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当前共找到 37260 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-03-06 |
Kindlin-2-Mediated Hematopoiesis Remodeling Regulates Triple-Negative Breast Cancer Immune Evasion
2025-May-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0698
PMID:39918417
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研究论文 | 本研究揭示了衔接蛋白Kindlin-2通过系统性重塑造血过程并上调PD-L1表达，从而促进三阴性乳腺癌免疫逃逸的机制 | 首次阐明Kindlin-2通过系统性调控造血（骨髓和脾脏髓系细胞扩增）来驱动肿瘤免疫逃逸的新机制，并发现其与PD-L1表达调控的关联 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证尚不充分；Kindlin-2调控造血的具体分子通路有待进一步解析 | 探究Kindlin-2在三阴性乳腺癌免疫逃逸中的作用机制，并评估其作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌肿瘤细胞、荷瘤小鼠的造血系统（骨髓和脾脏）及肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组化、基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、免疫组化图像 | 荷瘤小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 502 | 2026-03-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals a reprogramming of hepatic immune cells and a protective role for B cells in MASH-driven HCC
2025-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000668
PMID:40257356
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌中肝内免疫细胞的重编程，并强调了B细胞在肝癌中的保护作用 | 首次在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌模型中，利用单细胞RNA测序全面解析肝内免疫细胞的异质性和转录重编程，并发现B细胞通过增强T细胞反应发挥抗肿瘤免疫作用 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的直接适用性需进一步验证；单细胞测序样本量有限，可能未完全捕获所有免疫细胞亚群 | 探究代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌中免疫细胞的重编程机制及B细胞的抗肿瘤作用 | 高脂高碳水化合物饮食喂养的MUP-uPA小鼠模型中的肝内免疫细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但使用小鼠模型进行单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 503 | 2026-03-06 |
The dynamic immune behavior of primary and metastatic ovarian carcinoma
2025-Apr-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00818-8
PMID:40281242
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和空间转录组学，探索高级别浆液性卵巢癌中导致免疫抑制的分子机制 | 首次结合单细胞测序与空间转录组学技术，系统比较原发性与转移性卵巢癌的免疫微环境动态变化，并揭示上皮细胞与免疫细胞间的交互作用在免疫抑制中的关键角色 | 研究未明确说明样本量大小，且可能仅限于高级别浆液性卵巢癌亚型，未涵盖其他卵巢癌类型 | 揭示高级别浆液性卵巢癌免疫抑制的分子机制，为免疫调节药物临床试验设计提供依据 | 高级别浆液性卵巢癌患者的原发性肿瘤和网膜转移肿瘤 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 504 | 2026-03-06 |
SORBET: Automated cell-neighborhood analysis of spatial transcriptomics or proteomics for interpretable sample classification via GNN
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.30.573739
PMID:38260586
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研究论文 | 本文介绍了SORBET，一种几何深度学习框架，用于分析空间转录组学或蛋白质组学数据，通过图卷积网络进行可解释的样本分类 | SORBET是首个在空间转录组学数据上进行表型预测的示例，利用新颖的数据增强技术和定制可解释性分析，无需将完整细胞谱压缩为有限注释 | NA | 开发一种自动化细胞邻域分析框架，以整合空间信息与多重分子数据，准确预测表型，如免疫治疗反应 | 转移性黑色素瘤、非小细胞肺癌和结直肠癌样本 | 机器学习 | 黑色素瘤, 非小细胞肺癌, 结直肠癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 图卷积网络(GCN) | 空间转录组学数据, 空间蛋白质组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | CosMx, Imaging Mass Cytometry (IMC), Co-detection by indexing (CODEX) | CosMx空间转录组学数据集, Imaging Mass Cytometry (IMC)和CODEX空间蛋白质组学数据集 |
| 505 | 2026-03-06 |
Mapping dynamic regulation of gene expression using single-cell transcriptomics and application to complex disease genetics
2025-Apr-10, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2024.100397
PMID:39741416
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞转录组学的遗传模型，用于量化基因表达的动态遗传调控及其细胞类型特异性，并应用于精神分裂症等复杂疾病遗传学分析 | 开发了细胞类型特异性和细胞状态调整的基因表达遗传模型，能够量化基因表达的动态遗传调控并评估其细胞类型特异性，为复杂疾病机制提供新见解 | NA | 利用单细胞转录组学数据揭示遗传变异如何影响人类生理和疾病相关的生物过程，并应用于复杂疾病遗传学研究 | 诱导多能干细胞分化为中脑神经元的单细胞转录组数据，以及英国生物库中超过1,500种表型数据 | 自然语言处理 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 506 | 2026-03-06 |
An expandable synthetic library of human paired antibody sequences
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012932
PMID:40258041
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研究论文 | 本文介绍了IgHuAb，一种用于高通量生成配对人类抗体序列的大型语言模型，并基于此创建了模拟自然抗体序列特征的合成抗体库SynAbLib | 开发了首个基于大型语言模型的高通量配对人类抗体序列生成方法，并构建了具有更高序列多样性的合成抗体库 | 未提及具体实验验证的抗体数量或功能活性数据 | 解决当前单细胞测序方法在配对抗体序列数据获取中的低通量和高成本问题，以更好地理解人类抗体序列的潜在多样性 | 人类抗体序列 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | 大型语言模型 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 507 | 2026-03-06 |
The tectum transversum(TTR) maintains patency of the developing coronal suture
2025-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.30.646197
PMID:40236170
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠模型中短暂软骨结构TTR在冠状缝发育中的作用，发现其通过抑制BMP信号通路维持冠状缝开放，为冠状缝早闭的病因提供了新见解 | 首次通过基因消融实验证明TTR在维持冠状缝开放中的关键作用，并利用空间转录组学数据揭示其作为BMP信号屏障的潜在机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证；BMP信号调控机制的具体分子通路有待深入探索 | 探究冠状缝发育的调控机制及冠状缝早闭的病因 | 小鼠模型中的冠状缝、TTR软骨及相关组织（颅骨、硬脑膜） | 发育生物学 | 颅缝早闭 | 空间转录组学、基因消融 | NA | 空间转录组数据、组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 508 | 2026-03-06 |
Histidine metabolism drives liver cancer progression via immune microenvironment modulation through metabolic reprogramming
2025-Mar-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06267-y
PMID:40038727
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研究论文 | 本研究探讨了组氨酸代谢如何通过代谢重编程和免疫微环境调控驱动肝细胞癌进展 | 揭示了组氨酸代谢通过下调关键细胞通讯通路（如MIF、CLEC、MHC II）和促进BUD23基因表达来重塑免疫抑制微环境的新机制 | 具体组氨酸代谢产物如何直接调控BUD23的分子机制尚未完全阐明，且临床样本量有限 | 探究组氨酸代谢在肝细胞癌进展中的作用及其对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 肝细胞癌样本中的不同细胞类型，包括实质细胞、巨噬细胞和T细胞 | 肿瘤代谢与免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、体内外实验、TCGA数据库分析、多变量Cox回归模型 | 预后模型（基于多变量Cox回归） | 单细胞RNA测序数据、TCGA数据库的转录组数据 | 未明确指定样本数量，但使用了HCC样本和TCGA数据库 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 509 | 2026-03-06 |
Smoothie: Efficient Inference of Spatial Co-expression Networks from Denoised Spatial Transcriptomics Data
2025-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.640406
PMID:40060619
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Smoothie的方法，用于从去噪的空间转录组数据中高效推断空间共表达网络 | Smoothie通过高斯平滑去噪空间转录组数据，并构建和整合全基因组共表达网络，利用隐式和显式并行化技术，可扩展到超过1亿个空间解析点，具有快速运行时间和低内存使用 | NA | 从高分辨率空间转录组数据中提取深层生物学见解，包括基因模块检测、功能注释、基因表达与基因组结构关联以及多样本比较 | 空间转录组数据中的基因表达相关性 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 高斯平滑 | 空间转录组数据 | 超过1亿个空间解析点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 510 | 2026-03-06 |
Metabolic stress and age drive inflammation and cognitive decline in mice and humans
2025-Mar, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.70060
PMID:40110679
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研究论文 | 本研究探讨代谢应激和年龄如何在小鼠和人类中驱动炎症和认知衰退 | 结合小鼠高脂饮食模型和人类死后脑组织分析，揭示了代谢应激通过微胶质细胞介导的炎症机制（特别是SPP1基因）促进认知衰退的共性 | 研究主要基于动物模型和死后组织，难以完全模拟人类活体动态过程，且样本量可能有限 | 阐明代谢应激（如肥胖、糖尿病）导致认知障碍（包括阿尔茨海默病）的免疫炎症机制 | 高脂饮食喂养的小鼠以及阿尔茨海默病和2型糖尿病患者的死后脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确具体数量，但包括小鼠模型和人类死后组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 511 | 2026-03-06 |
Transcriptomic responses of lung mesenchymal cells during pneumonia
2025-Feb-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177084
PMID:39998887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠肺炎期间肺间充质细胞的转录组响应，揭示了其多样化和特异性的免疫活动 | 首次系统性地鉴定了肺炎期间肺间充质细胞的五种亚型及其转录组动态变化，并发现了跨细胞类型的核心响应和亚型特异性响应 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且时间点有限（仅24小时和6周），可能未覆盖所有疾病阶段 | 探究肺间充质细胞在肺炎期间的转录组响应及其免疫功能 | 小鼠肺组织中的间充质细胞 | 单细胞转录组学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自小鼠肺单细胞悬液的间充质细胞，包括初始组、肺炎组和感染恢复组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 512 | 2026-03-06 |
Ag-driven CD8 + T cell clonal expansion is a prominent feature of MASH in humans and mice
2025-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000971
PMID:39047085
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术，揭示了MASH（代谢功能障碍相关脂肪性肝炎）中肝脏T细胞的表型、T细胞受体多样性及抗原驱动的克隆扩增现象 | 首次在人类和小鼠模型中证实MASH诱导的肝硬化导致肝脏中T细胞发生抗原依赖性克隆扩增和功能分化，并识别了PD1、TIGIT和TOX等慢性抗原刺激标志物 | 研究未明确驱动T细胞激活的具体抗原靶点，且样本来源限于人类肝硬化和小鼠饮食诱导MASH模型，可能无法完全代表所有MASH亚型 | 旨在解析MASH进展中T细胞在肝脏积累的表型、T细胞受体多样性及其功能作用 | 人类肝硬化患者和小鼠饮食诱导MASH模型的肝脏驻留T细胞 | 免疫学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 5'单细胞测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 人类肝硬化患者和小鼠MASH模型的肝脏T细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 513 | 2026-03-06 |
Mapping cell-cell fusion at single-cell resolution
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.627873
PMID:39896473
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研究论文 | 本文开发了一种名为ClonMapper Duo（CMDuo）的分子工具包，用于在单细胞分辨率下映射肿瘤细胞群体中的细胞-细胞融合事件 | 通过结合报告基因表达和工程化的荧光相关索引序列与随机生成的核苷酸条形码，CMDuo能够识别并追踪单个细胞融合事件的起源和结果，这是首次在单细胞水平上实现此类映射 | 由于依赖于特定的实验系统和条形码技术，CMDuo可能不适用于所有细胞类型或疾病模型，且需要单细胞RNA-seq数据支持 | 研究细胞-细胞融合在癌症进展和治疗反应中的作用，开发一种高通量单细胞数据平台来映射融合事件 | 三阴性乳腺癌细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 514 | 2026-03-06 |
Meta-analyses of mouse and human prostate single-cell transcriptomes reveal widespread epithelial plasticity in tissue regression, regeneration, and cancer
2025-Jan-17, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01432-w
PMID:39825401
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研究论文 | 本文通过整合分析小鼠和人类前列腺的单细胞转录组数据，揭示了前列腺组织在稳态、退行、再生和癌症过程中上皮细胞状态的广泛可塑性 | 利用随机矩阵理论去噪和最优传输方法，首次系统比较了跨物种前列腺上皮细胞转录组相似性，并整合单细胞转录组与拷贝数变异分析，阐明了前列腺癌进展中的转录程序 | 研究主要基于已发表和新生成的scRNA-seq数据，可能受限于样本数量和技术平台的异质性，且功能验证实验较少 | 探究前列腺上皮细胞在组织稳态、退行、再生和癌症过程中的动态变化和可塑性 | 小鼠和人类前列腺组织，包括正常、雄激素剥夺后退行、良性前列腺增生和未经治疗的前列腺癌样本 | 单细胞转录组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机矩阵理论、最优传输 | 单细胞转录组数据、拷贝数变异数据 | 整合了多个已发表和新生成的小鼠和人类前列腺scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 515 | 2026-03-06 |
Dimensionality reduction for visualizing spatially resolved profiling data using SpaSNE
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf002
PMID:39960663
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研究论文 | 本文开发了一种名为SpaSNE的空间解析t-SNE方法，用于整合空间和分子信息，以更准确地可视化空间解析分析数据 | SpaSNE是首个针对空间解析分析数据定制的降维方法，整合了空间和分子信息，相比传统方法如t-SNE和UMAP能提供更准确和有意义的数据可视化 | NA | 开发一种针对空间解析分析数据的降维和可视化方法，以更好地解释细胞类型和分子结构 | 空间解析分析数据集，包括来自不同疾病、组织和细胞类型的细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间解析分析技术 | t-SNE, UMAP, SpaSNE | 空间解析分析数据 | 多个公共数据集，涵盖3个实验平台和不同疾病、组织及细胞类型 | 10x Genomics, 其他 | 空间转录组学, 空间解析分析 | Visium, STARmap, MERFISH | Visium, STARmap, MERFISH平台生成的空间解析分析数据 |
| 516 | 2026-03-06 |
Lifting the curse from high-dimensional data: automated projection pursuit clustering for a variety of biological data modalities
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf052
PMID:40440093
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研究论文 | 本文提出了一种名为自动投影追踪（APP）的无监督聚类方法，通过将高维数据顺序投影到低维表示来缓解维度诅咒，并在多种生物数据模态上验证其有效性 | 提出了一种替代传统高维空间聚类的方法，通过自动投影追踪技术降低维度诅咒的影响，从而更有效地揭示生物数据中的模式 | 未明确说明方法在极端高维或噪声数据下的鲁棒性，以及计算效率的详细评估 | 开发一种能缓解维度诅咒的无监督聚类方法，以改善高维生物数据的分析 | 高维生物数据，包括转录组学、蛋白质组学、单细胞组学数据等 | 机器学习 | NA | 自动投影追踪（APP） | 无监督聚类算法 | 高维生物数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 质谱细胞术, 多重成像, T细胞受体库分析 | NA | NA |
| 517 | 2026-03-06 |
Keeping an Eye Out for Autophagy in the Cornea: Sample Preparation for Single-Cell RNA-Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_502
PMID:37930627
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研究论文 | 本文描述了利用单细胞RNA测序技术研究角膜缘上皮干细胞群及自噬对其功能影响的样本制备方法 | 开发了针对角膜/角膜缘组织活细胞单细胞悬液的分离协议，并结合自噬缺陷模型进行scRNA-seq分析 | NA | 研究自噬对角膜缘上皮干细胞功能的影响 | 小鼠角膜缘上皮干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 518 | 2026-03-06 |
Characterizing the immune infiltrate in secondary syphilis: implications for transmission and pathology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1549206
PMID:40201184
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研究论文 | 本研究通过免疫组化、bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术，分析了二期梅毒皮肤病变中的免疫浸润特征，并探讨了梅毒螺旋体在皮肤中的免疫逃逸机制 | 首次结合单细胞RNA测序和免疫组化技术，系统描绘了二期梅毒皮肤病变中的免疫细胞组成和细胞间通讯网络，并揭示了表皮TLR-MYD88通路在宿主应答中的关键作用 | 研究样本来源于福尔马林固定石蜡包埋的组织，可能影响RNA质量和单细胞测序的灵敏度；体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境 | 阐明梅毒螺旋体在皮肤感染过程中的免疫逃逸机制和宿主免疫应答特征 | 二期梅毒患者的皮肤活检组织、健康人外周血单个核细胞（PBMCs）、原代角质形成细胞和MyD88敲除角质形成细胞 | 数字病理学 | 梅毒 | 免疫组化（IHC）、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 图像、转录组数据 | 二期梅毒患者的皮肤活检样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 519 | 2026-03-06 |
Modeling reproductive and pregnancy-associated tissues using organ-on-chip platforms: challenges, limitations, and the high throughput data frontier
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1568389
PMID:40236940
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综述 | 本文综述了使用器官芯片平台模拟生殖和妊娠相关组织的现状，包括现有平台、方法学、局限性以及高通量数据前沿技术 | 系统总结了器官芯片在生殖和妊娠研究中的应用，并提出了通过空间转录组学、成像质谱流式细胞术和外泌体分析等新技术来克服现有挑战 | 设备限制（如细胞数量少、上清液体积低）、制造材料限制以及分子和生化检测方法的不足 | 评估器官芯片技术在生殖和妊娠相关组织建模、药物发现和毒理学风险评估中的应用潜力和挑战 | 生殖和妊娠相关组织 | 生物医学工程 | NA | 空间转录组学, 成像质谱流式细胞术, 外泌体分析, 显微成像, 免疫细胞化学, 实时聚合酶链反应, 细胞因子多重分析 | 器官芯片（微生理系统或组织芯片） | 图像, 分子数据, 生化数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 520 | 2026-03-06 |
Serine supplementation suppresses hypoxia-induced pathological retinal angiogenesis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.105299
PMID:40303351
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研究论文 | 本研究探讨了丝氨酸补充对抑制缺氧诱导的病理性视网膜血管新生的作用及其机制 | 首次系统性地在氧诱导视网膜病变小鼠模型中，通过多组学分析和单细胞RNA测序，揭示了丝氨酸通过增强线粒体脂肪酸氧化和氧化磷酸化来抑制病理性血管新生的新机制，并鉴定出HMGB1蛋白作为关键介导因子 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类疾病中的直接适用性尚需进一步验证；干预时间点和剂量方案有待优化；对丝氨酸代谢下游具体信号通路的解析还不够深入 | 探究丝氨酸代谢在抑制缺氧驱动的病理性视网膜血管新生中的作用及分子机制 | 野生型C57BL/6J小鼠的氧诱导视网膜病变模型 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 代谢组学, 脂质组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹 | 动物模型 | 多组学数据, 图像, 文本 | 未明确具体数量的小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |