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当前共找到 38991 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-04-29 |
Senolytic treatment with fisetin reverses age-related endothelial dysfunction partially mediated by SASP factor CXCL12
2025-Aug-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.670216
PMID:40894771
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研究论文 | 使用单细胞转录组学评估非瑟酮（fisetin）抗衰老治疗对老年小鼠主动脉内皮细胞衰老和内皮功能障碍的影响，并发现SASP因子CXCL12是部分介导年龄相关性内皮功能障碍的关键因子 | 首次通过单细胞转录组学系统鉴定老年小鼠主动脉内皮细胞中SASP因子的表达变化，并验证非瑟酮可逆转CXCL12等SASP因子的表达，从而改善内皮功能 | 该研究主要基于小鼠模型，体外实验使用人内皮细胞，但尚需在人体中验证非瑟酮的抗衰老效果及其对CXCL12的调控作用 | 探究内皮细胞衰老相关信号通路、内皮来源SASP因子及其对年龄相关性内皮功能障碍的影响，并评估非瑟酮的干预效果 | 年轻（6月龄）和老年（27月龄）小鼠主动脉内皮细胞，以及培养的人内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共4组小鼠：年轻组和老年组（各含非瑟酮处理组和对照组），每组6只（原文未明确提及具体数量，但通常每组3-5只），另用体外分离的小鼠动脉和人内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 502 | 2026-04-29 |
Dynamical systems theory as an organizing principle for single-cell biology
2025-Aug-01, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00565-3
PMID:40750599
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评论 | 本文提出将动力系统理论作为解释单细胞生物学的组织原则，旨在为单细胞转录组数据提供可解释的因果定量分析框架 | 将动力系统理论首次系统性地应用于单细胞生物学领域，为理解基因表达异质性和细胞轨迹提供因果定量视角 | 未具体阐述该理论在复杂生物系统中的实际验证和实施细节 | 建立单细胞基因表达数据的统一理论框架，融合动力系统理论以增强数据解释能力和医疗应用潜力 | 单细胞转录组数据中的基因表达异质性和细胞发育轨迹 | 机器学习 | NA | NA | 动力系统模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 503 | 2026-04-29 |
Role of Dual Specificity Phosphatase 1 (DUSP1) in influencing inflammatory pathways in macrophages modulated by Borrelia burgdorferi lipoproteins
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.20.624562
PMID:39605372
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研究论文 | 本文研究双特异性磷酸酶1在疏螺旋体脂蛋白调节巨噬细胞炎症通路中的作用 | 通过多组学方法（单细胞RNA测序和蛋白质组学）发现DUSP1在疏螺旋体脂蛋白诱导的巨噬细胞反应中起关键调控作用 | 仅在小鼠骨髓来源巨噬细胞中进行，未在体内或人类细胞中验证 | 探索DUSP1在疏螺旋体脂蛋白调节巨噬细胞免疫反应中的功能和机制 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞 | 机器学习 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 504 | 2026-04-29 |
Targeted single cell expression profiling identifies integrators of sleep and metabolic state
2025-07-09, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf079
PMID:40509864
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研究论文 | 通过靶向单细胞表达谱分析，鉴定调控睡眠与代谢状态整合的神经元和基因 | 首次利用靶向单细胞测序技术对单个LHLK神经元进行转录组分析，鉴定出睡眠-代谢相互作用的新调控因子 | 仅限于果蝇模型，且仅关注单个神经元类型，可能遗漏其他相关神经元或全身性调控机制 | 研究单个神经元在睡眠与代谢交互中的转录变化及功能基因 | 果蝇（Drosophila melanogaster）的侧角亮氨酸激酶（LHLK）神经元 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序（single-cell sequencing） | NA | 基因表达数据 | 果蝇LHLK神经元（喂食状态与24小时饥饿状态对比，具体样本未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | 单细胞CEL-Seq | 靶向单细胞CEL-Seq对单个LHLK神经元进行RNA分离和测序 |
| 505 | 2026-04-29 |
Diminished and altered cellular senescence response in delayed wound healing of aging
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.08.658533
PMID:40661498
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研究论文 | 研究发现，老年小鼠伤口愈合过程中细胞衰老反应减弱且发生了质变，从有益于愈合的细胞外基质重塑转变为有害的促炎状态，导致伤口闭合延迟 | 首次揭示了衰老相关伤口愈合延迟中，伤口微环境的衰老反应不仅数量减少，而且功能发生了从有益到有害的转变，并利用单细胞RNA测序鉴定出p16/p21/Ki67阳性衰老成纤维细胞的独特亚群 | NA | 探究衰老个体皮肤伤口愈合延迟中细胞衰老反应的变化及其机制 | 幼年和老年小鼠的全层背侧皮肤伤口组织，以及人伤口组织（来自年轻捐赠者） | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 若干幼年和老年小鼠的全层背侧皮肤伤口样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 506 | 2026-04-29 |
Proline mitigates antibiotic resistance evolution induced by ciprofloxacin at environmental concentrations
2025-06-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137561
PMID:39938368
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研究论文 | 发现脯氨酸能够显著缓解环境浓度下环丙沙星诱导的抗生素耐药性进化 | 首次发现脯氨酸可通过调控TCA循环代谢通量降低细菌质子动力势，从而抑制抗生素摄取并减少耐药亚群的形成，且该效应在土壤微宇宙实验中保持了微生物群落多样性 | 基于单一模式菌株（土壤分离大肠杆菌）和短期实验（24天），对其他抗生素和菌群的普适性验证有限 | 探索氨基酸类化合物在环境层面控制抗生素耐药性进化的可行性及机理 | 土壤分离大肠杆菌及土壤微生物群落 | 机器学习 | 传染性疾病 | 转录组学、碳代谢流分析、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、代谢通量数据、单细胞转录组数据 | 24天进化实验（18种氨基酸筛选）、土壤微宇宙实验（1组最优剂量5 mg/kg） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA-seq分析 |
| 507 | 2026-04-29 |
Alternatively activated monocyte-derived myeloid cells promote extracellular pathogen persistence within pulmonary fungal granulomas
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655817
PMID:40568097
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研究论文 | 利用空间转录组学和流式细胞术研究隐球菌肉芽肿的免疫动态和细胞结构，揭示替代激活的单核细胞来源髓系细胞促进肺真菌肉芽肿中细胞外病原体持续存在的机制 | 挑战了替代激活髓系细胞是真菌内在复制生态位的传统观点，发现真菌主要存在于细胞外环境，并首次提出Th2-髓系回路形成局部免疫抑制环境驱动真菌持续存在的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和特定真菌病原体（隐球菌），可能不完全代表人类潜伏感染的真实情况 | 阐明潜伏真菌感染中无法产生杀菌免疫的潜在机制，寻找宿主导向治疗新靶点 | 肺部真菌肉芽肿中的免疫细胞（特别是单核细胞来源髓系细胞和CD4 T辅助2细胞） | 数字病理学 | 肺真菌感染 | 空间转录组学、流式细胞术、命运图谱、小鼠遗传工具 | NA | 空间转录组数据、流式细胞术数据 | 涉及小鼠模型样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 508 | 2026-04-29 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2025-05-08, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf045
PMID:40036847
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研究论文 | 首次构建小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，定义其分泌细胞和免疫细胞群体 | 首次对小鼠精囊进行单细胞RNA-seq分析，揭示了该组织的主要细胞类型及其转录组特征 | 未明确说明局限性 | 理解精囊的细胞组成和功能，为精囊在生殖和后代发育中的作用提供资源 | 小鼠精囊组织 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 基因表达数据 | 23只不同年龄的小鼠，暴露于多种饮食挑战 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 509 | 2026-04-29 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Cellular Response to PEG-Induced Stress in Wheat Leaves
2025-May-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12749
PMID:40287963
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示小麦叶片在PEG诱导干旱胁迫下的细胞应答机制 | 首次在单细胞水平系统分析干旱不敏感与敏感小麦幼苗在PEG诱导胁迫下的细胞异质性反应，并识别出多个细胞类型特异基因及主调控转录因子 | 仅依赖于PEG模拟干旱条件，未在自然干旱环境中验证；此外，研究局限于小麦叶片组织，未涵盖根部等其他关键器官 | 研究小麦叶片在干旱胁迫下的细胞层面应答机制 | 干旱不敏感和敏感的小麦幼苗叶片 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种小麦品系（干旱不敏感和敏感）的幼苗，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 510 | 2026-04-29 |
Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110422
PMID:39701169
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研究论文 | 研究滑液中常驻滑膜巨噬细胞在免疫调节中的作用及其与滑膜屏障完整性的关系 | 首次在人类滑液中发现常驻滑膜巨噬细胞，并建立新的外植体模型，揭示其在炎性关节炎中上调促纤维化和促破骨信号通路 | 未提及具体局限性 | 探究滑液中常驻滑膜巨噬细胞与滑膜屏障完整性的关联及其在关节炎免疫病理中的作用 | 人类滑液中的常驻滑膜巨噬细胞 | 数字病理学 | 关节炎 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 511 | 2026-04-29 |
