单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5141 - 5160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5141 | 2025-10-06 |
Protocol for isolating and characterizing human vitreous immune cell infiltrates by flow cytometry and single-cell transcriptomic studies
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103830
PMID:40382772
|
方法论文 | 本文提出了一种通过流式细胞术和单细胞转录组学分离和表征人类玻璃体免疫细胞浸润的定制方案 | 开发了包含手术改良的定制方案，以最大化人类玻璃体样本中免疫细胞的产量 | NA | 建立分离和表征玻璃体免疫细胞浸润的实验方案 | 人类玻璃体免疫细胞浸润 | 单细胞分析 | 眼科疾病 | 流式细胞术, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5142 | 2025-10-06 |
Protocol for high-quality RNA sequencing, cell surface protein analysis, and genotyping in single cells using TARGET-seq
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103832
PMID:40408252
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研究论文 | 本文介绍了一种改进的单细胞多组学技术TARGET-seq+，可同时进行RNA测序、细胞表面蛋白分析和基因分型 | 开发了TARGET-seq+技术，提高了单细胞RNA测序的灵敏度，并首次在单细胞水平整合转录组、蛋白表达和基因分型分析 | NA | 优化单细胞多组学分析技术，以更好地研究癌前和癌变组织中的体细胞突变 | 单细胞 | 单细胞测序技术 | 癌症 | RNA测序，细胞表面蛋白分析，基因分型 | NA | RNA测序数据，蛋白表达数据，基因型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学 | TARGET-seq+ | TARGET-seq+单细胞多组学分析平台 |
| 5143 | 2025-10-06 |
Protocol to decipher complex spatial transcriptomics data using STMiner
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103838
PMID:40411788
|
方法论文 | 介绍使用STMiner工具解析复杂空间转录组数据的标准化操作流程 | 提出无需参考数据即可适用于不同分辨率和平台的通用分析协议 | NA | 解决空间转录组数据分析中的采样不均、数据稀疏和组织边界模糊等挑战 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5144 | 2025-10-06 |
Regulation of cGAS-STING pathway with inhalable nanozyme in acute lung injury
2025-Jun-20, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种可吸入的纳米酶材料，通过调节cGAS-STING通路缓解急性肺损伤 | 首次发现CAL纳米片能与受损DNA结合并有效抑制cGAS-STING通路介导的炎症反应 | NA | 开发针对急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征的新型治疗方法 | 急性肺损伤和急性呼吸窘迫综合征的病理机制 | NA | 急性肺损伤 | 转录组分析，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell sequencing | NA | NA |
| 5145 | 2025-10-06 |
Acquired resistance to immunotherapy by physical barriers with cancer cell-expressing collagens in non-small cell lung cancer
2025-Jun-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500019122
PMID:40498460
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研究论文 | 本研究揭示了非小细胞肺癌中肿瘤细胞通过表达胶原蛋白形成物理屏障导致获得性免疫治疗抵抗的新机制 | 首次发现肿瘤细胞通过表达COL3A1和COL6A1形成不同类型的物理屏障来抵抗免疫治疗，并证实破坏这些屏障可恢复肿瘤对免疫治疗的敏感性 | 研究主要基于小鼠模型和肿瘤类器官，临床转化效果需要进一步验证 | 探究非小细胞肺癌获得性免疫治疗抵抗的肿瘤细胞内在机制 | 非小细胞肺癌小鼠模型和肿瘤类器官 | 癌症免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，电子显微镜，胶原酶处理，基因敲除 | NA | 基因表达数据，显微镜图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5146 | 2025-10-06 |
Antlers on does: An unexpected role of macrophages in deer biology
2025-Jun-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424448122
PMID:40512783
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞在雄激素调控鹿角再生中的关键作用 | 首次发现雄激素通过调控CCL2表达招募巨噬细胞来促进鹿角生成，并证明雌性鹿可通过局部注射CCL2、巨噬细胞或LPS诱导鹿角发育 | 雄激素调控巨噬细胞招募的具体分子通路尚未完全阐明 | 探究雄激素调控鹿角再生的分子机制 | 梅花鹿及移植鹿角原基骨膜的裸鼠 | 发育生物学 | NA | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 组织学分析 | NA | RNA测序数据, 组织学图像 | 梅花鹿及裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5147 | 2025-10-06 |
Integrated Multiomics Analysis and Machine Learning Approaches in Bladder Cancer: Unveiling the Impact of Immunogenic Cell Death and Its Key Gene SLC2A3 on Prognosis and Personalized Treatment Strategies
2025-Jun-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c01496
PMID:40547707
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和机器学习方法，揭示了免疫原性细胞死亡在膀胱癌中的作用，并识别出关键基因SLC2A3作为预后标志和治疗靶点 | 首次构建基于免疫原性细胞死亡的风险特征，并通过101种组合机器学习算法识别出关键基因SLC2A3在癌症相关成纤维细胞中的高表达 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 探索免疫原性细胞死亡在膀胱癌中的作用机制，开发预后标志物和个性化治疗策略 | 膀胱癌患者样本和正常对照样本 | 机器学习 | 膀胱癌 | 多组学分析，单细胞测序 | 组合机器学习算法，单机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的膀胱癌和正常样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5148 | 2025-10-06 |
Liver metastasis or peritoneal metastasis: single-cell RNA sequencing reveals the organotropism in colorectal cancer is driven by distinct partial-EMT processes
2025-Jun-17, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217880
PMID:40553883
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示结直肠癌肝转移和腹膜转移中不同的部分上皮间质转化状态驱动器官趋向性 | 首次在单细胞水平比较结直肠癌肝转移和腹膜转移的肿瘤细胞部分上皮间质转化状态差异 | 未明确验证这些差异如何具体导致器官特异性转移 | 探索结直肠癌转移器官趋向性的分子机制 | 结直肠癌肝转移和腹膜转移患者的肿瘤样本 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5149 | 2025-10-06 |
Application of single-cell sequencing in the study of immune cell infiltration in inflammatory bowel disease and colorectal cancer
2025-Jun-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i6.107382
PMID:40547160
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在炎症性肠病与结直肠癌免疫细胞浸润研究中的应用 | 利用单细胞测序技术揭示肠道微环境中免疫细胞的浸润模式及其在疾病进展中的作用 | NA | 探讨炎症性肠病与结直肠癌之间的相互关系及免疫细胞浸润特征 | 炎症性肠病和结直肠癌中的免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5150 | 2025-10-06 |
Highly sensitive and scalable time-resolved RNA sequencing in single cells with scNT-seq2
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.03.657745
PMID:40502146
|
研究论文 | 开发了一种高灵敏度和可扩展的时间分辨单细胞RNA测序方法scNT-seq2 | 通过系统优化第二链cDNA合成步骤，显著提高了读段比对率、降低了背景突变并增强了文库复杂性 | NA | 解析单细胞分辨率下新合成RNA与预存在RNA池的基因表达动态 | 4sU标记的K562细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 时间分辨单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | scNT-seq2 | 时间分辨单细胞RNA测序技术，优化了第二链cDNA合成步骤 |
| 5151 | 2025-10-06 |
Substrate stiffness dictates unique doxorubicin-induced senescence-associated secretory phenotypes and transcriptomic signatures in human pulmonary fibroblasts
2025-Jun, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01507-x
PMID:39826027
|
研究论文 | 研究基质刚度对多柔比星诱导的人肺成纤维细胞衰老相关分泌表型和转录组特征的影响 | 首次揭示机械张力通过调节基质刚度影响细胞衰老标志物和分泌表型，并识别出高刚度驱动的独特分泌蛋白谱和转录组特征 | 研究主要基于体外细胞培养模型，体内验证相对有限 | 探究物理机械刺激对细胞衰老和衰老相关分泌表型的影响机制 | 人原代肺成纤维细胞(IMR-90) | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 质谱分析, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 计算元分析 | 蛋白质组数据, 转录组数据 | 三种不同刚度基质培养的细胞(生理性2 kPa, 纤维化50 kPa, 塑料约3 GPa) | NA | 单细胞RNA测序, 质谱分析 | NA | NA |
| 5152 | 2025-10-06 |
A multi-omic single-cell landscape of the aging mouse ovary
2025-Jun, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01556-2
PMID:39934558
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术揭示了小鼠卵巢衰老过程中的细胞类型特异性分子特征 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq技术系统描绘了小鼠卵巢衰老的单细胞多组学景观，揭示了不同细胞类型在衰老过程中的特异性转录变化及其顺式/反式调控元件 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究卵巢衰老的分子机制及其与雌性生育能力下降的关系 | 年轻和年老小鼠的卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖系统衰老 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据 | 年轻和年老小鼠卵巢样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 5153 | 2025-10-06 |
SenSkin™: a human skin-specific cellular senescence gene set
2025-Jun, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01568-y
PMID:39998731
|
研究论文 | 开发并验证了一个人类皮肤特异性衰老基因集SenSkin™ | 创建了首个专门针对人类皮肤的衰老基因集，解决了现有通用衰老基因集在皮肤组织中敏感性和特异性不足的问题 | 研究主要基于文献回顾和现有数据集验证，缺乏实验验证 | 开发组织特异性衰老基因集以提高皮肤衰老细胞检测的准确性 | 人类皮肤组织及皮肤细胞类型 | 生物信息学 | 皮肤衰老 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个RNA-seq数据集（包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5154 | 2025-10-06 |
Recent Neuropathology Concepts
2025-Jun, Toxicologic pathology
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/01926233251320056
PMID:40079493
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综述 | 介绍2024年欧洲毒理病理学会大会上关于神经病理学新概念的专题会议内容 | 聚焦人工智能在毒理病理学中的应用、新型组织可视化分析技术以及特定病例报告 | 仅涵盖会议报告内容，未涉及原始研究数据 | 探讨新兴技术对药物筛选和开发的当前及潜在影响 | 毒理病理学家、神经病理学技术、临床前物种 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 人工智能、冷冻荧光断层扫描、血脑屏障类器官、空间转录组学 | NA | 组织图像、转录组数据、病例报告 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5155 | 2025-10-06 |
Mini Review: Spatial Transcriptomics to Decode the Central Nervous System
2025-Jun, Toxicologic pathology
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/01926233251325204
PMID:40119776
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综述 | 本微型综述探讨空间转录组学在中枢神经系统研究中的应用与影响 | 系统评述空间转录组学如何通过提供空间分辨的基因表达数据革新对中枢神经系统的理解 | 面临数据解读和分辨率限制等挑战 | 探索空间转录组学对中枢神经系统研究的影响 | 中枢神经系统及神经退行性疾病（阿尔茨海默病、帕金森病、多发性硬化症、肌萎缩侧索硬化症） | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5156 | 2025-10-06 |
Uncovering somatic genetic drivers in prostate cancer through comprehensive genome-wide analysis
2025-Jun, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01623-8
PMID:40156736
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研究论文 | 通过全基因组分析识别前列腺癌的体细胞遗传驱动因素 | 整合多组学数据和多种分析方法，首次系统识别150个与前列腺癌因果相关的基因，其中MSMB基因在所有四种分析中均表现一致 | 仅基于现有数据库进行分析，缺乏实验验证；部分基因在前列腺癌中的功能机制尚不明确 | 探索散发性前列腺癌的体细胞遗传驱动因素 | 前列腺癌相关基因 | 基因组学 | 前列腺癌 | eQTL分析、孟德尔随机化、蛋白质相互作用分析、单细胞RNA-seq、共定位分析 | NA | 基因组数据、表达数据、临床数据 | UK Biobank: 9131病例和173493对照；PRACTICAL研究: 79148病例和61106对照；FinnGen队列: 13216病例和119948对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组测序 | NA | NA |
| 5157 | 2025-10-06 |
Bi-level identification of governing equations for nonlinear physical systems
2025-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00804-x
PMID:40346196
|
研究论文 | 提出一种双层级方程识别框架，用于从观测数据中发现和验证非线性物理系统的控制方程 | 利用强化学习的策略梯度算法实现双层级优化，同时进行方程发现和验证 | NA | 从观测数据中识别非线性物理系统的控制方程 | 非线性物理系统，包括湍流、三体系统以及单细胞测序数据中的RNA和蛋白质速度方程 | 机器学习 | NA | 强化学习，策略梯度算法 | 双层级优化框架 | 观测数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5158 | 2025-10-06 |
Interpretable niche-based cell‒cell communication inference using multi-view graph neural networks
2025-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00809-6
PMID:40425827
|
研究论文 | 开发了一种基于空间转录组学的细胞间通讯推断工具STCase，能够识别细胞类型特异性生态位和生态位特异性细胞通讯事件 | 首次提出使用可解释的多视图图神经网络通过细胞通讯感知注意力机制，在单细胞/点位水平推断细胞间通讯，考虑生态位异质性 | 未明确说明方法在非空间转录组数据上的适用性，验证主要基于有限的组织类型 | 开发能够考虑生态位异质性的细胞间通讯推断方法 | 人类支气管腺体和口腔鳞状细胞癌组织 | 空间转录组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 多视图图神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5159 | 2025-10-06 |
Sparse deconvolution of cell type medleys in spatial transcriptomics
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013169
PMID:40505018
|
研究论文 | 提出一种名为WISpR的机器学习算法，用于空间转录组学数据中细胞类型的稀疏反卷积 | 引入权重诱导稀疏回归算法，整合位点特异性超参数和稀疏驱动建模，在非匹配数据集中仍能保持生物学一致性 | 未明确说明算法计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性 | 开发能够准确预测空间转录组学中细胞类型分布的新方法 | 空间转录组学数据中的细胞类型分布 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 权重诱导稀疏回归(WISpR) | 空间转录组学数据，单细胞参考数据 | 十个数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5160 | 2025-10-06 |
Single cell sequencing and spatial multiomics of diabetic kidney segmentation insights zonation-specific therapeutic metabolic pathways
2025-Jun, Cell insight
DOI:10.1016/j.cellin.2025.100252
PMID:40547113
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研究论文 | 通过整合空间多组学和单细胞转录组学技术，揭示了糖尿病肾病肾脏区域特异性代谢失调的分子机制 | 首次建立了糖尿病肾病的空间分辨代谢图谱，将分子分区与肾脏组织解剖定位联系起来，识别了GPX3作为成纤维细胞富集的生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明糖尿病肾病中空间代谢异质性及其在疾病进展中的作用机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和人类患者样本 | 空间多组学 | 糖尿病肾病 | 空间多组学, 单细胞转录组学, 空间代谢组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间多组学数据, 单细胞转录组数据 | 糖尿病小鼠模型和人类DN患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |