单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 31780 篇文献,本页显示第 5061 - 5080 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
5061 2025-10-06
Solute carrier (SLC) expression reveals skeletogenic cell diversity
2023-11, Developmental biology IF:2.5Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析海胆胚胎发育中转运蛋白表达模式,揭示细胞功能多样性 采用基于转运蛋白表达的细胞聚类策略,发现传统基因调控状态分类中被忽略的细胞功能亚群 研究仅针对紫球海胆特定发育阶段,结论在其他物种或发育阶段的普适性需进一步验证 探究胚胎发育过程中不同细胞类型转运蛋白表达模式的多样性 紫球海胆晚期原肠胚阶段的各类细胞,特别是中胚层细胞(色素细胞、胚腔细胞和骨骼形成细胞) 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序 聚类分析 单细胞基因表达数据 紫球海胆晚期原肠胚阶段单细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5062 2025-10-06
Discoveries in Retina Physiology and Disease Biology Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-10-19, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
综述 本文系统回顾单细胞RNA测序技术在视网膜生理和疾病生物学研究中的应用进展 系统梳理scRNA-seq技术在视网膜细胞亚型鉴定和疾病机制研究中的独特价值,提供对视网膜发育和疾病分子基础的新见解 NA 探讨单细胞RNA测序技术在视网膜生理功能和疾病生物学研究中的应用 视网膜神经元细胞和胶质细胞 数字病理 视网膜疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5063 2025-10-06
Deep learning applications in single-cell genomics and transcriptomics data analysis
2023-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
综述 本文系统回顾了深度学习在单细胞基因组学和转录组学数据分析中的应用 系统评估深度学习在单细胞多组学整合和空间转录组学等新兴领域的应用潜力 深度学习尚未彻底解决单细胞组学领域最紧迫的挑战,发展进程相对渐进 评估深度学习在单细胞组学研究中的优势与挑战 单细胞基因组学、转录组学、空间转录组学和多组学整合数据 机器学习 癌症 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学整合 深度学习 基因组数据, 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
5064 2025-10-06
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2023-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 构建了跨物种协调的背根神经节和三叉神经节细胞图谱,描述了6个物种18种神经元和11种非神经元细胞类型 创建了首个跨物种协调的背根神经节和三叉神经节细胞图谱,解决了不同研究和物种间细胞类型比较的难题 研究主要基于转录组数据,可能无法完全反映细胞功能的多样性 比较不同物种背根神经节和三叉神经节细胞类型的转录组特征 背根神经节和三叉神经节的神经元和非神经元细胞 单细胞转录组学 疼痛相关疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 6个物种、19项研究的细胞数据,包括新分析的人类和蝾螈背根神经节细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5065 2025-10-06
Endoplasmic reticulum in oocytes: spatiotemporal distribution and function
2023-Jun, Journal of assisted reproduction and genetics IF:3.2Q2
综述 本文系统综述了内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能、结构、时空分布及其与其他细胞器的相互作用 结合单细胞RNA测序技术解析内质网机制,并将内质网功能与体外成熟临床问题相联系 NA 总结内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能和作用机制,为辅助生殖技术研究提供参考 哺乳动物卵母细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5066 2025-10-06
A Comprehensive Exploration of the Transcriptomic Landscape in Multiple Sclerosis: A Systematic Review
2023-Jan-11, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文通过系统综述探讨多发性硬化症中的转录组学特征及其相关生物学过程 整合了近年来RNA测序技术在多发性硬化症研究中的应用,揭示了疾病不同阶段的特异性分子特征和非编码RNA的关键作用 作为综述文章,未进行原始数据分析,依赖于已有研究结果的整合 探索转录组学在多发性硬化症中的作用机制 多发性硬化症相关的转录组学研究 生物信息学 多发性硬化症 RNA-seq, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
5067 2025-10-06
CCN1 Is a Therapeutic Target for Reperfused Ischemic Brain Injury
2025-Aug, Translational stroke research IF:3.8Q2
研究论文 本研究揭示CCN1是再灌注缺血性脑损伤的治疗靶点,通过干预脑膜淋巴系统调控系统性炎症 首次发现脑膜淋巴破坏通过降低CCN1表达减轻脑缺血再灌注损伤,并证实CCN1是脑-CLN轴炎症调控的关键介质 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;CCN1作用机制尚未完全阐明 探究脑膜淋巴系统在缺血再灌注阶段调控系统性炎症的作用及机制 小鼠缺血再灌注脑损伤模型、脑膜淋巴管内皮细胞、脑浸润免疫细胞 神经科学 缺血性脑卒中 单细胞RNA测序、脑室内注射、空间记忆功能测试 动物疾病模型 基因表达数据、行为学数据、组织病理数据 未明确样本数量的小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5068 2025-10-06
The human infertility single-cell testis atlas (HISTA): an interactive molecular scRNA-Seq reference of the human testis
2025-Jul, Andrology IF:3.2Q1
研究论文 开发了一个名为HISTA的交互式单细胞RNA测序参考图谱,用于研究人类睾丸的基因表达 整合了来自多个供体、发育年龄和生育状态的单细胞RNA测序数据,创建了首个交互式人类睾丸分子图谱工具 数据集仅包含12个供者样本,样本量相对有限 构建人类睾丸单细胞转录组参考图谱,帮助科学家理解和研究人类精子发生过程 人类睾丸组织样本,包括健康成人对照、青少年和多种不孕症病例 生物信息学 不孕症 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) 机器学习 单细胞转录组数据 12个供者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5069 2025-10-06
Applications of spatial transcriptomics in studying spermatogenesis
2025-Jul, Andrology IF:3.2Q1
综述 探讨空间转录组学技术在研究生精过程中的应用价值 系统阐述空间转录组学如何突破单细胞测序技术丢失空间信息的局限,在组织原位解析基因表达空间模式 作为综述文章未涉及具体实验数据验证 阐明空间转录组学在研究生精细胞发育调控机制中的应用前景 哺乳动物睾丸组织 空间转录组学 男性不育症 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
5070 2025-10-06
Aberrant single-cell phenotype and clinical implications of genotypically defined polyclonal plasma cells in myeloma
2025-Jun-26, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤中基因型定义的多克隆浆细胞的异常表型及其临床意义 首次在单细胞水平上基因型鉴定多克隆浆细胞,揭示其在骨髓瘤进展中的表型变化和临床相关性 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 研究多发性骨髓瘤中多克隆浆细胞的表型异常和临床意义 46例浆细胞疾病患者样本和21例健康供体的浆细胞 单细胞组学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序,单细胞B细胞受体分析 NA 单细胞转录组数据 234,789个浆细胞(其中64,432个为多克隆浆细胞),来自46例患者和21例健康供体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5071 2025-10-06
CAF-derived LRRC15 orchestrates macrophage polarization and limits PD-1 immunotherapy efficacy in glioblastoma
2025-Jun-26, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究揭示胶质母细胞瘤中CAF来源的LRRC15通过调控巨噬细胞极化限制PD-1免疫疗法疗效的机制 首次发现LRRC15高表达的CAF亚群通过FAK/SRC/NF-κB通路促进IL8表达,驱动巨噬细胞M2极化并形成TGF-β/LRRC15正反馈环路 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 探索胶质母细胞瘤免疫治疗耐药机制并寻找联合治疗策略 胶质母细胞瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
5072 2025-10-06
Podocyte YAP and TAZ hyperactivation drives glomerular epithelial proliferative diseases in mice and humans
2025-Jun-25, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过免疫染色和空间转录组学分析,发现足细胞YAP和TAZ过度激活是驱动肾小球上皮增生性疾病的共同机制 首次发现足细胞YAP-TAZ过度激活是多种肾小球上皮增生性疾病的统一驱动因素,突破了传统上将这些疾病视为不同实体的认知 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,在人类疾病中的直接验证仍需进一步研究 探究肾小球上皮增生性疾病的共同致病机制 人类肾脏活检组织、培养的人类细胞、基因工程小鼠 数字病理学 肾脏疾病 免疫染色, 空间转录组学, 基因编辑 基因敲除小鼠模型 图像, 转录组数据 人类肾脏活检样本(包括塌陷性肾小球病和ANCA血管炎相关新月体肾炎患者) NA 空间转录组学 NA NA
5073 2025-10-06
Extracellular vesicle-induced lipid dysregulation drives liver premetastatic niche formation in colorectal cancer
2025-Jun-25, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究揭示了结直肠癌细胞通过细胞外囊泡诱导肝脏脂质代谢紊乱驱动肝转移前微环境形成的机制 首次发现高转移性结直肠癌细胞通过细胞外囊泡传递促脂肪生成脂质驱动肝脏脂质积累,并阐明Kupffer细胞在此过程中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证相对有限 阐明高转移性结直肠癌细胞来源的细胞外囊泡促进肝转移前微环境形成的分子机制 结直肠癌细胞、小鼠肝脏转移模型、患者来源的类器官、临床结直肠癌患者肿瘤样本 癌症生物学 结直肠癌 脂质组学、单细胞测序、类器官培养 NA 脂质组数据、单细胞测序数据、临床样本数据 通过两轮脾脏注射筛选的高转移性结直肠癌细胞系,患者来源的肿瘤样本和类器官 NA 单细胞测序 NA NA
5074 2025-10-06
spCLUE: a contrastive learning approach to unified spatial transcriptomics analysis across single-slice and multi-slice data
2025-Jun-23, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出spCLUE框架,通过对比学习方法统一分析单切片和多切片空间转录组数据 结合多视图图网络、对比学习、注意力机制和批次提示模块,能够同时处理对齐和未对齐样本数据 NA 开发空间转录组数据分析工具,整合跨组织切片数据并识别一致的空间域 空间转录组数据中的spots(空间位点) 空间转录组学 NA 空间转录组技术 多视图图网络, 对比学习, 注意力机制 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
5075 2025-10-06
Distal electrical stimulation enhances neuromuscular reinnervation and satellite cell differentiation for functional recovery
2025-Jun-23, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨远端电刺激通过促进神经肌肉接头再生和卫星细胞分化改善神经损伤后功能恢复的机制 首次结合单细胞RNA测序技术揭示远端电刺激对卫星细胞基因表达的调控作用,阐明其促进肌肉再生的分子机制 研究仅使用大鼠模型,样本量有限,电刺激参数尚未优化 研究远端电刺激对神经肌肉接头再生和卫星细胞活性的调控作用 斯普拉格-道利大鼠坐骨神经临界缺损模型 神经科学 周围神经损伤 单细胞RNA测序,组织学分析,生化检测,肌电图 动物模型 基因表达数据,组织图像,生理信号 未明确具体数量的大鼠样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5076 2025-10-06
CellMemory: hierarchical interpretation of out-of-distribution cells using bottlenecked transformer
2025-Jun-23, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文提出了一种名为CellMemory的瓶颈Transformer模型,用于单细胞组学中分布外细胞的分层解释 受认知神经科学中全局工作空间理论启发,开发了具有改进泛化能力的瓶颈Transformer,无需预训练即可优于现有单细胞基础模型 NA 提高单细胞组学研究中分布外细胞的解释性和准确表示 分布外细胞、恶性细胞及其祖细胞 机器学习 NA 单细胞组学、空间转录组学 Transformer 单细胞组学数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
5077 2025-10-06
Predicting prognosis and immunotherapy response of ferroptosis-related genes in colorectal cancer
2025-Jun-23, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据识别结直肠癌中铁死亡相关基因标志物,并评估其预后价值和免疫治疗反应 采用空间转录组、单细胞转录组和批量转录组数据整合的多组学分析方法,区别于以往研究 NA 识别与结直肠癌预后和免疫反应相关的铁死亡标志物 结直肠癌组织和铁死亡相关基因 生物信息学 结直肠癌 空间转录组测序,单细胞转录组测序,批量转录组测序,免疫组织化学,Kaplan-Meier生存分析,ROC曲线,Lasso分析 预后模型 转录组数据,空间转录组数据,单细胞数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
5078 2025-10-06
Exploring the causal relationship between CX3CL1 and prostate cancer prognosis using Mendelian randomization
2025-Jun-22, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过孟德尔随机化方法探讨CX3CL1与前列腺癌预后的因果关系 首次使用孟德尔随机化方法验证CX3CL1与前列腺癌风险的因果关联,并结合单细胞测序分析其在肿瘤微环境中的表达特征 研究人群仅限于欧洲血统个体,可能限制结果在其他人群的普适性 探索炎症介质在前列腺癌发展和预后中的作用 前列腺癌患者和健康对照人群 生物信息学 前列腺癌 全基因组关联研究(GWAS), 孟德尔随机化, 单细胞测序, 基因表达分析, 免疫细胞浸润分析 孟德尔随机化模型, meta分析模型 基因组数据, 基因表达数据, 临床预后数据 GWAS数据涉及21,758名欧洲血统个体;前列腺癌数据集分别包含9,132例/173,493对照、7,847例/455,163对照、6,321例/354,873对照 UK Biobank 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序 NA NA
5079 2025-10-06
Hyperglycemia induces an immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer liver metastases by recruiting peripheral blood monocytes through the CCL3-CCR1 axis
2025-Jun-22, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了高血糖通过CCL3-CCR1轴招募外周血单核细胞,在结直肠癌肝转移中诱导免疫抑制微环境的新机制 首次发现高血糖通过CCL3-CCR1信号轴调控免疫抑制的新机制,为CRLM合并T2D患者提供了新的潜在治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据分析,需要进一步临床验证 探究T2D背景下CRLM免疫微环境特征并识别潜在治疗靶点 结直肠癌肝转移患者和小鼠模型 单细胞测序分析 结直肠癌肝转移 单细胞RNA测序 高血糖CRLM小鼠模型 单细胞RNA测序数据 7个单细胞RNA测序数据集,包含20个CRLM样本及匹配的PBMC样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5080 2025-10-06
STS2 deficiency revives CD8+T cells from exhaustion and augments checkpoint blockade efficacy in cancer immunotherapy
2025-Jun-22, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了STS2在调节CD8+T细胞耗竭中的关键作用及其作为癌症免疫治疗新靶点的潜力 首次发现STS2通过物理相互作用调节PD-1的表达、内吞和降解,从而影响T细胞耗竭状态 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 探究STS2在肿瘤微环境中调节CD8+T细胞耗竭的机制及其对免疫检查点阻断疗法的影响 CD8+肿瘤浸润淋巴细胞和STS2基因缺陷小鼠模型 癌症免疫学 癌症 流式细胞术、质谱流式细胞术、单细胞转录组学、免疫共沉淀、蛋白质降解测定、内吞测量 基因敲除小鼠模型 蛋白质相互作用数据、基因表达数据、细胞功能数据 未明确具体样本数量,使用小鼠模型和T细胞进行分析 NA 单细胞转录组学 NA NA
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