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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-07-04 |
Spatial differences in gene expression across the dorsal raphe nucleus in a model of early Alzheimer's disease
2025-01, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877241299119
PMID:39584353
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研究论文 | 利用空间基因表达技术研究早期阿尔茨海默病模型中背侧缝核的基因表达差异 | 首次在早期阿尔茨海默病的小鼠模型中应用空间转录组学技术,发现背侧缝核内不同亚区域对tau蛋白病理性损害的差异性易感,并鉴定了相关长链非编码RNA Map2k3os的可能调控作用 | 需要进一步研究Map2k3os的相互作用机制,并强调汇聚数据验证以克服空间转录组学技术的局限性 | 识别5-羟色胺神经元对阿尔茨海默病病理性损害的易感或抵抗的潜在遗传因素 | 过表达人tau蛋白的htau小鼠的背侧缝核 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学、RNAscope、免疫组化 | NA | 基因表达数据、图像 | htau小鼠(早期阿尔茨海默病临床前模型)的背侧缝核组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间基因表达平台 |
| 502 | 2026-07-04 |
Dysregulated Treg repair responses lead to chronic rejection after heart transplantation
2024-12-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173593
PMID:39621314
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型,揭示心脏移植后IL-33+成纤维细胞与受体Treg之间的失调修复反应导致慢性排斥的机制 | 首次发现Treg分泌的双调蛋白(Areg)在慢性排斥反应中促进成纤维细胞增殖和纤维化,颠覆了传统认为Treg修复功能有益的观点 | 主要基于MHC-II不匹配小鼠模型,人类样本验证规模有限,且未涉及其他免疫抑制方案的影响 | 阐明心脏移植后慢性排斥反应中IL-33/Areg通路介导的失调修复机制 | MHC-II不匹配心脏移植小鼠模型、临床心脏移植患者样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MHC-II不匹配小鼠心脏移植模型(IL-33缺陷供体/Treg特异性Areg缺陷受体)及临床心脏移植患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 503 | 2026-07-04 |
Early concentrate starter introduction induces rumen epithelial parakeratosis by blocking keratinocyte differentiation with excessive ruminal butyrate accumulation
2024-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.12.016
PMID:38128723
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研究论文 | 研究了早期引入高浓度精料导致羔羊瘤胃上皮角化不全的机制,发现瘤胃丁酸过度积累通过阻断角质形成细胞分化引发该病 | 首次通过单细胞RNA测序揭示早期断奶羔羊瘤胃上皮从分化角质细胞到终末分化角质细胞的转变受阻,并利用瘤胃类器官模型验证高剂量丁酸直接导致角化不全 | 未提及具体限制,但模型仅针对新生羔羊且局限于短期观察 | 阐明瘤胃上皮角化过程及其影响因素,特别是早期营养干预策略对瘤胃健康的影响 | 新生羔羊瘤胃上皮组织及类器官 | 机器学习和单细胞组学 | 反刍动物消化系统疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 实时定量PCR, 代谢组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 组织切片图像 | 24只14日龄羔羊,分为三组(母乳、母乳+苜蓿干草、母乳+玉米大豆精料启动) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 504 | 2026-07-04 |
Insulin-like growth factor 2 drives fibroblast-mediated tumor immunoevasion and confers resistance to immunotherapy
2024-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183366
PMID:39545420
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研究论文 | 揭示胰岛素样生长因子2驱动成纤维细胞介导的肿瘤免疫逃逸并导致免疫治疗耐药性 | 首次揭示IGF2在免疫排斥肿瘤中主要由癌症相关成纤维细胞分泌,并通过CXCL12和PD-L1促进CAF与T细胞相互作用,证明IGF2缺陷可增强CD8+ T细胞浸润和细胞毒性 | 未明确说明 | 研究胰岛素样生长因子2在肿瘤免疫排斥和免疫治疗耐药中的作用机制 | 免疫排斥肿瘤中癌症相关成纤维细胞和T细胞 | 机器学习 | 泛癌种 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 不适用 | 空间和单细胞转录组数据 | 使用系统性或成纤维细胞特异性IGF2敲除小鼠模型 | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 10x Visium、10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组学,10x Chromium用于单细胞RNA测序 |
| 505 | 2026-07-04 |
Attenuated kidney oxidative metabolism in young adults with type 1 diabetes
2024-10-22, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183984
PMID:39436695
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研究论文 | 本论文研究了1型糖尿病年轻成人中肾脏氧化代谢减弱及其与糖尿病肾病早期发展的关系 | 首次结合单细胞RNA测序、空间代谢组学与伪时间轨迹分析,揭示1型糖尿病患者肾近端小管细胞亚型转换与氧化代谢减弱的分子机制 | 样本量较小(T1D组30例,对照组20例),且未进行纵向随访验证因果关系 | 探究1型糖尿病中胰岛素敏感性下降是否通过改变肾脏氧化代谢促进糖尿病肾病发生 | 年轻1型糖尿病成人患者与健康对照者 | digital pathology | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,空间代谢组学,伪时间轨迹分析 | Slingshot算法 | 基因表达数据,代谢物空间分布数据 | 30例1型糖尿病年轻患者和20例健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学 | NA | 使用11C-醋酸盐PET进行氧化代谢成像 |
| 506 | 2026-07-04 |
Evaluation of single-cell sorting accuracy using antibody-derived tag-based qPCR
2024-10, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24888
PMID:39132928
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研究论文 | 开发了一种基于抗体衍生标签的qPCR方法,用于评估单细胞分选准确性 | 首次利用抗体衍生标签(ADTs)结合多路TaqMan qPCR来确认分选后单细胞的蛋白表达,从而验证单细胞分选准确性 | 未在标题和摘要中明确提及局限性 | 开发一种新型检测方法,以确认分选单细胞的蛋白表达,并评估单细胞分选准确性 | 分选后的单细胞及全细胞裂解液 | NA | NA | qPCR, 荧光激活细胞分选(FACS), 抗体衍生标签(ADTs) | NA | NA | NA | Thermo Fisher | NA | TaqMan | 多路TaqMan qPCR |
| 507 | 2026-07-04 |
CXCL8 secreted by immature granulocytes inhibits WT hematopoiesis in chronic myelomonocytic leukemia
2024-09-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180738
PMID:39545419
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研究论文 | 本研究探讨了未成熟粒细胞分泌的CXCL8抑制慢性粒单核细胞白血病中正常造血干细胞增殖的机制 | 首次发现未成熟粒细胞通过分泌CXCL8选择性抑制正常造血干细胞,而白血病干细胞因下调CXCL8受体得以逃逸,并证明阻断CXCL8可恢复正常造血 | 未提及具体局限性,但需进一步验证CXCL8靶向治疗的临床可行性 | 阐明未成熟粒细胞在CMML进展中的炎症作用及其对正常造血的抑制机制 | 慢性粒单核细胞白血病患者的未成熟粒细胞、正常和白血病造血干细胞与祖细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 慢性粒单核细胞白血病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 508 | 2026-07-04 |
Points2Regions: Fast, interactive clustering of imaging-based spatial transcriptomics data
2024-09, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24884
PMID:38958502
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研究论文 | 介绍了一种用于成像空间转录组学数据快速交互聚类的工具Points2Regions | 通过将mRNA点栅格化到金字塔网格上进行快速特征提取,并结合层次聚类和K-means聚类实现高效的多尺度区域发现,无需依赖分割细胞等补充数据 | 未明确提及局限性,可能包括对真实数据集的验证有限或需要进一步评估不同实验条件下的性能 | 开发一种快速交互式的计算工具,用于识别成像空间转录组学数据中具有相似mRNA组成区域,支持多尺度分析 | 成像空间转录组学数据中的mRNA空间点数据 | 数字病理学 | NA | 成像空间转录组学 | 层次聚类和K-means聚类 | 图像 | 两个模拟数据集和多个真实世界数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 509 | 2026-07-04 |
Impact of different tissue dissociation protocols on endothelial cell recovery from developing mouse lungs
2024-07, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24843
PMID:38668123
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研究论文 | 评估不同组织解离方案对从发育中小鼠肺中回收内皮细胞的影响 | 首次系统比较胶原酶A和分散酶两种酶解方法对幼年和成年小鼠肺内皮细胞回收效率及亚型组成的影响,并利用单细胞RNA-Seq揭示不同方法导致的细胞亚型偏差 | 仅限于小鼠肺组织,未涉及其他组织或物种;未深入探讨酶解对细胞功能的影响 | 比较不同组织解离方案对内皮细胞回收效率及亚型组成的影响 | 幼年和成年小鼠肺组织中的内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠肺组织样本(幼年和成年) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 510 | 2026-07-04 |
Advances in preclinical assessment of therapeutic targets for bladder cancer precision medicine
2024-07-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001177
PMID:38602053
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综述 | 综述膀胱癌精准医学治疗靶点的临床前评估进展 | 重点介绍了抗体-药物偶联物(ADC)联合免疫疗法、单细胞RNA测序技术及功能精准医学等新策略在膀胱癌靶向治疗中的应用 | 未提及具体临床验证数据及治疗方案的长期效果评估 | 旨在改善膀胱癌患者个体化治疗和疗效 | 膀胱癌患者 | 机器学学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 511 | 2026-07-04 |
