单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 29530 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2025-07-04 |
Peritoneal cavity-derived GATA6+ macrophages inhibit fibrosis through IL33 in endometrium
2025-Jun-29, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.06.088
PMID:40592367
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，识别并验证了GATA6+巨噬细胞在子宫内膜损伤修复和抑制纤维化中的关键作用 | 首次发现腹膜腔来源的GATA6+巨噬细胞通过IL33抑制子宫内膜纤维化的机制 | 研究样本可能仅限于特定类型的子宫内膜损伤患者，未涉及其他病因的子宫内膜疾病 | 探究子宫内膜损伤后修复过程中巨噬细胞的来源及其功能机制 | 正常子宫内膜和宫腔粘连(IUA)患者的子宫内膜组织 | 生殖医学 | 宫腔粘连 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量，但包括正常子宫内膜和IUA患者的样本 |
| 502 | 2025-07-04 |
The progress and trends of the mechanism of cardiopulmonary bypass-associated acute lung injury: A narrative review
2025-Jun-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000043019
PMID:40587734
|
综述 | 本文回顾了心肺转流相关急性肺损伤机制的研究进展与趋势 | 强调未来研究应聚焦于炎症关键靶点（如中性粒细胞、巨噬细胞和糖萼细胞外衣）以及基因编辑和单细胞测序等先进技术 | 多年来该领域未取得突破性进展，导致管理策略和临床医学措施停滞不前 | 揭示心肺转流相关急性肺损伤的潜在机制并寻找有效的预防和治疗策略 | 心肺转流相关急性肺损伤的机制 | 临床医学 | 心血管疾病 | 基因编辑、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 503 | 2025-07-04 |
Cardiolipin-mimic lipid nanoparticles without antibody modification delivered senolytic in vivo CAR-T therapy for inflamm-aging
2025-Jun-26, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102209
PMID:40602406
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研究论文 | 本研究开发了一种基于卡迪奥脂类似物的脂质纳米颗粒，用于体内递送senolytic CAR-T疗法，以治疗炎症性衰老相关疾病 | 首次使用无需抗体修饰的卡迪奥脂类似物脂质纳米颗粒实现体内T细胞转染，并延长mRNA表达时间 | 未提及临床前研究的样本量及长期安全性数据 | 开发更高效的体内CAR-T细胞工程递送系统，治疗衰老相关炎症性疾病 | T细胞、衰老相关炎症性疾病（如肝纤维化和类风湿关节炎） | 生物医学工程 | 类风湿关节炎、肝纤维化 | mRNA递送、单细胞测序 | CAR-T | RNA序列数据 | NA |
| 504 | 2025-07-04 |
Sp140L functions as a herpesvirus restriction factor suppressing viral transcription and activating interferon-stimulated genes
2025-Jun-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426339122
PMID:40526717
|
研究论文 | 该研究揭示了Sp140L作为一种疱疹病毒限制因子，通过抑制病毒转录和激活干扰素刺激基因来发挥作用 | 首次发现Sp140L作为疱疹病毒的限制因子，并揭示了其在干扰素非依赖性先天免疫反应中的作用 | 研究主要基于EBV病毒模型，对其他疱疹病毒的普适性需要进一步验证 | 探究疱疹病毒如何逃避宿主防御机制以及宿主限制因子的作用 | EB病毒（EBV）及其与宿主B细胞的相互作用 | 病毒学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | EBNA-LP敲除（LPKO）模型 | RNA-seq数据 | 未明确说明样本数量，使用EBNA-LP敲除感染的B细胞 |
| 505 | 2025-07-04 |
CRISPR for cystic fibrosis: Advances and insights from a systematic review
2025-Jun-17, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.06.021
PMID:40534129
|
系统综述 | 本文系统综述了CRISPR技术在囊性纤维化(CF)基因治疗中的应用进展，分析了27篇相关研究文章 | 通过跨研究比较，分析了多种CRISPR技术对CF致病变异的编辑效果，并提出了标准化报告编辑效率和功能恢复的建议 | 需要更多单细胞RNA测序和体内研究以达到临床相关结论 | 为CRISPR基因编辑技术在CF治疗中的进一步探索提供技术见解 | 囊性纤维化(CF)致病变异 | 基因编辑 | 囊性纤维化 | CRISPR, 同源定向修复, 碱基编辑, 原始编辑 | NA | 研究文章 | 27篇研究文章 |
| 506 | 2025-07-04 |
Epigenetic Reprogramming of Autophagy Leads to Uncovering a Novel Therapeutic Target for Mutant IDH1 Astrocytomas
2025-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.08.584091
PMID:38559270
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研究论文 | 本文揭示了自噬在mIDH1胶质瘤中的关键作用，并提出了通过抑制自噬来增强放射敏感性的新治疗策略 | 发现自噬是mIDH1胶质瘤生存的关键通路，并证明通过阻断该通路可增强放射敏感性 | 研究主要基于体外和动物模型，临床转化效果尚需进一步验证 | 探索mIDH1胶质瘤的治疗新靶点 | 人类和小鼠的mIDH1胶质瘤细胞 | 肿瘤学 | 胶质瘤 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的mIDH1胶质瘤细胞及患者样本 |
| 507 | 2025-07-04 |
A Molecular, Spatial, and Regulatory Atlas of the Hydra vulgaris Nervous System
2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.15.531610
PMID:36993575
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研究论文 | 本研究提供了Hydra vulgaris神经系统的最全面分子和空间特征 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定了八种神经元类型，并进一步细分为十五种转录不同的亚型，每种亚型具有独特的空间分布和形态 | 研究仅针对Hydra vulgaris，结果可能不适用于其他生物 | 揭示神经系统发育、稳态和再生的分子机制 | Hydra vulgaris的神经系统 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 分子数据, 空间数据 | NA |
| 508 | 2025-07-04 |
Transcriptional landscape of pleural mesothelioma patients in relation to NF2 gene mutational status
2025-Jun-09, Journal of the Egyptian National Cancer Institute
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s43046-025-00284-0
PMID:40484892
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研究论文 | 本研究探讨了NF2基因突变状态对胸膜间皮瘤患者转录景观的影响 | 揭示了NF2突变如何影响肿瘤微环境、免疫浸润、细胞因子信号传导及化疗敏感性 | 样本量相对较小（82例），且缺乏实验验证 | 阐明NF2基因突变在胸膜间皮瘤生物学行为和治疗反应中的作用 | 82例胸膜间皮瘤患者 | 肿瘤基因组学 | 胸膜间皮瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序、生物信息学分析（xCell, Cytosig, pRRophetic） | 逻辑回归模型 | 转录组数据 | 82例胸膜间皮瘤患者（来自TCGA数据库） |
| 509 | 2025-07-04 |
Single-Cell RNA Sequencing of Rabbit Sclera at Different Developmental Stages: Unveiling Scleral Cells Atlas and the Heterogeneity of Fibroblasts
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.83
PMID:40576432
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了兔巩膜发育的单细胞转录组图谱，揭示了成纤维细胞的异质性、分化轨迹、基质组表达模式及细胞间通讯 | 首次构建兔巩膜发育的单细胞图谱，揭示了成纤维细胞的异质性及跨物种保守特征 | 研究仅针对新西兰兔，未涉及其他物种或人类样本的直接验证 | 阐明巩膜成纤维细胞的异质性及发育过程中的分子特征 | 新西兰兔巩膜组织（胚胎25天及出生后7天、21天、180天） | 单细胞转录组学 | 近视 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 新西兰兔巩膜组织（E25、P7、P21、P180四个发育阶段） |
| 510 | 2025-07-04 |
Elevated Fcy receptor expression augments pro-inflammatory macrophage phagocytosis in systemic sclerosis and associated rheumatic diseases
2025-Jun-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae688
PMID:39672802
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research paper | 本研究通过分析系统性硬化症（SSc）和其他风湿性疾病的巨噬细胞激活、信号通路及治疗反应，揭示了增强吞噬作用的机制 | 发现SSc患者巨噬细胞中FCGR基因表达升高及FcγR介导的吞噬途径富集，并指出FcγRI和FcγRII水平升高是增强吞噬活性和IL-6驱动炎症的关键因素 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，可能无法完全反映体内复杂的免疫环境 | 探究SSc及其他风湿性疾病中巨噬细胞的促吞噬表型及其机制 | 健康对照者及SSc、RA、PsA和axSpA患者的皮肤和肺巨噬细胞 | 免疫学 | 系统性硬化症及相关风湿性疾病 | scRNA-seq, 流式细胞术, Western blot, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 来自健康对照者及SSc、RA、PsA和axSpA患者的CD14+单核细胞衍生的巨噬细胞 |
| 511 | 2025-07-04 |
Lung-resident memory CD4+ T cells are dependent on Batf3
2025-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf035
PMID:40184040
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研究论文 | 本文研究了Batf3转录因子在肺组织中CD4+记忆T细胞积累中的作用及其对过敏反应的影响 | 揭示了Batf3通过促进特定CD4+记忆T细胞亚群的发育来调控过敏性反应的分子机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探究肺组织中记忆T细胞积累的细胞和分子机制 | 小鼠肺组织中的CD4+记忆T细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | 小鼠哮喘模型 | 基因表达数据 | Batf3缺陷小鼠和对照小鼠 |
| 512 | 2025-07-04 |
Cell type-specific network analysis in Diversity Outbred mice identifies genes potentially responsible for human bone mineral density GWAS associations
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.20.594981
PMID:38826475
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研究论文 | 利用单细胞转录组学数据，通过细胞类型特异性网络分析，识别与人类骨矿物质密度GWAS关联的潜在因果基因 | 结合单细胞转录组学数据和GWAS结果，识别出21个网络驱动基因，这些基因可能通过间充质谱系细胞分化调控骨矿物质密度 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 解析骨矿物质密度GWAS关联的潜在因果基因及其功能背景 | Diversity Outbred小鼠的骨髓基质细胞（BMSC-OBs） | 基因组学 | 骨质疏松症 | scRNA-seq, eQTL/sQTL分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 513 | 2025-07-04 |
Cardiac Fibroblasts regulate myocardium and coronary vasculature development via the collagen signaling pathway
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.11.612512
PMID:39314489
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研究论文 | 本研究揭示了心脏成纤维细胞通过胶原信号通路调控心肌和冠状血管发育的功能 | 首次系统研究了心脏成纤维细胞与心肌细胞、血管内皮细胞在发育过程中的相互作用，并确定了胶原信号通路的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类心脏发育可能存在差异；长期成纤维细胞消融的补偿机制需要进一步研究 | 探究心脏成纤维细胞在心肌和冠状血管发育中的作用机制 | 小鼠心脏发育过程中的成纤维细胞、心肌细胞和血管内皮细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, RNA染色, Pdgfra-CreER控制的DTA消融系统 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同发育阶段的小鼠心脏组织样本 |
| 514 | 2025-07-04 |
Pathological α-synuclein dysregulates epitranscriptomic writer METTL3 to drive neuroinflammation in microglia
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115618
PMID:40279247
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研究论文 | 本文研究了m6A甲基转移酶复合物中的METTL3在α-突触核蛋白和锰诱导的神经炎症中的作用 | 揭示了METTL3在α-突触核蛋白和锰诱导的神经炎症中的新功能，并发现其在阿尔茨海默病、帕金森病和路易体痴呆患者中的上调 | 研究主要基于体外和动物模型，人类组织样本的验证仍需进一步扩大 | 探究m6A RNA修饰在神经退行性疾病中的作用机制 | 人类小胶质细胞、星形胶质细胞、阿尔茨海默病、帕金森病和路易体痴呆患者的死后组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病, 帕金森病, 路易体痴呆 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 人类死后组织样本及体外细胞模型 |
| 515 | 2025-07-04 |
A multi-kingdom genetic barcoding system for precise clone isolation
2025-May-21, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02649-1
PMID:40399693
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研究论文 | 介绍了一种多界遗传条形码系统CloneSelect，用于从复杂细胞群中精确分离目标克隆 | 开发了CloneSelect系统，通过CRISPR碱基编辑技术触发目标克隆表达报告基因以实现分离，适用于多种细胞类型 | 未提及该系统在临床应用中的效果或可能存在的技术障碍 | 开发一种能够从复杂细胞群中精确分离目标克隆的技术 | 人类胚胎肾293T细胞、小鼠胚胎干细胞、人类多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞 | 基因工程 | NA | CRISPR碱基编辑、单细胞RNA测序 | NA | 遗传数据 | 多种细胞类型（人类胚胎肾293T细胞、小鼠胚胎干细胞、人类多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞） |
| 516 | 2025-07-04 |
MALADAPTIVE IMMUNE-FIBROTIC AXIS DRIVES IMPAIRED LONG BONE REGENERATION UNDER MECHANICAL INSTABILITY
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564177
PMID:37961650
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research paper | 该研究通过工程化小鼠延迟愈合模型，探讨了机械不稳定性如何通过免疫-纤维化轴影响长骨再生 | 开发了一种可调谐髓内钉小鼠模型，模拟人类肥大性骨不连，揭示了机械不稳定性如何通过免疫-基质细胞相互作用驱动病理过程 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究机械不稳定性对骨折愈合的影响及其免疫学机制 | 小鼠长骨骨折模型 | 骨再生医学 | 骨折愈合障碍 | 空间转录组学、系统免疫分析 | 多变量建模 | 基因表达数据、生物力学数据 | 未明确说明具体样本量的小鼠实验 |
| 517 | 2025-07-04 |
scTsI: an effective two-stage imputation method for single-cell RNA-seq data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf298
PMID:40579791
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research paper | 提出了一种名为scTsI的两阶段插补方法，用于处理单细胞RNA-seq数据中的丢失事件 | scTsI通过两阶段插补算法，保持高表达值不变，避免引入新噪声，并支持稀疏矩阵输入以加速插补过程 | 在处理高丢失率数据、不同类型数据及针对各种下游分析时，现有方法性能可能低于预期 | 减轻单细胞RNA-seq数据中丢失事件对下游分析的影响 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | ridge regression | 基因表达数据 | 多种模拟和真实数据 |
| 518 | 2025-07-02 |
Correction to: ScInfeR: an efficient method for annotating cell types and sub-types in single-cell RNA-seq, ATAC-seq, and spatial omics
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf337
PMID:40580031
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 519 | 2025-07-04 |
DeepExDC interprets genomic compartmentalization changes in single-cell Hi-C data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf301
PMID:40581982
|
研究论文 | 提出了一种名为DeepExDC的可解释一维卷积神经网络，用于在单细胞Hi-C数据中进行基因组区室差异分析 | DeepExDC无需任何分布假设和差异模式限制，能够解释跨多个条件的基因组区室变化，且在模拟和实验数据中显示出更高的准确性 | 单细胞水平上的区室化变化计算分析领域尚处于起步阶段 | 开发一种方法用于单细胞Hi-C数据中的基因组区室差异分析 | 单细胞Hi-C数据 | 基因组学 | NA | scHi-C, scRNA-seq, scATAC-seq | 1D CNN | 基因组数据 | 模拟和实验scHi-C数据 |
| 520 | 2025-07-04 |
Computational modeling of single-cell dynamics data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf305
PMID:40586321
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综述 | 本文综述了单细胞动态数据的计算建模方法及其在理解生命机制和疾病治疗中的应用 | 概述了单细胞动态数据整合与分析的最新算法进展，并讨论了生物技术和人工智能算法在探索复杂生命过程中的前沿发展 | 未提及具体算法的性能比较或实际应用中的具体限制 | 探讨单细胞动态数据的计算建模方法及其在生物医学研究中的应用 | 单细胞动态数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞动态数据 | NA |