单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5061 - 5080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5061 | 2025-10-06 |
Distal electrical stimulation enhances neuromuscular reinnervation and satellite cell differentiation for functional recovery
2025-Jun-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04459-3
PMID:40551270
|
研究论文 | 本研究探讨远端电刺激通过促进神经肌肉接头再生和卫星细胞分化改善神经损伤后功能恢复的机制 | 首次结合单细胞RNA测序技术揭示远端电刺激对卫星细胞基因表达的调控作用，阐明其促进肌肉再生的分子机制 | 研究仅使用大鼠模型，样本量有限，电刺激参数尚未优化 | 研究远端电刺激对神经肌肉接头再生和卫星细胞活性的调控作用 | 斯普拉格-道利大鼠坐骨神经临界缺损模型 | 神经科学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序，组织学分析，生化检测，肌电图 | 动物模型 | 基因表达数据，组织图像，生理信号 | 未明确具体数量的大鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5062 | 2025-10-06 |
CellMemory: hierarchical interpretation of out-of-distribution cells using bottlenecked transformer
2025-Jun-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03638-y
PMID:40551223
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CellMemory的瓶颈Transformer模型，用于单细胞组学中分布外细胞的分层解释 | 受认知神经科学中全局工作空间理论启发，开发了具有改进泛化能力的瓶颈Transformer，无需预训练即可优于现有单细胞基础模型 | NA | 提高单细胞组学研究中分布外细胞的解释性和准确表示 | 分布外细胞、恶性细胞及其祖细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞组学、空间转录组学 | Transformer | 单细胞组学数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5063 | 2025-10-06 |
Predicting prognosis and immunotherapy response of ferroptosis-related genes in colorectal cancer
2025-Jun-23, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02779-x
PMID:40551269
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据识别结直肠癌中铁死亡相关基因标志物，并评估其预后价值和免疫治疗反应 | 采用空间转录组、单细胞转录组和批量转录组数据整合的多组学分析方法，区别于以往研究 | NA | 识别与结直肠癌预后和免疫反应相关的铁死亡标志物 | 结直肠癌组织和铁死亡相关基因 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 空间转录组测序,单细胞转录组测序,批量转录组测序,免疫组织化学,Kaplan-Meier生存分析,ROC曲线,Lasso分析 | 预后模型 | 转录组数据,空间转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 5064 | 2025-10-06 |
Exploring the causal relationship between CX3CL1 and prostate cancer prognosis using Mendelian randomization
2025-Jun-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03001-4
PMID:40544418
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化方法探讨CX3CL1与前列腺癌预后的因果关系 | 首次使用孟德尔随机化方法验证CX3CL1与前列腺癌风险的因果关联，并结合单细胞测序分析其在肿瘤微环境中的表达特征 | 研究人群仅限于欧洲血统个体，可能限制结果在其他人群的普适性 | 探索炎症介质在前列腺癌发展和预后中的作用 | 前列腺癌患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 全基因组关联研究(GWAS), 孟德尔随机化, 单细胞测序, 基因表达分析, 免疫细胞浸润分析 | 孟德尔随机化模型, meta分析模型 | 基因组数据, 基因表达数据, 临床预后数据 | GWAS数据涉及21,758名欧洲血统个体；前列腺癌数据集分别包含9,132例/173,493对照、7,847例/455,163对照、6,321例/354,873对照 | UK Biobank | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5065 | 2025-10-06 |
Hyperglycemia induces an immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer liver metastases by recruiting peripheral blood monocytes through the CCL3-CCR1 axis
2025-Jun-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011310
PMID:40550559
|
研究论文 | 本研究揭示了高血糖通过CCL3-CCR1轴招募外周血单核细胞，在结直肠癌肝转移中诱导免疫抑制微环境的新机制 | 首次发现高血糖通过CCL3-CCR1信号轴调控免疫抑制的新机制，为CRLM合并T2D患者提供了新的潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据分析，需要进一步临床验证 | 探究T2D背景下CRLM免疫微环境特征并识别潜在治疗靶点 | 结直肠癌肝转移患者和小鼠模型 | 单细胞测序分析 | 结直肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序 | 高血糖CRLM小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 7个单细胞RNA测序数据集，包含20个CRLM样本及匹配的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5066 | 2025-10-06 |
STS2 deficiency revives CD8+T cells from exhaustion and augments checkpoint blockade efficacy in cancer immunotherapy
2025-Jun-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010735
PMID:40550566
|
研究论文 | 本研究揭示了STS2在调节CD8+T细胞耗竭中的关键作用及其作为癌症免疫治疗新靶点的潜力 | 首次发现STS2通过物理相互作用调节PD-1的表达、内吞和降解，从而影响T细胞耗竭状态 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究STS2在肿瘤微环境中调节CD8+T细胞耗竭的机制及其对免疫检查点阻断疗法的影响 | CD8+肿瘤浸润淋巴细胞和STS2基因缺陷小鼠模型 | 癌症免疫学 | 癌症 | 流式细胞术、质谱流式细胞术、单细胞转录组学、免疫共沉淀、蛋白质降解测定、内吞测量 | 基因敲除小鼠模型 | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据、细胞功能数据 | 未明确具体样本数量，使用小鼠模型和T细胞进行分析 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 5067 | 2025-10-06 |
A comprehensive review of spatial transcriptomics data alignment and integration
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf536
PMID:40568931
|
综述 | 本文对空间转录组数据对齐和整合方法进行了全面回顾 | 提出了空间转录组数据对齐和整合的通用流程，并对24种相关工具进行了系统分类和评估 | 排除了仅关注单切片分析或多组学整合的工具，且在异质组织切片间实现稳健对齐仍面临挑战 | 回顾空间转录组数据对齐和整合方法，解释问题范围与挑战，并提出通用流程 | 空间转录组数据分析工具和方法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5068 | 2025-10-06 |
Diverse Landscape of Group 1 Innate Lymphoid Cells Predicts the Prognosis in Patients with Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Jun-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17122047
PMID:40563696
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析头颈鳞状细胞癌患者中先天淋巴样细胞亚群的多样性及其预后预测价值 | 首次在头颈鳞癌中系统描绘了ieILC1/NK细胞的多样性景观，并发现ieILC1-1亚群具有最高免疫活性且主要来源于HPV阳性样本 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探索先天淋巴样细胞亚群在头颈鳞癌中的功能状态和预后意义 | 头颈鳞状细胞癌患者的免疫细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 生存预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 95,809个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5069 | 2025-10-06 |
The Role of Cardiac Fibroblast Heterogeneity in Myocardial Fibrosis and Its Novel Therapeutic Potential
2025-Jun-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125882
PMID:40565343
|
综述 | 本文综述了心脏成纤维细胞异质性在心肌纤维化中的作用及其新型治疗潜力 | 系统阐述了心脏成纤维细胞不同亚群的特征及其在细胞外基质重塑中的独特作用，并探讨了基于细胞异质性的精准抗纤维化治疗策略 | NA | 探讨心脏成纤维细胞异质性在心肌纤维化中的作用机制和治疗潜力 | 心脏成纤维细胞及其不同亚群 | 病理生理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、表观遗传分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5070 | 2025-10-06 |
Identification Exploring the Mechanism and Clinical Validation of Mitochondrial Dynamics-Related Genes in Membranous Nephropathy Based on Mendelian Randomization Study and Bioinformatics Analysis
2025-Jun-17, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061489
PMID:40564208
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化研究和生物信息学分析探索线粒体动力学相关基因在膜性肾病中的机制并进行临床验证 | 首次整合孟德尔随机化、机器学习算法和单细胞RNA测序技术系统研究线粒体动力学相关基因在膜性肾病中的作用机制 | 研究样本量有限，需要更大规模的多中心验证 | 探索线粒体动力学相关基因在膜性肾病发病机制中的作用 | 膜性肾病患者的基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化分析, 机器学习算法 | 列线图模型 | 转录组数据 | 来自三个数据集(GSE200828, GSE73953, GSE241302)的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5071 | 2025-10-06 |
Progenitor Cell Dynamics in Androgenetic Alopecia: Insights from Spatially Resolved Transcriptomics
2025-Jun-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125792
PMID:40565255
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术分析雄激素性脱发患者毛囊祖细胞区域的转录变化 | 首次在保留组织空间背景的情况下，使用GeoMX数字空间分析平台研究AGA患者祖细胞区域的转录组变化 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究雄激素性脱发中祖细胞耗竭的分子机制 | 雄激素性脱发患者的毛囊祖细胞区域 | 空间转录组学 | 雄激素性脱发 | 空间转录组学，数字空间分析 | NA | 空间转录组数据，蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | GeoMX Digital Spatial Profiling (DSP) | GeoMX数字空间分析平台 |
| 5072 | 2025-10-06 |
The Transcriptomic Signature of Donkey Ovarian Tissue Revealed by Cross-Species Comparative Analysis at Single-Cell Resolution
2025-Jun-14, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15121761
PMID:40564314
|
研究论文 | 通过跨物种单细胞比较分析揭示驴卵巢组织的转录组特征 | 首次构建驴卵巢单细胞转录组图谱，并通过跨物种比较发现卵巢核心细胞类型的进化保守性和颗粒细胞/卵泡膜细胞的物种特异性适应 | 研究仅基于转录组数据，需要进一步功能验证实验确认关键基因的具体作用机制 | 探究驴卵巢生物学分子机制及跨物种生殖效率差异的遗传基础 | 驴卵巢组织细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17,423个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5073 | 2025-10-06 |
Integrative Single-Cell Transcriptomics and Network Modeling Reveal Modular Regulators of Sheep Zygotic Genome Activation
2025-Jun-11, Biology
DOI:10.3390/biology14060676
PMID:40563927
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和网络建模揭示绵羊合子基因组激活的模块化调控因子 | 首次在绵羊胚胎中应用单细胞RNA测序和网络建模方法解析合子基因组激活的调控网络 | 仅分析了8细胞、16细胞和32细胞阶段的胚胎，未涵盖更早期或更晚期的发育阶段 | 解析绵羊合子基因组激活的调控机制和网络架构 | 绵羊体内和体外来源的胚胎 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | WGCNA, STRING蛋白互作网络, Louvain社区检测 | 单细胞转录组数据 | 8细胞、16细胞和32细胞阶段的绵羊胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞RNA测序技术 |
| 5074 | 2025-10-06 |
scRL: Utilizing Reinforcement Learning to Evaluate Fate Decisions in Single-Cell Data
2025-Jun-11, Biology
DOI:10.3390/biology14060679
PMID:40563931
|
研究论文 | 提出了一种利用强化学习评估单细胞数据中命运决策的新方法scRL | 首次将强化学习应用于单细胞数据分析，通过actor-critic框架将细胞分化重新定义为潜在流形上的顺序决策过程 | NA | 解码单细胞数据中的发育逻辑，精确定位命运决策的时间和位置 | 造血过程、小鼠内分泌发生、急性髓系白血病以及基因敲除和辐射数据集 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 强化学习, actor-critic框架, 潜在狄利克雷分配 | 单细胞转录组数据 | 数十万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5075 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics in Lung Cancer and Pulmonary Diseases: A Comprehensive Review
2025-Jun-09, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17121912
PMID:40563563
|
综述 | 本文全面回顾了空间转录组学在肺癌和肺部疾病研究中的应用与进展 | 系统总结了空间转录组技术在揭示肺部细胞空间组织和病理改变方面的革命性突破，包括发现局部免疫生态位、基质-上皮相互作用和疾病相关转录热点 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据和分析方法的详细验证 | 探讨空间转录组学在呼吸系统疾病研究中的新兴作用和应用潜力 | 肺癌、慢性阻塞性肺疾病、哮喘、特发性肺纤维化等肺部疾病 | 空间转录组学 | 肺癌,肺部疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5076 | 2025-10-06 |
Identifying CDCA4 as a Radiotherapy Resistance-Associated Gene in Colorectal Cancer by an Integrated Bioinformatics Analysis Approach
2025-Jun-09, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16060696
PMID:40565588
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析方法鉴定CDCA4为结直肠癌放疗耐药相关基因 | 首次通过整合胚系突变、转录组数据和免疫微环境特征的系统性分析，揭示CDCA4在结直肠癌放疗耐药中的关键作用及其与B细胞浸润的关联 | 样本量相对较小（12例LARC患者），需要在更大队列中进一步验证 | 探索结直肠癌放疗耐药的遗传和分子机制 | 局部晚期直肠癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 全外显子组测序, 转录组分析, 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因组数据, 转录组数据 | 12例LARC患者肿瘤样本，整合TCGA-READ、GSE150082、GSE190826和GSE132465数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 5077 | 2025-10-06 |
Chromoanagenesis in Osteosarcoma
2025-Jun-07, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15060833
PMID:40563473
|
综述 | 本文综述了染色体灾难现象在骨肉瘤中的作用机制及其对肿瘤进展的影响 | 系统阐述了染色体碎裂和染色体再合成等染色体灾难机制在骨肉瘤中的发生频率（高达62%）及其驱动肿瘤异质性的作用 | 针对骨肉瘤的靶向治疗仍难以实现，需要进一步研究开发有效治疗策略 | 探讨染色体灾难现象在骨肉瘤发生发展中的作用机制及潜在治疗方向 | 骨肉瘤及其相关的染色体灾难现象 | 基因组学 | 骨肉瘤 | 下一代测序，光学基因组图谱，单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5078 | 2025-10-06 |
Uridine, a Therapeutic Nucleoside, Exacerbates Alcoholic Liver Disease via SRC Kinase Activation: A Network Toxicology and Molecular Dynamics Perspective
2025-Jun-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125473
PMID:40564937
|
研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学和分子动力学方法，揭示了尿苷通过激活SRC激酶加剧酒精性肝病的新机制 | 首次发现尿苷作为潜在肝毒性物质通过SRC激酶激活加重酒精性肝病，并采用多组学整合分析阐明其分子机制 | 研究主要基于计算模拟和组学数据分析，需要进一步实验验证 | 探究酒精性肝病与血液代谢物尿苷之间的因果关系和分子机制 | 酒精性肝病患者（1416例）和对照组（217,376例）的基因组数据，以及1091种血液代谢物 | 计算生物学 | 酒精性肝病 | 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 基因组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 1416例酒精性肝病患者和217,376例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5079 | 2025-10-06 |
Dynamic Transcriptomic and Cellular Remodeling Underlie Cuprizone-Induced Demyelination and Endogenous Repair in the CNS
2025-Jun-06, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox14060692
PMID:40563324
|
研究论文 | 本研究通过铜宗诱导的脱髓鞘模型，揭示了中枢神经系统脱髓鞘和修复过程中的动态转录组和细胞重塑机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示胶质细胞群体的动态变化及Psap-Gpr37l1信号通路上调，并系统阐明了脱髓鞘过程中血脑屏障完整性、神经免疫激活和氧化应激的时序变化 | 研究基于动物模型，结果向人类疾病的转化需要进一步验证 | 探究中枢神经系统脱髓鞘和髓鞘再生的细胞分子机制 | 铜宗处理的小鼠模型 | 神经科学 | 脱髓鞘疾病 | 单细胞RNA测序，组织学分析，免疫荧光分析，转录组分析 | NA | 基因表达数据，组织图像数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5080 | 2025-10-06 |
Angiogenesis in Atrial Fibrillation: A Literature Review
2025-Jun-06, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061399
PMID:40564118
|
综述 | 本文综述了血管生成在心房颤动发病机制中的双重作用及治疗潜力 | 系统阐述了血管生成在房颤中的双重角色——过度血管生成促进心房重构，而代偿性血管生成具有保护作用，并提出了整合单细胞测序与心脏肿瘤学原则的跨学科策略 | 临床验证仍然有限，非选择性VEGF抑制存在心血管毒性安全问题 | 阐明血管生成在房颤发病机制中的作用并探索靶向治疗策略 | 心房颤动患者及相关病理机制 | 心血管疾病研究 | 心房颤动 | 单细胞测序 | NA | 文献资料 | 全球估计2.5-3.5%人口 | NA | NA | NA | NA |