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当前共找到 40705 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-06-17 |
A Novel Low-Dimensional Sparse and Low-Rank Representation Method for Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3674992
PMID:41843533
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研究论文 | 提出一种名为LDSLRR的新方法，通过整合降维、自表示矩阵构建和聚类过程到端到端模型中，实现单细胞RNA测序数据的精确聚类 | 将降维、自表示矩阵构建和聚类过程整合为一个端到端模型，同时优化三个模块以提高聚类准确性 | 未提及 | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 低秩表示(LRR)、稀疏约束、非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 482 | 2026-06-17 |
Rudolf Buchheim Award 2026: Toward a ToxAtlas of carbon-based nanomaterials: single-cell RNA sequencing reveals initiating cell circuits in pulmonary inflammation
2026-May, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05170-7
PMID:41848856
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研究论文 | 该论文利用单细胞RNA测序技术构建碳基纳米材料肺部炎症起始细胞图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统解析碳基纳米材料暴露后肺部炎症的起始事件及涉及的细胞类型，建立理化性质与细胞特异性炎症反应的关联图谱 | NA | 揭示碳基纳米材料引发呼吸道炎症的起始机制及关键细胞类型 | 碳基纳米材料（类烟尘碳纳米颗粒、柔性双壁碳纳米管、针状多壁碳纳米管）暴露的小鼠肺部细胞 | 数字病理学 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 483 | 2026-06-17 |
Defocus coding and transcriptomic remodeling in the mouse myopic retina
2026-05-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00011.2026
PMID:41910002
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研究论文 | 本研究通过全细胞记录和单细胞RNA测序，揭示了小鼠视网膜如何感知光学离焦并将其转化为调节生长的遗传信号 | 首次发现外侧视网膜的水平细胞而非内侧视网膜的AII无长突细胞对光学离焦有反应，并揭示多巴胺能无长突细胞在不同聚焦状态下受到差异性调控，以及透镜诱导近视视网膜中细胞类型特异性的基因表达重塑 | 未明确指出限制，但研究仅在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类；此外，透镜诱导近视模型可能不能完全模拟自然条件下近视发展的复杂性 | 探究视网膜如何感知聚焦与离焦信号，并将其转化为调控生长的遗传信号，以理解近视的视觉引导性眼球生长机制 | 小鼠视网膜细胞，包括水平细胞、AII无长突细胞、多巴胺能无长突细胞等 | 机器学习 | 近视 | 全细胞记录、单细胞RNA测序 | NA | 电生理数据、单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜样本，具体数量在摘要中未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 484 | 2026-06-17 |
Renal involvement in systemic sclerosis
2026-May, Best practice & research. Clinical rheumatology
DOI:10.1016/j.berh.2026.102138
PMID:41946628
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综述 | 系统综述系统性硬化症肾受累的流行病学、病理生理、临床表现、诊断与管理策略，并探讨精准医学、单细胞测序等新兴研究方向 | 整合单细胞测序、分子分型及补体靶向治疗等前沿技术，提出系统性硬化症肾受累的精准医疗新方向 | 未明确说明具体研究样本量及数据来源，可能受限于综述类型对原始数据的整合深度 | 系统性分析系统性硬化症肾受累的全方位特征，指导临床优化管理 | 系统性硬化症患者的肾并发症（包括硬皮病肾危象、肾衰竭、继发性肾损伤） | 数字病理学 | 风湿免疫病 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 485 | 2026-06-17 |
Robust Algorithm With Contrastive Learning for Identifying Spatial Domains From Noised Spatial Transcriptomics Data
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3683521
PMID:42247557
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研究论文 | 提出一种名为jNFACL的鲁棒算法，用于从含噪声的空间转录组数据中识别空间域，将去噪和识别任务同时集成 | 首次将噪声分离和空间域识别整合为统一框架，通过联合网络特征-亲和度对比学习在特征层面分离噪声，并利用自监督对比学习增强斑点特征质量 | 未明确讨论，但可能对极高噪声或复杂组织类型的适应性有限，且计算复杂度未详细分析 | 提高含噪声空间转录组数据中空间域识别的准确性和鲁棒性 | 空间转录组数据中的斑点（spots）及其对应基因表达和空间坐标 | 机器学习 | 不适用 | 空间转录组学 | 联合网络特征-亲和度对比学习框架 | 基因表达数据和空间坐标数据 | 多个平台和物种的不同噪声水平数据集 | 10x Genomics, Illumina, BGI, MGI | 空间转录组学 | 10x Visium, Illumina NovaSeq, BGI MGISEQ, MGI DNBSEQ | 10x Visium FFPE等平台的具体配置未详细说明 |
| 486 | 2026-06-17 |
Single-cell phenotype-associated subpopulation identification via transfer foundation model and statistical ensemble learning
2026-Apr-29, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02613-8
PMID:42050525
|
研究论文 | 提出scPASI方法，整合单细胞与批量信息，识别与表型相关的细胞亚群 | 结合预训练基础模型与残差变分自编码器，以及LASSO和稀疏组LASSO回归，将细胞分为四种不同表型关联程度的亚群 | NA | 建立单细胞转录组与表型之间的关联，识别疾病相关的细胞亚群 | 肿瘤状态、基因突变及临床预后等表型相关的细胞亚群 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 预训练基础模型、残差变分自编码器、LASSO、稀疏组LASSO | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 多个不同数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 487 | 2026-06-17 |
Single-cell transcriptomics reveals ADRB1 as a key immune checkpoint regulating T cell exhaustion in lung cancer and its prognostic value in lung cancer
2026-Apr-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05112-y
PMID:42056648
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了ADRB1作为肺癌中调控T细胞耗竭的关键免疫检查点及其预后价值 | 首次将ADRB1描述为一种参与肺癌T细胞耗竭的新型免疫检查点，并基于ADRB1+ T细胞特征进行预后建模 | 需要进行功能研究和临床试验来验证和讨论这一提出的概念 | 探索ADRB1在肺癌中作为免疫检查点调控T细胞耗竭的作用及其预后价值 | 肺腺癌和肺鳞癌患者的肿瘤及邻近非肿瘤组织中的T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 488 | 2026-06-17 |
Integrated Genomic and Single-Cell Analysis Identifies Notch1 as a Metastasis Suppressor in Nasopharyngeal Carcinoma Targeted by the AKT/Smad3 Axis
2026-Apr-29, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-026-00341-5
PMID:42056895
|
研究论文 | 本研究系统探究Notch1作为鼻咽癌转移抑制因子的功能及其通过AKT/Smad3轴调控的分子机制 | 首次通过整合基因组与单细胞分析发现Notch1在鼻咽癌中通过AKT/Smad3轴抑制EMT和转移，并基于Notch1相关基因实现患者分子分型 | 样本量有限且主要依赖TCGA和GEO数据库，缺乏大规模临床队列验证 | 阐明Notch1在鼻咽癌侵袭和转移中的功能及分子机制 | 鼻咽癌组织样本、细胞系及裸鼠模型 | 机器学习 | 鼻咽癌 | 免疫组化, 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀 | 共识聚类 | 图像, 文本, 测序数据 | 鼻咽癌组织微阵列（具体数量未说明）、多个细胞系及裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 489 | 2026-06-17 |
Machine learning predictions surpass individual mRNAs as a proxy of single-cell protein expression
2026-Apr-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04083-1
PMID:42021407
|
研究论文 | 测试九种机器学习方法预测单细胞蛋白表达，并与单独使用mRNA进行比较 | 系统比较多种机器学习方法在单细胞蛋白表达预测中的性能，发现基于全转录组的推断能预测mRNA缺失的蛋白表达 | 模型泛化能力有限，需要高度相似的训练数据，限制了当前应用范围 | 评估机器学习方法预测单细胞蛋白表达的能力，并比较其与直接使用mRNA的准确性 | 单细胞RNA测序数据及对应的表面蛋白表达数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 九种机器学习方法（包含多种类型） | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 490 | 2026-06-17 |
Clonal biases dictate availability of colonic cancer driver mutations for transformation
2026-Apr-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71944-5
PMID:41991531
|
研究论文 | 通过靶向测序分析正常结肠腺体中的癌症驱动突变，揭示不同基因突变在组织中的克隆行为及其转化风险差异 | 首次在组织学正常的结肠腺体中系统比较五种结直肠癌驱动基因（APC、KRAS、TP53、FBXW7和CTNNB1）的突变频率、克隆动态及转化风险，并揭示FBXW7 R465C突变倾向于固定而KRAS G12突变强力促进扩增的差异机制 | 未明确说明局限性 | 探究人结肠中不同原癌事件在频率、行为及后续转化风险方面的差异 | 来自56名患者的76,800个正常结肠腺体 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 靶向测序, 空间转录组学 | NA | 测序数据, 空间转录组数据 | 56名患者的76,800个正常结肠腺体 | NA | 靶向测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 491 | 2026-06-17 |
Spatial transcriptomics of en bloc transurethral resection of bladder tumor specimens defines an invasive-front gene expression signature
2026-Apr-14, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01417-x
PMID:41981124
|
研究论文 | 使用空间转录组学分析膀胱肿瘤整块经尿道切除标本，识别出侵袭前沿的基因表达特征 | 首次利用空间转录组学技术对整块经尿道膀胱肿瘤切除标本进行分析，在保留三维肿瘤结构的前提下，识别出与非肌层浸润性膀胱癌侵袭相关的前沿基因表达特征，并发现该15基因特征与预后相关 | 样本量较小（共7例），且仅针对高风险非肌层浸润性膀胱癌，结果需在更大队列中验证 | 阐明非肌层浸润性膀胱癌向肌层浸润性膀胱癌进展的侵袭机制，并识别预后标志物 | 7例高级别非肌层浸润性膀胱癌的整块经尿道切除标本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据，批量RNA-seq数据 | 7例膀胱肿瘤整块经尿道切除标本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台，用于分析整块经尿道切除标本 |
| 492 | 2026-06-17 |
Prognostic Implications of Programmed Cell Death Ligand 1 Expression, Cluster of Differentiation 8-Positive T-Cell Infiltration, and Related Immunophenotypes in Invasive Mucinous Adenocarcinoma of the Lung: A Multicenter Study
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70710
PMID:41948454
|
研究论文 | 本研究系统评估了肺浸润性黏液腺癌中PD-L1表达和CD8阳性T细胞浸润，并建立了新的免疫表型分类 | 首次在最大样本队列中深入分析了IMA的免疫微环境，并提出四类免疫表型分类系统，具有预后和预测潜力 | 未明确提及具体局限性，但单细胞RNA-seq分析样本量较小（20例接受免疫检查点抑制剂治疗的患者） | 探索肺浸润性黏液腺癌的免疫微环境及其对免疫治疗的潜在反应 | 肺浸润性黏液腺癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | PD-L1免疫组化, CD8免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 转录组数据 | 312例纯IMA患者，其中20例接受免疫检查点抑制剂治疗 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 493 | 2026-06-17 |
Spatial Transcriptomics of Human Decidua Identifies Molecular Signatures in Recurrent Pregnancy Loss
2026-Mar-27, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf080
PMID:41031483
