非转移性乳腺癌患者 | 识别和追溯乳腺癌中播散肿瘤细胞的起源 | 乳腺癌患者的骨髓上皮样细胞、原发性肿瘤和淋巴结转移灶 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌 | 单细胞测序,DNA拷贝数变异分析,进化重建分析 | NA | 基因组DNA | 6名非转移性乳腺癌患者的63个单细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
5246 | 2025-10-06 |
TSC22 domain family member 3 links natural killer cells to CD8+ T cell-mediated drug hypersensitivity
2025-Jun-21, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02300-0
PMID:40544157
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示TSC22D3调控的自然杀伤细胞在药物超敏反应中的关键作用 | 首次发现TSC22D3缺陷通过增强NK细胞效应功能,将免疫应答从CD4+T细胞转向CD8+T细胞功能 | 研究主要基于DHS患者和小鼠模型,需在其他SCARs类型中验证 | 探索自然杀伤细胞在严重皮肤药物不良反应发病机制中的作用 | DHS患者、dapsone耐受个体和小鼠模型 | 免疫学 | 药物超敏反应 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | DHS患者与dapsone耐受个体的血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5247 | 2025-10-06 |
BCAT1 Activation Reprograms Branched-Chain Amino Acid Metabolism and Epigenetically Promotes Inflammation in Diabetic Retinopathy
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.59
PMID:40530920
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研究论文 | 本研究探讨了BCAT1激活如何重编程支链氨基酸代谢并通过表观遗传机制促进糖尿病视网膜病变中的炎症反应 | 首次揭示BCAT1在糖尿病条件下通过调节α-酮戊二酸水平影响组蛋白甲基化状态,从而表观遗传调控炎症基因表达的新机制 | 研究主要聚焦于Müller细胞,其他视网膜细胞类型的作用尚未完全阐明 | 研究支链氨基酸代谢重编程及其在糖尿病视网膜病变进展中的贡献 | 糖尿病小鼠模型和Müller细胞 | 代谢组学与表观遗传学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞测序, 靶向代谢组学, 染色质免疫沉淀, RNA测序, 激酶筛选 | 糖尿病小鼠模型 | 基因表达数据, 代谢物数据, 表观遗传数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5248 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal how root tissues adapt to soil stress
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08941-z
PMID:40307555
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和空间转录组技术揭示了水稻根部组织如何适应土壤胁迫的细胞机制 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了根部不同组织对土壤胁迫的转录响应机制,特别是发现了韧皮部细胞释放脱落酸调控根部组织适应土壤紧实胁迫的新机制 | 研究主要聚焦于水稻模型,在其他植物物种中的普适性需要进一步验证 | 探究植物根部组织在单细胞水平上如何适应不同土壤条件和环境胁迫 | 水稻根部组织细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组 | NA | NA |
5249 | 2025-10-06 |
Multigenerational cell tracking of DNA replication and heritable DNA damage
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08986-0
PMID:40399682
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研究论文 | 通过多代单细胞追踪技术研究DNA复制模式和可遗传DNA损伤如何导致细胞异质性 | 开发了基于内源性标记蛋白的多代单细胞追踪方法,结合CRISPR基因组编辑同时追踪DNA复制模式和可遗传DNA损伤 | 研究仅限于异步生长的细胞,最多追踪四代细胞 | 阐明致癌扰动如何诱导姐妹细胞不对称性和表型异质性 | 哺乳动物细胞系 | 单细胞分析 | 癌症 | CRISPR基因组编辑, 单细胞转录组测序, 迭代染色 | 自定义计算工具 | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5250 | 2025-10-06 |
NOTCH2 disrupts the synovial fibroblast identity and the inflammatory response of epiphyseal chondrocytes
2025-May-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110206
PMID:40345585
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研究论文 | 本研究探讨NOTCH2信号如何通过改变转录组和细胞群来影响软骨细胞炎症反应和滑膜成纤维细胞特性 | 首次揭示NOTCH2通过破坏滑膜成纤维细胞特性和改变软骨细胞炎症反应在骨关节炎发病机制中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需要进一步验证 | 研究NOTCH2信号在骨关节炎发病机制中的作用机制 | 小鼠软骨细胞和滑膜成纤维细胞 | 分子生物学 | 骨关节炎 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 两种功能获得性突变小鼠模型的原代骨骺细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
5251 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics: Integrating Morphology and Molecular Mechanisms of Kidney Diseases
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.06.012
PMID:39097166
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在肾脏疾病研究中的应用,包括技术原理、数据分析方法及其临床潜力 | 整合形态学与分子生物学,在原生空间背景下解析肾脏疾病的分子机制 | 新兴技术仍面临技术挑战和标准化问题 | 探讨空间转录组学技术在肾脏疾病研究中的应用前景 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5252 | 2024-12-28 |
Advances in Single-Cell Sequencing and Spatial Profiling of Kidney Disease
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.10.010
PMID:39722281
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
5253 | 2025-10-06 |
FCGR2A contributes to M2 macrophages polarization in HCC through IL-4/JAK/STAT6 axis
2025-Aug, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102429
PMID:40482466
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研究论文 | 本研究揭示了FCGR2A通过IL-4/JAK/STAT6轴促进肝细胞癌中M2巨噬细胞极化的机制 | 首次发现FCGR2A在肝癌M2巨噬细胞中高表达并通过IL-4/JAK/STAT6轴驱动M2极化 | 具体调控机制细节仍需进一步研究 | 探究FCGR2A在肝细胞癌肿瘤微环境中对巨噬细胞极化的调控作用 | 肝细胞癌组织、巨噬细胞、NK细胞、T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、体内实验、转染实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5254 | 2025-10-06 |
TMEM55A-mediated PI5P signalling regulates alpha cell actin depolymerisation and glucagon secretion
2025-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06411-9
PMID:40140059
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研究论文 | 本研究揭示了TMEM55A通过调控PI5P信号和F-肌动蛋白网络调节胰岛α细胞胞吐和胰高血糖素分泌的新机制 | 首次发现TMEM55A介导的PI5P信号通路通过调节F-肌动蛋白解聚和GTPase/RhoA失活来控制胰高血糖素分泌 | 研究主要关注TMEM55A-PI5P信号轴,其他潜在调控机制尚未完全探索 | 验证TMEM55A及其信号分子在α细胞功能和胰高血糖素分泌中的作用 | 人和小鼠胰岛α细胞、αTC1-9细胞系 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 膜片钳电生理学、单细胞RNA测序、体外磷酸酶测定、活细胞成像、GTPase活性下拉测定、共聚焦显微镜 | NA | 电生理记录、RNA测序数据、显微镜图像、分泌测定数据 | 人和小鼠胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5255 | 2025-10-06 |
RFX3 is essential for the generation of functional human pancreatic islets from stem cells
2025-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06424-4
PMID:40263183
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研究论文 | 本研究揭示了RFX3在调控人类胰岛细胞分化和抑制肠嗜铬细胞定向中的关键作用 | 首次探索RFX3在人类胰岛发育中的功能,发现其调控胰岛内分泌细胞分化和抑制肠嗜铬细胞定向的新机制 | 研究主要基于干细胞衍生的胰岛类器官模型,未在体内系统中验证 | 研究RFX3在人类胰岛发育中的功能 | 人类诱导多能干细胞衍生的胰岛类器官 | 发育生物学 | 糖尿病 | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 基因敲除和过表达模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
5256 | 2025-10-06 |
Abundance of a metabolically active subpopulation in dedifferentiated adipocytes inversely correlates with body mass index
2025-Jul, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102161
PMID:40348015
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在人脂肪细胞中发现了一个代谢活跃的亚群,该亚群丰度与体重指数呈负相关 | 首次在去分化脂肪细胞中鉴定出具有独特基因特征和代谢活性的CD36+/CD146+亚群,并发现其丰度与BMI的负相关性 | 样本量相对有限(11名供者),且机制研究仍需深入 | 探究人脂肪组织中不同亚群的细胞组成和功能特性 | 人脂肪组织来源的去分化脂肪细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序,流式细胞分选,批量RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据,批量转录组数据 | 11名人类供者的脂肪细胞,以及1759名供者的皮下脂肪组织基因表达数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
5257 | 2025-10-06 |
The co-location of MARCO+ tumor-associated macrophages and CTSE+ tumor cells determined the poor prognosis in intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Jul-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001138
PMID:39471066
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研究论文 | 本研究通过空间转录组和单细胞数据分析,揭示了肝内胆管癌中MARCO+肿瘤相关巨噬细胞与CTSE+肿瘤细胞共定位导致不良预后的机制 | 首次在肝内胆管癌中识别出两种肿瘤内免疫浸润模式,并发现MARCO+ TAMs与CTSE+肿瘤细胞的空间共定位关系及其对预后的影响 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证发现 | 探究肝内胆管癌肿瘤微环境中免疫细胞表型及其空间分布对预后的影响 | 肝内胆管癌患者组织样本 | 空间转录组学 | 肝内胆管癌 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 6个空间转录组样本(29,632个点), 35个单细胞样本(21,158个细胞), 20个ICC样本用于验证 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5258 | 2025-06-22 |
Deciphering Macrophage-Fibroblast Cross Talk in Obesity-Induced Adipose Tissue Fibrosis: Insights From Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-Jul-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0337
PMID:40540667
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
5259 | 2025-10-06 |
Integrated spatial omics of metabolic reprogramming and the tumor microenvironment in pancreatic cancer
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112681
PMID:40538442
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学、空间转录组学和空间代谢组学,研究胰腺癌中代谢重编程与肿瘤微环境的空间关系 | 首次将单细胞转录组学、空间转录组学和空间代谢组学整合分析,可视化代谢物与基因表达的空间共定位 | NA | 探索胰腺癌代谢重编程与肿瘤微环境的相互作用机制 | 胰腺癌肿瘤样本 | 空间多组学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 空间代谢组学, 伪时间轨迹分析 | scMetabolism | 转录组数据, 代谢组数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
5260 | 2025-10-06 |
A deep generative model for deciphering cellular dynamics and in silico drug discovery in complex diseases
2025-Jun-20, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01423-7
PMID:40542107
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研究论文 | 开发了一个名为UNAGI的深度生成神经网络,用于分析时间序列单细胞转录组数据并推进计算机模拟药物发现 | 提出了首个专门针对时间序列单细胞转录组数据设计的深度生成模型,能够捕获疾病进展中的复杂细胞动态并增强药物扰动建模 | NA | 开发计算工具用于详细分析疾病进展和靶向计算机模拟药物干预 | 特发性肺纤维化患者和COVID-19患者的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序 | 深度生成神经网络 | 时间序列单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |