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当前共找到 38417 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-04-11 |
Pleural Mesothelioma-A Novel Uncommitted Molecular Phenotype Identified by Multiomics, Histologic, and scRNA-Seq Profiling
2026-Apr, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2026.103562
PMID:41956634
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 482 | 2026-04-11 |
Quantifying stability via count splitting to guide model selection in RNA velocity analyses
2026-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.23.625009
PMID:41959044
|
研究论文 | 本文提出了一种基于负二项计数分裂的新框架，用于评估RNA速度预测的稳定性，并通过复制一致性指标指导模型选择 | 首次引入负二项计数分裂生成独立数据副本，并定义复制一致性指标来量化RNA速度方法的稳定性和不确定性 | 未明确讨论计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 开发一个通用框架来评估和比较不同RNA速度方法的预测稳定性 | 小鼠红细胞、胰腺以及人类大脑发育的单细胞RNA测序数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 483 | 2026-04-11 |
Transcriptome-based cell type assignment for kidney cell culture models
2026-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.30.715265
PMID:41959092
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研究论文 | 本文开发了一种基于转录组的方法，通过将肾脏细胞系、原代细胞或组织的批量RNA-seq数据与单细胞RNA-seq数据集衍生的参考细胞类型进行匹配，以评估细胞系与其原生细胞类型的相似性 | 结合批量RNA-seq与单细胞参考数据集，利用基因表达秩相关和机器学习方法（如TabPFN）系统评估细胞系身份，并提供了两种互补的实现工具 | 方法主要依赖于转录组数据，可能未考虑表观遗传或蛋白质水平差异；验证策略虽全面，但可能受参考数据集质量和覆盖范围限制 | 开发并验证一种转录组学方法，以评估肾脏细胞系是否在基因表达上类似于其原生细胞类型，从而辅助细胞培养模型的选择和解释 | 人类和小鼠肾脏细胞系、原代细胞、微分离肾脏组织以及非肾脏阴性对照 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | Random Forest, XGBoost, TabPFN | 转录组数据 | 涉及两个人类和两个小鼠肾脏scRNA-seq数据集，以及多个肾脏细胞系和对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 484 | 2026-04-11 |
STAPLE: automating spatial transcriptomics analysis and AI interpretation
2026-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.30.715127
PMID:41959373
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研究论文 | STAPLE是一个自动化空间转录组学分析和AI解释的模块化框架 | 将细胞分型、邻域分析和细胞间通信等工具整合为统一框架，并引入AI驱动的报告层自动合成生物学发现摘要 | NA | 解决空间转录组学工作流中工具碎片化问题，提升分析的可扩展性、可解释性和可重复性 | 空间转录组学数据分析流程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | AI（未指定具体模型） | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 485 | 2026-04-11 |
LAML-Pro: Joint Maximum Likelihood Inference of Cell Genotypes and Cell Lineage Trees
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.27.714879
PMID:41959070
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研究论文 | 本文介绍了一种名为LAML-Pro的算法，用于联合推断细胞基因型和细胞谱系树，以解决现有方法中基因型错误导致谱系树不准确的问题 | LAML-Pro首次通过概率混合类型缺失观测模型联合推断细胞基因型和谱系树，能有效纠正基因型错误并提高谱系树准确性 | 方法主要基于模拟数据和两种成像谱系追踪系统验证，在其他技术平台或更大规模数据中的应用效果尚需进一步评估 | 开发一种能联合推断细胞基因型和细胞谱系树的算法，以提高动态谱系追踪技术的准确性 | 单细胞测序或成像数据中的细胞基因型和谱系树 | 机器学习 | NA | 单细胞测序，成像 | 概率混合类型缺失观测模型 | 测序数据，成像数据 | 数千个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，成像 | NA | NA |
| 486 | 2026-04-11 |
Intercellular communication is a heritable dimension of human tissue architecture
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.29.715138
PMID:41959167
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研究论文 | 本研究引入EdgeMap方法，通过整合空间转录组学和GWAS摘要统计数据，将性状遗传力分解为细胞内在和细胞间成分，并解析细胞间信号到特定配体-受体通道 | 首次提出EdgeMap方法，能够测试遗传效应是否集中在细胞间的分子界面上，并识别出标准基因级优先排序中缺失的细胞间通信基因 | 仅分析了17个性状和五种人类组织，可能未覆盖所有相关疾病或组织类型 | 研究遗传风险如何映射到细胞间通信，以识别疾病相关组织和细胞类型 | 人类组织中的细胞间通信和遗传性状 | 空间转录组学 | 双相情感障碍、心血管疾病、肝脏疾病 | 空间转录组学、GWAS摘要统计 | NA | 空间转录组数据、GWAS摘要统计数据 | 五种人类组织，具体样本数量未明确 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 细胞分割的Visium HD平台 |
| 487 | 2026-04-11 |
The Human Male Mammary Gland has Similar Epithelial Populations to Female but Distinct Composition and Transcriptional Properties
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.27.714915
PMID:41959192
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了成人乳腺的综合图谱，首次揭示了正常男性乳腺在单细胞分辨率下的细胞组成和转录特征 | 首次构建了成人男性乳腺的单细胞转录组图谱，系统比较了男女性乳腺上皮细胞群的异同，并发现男性乳腺具有独特的转录特征和信号通路活性 | 样本量相对较小（仅3名男性捐赠者），且未涉及疾病状态或年龄变化的纵向分析 | 阐明正常男性乳腺的细胞组成和转录特性，为理解男性乳腺癌生物学提供基础 | 成人人类乳腺组织（来自17名捐赠者，其中3名男性，14名女性） | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 174,471个细胞来自17名捐赠者（3男14女），其中18,117个细胞来自男性 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 488 | 2026-04-11 |
Hapln1-HA signaling promotes progenitor cell proliferation and spinal cord regeneration
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.28.714985
PMID:41959443
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研究论文 | 本研究通过跨物种单细胞转录组学揭示了透明质酸修饰酶Hapln1在斑马鱼脊髓损伤后上调，并通过促进祖细胞增殖来增强脊髓再生能力 | 首次发现斑马鱼利用促再生ECM分子Hapln1增强祖细胞效能，区别于哺乳动物中抗再生ECM成分的主导作用 | 研究主要基于斑马鱼模型，在哺乳动物中的直接应用仍需进一步验证 | 探究细胞外基质在脊髓自发修复中的积极作用机制 | 成年斑马鱼脊髓损伤后的祖细胞 | 单细胞转录组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 489 | 2026-04-11 |
High-dimensional multiomics reveals perturbations to IL-6/IL-6R axis and RUNX3 in CD4+ T cells during third trimester pregnancy
2026-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.26.711478
PMID:41959409
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研究论文 | 本研究通过高维多组学分析揭示了妊娠晚期CD4+ T细胞中IL-6/IL-6R轴和RUNX3的扰动 | 结合流式细胞术表面蛋白筛查和单细胞RNA测序（CITE-seq）技术，全面分析了妊娠期CD4+ T细胞的表面蛋白质组和转录组变化，并发现了IL-6/IL-6R信号轴及转录因子RUNX3在妊娠适应性中的新作用 | 研究样本仅包括足月妊娠（>37周）和非妊娠对照，未涵盖妊娠早期或中期，且样本量未明确说明，可能限制结果的普遍性 | 旨在理解妊娠期间CD4+ T细胞的表面蛋白质组和转录组变化，以揭示其在免疫调节和胎盘发育中的机制 | CD4+ T细胞，来源于足月妊娠（>37周）的血液和蜕膜组织，以及非妊娠血液对照 | 免疫学 | 妊娠并发症（如子痫前期、胎儿生长受限和死产） | 流式细胞术、单细胞RNA测序（CITE-seq） | NA | 表面蛋白数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | CITE-seq（使用超过130个条形码抗体） |
| 490 | 2026-04-11 |
CosMxScope: Scalable Reconstruction and Digital Pathology Integration of Imaging-Based Spatial Transcriptomics Data
2026-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.25.713520
PMID:41959506
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CosMxScope的轻量级开源Python框架，用于整合成像空间转录组学数据与数字病理学工具 | 开发了CosMxScope框架，首次将CosMx空间分子成像仪的输出数据（如FOV图像块、亚细胞转录坐标和细胞分割多边形）与数字病理学可视化环境（如QuPath）无缝桥接，实现了空间转录组数据的可扩展重建和交互式探索 | 框架目前主要针对CosMx平台，可能不直接兼容其他空间转录组学技术；且依赖于特定软件环境（如QuPath）进行进一步评估 | 旨在解决CosMx空间转录组学数据与广泛使用的数字病理学工具之间的兼容性问题，促进空间数据的可视化与分析 | 人类和小鼠组织的CosMx空间多模态组学分析数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像、空间坐标 | 涉及多个进行中的研究项目，具体样本数量未明确说明 | NA | 空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪，用于单细胞空间多模态组学分析，能够测量全玻片切片中每个细胞的数千个RNA或蛋白质靶标 |
| 491 | 2026-04-11 |
Oligodendrocyte precursor cells-microglia crosstalk via BMP4 drives microglial neuroprotective response and mitigates Alzheimer's disease
2026-Mar-25, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02620-9
PMID:41881962
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研究论文 | 本文揭示了少突胶质前体细胞通过分泌BMP4与微胶质细胞进行交流，从而驱动微胶质细胞的神经保护反应并减轻阿尔茨海默病病理 | 首次发现晚期少突胶质前体细胞（COPs）分泌的BMP4是调控微胶质细胞神经保护程序的关键信号，并阐明了其通过Smad1/5/8-Trem2通路直接调控疾病相关微胶质细胞（DAM）基因表达的分子机制 | 研究主要在5xFAD转基因小鼠模型中进行，其在人类阿尔茨海默病中的普适性及临床转化潜力有待进一步验证 | 探究少突胶质前体细胞与中枢神经系统免疫系统（特别是微胶质细胞）在阿尔茨海默病病理中的细胞间通讯机制 | 5xFAD转基因阿尔茨海默病小鼠模型、少突胶质前体细胞（OPCs/COPs）、微胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、基因敲除、腺相关病毒（AAV）介导的基因递送、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、组织病理学图像 | 5xFAD转基因小鼠及对照小鼠（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 492 | 2026-04-11 |
Integrating Microscopy Methods to Study Gene and Protein Expression alongside Metal Ion Distribution and Speciation: A Case Study of Iron within Pyramidal Neurons from Distinct Hippocampal CA1 Subregions
2026-Mar-23, Chemical & biomedical imaging
DOI:10.1021/cbmi.5c00059
PMID:41889472
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研究论文 | 本研究通过整合多种显微分析方法，探究了海马CA1区不同亚区域中锥体神经元的铁离子分布、氧化状态、储存蛋白表达及基因表达通路，以揭示铁代谢与神经退行性疾病易感性的关联 | 首次将X射线荧光显微镜、XANES光谱、免疫荧光和空间转录组学四种技术结合，对海马CA1区特定脑区域的铁代谢组进行空间解析，揭示了侧向与内侧CA1神经元在铁代谢方面的关键差异 | 研究仅针对海马CA1区，样本范围有限，且为案例研究，可能需要更大样本量验证结果 | 探究铁离子在大脑健康及神经退行性疾病中的作用，特别是在海马CA1区的分布与代谢特征 | 海马CA1区（侧向和内侧）的锥体神经元 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | X射线荧光显微镜，XANES光谱，免疫荧光，空间转录组学 | NA | 图像，光谱数据，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 493 | 2026-04-11 |
Single-cell spatial multi-omics molecular pathology enabled by SuperFocus
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.26.696575
PMID:41890079