Cancer-cell derived S100A11 promotes macrophage recruitment in ER+ breast cancer
2024-12-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2429186
PMID:39587886
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研究论文 | 通过分析25个ER+乳腺肿瘤的单细胞RNA测序数据，发现癌细胞分泌的S100A11促进巨噬细胞招募，揭示其在肿瘤微环境中的调控作用 | 首次发现S100A11在巨噬细胞与癌细胞相互作用中的新角色，并验证其作为潜在治疗靶点调控富含巨噬细胞的肿瘤微环境 | NA | 探究雌激素受体阳性乳腺癌中癌细胞与巨噬细胞的相互作用机制，特别是S100A11的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 25个雌激素受体阳性乳腺肿瘤中的癌细胞和巨噬细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 25个雌激素受体阳性乳腺肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 512 | 2026-04-29 |
sc-SPLASH provides ultra-efficient reference-free discovery in barcoded single-cell sequencing
2024-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.24.630263
PMID:39763839
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研究论文 | sc-SPLASH是一种高效的分析流程，能够对条形码化的单细胞RNA测序和空间转录组数据进行无参考基因组的从头发现 | 首次将统计学优先、无参考基因组发现的SPLASH框架扩展到条形码化单细胞RNA测序和空间转录组学数据，并提供了优化的预处理和k-mer计数模块BKC | 未提及明显的局限性 | 开发一种高效的流程，用于在单细胞和空间转录组数据中进行无参考基因组的从头发现，以捕捉传统方法遗漏的转录组多样性 | 人类细胞、海鞘、海绵 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 序列数据（k-mer计数） | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 513 | 2026-04-29 |
Spatial Transcriptomics Unravel the Tissue Complexity of Oral Pathogenesis
2024-Dec, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241271934
PMID:39382116
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综述 | 综述了空间转录组学在口腔发病机制研究中的应用，包括工作流程、数据分析方法以及在不同颅面区域疾病研究中的实例 | 综述了空间转录组学在口腔和颅面发育及疾病研究中的最新应用，展示了其在解析组织复杂性方面的独特优势 | 未明确提及，但可能包括空间转录组学技术的成本、分辨率限制以及数据分析的复杂性 | 探讨空间转录组学如何用于研究口腔和颅面区域的发育与发病机制 | 口腔和颅面组织，包括颅骨、腭、唾液腺、舌头、口底、口咽和牙周组织 | 数字病理学 | 口腔疾病、头颈癌、干燥综合征、牙周病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 514 | 2026-04-29 |
Analysis of the heterogeneity and complexity of murine extraorbital lacrimal gland via single-cell RNA sequencing
2024-10, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.06.005
PMID:38945476
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析小鼠泪腺的细胞异质性和复杂性 | 首次通过单细胞RNA测序对小鼠泪腺细胞类型进行无偏分类，并构建了全面的细胞图谱 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人体样本 | 揭示健康泪腺的细胞类型及其异质性 | C57BL/6J小鼠的泪腺细胞 | 机器学习和单细胞组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 43,850个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 515 | 2026-04-29 |
The effects of age and dysfunction on meibomian gland population dynamics
2024-10, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.08.005
PMID:39122180
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学探究年龄和功能障碍对睑板腺细胞群体动态变化的影响 | 首次通过单细胞和空间转录组学技术，揭示睑板腺细胞分化过程中脂质生成基因的分层表达模式，以及年龄相关腺体萎缩和免疫细胞浸润的新机制 | 未明确提及限制条件，可能包括小鼠模型与人类差异、样本量较小或功能验证不足 | 研究睑板腺功能障碍（MGD）的细胞分化、脂质合成及腺体萎缩机制 | 年轻（6月龄）和年老（22月龄）野生型C57Bl/6小鼠，以及年轻（3月龄）和年老（13月龄）Awat2敲除小鼠的睑板腺组织 | 数字病理学 | 干眼病（睑板腺功能障碍） | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及两种基因型（野生型和Awat2敲除）及不同年龄段（3-22月龄）的小鼠，具体样本数量未说明 | Resolve Biosciences | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | Resolve Biosciences Molecular Cartography panel | 使用含100个睑板腺特异性基因的Molecular Cartography panel进行空间转录组分析 |
| 516 | 2026-04-29 |
The proteomic landscape and temporal dynamics of mammalian gastruloid development
2024-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.05.609098
PMID:39282277
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研究论文 | 应用定量蛋白质组学分析人类和小鼠类原肠胚四个关键分化阶段的蛋白质动态，并整合转录组和磷酸化数据揭示翻译及翻译后调控的物种特异性 | 首次通过定量蛋白质组学系统描绘类原肠胚发育过程中的蛋白质动态图谱，并整合多组学数据揭示线粒体转录组与蛋白质组在围原肠胚阶段的物种差异性 | 未在体内胚胎模型中验证类原肠胚的蛋白质组学发现；磷酸化调控的激酶-底物关系仅基于动态相关性推测 | 揭示哺乳动物早期发育中蛋白质动态及调控机制 | 人类和小鼠的类原肠胚（包括初始态ESC、激发态ESC、早期类原肠胚、晚期类原肠胚） | 数字病理学 | 先天性遗传病 | 定量蛋白质组学、RNA-seq、磷酸化位点分析 | NA | 蛋白质组学数据、转录组数据、磷酸化修饰数据 | 人类和小鼠各四个发育阶段的类原肠胚样本 | NA | 定量蛋白质组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 517 | 2026-04-29 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
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研究论文 | 评估Element Biosciences的亲和力碱基化学DNA测序在单细胞RNA-seq中准确测序同源多聚体并提高比对率的能力 | 首次利用亲和力测序技术通过胸腺嘧啶同源多聚体准确读取cDNA序列，实现直接分配读段到多聚腺苷酸化位点，避免了传统方法的复杂性和局限性 | 与单端比对相比，双端比对并未持续提高读段比对率；其他新兴平台可能具有类似性能，但未进行排除验证 | 评估Element Aviti仪器在单细胞RNA-seq中通过同源多聚体测序的准确性及其对读段比对和多聚腺苷酸化位点定量的影响 | 单细胞RNA-seq文库中的cDNA片段，含poly(dT)引物位点（poly(A)尾或基因组腺嘌呤同源多聚体） | DNA测序 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | DNA测序数据 | 不明确 | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti, Illumina测序仪 | Element Aviti测序平台（基于亲和力碱基化学），Illumina测序系统（用于比较） |
| 518 | 2026-04-29 |
Gene Regulatory Programs that Specify Age-Related Differences during Thymocyte Development
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599011
PMID:38948840
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研究论文 | 构建新生儿和成年小鼠T细胞发育的转录和表观遗传图谱，揭示年龄相关差异的基因调控程序 | 首次整合转录组和表观遗传组数据，揭示T细胞发育中与年龄相关的基因调控程序差异，并利用CRISPR扰动结合单细胞测序鉴定关键调控因子 | 仅基于小鼠模型，人类年龄相关差异需进一步验证 | 研究T细胞发育过程中与年龄相关的基因调控程序及其机制 | 新生儿和成年小鼠的胸腺细胞发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR扰动、表观遗传分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 新生儿和成年小鼠的胸腺细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒，结合CRISPR扰动技术 |
| 519 | 2026-04-29 |
Single-Cell Sequencing Illuminates Thymic Development: An Updated Framework for Understanding Thymic Epithelial Tumors
2024-06-03, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyae046
PMID:38520743
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在解析胸腺上皮肿瘤研究中揭示的胸腺发育新框架，包括胸腺上皮区室的细胞多样性、分化与衰老过程及肿瘤发生机制 | 利用单细胞分子分析技术为胸腺上皮肿瘤的临床和基础研究提供新视角，提出针对肿瘤异质性和起源细胞等未解问题的新见解 | 胸腺上皮肿瘤的罕见性限制了肿瘤发生机制的研究和合理治疗方案的开发 | 探讨单细胞测序如何深化对胸腺正常发育和恶性转化的理解，以推动罕见胸腺上皮肿瘤的改进治疗策略 | 胸腺上皮肿瘤（包括胸腺瘤和胸腺癌）及正常胸腺组织 | 单细胞组学 | 胸腺上皮肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 520 | 2026-04-29 |
HIF2A mediates lineage transition to aggressive phenotype of cancer-associated fibroblasts in lung cancer brain metastasis
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2356942
PMID:38778816
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研究论文 | 通过对肺转移性肺癌单细胞RNA测序数据的再分析，发现癌症相关成纤维细胞在缺氧条件下经历由HIF-2α驱动的谱系转变，从而增强血管生成并促进肿瘤生长，揭示了肺癌脑转移的新机制 | 发现HIF-2α驱动癌症相关成纤维细胞谱系转变至更具侵袭性的表型，并明确其在肺癌脑转移微环境中的功能变化，提供了潜在的治疗靶点 | 未明确定量分析的样本规模有限，仅使用了四个配对的脑转移和原发肺癌样本进行验证 | 阐明肺癌脑转移中癌症相关成纤维细胞的谱系组成和功能变化及其分子机制 | 肺癌患者（包含原发灶和脑转移灶）的癌症相关成纤维细胞 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据（单细胞和批量RNA测序）、免疫组化图像 | 四个配对的脑转移和原发肺癌样本（用于多重免疫组化验证） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基于公共数据集GSE131907的分析 |