Recent contributions of single-cell and spatial profiling to the understanding of bladder cancer
2024-07-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001183
PMID:38650456
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综述 | 总结了单细胞和空间组学方法在理解膀胱癌生物学方面的最新进展及其对开发新型治疗策略的潜在影响 | 整合单细胞RNA测序与空间组学技术,以前所未有的分辨率揭示膀胱癌肿瘤微环境、异质性、癌症干细胞性和细胞可塑性 | 将研究成果转化为临床实践和实施个性化治疗策略仍面临挑战 | 探讨单细胞和空间组学技术对膀胱癌生物学理解的贡献及对治疗方案的影响 | 膀胱癌肿瘤微环境中的恶性细胞亚群、免疫细胞、癌症相关成纤维细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 512 | 2026-07-04 |
Comprehensive single-cell atlas of the mouse retina
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109916
PMID:38812536
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研究论文 | 生成了迄今最大规模的小鼠视网膜单细胞RNA测序数据集,并整合公共数据构建了涵盖12个主要类别和138种细胞类型的小鼠视网膜细胞图谱(MRCA) | 通过抗体介导的磁珠分选富集稀有细胞群体,生成了约190,000个单细胞的最大视网膜scRNA-seq数据集,并整合公共数据构建了包含330,000个细胞、138种细胞类型的综合图谱,发现新细胞类型并提供了公共访问资源 | 未提及具体局限性 | 构建全面的小鼠视网膜单细胞基因表达图谱,填补现有数据集的局限性 | C57BL/6J小鼠视网膜细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 约190,000个单细胞(来自C57BL/6J小鼠视网膜),整合后超过330,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2026-07-04 |
Silencing XIST on the future active X: Searching human and bovine preimplantation embryos for the repressor
2024-04, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-022-01115-9
PMID:35585273
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和qRT-PCR技术,研究人类和牛胚胎着床前XIST基因在活性X染色体上的沉默机制 | 首次在人类和牛胚胎中系统检测了XIST在活性X染色体上的表达时间,并确定了DNMT1、UHRF1、SAFB和SAFB2在XIST抑制中的潜在作用 | 仅分析了人类和牛胚胎着床前的特定阶段,未涉及其他哺乳动物或更广泛的发育时期 | 探索活性X染色体免受XIST介导失活的保护机制 | 人类和牛着床前胚胎中XIST的表达调控机制 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序、qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 人类胚胎和牛胚胎的多个发育阶段(4-8细胞期、桑椹胚期、早期囊胚期) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 514 | 2026-07-04 |
Transcriptomic research in atherosclerosis: Unravelling plaque phenotype and overcoming methodological challenges
2023-Dec, Journal of molecular and cellular cardiology plus
DOI:10.1016/j.jmccpl.2023.100048
PMID:39802625
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综述 | 探讨转录组研究在揭示动脉粥样硬化斑块表型及克服方法学挑战中的作用 | 系统讨论了整体和单细胞测序等最新转录组技术进展在斑块表型分析中的附加价值,并强调了多组学数据整合和机器学习对理解动脉粥样硬化的贡献 | 该领域研究结果可重复性低且缺乏标准化流程 | 阐明转录组研究如何帮助理解动脉粥样硬化斑块的不同表型及其在疾病发生发展中的作用 | 动脉粥样硬化斑块 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序、单细胞测序 | NA | 转录组数据、多组学数据 | NA | NA | 整体RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 515 | 2026-07-03 |
Sini decoction inhibits colorectal cancer liver metastasis by suppressing HIF-1α-dependent exosomal integrin signaling
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121951
PMID:42259422
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研究论文 | 该研究探讨了四逆汤通过抑制HIF-1α依赖性外泌体整合素信号来抑制结直肠癌肝转移的作用和机制 | 首次揭示四逆汤通过靶向HIF-1α减少ITGαvβ5富集的外泌体分泌,进而阻断M2巨噬细胞极化,从而抑制结直肠癌肝转移 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步的临床验证来确认其转化潜力 | 阐明四逆汤抑制结直肠癌肝转移的活性成分和机制,重点关注肿瘤来源外泌体和巨噬细胞极化 | 小鼠结直肠癌肝转移模型及其肿瘤微环境 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠结直肠肝转移模型(具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 516 | 2026-07-03 |
The crosstalk between SPP1+ macrophages and follicular helper T cells promotes the immune disorder of Graves' disease
2026-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110712
PMID:42128213
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学揭示Graves病中SPP1+巨噬细胞与滤泡辅助性T细胞的相互作用促进免疫紊乱 | 首次在Graves病中通过单细胞和空间转录组学联合分析,发现SPP1+巨噬细胞与CXCL13+ Tfh细胞通过SPP1-CD44相互作用加重免疫微环境失调,并揭示SPP1+巨噬细胞通过SPP1和VEGF信号通路促进新生血管内皮细胞形成 | NA | 探究Graves病甲状腺组织中免疫细胞和空间基因表达模式的变化,以及SPP1+巨噬细胞在疾病免疫紊乱中的作用 | Graves病患者、缓解期患者和正常对照个体的甲状腺组织 | 数字病理学 | 自身免疫性甲状腺疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组技术 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 对照个体、Graves病患者和缓解期患者的甲状腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 517 | 2026-07-03 |
JAK-STAT3-MYC axis defines pathogenic stem cell-like memory CD4+ T cells in rheumatoid arthritis
2026-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110733
PMID:42309459
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了类风湿关节炎患者CD4+ Tscm细胞中JAK-STAT3-MYC轴驱动致病性干细胞样记忆T细胞的作用 | 首次在类风湿关节炎Tscm细胞中鉴定出STAT3-MYC转录特征,并揭示其与治疗抵抗及疾病严重程度的相关性 | JAK抑制剂仅部分抑制STAT3活性,未完全阻断信号通路,MYC作为潜在治疗靶点需进一步验证 | 探究类风湿关节炎中CD4+ Tscm细胞的分子特征及其在慢性免疫激活中的致病机制 | 11名类风湿关节炎患者和8名健康对照的CD4+ Tscm细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | 不适用 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 11名类风湿关节炎患者和8名健康对照的外周血Tscm细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于Tscm细胞转录组分析,同时结合蛋白质组学分析 |
| 518 | 2026-07-03 |
Multiomic Single-Cell Sequencing Identifies BCR::ABL1 as an Acquired Resistance Mechanism in FLT3+ AML
2026-Aug, European journal of haematology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/ejh.70207
PMID:42046307
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研究论文 | 利用多组学单细胞测序识别FLT3阳性急性髓系白血病中BCR::ABL1作为获得性耐药机制 | 首次通过多组学单细胞DNA测序在单细胞分辨率下揭示BCR::ABL1获得作为FLT3-ITD AML患者对FLT3抑制剂耐药的克隆演化机制 | 基于单个病例的研究,结果可能需在更大样本中验证 | 阐明FLT3突变型AML中BCR::ABL1获得性耐药机制的克隆演化特征 | FLT3-ITD突变型急性髓系白血病患者 | 基因组学 | 急性髓系白血病 | 多组学单细胞DNA测序 | NA | 单细胞基因组数据 | 1例FLT3-ITD AML患者 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 519 | 2026-07-03 |
Cross-stage single-cell and spatial metabolome analyses reveal periderm specialization and tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza roots
2026-Aug, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71285
PMID:42169223
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研究论文 | 通过跨阶段单细胞和空间代谢组分析揭示丹参根周皮特化和丹参酮生物合成机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间代谢组学,构建丹参根从表皮到周皮的发育轨迹,鉴定与二萜生物合成相关的转录程序,并预测SmCYP76AK5参与丹参酮合成 | 未提及明确局限性 | 解析多年生根中周皮分化和次生代谢的细胞程序 | 丹参(Salvia miltiorrhiza)根在不同发育阶段的细胞类型组成和转录动态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间代谢组数据 | 不同发育阶段的丹参根样品 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 520 | 2026-07-03 |
Chromatin and genomic instability in the cochlea contributing to age-related hearing loss: Insights from in vitro and in vivo models
2026-Aug, Hearing research
IF:2.5Q1
DOI:10.1016/j.heares.2026.109691
PMID:42263393
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研究论文 | 通过体外和体内模型研究染色质和基因组不稳定性在年龄相关性听力损失中的贡献 | 结合多种体内外模型和单细胞RNA测序技术,首次揭示外毛细胞在衰老过程中染色质和基因组不稳定性的具体变化,并验证了ATRX基因的差异表达 | 具体限制未在标题和摘要中提及 | 探讨染色质和基因组不稳定性在年龄相关性听力损失中的作用机制 | 年龄相关性听力损失的小鼠模型(HEI-OC1细胞及Corti器、血管纹、螺旋神经节细胞)和转基因小鼠(tdTomato标记外毛细胞) | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |