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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-06-08 |
[Spatial omics in pulmonary fibrosis: advancing mechanistic insights and therapeutic strategies]
2026-Feb-25, Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences
DOI:10.3724/zdxbyxb-2025-0785
PMID:41631436
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综述 | 综述空间组学技术在肺纤维化研究中的应用进展,包括空间代谢组学、转录组学和蛋白质组学,揭示其揭示疾病机制和指导治疗策略的潜力 | 系统整合空间组学(代谢、转录、蛋白质)在肺纤维化中的最新进展,强调其在保留组织架构下实现高通量可视化分析,为精准诊断和药物开发提供新框架 | 未具体说明空间组学技术的可及性、成本及标准化挑战,以及从研究到临床转化的潜在障碍 | 总结空间组学技术在肺纤维化发病机制、精准诊断和靶向治疗中的应用进展,推动更有效的临床策略 | 肺纤维化疾病模型和特发性肺纤维化(IPF)患者组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化, 特发性肺纤维化 | 空间组学, 空间代谢组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 组织图像, 转录数据, 蛋白质数据, 代谢物数据 | NA | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 502 | 2026-06-08 |
Attention-guided enhanced deconvolution enables reference-free cell type estimation in spatial transcriptomics
2026-Feb-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39703-0
PMID:41667720
|
研究论文 | 提出一种无需单细胞参考数据的空间转录组解码方法AGED,结合概率建模与注意力机制实现细胞类型自动估计 | 首次将线性复杂度注意力机制(Performer)与多重注意力引导相结合,实现空间转录组数据中细胞类型数量的自动选择和特征优化 | 未在更大规模或更复杂组织的空间转录组数据上进行充分验证,可能受限于组织类型和平台差异 | 开发无需单细胞参考图谱的空间转录组细胞类型解卷积方法 | 小鼠嗅球、人胰腺导管腺癌、人胸腺组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组测序 | Performer注意力网络、交叉注意力、空间注意力、协同注意力 | 空间转录组表达数据 | 三种组织样本(小鼠嗅球、人胰腺导管腺癌、人胸腺) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 503 | 2026-06-08 |
Aerobic exercise facilitates p300 nuclear translocation via ADRB2-AMPKα signaling, leading to enhanced histone acetylation and mitigation of cognitive decline in APP/PS1 mice
2026-Feb-10, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-026-01983-z
PMID:41668187
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研究论文 | 探究有氧运动通过ADRB2-AMPKα信号通路促进p300核转位,增强组蛋白乙酰化,减轻APP/PS1小鼠认知衰退的机制 | 首次揭示有氧运动通过ADRB2-AMPKα-p300轴调控染色质重塑,对抗阿尔茨海默病突触退化和认知衰退的分子机制 | 基于APP/PS1小鼠模型,结果需在人类中验证;AMPKα抑制实验仅在小鼠中进行;样本量和运动方案的具体影响需进一步研究 | 阐明体育锻炼诱导的神经保护与表观遗传重塑之间的分子机制 | NHANES 2013-2014队列的1511名参与者、APP/PS1转基因小鼠 | 分子生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 1511名人类参与者;APP/PS1小鼠接受8周跑步机运动 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 504 | 2026-06-08 |
Interferon stimulation and NKG2D expression drive enhanced natural killer cell antibody-dependent cellular cytotoxicity against viral infections
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag019
PMID:41634919
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研究论文 | 结合功能ADCC检测和单细胞转录组学,揭示干扰素刺激和NKG2D表达在增强自然杀伤细胞抗体依赖性细胞毒性抗病毒反应中的关键作用 | 首次发现不同ADCC反应水平的COVID-19参与者中NK细胞具有不同的转录程序,低ADCC反应者NK细胞上调增殖通路,高ADCC反应者增强干扰素刺激基因和NKG2D表达,并揭示干扰素介导的NK细胞激活与抗体介导ADCC能力之间的调节性检查点机制 | 研究未明确阐述局限性 | 探究自然杀伤细胞内在因素和抗体在抗体依赖性细胞毒性反应中的相对贡献 | COVID-19参与者的外周血自然杀伤细胞 | 自然语言处理 | 病毒感染 | 单细胞转录组学,功能ADCC检测 | NA | 单细胞转录组数据,功能检测数据 | COVID-19参与者外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 505 | 2026-06-08 |
Spatial transcriptomics identifies differentiation, lipid metabolism, and retinoid pathway alterations in acne vulgaris
2026-Feb-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198021
PMID:41657309
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研究论文 | 通过空间转录组学分析揭示了痤疮中分化、脂质代谢和维甲酸通路的改变 | 首次使用定制化空间转录组学面板和专门分割流程研究痤疮不同亚型(粉刺型和脓疱型)的基因表达差异,并发现AP-1抑制剂T-5224具有治疗潜力 | 未在标题和摘要中明确提及局限性 | 探究痤疮发病机制中不同亚型(粉刺型和脓疱型)在基因表达、信号通路以及皮脂腺参与方面的差异 | 痤疮患者的健康皮肤、非病变皮肤、粉刺型和脓疱型皮肤 | 空间转录组学 | 痤疮 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 使用定制化面板聚焦皮脂分化、脂质代谢和维甲酸信号通路 |
| 506 | 2026-06-08 |
PTPN2 deficiency amplifies inflammatory signalling and impairs functional maturation of human stem cell-derived islets
2026-Feb-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04892-4
PMID:41654987
|
研究论文 | PTPN2缺乏加剧炎症信号并损害人类干细胞衍生胰岛的功能成熟 | 首次揭示了PTPN2在人类干细胞衍生胰岛分化过程中的动态表达模式及其对炎症信号和功能成熟的影响 | 研究基于体外和动物模型,尚需在人类体内验证,且具体分子机制需进一步阐明 | 探究PTPN2缺乏对人类干细胞衍生胰岛分化及功能的影响 | PTPN2缺陷的H1人类胚胎干细胞衍生胰岛 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | scRNA-Seq, CRISPR-Cas12a基因组编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据 | T1D器官捐赠者样本及NOD-SCID小鼠实验的有限样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序 |
| 507 | 2026-06-08 |
Mesothelial cells promote peritoneal invasion and metastasis of ascites-derived ovarian cancer cells through spheroid formation
2026-Feb-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu5944
PMID:41650261
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研究论文 | 该研究揭示了间皮细胞通过形成球状体促进卵巢癌细胞腹膜侵袭和转移的机制 | 首次发现间皮细胞是腹水中非恶性细胞的关键成分,并阐明其通过聚集性癌-间皮球体(ACMS)促进卵巢癌细胞快速腹腔扩散的创新机制 | 研究主要基于体外实验和RNA测序分析,缺乏体内动物模型验证,且样本量有限 | 探究上皮性卵巢癌细胞与非恶性细胞在腹膜转移前的相互作用 | 上皮性卵巢癌细胞和腹水中的间皮细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫荧光 | NA | 序列数据, 图像 | 涉及腹水样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 508 | 2026-06-08 |
Tumour-intrinsic features shape T cell differentiation through precursor to symptomatic multiple myeloma
2026-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68718-4
PMID:41644568
|
研究论文 | 通过大规模单细胞RNA测序探索多发性骨髓瘤中肿瘤内在特征对T细胞分化的影响 | 揭示了多发性骨髓瘤中T细胞并非表现为耗竭,而是抗原驱动的终末记忆分化,并发现肿瘤负担和抗原呈递基因表达等肿瘤内在特征对此过程的影响 | 未提及具体局限 | 探究多发性骨髓瘤及其前驱病变中T细胞分化与肿瘤内在特征的关联机制 | 多发性骨髓瘤患者、前驱病变患者及非癌症对照者的骨髓和血液样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包含多发性骨髓瘤患者、前驱病变患者及非癌症对照者的大规模样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 509 | 2026-06-08 |
Single-cell transcriptomic profiling of peripheral blood mononuclear cells reveals monocyte heterogeneity in patients with Moyamoya disease
2026-Feb-05, Orphanet journal of rare diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13023-026-04241-5
PMID:41645291
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析烟雾病患者外周血单个核细胞的转录组特征,揭示单核细胞的异质性 | 首次利用单细胞RNA测序全面绘制烟雾病患者外周免疫细胞图谱,发现中间型单核细胞(Mono_CD14_CD16)增加并鉴定RETN和TGFBR2作为潜在生物标志物 | 样本量较小(6例患者和3例对照),且未对发现的机制进行功能验证 | 探究烟雾病患者外周免疫细胞的转录组变化,寻找潜在生物标志物和疾病机制 | 烟雾病患者外周血单核细胞(PBMCs) | 机器学习 | 烟雾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 6例烟雾病患者和3例对照的PBMCs | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 510 | 2026-06-08 |
Single-cell Transcriptomic Profiling Reveals Diagnostic of T Cell-platelet Aggregates in Peripheral Blood for Coronary Vulnerable Plaques
2026-Feb-04, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-025-10723-x
PMID:41639521
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了外周血中T细胞-血小板聚集体在冠状动脉易损斑块诊断中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序在外周血中发现了T细胞-血小板聚集体与易损斑块的关联,并筛选出五种潜在的循环生物标志物用于无创诊断 | 数据来源仅限于特定队列,可能需更大样本验证;机制研究主要基于生物信息学分析,缺乏功能性实验验证 | 寻找用于冠状动脉易损斑块无创诊断的外周血生物标志物 | 冠状动脉疾病患者的易损斑块和外周血单核细胞中的T细胞-血小板聚集体 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机递归特征消除、LASSO回归、Boruta算法 | 单细胞转录组数据 | 来自冠状动脉疾病患者和对照组的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 511 | 2026-06-08 |
Decoding cytokine networks in ulcerative colitis to identify pathogenic mechanisms and therapeutic targets
2026-Feb-03, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.adt0986
PMID:41632832
|
研究论文 | 通过系统免疫学建模解析溃疡性结肠炎中细胞因子网络,识别致病机制与治疗靶点 | 利用单细胞转录组数据构建复杂细胞因子网络,首次识别出治疗初治患者独有的细胞因子子网络,并发现TL1A作为TNF和IL-23A上游调控因子的潜在治疗靶点 | 未明确提及实验验证范围或样本量限制 | 阐明溃疡性结肠炎中失调的细胞因子信号网络,指导靶向治疗 | 溃疡性结肠炎患者结肠活检样本及类器官 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | 细胞因子网络模型 | 转录组数据 | 来自治疗初治和治疗后溃疡性结肠炎患者的结肠活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 512 | 2026-06-08 |
The fetal trophoblast cell marker HLA-G activates a type I interferon response in primary NK cells through the receptor KIR2DL4
2026-Feb-03, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.adv2400
PMID:41632833
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研究论文 | 研究揭示了胎儿滋养细胞标志物HLA-G通过受体KIR2DL4激活原代NK细胞中的I型干扰素反应 | 发现HLA-G通过非经典途径选择性地诱导I型干扰素刺激基因转录,并揭示了KIR2DL4胞质尾部的羧基端序列与JAK1结合的必要性 | NA | 研究胎儿滋养细胞表达的HLA-G如何通过受体KIR2DL4调控母胎界面的NK细胞免疫反应 | 人早期妊娠子宫蜕膜中的NK细胞及胎儿滋养细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2026-06-08 |
Targeting RRBP1 reverses immune evasion and enhances immunotherapy efficacy via the CXCL10-CXCR3 axis in bladder cancer
2026-Feb-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013809
PMID:41633771
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研究论文 | 本研究揭示RRBP1通过CXCL10-CXCR3轴逆转膀胱癌免疫逃逸并增强免疫治疗效果 | 首次发现炎症相关基因RRBP1通过调控CXCL10-CXCR3轴影响CD8+ T细胞浸润和抗肿瘤免疫,并验证其抑制可增强抗PD-L1治疗敏感性 | 研究主要基于膀胱癌模型,RRBP1在其他癌症中的通用性及临床转化潜力需进一步验证 | 探索炎症相关基因RRBP1在膀胱癌恶性进展、免疫逃逸及免疫治疗中的作用机制 | 膀胱癌肿瘤细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞(特别是CD8+ T细胞) | 机器学习 | 膀胱癌 | 转录组学,蛋白质组学,Cas9筛选,单细胞RNA测序,免疫组化,多重免疫荧光,流式细胞术 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析肿瘤免疫微环境 |
| 514 | 2026-06-08 |
transFusion: a novel comprehensive platform for integration analysis of single-cell and spatial transcriptomics
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag059
PMID:41645434
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研究论文 | 开发了一个名为transFusion的综合性平台,用于整合分析单细胞RNA测序和10× Visium空间转录组数据 | 提供了一个基于网络的全新综合平台,集成了从基础可视化到高级分析的12项功能,包括细胞间依赖性分析、配体-受体共表达识别和可视化、空间多模态梯度变化模式等 | 主要针对10× Visium空间转录组数据,可能不适用于其他空间技术;对计算和统计专业知识有限的用户仍需一定学习成本 | 解决空间转录组数据分析中多模态数据整合不充分、空间信息利用有限的挑战 | 单细胞RNA测序和10× Visium空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 两个案例研究数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10× Visium空间转录组平台和单细胞RNA测序平台 |
| 515 | 2026-06-08 |
Single-cell omics in tumor lymph node metastasis: mechanisms and therapeutic implications
2026-Feb-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02585-x
PMID:41629958
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综述 | 综述单细胞组学在肿瘤淋巴结转移机制及免疫治疗意义方面的研究成果 | 通过单细胞测序技术揭示肿瘤引流淋巴结在免疫治疗中的关键角色及其适应性改变 | 从技术及研究内容角度,提出了当前挑战及未来发展方向 | 总结肿瘤淋巴结转移的微环境及免疫抑制机制,综述相关新靶点及免疫治疗研究现状 | 肿瘤淋巴结转移过程中的肿瘤细胞、肿瘤引流淋巴结及其微环境 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 516 | 2026-06-08 |
BiCLUM: Bilateral contrastive learning for unpaired single-cell multi-omics integration
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013932
PMID:41632825
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研究论文 | 提出BiCLUM双边对比学习方法,用于未配对单细胞多组学数据的整合 | 首次通过双边对比学习同时实现细胞级和特征级的跨模态对齐,并利用先验基因组知识将一种模态转换到另一种模态的数据空间 | 方法依赖先验基因组知识进行模态转换,可能限制其在缺失此类知识的场景下的适用性;未提及处理超过两种模态时的扩展性问题 | 开发一种鲁棒且可解释的未配对单细胞多组学数据整合方法 | 单细胞多组学数据,包括scRNA-seq、scATAC-seq和CITE-seq等 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、CITE测序 | 对比学习 | 基因表达数据、染色质可及性数据、蛋白质丰度数据 | 不适用(未在标题和摘要中明确提及) | 不适用 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 不适用 | 不适用 |
| 517 | 2026-06-08 |
A Comprehensive Analysis of Type I Interferon Risk Gene Signatures in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Feb, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70211
PMID:41635152
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研究论文 | 系统性红斑狼疮中I型干扰素风险基因标志的综合分析 | 通过孟德尔随机化分析首次确定HERC5、IFIT3、IFI44L和IFI6与SLE风险的因果关系,并发现IFI44L低甲基化是IFN-I通路激活的关键表观遗传驱动因素 | NA | 全面表征系统性红斑狼疮中I型干扰素风险基因标志及其因果关系 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞和单核细胞 | 机器学习 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据、临床参数、DNA甲基化数据 | 705例SLE患者和385509例对照(FinnGen队列),及外部验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 518 | 2026-06-08 |
Targeting the SIRT1-NAT10-GABABR1 Axis: A Novel Epitranscriptomic Approach to Mitigate Sevoflurane-Induced Cognitive Impairment in Aging
2026-Feb, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70762
PMID:41636018
|
研究论文 | 本研究探讨了SIRT1通过去乙酰化NAT10减少GABABR1 mRNA乙酰化,从而减轻七氟烷诱导老龄大鼠术后认知功能障碍的机制 | 首次揭示SIRT1-NAT10-GABABR1轴作为表观转录组调控新途径,通过去乙酰化NAT10降低GABABR1 mRNA ac4C修饰,恢复突触抑制与代谢-自噬平衡,为麻醉相关神经毒性提供全新治疗靶点 | 未明确说明 | 探索SIRT1通过调控NAT10介导的mRNA乙酰化及线粒体稳态,保护老龄大鼠免受七氟烷诱导的术后认知功能障碍 | 老龄大鼠七氟烷暴露模型及AAV介导Sirt1/Nat10操作的神经元亚群 | 数字病理学 | 老年性疾病 | NGS,单细胞RNA测序,RIP-qPCR,斑点印迹,膜片钳电生理记录 | NA | 基因表达数据,电生理数据,图像数据 | 老龄大鼠(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于鉴定神经元亚群 |
| 519 | 2026-06-08 |
Integrative single-cell analysis uncovers distinct tumour microenvironment ecotypes and immune evasion across skin cancers
2026-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70611
PMID:41636115
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据分析皮肤癌肿瘤微环境生态型及免疫逃逸机制 | 首次提出泛皮肤癌免疫重塑框架,鉴定出NARS2+NDUFC2+黑色素瘤细胞亚群及SPP1+巨噬细胞在免疫逃逸中的关键作用 | 单细胞数据样本量有限,功能验证主要基于体外实验,需进一步体内模型验证 | 揭示不同皮肤癌类型和进展阶段中肿瘤免疫生态系统的重塑模式及其对免疫逃逸和治疗抵抗的影响 | 皮肤癌患者样本(包括基底细胞癌、鳞状细胞癌、皮肤黑色素瘤和肢端黑色素瘤) | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序、CRISPR筛选、免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 | 102个皮肤癌样本(包括癌旁正常皮肤、早期和晚期肿瘤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 520 | 2026-06-08 |
Integrative Omics Analysis Reveals the Potential Value of CEACAM6 in Pan-Gastrointestinal Cancers
2026-Feb, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70327
PMID:41640009
|
研究论文 | 本研究利用多组学生物信息学方法探究CEACAM6在泛胃肠道癌症中的表达、预后价值及免疫功能 | 首次系统揭示CEACAM6在泛胃肠道癌症中的诊断准确性、肿瘤特异性过表达及空间转录组学定位特征,提出其作为精准免疫治疗靶点的潜力 | 未涉及实验验证,结论基于公共数据库的回顾性分析 | 评估CEACAM6在泛胃肠道癌症中的表达分布、预后价值和免疫功能 | 泛胃肠道癌症中的CEACAM6 | 计算机视觉 | 胃肠道癌症 | 多组学生物信息学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、甲基化数据、突变数据、空间转录组数据 | TCGA、cBioPortal、GDSC2、TIMER2.0、TISCH数据库中的多人种样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |