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当前共找到 40490 篇文献,本页显示第 5081 - 5100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
5081 2026-04-14
PEPITEM Regulates the Synovial Microenvironment During Immune-Mediated Inflammatory Arthritis to Limit Disease
2026-Apr-13, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本文研究了PEPITEM在早期、未治疗类风湿关节炎和银屑病关节炎中的状态及其在临床前模型中的治疗效果 揭示了PEPITEM通过抑制COX-2和NF-κB信号通路,改变关节内白细胞亚群组成,从而减轻关节炎严重性 研究主要基于临床前动物模型,尚未在人类患者中进行大规模临床试验验证 探究PEPITEM在免疫介导的炎症性关节炎中的调控作用及治疗潜力 类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的外周血单核细胞,以及三种不同的炎症性关节炎动物模型 数字病理学 类风湿关节炎 流式细胞术、Western blot、单细胞RNA测序、多重分析 NA 流式细胞数据、蛋白质印迹数据、单细胞RNA测序数据、组织学数据 临床疑似关节痛和疑似炎症性关节炎患者的外周血样本,以及三种动物模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5082 2026-04-14
CKAP4 Regulates ERS-Induced Apoptosis in Osteoclasts Through FOXO3 in Periodontitis
2026-Apr-13, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究揭示了CKAP4通过FOXO3调控内质网应激诱导的破骨细胞凋亡在牙周炎中的作用机制 首次发现CKAP4在牙周炎破骨细胞凋亡中的调控作用,并阐明其通过FOXO3介导的内质网应激通路 研究主要基于动物模型和测序数据分析,临床样本验证相对有限 探究牙周炎中破骨细胞凋亡失调的分子机制 破骨细胞(Osteoclasts) 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 GEO数据库中的牙周炎患者组织样本数据及Ckap4基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5083 2026-04-14
Vorinostat Potentiates Chemoimmunotherapy in Immune-Enriched Pancreatic Cancer
2026-Apr-13, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶抑制剂伏立诺他(SAHA)在免疫富集型胰腺癌中增强化疗免疫疗法效果的机制 通过整合体外药物筛选和计算机敏感性预测,首次识别出SAHA作为IE-PDAC中化疗免疫疗法的有效增敏剂,并揭示了其通过抑制FASN和PARP9破坏肿瘤微环境中代谢陷阱的新机制 研究主要基于临床前模型(如患者来源的异种移植模型和类器官共培养),尚未进行大规模临床试验验证 探究免疫富集型胰腺癌(IE-PDAC)的潜在机制并寻找有效疗法 胰腺导管腺癌(PDAC),特别是免疫富集型亚型 肿瘤免疫学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),体外药物筛选,计算机敏感性预测,患者来源的异种移植模型 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5084 2026-04-14
Single-cell RNA sequencing analysis reveals cellular heterogeneity and immune microenvironment dynamics in colorectal cancer
2026-Apr-12, The International journal of biological markers
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了结直肠癌中的细胞异质性和免疫微环境动态,重点关注CD8+ CD101hiTim3+ T细胞及其前体细胞与免疫治疗反应的关联 识别并注释了结直肠癌中的多种T细胞亚型,构建了CCT T细胞及其前体细胞的伪时间轨迹,揭示了PD-1免疫治疗组中CCT T细胞前体与其他细胞间增强的相互作用,并开发了一个包含15个基因特征的预后模型 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结果的普适性;对免疫治疗反应的预测仍需临床数据进一步确认 通过研究结直肠癌微环境中的CCT T细胞及其前体细胞,识别新的治疗靶点和潜在生物标志物,并探索它们与免疫治疗反应的关联 结直肠癌患者样本中的T细胞,特别是CD8+ CD101hiTim3+ T细胞及其前体细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 预后模型(基于基因特征) 单细胞测序数据,转录组数据 未明确指定具体样本数量,但使用了单细胞测序数据和TCGA数据库 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5085 2026-04-14
Senescence Programs Shape the Chronic Wound Microenvironment
2026-Apr-12, Advances in wound care IF:5.8Q1
综述 本文综述了细胞衰老在慢性伤口微环境中的作用及其对愈合过程的影响 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示慢性伤口中衰老细胞的异质性及其空间分布,为靶向治疗提供新见解 依赖非特异性衰老标志物(如p21或SA-β-gal)导致结果解释复杂化,且衰老细胞在慢性伤口中的身份、丰度和定位仍不明确 探讨细胞衰老如何影响慢性伤口的愈合过程,并评估靶向衰老细胞的治疗策略 慢性伤口(如糖尿病足溃疡、静脉性腿部溃疡和压力性溃疡)中的衰老细胞,特别是成纤维细胞和免疫细胞 数字病理学 慢性伤口 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
5086 2026-04-14
COPD reshapes the tumor microenvironment of NSCLC and enhances anti-PD-1 therapy response
2026-Apr-10, Med (New York, N.Y.)
研究论文 本研究揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)通过重塑非小细胞肺癌(NSCLC)的肿瘤微环境,特别是通过诱导上皮细胞重塑和建立CXCL14-CXCR4信号轴来招募巨噬细胞,从而增强抗PD-1免疫疗法的疗效 首次通过整合多组学分析和功能验证,阐明了COPD作为共病通过诱导特定的基底样肿瘤细胞群和建立肿瘤-巨噬细胞招募回路来增强NSCLC对PD-1阻断剂反应的分子机制 研究主要基于手术切除的新鲜肿瘤样本,样本量可能有限,且机制验证主要在体外进行,需要进一步的体内模型验证 探究COPD如何影响NSCLC的肿瘤微环境并增强抗PD-1免疫疗法的疗效 非小细胞肺癌(NSCLC)患者,特别是伴有COPD共病的患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫荧光图像 三个临床队列的新鲜手术肿瘤标本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
5087 2026-04-14
Single-cell transcriptomics brings stroke thrombi into cellular and molecular focus: A commentary on "characterizing stroke clots using single-cell sequencing"
2026-Apr-10, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism IF:4.9Q1
评论 本文评论了单细胞转录组学在人类缺血性卒中血栓研究中的应用,强调了血栓作为免疫活性微环境的重要性 通过单细胞RNA测序技术,揭示了卒中血栓并非惰性栓塞物质,而是具有结构化、免疫活性且受卒中病因塑造的微环境 NA 探讨单细胞转录组学如何提升对卒中血栓细胞和分子特征的理解 人类缺血性卒中血栓 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5088 2026-04-14
Pan-cancer macrophage atlas uncovers that MHC-IIhigh TAMs induce Treg activation through physical interactions
2026-Apr-10, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过整合10种癌症类型的单细胞RNA-seq数据,揭示了肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在肿瘤微环境中通过MHC-II介导抗原呈递并激活调节性T细胞(Tregs)的新机制 首次在泛癌层面系统描绘了巨噬细胞的抗原呈递功能,挑战了树突状细胞是肿瘤微环境中主要抗原呈递细胞的传统观点,并发现MHC-II高表达的TAMs通过物理接触直接激活Tregs 研究主要基于单细胞转录组数据,功能验证主要在肺癌小鼠模型中进行,其他癌症类型的体内验证尚不充分 探究肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的抗原呈递功能及其对免疫调节的影响 10种癌症类型的肿瘤样本、肺癌小鼠模型、接受免疫治疗的临床患者数据集 肿瘤免疫学 泛癌研究(包括肺癌、乳腺癌、结直肠癌等10种癌症) 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 10种癌症类型的多中心样本集合 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5089 2026-04-14
Psoriatic arthritis monocyte DNA methylomes bridge joint and skin inflammatory pathways across rheumatoid arthritis and psoriasis
2026-Apr-10, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过分析类风湿关节炎、银屑病关节炎和银屑病患者的单核细胞DNA甲基化组,揭示了这些免疫介导炎症性疾病之间共享和特异的表观遗传特征 首次系统比较了RA-PsA-PsO谱系中单核细胞的DNA甲基化特征,并整合单细胞转录组数据验证表观遗传发现,揭示了PsA作为连接关节和皮肤炎症的双重分子状态 研究主要基于外周血单核细胞,可能未完全反映组织局部免疫环境;样本量未明确说明 探究免疫介导炎症性疾病(特别是RA、PsA和PsO)共享和疾病特异性的表观遗传驱动因素 类风湿关节炎、银屑病关节炎、银屑病、未分化关节炎患者及健康对照者的外周血单核细胞 表观遗传学 类风湿关节炎、银屑病关节炎、银屑病 全基因组DNA甲基化分析、单细胞RNA测序 NA DNA甲基化数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5090 2026-04-14
RA and PsA synovial tissue single-cell analysis demonstrates differential fibroblast populations with distinct phenotypes and functional capacities
2026-Apr-10, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析,揭示了类风湿关节炎和银屑病关节炎中成纤维样滑膜细胞的不同亚群及其功能特性 首次在单细胞水平上系统比较了RA和PsA中FLS的异质性,并识别出与疾病特异性相关的功能亚群,特别是通过Hippo信号通路分析揭示了RA的潜在致病机制 研究样本量相对有限,且主要基于体外分析,需要进一步在体实验验证这些亚群的功能 比较类风湿关节炎和银屑病关节炎中成纤维样滑膜细胞的表型和功能差异 类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的滑膜组织细胞 单细胞组学 关节炎 单细胞RNA测序, 流式细胞术, ELISA, qPCR, 代谢分析 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 未明确样本数量,但涉及RA和PsA患者的滑膜细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5091 2026-04-14
Circadian-driven transcriptional programs govern metastatic progression
2026-Apr-10, Cancer biology & medicine IF:5.6Q1
综述 本文综述了昼夜节律如何通过调控肿瘤微环境(TME)成分来影响转移进程 整合了单细胞RNA-seq和活体成像数据,揭示了昼夜节律扰动(如时差反应或CRY1敲除)如何改变TME中的细胞因子网络、缺氧反应和代谢共生,从而识别了时间治疗靶点 关于TME分子机制的细节尚未完全阐明 探讨昼夜节律在肿瘤转移进程中的作用机制 肿瘤微环境(TME)成分,包括细胞外基质、基质细胞(如癌症相关成纤维细胞、巨噬细胞)和免疫细胞 肿瘤生物学 癌症 单细胞RNA-seq, 活体成像 NA 转录组数据, 成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5092 2026-04-14
Identification of immune cell type-specific susceptibility genes in multiple cancers using transcriptome-wide association studies
2026-Apr-09, Journal of the National Cancer Institute
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据和GWAS汇总统计,通过细胞类型特异性转录组范围关联研究(TWAS)方法,识别了多种癌症中免疫细胞类型特异性的易感基因 开发了一个整合跨细胞类型共享基因表达效应的建模框架,提高了预测准确性,并首次在多种癌症中系统性地进行了细胞类型特异性TWAS分析 研究依赖于公开的GWAS汇总统计数据,可能受到样本异质性和人群特异性的影响;单细胞数据主要来自OneK1K队列,细胞类型覆盖可能不完全 通过细胞类型特异性TWAS增强癌症易感基因的识别能力,并解析癌症病因中的免疫景观 七种癌症(乳腺癌、前列腺癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、弥漫性大B细胞淋巴瘤)的易感基因 生物信息学 多种癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组范围关联研究(TWAS)、全基因组关联研究(GWAS) 细胞类型特异性预测模型 基因表达数据、GWAS汇总统计数据 OneK1K队列(127万个细胞,14种免疫细胞类型);七种癌症GWAS数据(总计超过29万病例);肺癌验证数据(113个个体) NA 单细胞RNA-seq NA NA
5093 2026-04-14
Investigating the potential risk of nicotine exposure on glioblastoma: Integrating Mendelian randomization and network toxicology analysis
2026-Apr-09, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究整合孟德尔随机化和网络毒理学分析,探讨尼古丁暴露对胶质母细胞瘤的潜在风险 首次结合孟德尔随机化与网络毒理学方法,系统评估血清可替宁(尼古丁代谢物)与胶质母细胞瘤的因果关系,并识别核心靶点基因 研究依赖于公开数据库数据,可能存在样本选择偏倚;未进行实验验证核心靶点的功能机制 探究尼古丁暴露与胶质母细胞瘤风险之间的关联 胶质母细胞瘤(GBM)患者数据及尼古丁相关靶点基因 生物信息学 胶质母细胞瘤 孟德尔随机化、网络毒理学分析、机器学习、分子对接、结构动力学分析 机器学习(未指定具体模型) 基因表达数据、单细胞测序数据 NA CNGB 单细胞测序 NA CNGB单细胞测序数据库
5094 2026-04-14
Robust integration and annotation of single-cell and spatial omics data using interpretable gene programs
2026-Apr-08, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本文介绍了一个名为SSpMosaic的计算框架,该框架利用可解释的基因程序作为通用锚点,实现了单细胞和空间组学数据的稳健整合与注释 提出了以元程序(跨数据集对齐的高阶基因程序表示)作为生物学状态表示的通用锚点,实现了跨批次、模态和物种的一致且准确的整合,并支持无需参考数据的空间特征描述 NA 开发一个计算框架,以解决单细胞和空间组学数据整合与注释中的挑战,并实现跨尺度的空间转录组学解卷积 单细胞和空间组学数据,包括单核转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据 计算生物学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq 基于元程序的迁移学习框架 转录组数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 NA 10x Genomics, NanoString 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq 10x Visium, CosMx, Visium HD 10x Visium(spot级), CosMx/Visium HD(亚细胞级)
5095 2026-04-14
Microbial single-cell omics in situ
2026-Apr-08, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本文介绍了一种利用激光诱导前向转移技术,在复杂样本中获取高质量微生物单细胞基因组或转录组的方法 采用激光诱导前向转移技术,实现了对复杂样本中微生物单细胞的高质量基因组或转录组分析,并能直接分析邻近细菌或宿主细胞的相互作用 NA 开发一种可扩展且精确的单细胞方法,以深入理解微生物种群及其与宿主的单细胞相互作用 小鼠肠道、人类唾液和肿瘤切片等复杂样本中的微生物单细胞 单细胞组学 结直肠癌 激光诱导前向转移技术 NA 基因组、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5096 2026-04-14
Deoxynivalenol drives liver injury progression by dysregulating core molecular networks: integrated multi-omics, network toxicology and molecular docking analysis
2026-Apr-08, Environment international IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过整合多组学、网络毒理学和分子对接分析,揭示了脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)通过失调核心分子网络驱动肝损伤进展的机制 首次整合公共转录组数据集、单细胞RNA-seq数据和毒理基因组学数据,结合分子对接和细胞热位移分析,系统解码DON诱导肝损伤的致病网络,并识别出五个核心枢纽基因 研究主要基于公共数据集和体外/体内模型验证,人类直接临床证据有限,且DON暴露的长期效应和个体差异需进一步探索 解码脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)在慢性肝病进展至肝硬化和肝细胞癌中的致病网络 脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)诱导的肝损伤,涉及人类肝细胞(THLE-2)和小鼠模型 生物信息学与毒理学 肝病 转录组学、单细胞RNA-seq、毒理基因组学、分子对接、细胞热位移分析(CETSA) 机器学习建模 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 整合多个公共数据集(GSE139602、GSE25097、GSE136103、GSE149614),并进行体外和体内验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5097 2026-04-14
A Potential Target for Suppressing Pancreatic Cancer: PDGFRB Regulated by DNA Methylation
2026-Apr-08, Combinatorial chemistry & high throughput screening IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化分析、蛋白质数量性状位点和单细胞RNA测序数据,揭示了PDGFRB基因表达通过DNA甲基化位点cg11042320调控胰腺癌风险的因果路径 首次采用整合pQTLs、mQTLs和单细胞数据的孟德尔随机化框架,识别出PDGFRB作为胰腺癌保护因子及其上游甲基化调控机制,并量化了甲基化介导效应(97.62%) 研究依赖于公共数据库的汇总数据,缺乏实验验证;样本主要基于欧洲人群,需多族群验证;未涉及具体治疗干预效果评估 探究DNA甲基化和蛋白质数量性状位点在胰腺癌发展中的因果作用,寻找潜在治疗靶点 胰腺癌风险相关的基因表达与表观遗传调控机制 生物信息学 胰腺癌 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、中介分析 逆方差加权法、敏感性分析模型 基因组关联研究数据、表观基因组数据、单细胞转录组数据 GWAS数据476,245例、GoDMC数据27,750例、pQTL研究35,559例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5098 2026-04-14
SA2E: spatial-aware auto-encoder for cell type deconvolution of spatial transcriptomics data
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种空间感知的自编码器框架(SA2E),用于空间转录组学数据的细胞类型去卷积,无需预定义的细胞类型生物标志物 SA2E通过空间正则化自编码器学习潜在点表示,并利用模拟数据进行监督预训练,从而在无需预定义标记基因的情况下实现细胞类型去卷积 未在摘要中明确提及 开发一种无需预定义细胞类型生物标志物的空间转录组学数据细胞类型去卷积方法 空间转录组学数据和单细胞RNA-seq数据 空间转录组学 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq 自编码器 基因表达数据和空间位置数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
5099 2026-04-14
Hypergraph representations of single-cell RNA sequencing data for improved cell clustering
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种将单细胞RNA测序数据表示为超图的新方法,并开发了两种新颖的聚类算法,以改进细胞类型聚类 首次将scRNA-seq数据表示为超图以捕获高阶信息,并提出了两种新的超图随机游走聚类算法(DIPHW和CoMem-DIPHW),后者整合了单细胞表达超图与基因共表达、细胞共表达网络 未明确说明算法在超大规模数据集上的计算效率,也未讨论对批次效应等常见scRNA-seq数据问题的处理能力 改进单细胞RNA测序数据的细胞类型聚类分析 单细胞RNA测序数据 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 超图随机游走算法(DIPHW, CoMem-DIPHW) 基因表达矩阵 多个真实世界数据集(人胰腺、小鼠胰腺、人脑、小鼠脑组织)和模拟数据,包括人肺腺癌细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5100 2026-04-14
GRNFormer: accurate gene regulatory network inference using graph transformer
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为GRNFormer的通用图变换器框架,用于从跨物种、细胞类型和平台的转录组学数据中准确推断基因调控网络 GRNFormer整合了基于变换器的基因表达编码器与变分图自编码器,并采用TF-Walker子图采样策略,有效捕获基因调控相互作用,无需细胞类型注释或先验调控信息 NA 解决从单细胞转录组学数据中推断基因调控网络的挑战,包括数据稀疏性、高维度和缺乏可扩展、可泛化的推理模型 基因调控网络,涉及人类胚胎干细胞中的多能性回路和外围血单核细胞中的免疫细胞模块 计算生物学 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq 图变换器,变分图自编码器 转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
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