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当前共找到 38417 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-04-11 |
Spatial transcriptomics for gene discovery identifies Slc13a5 as a modulator of bone mechanoadaptation
2026-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.11.711126
PMID:41958988
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，在小鼠胫骨中识别了机械负荷诱导的基因表达变化，并发现Slc13a5作为骨机械适应的调节因子 | 首次应用空间转录组学（GeoMx, NanoString）系统分析骨组织在机械负荷下的空间特异性基因表达，并验证了跨平台一致性基因 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；空间转录组学技术可能受分辨率限制 | 识别骨机械适应的关键分子调节因子，以开发针对骨脆性疾病的治疗策略 | 小鼠胫骨组织，特别是骨膜和骨室在张力和压缩区域的细胞 | 空间转录组学 | 骨脆性疾病 | 空间转录组学，RNA-seq，激光捕获显微切割 | NA | 空间基因表达数据，RNA-seq数据 | 小鼠胫骨样本，具体数量未明确说明 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组学平台 |
| 502 | 2026-04-11 |
STEVE: Single-cell Transcriptomics Expression Visualization and Evaluation
2026-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.10.710898
PMID:41959208
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研究论文 | 本文提出了一个名为STEVE的定量框架，用于评估单细胞RNA测序研究中细胞类型注释的准确性、稳健性和可重复性 | 开发了首个系统性框架，可在数据集特定方式或完整分析流程背景下评估细胞类型注释的稳健性，并提供了统一的概率框架进行一致性置信度估计 | 框架主要针对单细胞RNA测序数据，未涉及其他单细胞组学技术；评估依赖于实验定义或专家标注的细胞类型标签 | 解决单细胞RNA测序中细胞类型注释的准确性和可重复性评估问题 | 单细胞RNA测序数据及其细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率框架 | 单细胞RNA测序数据 | 四个独立单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 503 | 2026-04-11 |
Systematic clustering alignment and feature characterization for single-cell omics using ACE-OF-Clust
2026-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710668
PMID:41959377
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ACE-OF-Clust的工具，用于解决单细胞组学数据聚类分析中的对齐与特征表征问题 | 提出了一个四步工作流程，首次实现了聚类解决方案的直接比较、与注释的一致性评估，并利用特征级聚类谱来优先识别区分细胞类型的基因 | 未明确说明算法在处理超大规模数据集时的计算效率限制 | 提高单细胞聚类分析的可解释性、灵活性和鲁棒性，以研究细胞异质性和基因表达动态 | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据以及多组学单细胞数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学分析 | 混合隶属度聚类模型 | 转录组数据、空间表达数据、多组学数据 | PBMC单细胞RNA测序数据和乳腺癌空间转录组数据（具体样本数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 504 | 2026-04-11 |
scDEcrypter: Uncertainty-aware differential expression analysis for viral infection in scRNA-seq
2026-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710583
PMID:41959296
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scDEcrypter的惩罚双向混合模型，用于解决单细胞RNA测序中病毒感染的差异表达分析问题 | 利用部分感染状态标签和细胞类型等额外变量，通过数据分割避免双重利用，实现快速基于似然的推断 | NA | 改进病毒感染单细胞RNA测序中的差异表达分析 | 病毒感染的单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 惩罚双向混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 505 | 2026-04-11 |
Rejuvenation of the Aged Cerebrovascular System via Protein Corona-Guided Fusogenic Liposome Delivery
2026-Mar-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.05.709925
PMID:41959031
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研究论文 | 本文介绍了一种利用载脂蛋白E富集的蛋白冠引导的融合性脂质体递送系统，用于改善白藜芦醇向脑血管系统的靶向递送，以对抗血管衰老和认知衰退 | 开发了一种新型的ApoE功能化融合性脂质体纳米载体，它能够自发形成富含ApoE的蛋白冠，通过直接与细胞膜融合（而非内存作用）来规避溶酶体降解，并利用ApoE-LRP1通路实现高效的脑血管靶向和长程递送 | 研究主要在细胞模型和老年小鼠中进行，尚未在更大型的动物模型或人类中进行验证；长期安全性和潜在的免疫原性有待进一步评估 | 开发一种高效的纳米药物递送系统，以靶向治疗与年龄相关的脑血管功能障碍和认知衰退 | 老年小鼠的脑血管系统、人脑微血管内皮细胞 | NA | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用人脑微血管内皮细胞和C57BL/6老年小鼠进行评估 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 506 | 2026-04-11 |
TWIST1-Mediated Induction of AEBP1 in Fibroblast-Like Synoviocytes Activates Transforming Growth Factor β Signaling to Drive Angiogenesis and Promote Rheumatoid Arthritis
2026-Mar-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70124
PMID:41787682
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了在类风湿关节炎中，位于滑膜下层的POSTN+成纤维样滑膜细胞亚群通过TWIST1-AEBP1-POSTN轴驱动疾病进展的机制 | 识别了致病性POSTN+ FLS亚群，并阐明了TWIST1-AEBP1-POSTN轴在调控该亚群激活、细胞外基质重塑和血管生成中的关键作用 | 研究主要基于小鼠胶原诱导性关节炎模型，人类样本的验证可能有限，且药理抑制TWIST1的长期效果和安全性需进一步评估 | 旨在识别导致滑膜增生、ECM重塑和血管翳形成的致病性FLS亚群，阐明其分子调控机制，并探索靶向治疗策略 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织、成纤维样滑膜细胞以及胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | bulk RNA测序、蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | RNA测序数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 507 | 2026-04-11 |
Single cell and multi-omics analysis reveal senescence-related molecular subtypes and a prognostic signature in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04674-1
PMID:41770477
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中细胞衰老相关的分子亚型，并构建了一个基于衰老相关基因的预后风险评分模型 | 首次在ccRCC中系统地表征了细胞衰老特征，定义了两种基于衰老相关基因表达的分子亚型，并识别了ALDH18A1作为一个关键的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步的实验验证来阐明衰老相关基因在ccRCC中的具体分子机制 | 阐明细胞衰老在ccRCC中的特征、临床意义及预后价值 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量转录组测序 | 随机生存森林（RSF） | 转录组数据 | 多个队列总计超过700个样本（包括TCGA-KIRC 537例，E-MTAB-1980 101例，CPTAC-ccRCC 105例，以及单细胞数据集GSE222703和GSE210042） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 508 | 2026-04-11 |
Computational framework for therapeutic target discovery via perturbation simulation: application to cystic fibrosis airway disease
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag129
PMID:41883030
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研究论文 | 提出一个整合单细胞转录组学、加权基因共表达网络分析和计算扰动模拟的计算框架，用于系统发现新的治疗靶点，并以囊性纤维化气道疾病为例进行应用 | 开发了一个结合多尺度生物数据和系统级扰动模拟的新型计算框架，能够高效、系统地发现高新颖性治疗靶点 | 未在论文摘要中明确说明 | 开发一个用于系统级治疗靶点发现的计算方法 | 囊性纤维化气道疾病 | 计算生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，计算扰动模拟 | 知识图谱，扰动模拟算法 | 单细胞转录组数据 | 38名患者的51,415个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 509 | 2026-04-11 |
BEASTsim-a benchmarking and analysis platform for spatial transcriptomics simulations
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag144
PMID:41947420
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研究论文 | 本文介绍了一个名为BEASTsim的综合性基准测试平台，用于评估空间转录组学模拟方法 | BEASTsim平台不仅评估模拟方法在数据属性分布和生物信号保留方面的表现，还通过相似性指标确保模拟引入有意义的生物变异，而非简单复制输入数据 | NA | 开发一个基准测试和分析平台，以标准化评估空间转录组学模拟方法，促进空间转录组学与单细胞RNA测序数据的整合 | 空间转录组学模拟方法 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 决策树 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 510 | 2026-04-11 |
Therapeutic strategy for cervical gastric-type adenocarcinoma by targeting CLU to relieve CLU-associated stress and sensitize chemotherapy
2026-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbag003
PMID:41878236
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研究论文 | 本研究探索了宫颈胃型腺癌的致癌机制，并验证了靶向CLU联合化疗的治疗策略 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了CLU相关热应激在GAS恶性微环境中的作用，并构建了GAS来源的类器官模型用于药物测试 | 样本量较小（单细胞测序仅5例样本），且类器官模型仍需进一步验证其临床相关性 | 探索宫颈胃型腺癌的致癌机制并寻找有效治疗靶点 | 宫颈非HPV相关腺癌患者组织样本及GAS来源的类器官 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，免疫组化染色 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 临床队列172例患者，单细胞测序5例，免疫组化50例，类器官实验未明确数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 511 | 2026-04-11 |
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-Feb-28, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04733-y
PMID:41764477
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研究论文 | 本研究开发了基于肝窦细胞特异性基因特征的生物标志物评分，用于慢性肝病的诊断和预后预测 | 首次整合肝窦内皮细胞、肝星状细胞和巨噬细胞的单细胞转录组特征，构建了反映细胞去分化状态的综合评分系统 | 评分系统基于回顾性数据推导，需要在前瞻性研究中进一步验证 | 开发用于慢性肝病诊断和预后的肝窦细胞特异性生物标志物 | 慢性肝病患者 | 数字病理学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序 | 生物标志物评分系统 | 基因表达数据 | 内部队列108例，三个独立验证队列总计1008例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 512 | 2026-04-11 |
Integrated Single-Cell Profiling Reveals Dichotomous NK Cell Populations Associated with Immunosuppression in Solid Tumors
2026-Feb-27, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1229
PMID:41758966
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了实体瘤中NK细胞存在由IFNG或TGFB1表达驱动的二分表型和功能景观，并发现组织驻留适应性NK细胞与免疫检查点阻断反应相关 | 首次系统揭示了实体瘤中NK细胞存在由内在信号程序驱动的二分功能亚群，并发现组织驻留适应性NK细胞与免疫治疗反应和生存期延长相关 | 研究主要基于单细胞转录组数据，功能验证和机制研究仍需进一步深入 | 探究实体瘤中NK细胞异质性对免疫应答和临床结局的影响 | 实体瘤中的自然杀伤细胞 | 单细胞组学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 513 | 2026-04-11 |
CD14 Plays a Critical Role in Pain and Inflammation Across Multiple Models of Post-traumatic Osteoarthritis
2026-Feb-24, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70100
PMID:41735778
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研究论文 | 本研究通过基因敲除和抗体阻断方法，探讨了CD14在多种创伤后骨关节炎模型中对疼痛和炎症的调控作用 | 首次在多种严重程度不同的创伤后骨关节炎模型中系统验证CD14抑制对滑膜炎症和疼痛的保护作用，并采用单细胞转录组学和空间蛋白质组学等新技术分析炎症机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本分析仅限于相关性研究，缺乏直接干预验证 | 验证CD14抑制能否减轻骨关节炎进展中的滑膜炎症和相关疼痛 | 人类骨关节炎滑液样本、多种创伤后骨关节炎小鼠模型（包括不同性别和肥胖因素） | 骨关节炎研究 | 骨关节炎 | 流式细胞术、单细胞转录组学、空间蛋白质组学、基因敲除、抗体阻断 | 动物疾病模型 | 蛋白质组数据、转录组数据、行为学数据、组织学数据 | 人类滑液样本及多种小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 514 | 2026-04-11 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Macaque LGN Neurons Reveals Novel Subpopulations
2026-Feb-18, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05361-y
PMID:41703343
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研究论文 | 本研究通过分析猕猴外侧膝状体核（LGN）的单细胞转录组数据，揭示了LGN神经元中新的亚群，超越了传统的M、P、K细胞类型分类 | 利用公开数据库的单细胞转录组数据，在灵长类LGN中发现了新的神经元亚群，表明LGN处理过程比经典三细胞类型观点更为复杂 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏功能评估的结合，且数据来源于公开数据库，可能受限于原始实验设计 | 探索猕猴LGN神经元的异质性，以更全面地理解视觉系统的工作原理 | 猕猴外侧膝状体核（LGN）的神经元 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 515 | 2026-04-11 |
Deep-Learning Tool ScVital Enables Species-Agnostic Integration of Cancer Cell States
2026-Feb-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4889
PMID:41223329
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研究论文 | 本研究开发了一种名为scVital的深度学习工具，用于跨物种整合单细胞RNA测序数据，以识别癌症细胞状态 | scVital利用变分自编码器和判别器将scRNA-seq数据嵌入到物种无关的潜在空间中，克服了批次效应，并开发了潜在空间相似性评分作为评估批次校正准确性的新指标 | NA | 开发一种计算工具以增强小鼠模型在癌症研究中的转化能力，通过跨物种识别保守的细胞状态 | 遗传工程小鼠模型和原发性患者样本中的癌症细胞状态 | 机器学习 | 胰腺导管腺癌, 肺腺癌, 未分化多形性肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 516 | 2026-04-11 |
TCRγ constant usage tunes human γδ T cell antigen sensitivity, thymic programming, and peripheral function
2026-Feb-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adr7167
PMID:41686911
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研究论文 | 本文揭示了人类γδ T细胞受体中γ恒定结构域如何独立于可变区抗原识别来调节激活强度，并影响细胞表型和功能 | 首次证明γδ T细胞受体的γ恒定结构域（Cγ1和Cγ2）能独立于可变区抗原识别来调节激活强度，为γδ T细胞功能调控提供了新机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未深入探讨Cγ结构域调节激活的具体分子机制，且功能验证可能有限 | 探究人类γδ T细胞受体中γ恒定结构域对细胞激活、表型和功能的影响 | 人类γδ T细胞及其受体 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 517 | 2026-04-11 |
Joint modeling of cellular heterogeneity and condition effects with scPCA in single-cell RNA-seq
2026-Feb-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09651-6
PMID:41639368
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scPCA的灵活降维框架，用于联合建模单细胞RNA测序数据中的细胞异质性和条件效应 | scPCA能够在线性降维框架中整合研究协变量，恢复集成的因子表示，并揭示跨条件和分解组分的转录变化 | NA | 开发一种能够同时处理细胞异质性和条件效应的降维方法，以更好地分析多条件实验中的单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据，包括未刺激和IFNß处理的外周血单个核细胞、啮齿动物肺细胞群、去极化视觉皮层神经元以及CRISPR-Cas9 chordin敲除斑马鱼数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 518 | 2026-04-11 |
A temporal and spatial atlas of adaptive immune responses in the lymph node following viral infection
2026-Feb-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504742123
PMID:41587309
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AIR-SPACE的整合方法，结合高分辨率空间转录组学和配对的高保真长读长测序技术，用于分析病毒感染后淋巴结中适应性免疫细胞的空间组织和动态响应 | 开发了AIR-SPACE方法，首次将空间转录组学与T和B细胞受体的长读长测序结合，实现了在原生空间背景下同时分析细胞转录组和适应性免疫受体库 | 研究仅基于小鼠模型和痘苗病毒感染，可能无法完全反映人类或其他病原体感染的情况 | 旨在理解病毒感染后淋巴结中适应性免疫反应的空间和时间动态 | 小鼠腘淋巴结在痘苗病毒感染后的适应性免疫细胞 | 空间转录组学 | 病毒感染 | 空间转录组学，长读长测序 | NA | 空间转录组数据，T和B细胞受体序列数据 | 五个不同时间点的小鼠腘淋巴结样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 519 | 2026-04-11 |
PDK4-driven metabolic reprogramming enhances mesothelial cell invasion in colorectal cancer peritoneal metastasis
2026-Jan-28, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025148
PMID:41607205
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现PDK4是结直肠癌腹膜转移中促进间皮细胞侵袭的关键基因，其通过代谢重编程和β-catenin乙酰化调控细胞侵袭 | 首次在单细胞水平揭示PDK4通过驱动脂肪酸氧化代谢重编程和β-catenin乙酰化促进间皮细胞侵袭的新机制 | 样本量较小（12例患者），且主要基于体外实验，需要更多体内验证 | 探究间皮细胞在结直肠癌腹膜转移中的分子机制 | 结直肠癌患者的腹膜转移组织样本及间皮细胞 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12例结直肠癌腹膜转移患者的组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 520 | 2026-04-11 |
Hyperactivated YAP1 Drives an Invasive EMT Subtype of Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.18.700207
PMID:41648504
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研究论文 | 本研究揭示了YAP1过度激活驱动一种新型HPV非依赖性、侵袭性宫颈鳞状细胞癌亚型，该亚型可逃逸现有筛查策略 | 首次发现Hippo-YAP信号通路破坏导致的YAP1过度激活足以诱导一种缺乏表面病变、可逃逸HPV和细胞学检测的侵袭性宫颈癌亚型，并利用单细胞和空间转录组学解析了其细胞结构和免疫微环境 | 未明确提及样本量限制或验证队列的规模，且临床转化策略尚需进一步研究 | 探究可逃逸当前筛查策略的宫颈癌亚型的分子机制，并为全球宫颈癌消除计划提供新策略 | 宫颈鳞状细胞癌（CVC） | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |