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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-06-02 |
Integrated Transcriptomics and Experimental Validation Reveal Müller Cell-Driven PANoptosis in Diabetic Retinopathy via PSAP-GPR37 Signaling
2026, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S585908
PMID:42221844
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研究论文 | 综合转录组学与实验验证揭示Müller细胞通过PSAP-GPR37信号通路驱动糖尿病视网膜病变中的PANoptosis | 首次整合单细胞与批量转录组学,明确Müller细胞亚群通过PSAP-GPR37信号轴驱动糖尿病视网膜病变中PANoptosis的新型机制,并筛选出潜在的治疗靶点 | 结果主要基于动物模型和体外细胞实验,缺乏人体临床样本的直接验证,且未深入探讨其他细胞类型在PANoptosis中的交互作用 | 阐明Müller细胞在糖尿病视网膜病变中通过膜蛋白介导的PANoptosis及其亚群特异性机制 | 糖尿病视网膜病变模型大鼠、高糖处理视网膜Müller细胞(RMC-1) | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、基因集富集分析、细胞通讯分析、蛋白质相互作用网络构建 | NA | 基因表达数据 | 大鼠视网膜组织样本及体外培养细胞 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 502 | 2026-06-02 |
Uromodulin as a genetically anchored biomarker stratifies time to valve intervention in aortic regurgitation
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1839906
PMID:42222106
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研究论文 | 该研究通过英国生物银行数据发现,尿调素可作为主动脉瓣反流患者术前进展和手术时机的遗传锚定生物标志物,与传统肾脏标志物相比具有独立预测价值 | 首次将尿调素确定为遗传锚定的肾脏特异性生物标志物,将肾-主动脉瓣反流 paradigm 从术后风险修正转向基于肾小管驱动疾病进展的机制模型,为早期风险分层提供新依据 | 研究仅基于英国生物银行数据,可能限制通用性;未涉及更早期疾病阶段或更长的随访时间;单细胞数据源自公共数据库,缺乏患者特异性验证 | 探究肾脏生物标志物在主动脉瓣反流患者术前疾病进展中的关联,并评估尿调素作为生物标志物的潜力 | 英国生物银行中2,493名主动脉瓣反流患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | Cox比例风险模型、逻辑回归 | 临床影像数据、基因组学数据、单细胞RNA测序数据 | 2,493名主动脉瓣反流患者(来自英国生物银行) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 利用Kidney Cell Atlas公共数据库的单细胞RNA测序数据 |
| 503 | 2026-06-02 |
Ferroptosis-pyroptosis crosstalk signature as prognostic biomarkers and therapeutic targets in sepsis-induced ARDS
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1810674
PMID:42222337
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研究论文 | 探讨铁死亡与焦亡交叉作用在脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征中的预后生物标志物和治疗靶点 | 首次系统分析铁死亡与焦亡通路在脓毒症相关ARDS中的交叉作用,并鉴定出10个交叉关键基因 | 未提及具体局限性 | 阐明铁死亡与焦亡交叉作用在脓毒症相关ARDS中的分子机制并验证其作为生物标志物的潜力 | 脓毒症和ARDS患者的基因表达数据及免疫细胞群体 | 生物信息学 | 脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 定量PCR, ELISA | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 504 | 2026-06-02 |
Genetic Loci Associated With Periodontitis: The FinnGen Study Based on National Health Registers
2025-09, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14193
PMID:40682483
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研究论文 | 利用FinnGen队列和全国健康登记数据,对牙周炎进行全基因组关联研究,识别出11个遗传位点 | 基于芬兰全国健康登记中的诊断和手术编码以及CPI指数设计三种牙周炎表型,并发现6个新的遗传位点 | 未在论文摘要中明确说明局限性 | 探索牙周炎的遗传因素及其与其他复杂性状的遗传相似性 | 近25万名芬兰公共医疗牙科就诊者 | 机器学习 | 牙周炎 | GWAS,单细胞RNA测序 | NA | 基因型数据,单细胞RNA表达数据 | 约250,000名芬兰个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 505 | 2026-06-02 |
Progress and new challenges in image-based profiling
2025-Aug-07, ArXiv
PMID:40799808
|
综述 | 综述了基于图像的轮廓分析在计算领域的发展现状,包括当前程序、局限性及未来发展方向 | 系统梳理了深度学习对基于图像的轮廓分析的变革性影响,包括特征提取、可扩展性和多模态数据整合的改进 | 该领域仍面临显著挑战,需要创新解决方案 | 为研究人员提供基于图像的轮廓分析技术演进的路线图 | 基于图像的轮廓分析方法及其计算工具 | 计算机视觉 | NA | NA | 深度学习 | 显微图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 506 | 2026-06-02 |
Correlative analysis of metallomic gene expression and metal ion content within the mouse hippocampus
2025-03-28, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf009
PMID:40175292
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研究论文 | 通过X射线荧光显微镜和空间转录组学相结合的多模态方法,研究小鼠海马体中金属组基因表达与金属离子含量的相关性 | 首次将元素图谱与空间转录组学结合,揭示海马体关键亚区金属异质性的分子基础 | 文中未提及具体局限 | 揭示海马体神经金属组图谱的分子基础及其区域异质性机制 | 小鼠海马体及其亚区 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | X射线荧光显微镜, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 507 | 2026-06-02 |
Dynamic Reprogramming of Stromal Pdgfra-expressing cells during WNT-Mediated Transformation of the Intestinal Epithelium
2025-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.22.634326
PMID:39896606
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研究论文 | 研究WNT介导的肠道上皮转化过程中基质Pdgfra表达细胞的动态重编程 | 首次揭示Pdgfra成纤维细胞在WNT驱动肿瘤发生早期分泌配体促进肠黏膜再生样状态 | 未明确说明 | 探究WNT介导的肠道肿瘤发生过程中基质成纤维细胞的动态变化及与上皮细胞的相互作用 | 小鼠肠道间充质细胞和上皮细胞 | 机器学习 | 肠道肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 508 | 2026-06-02 |
Glucocorticoid receptor inhibits Th2 immune responses by down-regulating Pparg and Gata3 in schistosomiasis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1518586
PMID:40196108
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研究论文 | 本研究探究糖皮质激素受体激活通过下调Pparg和Gata3抑制血吸虫病中Th2免疫反应的机制 | 首次整合RNA测序和单细胞测序揭示GR激活通过下调关键转录因子Gata3和Pparg抑制血吸虫病Th2免疫反应的分子机制 | 需要进一步研究评估靶向GR激活治疗血吸虫病的可行性和安全性 | 探究GR激活对血吸虫病肝脏Th2免疫反应的影响及其分子机制 | 日本血吸虫感染小鼠模型和Th2细胞 | 机器学习和数字病理学 | 血吸虫病 | RNA测序,单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 感染日本血吸虫的小鼠及体外培养的Th2细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 509 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing offers opportunities to explore the depth of physiology, adaptation, and biochemistry in non-model organisms exposed to pollution
2024-12, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101339
PMID:39393164
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综述 | 本短篇综述强调了单细胞RNA测序在揭示基因型-表型关系中的关键作用,特别是在非模式生物对环境污染反应中的应用潜力 | 将单细胞RNA测序的应用范围从典型疾病研究扩展到非模式生物对环境污染物的反应,提供了对细胞异质性的全面理解 | 未详细讨论单细胞RNA测序在非模式生物中应用的技术挑战或数据分析难点 | 通过分析已发表文章,说明单细胞RNA测序在生物学领域的最新进展,并探讨其在非模式生物对环境污染反应研究中的潜力 | 单细胞RNA测序应用相关的已发表文章 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 510 | 2026-06-02 |
Batch effects correction in scRNA-seq based on biological-noise decoupling autoencoder and central-cross loss
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出基于生物噪声解耦自编码器和中心交叉损失的BDACL模型,用于消除单细胞RNA测序数据的批次效应 | 通过自编码器重构数据和层次聚类树逐步合并小簇,引入中心交叉损失以无监督方式消除批次效应,同时保留稀有细胞类型 | 未提及具体局限性 | 解决单细胞RNA测序数据中批次效应导致稀有细胞类型信息丢失的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 511 | 2026-06-02 |
CopyMix: Mixture model based single-cell clustering and copy number profiling using variational inference
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出CopyMix模型,通过变分推断同时进行单细胞聚类和拷贝数变异分析,以研究肿瘤异质性 | 首次通过变分推断联合推断细胞聚类及其拷贝数谱,避免了传统分步处理中引入的人为聚类伪影 | 未明确说明局限性 | 开发一种能同时进行单细胞聚类和拷贝数谱推断的方法,以更好地研究肿瘤异质性 | 肿瘤细胞亚群 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞DNA测序 | 混合隐马尔可夫模型 | 拷贝数数据 | NA | NA | 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 512 | 2026-06-02 |
Deconvolution of cell-type-associated markers predictive of response to neoadjuvant radiotherapy
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据,对直肠癌新辅助放疗前样本进行细胞类型解卷积,识别预测放疗反应的细胞类型相关标记 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据,系统解析了直肠癌新辅助放疗响应的细胞类型特异性标记及其相互作用网络 | 未明确说明具体局限性 | 揭示直肠癌放疗后耐药和复发的细胞来源分子标记及治疗靶点 | 直肠癌患者新辅助放疗前的肿瘤样本 | 数字病理学, 机器学习 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 三个独立数据集(GSE119409、GSE35452、GSE45404) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-05, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示IL-7抗癌免疫疗法介导的髓系细胞和T细胞共刺激作用 | 首次发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多效性表达,并证明重组IL-7疗法通过激活T细胞和促炎性髓系细胞诱导抗肿瘤免疫 | 检查点抑制剂的靶点缺乏表达和免疫抑制细胞的持续存在限制了其普遍疗效 | 探索IL-7疗法作为替代方法共刺激T细胞和免疫微环境以克服检查点抑制剂的局限性 | 多种人类癌症和鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种人类癌症样本和鼠肿瘤移植模型样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 514 | 2026-06-02 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Response of Renal Lymphatic Endothelial Cells to Acute Kidney Injury
2024-05-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000325
PMID:38506705
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序表征小鼠肾淋巴内皮细胞在静息和顺铂损伤肾中的反应,首次描述肾淋巴内皮细胞异质性并揭示其调节AKI局部免疫反应的分子通路 | 首次描述肾淋巴内皮细胞异质性并揭示其调节AKI局部免疫反应的新分子通路,为AKI治疗提供潜在靶点 | 仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证;仅分析了顺铂损伤后72小时时间点,未涵盖AKI全病程 | 探究肾淋巴内皮细胞在急性肾损伤中的反应及其免疫调节作用 | 小鼠肾淋巴内皮细胞(顺铂损伤和缺血再灌注损伤模型)及体外培养人淋巴内皮细胞 | 单细胞基因组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾脏样本(顺铂损伤组和对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 515 | 2026-06-02 |
Tissue niches and immunopathology through the lens of spatial tissue profiling techniques
2024-02, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350484
PMID:37985207
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综述 | 本综述通过空间组织分析技术探讨了组织微环境与免疫病理学的关系,强调了多组学组织学和空间转录组学在研究免疫反应中的重要性 | 综合讨论了空间组织分析技术相较于传统组织病理学研究的优势,并指出了其在疾病诊断和治疗中的革命性潜力 | 承认了空间组织分析技术存在挑战和局限性 | 探讨空间组织分析技术如何揭示组织微环境调控区域免疫的机制,及其在组织免疫病理学中的相关性 | 组织微环境、免疫反应、空间组织分析技术 | 计算机视觉, 机器学习 | 癌症, 自身免疫性疾病, 感染性疾病 | 空间转录组学, 多重组织学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学, 多重组织学 | NA | NA |
| 516 | 2026-06-02 |
Distinct immune escape and microenvironment between RG-like and pri-OPC-like glioma revealed by single-cell RNA-seq analysis
2024-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-1017-7
PMID:37955814
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq分析揭示RG样和pri-OPC样胶质瘤之间不同的免疫逃逸和微环境特征 | 首次将胶质瘤分为原始少突胶质前体细胞样和放射状胶质样亚型,并发现它们在免疫逃逸机制上的显著差异,尤其是pri-OPC样肿瘤中MHC-I基因下调以及肿瘤浸润淋巴细胞中特定基因表达与免疫检查点和不良预后的关联 | 样本量较小,仅基于26例胶质瘤的单细胞RNA-seq分析,且结论主要依赖公共数据库验证,可能缺乏广泛的临床代表性 | 研究神经发生和胶质发生与胶质瘤的关系,揭示不同胶质瘤亚型的免疫逃逸机制 | 26例胶质瘤样本及其肿瘤浸润淋巴细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组表达数据 | 26例胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 517 | 2026-06-02 |
Tumor-derived exosomes induce initial activation by exosomal CD19 antigen but impair the function of CD19-specific CAR T-cells via TGF-β signaling
2024-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-1010-1
PMID:37870681
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研究论文 | 研究了肿瘤来源外泌体通过外泌体CD19抗原诱导初始激活,但通过TGF-β信号损害CD19特异性CAR-T细胞功能 | 首次揭示了B细胞淋巴瘤来源外泌体对CD19-CAR T细胞的双重作用:初始激活与后续抑制,并发现TGF-β抑制剂可逆转抑制作用 | 未明确外泌体诱导CAR-T细胞凋亡和功能损害的具体分子机制细节 | 探究淋巴瘤来源外泌体对CD19-CAR T细胞功能的影响及其机制 | B细胞淋巴瘤来源外泌体、CD19-CAR T细胞、淋巴瘤患者血浆外泌体 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究对象包括来自淋巴瘤患者的血浆外泌体及CD19-CAR T细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 518 | 2026-06-02 |
Underrepresentation of activating KIR gene expression in single-cell RNA-seq data is due to KIR gene misassignment
2024-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350590
PMID:37944995
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研究论文 | 研究指出标准单细胞RNA测序比对流程易将杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)转录本错误分配,导致活化型KIR基因表达被低估 | 首次揭示单细胞RNA-seq数据中KIR基因错误分配是导致激活型KIR表达被低估的根本原因 | 未提供具体解决方案或替代比对算法来纠正KIR基因错误分配问题 | 阐明单细胞RNA-seq数据中KIR基因表达低估的机制原因 | KIR基因转录本及单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 519 | 2026-06-02 |
Macrophage heterogeneity in atherosclerosis: A matter of context
2024-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350464
PMID:37943053
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综述 | 探讨动脉粥样硬化中巨噬细胞的异质性与功能特化及其与微环境的关系 | 强调巨噬细胞在动脉粥样硬化中具有高度异质性和功能特化,并指出传统炎症/抗炎范式不足以解释其复杂致病机制,提出空间多组学方法的重要性 | 对局部微环境在动脉粥样硬化中塑造巨噬细胞表型和功能的作用仍大多未被描述 | 综述巨噬细胞在动脉粥样硬化中的起源、功能特化、表型多样性及微环境的影响 | 巨噬细胞亚群(小鼠和人类动脉粥样硬化模型中的斑块巨噬细胞) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3' |
| 520 | 2026-06-02 |
Two distinct molecular faces of preeclampsia revealed by single-cell transcriptomics
2023-10-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.07.005
PMID:37572658
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示先兆子痫的两种不同分子面孔 | 首次通过单细胞和单核转录组学分析,系统揭示了早发型和晚发型先兆子痫在胎盘各细胞类型中的分子差异,发现早发型先兆子痫存在广泛的基因表达失调,而晚发型则影响极小;并鉴定了胎儿来源的Hofbauer细胞和母体来源的TREM2巨噬细胞作为炎症的关键角色 | 未明确说明,但研究主要基于胎盘样本,可能未涵盖全身其他组织的分子变化 | 解析早发型和晚发型先兆子痫中胎盘不同细胞类型的功能变化,提供两种疾病的分子证据 | 早发型和晚发型先兆子痫患者与孕周匹配对照组的胎盘样本 | 数字病理学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 早发型和晚发型先兆子痫及对照组的胎盘单细胞和单核样本,具体数量未明确 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 和单核测序,Illumina NovaSeq测序平台 |