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SuperFocus的计算平台，用于从基于点的空间测量中生成与组织病理学整合的单细胞空间多组学数据，无需外部参考数据 | SuperFocus平台结合了约束级联插补与特征级和细胞级质量控制评分，提高了准确性，并在基准数据集上比现有方法提升了28-73%的关键指标 | NA | 开发下一代分子病理学方法，将基因组尺度分子信息以单细胞分辨率投影到整个组织切片的组织病理学图像上 | MALT淋巴瘤微环境、人类海马体基因调控程序、人类MASH中的脂毒性肝细胞状态，以及帕金森病小鼠脑中与神经传递和神经炎症相关的转录组-代谢组状态 | 数字病理学 | MALT淋巴瘤, MASH, 帕金森病 | 空间转录组学, 空间ATAC-RNA, 空间CITE-seq, Visium-MALDI-MSI | 约束级联插补模型 | 空间多组学数据, 组织病理学图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞空间多组学, 空间转录组学 | Visium | Visium-MALDI-MSI (SMA) 数据集 |
| 494 | 2026-04-11 |
Contribution of cytotoxic CD8 T cells, neutrophils and type 1 interferon signaling to hyperinflammation in HIV-associated TB meningitis
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.10.710544
PMID:41959528
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了HIV相关结核性脑膜炎患者脑脊液中的免疫细胞，揭示了以细胞毒性CD8 T细胞、高度活化的中性粒细胞和有害的I型干扰素信号为特征的高炎症免疫反应 | 首次在HIV相关结核性脑膜炎患者中，通过大规模单细胞RNA测序（188,983个细胞）系统揭示了脑脊液免疫微环境的细胞组成和功能特征，特别是发现了细胞毒性CD8 T细胞的主导地位、中性粒细胞的异常活化状态以及I型干扰素信号的有害作用 | 样本量相对有限（25名成人患者），且主要针对HIV阳性人群，结果可能无法完全推广到HIV阴性结核性脑膜炎患者；研究为观察性研究，需要进一步实验验证这些免疫特征的因果关系 | 阐明HIV相关结核性脑膜炎患者脑脊液中免疫失调的具体机制，特别是高炎症反应的细胞和分子基础 | 25名患有HIV相关结核性脑膜炎的成人患者的脑脊液细胞 | 单细胞组学 | 结核性脑膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 25名成人患者，共188,983个脑脊液细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 495 | 2026-04-11 |
TYK2 Inhibition with Deucravacitinib Improves Clinical Outcomes and Resolves Interferon-Driven Inflammation in Lichen Planopilaris
2026-Mar-22, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.03.13.26348272
PMID:41891048
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研究论文 | 本研究通过一项临床试验，评估了口服TYK2抑制剂deucravacitinib治疗扁平苔藓样脱发（LPP）的疗效，并利用bulk和单细胞RNA测序揭示了其通过抑制I型干扰素驱动的炎症通路发挥作用的机制 | 首次在LPP中应用选择性TYK2抑制剂deucravacitinib进行临床治疗，并联合bulk和单细胞RNA测序技术，在单细胞分辨率上阐明了治疗如何下调I型干扰素信号通路、CD8+ T细胞受体信号以及成纤维细胞-免疫细胞间的通讯 | 样本量较小（N=10），为单臂临床试验缺乏安慰剂对照，随访时间较短（24周） | 评估TYK2抑制剂deucravacitinib治疗扁平苔藓样脱发（LPP）的临床疗效并探究其分子机制 | 经活检证实的扁平苔藓样脱发（LPP）患者 | 数字病理 | 皮肤疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 10名LPP患者，采集治疗前和治疗后第4周的头皮活检配对样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 496 | 2026-04-11 |
Diverse high-fat diets drive multi-omic reprogramming that persists after dietary reversal
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.708620
PMID:41889866
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研究论文 | 本研究通过纵向多组学分析，探究了不同高脂饮食对宿主生理和肠道微生物组的长期影响，以及饮食逆转后的恢复情况 | 首次系统比较了七种不同脂肪来源的高脂饮食的长期效应，并揭示了饮食逆转后宿主-微生物组互作网络中存在的持久性“记忆”现象 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果外推至人类需谨慎；研究窗口期可能不足以观察所有特征的完全恢复 | 阐明特定脂肪来源的长期影响，以及饮食逆转后宿主-微生物组变化的可逆性程度 | 小鼠模型及其肠道微生物组 | 微生物组学 | 代谢性疾病 | 粪便宏基因组学、粪便代谢组学、血浆代谢组学与脂质组学、肠道单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据（基因组、代谢组、转录组） | 多个小鼠队列，包括对照组、七种高脂饮食组及饮食逆转组，研究持续一年 | NA | 单细胞RNA-seq, 宏基因组测序, 代谢组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 497 | 2026-04-11 |
Single-cell inflammatory signaling defines a novel CEP135+ endothelial subtype associated with glioma progression
2026-Mar-19, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102742
PMID:41861657
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，识别了一种与胶质瘤进展相关的创新性CEP135+炎症相关内皮细胞亚型 | 首次在单细胞水平上定义了CEP135+炎症相关内皮细胞亚型，并建立了CEP135作为连接内皮炎症重编程、肿瘤进展和不良临床结局的关键生物标志物 | 研究主要基于观察性数据，需要进一步功能实验验证CEP135的具体作用机制 | 探究胶质瘤微环境中慢性炎症的细胞组织及其与肿瘤进展的关系 | 胶质瘤及相邻正常脑组织 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组学, 蛋白质组学, 免疫组化分析 | 通路水平评分方法, 伪时序轨迹分析, 细胞间通讯分析 | RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 | 来自本中心的人胶质瘤脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 498 | 2026-04-11 |
LIFUS-driven engineered bacteria reprogram immunosuppressive niches via mechano-NOTCH signaling
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102658
PMID:41806839
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研究论文 | 本研究通过工程化改造沙门氏菌表达气囊，利用低强度聚焦超声产生局部机械力，重塑肿瘤微环境，并开发了一种用于过继性T细胞疗法的机械启动方法 | 首次将工程化细菌与低强度聚焦超声结合，通过机械力选择性调控肿瘤微环境中的Notch1-Jagged1信号轴，并基于此开发了增强T细胞疗效的机械启动策略 | 研究主要在临床前模型中进行，尚未在人体中验证其安全性和有效性；机械力作用的长期影响和潜在副作用仍需进一步评估 | 克服实体瘤中限制T细胞浸润和功能的基质与免疫屏障，增强过继性T细胞疗法的疗效 | 实体瘤微环境、工程化沙门氏菌VNP20009、气囊、癌症相关成纤维细胞、CD8 T细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序、工程细菌改造、低强度聚焦超声 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 499 | 2026-04-11 |
ESPeR-seq: Extremely Sensitive and Pure, End-to-end, RNA-seq library preparation
2026-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711386
PMID:41959175
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研究论文 | 本文介绍了一种新型的RNA-seq文库制备方法ESPeR-seq，旨在解决单细胞RNA测序中的非特异性PCR产物、转录终止位点捕获不精确以及虚假UMI生成等问题 | 开发了Omega-dT引物以精确捕获转录终止位点，并采用含尿嘧啶的TSO和尿嘧啶不耐受DNA聚合酶的生化多锁机制，以消除PCR背景和虚假UMI | NA | 提高单细胞RNA测序的灵敏度和定量准确性，实现全长异构体解析 | 单细胞RNA测序文库 | 自然语言处理 | NA | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 500 | 2026-04-11 |
Fibroblasts neurotrophin signaling sustains pathological vascular maturation in rheumatoid arthritis
2026-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711120
PMID:41959252
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研究论文 | 本研究利用高维空间转录组学揭示了神经生长因子信号在类风湿关节炎滑膜中驱动异常血管成熟的关键作用 | 首次发现神经生长因子信号通过激活NOTCH3和NGFR诱导滑膜成纤维细胞分化为壁细胞，从而维持RA滑膜中成熟血管的形成 | 研究主要基于体外组织外植体实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究类风湿关节炎治疗失败机制，特别是滑膜成纤维细胞和血管内皮在驱动病理血管成熟中的作用 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织 | 空间转录组学 | 类风湿关节炎 | 高维空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |