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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
481 2026-06-08
autoFISH: a modular toolbox for sequential single-molecule RNA FISH experiments
2026-Apr-06, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 autoFISH是一种模块化工具箱,用于进行顺序单分子RNA FISH实验,旨在通过开源硬件、易用控制软件和整合分析工具降低设备成本和实验复杂性 提出了一个低成本、用户友好的自动化单分子RNA FISH平台,包含开源硬件组件、可访问的控制软件和集成分析工具,并优化了保存核结构的组织透明化方法 未提及具体局限性 开发一种经济实惠、易于使用的自动化单分子RNA FISH平台,以推动空间转录组学研究 多种细胞类型和组织样本 数字病理学 NA 单分子荧光原位杂交 (smFISH) NA 图像 多种细胞类型和组织样本(具体数量未提及) NA 单分子RNA FISH autoFISH 开源硬件组件、控制软件和集成分析工具的自动化平台
482 2026-06-08
Genetic insights into therapeutic targets for gestational diabetes mellitus: a multi-omics analysis
2026-Apr, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 通过多组学分析识别妊娠期糖尿病的潜在药物靶点 整合了cis-eQTL、cis-pQTL、孟德尔随机化、单细胞RNA测序等多组学方法,首次系统鉴定出5个与GDM风险因果相关的可成药基因,并验证其组织及细胞类型特异性表达 未提及具体局限性 为妊娠期糖尿病寻找遗传学支持的药物靶点,推动机制导向的治疗和精准预防策略 妊娠期糖尿病相关基因及其在胎盘组织中的表达模式 自然语言处理 妊娠期糖尿病 孟德尔随机化、顺式表达数量性状位点分析、顺式蛋白质数量性状位点分析、单细胞RNA测序 NA 表达定量数据、蛋白质定量数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
483 2026-06-08
The transcription factor Tcf21 is necessary for adoption of cell fates by Foxd1+ stromal progenitors during kidney development
2026-Apr-01, American journal of physiology. Renal physiology
研究论文 该研究通过单细胞测序和染色质可及性分析,揭示了转录因子Tcf21在肾脏发育中调控Foxd1+基质祖细胞命运决定的关键作用,其缺失会导致基质细胞分化异常、纤维化重塑及肾功能障碍 首次通过整合单细胞转录组、单细胞ATAC-seq和免疫组化等多模态数据,系统阐明Tcf21在肾脏基质祖细胞命运决定中的核心调控机制,并建立早期发育缺陷与成年期纤维化疾病的直接关联 研究主要基于小鼠模型,人类肾脏发育中的Tcf21功能尚需验证;未进行谱系追踪来证实异常Emcn+细胞的最终命运;未阐明Tcf21下游直接靶基因的调控网络 探究转录因子Tcf21在肾脏发育中调控Foxd1+基质祖细胞命运决定的分子机制 胚胎E14.5和E18.5期Tcf21条件性敲除小鼠的Foxd1谱系细胞及对照肾脏 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫组化 NA 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据, 组织病理图像 E14.5和E18.5期Tcf21条件性敲除及对照小鼠肾脏样本(具体数量未明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台
484 2026-06-08
YAP1-driven tumor-like cancer-associated fibroblasts modulate biomechanics of pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序鉴定出肿瘤样癌相关成纤维细胞(tCAFs)亚群,并揭示YAP1驱动其调控胰腺导管腺癌生物力学特性的机制 首次发现YAP1驱动的肿瘤样癌相关成纤维细胞(tCAFs)亚群及其在基质重塑和疾病进展中的关键作用;结合磁共振弹性成像(MRE)无创量化肿瘤硬度 未明确说明研究局限性 探究YAP1与癌相关成纤维细胞(CAFs)亚型在胰腺导管腺癌基质重塑中的相互作用及机制 胰腺导管腺癌患者及KPC小鼠模型中的肿瘤组织、CAFs亚群、细胞外基质(ECM) 数字病理学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序、磁共振弹性成像 NA 单细胞转录组数据、弹性成像数据 包括PDAC患者和KPC小鼠模型,具体样本量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
485 2026-06-08
Mechanical Strain-Programmed SDC1+ Sheath Fibroblasts Trigger CXCR4hi Neutrophil-Mediated Enthesitis in Ankylosing Spondylitis
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过构建机械应变相关的强直性脊柱炎小鼠模型,结合单细胞RNA测序图谱,揭示了SDC1+鞘成纤维细胞与CXCR4hi中性粒细胞在肌腱端炎发病中的关键作用及分子机制 首次在单细胞水平鉴定出机械应变诱导的疾病特异性SDC1+鞘成纤维细胞亚群,并阐明其通过CXCL5-CXCR4轴招募和激活中性粒细胞形成胞外诱捕网加剧肌腱端炎,同时发现SOX5增强子和超级增强子调控该细胞命运分支 研究主要基于SKG小鼠模型,结论在人体组织中的验证尚待进一步开展;机械应变的具体物理刺激参数及其下游信号转导的完整网络仍需深入解析 阐明机械应变相关强直性脊柱炎肌腱端炎的细胞互作和分子机制 实验性脊柱关节炎SKG小鼠及其后足加载/卸载模型中的滑膜组织细胞 计算生物学 强直性脊柱炎 单细胞RNA测序、慢病毒介导的基因沉默、中和抗体治疗 NA 单细胞转录组数据 实验性脊柱关节炎SKG小鼠后足组织样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞测序平台用于构建机械应变相关AS肌腱端炎的单细胞转录组图谱
486 2026-06-08
Decoding schizophrenia through postmortem human brain transcriptomics
2026-Apr, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2
综述 通过对死后人脑转录组分析,揭示精神分裂症的分子病理机制 整合大量死后脑组织转录组数据,从单细胞分辨率揭示精神分裂症中细胞类型特异性和个体异质性的基因表达变化,尤其发现上层层兴奋性神经元易受损伤 死后组织分析固有方法学挑战,如样本质量、降解等影响结论稳健性 阐明精神分裂症的分子特征和病理生理学机制 精神分裂症患者死后脑组织样本 数字病理学 精神分裂症 转录组测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
487 2026-06-08
Exosome-related lactylation gene signature defines diagnostic biomarkers of periodontitis through integrative bulk and single-cell transcriptomics
2026-Apr, Archives of oral biology IF:2.2Q2
research paper 通过整合bulk和单细胞转录组数据建立了基于外泌体相关乳酸化修饰基因的牙周炎诊断模型 首次建立基于外泌体相关乳酸化修饰基因的牙周炎诊断模型,并利用单细胞RNA测序揭示乳酸化修饰在牙周炎不同细胞类型中的异质性和细胞特异性重构 未提及明显局限性 探索外泌体相关乳酸化修饰基因作为牙周炎的潜在诊断标志物 牙周炎患者与健康对照的组织样本和单细胞数据 machine learning geriatric disease RNA-seq CNN image, text 训练队列和两个独立验证队列,具体样本数未在摘要中提及 NA single-cell RNA-seq NA NA
488 2026-06-08
Efferocytosis deficiency exacerbates local inflammation and predicts recurrence in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2026-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 揭示胞葬作用缺陷在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中加剧局部炎症并预测复发 首次系统地表征慢性鼻窦炎中胞葬作用缺陷,并鉴定出5分子标志物面板用于预测鼻息肉复发 NA 探究胞葬作用在慢性鼻窦炎中的作用及其与炎症内型和临床结局的关联 慢性鼻窦炎患者鼻息肉组织与健康鼻黏膜组织 数字病理学 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 实时定量PCR,免疫组化,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 未明确提及样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 公共单细胞RNA测序数据
489 2026-06-08
Single-cell RNA-seq reveals cellular dynamics and emergency hematopoiesis in banana shrimp Penaeus merguiensis hemocytes upon Yellow Head Virus infection
2026-Apr, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示了香蕉虾血细胞在黄头病毒(YHV)感染下的细胞动态和应急造血过程 首次通过单细胞RNA测序构建了香蕉虾血细胞在YHV感染下的高分辨率转录组图谱,鉴定了8个血细胞簇,并揭示了病毒诱导的成熟免疫细胞耗竭和未成熟祖细胞簇扩增的应急造血机制 未在标题和摘要中明确提及局限性,可能缺乏对病毒-宿主相互作用下游机制的验证或实验重复 阐明香蕉虾血细胞在黄头病毒感染下的细胞免疫动态和应急造血应答机制 香蕉虾(Penaeus merguiensis)血细胞 单细胞转录组学 黄头病毒感染 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 13个主要组织整合参考转录组以及正常和YHV感染状态下的血细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
490 2026-06-08
Unraveling dengue virus-host interactions through transcriptomics: Insights into disease progression and severity signatures
2026-Apr, Microbial pathogenesis IF:3.3Q2
综述 综述转录组学技术(包括微阵列、bulk RNA-seq、scRNA-seq、ViscRNA-seq和空间转录组学)在揭示登革病毒与宿主相互作用机制及疾病进展与严重性标志方面的研究进展 系统整合了多种转录组学技术(尤其是单细胞和空间转录组学)在登革病毒研究中的应用,强调了病毒-宿主相互作用的动态和空间特征 综述依赖已发表研究,可能缺乏最新数据整合;未深入探讨技术差异对结果一致性的影响 阐明转录组学如何揭示登革病毒调控宿主基因表达的机制,并识别与疾病进展和严重性相关的生物标志物及治疗靶点 登革病毒感染的宿主细胞及动物模型 自然语言处理 登革热 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
491 2026-06-08
The CD74-MIF axis contributes to acute uveitic injury by upregulating proinflammatory cytokine secretion in murine cytomegalovirus intracameral infection mouse models
2026-Apr, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究探讨了CD74-MIF轴在小鼠巨细胞病毒眼内感染模型中通过上调促炎细胞因子分泌加重急性葡萄膜炎损伤的机制 首次揭示CD74-MIF轴在小鼠巨细胞病毒眼内感染驱动的急性葡萄膜炎中的关键作用,并证明其通过促进促炎细胞因子分泌加剧眼内炎症 NA 阐明CD74-MIF轴在小鼠巨细胞病毒眼内感染诱导的急性葡萄膜炎损伤中的作用机制 小鼠巨细胞病毒眼内感染模型中的C57BL/6和BALB/c小鼠 NA 急性葡萄膜炎 单细胞测序 NA 基因表达数据 两种小鼠品系(C57BL/6和BALB/c) NA 单细胞RNA测序 NA NA
492 2026-06-08
YTHDF2-orchestrated m6A methylation of BECN1 induces Scoparone-mediated hepatic stellate cell ferroptosis to attenuate liver fibrosis
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 该文章研究了Scoparone通过YTHDF2介导的BECN1 m6A甲基化诱导肝星状细胞铁死亡来减轻肝纤维化的分子机制 首次揭示了Scoparone通过m6A表观转录组调控肝星状细胞铁死亡来抗肝纤维化的新机制,特别是YTHDF2识别BECN1 mRNA的m6A甲基化位点促进其翻译的发现 未提及具体局限性 阐明Scoparone通过m6A表观转录组调控肝星状细胞铁死亡来改善肝纤维化的分子机制 小鼠肝纤维化模型和人类肝星状细胞 机器学习 肝纤维化 单细胞测序, 空间转录组测序, 转录组测序, 免疫沉淀, 激光共聚焦 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 小鼠肝纤维化模型和人类肝纤维化组织标本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组测序
493 2026-06-08
Inhibiting Endoplasmic Reticulum/Plasma Membrane contact ameliorates endometrial fibrosis by preventing senescence in endometrial epithelial cells
2026-Apr, Free radical biology & medicine
研究论文 首次对小鼠宫腔粘连模型进行单细胞RNA测序,发现内质网/质膜接触通过STIM1/Orai1通道诱导子宫内膜上皮细胞衰老,促进内膜纤维化 首次将单细胞RNA测序应用于小鼠宫腔粘连模型,揭示了内质网/质膜接触通过STIM1/Orai1钙通道诱导子宫内膜上皮细胞衰老的新机制 目前发病机制尚未完全阐明,缺乏有效疗法且复发率高 阐明宫腔粘连的发病机制并探索新治疗策略 小鼠宫腔粘连模型的子宫内膜上皮细胞 数字病理学 妇科疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠宫腔粘连模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 或其他兼容试剂盒
494 2026-06-08
Complementary multi-omics profiling of chronic thromboembolic pulmonary hypertension reveals immune cell alterations, epigenetic changes, and genetically supported candidate genes
2026-Apr, Animal models and experimental medicine IF:3.8Q2
研究论文 整合多组学数据揭示慢性血栓栓塞性肺动脉高压的免疫细胞改变、表观遗传变化及遗传支持候选基因 首次结合单细胞RNA测序、DNA甲基化分析和孟德尔随机化研究,多组学整合揭示CTEPH的免疫细胞组成变化、表观遗传调控异常及遗传支持的候选基因 未提及样本量及外部验证队列,部分发现需进一步功能验证 探索慢性血栓栓塞性肺动脉高压的分子标志物和致病机制 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者 机器学习和计算生物学 肺动脉高压 单细胞RNA测序、DNA甲基化分析 NA 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据、遗传变异数据 未明确提及样本量 NA 单细胞RNA测序, 甲基化测序 NA NA
495 2026-06-08
FAM216A and CCDC166 are not essential for male fertility
2026-Mar-31, Reproduction, fertility, and development
研究论文 通过基因敲除小鼠模型研究了FAM216A和CCDC166在雄性生育力中的作用 首次系统评估了睾丸富集基因FAM216A和CCDC166在哺乳动物中的保守性及其对雄性生育功能的影响 仅在特定实验条件下评估了基因功能,未考虑其他生理过程或疾病状态下的潜在作用 探究睾丸富集基因FAM216A和CCDC166在雄性生育力中的功能及潜在冗余机制 FAM216A和CCDC166基因敲除小鼠模型 机器学习 NA 基因敲除、单细胞转录组测序、RT-PCR、组织化学染色 NA 单细胞转录组数据 基因敲除小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
496 2026-06-08
Comparison with Ezh2 reveals the PRC2-dependent functions of Jarid2 in hematopoietic stem Cell lineage commitment
2026-Mar-10, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 通过比较Jarid2和Ezh2的缺失效应,揭示Jarid2在造血干细胞谱系特化中的PRC2依赖功能 首次通过比较Jarid2与Ezh2遗传缺陷小鼠的干/祖细胞,系统解析Jarid2在造血中的PRC2依赖与非依赖功能,结合单细胞转录组学揭示其限制髓系分化潜力的核心PRC2依赖作用 未明确说明非PRC2依赖功能的具体机制,且研究仅限于小鼠模型,人类造血系统的适用性尚需验证 阐明Jarid2在造血干细胞谱系特化中PRC2依赖与非依赖功能的区分 小鼠多能祖细胞和造血干/祖细胞 机器学 NA 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 Jarid2和Ezh2基因缺陷小鼠的骨髓细胞,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
497 2026-06-08
In situ spatial transcriptomics reveals novel markers of the limbal stem cell niche and ocular surface epithelia
2026-Mar-10, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 利用原位空间转录组学揭示角膜缘干细胞龛及眼表上皮的新标志物 首次通过组织原位空间转录组学技术,在保持细胞空间位置的情况下识别出Krt16和Nkiras1分别为角膜缘干细胞和中性粒细胞的新型标志物,克服了单细胞RNA测序丢失空间信息的局限性 未明确说明 利用空间转录组学技术鉴定角膜缘干细胞龛和眼表上皮的新型分子标志物,以改善角膜缘干细胞缺乏症的治疗 哺乳动物角膜缘干细胞龛和眼表上皮组织 空间转录组学 角膜缘干细胞缺乏症 RNA-seq, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间表达数据 NA NA 空间转录组学 NA 组织原位空间转录组学技术
498 2026-06-08
Identification of a potential relationship between pigmented villonodular synovitis and atherosclerosis using comprehensive bioinformatics analyses
2026-Mar, Biomarkers : biochemical indicators of exposure, response, and susceptibility to chemicals IF:2.0Q4
研究论文 通过综合生物信息学分析,探究色素沉着绒毛结节性滑膜炎与动脉粥样硬化之间的潜在关系 首次利用生物信息学方法结合公共数据库,系统性地揭示了PVNS与AS之间的共享基因和免疫机制,并识别出CSF2RB作为关键诊断和治疗靶点 研究基于公共数据集,样本量有限,且缺乏独立的队列验证;机制分析依赖于生物信息学预测,需进一步实验验证 探究色素沉着绒毛结节性滑膜炎的发病机制及其与动脉粥样硬化的潜在关联 色素沉着绒毛结节性滑膜炎和动脉粥样硬化患者 生物信息学 色素沉着绒毛结节性滑膜炎和动脉粥样硬化 生物信息学分析、免疫组织化学、单细胞RNA-seq 机器学习 基因表达数据(微阵列和scRNA-seq) 基于多个公共数据集(GSE3698、GSE28829、GSE100927、GSE155527),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
499 2026-06-08
Experimental study of tumor-associated macrophage-derived SPP1 inhibit CD8+ T cells to promote Colorectal cancer progression
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 使用单细胞RNA测序和空间转录组学分析,发现肿瘤相关巨噬细胞来源的SPP1通过抑制CD8+ T细胞分化促进结直肠癌进展 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学鉴定出高表达SPP1的TAM亚群,并揭示其通过CD44介导的信号抑制CD8+ T细胞分化为Tc1细胞的新机制 未说明,从摘要推断为NA 阐明肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌免疫调节中的具体作用 结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞、MC38细胞系和小鼠模型 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 小鼠模型(MC38细胞和氯膦酸脂质体处理的巨噬细胞耗竭模型) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
500 2026-06-08
WDR72 Is Required for Urinary Acidification and Normal H+-ATPase Activity in Intercalated Cells in Mice
2026-Mar, Acta physiologica (Oxford, England)
研究论文 本研究探讨WDR72在肾脏酸化过程中的作用及其对H+-ATP酶活性的调控机制 首次发现WDR72是A型插入细胞依赖性尿液酸化的关键调控因子,并揭示了性别特异性代谢表型的新机制 未阐明WDR72调控H+-ATP酶活性的具体分子机制,且仅在小鼠模型中验证 研究WDR72在肾脏酸碱平衡中的作用及其表达定位 人类和小鼠肾脏组织、Wdr72基因敲除小鼠 机器学习 远端肾小管酸中毒 单细胞转录组测序、免疫组化、微灌注 NA 基因表达数据、蛋白定位数据 人肾组织样本(数量未说明)、小鼠(雌雄各若干) NA 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据分析人类和鼠类肾脏细胞的WDR72表达
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