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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-04-17 |
From forest floor to doctor's office: the immunological journey of Borrelia burgdorferi through vertebrate hosts
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1811554
PMID:41988178
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综述 | 本文综述了伯氏疏螺旋体在脊椎动物宿主中的免疫生物学进展,重点关注其通过免疫调节建立持续性感染的机制 | 采用阶段结构化框架整合了2020年后活体成像、单细胞转录组学、空间分析和系统免疫学等新技术带来的新见解 | NA | 理解伯氏疏螺旋体如何通过免疫调节在脊椎动物宿主中建立持续性感染,并为诊断、疫苗和治疗提供信息 | 伯氏疏螺旋体及其在脊椎动物宿主中的感染过程 | 自然语言处理 | 莱姆病 | 活体成像、单细胞转录组学、空间分析、系统免疫学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 482 | 2026-04-17 |
The mechanism of PKM2/HIF-1α axis polarizing TAMs by upregulating glucose-serine metabolism to promote melanoma progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1740155
PMID:41988200
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 483 | 2026-04-17 |
Histopathology and spatial transcriptomics jointly map myofiber-specific pathological programs in mTORC1-driven myopathy
2025-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.03.692123
PMID:41573854
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研究论文 | 本研究结合组织病理学和空间转录组学技术,在mTORC1过度激活的啮齿动物模型中,以单肌纤维分辨率揭示了肌纤维类型特异性的病理程序 | 首次将高分辨率Seq-Scope空间转录组学技术与组织病理学相结合,在单肌纤维水平上解析mTORC1驱动肌病的分子机制 | 研究基于啮齿动物模型,结果可能不完全适用于人类疾病;仅分析了两种特定肌肉(EDL和SOL),未涵盖所有肌肉类型 | 探究mTORC1过度激活如何通过不同代谢和结构途径破坏肌肉稳态,并将组织病理表型与分子状态直接关联 | mTORC1过度激活的啮齿动物模型中的骨骼肌组织,特别是趾长伸肌(EDL)和比目鱼肌(SOL) | 空间转录组学 | 肌病 | 空间转录组学,组织病理学分析 | NA | 空间转录组数据,组织病理图像 | 啮齿动物模型中的EDL和SOL肌肉组织样本 | NA | 空间转录组学 | Seq-Scope | 高分辨率Seq-Scope技术 |
| 484 | 2026-04-17 |
ABCA4-mutant human retinal organoids sequencing reveals organoids application in inherited retinal diseases
2025-Dec, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110677
PMID:41038369
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了由ABCA4突变引起的Stargardt病(STGD)患者与健康对照来源的视网膜类器官(ROs),验证了ROs作为遗传性视网膜疾病(IRDs)疾病模型的潜力 | 首次利用人类视网膜类器官(ROs)结合单细胞RNA测序技术,验证了其在模拟晚期发病的遗传性视网膜疾病(如Stargardt病)中的分子特征捕获能力,特别是在早期发育阶段就能揭示患者与对照样本之间的分子差异 | 研究仅涉及2名STGD患者样本,样本量较小;且ROs模拟晚期发病疾病特性的能力仍需进一步验证 | 验证人类视网膜类器官(ROs)作为由ABCA4突变引起的Stargardt病(STGD)的疾病模型,并探索其在遗传性视网膜疾病(IRDs)研究中的应用潜力 | 来自2名STGD患者和健康对照的干细胞衍生的人类视网膜类器官(ROs) | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2名STGD患者及健康对照的视网膜类器官样本,在两个发育阶段进行比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 485 | 2026-04-17 |
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01379-z
PMID:41291434
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据,识别骨关节炎相关基因并预测潜在治疗药物 | 结合hdWGCNA、随机森林和PPI网络分析识别OA关键基因,并利用孟德尔随机化和斑马鱼实验验证药物作用 | 研究主要基于生物信息学预测和斑马鱼模型,需进一步在哺乳动物或临床样本中验证 | 寻找骨关节炎的预防和治疗药物 | 骨关节炎相关基因和候选药物 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR | 随机森林, 网络分析 | 基因表达数据 | 从GEO数据库获取的scRNA-seq和bulk-RNA seq数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 486 | 2026-04-17 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq identifies transcriptional and epigenetic blueprint guiding osteoclastogenic trajectory
2025-Sep-28, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf084
PMID:40577680
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq、ATAC-seq、批量RNA-seq和ChIP-seq技术,揭示了破骨细胞生成过程中转录和表观遗传调控的蓝图 | 首次在单细胞分辨率下结合多组学分析,系统描绘了破骨细胞生成的分化轨迹,并鉴定出IRF8作为破骨细胞生成的关键负调控因子 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证和临床转化仍需进一步探索 | 阐明破骨细胞生成过程中的转录和表观遗传调控机制 | 野生型和IRF8条件性敲除小鼠的造血干细胞、祖细胞、单核细胞及破骨细胞前体 | 单细胞多组学 | 骨溶解性疾病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 批量RNA-seq, ChIP-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据, 批量转录组数据, 染色质免疫沉淀数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 批量RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 487 | 2026-04-17 |
Anti-tumor effects on tumor-infiltrating natural killer cells by localized ablative immunotherapy and immune checkpoint inhibitors: An integrated and comparative study using scRNAseq analysis
2025-Sep-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217825
PMID:40436260
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,比较了局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤浸润自然杀伤细胞的调控作用及其临床意义 | 首次整合单细胞测序和TCGA数据库,系统比较了LAIT和ICI对NK细胞的转录调控,并构建了基于NK细胞基因特征的预后模型 | 研究基于小鼠乳腺癌模型,临床转化需进一步验证;单细胞测序样本量有限 | 阐明局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤微环境中NK细胞的调控机制 | 肿瘤浸润自然杀伤细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠乳腺癌模型,具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 488 | 2026-04-17 |
ChemPerturb-seq screen identifies a small molecule cocktail enhancing human beta cell survival after subcutaneous transplantation
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.002
PMID:40562034
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研究论文 | 本研究开发了一种结合化学筛选与单细胞RNA测序的ChemPerturb-seq平台,用于系统分析小分子处理后人源β细胞的分子变化,并发现了一种能增强皮下移植后β细胞存活的小分子混合物 | 创新性地将化学筛选与单细胞RNA测序结合,开发了ChemPerturb-seq平台,实现了高通量分析小分子对细胞分子层面的影响,并发现了性别特异性的小分子混合物效果 | 研究仅在小鼠模型中进行验证,尚未在人体临床试验中证实效果;且发现的小分子混合物对雌性小鼠有效,但对雄性小鼠效果有限,存在性别差异 | 旨在通过化学筛选和单细胞分析,发现能增强人源β细胞在皮下移植后存活和功能的小分子混合物 | 人源β细胞和原代胰岛 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | AI驱动的网站分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,涉及人源β细胞和原代胰岛的体外及小鼠体内实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 489 | 2026-04-17 |
Enhancer-driven gene regulatory networks reveal transcription factors governing T cell adaptation and differentiation in the tumor microenvironment
2025-Jul-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.04.030
PMID:40425012
|
研究论文 | 本研究通过配对单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,揭示了肿瘤微环境中具有组织驻留记忆表型的CD8 T细胞分化的增强子驱动调控网络和关键转录因子。 | 首次通过配对单细胞多组学(RNA-seq和ATAC-seq)分析T细胞受体匹配的CD8 T细胞,构建增强子驱动的调控网络,并明确了KLF2和BATF转录因子在调控肿瘤浸润淋巴细胞中组织驻留记忆表型形成中的相反作用。 | 研究主要基于感染和癌症模型,其结果在人类患者肿瘤微环境中的普适性有待进一步验证。 | 阐明肿瘤微环境中CD8 T细胞向组织驻留记忆表型分化的表观遗传和转录调控机制。 | 感染和癌症模型中的T细胞受体匹配的CD8 T细胞,特别是具有组织驻留记忆表型的肿瘤浸润淋巴细胞。 | 单细胞多组学 | 癌症 | 配对单细胞RNA测序,配对单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 490 | 2026-04-17 |
Opposite regulation of intestinal and intrahepatic CD8+ T cells controls alcohol-associated liver disease progression
2025-Jul-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334412
PMID:40199574
|
研究论文 | 本研究揭示了酒精相关性肝病中肠道与肝内CD8+ T细胞的反向调控机制及其在疾病进展中的关键作用 | 首次发现酒精暴露导致十二指肠CD8+ T细胞特异性减少而肝内CD8+ T细胞增加的反向调控现象,并证明BCL2在其中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的关联分析,需要进一步验证BCL2调控机制在人体中的直接作用 | 探究肠道与肝内CD8+ T细胞在酒精相关性肝病中的调控机制及其对疾病进展的影响 | ALD患者样本、野生型小鼠、CD8特异性Bcl2转基因小鼠和Cd8基因敲除小鼠 | 单细胞组学 | 酒精相关性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | ALD患者样本及多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 491 | 2026-04-17 |
Identification of Immune Hub Genes in Obese Postmenopausal Women Using Microarray and Single-Cell RNA Seq Data
2025-Jun-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16070783
PMID:40725440
|
研究论文 | 本研究通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据,识别了绝经后肥胖女性脂肪组织中的关键免疫枢纽基因 | 结合WGCNA、PPI网络分析和单细胞RNA测序验证,首次在绝经后肥胖女性中鉴定出与脂肪组织炎症相关的免疫枢纽基因,并揭示了NK细胞在这些基因表达中的重要作用 | 研究样本来源于公共数据库,可能受限于原始数据质量;动物模型验证仅使用斑马鱼,与人类生理存在差异 | 阐明绝经后肥胖女性脂肪组织中免疫失调的分子机制 | 绝经后肥胖女性的脂肪组织 | 生物信息学 | 肥胖症 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | WGCNA, PPI网络分析, ssGSEA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的微阵列数据集GSE151839和单细胞RNA测序数据集GSE176171,以及肥胖和对照斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 492 | 2026-04-17 |
Decoding Cellular Communication Networks and Signaling Pathways in Bone, Skeletal Muscle, and Bone-Muscle Crosstalk Through Spatial Transcriptomics
2025-Jun-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6701121/v1
PMID:40585205
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术解码了小鼠股骨和相邻骨骼肌中的细胞间通讯网络和信号通路,首次绘制了骨与骨骼肌之间空间解析的细胞通讯图谱 | 首次应用空间转录组学技术系统性地绘制了骨与骨骼肌之间的空间解析细胞通讯图谱,揭示了13个关键的信号通路和特定的配体-受体对,为理解骨肌互作提供了新的分子见解 | 研究仅基于小鼠模型,样本量有限,且未涵盖所有可能的细胞类型或疾病状态 | 研究骨与骨骼肌之间的细胞通讯网络和信号通路,以理解骨肌互作的分子机制 | 小鼠的股骨和相邻骨骼肌组织 | 空间转录组学 | 骨质疏松症、肌肉减少症、代谢综合征 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium ST profiling |
| 493 | 2026-04-17 |
Radiotherapy promotes cuproptosis and synergizes with cuproptosis inducers to overcome tumor radioresistance
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.031
PMID:40215978
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研究论文 | 本研究揭示了放疗通过上调铜转运蛋白CTR1、消耗线粒体谷胱甘肽来诱导铜死亡,并发现放疗抵抗与BACH1下调导致的铜螯合蛋白MT1E/X表达升高有关,铜离子载体治疗可增强放疗敏感性 | 首次揭示了放疗诱导铜死亡的机制,并发现铜死亡诱导剂可协同放疗克服肿瘤放疗抵抗 | NA | 阐明放疗诱导铜死亡的机制,并探索通过靶向铜死亡克服肿瘤放疗抵抗的治疗策略 | 食管癌细胞、患者肿瘤样本、细胞系及患者来源的异种移植模型 | NA | 食管癌 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 494 | 2026-04-17 |
Machine learning approach to single cell transcriptomic analysis of Sjogren's disease reveals altered activation states of B and T lymphocytes
2025-Jun, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103419
PMID:40318561
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了干燥综合征患者外周血单个核细胞中B细胞和T细胞独特的基因表达模式和异常的激活状态 | 首次在干燥综合征患者中应用单细胞转录组学结合机器学习方法,系统揭示了B细胞和T细胞中独特的基因表达特征和激活状态改变 | 研究样本量未明确说明,且仅分析了外周血单个核细胞,未直接研究唾液腺等靶器官中的免疫细胞 | 探究干燥综合征的发病机制,识别参与疾病过程的细胞类型和功能变化 | 干燥综合征患者和症状性非干燥综合征对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 495 | 2026-04-17 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2025-May-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101260
PMID:40215972
|
研究论文 | 本文利用单细胞测序技术,系统研究了CAR-T细胞中不同细胞内信号域(ICD)架构如何通过信号传导影响T细胞功能,特别关注其在体内持久性和抗肿瘤效果中的作用 | 首次通过单细胞测序系统性地将多样化的CAR信号输入映射到转录输出,识别出与特定ICD架构相关的独特强直信号特征,该特征驱动了在液体肿瘤中的持久体内持久性和疗效 | 研究发现识别的强直信号特征在实体瘤中未表现出相同的驱动持久性和疗效的效果 | 解码CAR信号传导的设计原则,以指导优化用于体内功能的下一代ICD架构的理性设计 | 表达嵌合抗原受体(CARs)的工程化T细胞及其细胞内信号域(ICD) | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 496 | 2026-04-17 |
Engineering sonogenetic EchoBack-CAR T cells
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.02.035
PMID:40179881
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过超声波激活的EchoBack-CAR T细胞,用于治疗实体瘤,如胶质母细胞瘤和前列腺癌 | 利用超声波敏感的启动子和CAR信号的正反馈回路,实现CAR表达的持久激活,减少脱靶毒性和T细胞耗竭 | NA | 开发一种安全、高效的CAR T细胞疗法,以克服实体瘤治疗中的挑战,如脱靶毒性和T细胞持久性不足 | 胶质母细胞瘤和前列腺癌模型,以及相应的CAR T细胞 | 生物医学工程 | 胶质母细胞瘤, 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 497 | 2026-04-17 |
Direct microglia replacement reveals pathologic and therapeutic contributions of brain macrophages to a monogenic neurological disease
2025-May-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.03.019
PMID:40311614
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序揭示了克拉伯病中巨噬细胞的早期干扰素反应特征和分子标志,并通过直接小胶质细胞替换在小鼠模型中验证了其治疗潜力 | 利用单细胞测序识别了克拉伯病中巨噬细胞的早期干扰素反应特征和分子标志,并通过直接小胶质细胞替换在小鼠模型中实现了超过80%的内源性小胶质细胞替换,显著改善了疾病表型 | 研究基于小鼠模型,人类临床转化仍需进一步验证;直接小胶质细胞替换技术的长期安全性和有效性尚待评估 | 探究巨噬细胞在克拉伯病病理生理和造血干细胞移植中的作用,并评估直接小胶质细胞替换作为治疗策略的可行性 | 克拉伯病(一种单基因神经系统疾病)中的巨噬细胞和小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包括小鼠模型和人类脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 498 | 2026-04-17 |
Human skeletal development and regeneration are shaped by functional diversity of stem cells across skeletal sites
2025-May-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.02.013
PMID:40118065
|
研究论文 | 本研究通过整合人类骨骼干细胞的前瞻性分离、功能实验和单细胞RNA测序分析,揭示了骨骼发育和再生中干细胞功能多样性的关键作用 | 首次系统性地鉴定了人类骨骼干细胞的软骨生成、骨生成、基质和纤维生成亚型,并揭示了这些亚型在不同骨骼部位的独特组成和克隆动态 | 研究主要基于体外实验和动物模型,人类体内验证有限,且样本来源可能未覆盖所有骨骼变异 | 探究人类骨骼干细胞的功能多样性如何影响骨骼发育、再生及与年龄相关的骨骼疾病 | 人类骨骼干细胞(hSSCs)及其在不同骨骼部位的亚型 | 单细胞组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),前瞻性细胞分离,功能实验 | 布尔算法用于基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 来自十个骨骼部位的人类骨骼干细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 499 | 2026-04-17 |
A Robust Kernel-Based Workflow for Niche Trajectory Analysis
2025-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401199
PMID:40411819
|
研究论文 | 本文提出了一种基于核的稳健工作流程,用于分析组织微环境的生态位轨迹,无需细胞类型注释即可建模空间连续变化 | 提出了一种新的基于核的策略,将生态位的结构组成建模为基因表达空间中的连续函数,从而消除了对细胞类型注释的需求,并通过与细胞类型反卷积分析的集成扩展了其应用范围 | NA | 开发一种更稳健、准确的生态位轨迹分析方法,以克服现有方法对细胞类型注释的依赖 | 组织微环境(生态位)的空间连续变化 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 基于核的方法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 500 | 2026-04-17 |
Latent epigenetic programs in Müller glia contribute to stress and disease response in the retina
2025-04-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.014
PMID:39753128
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,揭示了人类和小鼠视网膜发育过程中细胞类型特异性的染色质结构变化,并发现了Müller胶质细胞中的“可塑性基因”程序 | 首次在单细胞分辨率下整合scRNA-seq和scATAC-seq数据,识别出Müller胶质细胞中转录沉默但染色质可及的“可塑性基因”,这些基因在视网膜应激和疾病反应中起关键作用 | 研究主要基于发育过程,对成年或疾病状态下的可塑性基因功能验证可能有限,且样本规模未明确说明 | 探究视网膜发育过程中细胞类型特异性的染色质结构变化及其在应激和疾病反应中的作用 | 人类和小鼠视网膜细胞,特别是Müller胶质细胞 | 表观遗传学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞ATAC测序(scATAC-seq),批量测序 | NA | 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据,批量测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |