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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5021 | 2025-10-06 |
Prostate luminal cell plasticity and cancer
2024-Dec-25, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217430
PMID:39730086
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综述 | 本文综述了前列腺管腔细胞可塑性在癌症中的作用及其对治疗耐药性的影响 | 整合了单细胞RNA测序和遗传谱系追踪技术揭示前列腺癌进展中的细胞可塑性和克隆动态变化 | 表观遗传改变如何影响肿瘤免疫原性仍是待研究领域 | 探讨前列腺细胞可塑性在癌症发展和治疗耐药中的作用机制 | 前列腺癌细胞、小鼠模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5022 | 2025-10-06 |
Pulmonary osteoclast-like cells in silica induced pulmonary fibrosis
2024-07-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4913
PMID:38985878
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研究论文 | 本研究探讨了二氧化硅诱导肺纤维化的机制,发现肺内破骨样细胞分化是导致肺损伤的关键因素 | 首次发现二氧化硅暴露可诱导肺泡巨噬细胞和单核细胞分化为肺内破骨样细胞,并证实抗RANKL抗体治疗可抑制此过程并减轻肺纤维化 | 研究样本量有限,机制研究主要基于动物模型,人类样本验证仍需扩大 | 探索矽肺发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 职业性二氧化硅暴露患者的肺组织样本和矽肺小鼠模型 | 病理生理学 | 矽肺 | 单细胞RNA测序,组织学分析,生化检测,生理功能评估 | NA | 基因表达数据,组织图像,生化指标,生理参数 | 人类职业暴露患者肺样本和纵向小鼠矽肺模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 全肺单细胞RNA测序 |
5023 | 2025-10-06 |
Development of human pancreatic cancer avatars as a model for dynamic immune landscape profiling and personalized therapy
2024-07-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9071
PMID:38968363
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研究论文 | 开发人胰腺癌avatar模型用于动态免疫景观分析和个性化治疗评估 | 创建个性化器官型avatar模型,能够对完整原位肿瘤微环境进行时空报告并反映临床反应 | 需要手术切除组织样本,模型维持时间有限(12天) | 建立胰腺癌临床前模型以促进治疗进展 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多重免疫荧光,空间转录组学 | 器官型avatar模型 | 图像,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5024 | 2025-10-06 |
Identification of intracellular bacteria from multiple single-cell RNA-seq platforms using CSI-Microbes
2024-07-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7402
PMID:38959321
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研究论文 | 开发了CSI-Microbes计算流程,用于从单细胞RNA测序数据中识别微生物reads并分析类群差异丰度 | 首次系统评估多种单细胞RNA测序技术回收微生物UMI的效率,发现较新的10x化学方法最适合 | NA | 研究肿瘤微生物组及其与肿瘤微环境的相互作用 | 食管癌和结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 食管癌,结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 计算流程(CSI-Microbes) | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 3' v3和5'化学方法 |
5025 | 2025-10-06 |
Tumor suppressor FRMD3 controls mammary epithelial cell fate determination via notch signaling pathway
2024-07-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8958
PMID:38959315
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研究论文 | 本研究揭示肿瘤抑制因子FRMD3通过调控Notch信号通路决定乳腺上皮细胞命运 | 首次发现FRMD3通过破坏Dvl2与去泛素化酶USP9x的相互作用促进其降解,并中断Dvl2与CK1、FOXK1/2和NICD的相互作用 | NA | 探究乳腺上皮细胞管腔-基底转化机制及FRMD3的肿瘤抑制功能 | 乳腺上皮细胞(MECs)和三阴性乳腺癌 | 分子生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5026 | 2025-10-06 |
Development of a nanoparticle-based tendon-targeting drug delivery system to pharmacologically modulate tendon healing
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn2332
PMID:38896625
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研究论文 | 开发了一种基于纳米颗粒的肌腱靶向药物递送系统,用于药理学调节肌腱愈合 | 首次发现肌腱愈合过程中的TRAP活性,并利用TRAP结合肽功能化纳米颗粒实现肌腱特异性药物递送 | 仅在小鼠模型中验证,尚未进行人体临床试验 | 开发改善肌腱愈合的药理学治疗方法 | 急性肌腱损伤的愈合过程 | 生物医学工程 | 肌腱损伤 | 空间转录组学、纳米颗粒药物递送系统 | NA | 基因表达数据、生物力学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5027 | 2025-10-06 |
Structure and dynamics of enterovirus genotype networks
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1693
PMID:38896609
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示肠道病毒种群通过突变网络维持与多个适应性基因型连接的进化动态 | 开发SEARCHLIGHT方法实现单细胞水平同时获取病毒单倍型和宿主转录组信息,首次在单细胞分辨率揭示病毒种群结构复杂性 | NA | 解析肠道病毒基因型网络的结构和动态,理解病毒种群如何适应选择性环境变化 | 肠道病毒种群 | 基因组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、病毒单倍型数据 | 数百个受感染的单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | SEARCHLIGHT(scRNA-seq-enabled acquisition of mRNA and consensus haplotypes linking individual genotypes and host transcriptomes) |
5028 | 2025-10-06 |
Expansion of learning capacity elicited by interspecific hybridization
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3409
PMID:38896617
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研究论文 | 本研究通过种间杂交培育F1杂交鸣禽,探索了物种特异性学习能力的神经遗传机制 | 首次发现杂交鸣禽具有扩展的学习能力,能模仿双亲物种及其他异种鸣叫,并揭示这与发声运动投射神经元的特异性转录特征相关 | 尽管发现神经回路大小和神经元数量保守,但具体分子机制仍需进一步验证 | 探索物种特异性鸣叫学习的神经遗传机制 | F1杂交鸣禽及其亲本物种 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | F1杂交鸣禽个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5029 | 2025-10-06 |
MOXD1 is a lineage-specific gene and a tumor suppressor in neuroblastoma
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1583
PMID:38905335
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研究论文 | 本研究通过分析神经母细胞瘤样本的RNA测序数据,发现MOXD1基因是神经母细胞瘤中的谱系特异性肿瘤抑制基因 | 首次将MOXD1鉴定为神经母细胞瘤中的谱系限制性肿瘤抑制基因,并揭示了其在肿瘤发展中的决定性作用 | 缺乏适当的早期肿瘤驱动事件研究模型 | 探索神经母细胞瘤的胚胎起源和早期肿瘤驱动事件 | 人类神经母细胞瘤样本、人类神经母细胞瘤细胞、胎儿肾上腺、斑马鱼、小鸡和小鼠模型 | 癌症生物学 | 神经母细胞瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 人类神经母细胞瘤样本和多种动物模型 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
5030 | 2025-10-06 |
Noninvasive assessment of the lung inflammation-fibrosis axis by targeted imaging of CMKLR1
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9817
PMID:38896611
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研究论文 | 本研究验证了CMKLR1作为肺部炎症-纤维化轴成像生物标志物的潜力 | 首次将CMKLR1确定为单核细胞源性巨噬细胞的瞬时标志物,并开发了CMKLR1靶向PET成像技术用于肺部炎症和纤维化的无创评估 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证仍需进一步开展 | 开发用于纤维化肺疾病风险分层和治疗监测的可靠生物标志物 | 特发性肺纤维化患者和小鼠肺纤维化模型 | 数字病理 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,正电子发射断层扫描 | NA | 基因表达数据,影像数据 | 特发性肺纤维化患者队列和博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5031 | 2025-10-06 |
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj9173
PMID:38905344
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研究论文 | 构建了跨物种三叉神经节和背根神经节的统一细胞图谱,促进不同物种和研究间的细胞类型比较 | 创建了首个涵盖6个物种、31个数据集的统一感觉神经节细胞图谱,改进了稀疏神经元亚型的注释 | 研究主要基于转录组数据,可能未完全捕捉蛋白质水平和功能特性的差异 | 比较不同物种感觉神经节的细胞类型多样性并建立统一注释标准 | 三叉神经节和背根神经节的感觉神经元和非神经元细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 6个物种、31个数据集 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
5032 | 2025-10-06 |
Integration mapping of cardiac fibroblast single-cell transcriptomes elucidates cellular principles of fibrosis in diverse pathologies
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8501
PMID:38905342
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据构建心脏纤维化的综合参考图谱 | 建立了首个全面的心脏纤维化单细胞转录组整合图谱,揭示了不同病理模型中成纤维细胞的相似性动态变化 | NA | 阐明不同病理条件下心脏纤维化的细胞学原理 | 心脏成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类健康及患病心脏样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
5033 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals segregation of tumor cell states in glioblastoma and marked immunosuppression within the perinecrotic niche
2024-04-22, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01769-0
PMID:38650010
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据,揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤细胞状态的空间分离模式以及坏死周围区域的免疫抑制特征 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术,系统揭示了胶质母细胞瘤中不同肿瘤细胞状态的空间分布规律及坏死周围区域的免疫抑制微环境 | 研究仅包含3例患者样本,样本量较小,可能限制结果的普适性 | 探究胶质母细胞瘤微环境中细胞类型和肿瘤细胞状态的空间分布特征 | 胶质母细胞瘤患者组织样本 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 3例胶质母细胞瘤患者 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序, 10x Visium空间转录组学平台 |
5034 | 2025-10-06 |
Development of a Nanoparticle-Based Tendon-Targeting Drug Delivery System to Pharmacologically Modulate Tendon Healing
2023-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.29.569204
PMID:38076889
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研究论文 | 开发了一种基于纳米颗粒的肌腱靶向药物递送系统,用于药理调节肌腱愈合 | 利用空间转录组学数据发现愈合肌腱中TRAP高表达区域,并首次将TRAP结合肽功能化纳米颗粒应用于肌腱靶向药物递送 | 研究仅针对急性肌腱损伤模型,未验证在慢性肌腱病变或其他类型软组织损伤中的效果 | 开发靶向肌腱的药物递送系统以改善肌腱愈合过程 | 肌腱愈合过程、TRAP表达、纳米颗粒药物递送系统 | 组织工程与再生医学 | 肌腱损伤 | 空间转录组学、纳米颗粒药物递送、功能评估 | NA | 基因表达数据、功能评估数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5035 | 2025-10-06 |
Solute carrier (SLC) expression reveals skeletogenic cell diversity
2023-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.08.004
PMID:37611888
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析海胆胚胎发育中转运蛋白表达模式,揭示细胞功能多样性 | 采用基于转运蛋白表达的细胞聚类策略,发现传统基因调控状态分类中被忽略的细胞功能亚群 | 研究仅针对紫球海胆特定发育阶段,结论在其他物种或发育阶段的普适性需进一步验证 | 探究胚胎发育过程中不同细胞类型转运蛋白表达模式的多样性 | 紫球海胆晚期原肠胚阶段的各类细胞,特别是中胚层细胞(色素细胞、胚腔细胞和骨骼形成细胞) | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞基因表达数据 | 紫球海胆晚期原肠胚阶段单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5036 | 2025-10-06 |
Discoveries in Retina Physiology and Disease Biology Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-10-19, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2810247
PMID:37919055
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综述 | 本文系统回顾单细胞RNA测序技术在视网膜生理和疾病生物学研究中的应用进展 | 系统梳理scRNA-seq技术在视网膜细胞亚型鉴定和疾病机制研究中的独特价值,提供对视网膜发育和疾病分子基础的新见解 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在视网膜生理功能和疾病生物学研究中的应用 | 视网膜神经元细胞和胶质细胞 | 数字病理 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5037 | 2025-10-06 |
Deep learning applications in single-cell genomics and transcriptomics data analysis
2023-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115077
PMID:37393865
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综述 | 本文系统回顾了深度学习在单细胞基因组学和转录组学数据分析中的应用 | 系统评估深度学习在单细胞多组学整合和空间转录组学等新兴领域的应用潜力 | 深度学习尚未彻底解决单细胞组学领域最紧迫的挑战,发展进程相对渐进 | 评估深度学习在单细胞组学研究中的优势与挑战 | 单细胞基因组学、转录组学、空间转录组学和多组学整合数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学整合 | 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
5038 | 2025-10-06 |
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2023-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.04.547740
PMID:37461736
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研究论文 | 构建了跨物种协调的背根神经节和三叉神经节细胞图谱,描述了6个物种18种神经元和11种非神经元细胞类型 | 创建了首个跨物种协调的背根神经节和三叉神经节细胞图谱,解决了不同研究和物种间细胞类型比较的难题 | 研究主要基于转录组数据,可能无法完全反映细胞功能的多样性 | 比较不同物种背根神经节和三叉神经节细胞类型的转录组特征 | 背根神经节和三叉神经节的神经元和非神经元细胞 | 单细胞转录组学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个物种、19项研究的细胞数据,包括新分析的人类和蝾螈背根神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5039 | 2025-10-06 |
Endoplasmic reticulum in oocytes: spatiotemporal distribution and function
2023-Jun, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02782-3
PMID:37171741
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综述 | 本文系统综述了内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能、结构、时空分布及其与其他细胞器的相互作用 | 结合单细胞RNA测序技术解析内质网机制,并将内质网功能与体外成熟临床问题相联系 | NA | 总结内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能和作用机制,为辅助生殖技术研究提供参考 | 哺乳动物卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5040 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Exploration of the Transcriptomic Landscape in Multiple Sclerosis: A Systematic Review
2023-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24021448
PMID:36674968
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综述 | 本文通过系统综述探讨多发性硬化症中的转录组学特征及其相关生物学过程 | 整合了近年来RNA测序技术在多发性硬化症研究中的应用,揭示了疾病不同阶段的特异性分子特征和非编码RNA的关键作用 | 作为综述文章,未进行原始数据分析,依赖于已有研究结果的整合 | 探索转录组学在多发性硬化症中的作用机制 | 多发性硬化症相关的转录组学研究 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |