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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5141 - 5160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5141 | 2025-10-06 |
Interrogation of macrophage-related prognostic signatures reveals a potential immune-mediated therapy strategy by histone deacetylase inhibition in glioma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1554845
PMID:40548122
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据识别胶质瘤相关巨噬细胞的预后基因，构建预后模型并筛选出组蛋白去乙酰化酶抑制剂伏立诺他作为潜在治疗药物 | 首次结合单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析识别胶质瘤相关巨噬细胞特异性预后基因，并通过药物筛选验证伏立诺他的治疗潜力 | 研究基于生物信息学分析和体外共培养模型，需要进一步体内实验验证 | 探索胶质瘤相关巨噬细胞在胶质瘤进展中的分子机制并寻找潜在免疫治疗策略 | 胶质瘤相关巨噬细胞和胶质瘤微环境 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析, Cox回归分析, LASSO回归分析 | 预后模型, 共培养模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5142 | 2025-10-06 |
Development of a machine learning-derived dendritic cell signature for prognostic stratification in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1621370
PMID:40552290
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习算法的树突状细胞特征标签，用于肺腺癌的预后分层 | 首次整合单细胞RNA测序数据构建树突状细胞相关特征标签，并通过多种机器学习算法验证其预后价值 | 需要更多前瞻性研究验证该特征标签的临床应用价值 | 开发肺腺癌预后分层工具并探索树突状细胞在肿瘤微环境中的作用 | 肺腺癌患者和肿瘤细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 伪时间分析 | Lasso-Cox, RSF, CoxBoost, Stepwise-Cox | 基因表达数据 | 七个外部队列验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5143 | 2025-10-06 |
scEMB: Learning context representation of genes based on large-scale single-cell transcriptomics
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614685
PMID:39386549
|
研究论文 | 开发基于Transformer的深度学习模型scEMB，用于从大规模单细胞转录组数据中学习基因的上下文表示 | 提出创新的分箱策略整合多平台数据，同时保留基因表达层次和细胞类型特异性，在批次整合、聚类和细胞类型注释等下游任务中表现优于现有模型 | NA | 从大规模单细胞转录组数据中挖掘复杂的基因-基因关系 | 超过3000万个单细胞转录组 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | 超过3000万个单细胞 | 多平台整合 | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5144 | 2025-10-06 |
scHD4E: Novel ensemble learning-based differential expression analysis method for single-cell RNA-sequencing data
2024-08, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108769
PMID:38897145
|
研究论文 | 提出了一种基于集成学习的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法scHD4E | 仅使用四种性能最佳的差异表达分析方法进行集成学习，相比现有方法scDEA使用的12种方法更为精简高效 | 方法性能评估主要基于有限的六个真实数据集和一个模拟数据集 | 开发更准确稳定的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 基因表达数据 | 六个真实数据集和一个模拟数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5145 | 2025-10-06 |
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-Jun-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202937
PMID:38912552
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综述 | 本文总结了2023年EMBO研讨会关于发育代谢领域的关键讨论，重点探讨了该领域面临的挑战与新兴机遇 | 强调了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算模型等技术革命为发育代谢研究带来的全新探索维度 | NA | 探讨发育代谢领域的历史障碍和新兴机遇 | 细胞特异性代谢网络、组织间代谢通讯、基因-代谢物时空相互作用 | 发育生物学 | NA | 代谢组学, 小分子传感器, 单细胞RNA测序, 计算建模 | 计算模型 | 代谢数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5146 | 2025-10-06 |
Single-cell landscape analysis unravels molecular programming of the human B cell compartment in chronic GVHD
2023-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169732
PMID:37129971
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示人类B细胞在慢性移植物抗宿主病中的分子编程机制 | 首次在人类异基因造血干细胞移植背景下对B细胞进行大规模单细胞转录组分析，发现慢性GVHD中记忆B细胞区室的显著转录差异和潜在致病性非典型B细胞的扩增 | 样本来源仅限于异基因造血干细胞移植患者，未涉及其他自身免疫疾病模型 | 理解异基因造血干细胞移植背景下B细胞的分子编程机制及其在慢性移植物抗宿主病发病中的作用 | 异基因造血干细胞移植患者的纯化B细胞 | 单细胞生物学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 来自患者的大量纯化B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5147 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals three sequential phases of gene expression during zebrafish sensory hair cell regeneration
2022-03-28, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.03.001
PMID:35316618
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示斑马鱼感觉毛细胞再生过程中基因表达的三个连续阶段 | 首次以高时空分辨率揭示斑马鱼感觉毛细胞再生的三个连续转录激活模块 | 研究仅限于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 理解感觉毛细胞再生的分子机制和转录动态 | 斑马鱼感觉毛细胞 | 单细胞生物学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5148 | 2025-10-06 |
CRISPR/Cas9-based genetic screen of SCNT-reprogramming resistant genes identifies critical genes for male germ cell development in mice
2021-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-94851-9
PMID:34326397
|
研究论文 | 通过CRISPR/Cas9基因筛选技术研究体细胞核移植重编程抗性基因在小鼠雄性生殖细胞发育中的关键作用 | 首次利用CRISPR技术系统筛选SRRG基因并揭示Cox7b2、Gm773和Tuba3a/3b在精子发生过程中的关键功能 | 研究仅针对五个未表征的SRRG基因，可能遗漏其他重要基因；结果主要基于小鼠模型 | 鉴定影响小鼠雄性生殖细胞发育的关键基因 | C57BL/6N小鼠的雄性生殖细胞 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、RT-qPCR | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织形态学数据 | 多个基因敲除小鼠品系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5149 | 2025-10-06 |
KHDC3 affects the lineage differentiation of early embryo by regulating the differential distribution of YAP signal
2025-Oct-01, Theriogenology
IF:2.4Q1
|
研究论文 | 本研究探讨KHDC3通过调控YAP信号通路影响早期胚胎细胞谱系分化的机制 | 首次揭示KHDC3通过调节YAP信号在桑葚胚阶段的差异分布来影响胚胎细胞谱系分化 | KHDC3通过肌动蛋白细胞骨架影响YAP信号通路的具体机制尚未完全阐明 | 探究KHDC3在早期胚胎发育中的作用机制 | 早期小鼠胚胎（从2细胞期到囊胚期） | 发育生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞转录组分析、基因敲降 | 基因敲降模型 | 基因表达数据、免疫荧光数据 | 未明确样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 5150 | 2025-10-06 |
Sex-specific neurotoxicity induced by long-term bisphenol A exposure: Single-cell sequencing reveals dual mechanisms involving hippocampal gliosis and neuronal apoptosis
2025-Aug-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2025.179810
PMID:40505511
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示长期双酚A暴露通过海马胶质增生和神经元凋亡双重机制诱导性别特异性神经毒性 | 首次结合行为学分析和单细胞测序技术系统阐明BPA性别特异性神经毒性的细胞分子机制 | 仅使用小鼠模型，未涉及人类样本验证 | 探究长期BPA暴露对成年小鼠行为记忆和神经系统的性别特异性影响 | 成年小鼠（分雌雄性别） | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据、行为学数据、形态学数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5151 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic atlas reveals the underlying mechanism of indole-3-acetic acid in protecting against acute cholestatic liver injury
2025-Aug, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156942
PMID:40513326
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组图谱揭示了吲哚-3-乙酸在急性胆汁淤积性肝损伤中的保护机制 | 首次整合转录组学、代谢组学和单细胞RNA测序技术，系统阐明3-IAA通过调节免疫细胞亚群发挥肝保护作用的新机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体中验证 | 探究吲哚-3-乙酸对急性胆汁淤积性肝损伤的治疗潜力及其作用机制 | 胆管结扎诱导的急性胆汁淤积性肝损伤大鼠模型 | 单细胞组学 | 肝病 | 单细胞RNA测序, 转录组学, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5152 | 2025-10-06 |
Investigating the potential risk of cadmium exposure on Osteoporosis: An integrated multi-omics approach
2025-Aug, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118502
PMID:40517505
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研究论文 | 通过多组学方法研究镉暴露对骨质疏松症的潜在风险 | 整合了流行病学数据、生物信息学、机器学习、单细胞RNA测序和分子对接等多种方法，首次系统揭示镉暴露通过HMOX1基因影响骨质疏松的机制 | 研究主要基于横断面分析，无法确定因果关系；需要进一步实验验证 | 探索镉暴露在骨质疏松症发病机制中的作用 | 骨质疏松症患者及相关基因表达 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 机器学习, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习模型 | 多组学数据, 流行病学数据 | NHANES数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5153 | 2025-10-06 |
Mucosal Macrophages Govern Intestinal Regeneration in Response to Injury
2025-Jul, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.01.252
PMID:40086603
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研究论文 | 本研究揭示了黏膜巨噬细胞在辐射损伤后通过分泌神经调节蛋白1和骨桥蛋白诱导肠道上皮细胞胎儿样重编程和增殖，从而驱动肠道再生的关键机制 | 首次发现巨噬细胞通过特定分泌因子直接调控肠道干细胞区室的再生程序，并证实该机制在人类细胞中具有保守性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限；巨噬细胞亚型的具体功能分化需要进一步解析 | 探究辐射性肠炎中肠道再生程序的激活机制 | 小鼠模型和人类肠道类器官 | 细胞生物学 | 辐射性肠炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 细胞谱系追踪, 细胞轨迹分析 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠模型和人类肠道类器官共培养体系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5154 | 2025-10-06 |
Targeting FGFR Attenuates Tumor Growth in an Anal Squamous Cell Carcinoma Patient Derived Xenograft Model
2025-Jul, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23919
PMID:40256931
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研究论文 | 本研究通过建立肛门鳞状细胞癌患者来源异种移植模型，发现FGFR抑制剂可显著抑制肿瘤生长 | 首次在ASCC PDX模型中应用单细胞RNA测序技术揭示肿瘤异质性，并验证FGFR靶向治疗的疗效 | 研究仅基于单个患者样本，样本量有限 | 探索肛门鳞状细胞癌的有效治疗靶点 | 肛门鳞状细胞癌患者来源的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肛门鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 傅里叶变换红外光谱 | 患者来源异种移植模型 | 基因表达数据, 光谱数据, 图像数据 | 1例转移性ASCC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5155 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of proximal tubular cells with different DNA content reveals functional heterogeneity in the acute kidney injury to chronic kidney disease transition
2025-Jul, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.03.025
PMID:40268163
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析不同DNA含量的近端肾小管上皮细胞在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的功能异质性 | 首次揭示不同DNA含量（特别是多倍体细胞）的近端肾小管上皮细胞在AKI向CKD转变中的功能异质性及其促纤维化作用机制 | 研究仅关注缺血再灌注损伤模型，未验证其他AKI模型中的普适性 | 探究不同DNA含量的近端肾小管上皮细胞在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的功能异质性 | 急性肾损伤后不同DNA含量的近端肾小管上皮细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | AKI后第3天和第14天分离的近端肾小管上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5156 | 2025-10-06 |
A survey of the methodological process of modeling, inference, and evaluation of gene regulatory networks using scRNA-Seq data
2025-Jul, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105464
PMID:40409400
|
综述 | 本文系统探讨了使用单细胞RNA测序数据构建基因调控网络的方法学流程，包括建模、推断和评估环节 | 全面梳理了scRNA-Seq技术在基因调控网络推断中面临的方法学挑战，并通过比较计算实验提出更稳健的方法学流程建议 | 作为综述性文章，未提出新的推断算法，主要聚焦于方法学问题的系统分析 | 分析单细胞RNA测序数据在基因调控网络推断中的方法学挑战并提出改进建议 | 基因调控网络的建模、推断和评估方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5157 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics of progression gene signature and tumor microenvironment leading to progression in mycosis fungoides
2025-Jun-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014495
PMID:40163757
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析蕈样肉芽肿进展过程中的基因特征和肿瘤微环境变化 | 首次使用空间转录组学技术结合形态学标记分析MF进展过程中的转录组表达变化和肿瘤微环境动态 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 识别早期蕈样肉芽肿患者进展至晚期的生物标志物和机制 | 蕈样肉芽肿患者组织样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 空间转录组学，免疫组织化学染色 | NA | 空间转录组数据，免疫组织化学图像 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | 使用CD3、CD4和CD30形态学标记进行空间分辨转录组分析 |
| 5158 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell chromatin and transcriptomic profiling of peripheral immune cells in nonsegmental vitiligo
2025-Jun-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf041
PMID:39888372
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研究论文 | 通过单细胞多组学方法研究非节段型白癜风患者外周免疫细胞的转录组和染色质可及性特征 | 首个对非节段型白癜风患者外周血单核细胞进行的单细胞多组学研究，整合了转录组和染色质可及性数据 | 样本量相对有限（初始队列NSV患者11例，健康对照5例） | 探究非节段型白癜风的系统性免疫失调机制 | 非节段型白癜风患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 初始队列：NSV患者11例，健康对照5例；扩展队列：NSV患者16例，健康对照9例；共分析59,192个PBMCs | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5159 | 2025-10-06 |
Cytoskeletal-related genes function as checkpoints for the maintenance of VSMC contractile phenotype and prevent pathological remodeling in arterial diseases
2025-Jun-20, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.065
PMID:40516911
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研究论文 | 本研究通过构建跨物种整合模型，发现细胞骨架相关基因在维持血管平滑肌细胞收缩表型和防止动脉疾病病理重塑中的关键检查点作用 | 首次识别Fblim1、Tns1和Synpo2等细胞骨架相关基因作为VSMC表型转换的检查点，并验证其在动脉疾病中的保护功能 | 研究主要基于公共单细胞RNA-seq数据集和动物模型，需要进一步临床验证 | 构建VSMC表型转换的跨物种整合模型，识别调控表型转换的关键基因并验证其在动脉重塑中的功能 | 血管平滑肌细胞(VSMC)、动脉粥样硬化和主动脉瘤动物模型 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq、siRNA敲低、基因过表达 | 轨迹分析模型 | 单细胞转录组数据 | 公共单细胞RNA-seq数据集、实验动物动脉瘤样本、PDGF-BB处理的VSMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5160 | 2025-10-06 |
Colorectal cancer cell line-derived organoid model with stem cell properties captures the regrowing state of residual cancer cells after neoadjuvant chemotherapy
2025-Jun-20, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02567-w
PMID:40537472
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研究论文 | 本研究建立了结直肠癌细胞系来源的类器官再生模型，用于研究新辅助化疗后残留癌细胞的再生状态 | 首次利用具有癌症干细胞特性的患者来源细胞系建立结直肠癌类器官再生模型，并发现RNA聚合酶I抑制剂BMH-21能显著抑制肿瘤生长 | 研究仅基于单一患者来源的细胞系，需要更多样本验证结果的普适性 | 研究结直肠癌新辅助化疗后残留癌细胞的再生机制并寻找治疗靶点 | 结直肠癌细胞系来源的类器官模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | 单一患者来源的细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |