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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5221 | 2026-03-31 |
CD70-Targeting CAR NK Cells Overcome BCMA Downregulation and Improve Survival in High-risk Multiple Myeloma Models
2026-Mar-04, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0130
PMID:41144785
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研究论文 | 本研究证实CD70是高危多发性骨髓瘤的潜在治疗靶点,并开发了一种靶向CD70的CAR NK细胞疗法,在临床前模型中显示出显著疗效 | 首次系统性地将CD70确立为高危多发性骨髓瘤的治疗靶点,并开发了结合CD27和IL-15的CAR NK细胞疗法,该疗法在BCMA下调或缺失的模型中仍保持有效 | 研究主要基于临床前模型,其临床疗效需通过正在进行的I/II期临床试验进一步验证 | 探索CD70作为高危多发性骨髓瘤治疗靶点的潜力,并开发相应的CAR NK细胞免疫疗法 | 多发性骨髓瘤患者样本、CD70+多发性骨髓瘤细胞系及动物模型 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学 | CAR NK细胞、CAR T细胞 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、图像数据 | 两个多发性骨髓瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5222 | 2026-03-31 |
Composition and Functional State of T and NK Cells in the Extramedullary Myeloma Tumor Microenvironment
2026-Mar-04, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0170
PMID:41236394
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和空间转录组学,揭示了髓外多发性骨髓瘤(EMM)肿瘤微环境(TME)中T细胞和NK细胞的组成和功能状态,并与骨髓多发性骨髓瘤(BM)进行了比较 | 首次系统性地描述了EMM TME中T和NK细胞的组成和功能状态,并发现了与BM相比的显著差异,如效应细胞与肿瘤细胞比例降低、CD4+ T细胞减少以及调节性CD16- NK细胞比例增加 | 研究样本量未明确说明,可能限制了结果的普遍性;且仅关注了T和NK细胞,未全面分析其他免疫细胞类型 | 探究EMM TME中免疫细胞的组成和功能状态,以理解其与治疗抵抗和生存期缩短的关联 | 髓外多发性骨髓瘤(EMM)肿瘤微环境中的T细胞和NK细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据, 空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5223 | 2026-03-31 |
The role of OSM/OSMRβ axis in shaping the tumor microenvironment favoring MASLD-related HCC immune evasion
2026-Mar-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001733
PMID:41779954
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研究论文 | 本研究探讨了OSM/OSMRβ轴通过促进肿瘤细胞产生CCL15来塑造免疫抑制性肿瘤微环境,从而在MASH相关HCC中驱动免疫逃逸的作用 | 揭示了OSM/OSMRβ轴在MASH-HCC中通过自分泌信号促进CCL15产生并塑造免疫抑制性肿瘤微环境的新机制,提出了OSM作为HCC治疗潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验,人类样本验证仍需进一步扩大;混合病因的TCGA数据分析可能引入混杂因素 | 探究OSM/OSMRβ轴在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)进展为肝细胞癌(HCC)过程中对肿瘤免疫微环境的调控作用 | MASLD/MASH患者(伴或不伴HCC)、野生型和肝细胞特异性OSMRβ缺陷小鼠的MASH-HCC模型、肝癌细胞系(HepG2, Huh7)及免疫细胞系(THP-1) | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体外共培养实验、转录组分析、磷酸化检测 | 基因敲除小鼠模型、细胞共培养模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床样本数据 | 人类MASLD/MASH患者队列、TCGA数据库HCC患者数据、野生型及hOSMRβ-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5224 | 2026-03-31 |
Multi-omics Analysis Revealed the Diagnostic and Therapeutic Value of Immunogenic Cell Death-derived SCN5A in Hepatocellular Carcinoma
2026-Mar, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01444-2
PMID:40272736
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了免疫原性细胞死亡相关基因SCN5A在肝细胞癌中的诊断和治疗潜力 | 首次将SCN5A鉴定为肝细胞癌中与免疫原性细胞死亡相关的关键生物标志物和治疗靶点,并通过分子对接发现抗心律失常药物普罗帕酮可作为SCN5A的高亲和力结合剂,展现出抗肿瘤效果 | 研究主要基于数据库分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的广泛验证 | 探索肝细胞癌的诊断和治疗新靶点 | 肝细胞癌 | 计算生物学与实验肿瘤学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、机器学习、分子对接、siRNA敲低、CCK8、Transwell、伤口愈合、TUNEL检测 | 机器学习预后模型 | RNA测序数据、细胞实验数据 | 四个数据库的综合分析,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5225 | 2026-03-31 |
Integrative Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal Functional and Spatial Heterogeneity of Atrial and Ventricular Cardiomyocytes in the Heart
2026-Mar, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01443-3
PMID:40488964
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了心脏中心房和心室心肌细胞的功能与空间异质性 | 首次整合单细胞RNA测序与空间定位技术,系统解析了心房和心室心肌细胞亚群的空间分布特征及其通过Igf2-Igf2r和Vegfb-Vegfr1等通路的细胞间通讯网络 | 研究基于分离的心脏细胞进行单细胞测序,可能丢失部分组织原位空间信息;样本来源和数量未具体说明 | 阐明心房和心室心肌细胞在心脏组织中的空间分布格局、细胞间通讯网络及其在能量代谢、泵功能和电信号传导中的功能差异 | 心脏组织中的心房心肌细胞和心室心肌细胞亚群 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | PCA, t-SNE | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5226 | 2026-03-31 |
3D "Emboli" Culture Models Epithelial Breast Cancer Cell Oxidative Mitochondrial Metabolism with Relevance for Lung Metastasis
2026-Mar-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0587
PMID:41706033
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研究论文 | 本研究比较了两种三维细胞培养模型(乳腺球培养和“栓子”培养)对乳腺癌细胞代谢和转移潜能的影响,发现“栓子”培养模型能更好地模拟上皮性乳腺癌细胞的氧化线粒体代谢,并与肺转移相关 | 首次系统比较了乳腺球培养和“栓子”培养模型对乳腺癌细胞表型的影响,并揭示了“栓子”培养模型能特异性地富集与肺转移相关的基因(如ID1),且使细胞对OXPHOS抑制高度敏感但对氧化应激更具抵抗力 | 研究仅使用了三种乳腺癌细胞系(SUM149、IBC-3和MDA-MB-468),且“栓子”培养模型最初是为炎性乳腺癌设计的,其普适性有待进一步验证 | 比较不同三维细胞培养模型在模拟乳腺癌生物学特性方面的适用性,并探究其与肺转移相关的代谢特征 | 乳腺癌细胞系(SUM149、IBC-3和MDA-MB-468) | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 蛋白质组学、单细胞转录组学、代谢通量分析、电子显微镜超微结构定量分析 | 三维细胞培养模型(乳腺球培养模型和“栓子”培养模型) | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、代谢通量数据、电子显微镜图像 | 三种乳腺癌细胞系 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 5227 | 2026-03-31 |
Enrichment of Neural Crest Cells by Antibody Labeling and Flow Cytometry for Single-Cell Transcriptomics in a Lizard
2026-Mar, Evolution & development
IF:2.6Q2
DOI:10.1111/ede.70030
PMID:41709476
|
研究论文 | 本文提出了一种结合抗体标记和流式细胞分选来富集神经嵴细胞的新方法,并在普通壁蜥中进行了验证 | 开发了一种不依赖转基因工具、适用于缺乏转基因模型的脊椎动物的神经嵴细胞富集方法 | 方法主要在蜥蜴胚胎中验证,在其他脊椎动物中的普适性需进一步测试 | 克服神经嵴细胞在发育胚胎中动态迁移和时空异质性带来的识别与分离挑战 | 普通壁蜥(Podarcis muralis)胚胎中的神经嵴细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 抗体标记、流式细胞分选、单细胞RNA测序、RT-qPCR、显微镜观察 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5228 | 2026-03-31 |
Compartmentalized VEGF receptor expression in hypothalamic tanycytes reveals a novel non-endothelial axis of VEGF signaling : Tanycytes as a novel non-endothelial target of VEGF signaling
2026-Feb-14, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-026-00774-w
PMID:41691203
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研究论文 | 本研究首次揭示了血管内皮生长因子(VEGF)及其受体在下丘脑伸长细胞中存在一种非内皮、空间区室化、发育程序化且年龄依赖的信号系统 | 首次发现并描绘了VEGF受体在下丘脑伸长细胞中的空间区室化表达模式,揭示了VEGF信号在非内皮脑细胞(特别是伸长细胞)中的新作用,并证明了该信号系统在发育和衰老过程中的动态变化及部分跨物种保守性 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据来自空间转录组学分析,功能验证和具体的信号下游机制仍需进一步实验探索 | 探究VEGF信号在下丘脑,特别是在血/脑脊液屏障关键细胞——伸长细胞中的空间分布、细胞类型特异性功能及其在发育和衰老过程中的变化 | 小鼠(雄性和雌性)及人类的下丘脑组织,重点关注下丘脑伸长细胞 | 神经科学,分子细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)再分析,RNAscope原位杂交,免疫组织化学,流式细胞分选(FACS)分离后qPCR,人类空间转录组学 | NA | 基因表达数据(RNA-seq,qPCR),空间定位数据(原位杂交,免疫组化) | 涉及雄性和雌性小鼠,以及人类组织样本(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 5229 | 2026-03-31 |
cRGD-Functionalized macrophage extracellular vesicles loaded with GSK2033 enhance T cell antitumor immunity in GBM by disrupting the LXR/ABCA1-Mediated Myelin lipid transfer axis
2026-Feb-14, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04116-8
PMID:41691219
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研究论文 | 本研究开发了一种cRGD功能化的巨噬细胞外囊泡负载GSK2033的纳米颗粒(cEV@GSK),用于增强T细胞介导的抗胶质母细胞瘤免疫,并通过破坏LXR/ABCA1介导的髓鞘脂质转移轴实现 | 首次利用cRGD功能化的巨噬细胞外囊泡作为载体,负载LXR拮抗剂GSK2033,靶向破坏胶质母细胞瘤中LXR/ABCA1介导的髓鞘脂质转移轴,从而增强T细胞抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠原位胶质母细胞瘤模型,其临床转化效果及人体安全性仍需进一步验证 | 开发一种新型的胶质母细胞瘤免疫治疗策略,通过调节肿瘤微环境中的脂质代谢增强T细胞功能 | 胶质母细胞瘤(GBM)及其免疫抑制微环境,特别是脂质负载巨噬细胞(LLMs)与T细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质组学分析、高效液相色谱(HPLC)、透射电子显微镜(TEM) | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、图像数据 | 使用原位胶质母细胞瘤小鼠模型进行研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5230 | 2026-02-14 |
Identification of key regulators for the development of Prunus leaves using single-cell RNA sequencing
2026-Feb-12, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-026-08348-6
PMID:41680607
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5231 | 2026-03-31 |
Loss of Intestinal Endosome-associated Protein Sorting Nexin 27 Disrupts Epithelial Barrier and Promotes Inflammation
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101682
PMID:41260570
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研究论文 | 本研究探讨了分选连接蛋白SNX27在肠道稳态中的作用,发现其缺失会破坏上皮屏障并促进炎症 | 首次揭示了SNX27在肠道上皮细胞中的关键作用,并建立了肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠模型 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本分析依赖于现有数据库,需要进一步验证SNX27在人类IBD中的具体机制 | 确定SNX27在调节肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的未知作用 | 人类炎症性肠病(IBD)样本、肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠 | 分子生物学与病理学 | 炎症性肠病(包括溃疡性结肠炎和克罗恩病) | 单细胞RNA测序、基因表达分析、小鼠模型构建 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织病理学数据 | 未明确具体样本数量,使用了NCBI GEO数据库和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5232 | 2026-03-31 |
Adoptive cellular therapy prevents reconstitution of myeloid-derived suppressor cells in the glioma tumor microenvironment
2026 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdag054
PMID:41908149
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研究论文 | 本研究探讨了针对胶质母细胞瘤的过继细胞疗法如何通过调节CCL12信号通路,阻止髓源性抑制细胞在肿瘤微环境中的积累,从而增强抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示了过继细胞疗法通过减少肿瘤相关巨噬细胞来源的CCL12,抑制髓源性抑制细胞向胶质瘤肿瘤微环境的迁移,这一机制先前未被认识 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证;CCL12在MDSC招募中的因果作用需要未来体内研究进一步确认 | 探究过继细胞疗法如何影响免疫恢复,特别是对髓源性抑制细胞在胶质瘤肿瘤微环境中积累的调控机制 | 胶质母细胞瘤(GBM)模型小鼠,重点关注髓源性抑制细胞(MDSCs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 流式细胞术、空间基因组学、多重蛋白分析、单细胞转录组学、Trans-well迁移实验 | NA | 细胞表型数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 | 使用KR158B胶质瘤荷瘤小鼠模型进行研究,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5233 | 2026-03-31 |
Single-cell analysis of ovarian myeloid cells identifies age-associated changes in macrophages and signaling dynamics†
2025-Aug-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf122
PMID:40459236
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和流式细胞术分析年轻与年老小鼠卵巢中的髓系细胞,揭示了与年龄相关的巨噬细胞亚群变化及信号通路动态 | 首次在年老小鼠卵巢中鉴定出独特的Cx3cr1lowCd81hi巨噬细胞亚群,并发现ANNEXIN和TGFβ信号通路的显著改变,为卵巢衰老相关的炎症和纤维化提供了新机制 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本,且样本量相对较小 | 探究卵巢衰老过程中髓系细胞的功能特征和信号动态变化 | 年轻(3个月)和年老(14-17个月)小鼠卵巢中的CD45+ CD11b+髓系细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | RNA序列数据, 流式细胞数据 | 年轻和年老小鼠卵巢样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5234 | 2026-03-31 |
The Advance of Single-Cell RNA Sequencing Applications in Ocular Physiology and Disease Research
2025-08-04, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15081120
PMID:40867565
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在眼生理学和疾病研究中的应用进展 | 系统总结了scRNA-seq如何通过单细胞水平的高分辨率分析,揭示眼部细胞异质性、识别疾病特异性基因谱,并推动新型生物标志物和治疗靶点的发现 | 作为一篇综述文章,未提出新的实验数据或方法,主要基于现有文献进行归纳总结 | 回顾和总结scRNA-seq技术在眼生理学和病理学研究中的应用进展与潜力 | 眼部组织,包括与近视、眼表和角膜疾病、青光眼、葡萄膜炎、视网膜疾病及眼部肿瘤相关的各类细胞 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5235 | 2026-03-31 |
Spatial Transcriptomics Decodes Breast Cancer Microenvironment Heterogeneity: From Multidimensional Dynamic Profiling to Precision Therapy Blueprint Construction
2025-07-24, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15081067
PMID:40867511
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在乳腺癌研究中的应用,重点探讨其在解析肿瘤异质性、表征肿瘤微环境、阐明疾病进展与转移机制以及预测治疗反应方面的作用 | 系统性地将空间转录组学定位为整合多组学数据的枢纽技术,并提出了其在构建乳腺癌精准治疗蓝图中的路线图 | 作为一篇综述文章,其局限性在于主要总结现有研究,而非提出新的原始数据或实验验证 | 旨在综合空间转录组学在乳腺癌研究中的应用,并探索其如何连接分子图谱与临床转化以推动精准治疗 | 乳腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5236 | 2026-03-31 |
Targeting Sodium Transport Reveals CHP1 Downregulation as a Novel Molecular Feature of Malignant Progression in Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Insights from Integrated Multi-Omics Analyses
2025-07-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15071019
PMID:40723891
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析,揭示了钠离子转运相关基因CHP1下调是透明细胞肾细胞癌恶性进展的新分子特征 | 首次通过整合单细胞RNA测序、蛋白质组学等多组学数据,系统揭示了CHP1在ccRCC恶性进展中的下调模式及其作为预后生物标志物的潜力,并筛选出靶向CHP1的候选化合物 | 研究主要基于回顾性数据分析,需要进一步的体内外实验验证CHP1的功能机制和候选化合物的治疗效果 | 构建ccRCC的细胞和转录组全景图,揭示恶性进展过程中的基因表达动态 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC) | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,免疫组化,分子对接,虚拟筛选 | 伪时间轨迹分析,Mfuzz聚类,细胞间通讯建模 | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,免疫组化图像,细胞系数据 | 90个scRNA-seq样本,包含534,227个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 5237 | 2026-03-31 |
Podocyte YAP and TAZ hyperactivation drives glomerular epithelial proliferative diseases in mice and humans
2025-Jun-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adq3852
PMID:40560997
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研究论文 | 本研究通过免疫染色和空间转录组学分析,揭示了足细胞中YAP和TAZ的异常过度激活是驱动肾小球上皮细胞增殖性疾病的共同机制 | 首次发现足细胞YAP-TAZ过度激活是多种肾小球上皮增殖性疾病的共同驱动因子,为这类疾病提供了统一的致病机制解释 | 研究主要基于小鼠模型和人类活检样本,需要进一步验证在更广泛人群中的普适性 | 探究肾小球上皮细胞增殖性疾病的共同致病机制 | 人类肾活检样本(塌陷性肾小球病和ANCA血管炎诱导的新月体性肾小球肾炎患者)及小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 免疫染色,空间转录组学 | NA | 图像,空间转录组数据 | 人类肾活检样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5238 | 2026-03-31 |
Pseudoassembly of k-mers
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.11.653354
PMID:40463286
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研究论文 | 本文介绍了一种通过彩色de Bruijn图识别基因组序列变异的方法,并实现了名为klue的程序进行伪组装 | 提出基于彩色de Bruijn图的伪组装方法,能够从单细胞RNA-seq数据中识别细胞类型特异性变异 | NA | 开发一种识别基因组序列变异的新方法 | 小鼠黑色素瘤模型中的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | 彩色de Bruijn图 | 基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5239 | 2026-03-31 |
Molecular and Biophysical Perspectives on Dormancy Breaking: Lessons from Yeast Spore
2025-05-11, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050701
PMID:40427594
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综述 | 本文综述了当前关于细胞休眠分子机制的知识,特别聚焦于两种主要酵母模型,并总结了通过单细胞RNA-seq、蛋白质组学分析和活细胞成像等多方面方法揭示的基因表达、蛋白质组组成和活力的动态变化 | 整合了分子和生物物理视角,特别是通过研究细胞质流动性变化来理解休眠细胞调控,提供了对休眠和休眠打破过程的新理解 | NA | 阐明休眠和休眠打破的分子和生物物理原理 | 酵母孢子作为模型系统,以及广泛的物种如细菌、真菌、植物和缓步动物 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学分析, 活细胞成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5240 | 2026-03-31 |
Interpreting single-cell and spatial omics data using deep neural network training dynamics
2024-12, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00721-5
PMID:39633094
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研究论文 | 本研究开发了Annotatability框架,通过监测深度神经网络在单细胞和空间组学数据上的训练动态,来识别注释不匹配并表征生物数据结构 | 提出了一种基于深度神经网络训练动态的新方法,用于评估细胞注释的可靠性并揭示生物信号结构,结合信号感知图嵌入技术进行下游分析 | 未明确说明方法在更大规模或更复杂数据集上的可扩展性,且依赖于预定义的细胞注释,可能受注释主观性影响 | 解决单细胞和空间组学数据注释中的模糊性和错误问题,以更好地解释细胞类型、状态和异质性 | 单细胞和空间组学数据中的细胞注释和生物信号结构 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,空间组学 | 深度神经网络 | 单细胞RNA测序数据,空间组学数据 | 八个单细胞RNA测序和空间组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |