单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 5141 - 5160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5141 | 2024-12-26 |
Single cell profiling of hematopoietic stem cell transplant recipients reveals TGF-β1 and IL-2 confer immunoregulatory functions to NK cells
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111416
PMID:39720529
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了在造血干细胞移植受者中，TGF-β1和IL-2如何赋予NK细胞免疫调节功能 | 首次定义了在造血干细胞移植后，CD56NK细胞群体与急性移植物抗宿主病（GVHD）保护之间的关联，并阐明了IL-2和TGF-β1联合作用在促进NK细胞调节表型中的角色 | 诱导的调节性NK细胞表型不稳定，暴露于不同细胞因子后会失去分泌TGF-β1的能力 | 研究造血干细胞移植后NK细胞的免疫调节功能 | 造血干细胞移植受者的NK细胞 | 免疫学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 造血干细胞移植受者的NK细胞样本 |
| 5142 | 2024-12-26 |
Myeloperoxidase and Thyrotropin-Releasing Hormone Within Leukaemia Stem Cells Increased Chemosensitivity in Acute Myeloid Leukaemia
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70306
PMID:39720891
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研究论文 | 本研究探讨了白血病干细胞（LSCs）中的髓过氧化物酶（MPO）和促甲状腺激素释放激素（TRH）在急性髓性白血病（AML）化疗敏感性中的作用 | 首次在LSCs中识别出MPO和TRH作为AML化疗敏感性的潜在生物标志物，并发现其与患者无复发生存率和总生存率的显著相关性 | 样本量较小（20名患者），且仅涉及接受'7+3'诱导治疗的患者，可能限制结果的普遍性 | 识别LSCs中能预测AML化疗敏感性的生物标志物 | 急性髓性白血病（AML）患者 | 生物医学研究 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 20名新诊断的AML患者 |
| 5143 | 2024-12-26 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Injuries in Aortic Dissection and Identifies PDGF Signalling Pathway as a Potential Therapeutic Target
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70293
PMID:39720896
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了主动脉夹层中的细胞异质性及相关损伤，并识别出PDGF信号通路作为潜在的治疗靶点 | 首次应用单细胞RNA测序技术全面解析主动脉夹层的细胞异质性，并发现PDGF信号通路在疾病中的关键作用 | 样本量较小，且未进行长期随访以验证治疗靶点的临床效果 | 揭示主动脉夹层的细胞异质性及分子机制，探索潜在治疗靶点 | 主动脉夹层患者及非主动脉夹层供体的主动脉细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 主动脉夹层患者及非主动脉夹层供体的主动脉细胞 |
| 5144 | 2024-12-26 |
Single-cell profiling uncovers synovial fibroblast subpopulations associated with chondrocyte injury in osteoarthritis
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1479909
PMID:39720254
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞损伤之间的相互作用和关联 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞之间的相互作用，并识别了具有修复和保护作用的CILP+成纤维细胞以及可能加剧软骨损伤的POSTN+成纤维细胞 | 研究主要基于单细胞测序数据，缺乏体内实验验证，且样本量未明确说明 | 阐明骨关节炎中滑膜细胞与软骨细胞之间的相互作用和关联，以深化对骨关节炎发病机制的理解 | 骨关节炎患者的滑膜细胞和软骨细胞 | 单细胞测序 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 5145 | 2024-12-25 |
The role of the haematopoietic stem cell niche in development and ageing
2025-Jan, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-024-00770-8
PMID:39256623
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综述 | 本文综述了造血干细胞（HSC）及其前体细胞（HSPC）在发育和衰老过程中与骨髓微环境（niche）的相互作用 | 本文通过单细胞转录组学和显微镜技术，揭示了HSC在发育过程中与不同niche的相互作用，并探讨了这些相互作用在衰老过程中的变化及其对造血疾病的影响 | 本文主要为综述性质，未提供具体实验数据或模型 | 探讨HSC与niche在发育和衰老过程中的相互作用，为改善自体HSC疗法和移植提供理论基础 | 造血干细胞（HSC）及其前体细胞（HSPC）与骨髓微环境（niche）的相互作用 | NA | NA | 单细胞转录组学、显微镜技术 | NA | NA | NA |
| 5146 | 2024-12-25 |
Hepatocellular carcinoma hosts cholinergic neural cells and tumoral hepatocytes harboring targetable muscarinic receptors
2025-Jan, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101245
PMID:39717507
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研究论文 | 本文研究了肝细胞癌中胆碱能神经细胞的存在及其对肿瘤肝细胞中可靶向毒蕈碱受体的影响 | 首次在人类肝细胞癌中发现密集的DCX+、synaptophysin+、NeuN+、VAChT+、TH-、CD31-、CD45-簇，并通过单细胞RNA测序数据独立验证 | 研究主要基于法国肝脏生物库的数据和TCGA等数据集，可能存在样本多样性不足的问题 | 探索肝细胞癌中胆碱能神经过程的作用，并评估现有神经药物在肝细胞癌研究中的应用潜力 | 肝细胞癌中的胆碱能神经细胞和肿瘤肝细胞中的毒蕈碱受体 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 包括来自法国肝脏生物库的肝肿瘤样本、TCGA数据集、其他数据集以及欧洲验证队列 |
| 5147 | 2024-12-25 |
Interplay between Netrin-1 and Norrin controls arteriovenous zonation of blood-retina barrier integrity
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2408674121
PMID:39693351
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研究论文 | 研究探讨了Netrin-1和Norrin信号通路在控制视网膜屏障完整性中的相互作用 | 首次揭示了Netrin-1/Unc5b和Norrin/Lrp5信号通路在视网膜屏障中的区室化基因表达调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步验证在人类中的适用性 | 探讨Netrin-1和Norrin信号通路在视网膜屏障完整性中的作用 | 视网膜屏障的完整性和基因表达调控 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用出生后视网膜屏障功能性小鼠视网膜内皮细胞进行单细胞RNA测序，识别了超过100个视网膜屏障相关基因 |
| 5148 | 2024-12-25 |
Pathway metrics accurately stratify T cells to their cells states
2024-Dec-24, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-024-00416-7
PMID:39716187
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PathSingle的Python工具，用于单细胞数据分析中的通路分析，能够准确分类T细胞的不同状态 | PathSingle采用独特的基于图的算法，能够分类不同的细胞状态，如T细胞亚型 | NA | 开发一种工具，用于从单细胞转录组数据中揭示生物学上有意义的见解 | T细胞及其亚型 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组分析 | 基于图的算法 | 基因表达数据 | NA |
| 5149 | 2024-12-25 |
Systematic pan-cancer analysis identifies ZBTB11 as a potential pan-cancer biomarker and immunotherapy target in multiple tumor types
2024-Dec-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01697-4
PMID:39715911
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研究论文 | 本文系统分析了ZBTB11在多种肿瘤类型中的表达、预后价值、基因突变和DNA启动子甲基化，并探讨了其在肿瘤发生和免疫治疗中的潜在作用 | 首次系统性地分析了ZBTB11在多种肿瘤类型中的表达和预后价值，并构建了ZBTB11的竞争性lncRNA-miRNA网络，揭示了其在肿瘤生物学行为中的调控作用 | 研究主要基于数据库和在线工具的分析，缺乏实验验证 | 探讨ZBTB11在多种肿瘤类型中的生物学意义及其作为潜在生物标志物和免疫治疗靶点的可能性 | ZBTB11在不同肿瘤类型中的表达、预后价值、基因突变、DNA甲基化和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 多种肿瘤类型 | DNA甲基化测序、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、突变数据、甲基化数据 | 多种肿瘤类型的样本 |
| 5150 | 2024-12-25 |
Uncovering the molecular networks of ferroptosis in the pathogenesis of type 2 diabetes and its complications: a multi-omics investigation
2024-Dec-23, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-01045-w
PMID:39716081
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示铁死亡在2型糖尿病及其并发症发病机制中的分子网络 | 首次通过多组学分析揭示铁死亡相关基因在2型糖尿病及其并发症中的作用，并验证了影像基因组学在非侵入性诊断中的潜力 | 研究依赖于现有数据集，可能存在样本偏倚和数据异质性 | 揭示铁死亡在2型糖尿病及其并发症中的作用，并探索非侵入性诊断的可能性 | 2型糖尿病及其并发症，包括糖尿病肾病、糖尿病心肌病和非酒精性脂肪肝病 | NA | 糖尿病 | 多组学分析、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质丰度数据、影像基因组数据 | 包括发现队列、验证队列和影像基因组队列的多个数据集 |
| 5151 | 2024-12-25 |
A protocol for time-resolved transcriptomics through metabolic labeling and combinatorial indexing
2024-Dec-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103356
PMID:39356643
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过代谢标记和组合索引进行时间分辨转录组学的优化协议 | 提出了一个自动化友好的协议，结合代谢标记和单细胞RNA测序的组合索引，以捕捉单细胞水平的基因表达动态 | 未提及 | 研究基因表达的动态变化 | 单细胞水平的RNA代谢标记和组合索引 | NA | NA | 代谢标记（4-thiouridine）、单细胞RNA测序、组合索引 | NA | RNA | 未提及 |
| 5152 | 2024-12-25 |
Protocol for mapping T cell activation using single-cell RNA-seq
2024-Dec-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103409
PMID:39427308
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研究论文 | 本文介绍了一种基于anti-CD3/CD28珠子刺激和单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究T细胞激活的协议 | 提出了使用anti-CD3/CD28珠子刺激和scRNA-seq技术来研究T细胞激活的新方法 | NA | 研究T细胞激活的机制 | 人类外周血单核细胞（PMBCs）和CD4 T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 人类外周血单核细胞（PMBCs）和CD4 T细胞 |
| 5153 | 2024-12-25 |
Protocol for isolating specific C. elegans neuron types for bulk and single-cell RNA sequencing
2024-Dec-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103439
PMID:39514392
|
研究论文 | 本文介绍了一种从C. elegans中分离特定神经元类型以进行批量和单细胞RNA测序的协议 | 提供了一种用于分离特定神经元类型进行基因表达分析的新协议 | NA | 识别驱动神经元特异性发育、功能和连接的遗传程序 | C. elegans的特定神经元类型 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 幼虫和成体动物的个体细胞类型 |
| 5154 | 2024-12-25 |
A protocol for acquiring high-quality single-cell multi-omics data from human peripheral blood
2024-Dec-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103430
PMID:39488839
|
研究论文 | 本文介绍了一种从人类外周血单核细胞（PBMCs）中获取高质量单细胞多组学数据的协议 | 提出了一个改进的多组学样本处理方法，用于单细胞测序、全基因组测序以及代谢组和蛋白质组分析 | NA | 开发一种确保单细胞测序数据质量和细胞活性的稳健协议 | 人类外周血单核细胞（PBMCs） | NA | NA | 单细胞测序、全基因组测序、代谢组和蛋白质组分析 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 5155 | 2024-12-25 |
Protocol for using scCURE to construct an immunotherapy outcome prediction model
2024-Dec-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103476
PMID:39661506
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术构建免疫治疗结果预测模型的协议 | 提出了基于scRNA-seq的免疫治疗期间变化和不变细胞识别方法（scCURE），用于构建免疫治疗结果预测模型 | NA | 开发一种预测癌症患者免疫治疗结果的方法 | 癌症患者的免疫治疗结果 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 5156 | 2024-12-25 |
Profiling low-mRNA content cells in complex human tissues using BD Rhapsody single-cell analysis
2024-Dec-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103475
PMID:39661509
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研究论文 | 本文介绍了一种使用BD Rhapsody单细胞RNA测序平台高效恢复低mRNA含量免疫细胞的协议 | 提出了针对前列腺、肺和肝脏组织的优化组织解离方法，并结合BD Rhapsody scRNA-seq平台进行单细胞捕获和数据预处理 | NA | 开发一种有效的单细胞RNA测序方法，以恢复复杂人体组织中低mRNA含量的免疫细胞 | 低mRNA含量的免疫细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 前列腺、肺和肝脏组织样本 |
| 5157 | 2024-12-25 |
Single-cell transcriptome analysis reveals reciprocal epithelial and endothelial cell evolution in ovarian cancer
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111417
PMID:39717089
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了卵巢癌中上皮细胞和内皮细胞的相互进化关系 | 首次揭示了输卵管上皮细胞向卵巢癌上皮细胞的潜在发展趋势，并发现了与肿瘤血管生成相关的内皮细胞亚型 | 研究仅限于卵巢癌中的上皮细胞和内皮细胞，未涉及其他细胞类型 | 探讨卵巢癌发展过程中上皮细胞和内皮细胞的相互作用 | 卵巢癌中的上皮细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 87,847个上皮细胞和11,696个内皮细胞 |
| 5158 | 2024-12-25 |
BDNF augmentation reverses cranial radiation therapy-induced cognitive decline and neurodegenerative consequences
2024-Dec-18, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01906-9
PMID:39696694
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研究论文 | 本文研究了BDNF增强剂逆转颅脑放射治疗引起的认知功能下降和神经退行性后果 | 本文首次在颅脑放射治疗模型中验证了BDNF增强剂（如利鲁唑）对认知功能下降的逆转作用，并展示了其在神经保护方面的潜力 | 本文仅在动物模型中进行了研究，尚未在人类中进行验证 | 探讨BDNF增强剂对颅脑放射治疗引起的认知功能下降和神经退行性后果的影响 | 颅脑放射治疗后的成年小鼠 | 神经科学 | 癌症相关疾病 | 空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据 | 颅脑放射治疗后的成年小鼠模型 |
| 5159 | 2024-12-25 |
Resolving the design principles that control postnatal vascular growth and scaling
2024-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627758
PMID:39713449
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研究论文 | 研究揭示了控制出生后血管生长和缩放的设计原则 | 发现了主动脉扩张遵循特定的生物学原则，并与脊柱的缩放相关，而不是动物体重；揭示了通过两波动脉细胞增殖来实现扩张的过程，并展示了细胞周期动力学的独特性；证明了内皮细胞的挤出对于稳态主动脉生长和平衡过度增殖的重要性 | NA | 探讨控制出生后血管生长和缩放的设计原则 | 主动脉的生长和缩放 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | NA | NA |
| 5160 | 2024-12-25 |
Current transcriptome database and biomarker discovery for immunotherapy by immune checkpoint blockade
2024-Dec-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.09.627506
PMID:39713380
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综述 | 本文综述了免疫检查点阻断（ICB）疗法的当前转录组数据库和生物标志物发现，重点讨论了肿瘤基因组、肿瘤微环境和肿瘤-宿主相互作用的生物标志物，并介绍了IOhub平台用于基准分析当前生物标志物 | 介绍了IOhub平台，该平台整合了36个bulk和10个单细胞转录组数据集，用于生物标志物的基准分析 | NA | 探讨免疫检查点阻断疗法的生物标志物发现和当前转录组数据库 | 肿瘤基因组、肿瘤微环境和肿瘤-宿主相互作用的生物标志物 | 数字病理学 | 癌症 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 36个bulk和10个单细胞转录组数据集 |