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当前共找到 40234 篇文献，本页显示第 5001 - 5020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5001 | 2026-04-08 |
Single-cell RNA-seq integrated with multi-omics reveals SERPINE2 as a target for metastasis in advanced renal cell carcinoma
2023-01-16, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05566-w
PMID:36646679
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序与多组学数据，揭示了SERPINE2作为晚期肾细胞癌转移的潜在治疗靶点 | 首次在晚期肾细胞癌中整合单细胞转录组、Hi-C、ATAC-seq和RNA-seq多组学数据，系统解析了恶性细胞与肿瘤微环境的相互作用，并鉴定出SERPINE2作为关键转移驱动因子 | 样本量相对有限（8例患者组织样本），主要基于细胞系验证，需要在更大规模临床队列中进一步验证 | 揭示晚期肾细胞癌进展中基因组、转录组和表观遗传改变的机制，并寻找转移治疗靶点 | 肾细胞癌患者组织样本、Caki-1肾癌细胞系、HK-2人肾小管上皮细胞系 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, Hi-C, ATAC-seq, RNA测序, 微阵列, 组织芯片 | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 三维基因组数据, 批量转录组数据 | 8例RCC患者组织样本（含2对原发-转移匹配样本）, 407例RCC患者微阵列数据, 两个组织芯片队列（TMA-30和TMA-2020） | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, RNA-seq | NA | NA |
| 5002 | 2026-04-08 |
Elevated pentose phosphate pathway flux supports appendage regeneration
2022-10-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111552
PMID:36288713
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研究论文 | 本文通过多模态方法研究了非洲爪蟾附肢再生过程中的代谢重编程，发现再生组织通过增强戊糖磷酸途径（PPP）通量来支持细胞增殖和再生 | 揭示了再生过程中葡萄糖代谢从糖酵解转向戊糖磷酸途径（PPP）的关键代谢重编程机制，并利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）证实了高增殖细胞中PPP酶转录上调 | 研究主要基于非洲爪蟾模型，结果在哺乳动物或人类中的普适性尚需验证，且未深入探讨PPP调控的具体分子机制 | 探究再生过程中支持快速组织生长的代谢途径 | 非洲爪蟾（Xenopus tropicalis）的附肢再生组织 | 代谢组学与再生生物学 | NA | 液相色谱-质谱联用（LC-MS）代谢物分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 代谢物数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5003 | 2026-04-08 |
Uphyloplot2: visualizing phylogenetic trees from single-cell RNA-seq data
2021-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07739-3
PMID:34090344
|
研究论文 | 本文介绍了Uphyloplot2，一个用于从单细胞RNA-seq数据推断的CNV信息生成系统发育图的Python脚本工具 | 开发了一个自动化工具，直接从RNA-seq推断数据或Newick格式的树文件生成系统发育图，简化了肿瘤克隆性可视化的流程 | 工具依赖于外部CNV推断工具（如inferCNV、CaSpER、HoneyBADGER）的准确性，且未在多种肿瘤类型或大规模数据集上进行广泛验证 | 开发一个可视化工具，用于从单细胞RNA-seq数据中推断的染色体拷贝数变异（CNV）信息生成系统发育图，以展示肿瘤克隆性 | 单细胞RNA-seq数据推断的CNV信息或Newick格式的树文件 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA-seq（scRNA-seq）、染色体拷贝数变异（CNV）推断 | NA | 基因表达数据、CNV推断数据、树文件 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5004 | 2026-04-08 |
Genetic pathways regulating hematopoietic lineage speciation: Factorial latent variable model analysis of single cell transcriptome
2021-Jun, Data in brief
IF:1.0Q3
DOI:10.1016/j.dib.2021.107080
PMID:34026977
|
研究论文 | 本研究应用因子单细胞潜变量模型分析小鼠造血干细胞和祖细胞的单细胞转录组数据，以解析造血谱系分化的遗传调控通路 | 首次采用因子单细胞潜变量模型分解单细胞转录组异质性为可解释的生物学因子，动态揭示细胞命运调控机制 | 研究仅基于12周龄雌性小鼠的造血干细胞和祖细胞数据，样本来源和年龄性别范围有限 | 解析稳态造血过程中调控细胞谱系分化的遗传通路 | 小鼠造血干细胞和祖细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子单细胞潜变量模型 | 单细胞转录组测序数据 | 1,920个造血干细胞和祖细胞，来自12周龄雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5005 | 2026-04-08 |
Single cell RNA-seq analysis of the flexor digitorum brevis mouse myofibers
2021-05-17, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-021-00269-2
PMID:34001262
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种通过流式分选分离完整骨骼肌肌纤维进行单细胞RNA测序的方法，以分析小鼠快肌纤维的基因表达模式 | 首次应用全细胞流式分选方法对单一肌肉类型（小鼠快肌屈趾短肌）进行单细胞RNA测序，而非基于单核RNA，扩展了纤维类型特异性基因的已知库 | 在763个肌纤维中，仅有171个细胞达到质量控制最优标准，样本利用率较低，可能影响统计效力 | 探索全细胞流式分选方法在单一肌肉类型单细胞RNA测序中的应用，以生成深度表达谱并识别纤维类型特异性基因 | 小鼠快肌屈趾短肌的完整和碎片化骨骼肌肌纤维 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式分选 | NA | RNA测序数据 | 763个完整和碎片化肌纤维，其中171个通过质量控制 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5006 | 2026-04-08 |
Ribonucleotide reductase small subunit M2 is a master driver of aggressive prostate cancer
2020-08, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12706
PMID:32385899
|
研究论文 | 本文探讨了核糖核苷酸还原酶小亚基M2（RRM2）在驱动侵袭性前列腺癌亚型中的作用及其与免疫抑制微环境的关联 | 首次将RRM2特征与PCS和PAM50分子分类系统整合，识别出侵袭性前列腺癌亚型，并揭示了RRM2在免疫逃逸和恩杂鲁胺耐药中的新作用 | 研究主要基于已发表的队列数据，缺乏前瞻性临床验证，且单细胞RNA-seq数据集样本来源有限 | 确定RRM2特征是否能用于识别侵袭性前列腺癌亚型，并评估其临床意义 | 前列腺癌细胞及来自六个已发表队列的4000例前列腺癌病例 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因本体和通路分析, CIBERSORT分析 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | 六个已发表队列共4000例前列腺癌病例 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5007 | 2026-04-08 |
Selective LXR agonist DMHCA corrects retinal and bone marrow dysfunction in type 2 diabetes
2020-07-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.137230
PMID:32641586
|
研究论文 | 本研究探讨了选择性LXR激动剂DMHCA在2型糖尿病小鼠模型和人类循环血管生成细胞中纠正视网膜和骨髓功能障碍的作用及分子机制 | 首次采用单细胞RNA测序技术分析糖尿病小鼠造血干细胞，揭示了DMHCA通过减少髓系分化、增加循环血管生成细胞和红细胞祖细胞来纠正糖尿病造血干细胞功能障碍的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，尚未在人体临床试验中验证DMHCA的疗效和安全性 | 探究DMHCA对2型糖尿病引起的视网膜和骨髓病理改变的改善作用及其分子机制 | 2型糖尿病（db/db）小鼠、人类循环血管生成细胞（CACs）、小鼠造血干细胞（HSCs） | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用糖尿病小鼠和人类CACs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5008 | 2026-04-07 |
Mapping cellular heterogeneity and dynamic interactions in pancreatic cancer
2026-May-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114757
PMID:41780688
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在胰腺导管腺癌（PDAC）中用于解析肿瘤内异质性、微环境成分及动态细胞相互作用的应用 | 系统总结了scRNA-seq在PDAC研究中的工作流程、数据分析方法及其在识别细胞亚群转化、生物标志物和治疗靶点方面的创新应用 | 作为综述文章，未进行原始实验研究，主要依赖现有文献总结，可能未涵盖所有最新技术进展 | 探讨scRNA-seq技术如何帮助理解PDAC的肿瘤内异质性、微环境动态及潜在治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤细胞、微环境成分（如免疫细胞、癌症相关成纤维细胞）及相关生物标志物 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5009 | 2026-04-07 |
The immune-metabolism interactome in efferocytosis: a new paradigm for the central nervous system diseases revealed by single-cell sequencing analysis
2026-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70031
PMID:41693397
|
综述 | 本文综述了胞葬作用在维持中枢神经系统稳态中的基本过程、免疫-代谢交互作用及其调控，并基于单细胞测序分析探讨了其在多种中枢神经系统疾病中的关键作用 | 提出了免疫-代谢相互作用组在胞葬作用中的新范式，并利用单细胞测序分析揭示了小胶质细胞在胞葬过程中的异质性 | NA | 总结胞葬作用在中枢神经系统发育、衰老及疾病中的作用，并探讨其潜在治疗策略 | 小胶质细胞、中枢神经系统疾病（如脑缺血、脑出血、创伤性脑损伤、重度抑郁症、多形性胶质母细胞瘤、阿尔茨海默病、帕金森病等） | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5010 | 2026-04-07 |
Xenium-based spatial transcriptomic analyses uncover prognosis-associated heterogeneity in the tumor microenvironment (TME) of angioimmunoblastic T-cell lymphoma (AITL)
2026-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70035
PMID:41711078
|
研究论文 | 本研究利用Xenium空间转录组学技术，比较了难治/复发性和治疗敏感的血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤样本，揭示了肿瘤微环境的异质性并鉴定出与预后相关的新型Tfh细胞亚群 | 首次在AITL中鉴定出具有干细胞样特征的NEIL3+ Tfh细胞亚群，并系统描绘了难治/复发与治疗敏感病例间肿瘤微环境免疫细胞组成的空间分布差异 | 样本量较小（10例临床样本），且为观察性研究，需要更大规模队列和功能实验验证 | 解析血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤肿瘤微环境的异质性及其与治疗抵抗的关联 | 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤患者的临床组织样本 | 空间转录组学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 10例临床样本（包括难治/复发和治疗敏感病例） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组分析平台 |
| 5011 | 2026-04-07 |
Intervention of Rutin and Ochnaflavone in the Attenuation of Neuroinflammation and Neuronal Apoptosis in Spinal Cord Injury
2026-Apr, Global spine journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1177/21925682251383489
PMID:41001708
|
研究论文 | 本研究探讨了芦丁和欧查黄酮在脊髓损伤中通过调节小胶质细胞和PI3K/AKT及NF-κB信号通路减轻神经炎症和神经元凋亡的神经保护机制 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学方法，揭示了芦丁和欧查黄酮协同抑制小胶质细胞激活及下游信号通路的分子机制，为脊髓损伤提供了一种新的联合治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床中进行验证，且具体剂量和长期安全性需进一步评估 | 阐明芦丁和欧查黄酮在脊髓损伤中的神经保护作用机制，特别是对次级损伤过程的调控 | 脊髓损伤小鼠模型、LPS刺激的BV2小胶质细胞、小胶质细胞-神经元共培养系统 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序、网络药理学、Western blotting、免疫荧光、ELISA | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5012 | 2026-04-07 |
A universal and cost-efficient sample labeling approach for multiplexed single-cell RNA-seq based on recombinant HUH-endonuclease-agglutinin tagging
2026-Apr, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.10.004
PMID:41167558
|
研究论文 | 本文提出了一种基于重组HUH-核酸内切酶-凝集素标记（HEATag）的通用且成本效益高的样本标记方法，用于多重单细胞RNA测序 | 结合鸭圆环病毒HUH核酸内切酶（DCV）和小麦胚芽凝集素（WGA），开发了一种新型通用细胞膜标记方法，实现了快速、序列特异性的索引单链DNA标记，且适用于新鲜或固定细胞及多种物种 | NA | 解决单细胞转录组学中多重样本标记方法成本高或操作复杂的问题，以降低单细胞测序的每样本成本 | 细胞膜（适用于新鲜或固定细胞及多种物种） | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 兼容商业平台和定制系统，可适配多种单细胞组学工作流程 |
| 5013 | 2026-04-07 |
Endogenous oestrogens as neuroprotective modulators in the human retina: Evidence from transcriptomic profiling and aromatase inhibition
2026-Apr, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70171
PMID:41877439
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析和小鼠视网膜外植体实验，探讨了内源性雌激素在人视网膜中的神经保护作用及其细胞类型特异性表达 | 首次在单细胞水平上系统描绘了人视网膜中类固醇激素代谢和雌激素信号通路基因的表达图谱，并利用芳香化酶抑制剂验证了局部雌激素合成对光感受器维持和免疫调节的功能相关性 | 研究主要基于小鼠视网膜外植体模型，可能无法完全模拟人视网膜的生理环境；且实验仅使用单一浓度（20 μM）的来曲唑进行抑制，缺乏剂量依赖性验证 | 探究内源性雌激素在人视网膜中的神经保护作用及其细胞类型特异性功能 | 人视网膜单细胞RNA测序数据和小鼠视网膜外植体 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 基于公开数据集E-MTAB-7316，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5014 | 2026-04-07 |
Pathogenic GM-CSF drives functional diversification of inflammatory macrophages in autoimmune arthritis
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec0986
PMID:41880492
|
研究论文 | 本研究探讨了在自身免疫性关节炎中，致病性GM-CSF如何驱动炎症性巨噬细胞的功能多样化，从而加剧关节炎症和疼痛 | 揭示了GM-CSF在促进关节浸润单核细胞分化为功能不同的巨噬细胞亚群中的关键作用，并识别了两个GM-CSF依赖的致病性滑膜巨噬细胞亚群 | 研究基于T辅助17细胞介导的自身免疫性关节炎模型，可能不适用于所有类型的关节炎，且单细胞RNA测序的样本量有限 | 阐明自身免疫性关节炎中巨噬细胞发育和功能多样化的机制 | 关节浸润的Ly6C单核细胞和滑膜巨噬细胞 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5015 | 2026-04-07 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于热力学的可编程核酸扩增方法，通过机器学习优化，提高了扩增效率的调控精度，应用于DNA数据存储和临床诊断 | 通过引物标签补偿策略解耦序列特异性和杂交能量调控，实现了连续精确的扩增效率调制，并利用机器学习模型显著提升预测准确性 | 未明确说明方法在单细胞测序和空间转录组学中的具体应用验证，临床验证仅基于模拟测序深度 | 开发可编程核酸扩增技术，用于分子诊断和DNA数据存储 | 核酸扩增过程、DNA数据存储系统、宫颈癌RNA变异 | 机器学习 | 宫颈癌 | 核酸扩增、机器学习建模 | 机器学习模型 | 实验数据 | 2483个实验数据点 | NA | NA | NA | NA |
| 5016 | 2026-03-28 |
Correction: Single-cell RNA-seq integrated with multi-omics reveals SERPINE2 as a target for metastasis in advanced renal cell carcinoma
2026-Mar-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08472-z
PMID:41876448
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5017 | 2026-04-07 |
SR2P: an efficient stacking method to predict protein abundance from gene expression in spatial transcriptomics data
2026-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.04.709692
PMID:41846960
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SR2P的堆叠机器学习框架，用于从空间转录组学数据中的基因表达预测蛋白质丰度 | SR2P通过集成11种互补的预测模型，在多个空间多组学基准测试中持续优于现有方法，首次实现了从仅含RNA的空间数据中推断蛋白质丰度 | 技术仍受限于仅基于RNA表达进行预测，可能无法完全捕捉蛋白质-RNA丰度不一致性，且依赖于现有空间多组学数据进行训练 | 开发一种高效方法，从空间转录组学数据中的基因表达预测蛋白质丰度，以增强对肿瘤微环境中免疫细胞状态的分析能力 | 空间转录组学数据，特别是头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | 空间转录组学，空间多组学分析 | 堆叠机器学习框架，集成11种预测模型 | 基因表达数据，蛋白质丰度数据 | NA | NA | 空间转录组学，空间多组学 | NA | NA |
| 5018 | 2026-04-07 |
Ovarian hormone deficiency enhances wood smoke-induced immune dysfunction via transcriptomic and metabolic alterations
2026-Mar-02, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfag023
PMID:41879291
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研究论文 | 本研究探讨卵巢激素缺乏如何通过转录组和代谢改变加剧木烟暴露引起的免疫功能障碍 | 首次在单细胞水平揭示卵巢激素缺乏与木烟暴露协同作用导致骨髓免疫细胞转录程序和代谢重编程的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证；单细胞分析仅聚焦卵巢切除背景 | 识别木烟暴露免疫毒性的易感因素，特别是卵巢激素缺乏的作用 | 卵巢切除小鼠的骨髓免疫细胞和骨髓来源巨噬细胞 | 单细胞组学 | 免疫功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 卵巢切除和假手术小鼠的骨髓细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5019 | 2026-04-07 |
Unraveling the carcinogenic mechanisms of benzo[a]pyrene in prostate cancer: a multi-omics approach
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04842-0
PMID:41288678
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、单细胞转录组学、分子对接、孟德尔随机化等多种方法，揭示了苯并[a]芘在前列腺癌中的致癌机制 | 首次采用多组学方法系统研究苯并[a]芘在前列腺癌中的具体作用机制，并识别出TP53等关键基因的诊断和因果相关性 | 研究主要基于生物信息学分析和已有数据，缺乏实验验证，且样本来源和具体技术细节未明确说明 | 阐明苯并[a]芘在前列腺癌中的致病机制 | 苯并[a]芘靶点基因与前列腺癌相关基因 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 网络毒理学、单细胞转录组学、差异基因表达分析、分子对接、孟德尔随机化、文献计量学 | NA | 基因表达数据、文献数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 5020 | 2026-04-07 |
Unraveling the ferroptosis landscape in intervertebral disc degeneration through integrated bioinformatics and single-cell sequencing
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04826-0
PMID:41288682
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和单细胞RNA测序分析，系统揭示了铁死亡在椎间盘退变中的关键基因网络和细胞分布，并探索了白藜芦醇作为潜在治疗药物的可能性 | 首次在椎间盘退变中整合转录组和单细胞RNA测序数据，系统识别了铁死亡相关的核心枢纽基因网络，并揭示了这些基因在12种主要细胞亚群中的异质性表达模式，同时通过药物预测和体外实验验证了白藜芦醇的治疗潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证；单细胞测序样本量未明确说明；药物作用机制仍需进一步深入探究 | 阐明铁死亡在椎间盘退变发病机制中的作用，并探索潜在的治疗干预策略 | 椎间盘退变患者样本、髓核细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序、转录组分析、生物信息学分析、分子对接、CCK-8检测、RT-qPCR | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |