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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-05-21 |
Ferroptosis, orchestrated by GPX4 downregulation, serves as a critical mediator of neutrophil extracellular trap-driven pathology in hypoxic pulmonary edema
2026-05-11, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02331-0
PMID:42115527
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研究论文 | 该研究探索了铁死亡(一种由GPX4下调调控的细胞死亡形式)在低氧条件下肺水肿发展中的作用,并揭示了其与中性粒细胞胞外陷阱(NET)形成的相互作用 | 首次阐明了低氧诱导的GPX4抑制通过促进铁死亡细胞死亡,进而驱动NET相关炎症的致病级联反应,将GPX4确定为预防高原肺水肿(HAPE)的关键治疗靶点 | 研究基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床样本中验证,且多组学分析可能遗漏某些组织特异性变化 | 探究铁死亡在高原肺水肿(HAPE)低氧条件下的贡献,特别是GPX4与NET形成的相互作用 | 小鼠高原低氧模型和体外低氧/复氧模型中的肺组织及人肺微血管内皮细胞 | 机器学习 | 呼吸系统疾病 | 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 小鼠模型和体外细胞模型,具体样本数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 502 | 2026-05-21 |
Identification of high-risk cells in single-cell spatially resolved transcriptomics data using Diagnostic Evidence GAuge of Single-cells with spatial smoothing
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag098
PMID:41934088
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研究论文 | 开发了DEGAS方法,利用单细胞空间分辨转录组学数据识别高风险细胞和区域 | 通过潜在表征和域适应,将疾病属性从患者转移到单个细胞,实现个体细胞层面的风险识别 | 未描述 | 提出并验证能够识别单细胞空间分辨转录组学数据中高风险细胞的新方法 | 肝细胞癌、皮肤黑色素瘤以及新生成的II型糖尿病Xenium数据集中的组织样本 | 机器学习 | 肝细胞癌, 皮肤黑色素瘤, II型糖尿病 | 单细胞空间分辨转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | NA |
| 503 | 2026-05-21 |
Super-enhancer-driven TCF4 orchestrates neuroblastoma metastasis by sphingolipid-dependent membrane remodeling and ITGB1-FAK activation
2026-May-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag021
PMID:41630015
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research paper | 本文揭示了超级增强子驱动的TCF4通过鞘脂依赖性膜重塑和ITGB1-FAK激活调控神经母细胞瘤转移的分子机制 | 首次发现超级增强子驱动的转录因子TCF4在神经母细胞瘤转移中的核心作用,并阐明其通过调控鞘脂代谢和膜重塑激活ITGB1-FAK信号通路的新机制,同时提出HDAC6抑制剂ACY-1215作为潜在治疗药物 | NA | 鉴定神经母细胞瘤转移中超级增强子驱动的转录因子并探索潜在靶向药物 | 神经母细胞瘤细胞及其转移机制 | machine learning | 神经母细胞瘤 | ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, CUT&Tag, 转录组测序 | NA | 基因表达数据, 染色质免疫沉淀测序数据 | NA | Illumina | 单细胞RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 504 | 2026-05-21 |
NAD(P)H: quinone oxidoreductase 1-mediated oxidative stress resistance and tumor microenvironment remodeling in glioblastoma
2026-May-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag015
PMID:41738493
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研究论文 | 本研究揭示NQO1在胶质母细胞瘤干细胞中高表达,通过调控ROS水平维持细胞稳定性并抑制cGAS-I型干扰素信号,重塑免疫抑制性肿瘤微环境 | 首次发现NQO1通过维持核Lamin B1稳定性调控cGAS-I型干扰素信号,连接氧化应激与免疫抑制微环境重塑,并验证NRF2对NQO1的转录调控 | 未明确提及临床样本验证及长期治疗安全性评估 | 阐明NQO1在胶质母细胞瘤抗氧化应激及免疫微环境重塑中的作用机制 | 胶质母细胞瘤干细胞(GSCs)及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 蛋白质组学, ChIP-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | 患者来源胶质母细胞瘤干细胞及异种移植小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序技术用于分析肿瘤微环境细胞异质性 |
| 505 | 2026-05-21 |
Spatial transcriptomics characterisation of radionecrotic changes in glioblastoma patients
2026-May-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag026
