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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-05-08 |
Low PTGDS Expression Facilitates HNSCC by Suppressing Programmed Cell Death and Reducing B Cell-Mediated Immune Responses
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/4521847
PMID:41866775
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研究论文 | 研究了低表达的前列腺素D2合成酶(PTGDS)如何通过抑制程序性细胞死亡和减少B细胞介导的免疫反应促进头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)进展 | 首次揭示PTGDS作为连接成纤维细胞介导的程序性细胞死亡抵抗和B细胞免疫调节的关键调控因子,并阐明其通过上调CXCL13增强免疫浸润的机制 | 未明确说明研究局限性 | 探索癌症相关成纤维细胞在HNSCC中导致程序性细胞死亡抵抗的机制 | 头颈部鳞状细胞癌样本及癌症相关成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序、空间转录组学、Seurat聚类、Monocle2伪时间轨迹分析、随机森林算法、ssGSEA、CIBERSORT、功能获得实验、Western blotting、免疫组化 | 随机森林 | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、TCGA转录组数据 | 24例单细胞测序样本及TCGA和空间转录组数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学 |
| 502 | 2026-05-08 |
CFMF: A Clustering-Free Cell Marker Finder for Single-Cell Transcriptomic Data
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70065
PMID:41911006
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研究论文 | 开发了一种无需细胞聚类的单细胞转录组数据细胞标志物发现方法CFMF | 提出无需细胞聚类的标志基因发现框架,避免了传统方法中参数选择的非平凡性和主观性,能够发现稀有细胞类型且对低丰度细胞具有高灵敏度 | 未提及,但可能依赖高质量单细胞数据且验证数据集规模有限 | 开发无需聚类的细胞标志物发现方法,分析肿瘤异质性和复杂生物系统 | 单细胞RNA测序数据中的细胞标志物 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | PBMC3K数据集、多形性胶质母细胞瘤数据集、人正常肺scRNA-seq数据集、结直肠癌scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 503 | 2026-05-08 |
Screening macrophage polarization genes in spinal cord injury as therapeutic targets
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347599
PMID:42081466
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研究论文 | 筛选脊髓损伤中巨噬细胞极化基因作为治疗靶点 | 首次鉴定Soat1、Comt和Myo1f三个与巨噬细胞极化相关的关键基因在脊髓损伤中的诊断和治疗潜力,并结合机器学习算法和单细胞RNA测序进行多维验证 | 研究主要在动物模型和生物信息学分析基础上进行,缺少临床样本的大规模验证 | 探索巨噬细胞极化相关基因在脊髓损伤中的诊断、预后和治疗潜力 | 脊髓损伤样本中的巨噬细胞极化相关基因 | 机器学习 | 脊髓损伤 | RNA测序,单细胞RNA测序,RT-qPCR | LASSO,随机森林,XGBoost | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 504 | 2026-05-08 |
Integrating multi-omics and machine learning to decipher the molecular pathways of bisphenol a-associated lactylation-related genes driving bladder cancer
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347134
PMID:42085381
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研究论文 | 通过整合多组学数据和机器学习方法,系统研究双酚A相关的乳酸化修饰基因在膀胱癌中的分子机制 | 首次将毒理基因组学与乳酸化相关基因集结合,通过多组学整合和机器学习筛选出4个BPA-乳酸化关联候选基因 | 未提及具体局限性 | 利用毒理基因组学框架系统解析双酚A暴露通过乳酸化修饰驱动膀胱癌的分子通路 | 膀胱癌相关基因及双酚A-乳酸化关联候选基因(ENO1、WBP11、GTF2F1、SPR) | 机器学习 | 膀胱癌 | NA | LASSO、SVM、随机森林 | 多组学数据(基因表达、单细胞转录组、蛋白质组) | NA | NA | NA | NA | NA |
| 505 | 2026-05-08 |
[Comprehensive characterization of primary ciliated cells in inflammatory skin diseases]
2026, Nihon yakurigaku zasshi. Folia pharmacologica Japonica
DOI:10.1254/fpj.25073
PMID:42091477
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研究论文 | 综合表征炎性皮肤病中的初级纤毛细胞及其功能作用 | 通过结合免疫荧光染色和空间转录组学(Visium HD),首次揭示特应性皮炎和银屑病中纤毛细胞显著增加,且光疗后仍保持较高数量,并发现其保留未分化角质形成细胞特征并上调代谢、细胞周期和信号通路 | 未明确提及,但可能包括样本量有限或功能验证不足 | 探究初级纤毛在炎性皮肤病中的作用及其潜在治疗策略 | 健康皮肤、特应性皮炎和银屑病病变组织 | 数字病理学 | 皮炎, 银屑病 | 空间转录组学, 免疫荧光染色 | NA | 图像, 转录组数据 | 健康皮肤、特应性皮炎和银屑病病变样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 10x Genomics Visium HD 空间转录组学平台,提供单细胞级空间分辨率 |
| 506 | 2026-05-08 |
Salidroside and Hongjingtian Injection Inhibit the Onset and Progression of Asthma via Pyroptosis in the Ozone-Exposed Inflammation Environment
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9618148
PMID:42093379
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研究论文 | 通过网络毒理学、RNA-seq和多组学方法,研究红景天苷和红景天注射液通过焦亡途径抑制臭氧暴露炎症环境下哮喘的起始和进展 | 首次通过网络毒理学和转录组学分析识别臭氧相关的焦亡基因,并利用多组学方法和动物模型验证红景天苷及其类似物通过靶向GSDMD抑制臭氧诱导的哮喘加重 | NA(标题和摘要未提及) | 识别臭氧相关的焦亡基因,探讨其在哮喘中的作用,并筛选靶向这些基因的中药成分以治疗臭氧暴露下的哮喘 | 臭氧暴露下的哮喘动物模型及哮喘组织样本 | 机器学习 | 哮喘 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 网络毒理学, 网络药理学, 分子对接, 分子聚类 | 机器学习(用于诊断预测) | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、动物模型实验数据 | 多份哮喘组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 507 | 2026-05-08 |
Insights gained from single-cell sequencing analysis of ischemic stroke
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1784660
PMID:42093724
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review | 本文综述了基于单细胞RNA测序技术的缺血性中风研究,总结了细胞类型、异质性、相互作用及技术进展 | 系统整理了22种脑细胞类型和7种血细胞类型,总结了13种频繁报道的细胞类型的异质性研究,并探讨了免疫细胞与非免疫细胞的相互作用 | 未明确提及具体局限性,但隐含单细胞测序分析虽然名为“单细胞”,实际上整合了数千个细胞的信息,可能忽略个体细胞变异 | 总结单细胞RNA测序在缺血性中风研究中的应用,提供新靶点和生物标志物的见解 | 缺血性中风相关的脑细胞和血细胞 | machine learning | cardiovascular disease | single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data | 超过50项研究 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 508 | 2026-05-08 |
CGRP-mediated neuro-vascular-pulp cell crosstalk is essential for dental pulp repair
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1793692
PMID:42093726
|
研究论文 | 本文旨在系统阐明感觉神经及其关键神经肽CGRP在牙髓损伤修复中调控血管生成和基质细胞激活的分子机制 | 首次系统揭示了CGRP介导的“神经-血管-牙髓细胞”协同网络在牙髓修复中的双重作用机制 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,临床转化仍需进一步验证 | 阐明CGRP调控牙髓损伤修复中血管生成和干细胞分化的分子机制 | 牙髓组织、感觉神经纤维、血管内皮细胞、牙髓干细胞 | 数字病理学 | 牙科疾病 | 单细胞转录组分析、qPCR、Western blot、免疫荧光、划痕试验、管形成实验、RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 三个公开单细胞转录组数据集(GSE197289, GSE274562, GSE280528);小鼠牙本质-牙髓损伤模型;人牙髓细胞、人脐静脉内皮细胞和牙髓干细胞 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 509 | 2026-05-08 |
TDAGENE: Inference of Gene Regulatory Network Based on Topological Data Analysis and Graph Attention Network for Single-Cell RNA Sequencing Data
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0080
PMID:42093817
|
研究论文 | 提出了TDAGENE方法,结合拓扑数据分析与图注意力网络,用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 首次将拓扑数据分析(TDA)引入基因调控网络推断,融合全局拓扑特征与局部图表示,提升模型捕捉网络拓扑结构和识别基因相互作用关系的能力 | 未明确提及局限性 | 开发并验证一种基于拓扑数据分析和图注意力网络的新型基因调控网络推断方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图注意力网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 510 | 2026-05-08 |
Duhuo Jisheng Decoction ameliorates experimental intervertebral disc degeneration by modulating immune-inflammatory responses through regulation of macrophage polarization
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1774140
PMID:42093971
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research paper | 该研究通过单细胞测序分析发现独活寄生汤通过调控巨噬细胞极化减轻椎间盘退变的免疫炎症反应 | 首次从单细胞水平揭示独活寄生汤通过调控巨噬细胞M1/M2极化平衡改善椎间盘退变的免疫炎症机制 | 未提及具体局限性 | 探讨独活寄生汤是否通过调控巨噬细胞介导的免疫炎症反应来减轻椎间盘退变 | 椎间盘退变模型小鼠及巨噬细胞 | machine learning | 椎间盘退变 | single-cell sequencing | NA | single-cell sequencing data | 实验动物样本数量未明确说明 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 511 | 2026-05-08 |
The therapeutic effect and specific mechanism involved active Chinese medicine component biochaninA in glioma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1780159
PMID:42093975
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研究论文 | 通过多组学策略探究中药活性成分鹰嘴豆芽素A对胶质瘤的治疗效果及具体机制 | 采用多组学整合方法,结合单细胞RNA测序、体外实验、GSTP1预后模型构建及免疫浸润和药物敏感性分析,揭示了鹰嘴豆芽素A通过调控GSTP1发挥抗胶质瘤作用的新机制 | 未提及具体局限性 | 阐明中药活性成分鹰嘴豆芽素A对胶质瘤的治疗机制 | 胶质瘤细胞及复发胶质瘤中的C2 CENPF⁺肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 多组学分析、单细胞RNA测序、体外实验 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 512 | 2026-05-08 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomics identify autophagy-related immune-suppressive subtypes and a prognostic signature in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1820929
PMID:42093974
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research paper | 整合单细胞与批量转录组数据识别结直肠癌中自噬相关的免疫抑制亚型及预后特征 | 首次在结直肠癌中跨细胞类型绘制自噬活性图谱,并基于自噬相关基因定义分子亚型与预后模型 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模临床队列验证 | 探索自噬相关基因在结直肠癌肿瘤微环境中的角色及其对风险分层的价值 | 结直肠癌肿瘤组织中的恶性细胞、基质细胞和免疫细胞 | digital pathology | colorectal cancer | RNA-seq | machine learning | gene expression data | 多个公共队列样本,包括TCGA和GEO数据 | Illumina | bulk RNA-seq | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序和批量转录组测序 |
| 513 | 2026-05-08 |
Enhanced TLR7-induced interferon responses in women living with HIV
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1791579
PMID:42093980
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研究论文 | 本研究通过大规模队列分析了TLR7刺激后女性与男性HIV感染者的免疫反应差异,发现女性表现出更强的干扰素应答和减弱的炎症细胞因子产生 | 首次在大型HIV感染者队列中系统揭示TLR7刺激的性别特异性免疫反应,包括女性独有的干扰素通路增强和炎症通路抑制,并鉴定出IRF7在浆细胞样树突状细胞中的关键作用 | 男性为主的队列构成(女性仅占14.5%)可能影响统计效力,且未完全阐明TFH细胞频率差异与干扰素应答的因果关系 | 探究HIV感染背景下TLR7驱动的免疫反应是否存在性别差异及其对病毒控制的潜在影响 | 1326名接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者(192名女性、1134名男性)和43名未感染者(28名女性、15名男性) | 免疫学 | HIV感染 | TLR7激动剂刺激、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 1369名研究对象(包括1326名HIV感染者和43名未感染者),其中单细胞测序分析290名HIV感染者(76名女性、214名男性) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 外周血单个核细胞的单细胞RNA测序 |
| 514 | 2026-05-08 |
Combining multi-omics analysis methods to identify biomarkers for mitophagy involved in immune checkpoint inhibitors-related myocarditis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1691848
PMID:42093991
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研究论文 | 通过多组学分析识别免疫检查点抑制剂相关心肌炎中线粒体自噬的生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据筛选ICIs相关心肌炎中的线粒体自噬关键基因,并验证其诊断价值 | 研究基于公开数据集和小鼠模型,临床样本验证不足 | 探索线粒体自噬在免疫检查点抑制剂相关心肌炎中的作用并识别潜在生物标志物 | ICIs相关心肌炎患者和小鼠模型的心肌组织 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, qRT-PCR | NA | 基因表达数据, 测序数据 | 公开数据集及小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 515 | 2026-05-08 |
Galectin-3 promotes FBXL5-dependent ubiquitination and degradation of YAP1 to constrain colorectal cancer growth
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1769656
PMID:42093989
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研究论文 | 本研究探讨了Galectin-3通过FBXL5依赖性泛素化降解YAP1以抑制结直肠癌生长的机制 | 首次揭示Gal-3通过FBXL5介导的泛素化途径促进YAP1蛋白降解,构成Gal-3-FBXL5-YAP1信号轴,并提出该轴在抑制结直肠癌进展中的新角色 | 需通过TEAD报告基因实验及YAP1拯救或突变分析进一步验证该信号轴的因果框架 | 阐明Gal-3在结直肠癌中的临床相关性及其调控FBXL5和YAP1的分子机制 | 结直肠癌患者组织样本及细胞系 | 分子生物学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀, 泛素化检测 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 小鼠模型数据 | TCGA及单细胞RNA测序数据集;细胞实验及小鼠异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 大量RNA-seq | NA | NA |
| 516 | 2026-05-08 |
Loss of SHP-1 in CD11c+ cells impairs anti-tumor immunity
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1710547
PMID:42093998
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研究论文 | 通过条件性基因敲除小鼠模型,研究SHP-1在CD11c+细胞(包括树突状细胞和巨噬细胞)中缺失对抗肿瘤免疫的影响 | 首次揭示SHP-1在抗原呈递细胞而非CD8+ T细胞中发挥关键免疫调节作用,并证明其在cDC1和巨噬细胞中通过不同机制影响抗肿瘤免疫 | 未具体说明研究样本量、临床相关性验证及具体分子机制细节 | 探究SHP-1在CD11c+抗原呈递细胞中缺失对抗肿瘤免疫应答的影响 | ItgaxΔPtpn6、Xcr1ΔPtpn6和Lyz2ΔPtpn6条件性基因敲除小鼠及其MC38肿瘤模型 | 免疫学 | 癌症 | 条件性基因敲除、单细胞RNA测序、流式细胞术 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 多种基因型小鼠及肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 517 | 2026-05-08 |
Multi-functional Small Molecule for Regenerative Healing of Avascular Meniscus Tears: Modulation of Inflammation, Differentiation, and Multi-Tissue Crosstalk
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.132326
PMID:42094591
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研究论文 | 本研究报道了一种新型小分子4-PPBP,作为σ1受体激动剂,通过调节炎症、分化和多组织串扰促进无血管半月板撕裂的再生愈合 | 首次发现4-PPBP通过激活滑膜间充质干细胞和调节巨噬细胞介导的炎症,经多组织串扰促进无血管半月板愈合,并利用单细胞RNA测序揭示细胞间通讯机制 | NA | 开发可促进无血管半月板撕裂愈合的多功能小分子治疗药物 | 半月板细胞、滑膜间充质干细胞、巨噬细胞、成纤维细胞、软骨细胞、纤维软骨细胞、脂肪细胞 | NA | 骨关节炎 | scRNA-seq, CellChat分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 518 | 2026-05-08 |
Cell type-specific alterations in fatty acid metabolism in neuronal subpopulations of schizophrenia and construction of a diagnostic model
2026, Frontiers in psychiatry
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fpsyt.2026.1770038
PMID:42094829
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研究论文 | 本研究整合单细胞和批量RNA测序,探究精神分裂症患者背外侧前额叶皮层中脂肪酸代谢相关基因的细胞类型特异性改变,并构建诊断模型 | 首次结合单细胞与批量RNA测序揭示精神分裂症神经元亚群中脂肪酸代谢的细胞类型特异性失调,并基于关键基因构建了具有转化潜力的五基因诊断模型 | 模型在外部验证队列中的AUC为0.779,提示泛化性能可能有限;仅使用MK-801诱导的小鼠模型进行验证,未在人体组织中进行直接验证 | 研究精神分裂症患者背外侧前额叶皮层中脂肪酸代谢相关基因的细胞类型特异性变化及其作为诊断生物标志物的潜力 | 精神分裂症患者和对照的背外侧前额叶皮层组织样本 | 机器学习 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qPCR | LASSO回归 | 基因表达数据 | 9例精神分裂症患者和14例对照的单细胞测序样本,以及两个批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 519 | 2026-05-08 |
Association of the CXCL-ACKR1 Signaling Axis with the Angiogenic Microenvironment in Endometrial Cancer: A Single-Cell Transcriptomic Analysis
2026, International journal of women's health
DOI:10.2147/IJWH.S582387
PMID:42094869
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨CXCL信号通路在子宫内膜癌血管生成中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次在单细胞水平揭示CXCL-ACKR1信号轴与子宫内膜癌血管生成微环境的关联,并鉴定出ACKR1作为抗血管生成治疗的新靶点 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量较小或缺乏功能验证实验 | 研究子宫内膜癌中CXCL信号通路在血管生成中的作用,评估其作为治疗靶点的潜力 | 18例子宫内膜癌和正常对照组织的单细胞RNA测序数据 | 癌症研究 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个样本(子宫内膜癌和正常对照组织) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 520 | 2026-05-08 |
The Role of COQ10B in Tumor Progression and Its Association with Immune Escape in Esophageal Squamous Cell Carcinoma: A Multi-Omics and Functional Analysis
2026, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S581929
PMID:42095211
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研究论文 | 本研究通过多组学和功能分析,探讨COQ10B在食管鳞状细胞癌进展中的作用及其与免疫逃逸的关联 | 首次系统揭示COQ10B在食管鳞癌中通过激活PI3K/AKT/HIF-1A信号通路促进肿瘤进展和免疫逃逸的机制 | 未提及具体局限性 | 阐明COQ10B在食管鳞状细胞癌中的功能及其调控肿瘤免疫微环境的潜在机制 | 食管鳞状细胞癌(ESCC),TE-1细胞,C57BL/6小鼠皮下异种移植模型 | 机器学习 | 肺癌 | NGS, RNA-seq | NA | 文本 | TCGA和GEO数据库样本,单细胞测序数据,TE-1细胞,C57BL/6小鼠 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | TCGA和GEO数据库的批量RNA-seq及单细胞RNA-seq数据 |