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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4981 | 2025-10-06 |
Ectopic expression of GDF15 in cancer-associated fibroblasts enhances melanoma immunosuppression via the GFRAL/RET cascade
2025-Jun-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011036
PMID:40555562
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过异位表达GDF15促进黑色素瘤免疫抑制微环境形成的分子机制 | 首次发现CAFs通过GDF15/GFRAL/RET信号级联诱导巨噬细胞M2极化和肿瘤干细胞性增强 | NA | 阐明CAFs在黑色素瘤免疫微环境中的关键作用机制 | 黑色素瘤、癌症相关成纤维细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子动力学模拟,免疫共沉淀,染色质免疫沉淀,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
4982 | 2025-10-06 |
A novel mesothelioma molecular classification based on malignant cell differentiation
2025-Jun-24, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03816-9
PMID:40555979
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研究论文 | 基于恶性细胞分化状态开发了一种新的间皮瘤分子分型系统和预后预测模型 | 首次基于肿瘤细胞分化状态对间皮瘤进行分子分型,识别了8种恶性细胞亚型和3种临床相关亚型 | 研究基于公共数据库数据,需要更多临床样本验证 | 建立间皮瘤的分子分型系统和预后预测模型 | 间皮瘤肿瘤细胞 | 生物信息学 | 间皮瘤 | 单细胞RNA测序,多组学分析,调控网络构建 | 降维分析,聚类分析,预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的间皮瘤单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4983 | 2025-10-06 |
Molecular and genetic characterization of sex-linked orange coat color in the domestic cat
2025-Jun-23, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2025.04.055
PMID:40378841
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研究论文 | 本研究揭示了家猫性连锁橙色被毛颜色的分子遗传机制 | 首次发现性连锁橙色突变由5-kb缺失引起,导致Arhgap36基因在黑色素细胞中异位表达,并证实其通过抑制PKA催化亚基影响毛色形成 | 研究主要基于胎儿猫皮肤样本,成年猫中的机制可能需要进一步验证 | 解析家猫性连锁橙色被毛颜色的遗传和分子机制 | 家猫(特别是玳瑁猫和三花猫)的毛色形成机制 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胎儿猫皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4984 | 2025-10-06 |
Preclinical and first-in-human of purinostat mesylate, a novel selective HDAC I/IIb inhibitor, in relapsed/refractory multiple myeloma and lymphoma
2025-Jun-23, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02285-w
PMID:40562746
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研究论文 | 评估新型选择性HDAC I/IIb抑制剂嘌呤司他甲磺酸盐在复发/难治性多发性骨髓瘤和淋巴瘤中的临床前研究及首次人体试验 | 开发了高选择性HDAC I/IIb抑制剂,相比泛HDAC抑制剂具有更优的抗肿瘤活性和独特的免疫调节机制 | 样本量较小(N=29),需要更大规模的临床试验验证疗效 | 评估嘌呤司他甲磺酸盐在血液恶性肿瘤中的安全性和有效性 | 复发/难治性多发性骨髓瘤和淋巴瘤患者 | 肿瘤学 | 多发性骨髓瘤, 淋巴瘤 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 临床数据 | 29例患者(11例MM, 18例淋巴瘤) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4985 | 2025-10-06 |
High glucose burden disrupts the glucose responsiveness of human pancreatic beta cells encapsulated in alginate fibers during Long-Term culture
2025-Jun-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149639
PMID:40544971
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研究论文 | 本研究通过藻酸盐封装技术长期培养人胰岛细胞,揭示了高葡萄糖负荷破坏β细胞葡萄糖响应性的分子机制 | 首次利用藻酸盐封装技术实现人胰岛细胞长期功能维持,并通过多组学分析鉴定出导致β细胞功能障碍的关键基因 | 研究仅使用两个批次的样本,样本量有限;体外培养模型可能无法完全模拟体内环境 | 探究高葡萄糖负荷下人胰腺β细胞功能障碍的分子机制 | 藻酸盐封装的人胰岛细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个不同批次的培养样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
4986 | 2025-10-06 |
Distinct transcriptomic signatures in pulmonary tissue resident and vascular resident-like T cells in nonhuman primates
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112745
PMID:40546965
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究非人灵长类动物肺组织中血管相关T细胞与间质T细胞的转录组特征差异 | 首次在非人灵长类动物中通过血管内染色技术区分肺血管相关T细胞与间质T细胞,发现血管相关T细胞是具有独特功能的'驻留样'细胞群 | 研究样本仅限于非人灵长类动物,人类中的适用性需要进一步验证 | 探索肺组织中不同空间定位T细胞的转录组特征和免疫功能 | 恒河猴肺组织中的血管相关(ivs+)和间质(ivs-)CD8 T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,血管内染色 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 恒河猴肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4987 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics in Thyroid Cancer: Applications, Limitations, and Future Perspectives
2025-Jun-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14120936
PMID:40558562
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综述 | 本文综述了空间转录组学在甲状腺癌研究中的应用、局限性与未来展望 | 系统整合了空间转录组学在解析甲状腺癌空间异质性方面的最新应用进展 | 存在分辨率低、测序深度不足、样本质量要求高和数据处理复杂等技术局限 | 探讨空间转录组学在甲状腺癌研究中的潜力与挑战 | 甲状腺癌肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 甲状腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
4988 | 2025-10-06 |
Muscle Spatial Transcriptomic Reveals Heterogeneous Profiles in Juvenile Dermatomyositis and Persistence of Abnormal Signature After Remission
2025-Jun-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14120939
PMID:40558566
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了幼年皮肌炎患者肌肉组织的分子特征空间异质性及其在缓解期后的持续存在 | 首次在JDM肌肉中发现ANKRD1和FSLT1等新相关基因,并揭示病理特征在临床缓解后仍持续存在 | 样本量较小,仅为初步研究 | 研究幼年皮肌炎患者治疗前后肌肉分子特征的空间异质性 | 幼年皮肌炎患者肌肉活检组织 | 空间转录组学 | 幼年皮肌炎 | 空间转录组学,标准化形态计量学 | 无监督参考解卷积 | 空间转录组数据 | 4例JDM肌肉活检(来自不同患者,包含治疗前后对比) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
4989 | 2025-10-06 |
A single-cell plume transcriptome atlas of the cold-seep tubeworm Paraescarpia echinospica
2025-Jun-17, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05392-z
PMID:40527908
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研究论文 | 本研究构建了深海管虫Paraescarpia echinospica羽状物的单细胞转录组图谱 | 首次对深海管虫羽状物进行单细胞分辨率分析,鉴定出六种细胞类型并表征免疫和转运相关基因 | NA | 解析深海管虫羽状物的细胞组成和功能特征 | Paraescarpia echinospica管虫的羽状物组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4990 | 2025-10-06 |
Patterning Defects in Mice with Defective Ventricular Wall Maturation and Cardiomyopathy
2025-Jun-12, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd12060224
PMID:40558659
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研究论文 | 本研究通过比较小鼠和人类胎儿心室发育过程中的基因表达模式,揭示了心室壁成熟缺陷与心肌病的关系 | 首次在小鼠LVNC模型中系统分析心室区域特异性基因表达模式的变化 | 研究仅基于小鼠模型,与人类心脏发育存在物种差异 | 探究心室壁成熟过程中基因表达的空间调控机制及其在心肌病发病中的作用 | 小鼠心室发育过程及左心室非致密化心肌病模型 | 发育生物学 | 心肌病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,原位杂交 | NA | 基因表达数据,空间表达模式 | 正常和LVNC模型小鼠心室组织 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
4991 | 2025-10-06 |
NOTCH3 Drives Fatty Acid Oxidation and Ferroptosis Resistance in Aggressive Meningiomas
2025-Jun-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6779386/v1
PMID:40502769
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研究论文 | 本研究揭示了NOTCH3通过驱动脂肪酸氧化代谢重编程赋予侵袭性脑膜瘤细胞铁死亡抵抗性的新机制 | 首次发现NOTCH3在脑膜瘤中调控脂肪酸氧化代谢并介导铁死亡抵抗,建立了NOTCH3信号与脂质代谢重编程的直接联系 | 研究主要基于细胞系模型,需要更多体内实验验证;样本量相对有限 | 探究NOTCH3在侵袭性脑膜瘤中的代谢调控机制及其对铁死亡敏感性的影响 | 人类脑膜瘤细胞系(CH157-MN)和患者来源的原代脑膜瘤细胞 | 癌症代谢研究 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学, 脂质组学, 批量RNA测序, 功能性代谢分析 | 细胞系模型 | 基因表达数据, 代谢物数据, 脂质数据 | 未明确具体样本数量,包括细胞系和患者来源细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 代谢组学, 脂质组学 | NA | NA |
4992 | 2025-10-06 |
Novel mouse model reveals neurodevelopmental origin of PMM2-CDG brain pathology
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.01.657261
PMID:40501776
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研究论文 | 本研究通过构建新型小鼠模型揭示了PMM2-CDG脑部病理的神经发育起源 | 开发了能够模拟患者复合杂合致病变异的条件性基因敲除小鼠模型,克服了全身敲除导致的胚胎致死问题 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证样本有限 | 探究PMM2-CDG脑部病理的发育机制和分子基础 | PMM2-CDG疾病模型小鼠和患者尸检小脑组织 | 神经科学 | 先天性糖基化障碍 | 多组学分析,包括代谢组学、糖组学、单细胞转录组学、蛋白质组学和糖蛋白组学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 多组学数据、行为学数据、组织学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
4993 | 2025-10-06 |
Blocking ITGA5 potentiates the efficacy of anti-PD-1 therapy on glioblastoma by remodeling tumor-associated macrophages
2025-Jun, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70016
PMID:40084746
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研究论文 | 本研究通过阻断ITGA5增强抗PD-1疗法对胶质母细胞瘤的疗效,并揭示其通过重塑肿瘤相关巨噬细胞的机制 | 发现circSDHAF2通过N-糖基化稳定ITGA5蛋白,促进间质型胶质母细胞瘤细胞形成和SPP1+髓源性巨噬细胞分化,首次阐明ITGA5阻断可增强抗PD-1疗法疗效 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 解析胶质母细胞瘤对抗PD-1疗法耐药的分子机制,开发联合治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者组织样本、肿瘤微环境中的细胞亚群 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫共沉淀、RNA免疫沉淀、pull-down实验 | NA | 单细胞测序数据、空间转录组数据、体外和体内实验数据 | 接受抗PD-1治疗的胶质母细胞瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
4994 | 2025-10-06 |
RIDDEN: Data-driven inference of receptor activity from transcriptomic data
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013188
PMID:40522999
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研究论文 | 开发了一种名为RIDDEN的计算工具,通过受体调控的基因表达谱预测受体活性 | 首个直接关注受体端活性的计算方法,使用受体调控基因表达谱而非配体-受体共表达来推断功能活性 | NA | 从转录组数据推断受体活性,促进细胞间通讯研究 | 229种不同受体的14463个扰动基因表达谱 | 生物信息学 | 癌症 | 转录组测序 | 数据驱动推断模型 | 转录组数据 | 14463个扰动基因表达谱 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
4995 | 2025-10-06 |
Secreted Phosphoprotein 1 in Lung Diseases
2025-May-30, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15060365
PMID:40559389
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综述 | 本文综述了分泌磷蛋白1(SPP1)在多种肺部疾病中的作用机制和临床意义 | 系统总结了SPP1在间质性肺病等多种肺部疾病中的最新研究进展,特别关注了单细胞RNA测序技术带来的新发现 | 作为综述文章,主要基于现有文献分析,缺乏原始实验数据验证 | 探讨SPP1在肺部疾病发生发展中的作用机制和潜在治疗靶点价值 | 分泌磷蛋白1(SPP1)及其在肺部疾病中的表达和功能 | 病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4996 | 2025-10-06 |
Exploring the Role of Bifenthrin in Recurrent Implantation Failure and Pregnancy Loss Through Network Toxicology and Molecular Docking
2025-May-29, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics13060454
