单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5041 - 5060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5041 | 2025-10-06 |
MOXD1 is a lineage-specific gene and a tumor suppressor in neuroblastoma
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1583
PMID:38905335
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研究论文 | 本研究通过分析神经母细胞瘤样本的RNA测序数据，发现MOXD1基因是神经母细胞瘤中的谱系特异性肿瘤抑制基因 | 首次将MOXD1鉴定为神经母细胞瘤中的谱系限制性肿瘤抑制基因，并揭示了其在肿瘤发展中的决定性作用 | 缺乏适当的早期肿瘤驱动事件研究模型 | 探索神经母细胞瘤的胚胎起源和早期肿瘤驱动事件 | 人类神经母细胞瘤样本、人类神经母细胞瘤细胞、胎儿肾上腺、斑马鱼、小鸡和小鼠模型 | 癌症生物学 | 神经母细胞瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 人类神经母细胞瘤样本和多种动物模型 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5042 | 2025-10-06 |
Noninvasive assessment of the lung inflammation-fibrosis axis by targeted imaging of CMKLR1
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9817
PMID:38896611
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研究论文 | 本研究验证了CMKLR1作为肺部炎症-纤维化轴成像生物标志物的潜力 | 首次将CMKLR1确定为单核细胞源性巨噬细胞的瞬时标志物，并开发了CMKLR1靶向PET成像技术用于肺部炎症和纤维化的无创评估 | 研究主要基于小鼠模型，临床验证仍需进一步开展 | 开发用于纤维化肺疾病风险分层和治疗监测的可靠生物标志物 | 特发性肺纤维化患者和小鼠肺纤维化模型 | 数字病理 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，正电子发射断层扫描 | NA | 基因表达数据，影像数据 | 特发性肺纤维化患者队列和博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5043 | 2025-10-06 |
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj9173
PMID:38905344
|
研究论文 | 构建了跨物种三叉神经节和背根神经节的统一细胞图谱，促进不同物种和研究间的细胞类型比较 | 创建了首个涵盖6个物种、31个数据集的统一感觉神经节细胞图谱，改进了稀疏神经元亚型的注释 | 研究主要基于转录组数据，可能未完全捕捉蛋白质水平和功能特性的差异 | 比较不同物种感觉神经节的细胞类型多样性并建立统一注释标准 | 三叉神经节和背根神经节的感觉神经元和非神经元细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 6个物种、31个数据集 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 5044 | 2025-10-06 |
Integration mapping of cardiac fibroblast single-cell transcriptomes elucidates cellular principles of fibrosis in diverse pathologies
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8501
PMID:38905342
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据构建心脏纤维化的综合参考图谱 | 建立了首个全面的心脏纤维化单细胞转录组整合图谱，揭示了不同病理模型中成纤维细胞的相似性动态变化 | NA | 阐明不同病理条件下心脏纤维化的细胞学原理 | 心脏成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类健康及患病心脏样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5045 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals segregation of tumor cell states in glioblastoma and marked immunosuppression within the perinecrotic niche
2024-04-22, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01769-0
PMID:38650010
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据，揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤细胞状态的空间分离模式以及坏死周围区域的免疫抑制特征 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术，系统揭示了胶质母细胞瘤中不同肿瘤细胞状态的空间分布规律及坏死周围区域的免疫抑制微环境 | 研究仅包含3例患者样本，样本量较小，可能限制结果的普适性 | 探究胶质母细胞瘤微环境中细胞类型和肿瘤细胞状态的空间分布特征 | 胶质母细胞瘤患者组织样本 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 3例胶质母细胞瘤患者 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序, 10x Visium空间转录组学平台 |
| 5046 | 2025-10-06 |
Development of a Nanoparticle-Based Tendon-Targeting Drug Delivery System to Pharmacologically Modulate Tendon Healing
2023-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.29.569204
PMID:38076889
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研究论文 | 开发了一种基于纳米颗粒的肌腱靶向药物递送系统，用于药理调节肌腱愈合 | 利用空间转录组学数据发现愈合肌腱中TRAP高表达区域，并首次将TRAP结合肽功能化纳米颗粒应用于肌腱靶向药物递送 | 研究仅针对急性肌腱损伤模型，未验证在慢性肌腱病变或其他类型软组织损伤中的效果 | 开发靶向肌腱的药物递送系统以改善肌腱愈合过程 | 肌腱愈合过程、TRAP表达、纳米颗粒药物递送系统 | 组织工程与再生医学 | 肌腱损伤 | 空间转录组学、纳米颗粒药物递送、功能评估 | NA | 基因表达数据、功能评估数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5047 | 2025-10-06 |
Solute carrier (SLC) expression reveals skeletogenic cell diversity
2023-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.08.004
PMID:37611888
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析海胆胚胎发育中转运蛋白表达模式，揭示细胞功能多样性 | 采用基于转运蛋白表达的细胞聚类策略，发现传统基因调控状态分类中被忽略的细胞功能亚群 | 研究仅针对紫球海胆特定发育阶段，结论在其他物种或发育阶段的普适性需进一步验证 | 探究胚胎发育过程中不同细胞类型转运蛋白表达模式的多样性 | 紫球海胆晚期原肠胚阶段的各类细胞，特别是中胚层细胞（色素细胞、胚腔细胞和骨骼形成细胞） | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞基因表达数据 | 紫球海胆晚期原肠胚阶段单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5048 | 2025-10-06 |
Discoveries in Retina Physiology and Disease Biology Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-10-19, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2810247
PMID:37919055
|
综述 | 本文系统回顾单细胞RNA测序技术在视网膜生理和疾病生物学研究中的应用进展 | 系统梳理scRNA-seq技术在视网膜细胞亚型鉴定和疾病机制研究中的独特价值，提供对视网膜发育和疾病分子基础的新见解 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在视网膜生理功能和疾病生物学研究中的应用 | 视网膜神经元细胞和胶质细胞 | 数字病理 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5049 | 2025-10-06 |
Deep learning applications in single-cell genomics and transcriptomics data analysis
2023-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115077
PMID:37393865
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综述 | 本文系统回顾了深度学习在单细胞基因组学和转录组学数据分析中的应用 | 系统评估深度学习在单细胞多组学整合和空间转录组学等新兴领域的应用潜力 | 深度学习尚未彻底解决单细胞组学领域最紧迫的挑战，发展进程相对渐进 | 评估深度学习在单细胞组学研究中的优势与挑战 | 单细胞基因组学、转录组学、空间转录组学和多组学整合数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学整合 | 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5050 | 2025-10-06 |
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2023-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.04.547740
PMID:37461736
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研究论文 | 构建了跨物种协调的背根神经节和三叉神经节细胞图谱，描述了6个物种18种神经元和11种非神经元细胞类型 | 创建了首个跨物种协调的背根神经节和三叉神经节细胞图谱，解决了不同研究和物种间细胞类型比较的难题 | 研究主要基于转录组数据，可能无法完全反映细胞功能的多样性 | 比较不同物种背根神经节和三叉神经节细胞类型的转录组特征 | 背根神经节和三叉神经节的神经元和非神经元细胞 | 单细胞转录组学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个物种、19项研究的细胞数据，包括新分析的人类和蝾螈背根神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5051 | 2025-10-06 |
Endoplasmic reticulum in oocytes: spatiotemporal distribution and function
2023-Jun, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02782-3
PMID:37171741
|
综述 | 本文系统综述了内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能、结构、时空分布及其与其他细胞器的相互作用 | 结合单细胞RNA测序技术解析内质网机制，并将内质网功能与体外成熟临床问题相联系 | NA | 总结内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能和作用机制，为辅助生殖技术研究提供参考 | 哺乳动物卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5052 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Exploration of the Transcriptomic Landscape in Multiple Sclerosis: A Systematic Review
2023-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24021448
PMID:36674968
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综述 | 本文通过系统综述探讨多发性硬化症中的转录组学特征及其相关生物学过程 | 整合了近年来RNA测序技术在多发性硬化症研究中的应用，揭示了疾病不同阶段的特异性分子特征和非编码RNA的关键作用 | 作为综述文章，未进行原始数据分析，依赖于已有研究结果的整合 | 探索转录组学在多发性硬化症中的作用机制 | 多发性硬化症相关的转录组学研究 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5053 | 2025-10-06 |
CCN1 Is a Therapeutic Target for Reperfused Ischemic Brain Injury
2025-Aug, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01279-0
PMID:39028413
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研究论文 | 本研究揭示CCN1是再灌注缺血性脑损伤的治疗靶点，通过干预脑膜淋巴系统调控系统性炎症 | 首次发现脑膜淋巴破坏通过降低CCN1表达减轻脑缺血再灌注损伤，并证实CCN1是脑-CLN轴炎症调控的关键介质 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；CCN1作用机制尚未完全阐明 | 探究脑膜淋巴系统在缺血再灌注阶段调控系统性炎症的作用及机制 | 小鼠缺血再灌注脑损伤模型、脑膜淋巴管内皮细胞、脑浸润免疫细胞 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序、脑室内注射、空间记忆功能测试 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、行为学数据、组织病理数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5054 | 2025-10-06 |
The human infertility single-cell testis atlas (HISTA): an interactive molecular scRNA-Seq reference of the human testis
2025-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13637
PMID:38577799
|
研究论文 | 开发了一个名为HISTA的交互式单细胞RNA测序参考图谱，用于研究人类睾丸的基因表达 | 整合了来自多个供体、发育年龄和生育状态的单细胞RNA测序数据，创建了首个交互式人类睾丸分子图谱工具 | 数据集仅包含12个供者样本，样本量相对有限 | 构建人类睾丸单细胞转录组参考图谱，帮助科学家理解和研究人类精子发生过程 | 人类睾丸组织样本，包括健康成人对照、青少年和多种不孕症病例 | 生物信息学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | 12个供者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5055 | 2025-10-06 |
Applications of spatial transcriptomics in studying spermatogenesis
2025-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70043
PMID:40202007
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综述 | 探讨空间转录组学技术在研究生精过程中的应用价值 | 系统阐述空间转录组学如何突破单细胞测序技术丢失空间信息的局限，在组织原位解析基因表达空间模式 | 作为综述文章未涉及具体实验数据验证 | 阐明空间转录组学在研究生精细胞发育调控机制中的应用前景 | 哺乳动物睾丸组织 | 空间转录组学 | 男性不育症 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5056 | 2025-10-06 |
Aberrant single-cell phenotype and clinical implications of genotypically defined polyclonal plasma cells in myeloma
2025-Jun-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025643
PMID:40009503
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤中基因型定义的多克隆浆细胞的异常表型及其临床意义 | 首次在单细胞水平上基因型鉴定多克隆浆细胞，揭示其在骨髓瘤进展中的表型变化和临床相关性 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 研究多发性骨髓瘤中多克隆浆细胞的表型异常和临床意义 | 46例浆细胞疾病患者样本和21例健康供体的浆细胞 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，单细胞B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 234,789个浆细胞（其中64,432个为多克隆浆细胞），来自46例患者和21例健康供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5057 | 2025-10-06 |
CAF-derived LRRC15 orchestrates macrophage polarization and limits PD-1 immunotherapy efficacy in glioblastoma
2025-Jun-26, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf157
PMID:40569145
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研究论文 | 本研究揭示胶质母细胞瘤中CAF来源的LRRC15通过调控巨噬细胞极化限制PD-1免疫疗法疗效的机制 | 首次发现LRRC15高表达的CAF亚群通过FAK/SRC/NF-κB通路促进IL8表达，驱动巨噬细胞M2极化并形成TGF-β/LRRC15正反馈环路 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探索胶质母细胞瘤免疫治疗耐药机制并寻找联合治疗策略 | 胶质母细胞瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 5058 | 2025-10-06 |
Podocyte YAP and TAZ hyperactivation drives glomerular epithelial proliferative diseases in mice and humans
2025-Jun-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adq3852
PMID:40560997
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研究论文 | 本研究通过免疫染色和空间转录组学分析，发现足细胞YAP和TAZ过度激活是驱动肾小球上皮增生性疾病的共同机制 | 首次发现足细胞YAP-TAZ过度激活是多种肾小球上皮增生性疾病的统一驱动因素，突破了传统上将这些疾病视为不同实体的认知 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，在人类疾病中的直接验证仍需进一步研究 | 探究肾小球上皮增生性疾病的共同致病机制 | 人类肾脏活检组织、培养的人类细胞、基因工程小鼠 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 免疫染色, 空间转录组学, 基因编辑 | 基因敲除小鼠模型 | 图像, 转录组数据 | 人类肾脏活检样本（包括塌陷性肾小球病和ANCA血管炎相关新月体肾炎患者） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5059 | 2025-10-06 |
Extracellular vesicle-induced lipid dysregulation drives liver premetastatic niche formation in colorectal cancer
2025-Jun-25, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-334851
PMID:40562522
|
研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌细胞通过细胞外囊泡诱导肝脏脂质代谢紊乱驱动肝转移前微环境形成的机制 | 首次发现高转移性结直肠癌细胞通过细胞外囊泡传递促脂肪生成脂质驱动肝脏脂质积累，并阐明Kupffer细胞在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证相对有限 | 阐明高转移性结直肠癌细胞来源的细胞外囊泡促进肝转移前微环境形成的分子机制 | 结直肠癌细胞、小鼠肝脏转移模型、患者来源的类器官、临床结直肠癌患者肿瘤样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 脂质组学、单细胞测序、类器官培养 | NA | 脂质组数据、单细胞测序数据、临床样本数据 | 通过两轮脾脏注射筛选的高转移性结直肠癌细胞系，患者来源的肿瘤样本和类器官 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5060 | 2025-10-06 |
spCLUE: a contrastive learning approach to unified spatial transcriptomics analysis across single-slice and multi-slice data
2025-Jun-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03636-0
PMID:40551235
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研究论文 | 提出spCLUE框架，通过对比学习方法统一分析单切片和多切片空间转录组数据 | 结合多视图图网络、对比学习、注意力机制和批次提示模块，能够同时处理对齐和未对齐样本数据 | NA | 开发空间转录组数据分析工具，整合跨组织切片数据并识别一致的空间域 | 空间转录组数据中的spots（空间位点） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 多视图图网络, 对比学习, 注意力机制 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |