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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5241 | 2026-03-31 |
Mapping the gene space at single-cell resolution with gene signal pattern analysis
2024-12, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00734-0
PMID:39706866
|
研究论文 | 本文提出了一种名为基因信号模式分析(GSPA)的图信号处理方法,用于从单细胞数据中学习丰富的基因表示,以映射基因空间 | 首次系统性地提出基因嵌入问题,并开发了基于细胞-细胞图的扩散小波字典的GSPA方法,实现了基因在细胞流形上的模式化和定位表征 | 未明确提及方法在特定疾病或大规模数据集上的验证限制 | 开发计算方法来映射单细胞测序分析中的基因空间,并评估基因表示的有效性 | 单细胞测序数据中的基因 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 图信号处理(GSPA) | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5242 | 2026-03-31 |
Single-cell RNA sequencing reveals characteristics of myeloid cells in pulmonary post-acute sequelae of SARS-CoV-2
2023-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.31.551349
PMID:37577518
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了SARS-CoV-2感染后肺部长期后遗症(PPASC)中髓系细胞的免疫特征和代谢变化 | 首次在单细胞水平上详细描述了PPASC患者外周血单核细胞中髓系细胞的转录组特征,并发现了与纤维化、免疫抑制和代谢改变相关的基因表达模式 | 样本量相对较小,且主要关注外周血细胞,未直接分析肺部组织;研究为观察性,需进一步功能验证 | 探究SARS-CoV-2感染后肺部长期后遗症(PPASC)的免疫学机制 | SARS-CoV-2感染后出现慢性肺部症状的患者(PPASC)与未感染对照者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19后遗症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过34,139个外周血单核细胞,整合了公开数据集(GSM4509024) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序技术 |
| 5243 | 2026-03-31 |
Proteomic Profiling of Fallopian Tube-Derived Extracellular Vesicles Using a Microfluidic Tissue-on-Chip System
2023-Mar-27, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10040423
PMID:37106610
|
研究论文 | 本研究建立了一个微流控组织芯片系统,用于培养人输卵管上皮细胞并收集其分泌的小细胞外囊泡,首次报道了295种常见的hFTE sEV蛋白,并揭示了这些蛋白与输卵管组织转录组之间的相关性 | 首次利用微流控平台培养人输卵管上皮细胞进行sEV收集,并通过质谱蛋白质组学分析,首次报道了295种常见的hFTE sEV蛋白质,并关联了sEV蛋白谱与组织空间转录组数据 | 研究受限于生物材料的可用性和适当的培养方法,且样本规模可能较小 | 研究人输卵管上皮细胞来源的小细胞外囊泡的蛋白质组成及其功能,探索其在卵巢癌发生和生殖功能中的作用 | 人输卵管上皮细胞及其分泌的小细胞外囊泡 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 质谱蛋白质组学分析,空间转录组学分析 | 微流控组织芯片系统 | 蛋白质组数据,转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | GeoMx Cancer Transcriptome Atlas | NA |
| 5244 | 2026-03-31 |
Multiplexed single-cell RNA-sequencing of mouse thymic and splenic samples
2022-Mar-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.101041
PMID:36475567
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用抗体标记的哈希寡核苷酸(Ab-HTO)和10x Genomics技术进行小鼠胸腺和脾脏样本的多重单细胞RNA测序方法 | 利用Ab-HTO标记样本,结合10x Genomics平台实现多重单细胞RNA测序,以降低成本、避免批次效应,并促进细胞双联体去除与数据整合 | 未明确说明样本数量或实验重复次数,可能限制结果的统计稳健性 | 研究小鼠胸腺细胞和脾脏T淋巴细胞的发育过程 | 小鼠胸腺和脾脏样本 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics技术用于单细胞基因表达分析 |
| 5245 | 2026-03-31 |
Single-cell transcriptomics identifies multiple pathways underlying antitumor function of TCR- and CD8αβ-engineered human CD4+ T cells
2020-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aaz7809
PMID:32923584
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了TCR和CD8αβ工程化改造的人CD4+ T细胞获得抗肿瘤功能的多重分子通路 | 首次在单细胞分辨率下系统解析了TCR8工程化CD4 T细胞获得抗肿瘤功能的转录组基础,并发现其能同时激活细胞毒性、共刺激、氧化磷酸化和增殖相关基因,同时减少分化和耗竭 | 研究主要基于体外实验和小鼠异种移植模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究TCR和CD8αβ共表达工程化CD4 T细胞获得抗肿瘤功能的分子机制 | 经过TCR和CD8αβ(TCR8)工程化改造的人CD4+ T细胞和CD8+ T细胞 | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,涉及工程化T细胞的体外实验和小鼠异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5246 | 2026-03-30 |
The plastic stomatal development in grasses and its implications in crop improvement
2026-Apr, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2026.154748
PMID:41849825
|
综述 | 本文综述了禾本科植物气孔发育的物种特异性机制及其在作物改良中的应用潜力 | 系统总结了禾本科植物四细胞气孔复合体的独特发育机制、可塑性及其关键调控因子,并强调了整合单细胞RNA-seq、空间转录组学、泛基因组学和人工智能等多组学方法在加速新型调控因子发现和基因型-表型关联研究中的应用 | NA | 阐明禾本科植物气孔发育的物种特异性机制,为通过遗传改良提高作物水分利用效率和抗旱性提供理论框架和可行靶点 | 禾本科植物(特别是谷物作物)的气孔发育 | 植物生物学与作物遗传改良 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、泛基因组学、全基因组关联研究、人工智能驱动的数据挖掘 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5247 | 2026-03-30 |
A Tumor Microenvironment-Derived CAF-VEGF Model and Its Application in Biomarker Screening for HCC
2026-Apr, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.70204
PMID:41902797
|
研究论文 | 本研究构建了一个基于肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞和血管内皮生长因子的预后评分模型,用于评估肝细胞癌患者的预后,并筛选出关键生物标志物 | 首次结合单细胞测序数据构建了CAF-VEGF预后评分模型,并发现ESCO2和WDHD1两个新基因通过调控血管生成促进肝细胞癌进展 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证模型的普适性 | 开发肝细胞癌预后评估模型并筛选关键生物标志物 | 肝细胞癌组织及其邻近正常组织 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | COX回归模型,LASSO回归模型 | 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量(使用GEO数据库数据) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5248 | 2026-03-30 |
Bulk and single-cell transcriptome analyses combined with molecular simulations identify ferritinophagy as a key target for resveratrol in osteoarthritis
2026-Mar-28, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05244-6
PMID:41902854
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组数据、机器学习方法和分子模拟,揭示了白藜芦醇通过抑制NCOA4介导的铁蛋白自噬来缓解骨关节炎软骨细胞损伤的分子机制 | 首次结合批量与单细胞转录组分析及分子模拟,将铁蛋白自噬确定为白藜芦醇治疗骨关节炎的关键靶点,并验证了其通过调控NCOA4等核心蛋白发挥保护作用 | 研究主要基于体外细胞实验和计算模拟,缺乏体内动物模型验证,且样本来源和规模有限 | 探究白藜芦醇是否通过调控铁蛋白自噬网络保护软骨,为骨关节炎治疗提供新靶点 | 人类关节软骨细胞(在IL-1β诱导的炎症模型中) | 生物信息学与计算生物学 | 骨关节炎 | 转录组测序、分子对接、分子动力学模拟、Western blot、透射电子显微镜、免疫荧光 | 机器学习方法(如加权基因共表达网络分析) | 转录组数据(批量与单细胞)、蛋白质表达数据、细胞图像数据 | 未明确具体样本数量,涉及人类关节软骨细胞体外模型 | NA | 转录组测序 | NA | NA |
| 5249 | 2026-03-30 |
February in focus in HCB: spatial transcriptomics
2026-Mar-28, Histochemistry and cell biology
IF:2.1Q2
DOI:10.1007/s00418-026-02467-9
PMID:41902844
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5250 | 2026-03-30 |
PTBP1 knockdown reprograms glioma stem cells into neuronal-like cells and suppresses tumorigenesis via the DUSP5-ERK1/2 signaling pathway
2026-Mar-28, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag068
PMID:41903206
|
研究论文 | 本研究通过深度学习形态分类、单细胞RNA-seq分析和实验验证,揭示了PTBP1通过DUSP5-ERK1/2信号通路调控胶质瘤干细胞增殖和分化的新机制,并开发了一种靶向PTBP1的纳米治疗策略 | 首次将胶质瘤细胞形态与患者生存时间关联,并发现PTBP1通过调控DUSP5表达和ERK1/2磷酸化动态影响胶质瘤干细胞命运,同时将白血病药物venetoclax重新用于胶质瘤治疗 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证 | 探究胶质瘤干细胞增殖和分化的调控机制,并开发新的治疗策略 | 胶质瘤患者样本、小鼠模型、胶质瘤干细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 深度学习形态分类、组织透明化3D成像、转录组分析、单细胞RNA-seq、慢病毒敲低、基于结构的药物筛选 | 深度学习模型 | 图像、转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | 65例胶质瘤患者H&E染色标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5251 | 2026-03-30 |
Geometric quantification of cell phenotype transition manifolds with information geometry
2026-Mar-27, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101564
PMID:41903532
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SCIM的几何引导方法,利用信息几何学量化细胞表型转换(CPT)的低维流形 | SCIM方法首次将单细胞基因表达谱嵌入为高斯分布,并自然定义Fisher度量,从而直接量化CPT流形的几何特性 | 方法依赖于RNA速度计算信息速度,可能受限于RNA速度估计的准确性 | 量化细胞表型转换过程中的低维流形几何结构 | 单细胞基因表达数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 信息几何学方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5252 | 2026-03-30 |
Genome-wide identification and characterization of QTLs for transcriptional noise in human midbrain cells
2026-Mar-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117151
PMID:41903140
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研究论文 | 本研究通过分析155名个体的诱导多能干细胞来源中脑细胞的单细胞RNA测序数据,在全基因组范围内识别并表征了转录噪声的数量性状位点,揭示了其与精神分裂症等人类性状的关联 | 首次在全基因组范围内系统识别转录噪声的数量性状位点,并发现其与精神分裂症关联信号的富集,以及疾病状态下特定神经元类型的转录噪声显著改变 | 研究主要基于诱导多能干细胞来源的细胞模型,可能无法完全反映体内复杂环境;样本量相对有限;功能验证有待进一步深入 | 探究遗传变异如何调控基因表达的细胞间变异(转录噪声),及其与人类性状(特别是精神分裂症)的关联机制 | 155名个体的诱导多能干细胞来源的中脑细胞,以及精神分裂症患者的大脑单细胞RNA测序数据 | 单细胞转录组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序,全基因组关联研究 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因型数据 | 155名个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5253 | 2026-03-30 |
Mitochondria orchestrated immune microenvironment and response in health and disease-clinically relevant outlook and recommendations
2026-Mar-26, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.048
PMID:41903791
|
综述 | 本文系统综述了线粒体与免疫微环境之间的相互作用,包括线粒体在免疫细胞中的调控模式、细胞间线粒体通讯机制、疾病中的线粒体-免疫重塑病理机制、新型分析技术及靶向治疗策略 | 打破线粒体仅作为细胞能量工厂的传统认知,强调其通过代谢重编程、动力学重塑、自噬调控和细胞间通讯等多种方式精确调控免疫细胞功能,并指出线粒体-免疫重塑在多种疾病中存在三个保守检查点,为通用治疗靶点提供新视角 | NA | 深入理解线粒体的免疫调控功能,为开发新型免疫治疗策略提供理论支持和临床参考 | 线粒体与免疫微环境的相互作用,涵盖免疫细胞、细胞间通讯及多种疾病模型 | NA | 心血管疾病、自身免疫疾病、肿瘤、衰老 | 单细胞测序、多组学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5254 | 2026-03-30 |
Lipid Metabolism and Neurodegeneration: Mechanistic Insights and Therapeutic Targets
2026-Mar-26, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103114
PMID:41903861
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综述 | 本文综述了脂质代谢在维持大脑稳态中的作用及其与神经炎症和神经退行性疾病(如阿尔茨海默病和帕金森病)进展的关联,并探讨了靶向脂质通路的治疗策略 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核转录组学等先进技术揭示了不同细胞类型中脂质代谢的特异性改变,并提出了脂质组学作为早期诊断和治疗监测的生物标志物来源 | NA | 探讨脂质代谢与神经退行性疾病之间的机制联系,并识别潜在的治疗靶点 | 大脑中的脂质代谢途径、神经炎症过程以及神经退行性疾病(如阿尔茨海默病和帕金森病) | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核转录组学、脂质组学 | NA | 转录组数据、脂质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、单核转录组学 | NA | NA |
| 5255 | 2026-03-30 |
Inhibition of endothelial ALOX12 mitigates cerebral ischemia-reperfusion injury by suppressing 12-HETE
2026-Mar-24, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和非靶向代谢组学等方法,揭示了内皮ALOX12-12-HETE信号通路在脑缺血再灌注损伤中的作用,并验证了抑制该通路可减轻神经血管损伤 | 首次结合单细胞RNA测序和非靶向代谢组学,明确了内皮细胞是脑缺血再灌注后ALOX12诱导和12-HETE积累的主要来源,并阐明了12-HETE作为有害血管分泌介质的多细胞损伤机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞系统,临床相关性仅通过血浆12-HETE水平与卒中严重度的相关性初步验证,缺乏直接的人体干预证据 | 探究脑缺血再灌注损伤中内皮ALOX12-12-HETE信号通路的细胞起源、功能作用及治疗潜力 | 小鼠短暂性大脑中动脉闭塞模型、氧糖剥夺/再灌注细胞系统、急性缺血性卒中患者血浆样本 | 神经科学 | 急性缺血性卒中 | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学, 微血管-实质分馏, AAV介导的基因敲低 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 临床评分数据 | 小鼠模型及细胞系统未明确数量, 急性缺血性卒中患者与健康对照的倾向评分匹配队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5256 | 2026-03-30 |
Reduced cartilage matrix stiffness in temporomandibular joint osteoarthritis impairs the functions of superficial zone chondrocytes via downregulation of CREB5-PLPP3 signaling
2026-Mar-23, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-026-00435-2
PMID:41870835
|
研究论文 | 本研究探讨了颞下颌关节骨关节炎中软骨基质刚度降低如何通过下调CREB5-PLPP3信号通路损害浅层区软骨细胞功能 | 揭示了软化细胞外基质通过减少PLPP3表达、抑制线粒体分裂和呼吸,以及下调PI3K-AKT通路损害浅层区软骨细胞功能的机制,并提出了PLPP3作为治疗靶点 | NA | 研究颞下颌关节骨关节炎中软骨基质刚度降低对浅层区软骨细胞功能的影响及其分子机制 | 颞下颌关节骨关节炎患者、大鼠模型以及体外培养的浅层区软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、mRNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5257 | 2026-03-30 |
Helminth infection induces malabsorption of dietary fat via STAT6-dependent intestinal MTTP suppression
2026-Mar-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.040
PMID:41875946
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研究论文 | 本研究探讨了蠕虫感染如何通过STAT6依赖性途径抑制肠道MTTP表达,从而损害膳食脂肪吸收,揭示了免疫与代谢之间的权衡机制 | 首次发现蠕虫感染通过STAT6依赖性抑制MTTP来减少脂肪吸收,为肥胖和代谢疾病提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究蠕虫感染如何影响膳食脂肪吸收及其分子机制 | 感染Heligomosomoides polygyrus的野生型和STAT6敲除小鼠,以及Caco-2细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),体外细胞实验 | NA | 基因表达数据,脂质代谢数据 | 未明确指定样本数量,涉及小鼠和Caco-2细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5258 | 2026-03-30 |
Precision Immunotherapeutics for Glioblastoma: Current Approaches and Emerging Strategies in 2026
2026-Mar-20, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15060561
PMID:41892350
|
综述 | 本文综述了2026年胶质母细胞瘤精准免疫治疗的当前方法与新兴策略,提出了基于系统生物学理解肿瘤-免疫系统复杂相互作用的新一代治疗框架 | 提出了超越单轴免疫激活/调节的系统生物学框架,整合空间转录组学、单细胞分析、高参数成像等新技术,并探讨了基于人工智能分析和适应性临床试验设计的生物标志物驱动治疗选择策略 | 作为综述文章,未报告原始实验数据或具体临床结果,主要基于现有文献和理论分析 | 开发胶质母细胞瘤的下一代精准免疫治疗策略 | 胶质母细胞瘤及其肿瘤微环境中的免疫系统 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学, 单细胞分析, 高参数成像 | NA | 转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5259 | 2026-03-30 |
Omics insights into MYBL2-promoted cancer stem-like cells driving ferroptosis resistance in hepatocellular carcinoma
2026-Mar-19, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.039
PMID:41864611
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了MYBL2驱动的癌症干细胞样细胞在肝细胞癌中维持干性和抗铁死亡的关键作用 | 首次结合单核RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据,跨物种识别并验证了MYBL2驱动的癌症干细胞样细胞亚群,并开发了新的预后预测基因特征模型 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的测序数据,体内功能验证和临床转化应用仍需进一步探索 | 识别肝细胞癌中关键的干细胞样细胞亚群并阐明其促肿瘤分子机制 | c-Myc/CreAlb转基因HCC小鼠模型和HCC患者组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 风险评分模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | 转基因HCC小鼠模型和HCC患者组织样本 | NA | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5260 | 2026-03-30 |
PDGFD: A Dual-Function Regulator That Maintains Myoblast Pool and Fuels Myogenic Differentiation
2026-Mar-18, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48030322
PMID:41899473
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研究论文 | 本研究首次揭示了PDGFD在骨骼肌生成中的双重调节作用,既作为维持成肌细胞库的“守护者”,又作为驱动肌源性分化的“启动者” | 首次发现PDGFD在肌生成中的双重功能角色,并通过单细胞RNA测序分析将其鉴定为肌肉和脂肪发育的共同候选基因 | 研究主要基于C2C12细胞模型,体内验证不足;PDGFD通过独立或平行信号轴调节肌源性分化的具体机制尚未完全阐明 | 探究PDGFD在骨骼肌生成中的具体功能和作用机制 | 骨骼肌组织、C2C12成肌细胞系 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |