单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5081 - 5100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5081 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Unveils the Mechanistic Role of FOSL1 in Cutaneous Wound Healing
2025-May-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061330
PMID:40564048
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了转录因子FOSL1在皮肤伤口愈合中的调控机制 | 首次系统揭示FOSL1通过调控MAPK和EGFR信号通路在皮肤伤口愈合中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探究FOSL1在皮肤伤口愈合中的作用机制及其治疗潜力 | 皮肤组织样本和动物模型 | 生物信息学 | 皮肤创伤 | 单细胞转录组测序, Western blot, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5082 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal Single-Cell Analysis Reveals T Cell Clonal Dynamics and Phenotypic Plasticity in Human Graft-versus-Host Disease
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.24.655962
PMID:40501545
|
研究论文 | 通过时空单细胞分析揭示人类移植物抗宿主病中T细胞克隆动态和表型可塑性 | 开发了新型计算工具DecompTCR用于纵向TCR分析，整合多种技术揭示GVHD严重程度相关的克隆扩增程序 | 样本量相对有限（27例alloHCT受者），需要更大规模验证 | 解析移植物抗宿主病中T细胞介导的复杂病理机制 | 27例异基因造血细胞移植受者 | 单细胞分析 | 移植物抗宿主病 | 混合淋巴细胞反应克隆指纹识别,TCR克隆分型,单细胞RNA/TCR测序,空间转录组学 | DecompTCR | 单细胞RNA-seq, TCR序列,空间转录组 | 27例异基因造血细胞移植受者 | NA | 单细胞RNA-seq, TCR测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 5083 | 2025-10-06 |
Correction: Desterke et al. Single-Cell RNA-Seq Analysis Links DNMT3B and PFKFB4 Transcriptional Profiles with Metastatic Traits in Hepatoblastoma. Biomolecules 2024, 14, 1394
2025-May-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15060769
PMID:40563546
|
更正 | 对已发表论文中错误的修正说明 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5084 | 2025-10-06 |
Multi-Transcriptomic Analysis Reveals GSC-Driven MES-Like Differentiation via EMT in GBM Cell-Cell Communication
2025-May-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061304
PMID:40564022
|
研究论文 | 通过多转录组分析揭示胶质母细胞瘤中胶质瘤干细胞通过EMT驱动间充质样分化的细胞间通讯模式 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组数据系统分析GSC通过EMT介导的细胞通讯机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要实验验证EMT通路在GSC分化中的具体作用机制 | 探索胶质母细胞瘤中胶质瘤干细胞的细胞间通讯模式及其对肿瘤进展的影响 | 胶质母细胞瘤中的胶质瘤干细胞及其他肿瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组,基因集富集分析 | CellChat, ssGSEA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组 | NA | NA |
| 5085 | 2025-10-06 |
Evaluation of the Effects of the Quaternary Ammonium Silane K21 on Zebrafish Viability, Toxicity, Growth, and Development
2025-May-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061267
PMID:40563986
|
研究论文 | 评估季铵硅烷K21对斑马鱼存活率、毒性、生长和发育的影响 | 首次系统评估K21在斑马鱼多代发育中的生物学效应，并发现其可能激活新的生长加速通路 | 研究主要基于斑马鱼模型，在人类应用中的效果仍需进一步验证 | 探索K21分子在人类健康保护和疾病防治中的潜在应用 | 野生型、Casper透明皮肤突变型和转基因斑马鱼品系，以及卤虫 | 毒理学与发育生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序，连续稀释法，急性和慢性暴露研究 | NA | 基因表达数据，发育表型数据 | 多个发育阶段（胚胎、幼虫、幼鱼、成鱼）的斑马鱼和卤虫样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5086 | 2025-10-06 |
Mapping Inherited Genetic Variation with Opposite Effects on Autoimmune Disease and Four Cancer Types Identifies Candidate Drug Targets Associated with the Anti-Tumor Immune Response
2025-May-14, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16050575
PMID:40428397
|
研究论文 | 通过基因组关联研究识别对自身免疫疾病和癌症具有相反效应的遗传变异，发现潜在的癌症免疫治疗靶点 | 首次系统性地识别对自身免疫疾病和四种癌症类型具有相反效应的遗传变异，并验证其作为免疫治疗靶点的潜力 | 研究局限于四种特定癌症类型和七种自身免疫疾病，需要进一步实验验证 | 识别具有相反效应于自身免疫疾病和癌症的遗传变异，发现新的癌症免疫治疗靶点 | 乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌和子宫内膜癌患者(240,540例)及自身免疫疾病患者(112,631例)的基因组数据 | 基因组学 | 多种癌症和自身免疫疾病 | GWAS, 元分析, RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, eQTL分析 | 固定效应元分析, 连锁不平衡聚类 | 基因组关联数据, 转录组数据 | 240,540例癌症患者/317,000例对照, 112,631例自身免疫疾病患者/895,386例对照 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5087 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell RNA sequencing and mendelian randomization analysis reveal the potential role of synaptic vesicle cycling-related genes in Alzheimer's disease
2025-May, The journal of prevention of Alzheimer's disease
DOI:10.1016/j.tjpad.2025.100097
PMID:40021385
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，揭示了突触小泡循环相关基因在阿尔茨海默病中的潜在作用 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析识别出四个突触小泡循环相关基因作为AD的保护因子 | 研究数据完全来源于公共数据库，缺乏实验验证 | 探索突触小泡循环相关基因在阿尔茨海默病中的潜在作用机制 | 阿尔茨海默病患者和健康个体的基因表达数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 差异表达分析 | 列线图 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5088 | 2025-10-06 |
Spatial profiling of ANO7 in prostate tissue: links to AR-signalling-associated lipid metabolism and inflammation
2025-04, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6405
PMID:39978863
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析ANO7在前列腺组织中的表达模式及其与雄激素受体信号和脂质代谢的关联 | 首次发现ANO7在前列腺上皮中呈现异质性开关表达模式，并揭示其与雄激素受体信号通路和脂质代谢的关联 | 研究样本仅来自局限性前列腺癌患者，未涵盖更广泛的前列腺疾病谱系 | 探讨ANO7基因在良性前列腺上皮中的功能作用 | 前列腺切除术样本中的良性前列腺上皮区域 | 空间转录组学 | 前列腺癌 | 空间转录组学，RNA-seq | NA | 空间转录组数据，批量RNA-seq数据 | 来自局限性前列腺癌患者的前列腺切除术样本（具体样本数未明确说明） | NA | 空间转录组学，批量RNA测序 | NA | NA |
| 5089 | 2025-10-06 |
An Improved, High-Yield Method for Isolating Nuclei from Individual Zebrafish Embryos for Single-Nucleus RNA Sequencing
2025-04, Zebrafish
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/zeb.2024.0175
PMID:40040474
|
研究论文 | 开发了一种改进的从斑马鱼胚胎中高效分离高质量细胞核的方法，用于单细胞RNA测序 | 采用珠磨均质化方法在96孔板格式中高效分离细胞核，相比酶消化法有显著改进 | NA | 建立高效的斑马鱼胚胎细胞核分离方法以支持单细胞测序研究 | 斑马鱼胚胎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组合索引RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5090 | 2025-10-06 |
Accurate trajectory inference in time-series spatial transcriptomics with structurally-constrained optimal transport
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644194
PMID:40166168
|
研究论文 | 提出一种基于最优传输的时空轨迹推断方法SOCS，用于时间序列空间转录组数据 | 开发了保持生物结构完整性的轨迹推断方法，能够维持空间连续生物单元在时间上的结构一致性 | NA | 改进时间序列空间转录组数据中的轨迹推断准确性 | 空间连续生物单元（如卵巢滤泡、肾小管和肾小球） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5091 | 2025-10-06 |
Assessing spatial sequencing and imaging approaches to capture the molecular and pathological heterogeneity of archived cancer tissues
2025-03, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6383
PMID:39846232
|
研究论文 | 评估空间转录组学和成像方法在捕获存档癌症组织分子和病理异质性方面的应用 | 首次系统评估多种空间转录组协议和成像方法在FFPE存档组织中的表现，整合基因表达谱与病理信息绘制新的分子图谱 | 研究仅使用皮肤来源的组织样本，存储时间范围为4-14年 | 评估空间转录组技术在存档癌症组织中解析异质性的技术性能和应用价值 | 福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的皮肤癌组织 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学, 单分子成像, 多重蛋白成像 | NA | 空间转录组数据, 成像数据 | 不同存储时间(4-14年)的FFPE组织样本，涵盖不同RNA质量 | NA | 空间转录组学, 单分子RNA成像, 多重蛋白成像 | NA | 两种测序基础的空间转录组协议, multiplex RNAScope, CODEX |
| 5092 | 2025-10-06 |
Current molecular understanding of central nervous system schwannomas
2025-02-05, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-01937-w
PMID:39910685
|
综述 | 本文全面概述了中枢神经系统神经鞘瘤的分子生物学研究现状 | 总结了新型遗传改变如SH3PXD2A::HTRA1融合基因、VGLL融合和SOX10突变，以及单细胞测序和多组学分析等先进技术的应用 | 对神经鞘瘤分子生物学的理解仍不完整，存在现有争议需要解决 | 阐明神经鞘瘤发生和进展的分子机制，指导新治疗靶点开发 | 中枢神经系统神经鞘瘤 | 神经肿瘤学 | 神经鞘瘤 | 单细胞测序, 多组学分析, 基因表达分析, 表观遗传调控分析 | NA | 基因组数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 5093 | 2025-10-06 |
CRISPR-Cas9 screening identifies the role of FER as a tumor suppressor
2025-02, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6374
PMID:39648412
|
研究论文 | 通过CRISPR-Cas9筛选发现FER作为肿瘤抑制基因在肿瘤发生发展中的关键作用 | 首次通过体内全基因组CRISPR-Cas9筛选鉴定FER为肿瘤抑制基因，并系统揭示其在肿瘤起始和进展中的功能机制 | 未明确FER在具体肿瘤类型中的作用机制，缺乏临床样本验证 | 系统性识别肿瘤抑制基因以理解肿瘤发生机制并开发早期诊断策略 | FER基因及其在肿瘤发生发展中的功能 | 功能基因组学 | 肿瘤 | CRISPR-Cas9筛选，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5094 | 2025-10-06 |
Integrated cancer cell-specific single-cell RNA-seq datasets of immune checkpoint blockade-treated patients
2025-Jan-22, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-04381-6
PMID:39843468
|
研究论文 | 整合了免疫检查点阻断治疗患者的癌细胞特异性单细胞RNA-seq数据集 | 整合了来自9种癌症类型、223名患者的8个scRNA-seq数据集，创建了专门研究癌细胞对ICB治疗反应的独特资源 | 样本量相对有限，数据集来自已有研究而非新收集 | 研究不同癌症类型中癌细胞对免疫检查点阻断治疗的反应机制 | 223名ICB治疗患者的90,270个癌细胞和265,671个其他细胞类型 | 单细胞组学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 223名患者，90,270个癌细胞，265,671个其他细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5095 | 2025-10-06 |
Kininogen enhances seizure susceptibility in mice possibly through bradykinin-induced modulation of calcium transients in glutamatergic and GABAergic neurons
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1509837
PMID:40556759
|
研究论文 | 本研究揭示了激肽原通过缓激肽调节谷氨酸能和GABA能神经元钙瞬变从而增强小鼠癫痫易感性的新机制 | 首次发现激肽原在癫痫发生中的病理作用，阐明了其通过缓激肽调节兴奋性和抑制性神经元钙活动的潜在神经环路机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证；机制研究尚未完全阐明激肽原-缓激肽信号通路的具体分子靶点 | 探究激肽原在癫痫发生中的功能作用及其神经环路机制 | 小鼠大脑组织、海马CA1区神经元、皮质层2/3谷氨酸能神经元和GABA能小清蛋白阳性神经元 | 神经科学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、免疫印迹、AAV介导的基因递送、双光子活体钙成像 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、钙成像数据、行为学数据 | 小鼠脑组织样本和活体成像数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5096 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Transcriptomics and Multi-omics Analyses Reveal the Clinical Effects of Acupuncture on Methadone Reduction
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0741
PMID:40556944
|
研究论文 | 通过单细胞RNA转录组学和多组学分析揭示针灸对美沙酮减量的临床效果及生物学机制 | 首次整合临床试验与多组学分析（单细胞测序、转录组学、代谢组学、宏基因组学）系统研究针灸对美沙酮维持治疗患者的作用机制 | 样本量有限（48例参与者），需更大规模研究验证 | 评估针灸对美沙酮维持治疗患者的临床效果并阐明其生物学机制 | 48名美沙酮维持治疗患者（针灸组25人，假针灸组23人） | 多组学分析 | 阿片类药物使用障碍 | 单细胞RNA测序, 转录组学, 代谢组学, 宏基因组学, 体外实验 | 随机对照试验 | 单细胞RNA序列, 代谢物, 微生物组, 临床数据 | 48名参与者（外周血单核细胞、血浆和粪便样本） | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 宏基因组学 | NA | NA |
| 5097 | 2025-10-06 |
Single-cell ligand-receptor profiling reveals an immunotherapy-responsive subtype and prognostic signature in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1590951
PMID:40557143
|
研究论文 | 通过单细胞配体-受体分析识别三阴性乳腺癌的免疫治疗应答亚型并建立预后标志 | 首次系统分析TNBC中配体-受体相互作用的单细胞特征，建立LR评分系统并验证其预测免疫治疗反应的能力 | 研究样本量有限，需要更多独立队列验证LR评分的临床适用性 | 探索配体-受体相互作用在三阴性乳腺癌预后和免疫治疗反应预测中的作用 | 三阴性乳腺癌患者和MDA-MB-231细胞系 | 单细胞转录组学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序，siRNA敲低，RT-qPCR，Western blot，增殖实验，集落形成实验，伤口愈合实验 | Lasso回归，逐步多变量分析 | 单细胞RNA测序数据，临床生存数据 | METABRIC队列298例，GSE58812数据集107例，细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5098 | 2025-10-06 |
Construction of a novel inflammatory-related prognostic signature of acute myelocytic leukemia based on conjoint analysis of single-cell and bulk RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565954
PMID:40557150
|
研究论文 | 本研究通过联合分析单细胞和bulk RNA测序数据，构建了一个基于炎症相关基因的急性髓系白血病预后风险模型 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据构建AML炎症相关预后特征，识别了五个关键预后基因 | 模型验证依赖于外部数据集，需要进一步前瞻性研究验证 | 构建急性髓系白血病的预后风险模型以优化精准治疗策略 | 急性髓系白血病患者 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, ssGSEA, LASSO分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5099 | 2025-10-06 |
FABP5+ macrophages contribute to lipid metabolism dysregulation in type A aortic dissection
2024-Dec-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113438
PMID:39447410
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了FABP5+巨噬细胞在A型主动脉夹层脂质代谢失调中的关键作用 | 首次系统评估主动脉夹层中非免疫细胞与免疫细胞间的相互作用及其对代谢的影响，并发现FABP5+巨噬细胞的新亚群 | 研究结果仍需在更大样本中进一步验证，机制研究尚待深入 | 阐明A型主动脉夹层的脂质代谢景观及其病理机制 | A型主动脉夹层患者和模型小鼠 | 多组学分析 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 脂质代谢组学 | NA | RNA序列数据, 代谢组学数据 | TAAD模型小鼠和TAAD患者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 脂质代谢组学 | NA | NA |
| 5100 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing data analysis utilizing multi-type graph neural networks
2024-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108921
PMID:39059210
|
研究论文 | 提出一种利用多类型图神经网络和去噪自编码器的单细胞RNA测序数据分析模型 | 将零膨胀负二项模型与去噪自编码器结合，并集成多类型图神经网络处理单细胞数据 | NA | 解决单细胞RNA测序数据降维、去噪和聚类分析的技术难题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 去噪自编码器, 图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |