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当前共找到 40705 篇文献,本页显示第 501 - 520 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
501 2026-06-17
A low-level Cdkn1c/p57kip2 expression in spinal progenitors drives the transition from proliferative to neurogenic modes of division
2026-01, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究利用鸡胚神经管的单细胞RNA测序数据,鉴定出细胞周期调节因子Cdkn1c作为从增殖性分裂转向神经源性分裂模式的关键驱动因子,其低表达水平在神经祖细胞中启动这一转变 首次揭示Cdkn1c/p57kip2的低表达水平而非高表达水平驱动神经祖细胞从增殖性向神经源性分裂模式转变,并提出其在不同表达阶段具有双重功能 主要基于鸡胚模型,未在哺乳动物或人类系统中验证,且低表达调控机制的分子细节尚不完整 探究脊椎动物神经发生过程中从对称增殖性分裂向不对称神经源性分裂转变的分子调控机制 鸡胚神经管中的神经祖细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 鸡胚神经管细胞(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
502 2026-06-17
Transcript profiling and gene regulation of the human pre-implantation embryo: parental effects and impact of ARTs
2026-01-01, Human reproduction update IF:14.8Q1
综述 探讨人植入前胚胎转录组受亲本特征、辅助生殖技术(ART)条件和胚胎因素影响的综述 首次系统综述了影响人植入前胚胎转录组的多重因素,包括亲本特征、ART干预和胚胎内在因素,并利用单细胞RNA测序数据比对各细胞谱系特异性表达变化 关于多囊卵巢综合征、子宫内膜异位症、卵巢储备功能减退、精子异常、不明原因不孕及ART技术影响的证据仍然有限 探究亲本特征、ART条件和胚胎内因如何影响人植入前胚胎转录组,并识别不同因素中共有的失调分子通路 人植入前胚胎(尤其囊胚阶段)的转录组数据 自然语言处理 不孕症 单细胞RNA测序 NA 文本(综述信息)、基因表达数据 NA(综述,包含多篇研究数据) NA 单细胞RNA-seq NA NA
503 2026-06-17
Conserved Ductular Reaction Mechanisms in Biliary Atresia and Primary Sclerosing Cholangitis Derived From Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
综述 基于单细胞和空间转录组学研究胆道闭锁与原发性硬化性胆管炎中保守的导管反应机制 揭示了两种胆道疾病中导管反应共享的上皮、间充质和先天免疫机制,而适应性免疫机制存在差异 未来需要涵盖早期和晚期疾病样本,特别是非肝硬化PSC;单细胞空间转录组技术可提高配体-受体相互作用预测的置信度 阐明胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎中导管反应的保守机制以识别通用治疗靶点 胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎患者的肝脏组织样本 机器学习 胆道疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
504 2026-06-17
Integrative Single-Cell Transcriptomics and Network Pharmacology Analysis of Xiao Qing Long Tang in Pediatric Cough-Variant Asthma
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 通过整合单细胞转录组学和网络药理学分析,探究小青龙汤在小儿咳嗽变异性哮喘中的作用机制 首次利用单细胞RNA测序技术构建儿童哮喘气道上皮细胞的单细胞图谱,并结合网络药理学分析中药复方小青龙汤的多靶点作用机制 NA 揭示儿童咳嗽变异性哮喘的细胞异质性和分子机制,并探索小青龙汤的潜在治疗靶点 儿童哮喘患者的气道上皮组织 自然语言处理, 机器学习 哮喘 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) Monocle算法 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics 单细胞RNA测序平台
505 2026-06-17
A Cross-Tissue Multiomics Analysis Reveals the Protective Role of TGFBR3 in Postmenopausal Osteoporosis
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 通过跨组织多组学分析揭示TGFBR3在绝经后骨质疏松中的保护作用 首次整合人类跨组织转录组谱发现TGFBR3作为绝经后骨质疏松的新型保护性调控因子,并结合遗传流行病学、单细胞转录组学及动物模型进行多层次机制验证 未提及具体局限性 发现绝经后骨质疏松的保守遗传调控因子并表征其生物学功能 绝经后骨质疏松患者的外周血单核细胞、骨髓及骨组织转录组数据,以及卵巢切除小鼠模型 机器学习 骨质疏松 RNA测序, 孟德尔随机化, 单细胞转录组学 机器学习算法组合(108种) 转录组数据 人类样本:外周血单核细胞、骨髓、骨组织;小鼠模型:卵巢切除骨质疏松模型 NA NA NA NA
506 2026-06-17
Rapid establishment of KRAS-driven bladder cancer initiation and immune escape models using genetically engineered mice and organoid approaches
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 结合基因工程小鼠模型和类器官技术快速建立KRAS驱动的膀胱癌起始和免疫逃逸模型 首次将新型基因表达小鼠模型与先进类器官技术结合,利用单细胞测序纵向追踪肿瘤演化和细胞动态,建立可扩展且生理相关的临床前药物筛选平台 未明确说明局限性 开发膀胱癌起始和免疫逃逸的快速模型以推动肿瘤生物学和药物开发研究 KRAS驱动的膀胱癌起始和免疫逃逸模型 机器学习 膀胱癌 单细胞测序 基因工程小鼠模型 单细胞数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
507 2026-06-17
ecPICK: A deep learning-enabled spatial diagnostic platform for direct ecDNA identification and clinical prognosis across pan-cancer histopathology
2026, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 开发一种名为ecPICK的深度学习框架,通过常规H&E染色全切片图像直接识别和定位染色体外DNA,并评估其在泛癌病理中的诊断和预后价值 首次将深度学习应用于常规病理切片的ecDNA空间诊断,无需昂贵测序即可实现ecDNA定性和定量分析,并揭示ecDNA富集区域的独特肿瘤微环境特征 需要进一步验证模型在不同染色条件和扫描仪下的一致性,以及更大规模临床队列的泛化能力 开发一种经济高效、可临床转化的ecDNA诊断平台,实现常规病理样本中的ecDNA定量和空间定位 来自20种不同癌症的4280张H&E染色全切片图像及其对应的ecDNA状态 数字病理学 泛癌(肺癌、前列腺癌等20种癌症) 深度学习、荧光原位杂交、空间转录组学 深度卷积神经网络 图像(H&E染色全切片图像) 4280张来自20种癌症的H&E染色图像 NA 空间转录组学 NA NA
508 2026-06-17
CLIC6 and ANLN: novel exosome-related prognostic markers and therapeutic targets in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究基于CLIC6和ANLN等外泌体相关基因构建肺腺癌预后模型,并评估其免疫特征和治疗价值 首次鉴定CLIC6和ANLN为外泌体相关新型预后标志物,并结合免疫浸润和单细胞分析揭示其在肺腺癌中的免疫调控机制 仅基于TCGA和GEO公共数据库,缺乏多中心外部验证队列;ANLN功能验证仅在有限细胞系中进行 探索肺腺癌中外泌体相关基因的预后价值及免疫治疗反应预测潜力 肺腺癌肿瘤样本(TCGA和GEO公共数据)、A549和NCI-H838肺腺癌细胞系 机器学习 肺癌 RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR LASSO回归, 共识聚类 基因表达数据, 单细胞转录组数据 未明确说明(利用TCGA和GEO公共数据库,样本量需参考原文) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
509 2026-06-17
Integrative profiling of lactylation reveals prognostic biomarkers and an immunosuppressive niche in acute myeloid leukemia
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合分析急性髓系白血病中乳酰化修饰谱,鉴定出预后生物标志物并揭示免疫抑制微环境 首次系统构建急性髓系白血病的乳酰化相关基因图谱,结合机器学习算法和多组学数据鉴定出GZMB和LSP1两个关键基因,并通过孟德尔随机化验证其因果关系 研究主要基于公开数据库的转录组数据,缺乏多中心独立验证队列,且乳酰化修饰的机制验证主要限于体外实验 阐明急性髓系白血病中乳酰化修饰的调控景观,发现预后生物标志物和潜在治疗靶点 急性髓系白血病患者样本及细胞系(Kasumi-1细胞) 机器学习 急性髓系白血病 RNA-seq, 单细胞测序, 免疫组化, 分子对接 LASSO-logistic, SVM-RFE, Boruta, GLM, CIBERSORT 转录组数据, 单细胞测序数据 来自GEO和TCGA数据库的公开数据集,具体样本量未明确说明 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
510 2026-06-17
Identification of CCND1 and IL7R as core JAK-STAT pathway genes promoting hepatitis B-related liver fibrosis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合生物信息学分析,识别出CCND1和IL7R作为JAK-STAT通路核心基因,并验证其在乙肝相关肝纤维化中的促进作用 首次结合WGCNA、机器学习诊断模型构建、孟德尔随机化因果推断和单细胞RNA测序验证,多维度鉴定CCND1和IL7R为JAK-STAT通路在乙肝相关肝纤维化中的核心基因 基于公开数据库分析,样本量和数据来源有限;实验验证仅在蛋白和mRNA水平进行,缺乏功能实验和体内动物模型验证 识别JAK-STAT通路中促进乙肝相关肝纤维化的核心基因并探索其生物学功能 乙肝病毒感染患者的肝纤维化组织样本 机器学习 肝纤维化 RNA-seq 机器学习诊断模型 基因表达数据 GSE84044数据集(具体样本数未明确给出) NA 单细胞RNA测序 NA NA
511 2026-06-17
S100A4 characterize antigen-presenting cancer-associated fibroblasts and predicts surgical outcomes in relapsed ovarian cancer
2026, Therapeutic advances in medical oncology IF:4.3Q2
研究论文 该研究通过多平台整合分析,鉴定了复发性卵巢癌中S100A4+抗原呈递癌症相关成纤维细胞亚群及其与手术结局的关联 首次在复发性卵巢癌中描绘S100A4+ CAFs的异质性,并发现抗原呈递S100A4+apCAFs亚群与完全手术切除及良好免疫微环境密切相关 样本量相对较小,需在更大队列中验证;功能性验证实验未直接在文中提及 阐明复发性卵巢癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其对手术预后和免疫调节的影响 复发性卵巢癌肿瘤组织样本 数字病理学 卵巢癌 多重免疫组化、空间数字表型分析、单细胞RNA测序、转录组荟萃分析 NA 空间图像、单细胞转录组数据、批量转录组数据 31个肿瘤切片(多重免疫组化),11个肿瘤(单细胞RNA测序),多个外部转录组数据集 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
512 2026-06-17
Activation of endogenous retroviruses in tumor cells and their immunomodulatory mechanisms: from molecular basis to clinical translation
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
综述 系统解析内源性逆转录病毒在肿瘤微环境中异常激活的分子机制及其免疫调节双重作用,并探讨其在肿瘤诊断与免疫治疗中的转化潜力 整合单细胞多组学和空间转录组学技术揭示ERV在肿瘤异质性中的动态表达模式,并首次提出利用时空精准基因编辑和AI驱动的ERV活性预测模型突破现有研究瓶颈 未提供具体实验验证数据,主要基于现有文献综述,缺乏对ERV激活与临床预后之间因果关系的直接证据 系统阐述ERV异常激活在肿瘤发生、进展和免疫逃逸中的分子机制,并评估其作为肿瘤诊断和免疫治疗靶点的临床转化可行性 内源性逆转录病毒在肿瘤细胞中的激活机制及其免疫调节作用 自然语言处理 恶性肿瘤 单细胞多组学、空间转录组学 NA 临床前和临床试验数据 NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
513 2026-06-17
Immunomodulatory Roles and Clinical Significance of GZMM and DDX24 in Sepsis: A Multiomics Integrative Analysis With Experimental Validation
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 通过多组学整合分析和实验验证,揭示了GZMM和DDX24在脓毒症中的免疫调节作用及临床意义 首次利用多组学整合分析结合机器学习方法鉴定DDX24和GZMM作为脓毒症诊断和预后的关键基因,并通过单细胞RNA测序揭示其在T细胞和NK细胞中的表达模式 初步验证样本量有限,且未深入探讨基因调控的分子机制 探索脓毒症免疫功能障碍的分子机制并鉴定新的诊断和预后标志物 从GEO数据集获取的脓毒症转录组数据及临床样本 机器学习 脓毒症 RNA-seq 机器学习算法 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
514 2026-06-17
Integrative single-cell analysis reveals immunogenic cell death-associated heterogeneity and identifies a robust prognostic signature in osteosarcoma with experimental validation
2026, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 通过整合单细胞分析揭示骨肉瘤中免疫原性细胞死亡相关的异质性,并构建具有实验验证的稳健预后特征 首次在单细胞分辨率下表征骨肉瘤中免疫原性细胞死亡特征的细胞类型特异性分布,并基于此构建预后模型,结合多种实验验证了关键基因NAP1L1的作用 需要进一步的前瞻性验证来确认该预后特征的临床应用价值 探索骨肉瘤中免疫原性细胞死亡相关的细胞异质性及其临床意义,并构建预后模型 骨肉瘤患者样本中的肿瘤细胞、巨噬细胞、免疫细胞及间质细胞 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序、转录组分析、机器学习 加权基因共表达网络分析、集成机器学习 基因表达数据、临床随访数据 11例骨肉瘤样本(单细胞RNA测序);训练集TCGA-TARGET、验证集GSE16091与GSE21257 NA 单细胞RNA测序 NA NA
515 2026-06-17
Decoding the human PBMC isonome: isoform-level resolution with single-cell long-read transcriptomics
2026, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 利用单细胞长读长转录组学解析人类PBMC异构体组(isonome) 首次使用改良的微流控-free PIPseq流程与牛津纳米孔长读长测序技术,构建了迄今最大规模的单个供体人类外周血单核细胞长读长单细胞数据集,能够检测到巨核细胞;发现了126个来自已知和新基因的新型异构体,并揭示了它们在不同细胞类型中的特异性表达模式 NA 在异构体水平上研究人类免疫细胞的多样性和疾病机制,并定义细胞类型 人类外周血单核细胞(PBMCs) 数字病理学 NA 单细胞长读长RNA测序 NA 转录组数据 单个供体的PBMC样本 Oxford Nanopore Technologies 单细胞RNA测序 Oxford Nanopore MinION/GridION 改良的PIPseq工作流程结合牛津纳米孔长读长测序
516 2026-06-17
Optimized protocol for processing murine tumor-bearing lung tissue for flow cytometry and single cell RNA-sequencing
2025-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种从荷瘤小鼠肺组织中处理样本用于流式细胞术和单细胞RNA测序的优化流程 针对纤维化和异质性强的荷瘤肺组织,开发了减少处理应激并获取>85%活细胞的详细分步操作方案 未明确说明局限,但可能包括对特定小鼠模型(Kras; tdTomato)的依赖和需验证的通用性 优化从健康及荷瘤小鼠肺组织中分离高质量单细胞悬液的方法 Kras; tdTomato报告基因小鼠的荷瘤肺组织 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,涉及健康及荷瘤小鼠肺组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
517 2026-06-17
Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb
2025-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过测序技术定义了小鼠前肢起始的四个不同阶段,识别了前肢特异性转录的基因特征并揭示了TBX5的早期转录靶点 首次利用高通量测序方法系统解析前肢起始的时序转录程序,发现神经投射和细胞粘附相关基因作为TBX5候选早期靶点的全新机制模型 未知(摘要未提供) 阐明脊椎动物前肢起始的分子机制和转录程序 小鼠胚胎的体壁侧板中胚层细胞 NA NA RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, Ribo-ITP NA 转录组数据, 表观基因组数据 小鼠胚胎样本(未提供具体数量) NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, 核糖体分析 NA NA
518 2026-06-17
Multi-site Assessment of Methods for Cell Preservation Upstream of Single Cell RNA Sequencing
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 评估三种细胞保存方法在单细胞RNA测序中的性能和可重复性 首次跨平台、多站点比较10x Genomics FLEX、Parse Bioscience Evercode WT v2和Honeycomb Bio HIVE三种细胞保存方法在单细胞RNA测序中的表现,并证明保存方法能更好地保留脆弱粒细胞群体 检测的基因子集存在平台特异性差异,且研究仅针对同一位健康个体的白细胞,样本多样性有限 评估三种商业细胞保存平台在单细胞RNA测序中的性能和可重复性,为科研人员选择最佳保存工作流程提供参考 来自一位健康个体的总白细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、流式细胞术数据 1位健康个体的白细胞样本 10x Genomics, Parse Biosciences, Honeycomb Bio 单细胞RNA测序 10x Genomics FLEX, Parse Bioscience Evercode WT v2, Honeycomb Bio HIVE 10x Genomics FLEX固定保存法,Parse Bioscience Evercode WT v2固定保存法,Honeycomb Bio HIVE冷冻保存法
519 2026-06-17
Decoding the human PBMC isonome: Isoform-level resolution with single-cell long-read transcriptomics
2025-Oct-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 使用单细胞长读长转录组学解析人类PBMC异构体组,实现异构体水平分辨率 首次生成最大规模的人类外周血单核细胞(PBMC)长读长单细胞数据集,结合微流控自由PIPseq工作流程和Oxford Nanopore长读长测序,发现128种新型异构体并鉴定细胞类型特异性异构体表达模式 NA 利用单细胞长读长RNA测序在异构体水平研究人类免疫细胞的多样性和功能机制 人类外周血单核细胞(PBMC)中的免疫细胞 数字病理学 NA 单细胞长读长RNA测序(ONT) NA RNA序列数据 人类PBMC样本 Oxford Nanopore Technologies 单细胞RNA-seq Oxford Nanopore测序平台 PIPseq工作流程结合Oxford Nanopore长读长测序
520 2026-06-17
Repopulating Microglia Suppress Peripheral Immune Cell Infiltration to Promote Poststroke Recovery
2025-09, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 采用PLX5622介导的小胶质细胞耗竭再殖模型,发现再殖小胶质细胞通过抑制外周免疫细胞浸润和重塑免疫微环境促进脑卒中后神经功能恢复 首次揭示短暂小胶质细胞耗竭再殖可通过抑制外周T细胞耗竭和中性粒细胞终末分化、促进吞噬型巨噬细胞表型转化来改善卒中后修复 仅在小鼠模型中验证,且PLX5622给药方案(7天给药+7天停药)的时效性和安全性需进一步评估以转化至临床 研究小胶质细胞再殖对脑缺血后免疫微环境重塑及神经功能恢复的影响 小鼠脑缺血模型中小胶质细胞、T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞及血脑屏障 神经免疫学 缺血性脑卒中 单细胞转录组学、流式细胞术、细胞因子阵列、免疫荧光 NA 基因表达数据、细胞表型数据 小鼠脑组织样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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