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研究论文 | 通过空间转录组学分析人类蜕膜，揭示复发性妊娠丢失中的分子特征 | 首次对健康供体和复发性妊娠丢失患者的早期妊娠蜕膜进行空间转录组分析，鉴定了两个不同的空间区域（植入区和腺体分泌区），并发现FOSL2是协调蜕膜自然杀伤细胞（dNK1）空间转化的关键调控因子 | 未提及具体局限性 | 阐明人类蜕膜中免疫耐受的复杂空间和调控结构，为复发性妊娠丢失中的免疫耐受失调提供新见解 | 人类早期妊娠蜕膜组织，包括健康供体和复发性妊娠丢失患者 | 数字病理学 | 复发性妊娠丢失 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据，单细胞染色质可及性数据，转录因子占用数据 | 健康供体和复发性妊娠丢失患者的早期妊娠蜕膜样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 494 | 2026-06-17 |
Spatial transcriptomics uncovers hybrid, proinflammatory, and profibrotic cellular niches in pulmonary granuloma of patients with chronic sarcoidosis
2026-Feb-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1093/ajrccm/aamaf089
PMID:41738160
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示慢性结节病患者肺部肉芽肿中混合型、促炎和促纤维化的细胞微环境 | 首次在慢性结节病肺部肉芽肿中利用空间转录组学技术详细描述细胞微环境的组成和功能，特别是中央巨噬细胞微环境同时具有促炎和促纤维化特性 | 样本量较小（9例），缺乏功能实验验证，需要进一步研究肉芽肿微环境的动态变化 | 利用空间转录组学揭示慢性结节病患者肺部肉芽肿内的细胞微环境 | 9例慢性结节病患者的肺部外植体（含肉芽肿） | 空间转录组学、数字病理学 | 结节病 | 空间转录组学、免疫组织荧光染色、RNA原位杂交 | NA | 空间基因表达数据、图像 | 9例患者样本，涵盖30,587个基因表达点和173个肉芽肿 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 495 | 2026-06-17 |
Reactive oligodendrocytes promote glioblastoma progression through CCL5/CCR5-mediated glioma stem cell maintenance
2026-01-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.12.012
PMID:41570802
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学技术，揭示反应性少突胶质细胞通过CCL5/CCR5信号轴维持胶质瘤干细胞，促进胶质母细胞瘤进展 | 首次发现胶质母细胞瘤细胞通过fractalkine信号将少突胶质细胞招募至肿瘤边缘，并诱导其进入类似脱髓鞘炎症和创伤损伤的IFN诱导反应状态，且CCL5/CCR5轴作为可药物靶点 | 未明确提及具体局限性，但可能包括依赖小鼠模型的局限性以及临床转化仍需进一步验证 | 研究少突胶质细胞在胶质母细胞瘤微环境中的功能作用及其对肿瘤进展的影响 | 原发性及复发性胶质母细胞瘤肿瘤组织、少突胶质细胞、胶质瘤干细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序、免疫组化、细胞因子分析、迁移实验 | NA | 基因表达数据、图像 | 原发性及复发性胶质母细胞瘤肿瘤样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞测序平台用于单细胞转录组，10x Visium用于空间转录组 |
| 496 | 2026-06-17 |
Genetically supported mediators linking peripheral metabolism to cerebral ischemia: a multi-omics characterization of HMGCR, TLR4, and MMP9 in angina pectoris and stroke
2026-Jan-09, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elag004
PMID:42296234
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研究论文 | 利用多组学整合分析，鉴定出HMGCR、TLR4和MMP9作为连接心绞痛与缺血性卒中的遗传中介因子 | 首次通过多组学框架（孟德尔随机化、转录组学、单细胞RNA-seq）揭示外周代谢-炎症通路介导心绞痛向缺血性卒中转化的分子机制 | 未提及具体局限性 | 探究心绞痛与缺血性卒中之间的因果中介因子及外周-中枢信号传导机制 | 心绞痛和缺血性卒中患者的外周血及脑组织样本 | 多组学整合分析 | 心血管疾病，脑血管疾病 | 孟德尔随机化（BWMR）、转录组学分析、Boruta特征选择、分子对接、CIBERSORT、单细胞RNA-seq | 多层感知器分类器（MLPC） | 基因组数据、转录组数据（bulk RNA-seq和scRNA-seq） | 大样本GWAS数据（n=628,000） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | CIBERSORT用于免疫细胞浸润分析，scRNA-seq用于免疫细胞亚群分析 |
| 497 | 2026-06-17 |
BST2 expression at astrocyte borders promotes microglial recruitment via the C3/C3aR signaling
2026-01-07, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.09.038
PMID:41138733
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研究论文 | 通过单细胞测序和空间转录组学技术，发现星形胶质细胞边缘表达的BST2通过C3/C3aR信号促进小胶质细胞招募，在脑损伤后形成病变边界并调节神经功能 | 首次鉴定出星形胶质细胞边缘表达的BST2蛋白通过PKCβII磷酸化增强C3表达，进而调控星形胶质细胞-小胶质细胞相互作用，为脑卒中后早期脑损伤提供潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，BST2在人类脑损伤中的具体作用机制及临床转化潜力尚需进一步验证 | 阐明星形胶质细胞边界特征及其与小胶质细胞的相互作用机制，探索BST2作为脑卒中治疗靶点的可能性 | 脑损伤后边界星形胶质细胞、小胶质细胞以及它们之间的相互作用 | 机器学习 | 脑血管疾病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间基因表达数据 | 小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3‘测序和10x Visium空间转录组学 |
| 498 | 2026-06-17 |
Customized Design and Preparation of Bionic Drug Delivery System Leveraging Single-Cell RNA Sequencing for Precisely Targeted Therapy
2026-01, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501497
PMID:40936355
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研究论文 | 本文报道了一种基于单细胞RNA测序定制的仿生药物递送系统，用于急性肾损伤的精准靶向治疗 | 首次利用单细胞RNA测序识别病理进展关键细胞亚型（PTIs）并筛选特异性细胞粘附分子（VCAM1和ICAM1）作为靶向递送介体，据此定制设计和制备了仿生药物递送系统BRNCs@AMMOs | 未提及具体局限性，但可能包括体内分布和长期安全性需进一步评估 | 开发一种单细胞RNA测序引导的仿生药物递送系统，用于急性肾损伤的靶向治疗 | 急性肾损伤的关键细胞亚型（PTIs）及相应的靶向递送介体（VCAM1和ICAM1） | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量，但涉及体外和体内实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 499 | 2026-06-17 |
Notch signaling is a driver of glandular stem cell activity and regenerative migration after damage
2026-01, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00607-w
PMID:41193641
|
研究论文 | 通过多组学整合方法揭示Notch信号在小鼠唾液腺类器官模型中调控干细胞活性及辐射损伤后再生迁移的作用 | 首次采用整合单细胞RNA测序、批量ATAC和RNA测序的多组学方法，结合体外类器官模型与体内组织验证，系统解析了Notch信号在腺体干细胞自我更新和辐射诱导迁移中的保守调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，虽然扩展到人和鼠的多种腺体类器官，但人体内验证数据有限，且未深入探讨Notch信号下游的具体分子通路细节 | 探究腺体器官中稀有静止干细胞的调控机制，特别是Notch信号在辐射损伤后干细胞自我更新和迁移中的作用 | 小鼠唾液腺类器官、辐射损伤小鼠唾液腺组织、小鼠及患者来源的唾液腺、乳腺和甲状腺类器官 | 数字病理学 | 放射性损伤相关疾病 | 单细胞RNA测序, 批量ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 小鼠唾液腺类器官多时间点样本及辐射损伤后样本，小鼠唾液腺组织样本，以及人和鼠的唾液腺、乳腺和甲状腺类器官样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 500 | 2026-06-17 |
Cyst-independent oocyte phagocytosis builds the female reproductive reserve in mice
2026-01, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00663-7
PMID:41361694
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研究论文 | 开发高分辨率四维卵巢成像系统，发现小鼠卵母细胞通过独立于囊肿的吞噬作用构建生殖储备 | 发现卵母细胞以独立细胞形式而非囊肿结构进行选择，并通过吞噬牺牲卵母细胞碎片来富集细胞质和支持存活 | 实验仅在模型小鼠中进行，未在人类或其他哺乳动物中验证 | 揭示哺乳动物卵巢发育中卵母细胞命运决定的机制 | 小鼠卵母细胞 | 自然语言处理 | NA | NA | NA | 图像, 基因表达数据 | 小鼠卵巢样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |