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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5001 - 5020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5001 | 2025-10-06 |
RIDDEN: Data-driven inference of receptor activity from transcriptomic data
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013188
PMID:40522999
|
研究论文 | 开发了一种名为RIDDEN的计算工具，通过受体调控的基因表达谱预测受体活性 | 首个直接关注受体端活性的计算方法，使用受体调控基因表达谱而非配体-受体共表达来推断功能活性 | NA | 从转录组数据推断受体活性，促进细胞间通讯研究 | 229种不同受体的14463个扰动基因表达谱 | 生物信息学 | 癌症 | 转录组测序 | 数据驱动推断模型 | 转录组数据 | 14463个扰动基因表达谱 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5002 | 2025-10-06 |
Secreted Phosphoprotein 1 in Lung Diseases
2025-May-30, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15060365
PMID:40559389
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综述 | 本文综述了分泌磷蛋白1(SPP1)在多种肺部疾病中的作用机制和临床意义 | 系统总结了SPP1在间质性肺病等多种肺部疾病中的最新研究进展，特别关注了单细胞RNA测序技术带来的新发现 | 作为综述文章，主要基于现有文献分析，缺乏原始实验数据验证 | 探讨SPP1在肺部疾病发生发展中的作用机制和潜在治疗靶点价值 | 分泌磷蛋白1(SPP1)及其在肺部疾病中的表达和功能 | 病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5003 | 2025-10-06 |
Exploring the Role of Bifenthrin in Recurrent Implantation Failure and Pregnancy Loss Through Network Toxicology and Molecular Docking
2025-May-29, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics13060454
PMID:40559927
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研究论文 | 通过网络毒理学和分子对接研究联苯菊酯在复发性种植失败和复发性流产中的潜在作用机制 | 首次将网络毒理学与分子对接方法结合，系统研究联苯菊酯与生殖障碍疾病的关联，并构建基于枢纽基因的诊断模型 | 缺乏体内和体外实验证据验证，需要进一步研究阐明具体机制 | 探索联苯菊酯与复发性种植失败和复发性流产的潜在关联 | 联苯菊酯及其潜在靶点基因，复发性种植失败和复发性流产患者样本 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 网络毒理学，分子对接，RNA-seq分析，功能富集分析 | 诊断模型 | 基因表达数据，蛋白质结构数据 | 来自GEO数据库的bulk RNA-seq数据集和单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5004 | 2025-10-06 |
A retinoic acid:YAP1 signaling axis controls atrial lineage commitment
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115687
PMID:40343798
|
研究论文 | 本研究揭示了视黄酸与YAP1信号轴协同调控心脏祖细胞向心房谱系分化的机制 | 首次发现Hippo效应因子YAP1与视黄酸信号协同整合于心房转录因子增强子网络，调控心房谱系特化 | 研究主要基于体外hESC模型和小鼠胚胎，人类体内验证尚需进一步研究 | 探究视黄酸信号调控心房谱系特化的下游效应机制 | 人类胚胎干细胞来源的心脏祖细胞、小鼠胚胎、模式化心脏类器官 | 发育生物学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, snATAC-seq, 功能基因组学 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据 | 未处理与RA处理的人类胚胎干细胞来源CPCs | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 5005 | 2025-10-06 |
Integrative Spatial Proteomics and Single-Cell RNA Sequencing Unveil Molecular Complexity in Rheumatoid Arthritis for Novel Therapeutic Targeting
2025-May-22, Proteomes
IF:4.0Q2
DOI:10.3390/proteomes13020017
PMID:40559990
|
研究论文 | 通过整合空间蛋白质组学和单细胞RNA测序技术揭示类风湿关节炎滑膜分子复杂性 | 首次结合激光捕获显微切割蛋白质组学和单细胞RNA测序分析类风湿关节炎滑膜组织空间异质性 | 未明确说明样本规模和验证方法 | 解析类风湿关节炎滑膜组织分子机制并发现治疗靶点 | 类风湿关节炎患者滑膜组织及其健康对照 | 空间多组学 | 类风湿关节炎 | 激光捕获显微切割, 质谱蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 激光捕获显微切割结合质谱蛋白质组学 |
| 5006 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveal PI3K-AKT and metabolic alterations in aggressive, treatment-resistant lactotroph pituitary neuroendocrine tumors
2025-05-19, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02025-9
PMID:40390063
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示侵袭性、治疗抵抗性催乳素垂体神经内分泌肿瘤中PI3K-AKT通路和代谢改变 | 首次在DA抵抗性催乳素PitNET中应用空间转录组学技术揭示肿瘤内异质性，发现PI3K/AKT通路和脂质代谢改变 | 样本量较小（13例患者），未观察到从部分响应到完全无响应肿瘤的明确分化模式 | 解析催乳素垂体神经内分泌肿瘤的分子异质性，识别侵袭性和药物治疗抵抗的生物标志物 | 多巴胺激动剂抵抗性催乳素垂体神经内分泌肿瘤患者 | 空间转录组学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 空间转录组学, 全转录组测序, 全外显子组测序 | NA | 空间转录组数据, 测序数据 | 13例DA抵抗性催乳素PitNET患者 | 10x Genomics | 空间转录组学, bulk RNA-seq, WES | Visium | Visium Spatial Transcriptomics |
| 5007 | 2025-10-06 |
Temporal transcriptomic changes in the THY-Tau22 mouse model of tauopathy display cell type- and sex-specific differences
2025-05-07, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02013-z
PMID:40336141
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析THY-Tau22小鼠模型中不同细胞类型和性别的时序转录组变化 | 首次在tauopathy小鼠模型中系统揭示细胞类型特异性和性别特异性的年龄依赖性转录组变化 | 研究基于小鼠模型，人类验证数据有限 | 理解AD相关tauopathy中性别特异性和性别二态性转录组变化的细胞类型特异性和年龄依赖性 | THY-Tau22转基因小鼠和野生型小鼠的皮质组织 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17月龄和7月龄的雄性和雌性THY-Tau22及野生型小鼠皮质组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5008 | 2025-10-06 |
Oncogenic Ras, Yki and Notch signals converge to confer clone competitiveness through Upd2
2025-May-02, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.04.017
PMID:40320143
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学发现致癌信号Ras、Yki和Notch通过上调细胞因子Upd2共同赋予克隆细胞竞争优势 | 首次揭示Ras、Yki和Notch信号通路通过共同上调Upd2来克服细胞竞争压力，并证明Upd2是关键的细胞适应性因子 | 研究主要基于果蝇模型，在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 探究致癌信号如何通过共同机制赋予克隆细胞竞争优势 | 果蝇翅芽盘中的scribble突变克隆和肠道干细胞 | 单细胞转录组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 果蝇遗传学模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5009 | 2025-10-06 |
Microglial mechanisms drive amyloid-β clearance in immunized patients with Alzheimer's disease
2025-May, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03574-1
PMID:40050704
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学探索阿尔茨海默病患者中Aβ免疫治疗后的清除机制 | 首次通过空间转录组学结合单细胞RNA测序揭示不同免疫方法下小胶质细胞的区域特异性反应和TREM2/APOE上调机制 | 样本量有限，机制研究主要基于转录组数据，需要进一步功能验证 | 探究阿尔茨海默病Aβ免疫治疗中Aβ清除的分子机制 | 接受主动和被动Aβ免疫的阿尔茨海默病患者、未免疫患者及神经健康对照 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 免疫与非免疫AD患者及健康对照 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5010 | 2025-10-06 |
Unveiling a novel cancer hallmark by evaluation of neural infiltration in cancer
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf082
PMID:40052442
|
研究论文 | 通过评估肿瘤微环境中的神经浸润程度，揭示其作为癌症标志物的作用 | 提出癌症相关神经浸润评分(C-Neural评分)，首次系统评估神经浸润作为癌症标志物的重要性 | 研究基于回顾性数据分析，需要更多实验验证 | 探索神经浸润在肿瘤微环境中的作用及其作为癌症标志物的潜力 | 10种癌症类型的肿瘤样本 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 预测评分模型 | 基因表达数据 | 40个批量RNA-seq数据集和55个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5011 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics defines the cell-specific RNA landscape of equine dorsal root ganglia
2025-Feb-06, Veterinary pathology
IF:2.3Q1
DOI:10.1177/03009858241312623
PMID:39916473
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术绘制了马背根神经节细胞特异性RNA图谱 | 首次将人类细胞标记物成功应用于马背根神经节的空间转录组分析，并验证了其跨物种适用性 | 研究仅针对健康成年马匹，尚未应用于疾病状态 | 定义健康成年马背根神经节的空间转录组景观 | 马背根神经节组织 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 数字空间分析 | NA | 空间基因表达数据 | 健康成年马背根神经节样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiling | GeoMx数字空间分析平台 |
| 5012 | 2025-10-06 |
Integrating mitochondrial and lysosomal gene analysis for breast cancer prognosis using machine learning
2025-01-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86970-4
PMID:39865118
|
研究论文 | 本研究通过机器学习整合线粒体和溶酶体基因分析，开发乳腺癌预后预测模型 | 首次将线粒体和溶酶体共调控因子结合用于乳腺癌预后预测，并发现SHMT2关键基因的功能 | 研究样本量未明确说明，需要进一步临床验证 | 开发乳腺癌预后预测模型，为患者分层和个性化干预提供基础 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 差异分析、拷贝数变异、单核苷酸多态性、相关性分析、WGCNA、单变量Cox回归、单细胞RNA测序 | CoxBoost + Survivor-SVM | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5013 | 2025-10-06 |
Real-world effectiveness and safety of oral azvudine versus nirmatrelvir‒ritonavir (Paxlovid) in hospitalized patients with COVID-19: a multicenter, retrospective, cohort study
2025-Jan-17, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02126-w
PMID:39819859
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研究论文 | 比较阿兹夫定与奈玛特韦-利托那韦在COVID-19住院患者中的真实世界疗效和安全性 | 首次通过大规模多中心回顾性队列研究比较两种药物的临床效果，并发现阿兹夫定对肝癌患者具有额外抗肿瘤作用 | 回顾性研究设计存在潜在偏倚，未采用随机分组 | 评估阿兹夫定与Paxlovid在COVID-19住院患者中的疗效和安全性差异 | COVID-19住院患者，特别是合并恶性肿瘤的患者 | 临床医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，Kaplan-Meier分析，Cox回归模型 | Cox回归模型 | 临床数据，实验数据 | 40,876名住院患者（倾向评分匹配后3,606名） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5014 | 2025-10-06 |
Novel insights from comprehensive analysis: The role of cuproptosis and peripheral immune infiltration in Alzheimer's disease
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325799
PMID:40560886
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研究论文 | 通过综合分析铜死亡和免疫浸润在阿尔茨海默病中的作用，识别了五个关键特征基因 | 首次系统研究铜死亡相关基因在阿尔茨海默病外周免疫细胞中的作用机制 | 样本来源主要依赖公共数据库，实验验证仅限于部分基因的qPCR验证 | 探索铜死亡相关基因在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 阿尔茨海默病患者的外周血细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 基因表达分析，机器学习，单细胞RNA测序，实时定量PCR，分子对接 | 四种机器学习模型 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | GEO数据库中的阿尔茨海默病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5015 | 2025-10-06 |
Optimization of clustering parameters for single-cell RNA analysis using intrinsic goodness metrics
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1562410
PMID:40567596
|
研究论文 | 本研究利用内在质量指标优化单细胞RNA测序分析中的聚类参数 | 使用内在质量指标预测不同参数下聚类方法的准确性，并识别出可用于快速比较不同聚类参数配置的代理指标 | 仅使用了三个数据集和两种聚类方法，可能无法代表所有单细胞RNA测序数据的多样性 | 优化单细胞RNA测序分析中的聚类参数选择 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性混合回归模型, ElasticNet回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | 三个来自不同解剖区域的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5016 | 2025-10-06 |
Stemness-driven clusters in ovarian cancer: immune characteristics and prognostic implications
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1577283
PMID:40567611
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研究论文 | 本研究通过鉴定卵巢癌中的干细胞性相关亚型，建立了预后预测模型并发现AKAP12作为潜在治疗靶点 | 首次在卵巢癌中定义了三种干细胞性相关分子亚型，发现成纤维细胞在维持肿瘤干细胞特性中的关键作用，并鉴定AKAP12为新的干细胞性相关生物标志物 | 研究主要基于细胞系和有限临床样本，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索卵巢癌中干细胞性相关亚型的特征及其治疗意义 | 卵巢癌患者、SKOV3细胞系、临床样本和卵巢癌类器官 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 转录组测序、单细胞RNA测序、免疫组织化学、功能验证实验 | WGCNA、LASSO回归、列线图 | 基因表达数据、单细胞数据、临床数据 | 卵巢癌患者队列和细胞系模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5017 | 2025-10-06 |
Hemoglobin-associated CALR in proximal tubule cells can be used as a biomarker for idiopathic membranous nephropathy
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1574852
PMID:40568201
|
研究论文 | 本研究通过尿液细胞RNA测序发现CALR基因可作为特发性膜性肾病的潜在生物标志物 | 首次发现血红蛋白相关CALR在近端肾小管细胞中的表达与IMN相关，并验证其作为诊断生物标志物的潜力 | 样本来源仅限于尿液和肾脏组织，需要更大规模研究验证临床适用性 | 识别特发性膜性肾病的尿液生物标志物并探究其疾病机制 | 特发性膜性肾病患者的尿液细胞和肾脏组织 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 实时定量PCR | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 5018 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis untangles the crosstalk between intratumor microbiome, lactic acid metabolism and immune status in lung squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1603822
PMID:40568577
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示肺鳞状细胞癌中瘤内微生物组、乳酸代谢与免疫状态之间的相互作用关系 | 首次系统整合批量与单细胞转录组、基因组、瘤内微生物组和数字病理数据，建立了基于乳酸代谢模式的肺鳞癌分型系统，并开发了基于病理图像的深度学习预测模型 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证发现的机制通路 | 探索肺鳞状细胞癌中乳酸代谢模式与肿瘤生物学特征及免疫状态的关联 | 肺鳞状细胞癌患者的多组学数据 | 数字病理 | 肺癌 | 多组学分析, 单细胞转录组测序, 数字病理 | 深度学习, 机器学习 | 转录组数据, 基因组数据, 微生物组数据, 病理图像 | 多个数据集（具体样本数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 数字病理分析 | NA | NA |
| 5019 | 2025-10-06 |
Dual function of Gasdermin E: pyroptosis-mediated pan-cancer suppression versus HCC-specific oncogenic activity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1626311
PMID:40568597
|
研究论文 | 本文探讨了Gasdermin E在肿瘤发生中的双重功能：通过焦亡介导的泛癌抑制作用与肝细胞癌特异性致癌活性 | 揭示了GSDME在肝细胞癌中异常过表达并通过非焦亡机制促进免疫抑制的独特现象 | 当前研究面临三大挑战：阐明HCC中GSDME过表达机制、明确非焦亡促癌途径分子枢纽、开发控制GSDME功能转换的精准策略 | 解析GSDME在肿瘤发生中的双重功能及其治疗潜力 | Gasdermin E蛋白及其在多种癌症中的表达和功能 | 癌症生物学 | 肝细胞癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌 | 表观遗传学分析、免疫细胞浸润分析 | NA | 分子生物学数据、表达谱数据 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 5020 | 2025-10-06 |
Spatial Proteomics towards cellular Resolution
2024-Dec-25, Expert review of proteomics
IF:3.8Q1
DOI:10.1080/14789450.2024.2445809
PMID:39710940
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综述 | 本文概述了基于非靶向质谱的空间蛋白质组学工作流程及其向细胞分辨率发展的最新进展 | 强调空间蛋白质组学向细胞分辨率发展的技术突破，包括组织解剖、样品处理、生物信息学和液相色谱-质谱技术的进步 | 需要进一步发展数据分析和开发细胞或亚细胞水平的自动化智能组织解剖技术 | 推动空间蛋白质组学向细胞分辨率发展，深化对组织微环境空间组织的理解 | 组织微环境中的蛋白质空间分布 | 空间生物学 | NA | 非靶向质谱、液相色谱-质谱联用 | NA | 蛋白质组数据 | NA | NA | 空间蛋白质组学 | NA | 基于质谱的空间蛋白质组学工作流程 |