单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 39758 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 481 | 2026-05-24 |
Endothelial cells are a key target of IFN-g during response to combined PD-1/CTLA-4 ICB treatment in a mouse model of bladder cancer
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107937
PMID:37810214
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术，在膀胱癌小鼠模型中探究联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗后不同细胞类型的应答机制，发现内皮细胞是IFN-γ信号的关键靶点 | 首次通过单细胞分辨率揭示内皮细胞中IFN-γ信号在联合ICB治疗中的关键作用，并利用基因敲除实验验证其功能 | 仅在小鼠模型中进行验证，缺乏人类样本数据，且未深入探究内皮细胞IFN-γ信号下游的具体分子机制 | 探索联合PD-1/CTLA-4 ICB治疗在不同细胞类型中的应答机制 | 膀胱癌小鼠模型中的肿瘤细胞、内皮细胞及CD4 T细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞基因表达数据 | 三种条件下的肿瘤组织样本：未治疗、治疗后、CD4 T细胞清除后治疗 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 482 | 2026-05-24 |
Cloning a profibrotic stem cell variant in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-04-26, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abp9528
PMID:37099633
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研究论文 | 通过单细胞克隆技术从特发性肺纤维化患者远端肺中鉴定出一种促纤维化干细胞变体，该变体能够转化正常肺成纤维细胞并激活肌成纤维细胞，其基因表达网络与器官纤维化相关 | 首次通过单细胞克隆技术鉴定出特发性肺纤维化中一种促纤维化干细胞变体，该变体在正常和胎儿肺中低量存在，但具有转化正常成纤维细胞为致病性肌成纤维细胞的能力，并筛选出表皮生长因子和雷帕霉素靶蛋白信号通路抑制剂作为潜在治疗靶点 | 未明确说明研究的局限性，但可能包括样本量有限、体外实验与体内微环境的差异、以及干细胞变体在疾病中的确切致病机制仍需进一步验证 | 揭示特发性肺纤维化中肺基底干细胞异质性的致病机制，鉴定促纤维化干细胞变体及其治疗靶点 | 16例特发性肺纤维化患者和10例对照者的远端肺基底干细胞 | 机器学习和数字病理学 | 特发性肺纤维化，慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞克隆技术 | NA | 基因表达数据 | 16例特发性肺纤维化患者和10例对照者的远端肺样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 483 | 2026-05-24 |
Human ureteric bud organoids recapitulate branching morphogenesis and differentiate into functional collecting duct cell types
2023-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01429-5
PMID:36038632
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研究论文 | 描述了从人类多能干细胞高效无血清分化成输尿管芽类器官和功能性集合管细胞的过程 | 首次实现高效无血清分化人类多能干细胞为输尿管芽类器官，其展现类似胎儿输尿管芽的分支形态发生，并能分化出功能性集合管细胞类型 | 未提及具体局限性 | 肾脏再生医学中功能性输尿管和集合管上皮的分化 | 人类多能干细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 类器官 | 基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序用于估计集合管细胞类型比例 |
| 484 | 2026-05-24 |
Reconstruction of Single-Cell Trajectories Using Stochastic Tree Search
2023-01-26, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14020318
PMID:36833245
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研究论文 | 提出一种用于单细胞轨迹重建的随机树搜索算法 | 引入惩罚似然框架和随机树搜索算法，旨在解决大且非凸树空间中的全局最优问题，相比现有方法提高了细胞排序和伪时间估计的准确性和鲁棒性 | 未明确提及局限性 | 开发更准确且鲁棒的单细胞轨迹推断方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机树搜索 | 基因表达数据 | 模拟数据和真实数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 485 | 2026-05-24 |
Transcriptome-wide association analysis identifies DACH1 as a kidney disease risk gene that contributes to fibrosis
2021-05-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI141801
PMID:33998598
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研究论文 | 通过转录组全关联分析鉴定DACH1为肾脏疾病风险基因，该基因促进纤维化 | 整合GWAS、TWAS、单细胞表观基因组、表达分析、基因编辑及小鼠模型功能验证，首次鉴定DACH1为肾脏疾病风险基因并阐明其在纤维化中的机制 | 主要基于小鼠模型和体外实验，人类验证有限；未能完全阐明DACH1在所有肾细胞类型中的具体作用 | 鉴定肾脏功能相关GWAS位点中调控基因表达的因果基因及其在疾病中的机制 | 人类和小鼠肾脏组织样本、肾小管细胞、巨噬细胞 | 自然语言处理 | 肾脏疾病 | GWAS, TWAS, 孟德尔随机化, MetaXcan, CRISPR-Cas9, 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 单细胞表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及人类GWAS数据、小鼠模型（叶酸和糖尿病肾损伤模型） | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 486 | 2026-05-24 |
A single-cell atlas of the healthy breast tissues reveals clinically relevant clusters of breast epithelial cells
2021-03-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100219
PMID:33763657
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研究论文 | 通过对健康女性乳腺活检组织进行单细胞RNA测序，创建了健康乳腺组织细胞图谱，并发现了23个乳腺上皮细胞簇，揭示了这些细胞簇与乳腺癌亚型的临床相关性 | 首次利用健康女性乳腺活检样本（而非传统上组织学异常的乳房缩小术样本）进行单细胞RNA测序，并鉴定了23个乳腺上皮细胞簇；揭示了成熟管腔细胞簇和管腔祖细胞簇基因特征在乳腺癌中的不同富集模式及其预后意义 | 未明确提及，但可推测可能包括样本量有限、单细胞测序技术本身的局限性、以及细胞簇标记基因的验证不足等 | 利用单细胞RNA测序技术构建健康乳腺组织的细胞图谱，探究乳腺上皮细胞簇与乳腺癌亚型及预后的关联 | 健康女性的乳腺活检组织样本以及约3000例乳腺癌转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康乳腺活检样本（未明确数量）及约3000例乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 487 | 2026-05-24 |
Beta-Poisson model for single-cell RNA-seq data analyses
2016-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw202
PMID:27153638
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA-seq数据的Beta-Poisson混合模型，能够捕捉基因表达的双峰分布特性，并集成到广义线性模型中用于差异表达分析 | 首次引入Beta-Poisson模型来处理单细胞RNA-seq数据中常见的双峰表达分布，优于传统的gamma-Poisson模型和现有单细胞专用方法 | 未明确提及局限性，但模型对∼90%的转录本拟合良好，仍有10%的转录本可能不适合该模型 | 开发一种新的统计模型来更好地分析单细胞RNA-seq数据的基因表达分布和差异表达 | 来自多个真实单细胞RNA-seq数据集的基因表达数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | Beta-Poisson混合模型 | 基因表达数据 | 多个真实单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 488 | 2026-05-23 |
SIRT1-NCOR2 Corepressor Modulates Trophoblast-Macrophage Interactions in Preeclampsia
2026-Jun, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 研究SIRT1-NCOR2共抑制复合物在子痫前期中调节滋养层-巨噬细胞相互作用的机制 | 首次揭示SIRT1通过招募NCOR2调控RARRES2表达，影响滋养层与巨噬细胞相互作用，并验证孕酮补充可逆转子痫前期样症状 | 未标注具体局限性，但可能涉及小鼠模型的物种差异及临床样本量限制 | 探究子痫前期中低SIRT1水平如何上调RARRES2表达，影响巨噬细胞极化和疾病发病机制 | 系统性Sirt1杂合敲除小鼠、滋养层特异性Sirt1敲除（cKO）小鼠、子痫前期患者血浆 | 数字病理学 | 妊娠期高血压疾病（子痫前期） | 单细胞测序、共培养实验、荧光素酶报告基因、染色质免疫沉淀、质谱分析、免疫沉淀 | NA | 测序数据、细胞实验数据、动物模型数据、临床样本数据 | 包含小鼠模型（具体数量未提及）及子痫前期患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 489 | 2026-05-23 |
Endothelial prolyl hydroxylase 3 mitigates maladaptive inflammation to promote post-ischemic kidney repair
2026-Jun, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.017
PMID:41692346
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研究论文 | 研究内皮细胞脯氨酰羟化酶3在急性肾损伤后修复中的作用机制 | 首次揭示内皮PHD3作为关键氧感受器，通过抑制干扰素-γ驱动的内皮激活来保护肾脏免受适应不良性炎症，促进组织修复并限制AKI向CKD的转变 | 主要基于小鼠模型和人类样本的单细胞分析，具体机制在人体内的验证尚需进一步研究 | 探究内皮氧感受（特别是PHD3）在急性肾损伤后肾脏修复中的作用 | 小鼠（条件性基因敲除品系）和人类肾脏样本 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、体外实验数据 | 两种独立人类数据集及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 490 | 2026-05-23 |
The splenic norepinephrine-β2-adrenergic receptor axis aggravates sepsis-associated acute kidney injury via neutrophil-mediated immunosuppression
2026-Jun, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.024
PMID:41724376
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研究论文 | 该文章揭示了脾脏去甲肾上腺素-β2肾上腺素能受体轴通过中性粒细胞介导的免疫抑制加重脓毒症相关急性肾损伤的机制 | 首次阐明脾脏NE/β2-AR信号在SA-AKI中通过调节中性粒细胞前列腺素E2合成及T辅助细胞1抑制的免疫抑制机制 | 未提及具体限制 | 阐明脾脏神经免疫调控在脓毒症相关急性肾损伤中的作用机制 | 脾脏去甲肾上腺素-β2肾上腺素能受体轴及中性粒细胞 | 数字病理学 | 脓毒症相关急性肾损伤 | 单细胞测序, 条件基因敲除 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 491 | 2026-05-23 |
Autocrine SFRP2 (secreted frizzled related protein 2) enhances lung myofibroblast fibrogenic activity by suppressing PINK1-mediated mitophagy initiation
2026-Jun, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2026.2642341
PMID:41789512
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现SFRP2在IPF肺肌成纤维细胞中高表达，并揭示其通过抑制PINK1介导的线粒体自噬启动来增强肺肌成纤维细胞的纤维化活性 | 首次定义了一个新型的自分泌SFRP2-线粒体自噬调控轴，该轴持续激活肌成纤维细胞，并作为肺纤维化的潜在治疗靶点 | 目前文章未明确提及局限性，但可能包括模型仅限于小鼠、未在人体样本中验证治疗干预等 | 探究特发性肺纤维化中肌成纤维细胞持续激活的调控机制 | IPF患者肺组织、小鼠肺纤维化模型、原代小鼠肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、腺相关病毒载体、中和抗体、自噬诱导剂 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及IPF患者肺组织样本和小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'（推测） |
| 492 | 2026-05-23 |
Epigenetic and Transcriptional Regulatory Networks Underlying Psoriasis Pathogenesis
2026-Jun, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.03.003
PMID:41856313
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综述 | 本文综述了表观遗传调控在银屑病发病机制中的作用，包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA，并探讨了环境因素、诊断工具和治疗策略 | 整合了表观遗传学与遗传风险、环境触发因素及精准治疗策略的联系，并强调了单细胞表观基因组学和空间转录组学等新型诊断工具的应用潜力 | 临床前模型的预测价值有限，且表观遗传谱存在个体差异，限制了研究结果的转化 | 阐明表观遗传调控在银屑病病理生理中的核心作用，并探索其作为精准医学框架的桥梁价值 | 银屑病相关的表观遗传机制（DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA）及环境因素（紫外线、空气污染） | 自然语言处理 | 银屑病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞表观基因组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 493 | 2026-05-23 |
Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell Transcriptomics Identifies Prognostic Biomarkers in Breast Cancer Metastasis
2026-Jun, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11228-7
PMID:40828203
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研究论文 | 通过整合批量与单细胞转录组数据，识别乳腺癌转移相关的预后生物标志物 | 首次结合批量微阵列与单细胞RNA测序数据，发现PRC1和POLR3H作为乳腺癌转移的新型预后标志物 | 未提供具体局限信息 | 识别乳腺癌转移的预后相关基因标志物 | 乳腺癌转移相关的差异表达基因及其在恶性上皮和EMT细胞中的表达 | 机器学习 | 乳腺癌 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 三个公共微阵列数据集（GSE14776、GSE103357、GSE32489）及一个单细胞RNA测序数据集（GSE180286） | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 494 | 2026-05-23 |
SYT8 Drives Colorectal Cancer Progression and Immune Evasion via the SETD1A-H3K4me3 Axis
2026-Jun, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.03.006
PMID:41881308
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研究论文 | 通过整合多组学数据，发现SYT8通过SETD1A-H3K4me3轴驱动结直肠癌进展和免疫逃逸 | 首次揭示SYT8通过SETD1A-H3K4me3正反馈环路促进结直肠癌增殖、侵袭及免疫微环境重塑 | 研究主要基于体外实验和公共数据库分析，缺乏体内验证及临床试验数据 | 探究SYT8在结直肠癌中的作用机制及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 结直肠癌患者肿瘤样本及细胞系 | 数字病理学, 机器学习 | 结直肠癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫荧光, 免疫共沉淀-质谱 | NA | 转录组数据 | TCGA、GEO及自建结直肠癌队列数据 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 495 | 2026-05-23 |
Chemotherapy-induced reactive myelopoiesis promotes expansion of immunosuppressive neutrophil-like monocytes in mice and humans
2026-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198360
PMID:41945895
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研究论文 | 化疗诱导的反应性骨髓生成促进免疫抑制性中性粒细胞样单核细胞在小鼠和人类中扩增 | 通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术，揭示化疗药物环磷酰胺诱导骨髓生成产生中性粒细胞样单核细胞（NeuMo）的分子特征，并确认其在人类中的保守免疫调节反馈机制 | 对CTX诱导的骨髓生成的分子机制理解仍有限，且NeuMo细胞在肿瘤对化学免疫治疗反应中的临床意义尚待进一步研究 | 研究化疗诱导的反应性骨髓生成及其对免疫抑制性单核细胞扩增的影响 | 化疗（环磷酰胺）处理的小鼠和接受含环磷酰胺化疗的淋巴瘤患者 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 小鼠骨髓单核细胞（具体数量未说明），公共数据库中化疗治疗的癌症患者数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 |
| 496 | 2026-05-23 |
Inhibiting VTCN1 overcomes immunosuppression in colorectal cancer to activate T cells via galectin-3
2026-05-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00323.2025
PMID:41778365
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研究论文 | 通过整合多组学分析，揭示VTCN1-半乳糖凝集素3轴在结直肠癌免疫抑制中的作用，并验证VTCN1抑制剂SGN-B7H4可恢复T细胞功能并抑制肿瘤进展 | 首次阐明VTCN1通过调控半乳糖凝集素3介导T细胞功能障碍的免疫检查点机制，并证明靶向该通路可逆转结直肠癌免疫治疗耐药 | 未明确提及研究局限性 | 探索VTCN1-半乳糖凝集素3轴在结直肠癌免疫抑制中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌细胞及T细胞（包括小鼠模型和细胞实验） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | 多组学数据（单细胞、转录组、蛋白质组） | 体外实验：结直肠癌细胞系；体内实验：小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 497 | 2026-05-23 |
Single-cell transcriptomics reveals that air-liquid interface culture promotes goblet cell differentiation and inhibits glycolysis in organoid cell monolayers
2026-05-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00251.2025
PMID:41830459
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示气液界面培养促进肠道类器官单层中杯状细胞分化并抑制糖酵解 | 首次利用单细胞RNA测序系统比较了浸没培养和气液界面培养条件下兔盲肠类器官的细胞异质性，发现ALI培养能显著增强分泌谱系分化并更接近体内转录组特征 | BEST4细胞在类器官中未能检测到，表明ALI条件仍无法完全重现体内所有上皮细胞类型 | 阐明气液界面培养对肠道类器官上皮细胞类型特异性基因表达的影响及代谢机制 | 兔盲肠来源的类器官单层细胞（浸没培养和气液界面培养）及体内兔盲肠上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 兔盲肠类器官样本（浸没和气液界面两种条件）及体内兔盲肠上皮样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 498 | 2026-05-21 |
Corrigendum to: Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals endoplasmic reticulum stress-related CAF subpopulations associated with chordoma progression
2026-May-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf159
PMID:40719554
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 499 | 2026-05-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals HMGA2 involvement in neoplastic aggressiveness and endothelial cell senescence in chondrosarcoma
2026-Apr-11, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10188-x
PMID:41964890
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示HMGA2在软骨肉瘤肿瘤侵袭性和内皮细胞衰老中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析高低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤和瘤旁组织的细胞异质性，发现HMGA2调控恶性表型并与不良预后相关，同时揭示SPP1和HBEGF在肿瘤细胞与内皮细胞通讯中的新机制 | 研究基于有限临床样本，公共数据集验证可能受批次效应影响，功能实验仅在体外和动物模型中进行 | 解析软骨肉瘤肿瘤微环境的细胞异质性，寻找潜在治疗靶点 | 高低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤和瘤旁组织的临床样本 | 单细胞转录组学 | 软骨肉瘤 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 高低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤和瘤旁组织临床标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 500 | 2026-05-23 |
DUSP5 suppresses esophageal squamous cell carcinoma by counteracting macrophage-derived AREG-ERK1/2 signaling and disrupting an oncogenic ERK1/2-ELK1-DUSP5 feedback circuitry
2026-Apr-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08641-0
PMID:41956999
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合体内外模型，揭示了DUSP5通过抑制肿瘤浸润巨噬细胞来源的AREG-ERK1/2信号通路及破坏致癌性ERK1/2-ELK1-DUSP5正反馈回路来抑制食管鳞癌进展的分子机制 | 首次阐明DUSP5在食管鳞癌中充当肿瘤抑制因子，并发现其受ERK1/2下游转录因子ELK1负调控，形成致癌性反馈回路；同时揭示了APOC⁺巨噬细胞通过AREG-EGFR轴促进肿瘤生长的免疫微环境机制 | 未明确提及具体研究限制 | 探究DUSP5在食管鳞癌中的功能及肿瘤免疫微环境中的调控机制 | 食管鳞癌细胞系、小鼠异种移植模型及致癌物诱导的DUSP5敲除小鼠 | 数字病理学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序、Western blot、细胞增殖/凋亡/迁移检测、小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组分析、基因表达谱 | 单细胞转录组数据、临床组织样本数据 | 未明确提及样本量，涉及多个细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |