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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5141 - 5160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5141 | 2025-10-06 |
Mini Review: Spatial Transcriptomics to Decode the Central Nervous System
2025-Jun, Toxicologic pathology
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/01926233251325204
PMID:40119776
|
综述 | 本微型综述探讨空间转录组学在中枢神经系统研究中的应用与影响 | 系统评述空间转录组学如何通过提供空间分辨的基因表达数据革新对中枢神经系统的理解 | 面临数据解读和分辨率限制等挑战 | 探索空间转录组学对中枢神经系统研究的影响 | 中枢神经系统及神经退行性疾病（阿尔茨海默病、帕金森病、多发性硬化症、肌萎缩侧索硬化症） | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5142 | 2025-10-06 |
Uncovering somatic genetic drivers in prostate cancer through comprehensive genome-wide analysis
2025-Jun, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01623-8
PMID:40156736
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研究论文 | 通过全基因组分析识别前列腺癌的体细胞遗传驱动因素 | 整合多组学数据和多种分析方法，首次系统识别150个与前列腺癌因果相关的基因，其中MSMB基因在所有四种分析中均表现一致 | 仅基于现有数据库进行分析，缺乏实验验证；部分基因在前列腺癌中的功能机制尚不明确 | 探索散发性前列腺癌的体细胞遗传驱动因素 | 前列腺癌相关基因 | 基因组学 | 前列腺癌 | eQTL分析、孟德尔随机化、蛋白质相互作用分析、单细胞RNA-seq、共定位分析 | NA | 基因组数据、表达数据、临床数据 | UK Biobank: 9131病例和173493对照；PRACTICAL研究: 79148病例和61106对照；FinnGen队列: 13216病例和119948对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组测序 | NA | NA |
| 5143 | 2025-10-06 |
Bi-level identification of governing equations for nonlinear physical systems
2025-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00804-x
PMID:40346196
|
研究论文 | 提出一种双层级方程识别框架，用于从观测数据中发现和验证非线性物理系统的控制方程 | 利用强化学习的策略梯度算法实现双层级优化，同时进行方程发现和验证 | NA | 从观测数据中识别非线性物理系统的控制方程 | 非线性物理系统，包括湍流、三体系统以及单细胞测序数据中的RNA和蛋白质速度方程 | 机器学习 | NA | 强化学习，策略梯度算法 | 双层级优化框架 | 观测数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5144 | 2025-10-06 |
Interpretable niche-based cell‒cell communication inference using multi-view graph neural networks
2025-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00809-6
PMID:40425827
|
研究论文 | 开发了一种基于空间转录组学的细胞间通讯推断工具STCase，能够识别细胞类型特异性生态位和生态位特异性细胞通讯事件 | 首次提出使用可解释的多视图图神经网络通过细胞通讯感知注意力机制，在单细胞/点位水平推断细胞间通讯，考虑生态位异质性 | 未明确说明方法在非空间转录组数据上的适用性，验证主要基于有限的组织类型 | 开发能够考虑生态位异质性的细胞间通讯推断方法 | 人类支气管腺体和口腔鳞状细胞癌组织 | 空间转录组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 多视图图神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5145 | 2025-10-06 |
Sparse deconvolution of cell type medleys in spatial transcriptomics
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013169
PMID:40505018
|
研究论文 | 提出一种名为WISpR的机器学习算法，用于空间转录组学数据中细胞类型的稀疏反卷积 | 引入权重诱导稀疏回归算法，整合位点特异性超参数和稀疏驱动建模，在非匹配数据集中仍能保持生物学一致性 | 未明确说明算法计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性 | 开发能够准确预测空间转录组学中细胞类型分布的新方法 | 空间转录组学数据中的细胞类型分布 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 权重诱导稀疏回归(WISpR) | 空间转录组学数据，单细胞参考数据 | 十个数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5146 | 2025-10-06 |
Single cell sequencing and spatial multiomics of diabetic kidney segmentation insights zonation-specific therapeutic metabolic pathways
2025-Jun, Cell insight
DOI:10.1016/j.cellin.2025.100252
PMID:40547113
|
研究论文 | 通过整合空间多组学和单细胞转录组学技术，揭示了糖尿病肾病肾脏区域特异性代谢失调的分子机制 | 首次建立了糖尿病肾病的空间分辨代谢图谱，将分子分区与肾脏组织解剖定位联系起来，识别了GPX3作为成纤维细胞富集的生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明糖尿病肾病中空间代谢异质性及其在疾病进展中的作用机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和人类患者样本 | 空间多组学 | 糖尿病肾病 | 空间多组学, 单细胞转录组学, 空间代谢组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间多组学数据, 单细胞转录组数据 | 糖尿病小鼠模型和人类DN患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 5147 | 2025-10-06 |
Calbindin 2 as a Novel Biomarker and Therapeutic Target for Abdominal Aortic Aneurysm: Integrative Analysis of Human Proteomes and Genetics
2025-May-06, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.039195
PMID:40314374
|
研究论文 | 本研究通过整合人类蛋白质组学和遗传学分析，发现CALB2作为腹主动脉瘤的新型生物标志物和治疗靶点 | 首次将CALB2鉴定为腹主动脉瘤的因果风险因子，并通过多组学分析揭示其在脂肪组织间皮细胞中的特异性表达 | 研究主要基于遗传学证据和小鼠模型，需要在人类临床试验中进一步验证 | 识别腹主动脉瘤的新型生物标志物和治疗靶点 | 人类遗传数据、小鼠腹主动脉瘤模型 | 生物医学 | 腹主动脉瘤 | 蛋白质组范围孟德尔随机化、遗传相关性分析、共定位分析、多组学数据分析、bulk RNA测序、单细胞/单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 遗传数据、蛋白质组数据、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5148 | 2025-10-06 |
Candidate Biomarkers for Hard-to-Heal Wounds Revealed by Single-Cell RNA Sequencing of Wound Fluid in Murine Wound Models
2025 May-Jun, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70038
PMID:40444294
|
研究论文 | 通过小鼠伤口模型中伤口液的单细胞RNA测序揭示难愈合伤口的候选生物标志物 | 首次使用伤口液细胞进行单细胞RNA测序分析，识别不同延迟愈合伤口模型中的共同生物标志物 | 样本收集困难，研究仅限于小鼠模型，尚未在临床环境中验证 | 探索不依赖单一病理学的因素，填补当前伤口管理空白 | 小鼠伤口模型中的伤口液细胞 | 单细胞组学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种代表性延迟伤口模型（老年、糖尿病和脂多糖诱导炎症模型）与正常年轻小鼠的比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5149 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis of HIV and tuberculosis coinfection in a humanized mouse model reveals specific transcription patterns, immune responses and early morphological alteration signaling
2025-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.29.635571
PMID:39975088
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了HIV和结核分枝杆菌共感染早期阶段的特异性转录模式、免疫反应和形态改变信号 | 首次在人类化小鼠模型中利用空间转录组学技术系统分析HIV与结核分枝杆菌共感染的早期免疫反应和组织形态变化 | 研究仅观察感染后三周的早期阶段，缺乏长期动态变化数据；人类化小鼠模型可能与真实人类感染存在差异 | 理解HIV和结核分枝杆菌共感染早期在受影响器官中的表型和功能性免疫细胞浸润变化 | 人类化小鼠模型的肺组织样本 | 空间转录组学 | 结核病 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | 人类化小鼠感染模型（HIV单感染、结核分枝杆菌单感染、共感染三组） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5150 | 2025-10-06 |
A Toolkit for Single-Nucleus Characterization of Glioblastoma
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4654-0_18
PMID:40553287
|
研究论文 | 本文提供了一个用于胶质母细胞瘤单核RNA测序表征的工具包 | 开发了针对临床GBM样本和患者来源细胞系的高质量单核制备优化流程 | NA | 建立胶质母细胞瘤单核RNA测序的标准化实验流程 | 胶质母细胞瘤临床标本和患者来源细胞系 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 5151 | 2025-10-06 |
A CD8+ T Cell Infiltration-Driven Prognostic Signature for Gastric Cancer: Bridging Tumor Immunity and Clinical Outcomes
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6629479
PMID:40547199
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，揭示了胃癌中CD8+ T细胞的功能异质性，并开发了一个三基因预后标志物 | 首次在胃癌中系统解析CD8+ T细胞的功能亚群异质性，并鉴定出具有预后和治疗潜力的三基因标志物(SELL/CD79B/RAMP2) | 样本量相对有限(23例胃癌组织)，需要在更大队列中进一步验证 | 探究胃癌肿瘤微环境中CD8+ T细胞的功能异质性及其对临床预后的影响 | 胃癌组织和相关的CD8+ T细胞亚群 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 伪时间轨迹分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 无监督聚类, 伪时间分析, PPI网络分析 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 23例胃癌组织(scRNA-seq) + TCGA-STAD队列(批量转录组) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5152 | 2025-10-06 |
Interrogation of macrophage-related prognostic signatures reveals a potential immune-mediated therapy strategy by histone deacetylase inhibition in glioma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1554845
PMID:40548122
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据识别胶质瘤相关巨噬细胞的预后基因，构建预后模型并筛选出组蛋白去乙酰化酶抑制剂伏立诺他作为潜在治疗药物 | 首次结合单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析识别胶质瘤相关巨噬细胞特异性预后基因，并通过药物筛选验证伏立诺他的治疗潜力 | 研究基于生物信息学分析和体外共培养模型，需要进一步体内实验验证 | 探索胶质瘤相关巨噬细胞在胶质瘤进展中的分子机制并寻找潜在免疫治疗策略 | 胶质瘤相关巨噬细胞和胶质瘤微环境 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析, Cox回归分析, LASSO回归分析 | 预后模型, 共培养模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5153 | 2025-10-06 |
Development of a machine learning-derived dendritic cell signature for prognostic stratification in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1621370
PMID:40552290
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习算法的树突状细胞特征标签，用于肺腺癌的预后分层 | 首次整合单细胞RNA测序数据构建树突状细胞相关特征标签，并通过多种机器学习算法验证其预后价值 | 需要更多前瞻性研究验证该特征标签的临床应用价值 | 开发肺腺癌预后分层工具并探索树突状细胞在肿瘤微环境中的作用 | 肺腺癌患者和肿瘤细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 伪时间分析 | Lasso-Cox, RSF, CoxBoost, Stepwise-Cox | 基因表达数据 | 七个外部队列验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5154 | 2025-10-06 |
scEMB: Learning context representation of genes based on large-scale single-cell transcriptomics
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614685
PMID:39386549
|
研究论文 | 开发基于Transformer的深度学习模型scEMB，用于从大规模单细胞转录组数据中学习基因的上下文表示 | 提出创新的分箱策略整合多平台数据，同时保留基因表达层次和细胞类型特异性，在批次整合、聚类和细胞类型注释等下游任务中表现优于现有模型 | NA | 从大规模单细胞转录组数据中挖掘复杂的基因-基因关系 | 超过3000万个单细胞转录组 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | 超过3000万个单细胞 | 多平台整合 | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5155 | 2025-10-06 |
scHD4E: Novel ensemble learning-based differential expression analysis method for single-cell RNA-sequencing data
2024-08, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108769
PMID:38897145
|
研究论文 | 提出了一种基于集成学习的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法scHD4E | 仅使用四种性能最佳的差异表达分析方法进行集成学习，相比现有方法scDEA使用的12种方法更为精简高效 | 方法性能评估主要基于有限的六个真实数据集和一个模拟数据集 | 开发更准确稳定的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 基因表达数据 | 六个真实数据集和一个模拟数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5156 | 2025-10-06 |
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-Jun-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202937
PMID:38912552
|
综述 | 本文总结了2023年EMBO研讨会关于发育代谢领域的关键讨论，重点探讨了该领域面临的挑战与新兴机遇 | 强调了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算模型等技术革命为发育代谢研究带来的全新探索维度 | NA | 探讨发育代谢领域的历史障碍和新兴机遇 | 细胞特异性代谢网络、组织间代谢通讯、基因-代谢物时空相互作用 | 发育生物学 | NA | 代谢组学, 小分子传感器, 单细胞RNA测序, 计算建模 | 计算模型 | 代谢数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5157 | 2025-10-06 |
Single-cell landscape analysis unravels molecular programming of the human B cell compartment in chronic GVHD
2023-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169732
PMID:37129971
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示人类B细胞在慢性移植物抗宿主病中的分子编程机制 | 首次在人类异基因造血干细胞移植背景下对B细胞进行大规模单细胞转录组分析，发现慢性GVHD中记忆B细胞区室的显著转录差异和潜在致病性非典型B细胞的扩增 | 样本来源仅限于异基因造血干细胞移植患者，未涉及其他自身免疫疾病模型 | 理解异基因造血干细胞移植背景下B细胞的分子编程机制及其在慢性移植物抗宿主病发病中的作用 | 异基因造血干细胞移植患者的纯化B细胞 | 单细胞生物学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 来自患者的大量纯化B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5158 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals three sequential phases of gene expression during zebrafish sensory hair cell regeneration
2022-03-28, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.03.001
PMID:35316618
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示斑马鱼感觉毛细胞再生过程中基因表达的三个连续阶段 | 首次以高时空分辨率揭示斑马鱼感觉毛细胞再生的三个连续转录激活模块 | 研究仅限于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 理解感觉毛细胞再生的分子机制和转录动态 | 斑马鱼感觉毛细胞 | 单细胞生物学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5159 | 2025-10-06 |
CRISPR/Cas9-based genetic screen of SCNT-reprogramming resistant genes identifies critical genes for male germ cell development in mice
2021-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-94851-9
PMID:34326397
|
研究论文 | 通过CRISPR/Cas9基因筛选技术研究体细胞核移植重编程抗性基因在小鼠雄性生殖细胞发育中的关键作用 | 首次利用CRISPR技术系统筛选SRRG基因并揭示Cox7b2、Gm773和Tuba3a/3b在精子发生过程中的关键功能 | 研究仅针对五个未表征的SRRG基因，可能遗漏其他重要基因；结果主要基于小鼠模型 | 鉴定影响小鼠雄性生殖细胞发育的关键基因 | C57BL/6N小鼠的雄性生殖细胞 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、RT-qPCR | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织形态学数据 | 多个基因敲除小鼠品系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5160 | 2025-10-06 |
KHDC3 affects the lineage differentiation of early embryo by regulating the differential distribution of YAP signal
2025-Oct-01, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 本研究探讨KHDC3通过调控YAP信号通路影响早期胚胎细胞谱系分化的机制 | 首次揭示KHDC3通过调节YAP信号在桑葚胚阶段的差异分布来影响胚胎细胞谱系分化 | KHDC3通过肌动蛋白细胞骨架影响YAP信号通路的具体机制尚未完全阐明 | 探究KHDC3在早期胚胎发育中的作用机制 | 早期小鼠胚胎（从2细胞期到囊胚期） | 发育生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞转录组分析、基因敲降 | 基因敲降模型 | 基因表达数据、免疫荧光数据 | 未明确样本数量 | NA | NA | NA | NA |