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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5041 | 2025-10-06 |
CCN1 Is a Therapeutic Target for Reperfused Ischemic Brain Injury
2025-Aug, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01279-0
PMID:39028413
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研究论文 | 本研究揭示CCN1是再灌注缺血性脑损伤的治疗靶点,通过干预脑膜淋巴系统调控系统性炎症 | 首次发现脑膜淋巴破坏通过降低CCN1表达减轻脑缺血再灌注损伤,并证实CCN1是脑-CLN轴炎症调控的关键介质 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;CCN1作用机制尚未完全阐明 | 探究脑膜淋巴系统在缺血再灌注阶段调控系统性炎症的作用及机制 | 小鼠缺血再灌注脑损伤模型、脑膜淋巴管内皮细胞、脑浸润免疫细胞 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序、脑室内注射、空间记忆功能测试 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、行为学数据、组织病理数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5042 | 2025-10-06 |
The human infertility single-cell testis atlas (HISTA): an interactive molecular scRNA-Seq reference of the human testis
2025-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13637
PMID:38577799
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研究论文 | 开发了一个名为HISTA的交互式单细胞RNA测序参考图谱,用于研究人类睾丸的基因表达 | 整合了来自多个供体、发育年龄和生育状态的单细胞RNA测序数据,创建了首个交互式人类睾丸分子图谱工具 | 数据集仅包含12个供者样本,样本量相对有限 | 构建人类睾丸单细胞转录组参考图谱,帮助科学家理解和研究人类精子发生过程 | 人类睾丸组织样本,包括健康成人对照、青少年和多种不孕症病例 | 生物信息学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | 12个供者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5043 | 2025-10-06 |
Applications of spatial transcriptomics in studying spermatogenesis
2025-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70043
PMID:40202007
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综述 | 探讨空间转录组学技术在研究生精过程中的应用价值 | 系统阐述空间转录组学如何突破单细胞测序技术丢失空间信息的局限,在组织原位解析基因表达空间模式 | 作为综述文章未涉及具体实验数据验证 | 阐明空间转录组学在研究生精细胞发育调控机制中的应用前景 | 哺乳动物睾丸组织 | 空间转录组学 | 男性不育症 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5044 | 2025-10-06 |
Aberrant single-cell phenotype and clinical implications of genotypically defined polyclonal plasma cells in myeloma
2025-Jun-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025643
PMID:40009503
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤中基因型定义的多克隆浆细胞的异常表型及其临床意义 | 首次在单细胞水平上基因型鉴定多克隆浆细胞,揭示其在骨髓瘤进展中的表型变化和临床相关性 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 研究多发性骨髓瘤中多克隆浆细胞的表型异常和临床意义 | 46例浆细胞疾病患者样本和21例健康供体的浆细胞 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 234,789个浆细胞(其中64,432个为多克隆浆细胞),来自46例患者和21例健康供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5045 | 2025-10-06 |
CAF-derived LRRC15 orchestrates macrophage polarization and limits PD-1 immunotherapy efficacy in glioblastoma
2025-Jun-26, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf157
PMID:40569145
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研究论文 | 本研究揭示胶质母细胞瘤中CAF来源的LRRC15通过调控巨噬细胞极化限制PD-1免疫疗法疗效的机制 | 首次发现LRRC15高表达的CAF亚群通过FAK/SRC/NF-κB通路促进IL8表达,驱动巨噬细胞M2极化并形成TGF-β/LRRC15正反馈环路 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索胶质母细胞瘤免疫治疗耐药机制并寻找联合治疗策略 | 胶质母细胞瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
5046 | 2025-10-06 |
Podocyte YAP and TAZ hyperactivation drives glomerular epithelial proliferative diseases in mice and humans
2025-Jun-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adq3852
PMID:40560997
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研究论文 | 本研究通过免疫染色和空间转录组学分析,发现足细胞YAP和TAZ过度激活是驱动肾小球上皮增生性疾病的共同机制 | 首次发现足细胞YAP-TAZ过度激活是多种肾小球上皮增生性疾病的统一驱动因素,突破了传统上将这些疾病视为不同实体的认知 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,在人类疾病中的直接验证仍需进一步研究 | 探究肾小球上皮增生性疾病的共同致病机制 | 人类肾脏活检组织、培养的人类细胞、基因工程小鼠 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 免疫染色, 空间转录组学, 基因编辑 | 基因敲除小鼠模型 | 图像, 转录组数据 | 人类肾脏活检样本(包括塌陷性肾小球病和ANCA血管炎相关新月体肾炎患者) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5047 | 2025-10-06 |
Extracellular vesicle-induced lipid dysregulation drives liver premetastatic niche formation in colorectal cancer
2025-Jun-25, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-334851
PMID:40562522
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌细胞通过细胞外囊泡诱导肝脏脂质代谢紊乱驱动肝转移前微环境形成的机制 | 首次发现高转移性结直肠癌细胞通过细胞外囊泡传递促脂肪生成脂质驱动肝脏脂质积累,并阐明Kupffer细胞在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证相对有限 | 阐明高转移性结直肠癌细胞来源的细胞外囊泡促进肝转移前微环境形成的分子机制 | 结直肠癌细胞、小鼠肝脏转移模型、患者来源的类器官、临床结直肠癌患者肿瘤样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 脂质组学、单细胞测序、类器官培养 | NA | 脂质组数据、单细胞测序数据、临床样本数据 | 通过两轮脾脏注射筛选的高转移性结直肠癌细胞系,患者来源的肿瘤样本和类器官 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
5048 | 2025-10-06 |
spCLUE: a contrastive learning approach to unified spatial transcriptomics analysis across single-slice and multi-slice data
2025-Jun-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03636-0
PMID:40551235
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研究论文 | 提出spCLUE框架,通过对比学习方法统一分析单切片和多切片空间转录组数据 | 结合多视图图网络、对比学习、注意力机制和批次提示模块,能够同时处理对齐和未对齐样本数据 | NA | 开发空间转录组数据分析工具,整合跨组织切片数据并识别一致的空间域 | 空间转录组数据中的spots(空间位点) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 多视图图网络, 对比学习, 注意力机制 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5049 | 2025-10-06 |
Distal electrical stimulation enhances neuromuscular reinnervation and satellite cell differentiation for functional recovery
2025-Jun-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04459-3
PMID:40551270
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研究论文 | 本研究探讨远端电刺激通过促进神经肌肉接头再生和卫星细胞分化改善神经损伤后功能恢复的机制 | 首次结合单细胞RNA测序技术揭示远端电刺激对卫星细胞基因表达的调控作用,阐明其促进肌肉再生的分子机制 | 研究仅使用大鼠模型,样本量有限,电刺激参数尚未优化 | 研究远端电刺激对神经肌肉接头再生和卫星细胞活性的调控作用 | 斯普拉格-道利大鼠坐骨神经临界缺损模型 | 神经科学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序,组织学分析,生化检测,肌电图 | 动物模型 | 基因表达数据,组织图像,生理信号 | 未明确具体数量的大鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5050 | 2025-10-06 |
CellMemory: hierarchical interpretation of out-of-distribution cells using bottlenecked transformer
2025-Jun-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03638-y
PMID:40551223
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研究论文 | 本文提出了一种名为CellMemory的瓶颈Transformer模型,用于单细胞组学中分布外细胞的分层解释 | 受认知神经科学中全局工作空间理论启发,开发了具有改进泛化能力的瓶颈Transformer,无需预训练即可优于现有单细胞基础模型 | NA | 提高单细胞组学研究中分布外细胞的解释性和准确表示 | 分布外细胞、恶性细胞及其祖细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞组学、空间转录组学 | Transformer | 单细胞组学数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
5051 | 2025-10-06 |
Predicting prognosis and immunotherapy response of ferroptosis-related genes in colorectal cancer
2025-Jun-23, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02779-x
PMID:40551269
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据识别结直肠癌中铁死亡相关基因标志物,并评估其预后价值和免疫治疗反应 | 采用空间转录组、单细胞转录组和批量转录组数据整合的多组学分析方法,区别于以往研究 | NA | 识别与结直肠癌预后和免疫反应相关的铁死亡标志物 | 结直肠癌组织和铁死亡相关基因 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 空间转录组测序,单细胞转录组测序,批量转录组测序,免疫组织化学,Kaplan-Meier生存分析,ROC曲线,Lasso分析 | 预后模型 | 转录组数据,空间转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
5052 | 2025-10-06 |
Exploring the causal relationship between CX3CL1 and prostate cancer prognosis using Mendelian randomization
2025-Jun-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03001-4
PMID:40544418
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化方法探讨CX3CL1与前列腺癌预后的因果关系 | 首次使用孟德尔随机化方法验证CX3CL1与前列腺癌风险的因果关联,并结合单细胞测序分析其在肿瘤微环境中的表达特征 | 研究人群仅限于欧洲血统个体,可能限制结果在其他人群的普适性 | 探索炎症介质在前列腺癌发展和预后中的作用 | 前列腺癌患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 全基因组关联研究(GWAS), 孟德尔随机化, 单细胞测序, 基因表达分析, 免疫细胞浸润分析 | 孟德尔随机化模型, meta分析模型 | 基因组数据, 基因表达数据, 临床预后数据 | GWAS数据涉及21,758名欧洲血统个体;前列腺癌数据集分别包含9,132例/173,493对照、7,847例/455,163对照、6,321例/354,873对照 | UK Biobank | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5053 | 2025-10-06 |
Hyperglycemia induces an immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer liver metastases by recruiting peripheral blood monocytes through the CCL3-CCR1 axis
2025-Jun-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011310
PMID:40550559
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研究论文 | 本研究揭示了高血糖通过CCL3-CCR1轴招募外周血单核细胞,在结直肠癌肝转移中诱导免疫抑制微环境的新机制 | 首次发现高血糖通过CCL3-CCR1信号轴调控免疫抑制的新机制,为CRLM合并T2D患者提供了新的潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据分析,需要进一步临床验证 | 探究T2D背景下CRLM免疫微环境特征并识别潜在治疗靶点 | 结直肠癌肝转移患者和小鼠模型 | 单细胞测序分析 | 结直肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序 | 高血糖CRLM小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 7个单细胞RNA测序数据集,包含20个CRLM样本及匹配的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5054 | 2025-10-06 |
STS2 deficiency revives CD8+T cells from exhaustion and augments checkpoint blockade efficacy in cancer immunotherapy
2025-Jun-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010735
PMID:40550566
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研究论文 | 本研究揭示了STS2在调节CD8+T细胞耗竭中的关键作用及其作为癌症免疫治疗新靶点的潜力 | 首次发现STS2通过物理相互作用调节PD-1的表达、内吞和降解,从而影响T细胞耗竭状态 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究STS2在肿瘤微环境中调节CD8+T细胞耗竭的机制及其对免疫检查点阻断疗法的影响 | CD8+肿瘤浸润淋巴细胞和STS2基因缺陷小鼠模型 | 癌症免疫学 | 癌症 | 流式细胞术、质谱流式细胞术、单细胞转录组学、免疫共沉淀、蛋白质降解测定、内吞测量 | 基因敲除小鼠模型 | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据、细胞功能数据 | 未明确具体样本数量,使用小鼠模型和T细胞进行分析 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
5055 | 2025-10-06 |
A comprehensive review of spatial transcriptomics data alignment and integration
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf536
PMID:40568931
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综述 | 本文对空间转录组数据对齐和整合方法进行了全面回顾 | 提出了空间转录组数据对齐和整合的通用流程,并对24种相关工具进行了系统分类和评估 | 排除了仅关注单切片分析或多组学整合的工具,且在异质组织切片间实现稳健对齐仍面临挑战 | 回顾空间转录组数据对齐和整合方法,解释问题范围与挑战,并提出通用流程 | 空间转录组数据分析工具和方法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5056 | 2025-10-06 |
Diverse Landscape of Group 1 Innate Lymphoid Cells Predicts the Prognosis in Patients with Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Jun-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17122047
PMID:40563696
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析头颈鳞状细胞癌患者中先天淋巴样细胞亚群的多样性及其预后预测价值 | 首次在头颈鳞癌中系统描绘了ieILC1/NK细胞的多样性景观,并发现ieILC1-1亚群具有最高免疫活性且主要来源于HPV阳性样本 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探索先天淋巴样细胞亚群在头颈鳞癌中的功能状态和预后意义 | 头颈鳞状细胞癌患者的免疫细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 生存预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 95,809个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5057 | 2025-10-06 |
The Role of Cardiac Fibroblast Heterogeneity in Myocardial Fibrosis and Its Novel Therapeutic Potential
2025-Jun-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125882
PMID:40565343
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综述 | 本文综述了心脏成纤维细胞异质性在心肌纤维化中的作用及其新型治疗潜力 | 系统阐述了心脏成纤维细胞不同亚群的特征及其在细胞外基质重塑中的独特作用,并探讨了基于细胞异质性的精准抗纤维化治疗策略 | NA | 探讨心脏成纤维细胞异质性在心肌纤维化中的作用机制和治疗潜力 | 心脏成纤维细胞及其不同亚群 | 病理生理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、表观遗传分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
5058 | 2025-10-06 |
Identification Exploring the Mechanism and Clinical Validation of Mitochondrial Dynamics-Related Genes in Membranous Nephropathy Based on Mendelian Randomization Study and Bioinformatics Analysis
2025-Jun-17, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061489
PMID:40564208
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研究论文 | 通过孟德尔随机化研究和生物信息学分析探索线粒体动力学相关基因在膜性肾病中的机制并进行临床验证 | 首次整合孟德尔随机化、机器学习算法和单细胞RNA测序技术系统研究线粒体动力学相关基因在膜性肾病中的作用机制 | 研究样本量有限,需要更大规模的多中心验证 | 探索线粒体动力学相关基因在膜性肾病发病机制中的作用 | 膜性肾病患者的基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化分析, 机器学习算法 | 列线图模型 | 转录组数据 | 来自三个数据集(GSE200828, GSE73953, GSE241302)的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5059 | 2025-10-06 |
Progenitor Cell Dynamics in Androgenetic Alopecia: Insights from Spatially Resolved Transcriptomics
2025-Jun-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125792
PMID:40565255
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术分析雄激素性脱发患者毛囊祖细胞区域的转录变化 | 首次在保留组织空间背景的情况下,使用GeoMX数字空间分析平台研究AGA患者祖细胞区域的转录组变化 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究雄激素性脱发中祖细胞耗竭的分子机制 | 雄激素性脱发患者的毛囊祖细胞区域 | 空间转录组学 | 雄激素性脱发 | 空间转录组学,数字空间分析 | NA | 空间转录组数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | GeoMX Digital Spatial Profiling (DSP) | GeoMX数字空间分析平台 |
5060 | 2025-10-06 |
The Transcriptomic Signature of Donkey Ovarian Tissue Revealed by Cross-Species Comparative Analysis at Single-Cell Resolution
2025-Jun-14, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15121761
PMID:40564314
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研究论文 | 通过跨物种单细胞比较分析揭示驴卵巢组织的转录组特征 | 首次构建驴卵巢单细胞转录组图谱,并通过跨物种比较发现卵巢核心细胞类型的进化保守性和颗粒细胞/卵泡膜细胞的物种特异性适应 | 研究仅基于转录组数据,需要进一步功能验证实验确认关键基因的具体作用机制 | 探究驴卵巢生物学分子机制及跨物种生殖效率差异的遗传基础 | 驴卵巢组织细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17,423个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |