单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 31780 篇文献,本页显示第 5241 - 5260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
5241 2025-10-06
The impact of de novo lipogenesis on predicting survival and clinical therapy: an exploration based on a multigene prognostic model in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-18, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 基于从头脂质生成相关基因构建肝细胞癌预后风险模型并探索其与免疫微环境和治疗反应的关系 首次基于从头脂质生成通路构建包含六个特征基因的肝细胞癌预后模型,并系统分析风险分型与免疫细胞浸润模式及治疗反应的关联 样本量相对有限,需要更多独立队列验证模型的普适性 开发肝细胞癌预后预测模型并探索从头脂质生成在肿瘤进展中的作用机制 肝细胞癌患者 生物信息学 肝细胞癌 LASSO-Cox回归分析,免疫组织化学,Western blotting,多重免疫荧光染色,单细胞RNA测序 预后风险模型 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 TCGA、GEO、ICGC-LIRI数据集及湘雅队列106例患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5242 2025-10-06
Artificial intelligence approaches for tumor phenotype stratification from single-cell transcriptomic data
2025-Jun-13, eLife IF:6.4Q1
研究论文 提出一种基于NLP文档嵌入技术的单细胞RNA测序分析框架SCellBOW,用于肿瘤表型分层和风险评估 首次将自然语言处理中的文档嵌入技术应用于单细胞转录组数据分析,能够识别具有临床意义的肿瘤亚群并评估其侵袭风险 缺乏与临床注释的直接关联,肿瘤表型空间复杂性带来的分析挑战 开发计算框架用于肿瘤表型异质性分析和风险分层 单细胞转录组数据中的恶性与非恶性细胞亚型 自然语言处理 前列腺癌 单细胞RNA测序 文档嵌入模型 单细胞转录组数据 人类脾细胞和匹配的外周血单个核细胞数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5243 2025-10-06
Mechanisms of hematopoietic clonal dominance in VEXAS syndrome
2025-Jun, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究揭示了VEXAS综合征中造血克隆优势的机制,并通过单细胞转录组学和人源化模型阐明了UBA1基因突变导致克隆优势的病理过程 首次通过碱基编辑技术构建VEXAS综合征人源化模型,揭示了突变细胞通过获得衰老样状态在炎症环境中具有竞争优势的机制 研究样本量较小(仅9例男性患者),需要更大规模研究验证发现 探究VEXAS综合征中造血克隆优势的驱动机制 VEXAS综合征患者造血干细胞和祖细胞(HSPCs) 单细胞组学 自身炎症性疾病 单细胞转录组学,碱基编辑,竞争性移植 人源化疾病模型 单细胞转录组数据,免疫表型数据 9例男性VEXAS综合征患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5244 2025-10-06
Broad rim lesions are a new pathological and imaging biomarker for rapid disease progression in multiple sclerosis
2025-Jun, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究通过组织学和空间转录组学分析发现广泛髓样细胞边缘病变是多发性硬化快速疾病进展的新型生物标志物 首次发现具有广泛髓样细胞边缘的特定MS病变类型与快速疾病进展相关,并利用独立PET研究验证了这一关联 研究基于尸检队列,可能无法完全反映活体患者的动态疾病过程 探索多发性硬化疾病进展的潜在机制并寻找相关生物标志物 多发性硬化患者尸检脑组织和活体患者PET影像数据 数字病理学 多发性硬化 组织学分析, 空间转录组学, PET成像 NA 组织图像, 基因表达数据, 医学影像 尸检队列186人,PET研究114人 NA 空间转录组学, PET成像 NA NA
5245 2025-10-06
Narrowing Down Key Players in Autoimmunity via Single-Cell Multiomics
2025-Jun, European journal of immunology IF:4.5Q2
综述 本文探讨单细胞多组学技术如何揭示自身免疫疾病的机制,包括疾病相关细胞状态和细胞通讯网络 通过单细胞多组学技术以前所未有的分辨率绘制自身反应性淋巴细胞图谱,并关联特定自身免疫易感基因位点 NA 阐明自身免疫疾病的分子机制和效应细胞 健康组织和患者组织中的T细胞和B细胞 单细胞多组学 自身免疫疾病 单细胞多组学测序 NA 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞多组学 NA NA
5246 2025-10-06
nf-core/marsseq: systematic preprocessing pipeline for MARS-seq experiments
2025, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 开发了一个用于MARS-seq实验的系统性预处理流程,基于nf-core框架实现标准化分析 将原始MARS-seq2.0流程改进为nf-core框架实现,简化了流程执行并增加了RNA速度估计功能 NA 标准化MARS-seq分析并应用于RNA速度研究 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA MARS-seq2.0, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA MARS-seq2.0(大规模并行RNA单细胞测序)
5247 2025-10-06
ReSort enhances reference-based cell type deconvolution for spatial transcriptomics through regional information integration
2025, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 提出ReSort方法,通过整合区域信息增强空间转录组学中基于参考的细胞类型反卷积 利用空间转录组学的区域级数据减少对参考数据的依赖,缓解批次/平台差异问题 NA 提高空间转录组学中细胞类型反卷积的准确性 小鼠乳腺癌模型中的细胞类型分布 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 参考基于的反卷积方法 基因表达空间数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
5248 2025-10-06
Zileuton protects against arachidonic acid/5-lipoxygenase/leukotriene axis-mediated neuroinflammation in experimental traumatic brain injury
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究探讨了齐留通通过抑制花生四烯酸/5-脂氧合酶/白三烯轴减轻实验性创伤性脑损伤中的神经炎症 首次揭示5-脂氧合酶在TBI中的具体作用机制,并证明其抑制剂齐留通可通过调节AA/5-LOX/LT轴改善神经功能 研究仅使用小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;机制研究主要集中于体外微胶质细胞实验 探究5-脂氧合酶在创伤性脑损伤病理生理过程中的作用及潜在治疗价值 创伤性脑损伤小鼠模型及BV2微胶质细胞系 神经科学 创伤性脑损伤 RNA-seq, RT-PCR, 免疫细胞化学, Western blotting, 单细胞测序, 液相色谱质谱联用, ELISA NA 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 代谢物数据, 行为学数据 创伤性脑损伤小鼠模型及假手术对照组 NA 单细胞测序, RNA-seq NA NA
5249 2025-10-06
EPHX2 overexpression deters the advancement of clear cell renal cell carcinoma via lipid metabolism reprogramming
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨EPHX2通过脂代谢重编程抑制透明细胞肾细胞癌进展的机制 首次整合机器学习方法与实验验证揭示EPHX2在ccRCC中的肿瘤抑制功能及脂代谢调控机制 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内动物模型验证 阐明EPHX2在透明细胞肾细胞癌进展中的机制作用 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)细胞系786-O和ACHN 机器学习 肾癌 转录组测序,慢病毒转染技术 机器学习集成方法 转录组数据,单细胞转录组数据 TCGA和GEO数据库中的ccRCC数据集 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
5250 2025-10-06
Single Cell and Transcriptomic Analysis of Regulatory Mechanisms of Key Genes in Systemic Lupus Erythematosus
2025, International journal of general medicine IF:2.1Q2
研究论文 本研究整合单细胞和转录组数据,识别系统性红斑狼疮中记忆B细胞相关的六个关键基因及其调控机制 首次整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统性识别SLE中记忆B细胞特异性关键基因并揭示其动态表达模式 样本量较小(6例患者和6例对照),仅使用公共数据集GSE82221进行验证 阐明系统性红斑狼疮的细胞免疫调控机制和关键致病基因 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血细胞 生物信息学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 差异表达分析, ssGSEA, 功能富集分析, 甲基化分析, PPI网络分析, 伪时序分析 NA 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 6例SLE患者和6例健康对照的外周血样本,整合GSE82221公共数据集 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
5251 2025-10-06
High-expression of BCL10 inhibits cell-mediated immunity within the tumor immune microenvironment
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证探讨了BCL10在肿瘤免疫微环境中对免疫细胞的调控作用 首次系统揭示BCL10高表达通过激活NF-κB信号通路上调PD-1表达,导致CD8+T细胞耗竭的机制 研究主要聚焦于宫颈鳞状细胞癌,其他肿瘤类型的验证尚不充分 探究BCL10在肿瘤免疫微环境中对T细胞功能的调控机制 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞,特别是CD8+T细胞 生物信息学 宫颈癌 单细胞RNA测序,生物信息学分析,小鼠模型实验 NA 基因表达数据,单细胞测序数据 TCGA和GTEx数据库数据,GEO数据库单细胞数据,植入性CESC小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5252 2025-10-06
Integrated machine learning and single-cell RNA sequencing reveal COL4A2 and CXCL6 as oxidative stress-associated biomarkers in periodontitis
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合机器学习与单细胞RNA测序技术,鉴定COL4A2和CXCL6作为牙周炎氧化应激相关生物标志物 首次结合机器学习算法与单细胞RNA测序技术系统筛选牙周炎氧化应激相关关键基因,并明确其在细胞亚群中的特异性表达 研究主要基于公共数据库数据,实验验证仅限于大鼠模型,需要进一步临床验证 探索氧化应激与牙周炎发病机制的关联,识别潜在诊断生物标志物和治疗靶点 牙周炎患者牙龈组织转录组数据及牙周炎大鼠模型 生物信息学 牙周炎 单细胞RNA测序, 差异表达分析, WGCNA, GSEA, GO/KEGG富集分析 机器学习算法 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 牙周炎患者和对照者牙龈组织样本,牙周炎大鼠模型 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq NA NA
5253 2025-10-06
Single-cell sequencing reveals dysregulated cell type perturbations and critical mediator communication remodelling in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞测序揭示结直肠癌中细胞类型扰动和关键介质通讯重塑 识别了具有增殖和侵袭特征的上皮亚群及终末状态髓系细胞ActMono,发现半乳糖凝集素信号在免疫调控中的关键作用,建立了基于分泌性免疫细胞相关基因的预后模型 样本量相对有限(41个CRC样本),部分发现需进一步体内验证 研究结直肠癌的细胞异质性和免疫微环境,识别关键细胞亚群、功能通路和预后生物标志物 结直肠癌患者组织样本 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组测序 预后模型(CRS) 单细胞转录组数据 41个结直肠癌样本(来自四个数据集) NA 单细胞RNA测序 NA NA
5254 2025-10-06
Cellular hierarchy framework based on single-cell and bulk RNA sequencing reveals fatty acid metabolic biomarker MYDGF as a therapeutic target for ccRCC
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学分析发现MYDGF是透明细胞肾细胞癌中促进肿瘤进展的关键脂肪酸代谢生物标志物 首次从脂肪酸代谢重编程角度系统阐明ccRCC的细胞层级结构,并鉴定出MYDGF作为关键致癌生物标志物 NA 探索脂肪酸代谢重编程对ccRCC异质性和预后的影响,并寻找治疗靶点 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者样本和细胞系 数字病理学 肾癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 机器学习算法 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 NA NA
5255 2025-10-06
Single-cell RNA seq data analysis reveals molecular markers and possible treatment targets for laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC): an in-silico approach
2025, In silico pharmacology
研究论文 通过单细胞RNA测序数据分析喉鳞状细胞癌的分子标志物和潜在治疗靶点 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析喉鳞状细胞癌的细胞异质性,识别出12个细胞簇和20个核心基因 基于生物信息学分析方法,缺乏实验验证 探索喉鳞状细胞癌的诊断生物标志物和治疗靶点 喉鳞状细胞癌患者样本 生物信息学 喉癌 单细胞RNA测序 主成分分析,基因本体富集分析,KEGG通路分析 单细胞RNA测序数据 GSE252490数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5256 2025-10-06
Diverse contribution of amniogenic somatopleural cells to cardiovascular development: With special reference to thyroid vasculature
2024-01, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了羊膜生成体壁细胞在心血管发育中的多样化贡献,特别关注甲状腺血管系统的形成 首次发现羊膜生成体壁细胞不仅形成羊膜,还迁移入胚胎分化为多种心血管细胞类型,并揭示其在甲状腺血管形成中的特异性作用 iASCs的详细分化过程和最终分布仍不完全清楚 阐明羊膜生成体壁细胞在心血管发育中的作用机制 鹌鹑-鸡嵌合体胚胎中的羊膜生成体壁细胞 发育生物学 心血管发育异常 单细胞转录组分析, 嵌合体分析, 外植体培养 NA 基因表达数据, 细胞分布数据 鹌鹑-鸡嵌合体胚胎样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5257 2025-10-06
Mitochondrial dysfunction induces ALK5-SMAD2-mediated hypovascularization and arteriovenous malformations in mouse retinas
2022-12-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了线粒体功能障碍通过ALK5-SMAD2信号通路导致小鼠视网膜血管发育异常和动静脉畸形的机制 首次发现线粒体功能障碍通过诱导SMAD2线粒体定位和MAPKs介导的磷酸化增强ALK5-SMAD2信号通路,导致视网膜血管异常 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类疾病中验证 探究线粒体功能障碍导致视网膜血管发育异常的分子机制 内皮细胞特异性缺失Tfam、Cox10或Trx2基因的小鼠视网膜 分子生物学 视网膜血管疾病 单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织学图像 三种不同基因敲除小鼠品系的视网膜样本 NA single-cell RNA-seq NA NA
5258 2025-10-06
mTORC1 links pathology in experimental models of Still's disease and macrophage activation syndrome
2022-11-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了mTORC1在斯蒂尔病和巨噬细胞活化综合征病理机制中的核心作用 首次证明mTORC1的异常激活是连接斯蒂尔病和巨噬细胞活化综合征的关键分子机制 主要基于小鼠模型研究,人类样本验证相对有限 探究mTORC1在斯蒂尔病和巨噬细胞活化综合征发病机制中的作用 小鼠模型和斯蒂尔病患者样本 分子病理学 斯蒂尔病, 巨噬细胞活化综合征 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas基因编辑, 转录组分析 NA 基因表达数据, 转录组数据 小鼠模型和人类患者样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
5259 2025-10-06
A dual-targeting strategy to inhibit colorectal cancer liver metastasis via tumor cell ferroptosis and cancer-associated fibroblast reprogramming
2025-Oct, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 通过诱导肿瘤细胞铁死亡和重编程癌症相关成纤维细胞来抑制结直肠癌肝转移的双靶向策略 开发了双靶向纳米系统,同时靶向肿瘤细胞铁死亡和CAFs重编程,实现双重协同治疗效果 NA 开发抑制结直肠癌肝转移的新型治疗策略 结直肠癌细胞和癌症相关成纤维细胞 癌症研究 结直肠癌 单细胞转录组学 NA 转录组数据 临床结直肠癌样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5260 2025-10-06
Single-cell RNA sequencing analysis of intrahepatic cholangiocarcinoma reveals SPP1 facilitates disease progression via interaction with CD4+ T cells
2025-Aug, Oncology letters IF:2.5Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序分析肝内胆管癌肿瘤微环境,揭示SPP1通过调控CD4+ T细胞分化促进疾病进展 首次在单细胞水平揭示SPP1-CD44轴介导肿瘤细胞与免疫细胞相互作用,影响CD4+ T细胞分化 未明确SPP1-CD44相互作用的具体分子机制及临床转化潜力 探究肝内胆管癌肿瘤微环境中CD4+ T细胞的作用机制 肝内胆管癌患者肿瘤组织中的肿瘤细胞和免疫细胞 单细胞组学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部