PMID:41783996
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研究论文 | 利用空间转录组学表征胶质母细胞瘤患者放射性坏死变化 | 首次通过空间单细胞转录组学全面描绘进行性胶质母细胞瘤与放射性坏死脑组织的差异,揭示肿瘤细胞在放射性坏死中下调EGFR表达且不表达增殖标记 | 样本量较小(9名患者的10个样本),且仅基于二次手术后的组织分析 | 区分胶质母细胞瘤进展与放射性坏死变化,并探索其空间分子特征 | 9名胶质母细胞瘤患者经标准治疗后二次手术获取的脑组织样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间单细胞转录组数据 | 9名患者的10个样本(4例肿瘤复发,4例放射性坏死,1例两者兼有) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium平台用于空间单细胞转录组分析 |
| 506 | 2026-05-21 |
Spatiotemporal Transcriptomics Characterizes Immune Microenvironment During Mouse Liver Aging
2026-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70482
PMID:42010880
|
研究论文 | 利用时空转录组学分析小鼠肝脏衰老过程中的免疫微环境 | 首次结合单细胞/单核测序和空间转录组学系统研究小鼠肝脏衰老过程中免疫细胞的时空动态变化,并揭示LPIN1在门静脉周围肝细胞中上调促进CD8 T细胞耗竭的新机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类肝脏中进行验证,且时空动态变化的因果关系仍需进一步功能实验确认 | 探索肝脏衰老过程中免疫细胞的时空动态变化及其与年龄相关肝病的关联 | 年轻和年老小鼠的肝脏组织 | 数字病理学 | 衰老相关肝病 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 年轻和年老小鼠肝脏样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组分析 |
| 507 | 2026-05-21 |
PSGRN: Gene regulatory network inference from single-cell perturbational data through self-training with synthetic gold standards
2026-May, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb3376
PMID:42054465
|
研究论文 | 提出了一种名为PSGRN的方法,通过自训练框架结合合成金标准,从单细胞扰动数据中推断基因调控网络 | 首次将自训练框架与合成金标准结合,充分利用单细胞扰动数据中的干预信息,在CausalBench挑战中表现最佳 | NA | 开发一种能从单细胞扰动数据中准确推断基因调控网络的鲁棒方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自训练框架 | 单细胞扰动数据 | 8个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 508 | 2026-05-21 |
Multidimensional Characterization of Tumor-Immune Architecture Reveals Clinically Relevant Classic Hodgkin Lymphoma Subtypes
2026-05-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0859
PMID:41615883
|
研究论文 | 通过多模态方法对经典霍奇金淋巴瘤的肿瘤-免疫微环境进行多维表征,发现了具有临床意义的分子亚型 | 首次整合恶性细胞测序、空间转录组学和成像质谱流式技术,系统性地对经典霍奇金淋巴瘤进行多维表征,并鉴定出四种具有独特临床和分子特征的亚型 | 未明确说明,但可能包括样本量有限或验证不足 | 探讨经典霍奇金淋巴瘤的疾病异质性和临床相关分子亚型 | 经典霍奇金淋巴瘤肿瘤样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 恶性细胞测序、空间转录组学、成像质谱流式 | NA | 转录组数据、空间转录数据、成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 509 | 2026-05-21 |
Blockade of Tumor TAK1 Induces DNA Damage and Immunogenic cGAS-STING Pathway Activation in Pancreatic Cancer
2026-May-01, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.04.017
PMID:42070691
|
研究论文 | 本文揭示了TAK1在胰腺癌中维持基因组完整性的关键作用,并证明抑制TAK1可通过cGAS-STING通路激活免疫反应,增强免疫检查点阻断疗法的效果 | 首次发现TAK1通过磷酸化Ephrin受体A2和RAD51来维持DNA修复,抑制TAK1可诱导DNA损伤和免疫原性cGAS-STING通路激活,为胰腺癌免疫治疗提供新靶点 | NA | 探究TAK1在胰腺导管腺癌免疫抑制微环境中的作用机制及其作为治疗靶点的潜力 | 胰腺导管腺癌细胞、CD4+和CD8+效应T细胞、p48-Cre/Trp53f/f/LSL-KrasG12D基因工程小鼠模型 | 癌症免疫学 | 胰腺癌 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序、流式细胞术、蛋白质组学 | NA | 组织切片图像、基因表达数据、蛋白质组数据 | 人PDAC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 510 | 2026-05-21 |
Exceptional Longevity Modifying Allele APOE2 Promotes DNA Signaling Pathways Resisting Cellular Senescence in Human Neurons
2026-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70494
PMID:42103698
|
研究论文 | 本研究通过人类同基因APOE iPSC衍生模型和APOE2靶向替换小鼠,揭示APOE2等位基因通过促进DNA修复和抑制细胞衰老机制赋予神经保护作用,解释其与卓越长寿及阿尔茨海默病抵抗的关联 | 首次从DNA修复和衰老抑制角度阐明APOE2对神经元的保护机制,并通过单细胞RNA测序揭示APOE4特异性基因表达特征与重复核糖体RNA增加导致的衰老关联 | 未提及 | 探究APOE2等位基因如何促进神经元长寿并发挥神经保护作用 | 人类同基因APOE iPSC衍生抑制性GABA能神经元和兴奋性神经元,以及APOE2靶向替换小鼠 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类同基因APOE iPSC衍生神经元模型及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 511 | 2026-05-21 |
Inflammation-Driven Lymphoid Structures: Organization, Function, and Clinical Impact Across Autoimmunity, Cancer, and Checkpoint Toxicity
2026-May, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.70127
PMID:42144723
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综述 | 本文提出一个框架区分炎症驱动淋巴样结构与成熟三级淋巴样结构,探讨它们在自身免疫、癌症和检查点毒性中的组织、功能及临床影响 | 提出了炎症性淋巴样结构与成熟三级淋巴样结构的区分框架,强调淋巴样结构作为异质性免疫微环境而非二元分类的新视角 | 未提及具体局限性 | 阐明淋巴样结构在不同疾病背景下的形成机制、功能异质性和临床意义 | 自身免疫性疾病、癌症、移植、免疫相关不良事件及衰老过程中的淋巴样结构 | 机器学习 | 自身免疫性疾病, 癌症, 移植排斥, 老年病 | NA | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 512 | 2026-05-21 |
Tumour-derived SAA1 reprogrammes macrophages to promote CXCL1-mediated metastasis in Ovarian Cancer
2026-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70698
PMID:42145073
|
研究论文 | 揭示肿瘤来源的SAA1通过重新编程巨噬细胞促进CXCL1介导的卵巢癌转移机制 | 首次识别出SAA1-TAM-CXCL1免疫炎症信号轴在卵巢癌转移中的关键作用,并为开发新型抗转移治疗策略提供了理论基础 | 未提及具体局限性,可能包括样本量或体外模型局限性 | 阐明SAA1在高级别浆液性卵巢癌腹膜转移中的驱动机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者及肿瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床标本及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2026-05-21 |
Transcriptional Profiling at Single-Cell Resolution Reveals Diversity and Regulatory Networks of Primary and Secondary Senescent Cells
2026-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70540
PMID:42148795
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析原代和次代衰老细胞的转录多样性及调控网络 | 首次在单细胞分辨率下系统比较原代和次代衰老细胞的转录谱差异,揭示其不同的终末簇及共享的应激反应模块,并鉴定亚型特异性基因和候选转录调控因子 | 仅以人类肾上皮细胞为模型,可能无法完全代表其他组织类型中衰老细胞的异质性;依赖体外培养体系,体内衰老过程的复杂性未涉及 | 探究原代和次代衰老细胞在单细胞水平的转录组异质性及调控机制 | 人类肾上皮细胞的原代和次代衰老模型 | 单细胞转录组学 | 肾脏衰老及相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类肾上皮细胞的原代和次代衰老模型样本,具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium(推断) | NA |
| 514 | 2026-05-21 |
TNFAIP3 in M2 Macrophage Attenuates Subretinal Fibrosis in Laser-Induced Murine Model
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.25
PMID:42126158
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 515 | 2026-05-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals extensive fibrotic remodeling and pathogenic chondrocyte subpopulations in developmental dysplasia of the hip
2026-Apr-30, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-2025-1-891
PMID:42158655
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示发育性髋关节发育不良中髋臼软骨的纤维化重塑和致病性软骨细胞亚群 | 首次在发育性髋关节发育不良的髋臼软骨中通过单细胞RNA测序识别出四个此前未知的软骨细胞亚群,并揭示其向纤维软骨样表型的显著转变及相关的分子机制 | 样本量较小(3例患者和2例对照),且研究仅聚焦于转录组层面,缺乏功能验证实验 | 探究发育性髋关节发育不良中髋臼软骨的细胞异质性和纤维化重塑机制 | 发育性髋关节发育不良患儿的髋臼软骨细胞 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序,PCR,免疫组化,组织学染色 | NA | 基因表达数据 | 3例发育性髋关节发育不良患儿和2例年龄匹配对照的髋臼软骨,共10550个软骨细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 516 | 2026-05-21 |
Shaping the microvascular network: insights into skeletal muscle angiogenesis
2026-Apr-29, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.250183
PMID:42156063
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综述 | 本文综述了骨骼肌血管生成的细胞事件和分子机制,包括与细胞外基质的相互作用以及多种驻留和浸润细胞类型的关键作用 | 重点介绍了新兴高分辨率技术(如单细胞RNA测序)在揭示骨骼肌血管生成中细胞类型特异性作用及细胞间相互作用方面的应用潜力 | 骨骼肌血管生成的确切机制仍然只有部分被理解 | 探讨骨骼肌血管生成的调控机制及其在生理和病理条件下的变化 | 骨骼肌血管生成过程中的细胞事件和分子机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 517 | 2026-05-21 |
Multi-Omics reveals SPP1 + malignant and CXCR4+ TAM crosstalk predicts immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2026-Apr-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05095-w
PMID:42045760
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研究论文 | 通过多组学分析揭示SPP1+恶性细胞与CXCR4+肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用预测肺腺癌免疫治疗反应 | 首次发现SPP1+恶性细胞和CXCR4+肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用是驱动CD8T细胞耗竭并导致免疫治疗反应不良的新机制,并提供了潜在的生物标志物 | NA | 识别肺腺癌免疫治疗反应的预测性生物标志物 | 肺腺癌的肿瘤微环境中的细胞异质性和动态变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'试剂盒,Illumina NovaSeq测序平台用于空间转录组分析 |
| 518 | 2026-05-21 |
SIV infection disrupts the spatial cellular and communication networks of pulmonary granulomas during SIV/Mtb co-infection
2026-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.24.720743
PMID:42079194
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研究论文 | 通过空间转录组学比较SIV/Mtb共感染猕猴肺部肉芽肿的细胞和通讯网络,发现SIV感染破坏了肉芽肿的空间免疫功能,且抗逆转录病毒治疗未能完全恢复 | 首次在SIV/Mtb共感染模型中揭示了肉芽肿内空间转录组学特征的变化,并评估了抗逆转录病毒治疗对空间免疫网络的影响 | 未详细说明ART治疗的持续时间对结果的影响,且样本量有限 | 探究HIV/Mtb共感染中肺部肉芽肿的免疫相互作用及ART对空间转录组学的影响 | 与SIV/Mtb共感染的猕猴 | 空间转录组学 | 结核病,艾滋病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 猕猴样本(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 519 | 2026-05-21 |
Single-cell profiling of ANKRD26 thrombocytopenia reveals progenitor expansion and polyploid apoptosis via JUNB-p21
2026-Apr-23, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030017
PMID:41538704
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和体外功能分析,揭示ANKRD26相关性血小板减少症中祖细胞扩增和通过JUNB-p21通路诱导多倍体巨核细胞凋亡的机制 | 首次在多个患者中整合单细胞转录组和体外功能分析,发现ANKRD26通过JUNB介导的CDKN1A转录激活独立于经典p53-PIDDosome轴诱导多倍体巨核细胞凋亡,并定位ANKRD26到中心体参与有丝分裂调控 | 样本量有限(仅4名患者),未提及可能的批次效应或技术复制的详细评估 | 阐明ANKRD26基因5'UTR变异导致的血小板减少症的细胞和分子机制 | 4名THC2患者的骨髓CD34+造血干细胞和祖细胞以及原代巨核细胞 | 数字病理学 | 血小板减少症 | 单细胞转录组学,共聚焦成像 | NA | 序列数据 | 4名患者,包含47,281个THC2 HSPC细胞与51,907个对照细胞,以及7,309个THC2 pMK细胞与5,077个对照细胞 | 10x Genomics,Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium,Illumina NovaSeq | 10x Chromium 单细胞3'测序,Illumina NovaSeq测序平台 |
| 520 | 2026-05-21 |
Reference-free discovery with barcoded single-cell sequencing
2026-Apr-22, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03084-6
PMID:42020848
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研究论文 | 介绍sc-SPLASH方法用于无参考的条形码单细胞测序数据发现 | 首次提出统计优先、无参考的发现方法,独立BKC子模块优化条形码数据预处理,速度比UMI-tools快约50倍 | 文章中未提及具体局限性 | 开发一种无参考的统计优先方法,用于发现条形码单细胞测序和空间转录组学中的转录组变异 | 海绵(Spongilla,缺少参考序列)和海鞘(Ciona)的免疫样细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 | NA | 序列数据 | 海绵和海鞘的免疫样细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |