单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28561 篇文献，本页显示第 5121 - 5140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5121 | 2025-03-06 |
Identification of cancer-associated fibroblast signature genes for prognostic prediction in colorectal cancer
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1476092
PMID:40041860
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研究论文 | 本研究旨在鉴定与结直肠癌相关的成纤维细胞特征基因，并建立用于预后预测的CAFs风险模型 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出与CAFs相关的差异表达基因，并建立了一个高精度的预后预测模型 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本选择的限制 | 鉴定与结直肠癌相关的成纤维细胞特征基因，并建立用于预后预测的CAFs风险模型 | 结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq），qRT-PCR | LASSO算法 | RNA测序数据 | 来自GEO和TCGA数据库的结直肠癌样本 |
| 5122 | 2025-03-06 |
ETV2 transcriptionally activates Rig1 gene expression and promotes reprogramming of the endothelial lineage
2024-11-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78115-w
PMID:39562637
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研究论文 | 本研究探讨了ETV2-RIG1级联在ETV2介导的细胞重编程中的作用，揭示了ETV2通过直接激活RIG1基因表达促进成纤维细胞向内皮细胞重编程的分子机制 | 首次揭示了ETV2通过直接激活RIG1基因表达来促进成纤维细胞向内皮细胞重编程的分子机制 | 研究主要基于小鼠胚胎成纤维细胞，尚未在人类细胞中进行验证 | 探讨ETV2介导的成纤维细胞向内皮细胞重编程的分子机制 | 小鼠胚胎成纤维细胞（MEFs） | 细胞生物学 | 缺血性心脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）、电泳迁移率变动分析（EMSA） | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎成纤维细胞（MEFs） |
| 5123 | 2025-03-06 |
Single-Cell Profiling Uncovers Evolutionary Divergence of Hypocretin/Orexin Neuronal Subpopulations
2024-Sep-04, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0095-24.2024
PMID:39122556
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和高分辨率成像技术，揭示了斑马鱼下丘脑中Hcrt神经元的亚群功能异质性及其在进化中的保守与分歧 | 首次在斑马鱼中通过单细胞RNA测序和高分辨率成像技术，揭示了Hcrt神经元的亚群功能异质性及其在进化中的保守与分歧 | 研究主要集中于斑马鱼和小鼠，未涉及其他脊椎动物，可能限制了结果的普适性 | 揭示下丘脑中Hcrt神经元的亚群功能异质性及其在进化中的保守与分歧 | 成年雄性和雌性斑马鱼下丘脑室周区的神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），高分辨率成像 | NA | RNA测序数据，成像数据 | 成年雄性和雌性斑马鱼下丘脑室周区的神经元 |
| 5124 | 2025-03-06 |
Construction and validation of a novel NAD+ metabolism-related risk model for prognostic prediction in osteosarcoma
2024-05, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.25757
PMID:38047487
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研究论文 | 本研究构建并验证了一个与NAD+代谢相关的新型风险模型，用于骨肉瘤的预后预测 | 通过结合生物信息学分析和体外实验验证，首次揭示了NAD代谢相关基因在骨肉瘤肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后的影响 | 研究主要依赖于公开数据库的数据，且体外实验的样本量可能有限 | 探讨NAD代谢相关基因与骨肉瘤肿瘤免疫微环境、免疫治疗反应及预后的关联 | 骨肉瘤患者 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | Cox分析、共识聚类、主成分分析、t-SNE、UMAP、基因集富集分析、基因集变异分析、Lasso分析、生存和ROC曲线、Nomogram、免疫相关分析、药物敏感性分析、单细胞RNA测序分析 | 风险模型和Nomogram | 基因表达数据 | 从TARGET和GEO数据库获取的骨肉瘤数据 |
| 5125 | 2025-03-06 |
The role of epigenetic regulation in pancreatic ductal adenocarcinoma progression and drug response: an integrative genomic and pharmacological prognostic prediction model
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1498031
PMID:39640482
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和临床数据，揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）的表观遗传调控全景，并构建了一个基于机器学习的预后预测模型 | 首次在单细胞分辨率下全面描绘了PDAC的表观遗传调控全景，并构建了一个基于17个表观遗传基因的机器学习预后模型，该模型在预测1年、3年和5年生存率方面表现出色（AUC >0.7） | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据异质性和偏差 | 探索表观遗传调控在PDAC进展和药物反应中的作用，并构建一个预后预测模型 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、WGCNA、Lasso、随机生存森林 | 机器学习模型 | RNA测序数据、临床数据 | 多个公共数据库中的数据，具体样本数量未明确 |
| 5126 | 2025-03-06 |
Construction of a circRNA- lincRNA-lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA regulatory network identifies genes and pathways linked to goat fertility
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1195480
PMID:37547465
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了高生育力和低生育力山羊的颗粒细胞转录组，构建了ceRNA调控网络，并鉴定了与山羊生育力相关的基因和通路 | 首次利用单细胞RNA测序技术比较了高生育力和低生育力山羊的颗粒细胞转录组，并构建了ceRNA调控网络，鉴定了与生育力相关的关键基因和通路 | 研究依赖于公开的单细胞RNA测序数据，样本量相对较小，且仅限于Ji'ning Gray山羊 | 研究山羊生育力的遗传基础，特别是通过转录组分析揭示与生育力相关的基因和通路 | 高生育力和低生育力的Ji'ning Gray山羊的颗粒细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 30个样本（15个高生育力山羊和15个低生育力山羊） |
| 5127 | 2025-03-06 |
Interactions in CSF1-Driven Tenosynovial Giant Cell Tumors
2022-11-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1898
PMID:36007098
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究了CSF1驱动的腱鞘巨细胞瘤（TGCT）中的细胞相互作用 | 使用scRNA-seq技术首次在TGCT中识别出两种复发性肿瘤细胞群，并发现这些细胞与正常滑膜细胞高度相似，且不表达CSF1R | 样本量较小，仅分析了3个TGCT和2个骨巨细胞瘤（GCTB）样本 | 研究TGCT中肿瘤细胞与旁观者巨噬细胞之间的相互作用 | 腱鞘巨细胞瘤（TGCT）和骨巨细胞瘤（GCTB）样本 | 数字病理学 | 腱鞘巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、长读长RNA测序、免疫荧光和免疫组化（IHC） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 18,788个单细胞，来自3个TGCT和2个GCTB样本 |
| 5128 | 2025-03-06 |
Sphingolipids control dermal fibroblast heterogeneity
2022-04-15, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abh1623
PMID:35420948
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研究论文 | 本文通过高分辨率质谱成像与单细胞转录组学结合，测量了人类皮肤成纤维细胞的脂质组和转录组，揭示了脂质代谢途径的细胞间差异对皮肤结构组织中的细胞状态的影响 | 首次揭示了脂质代谢途径的细胞间差异在细胞状态确定中的作用，特别是鞘脂代谢重编程驱动细胞状态转变 | 研究仅限于皮肤成纤维细胞，未涉及其他细胞类型或组织 | 研究脂质代谢途径的细胞间差异对细胞状态的影响 | 人类皮肤成纤维细胞 | 细胞生物学 | NA | 高分辨率质谱成像，单细胞转录组学 | NA | 脂质组数据，转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 5129 | 2025-03-05 |
Mitigation of ischemia/reperfusion injury via selenium nanoparticles: Suppression of STAT1 to inhibit cardiomyocyte oxidative stress and inflammation
2025-Jul, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文提出了一种通过静脉注射球形硒纳米颗粒（SeNPs）来缓解心肌梗死后缺血/再灌注损伤（I/RI）的策略 | 使用模板法合成的球形SeNPs具有显著的抗氧化和抗炎特性，能够破坏STAT1-ROS循环，从而保护线粒体呼吸并抑制caspase介导的心肌细胞凋亡 | NA | 研究目的是通过SeNPs缓解心肌梗死后缺血/再灌注损伤 | 心肌细胞和巨噬细胞 | 生物医学工程 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 5130 | 2025-03-05 |
Detection by Single-Cell RNA Sequencing of Virally Mediated Skin Diseases
2025-May, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2025.100348
PMID:40026481
|
研究论文 | 本文描述了一种基于单细胞RNA测序的策略，用于检测人类皮肤活检中的病毒转录本，从而在样本中检测病毒感染、单细胞分辨率下识别病毒感染细胞以及后续的转录组扰动 | 结合单细胞RNA测序数据和病毒组检测策略，提供了一种强大的方法来研究和阐明病毒介导的基因调控在健康和疾病中的作用 | 在已确定的非病毒介导的炎症性皮肤疾病中未发现一致的病毒感染证据 | 研究病毒在皮肤疾病中的作用及其精确机制 | 人类皮肤活检样本 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个已知病毒阳性的肿瘤样本和已知风疹相关肉芽肿患者的样本 |
| 5131 | 2025-03-05 |
Gbp2 driving macrophages dynamics in murine heart transplant
2025-Apr, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2024.102695
PMID:39709712
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，识别了在急性排斥反应中驱动巨噬细胞动态变化的关键基因Gbp2，并验证了其在巨噬细胞极化中的作用 | 首次发现Gbp2在急性排斥反应中调控巨噬细胞极化的关键作用，并验证其作为潜在治疗靶点的可能性 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证Gbp2的作用 | 识别在急性排斥反应中驱动巨噬细胞动态变化的关键基因，并评估其对巨噬细胞极化的影响 | 小鼠心脏移植模型中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、伪时间分析、hdWGCNA | NA | 单细胞测序数据 | 小鼠心脏移植模型 |
| 5132 | 2025-03-05 |
High expression of SERPINE1 and CTSL in keratinocytes in pressure injury caused by ischemia-reperfusion injury
2025-Apr, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2025.102746
PMID:39864211
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研究论文 | 本研究通过转录组测序、单细胞测序数据库和GeneCards数据库分析筛选与缺血再灌注损伤相关的压力性损伤（PI）候选基因，并利用机器学习算法识别关键基因SERPINE1和CTSL，验证其在PI中的预后价值 | 首次通过整合转录组测序、单细胞测序和机器学习算法，识别出SERPINE1和CTSL作为PI的潜在生物标志物 | 研究主要基于大鼠模型，尚未在人类样本中进行验证 | 探索压力性损伤（PI）的生理机制及相关分子生物标志物，以开发有效的预防和治疗策略 | 压力性损伤（PI）大鼠模型 | 生物信息学 | 压力性损伤 | 转录组测序、单细胞测序、机器学习算法 | 机器学习算法（未具体说明） | 基因表达数据 | 大鼠模型样本 |
| 5133 | 2025-03-05 |
Profiling Multiple CD8+ T-cell Functional Dimensions Enhances Breast Cancer Immune Assessment
2025-Mar-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0235
PMID:39715293
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研究论文 | 本研究开发了基于bulk RNA测序的FuncDimen模型，用于评估CD8+ T细胞在五个功能维度上的表现，以增强乳腺癌的免疫评估 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，开发了FuncDimen模型，能够从多个功能维度评估CD8+ T细胞的功能，从而更准确地预测乳腺癌的预后和免疫治疗反应 | 尽管FuncDimen模型在乳腺癌中表现出优越的预测性能，但其临床应用仍需进一步验证 | 提高乳腺癌免疫评估的准确性，特别是通过CD8+ T细胞的功能维度来预测预后和免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | FuncDimen模型 | RNA测序数据 | 乳腺癌队列及外部数据库中的样本 |
| 5134 | 2025-03-05 |
Single-cell eQTL mapping reveals cell subtype-specific genetic control and mechanism in malignant transformation of colorectal cancer
2025-Mar-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1561
PMID:40029140
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组、空间转录组和单核多组学技术，揭示了结直肠癌（CRC）发展过程中的细胞和分子变化及动态细胞间相互作用 | 创建了CRC单细胞eQTL图谱，识别了16,833对显著关联，其中76%为细胞类型特异性，且多基因风险评分显著提高了CRC风险预测 | NA | 揭示结直肠癌恶性转化的细胞亚型特异性遗传控制和机制 | 142个多阶段样本的751,531个单细胞转录组、空间转录组和单核多组学数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组、空间转录组、单核多组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、单核多组学数据 | 142个多阶段样本 |
| 5135 | 2025-03-05 |
Plasma Exosomes Derived from Patients with Primary Immune Thrombocytopenia Attenuate TBX21+ Regulatory T Cell-Mediated Immune Suppression via MiR-363-3p
2025-Mar-04, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02275-8
PMID:40032779
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研究论文 | 本研究探讨了原发性免疫性血小板减少症（ITP）患者血浆外泌体通过miR-363-3p减弱TBX21+调节性T细胞介导的免疫抑制的机制 | 揭示了ITP患者外泌体通过miR-363-3p调控ARID3A/SPI1/TBX21轴，从而减弱调节性T细胞功能的机制 | 研究中未明确外泌体中miR-363-3p的具体来源及其在其他免疫细胞中的作用 | 探究ITP患者调节性T细胞功能减弱的分子机制 | 原发性免疫性血小板减少症（ITP）患者 | 免疫学 | 原发性免疫性血小板减少症 | Treg功能检测、细胞因子分析、单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据、血浆外泌体数据 | ITP患者样本 |
| 5136 | 2024-09-13 |
From genes to geography: Mapping allergic disease landscapes with spatial transcriptomics
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.08.025
PMID:39260791
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5137 | 2025-03-05 |
Single-cell RNA sequencing of chronic idiopathic erythroderma defines disease-specific markers
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.11.037
PMID:39694280
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，研究了慢性特发性红皮病（CIE）的分子疾病图谱，并与红皮病性皮肤T细胞淋巴瘤（eCTCL）、中重度特应性皮炎、银屑病及健康对照组进行了比较 | 首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，揭示了CIE患者血液和皮肤中CD8A+KLRK1+ T细胞克隆的低水平但一致的扩增模式，并发现了CIE特有的致病特征 | 样本量较小，仅包括5名CIE患者，可能影响结果的普遍性 | 建立慢性特发性红皮病（CIE）的分子疾病图谱，以改善对其致病机制的理解并发现未来的治疗靶点 | 慢性特发性红皮病（CIE）患者、红皮病性皮肤T细胞淋巴瘤（eCTCL）患者、中重度特应性皮炎患者、银屑病患者及健康对照个体 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | RNA测序数据 | 5名CIE患者、8名eCTCL患者、15名中重度特应性皮炎患者、10名银屑病患者及20名健康对照个体 |
| 5138 | 2025-03-05 |
A single-cell sequencing-based analysis of a 13-year-old with maxillary sinus NUT carcinoma
2025-Mar, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 本研究通过对一名13岁上颌窦NUT癌患者的肿瘤组织进行单细胞RNA测序，揭示了肿瘤微环境中上皮细胞的显著异质性 | 首次在NUT癌中应用单细胞RNA测序技术，揭示了肿瘤微环境中上皮细胞的异质性及免疫细胞浸润低的特征 | 样本量有限，仅针对一名患者进行研究，结果可能不具有普遍性 | 研究NUT癌的生物学特性、生长机制及潜在治疗靶点 | 13岁上颌窦NUT癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | NUT癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 1名患者的肿瘤组织 |
| 5139 | 2025-03-05 |
Cell autonomous TLR4 signaling modulates TGF-β induced activation of human cardiac fibroblasts
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42452
PMID:40028530
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研究论文 | 本文研究了心脏成纤维细胞中TLR4信号在TGF-β诱导的纤维化过程中的作用 | 揭示了TLR4作为心脏成纤维细胞中的主要免疫传感器，并展示了抑制TLR4信号如何减少TGF-β诱导的纤维化变化 | 研究主要基于体外实验，未涉及体内模型的验证 | 探讨心脏成纤维细胞中TLR4信号在纤维化过程中的调控机制 | 成年人类心脏成纤维细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | FACS, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 来自Collagen1-α1GFP小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 |
| 5140 | 2025-03-05 |
Global landscape of hepatic organoid research: A bibliometric and visual study
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.95624
PMID:40027550
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研究论文 | 本文通过文献计量分析，研究了全球肝脏类器官研究的科学产出，评估了当前成就和未来趋势 | 利用CiteSpace 6.3.R1进行文献计量分析，揭示了肝脏类器官研究的关键领域和未来趋势 | 研究仅限于Web of Science Core Collection中的文献，可能未涵盖所有相关研究 | 分析全球肝脏类器官研究的科学产出，评估当前成就和未来趋势 | 肝脏类器官研究 | 生物医学研究 | 肝病 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 991篇文章 |