PMID:40559927
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研究论文 | 通过网络毒理学和分子对接研究联苯菊酯在复发性种植失败和复发性流产中的潜在作用机制 | 首次将网络毒理学与分子对接方法结合,系统研究联苯菊酯与生殖障碍疾病的关联,并构建基于枢纽基因的诊断模型 | 缺乏体内和体外实验证据验证,需要进一步研究阐明具体机制 | 探索联苯菊酯与复发性种植失败和复发性流产的潜在关联 | 联苯菊酯及其潜在靶点基因,复发性种植失败和复发性流产患者样本 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 网络毒理学,分子对接,RNA-seq分析,功能富集分析 | 诊断模型 | 基因表达数据,蛋白质结构数据 | 来自GEO数据库的bulk RNA-seq数据集和单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
4997 | 2025-10-06 |
A retinoic acid:YAP1 signaling axis controls atrial lineage commitment
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115687
PMID:40343798
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研究论文 | 本研究揭示了视黄酸与YAP1信号轴协同调控心脏祖细胞向心房谱系分化的机制 | 首次发现Hippo效应因子YAP1与视黄酸信号协同整合于心房转录因子增强子网络,调控心房谱系特化 | 研究主要基于体外hESC模型和小鼠胚胎,人类体内验证尚需进一步研究 | 探究视黄酸信号调控心房谱系特化的下游效应机制 | 人类胚胎干细胞来源的心脏祖细胞、小鼠胚胎、模式化心脏类器官 | 发育生物学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, snATAC-seq, 功能基因组学 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据 | 未处理与RA处理的人类胚胎干细胞来源CPCs | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
4998 | 2025-10-06 |
Integrative Spatial Proteomics and Single-Cell RNA Sequencing Unveil Molecular Complexity in Rheumatoid Arthritis for Novel Therapeutic Targeting
2025-May-22, Proteomes
IF:4.0Q2
DOI:10.3390/proteomes13020017
PMID:40559990
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研究论文 | 通过整合空间蛋白质组学和单细胞RNA测序技术揭示类风湿关节炎滑膜分子复杂性 | 首次结合激光捕获显微切割蛋白质组学和单细胞RNA测序分析类风湿关节炎滑膜组织空间异质性 | 未明确说明样本规模和验证方法 | 解析类风湿关节炎滑膜组织分子机制并发现治疗靶点 | 类风湿关节炎患者滑膜组织及其健康对照 | 空间多组学 | 类风湿关节炎 | 激光捕获显微切割, 质谱蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 激光捕获显微切割结合质谱蛋白质组学 |
4999 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveal PI3K-AKT and metabolic alterations in aggressive, treatment-resistant lactotroph pituitary neuroendocrine tumors
2025-05-19, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02025-9
PMID:40390063
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示侵袭性、治疗抵抗性催乳素垂体神经内分泌肿瘤中PI3K-AKT通路和代谢改变 | 首次在DA抵抗性催乳素PitNET中应用空间转录组学技术揭示肿瘤内异质性,发现PI3K/AKT通路和脂质代谢改变 | 样本量较小(13例患者),未观察到从部分响应到完全无响应肿瘤的明确分化模式 | 解析催乳素垂体神经内分泌肿瘤的分子异质性,识别侵袭性和药物治疗抵抗的生物标志物 | 多巴胺激动剂抵抗性催乳素垂体神经内分泌肿瘤患者 | 空间转录组学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 空间转录组学, 全转录组测序, 全外显子组测序 | NA | 空间转录组数据, 测序数据 | 13例DA抵抗性催乳素PitNET患者 | 10x Genomics | 空间转录组学, bulk RNA-seq, WES | Visium | Visium Spatial Transcriptomics |
5000 | 2025-10-06 |
Temporal transcriptomic changes in the THY-Tau22 mouse model of tauopathy display cell type- and sex-specific differences
2025-05-07, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02013-z
PMID:40336141
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析THY-Tau22小鼠模型中不同细胞类型和性别的时序转录组变化 | 首次在tauopathy小鼠模型中系统揭示细胞类型特异性和性别特异性的年龄依赖性转录组变化 | 研究基于小鼠模型,人类验证数据有限 | 理解AD相关tauopathy中性别特异性和性别二态性转录组变化的细胞类型特异性和年龄依赖性 | THY-Tau22转基因小鼠和野生型小鼠的皮质组织 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17月龄和7月龄的雄性和雌性THY-Tau22及野生型小鼠皮质组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |