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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-04-29 |
Exploring Centrosome Amplification-Associated Biomarkers in Osteoarthritis Through Bioinformatics and Experimental Approaches
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S576712
PMID:41907222
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研究论文 | 通过生物信息学和实验方法探索骨关节炎中与中心体扩增相关的生物标志物 | 首次将中心体扩增相关基因与骨关节炎联系起来,通过整合差异表达分析、WGCNA、孟德尔随机化、ROC曲线及单细胞RNA测序等多种方法,鉴定出PLK2和SUN2两个潜在生物标志物,并构建了高预测准确度的列线图模型 | 未明确说明 | 识别骨关节炎中中心体扩增相关基因作为潜在生物标志物 | 骨关节炎患者的转录组数据和临床标本 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 482 | 2026-04-29 |
CPEB1 drives ferroptosis-neuroinflammation crosstalk in temporal lobe epilepsy via the SIRT1-NRF2 acetylation axis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1727784
PMID:41909681
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研究论文 | CPEB1通过SIRT1-NRF2乙酰化轴驱动颞叶癫痫中铁死亡与神经炎症的交互作用 | 首次揭示CPEB1通过调节SIRT1-NRF2乙酰化轴促进铁死亡-神经炎症交互作用在颞叶癫痫中的机制 | 未明确说明,但研究主要基于模型验证,可能需更多临床验证 | 探究CPEB1在颞叶癫痫中铁死亡与神经炎症交互作用中的分子机制 | 人类颞叶癫痫患者和海马组织、小鼠模型(KA/PTZ诱导)及体外谷氨酸诱导的神经元损伤模型 | 神经科学 | 颞叶癫痫 | 单细胞转录组学、批量RNA测序、生物信息学分析、腺相关病毒(AAV)介导的过表达与敲低、药物调控 | NA | 转录组数据 | 人类颞叶癫痫患者组织样本及小鼠模型(数量未具体说明) | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 483 | 2026-04-29 |
Machine learning meets psoriasis: identifying key lactylation biomarkers as potential targets for diagnosis and therapies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1791693
PMID:41909697
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研究论文 | 该研究通过机器学习识别银屑病中与乳酰化相关的关键生物标志物,为诊断和治疗提供潜在靶点 | 首次将机器学习算法(随机森林和LASSO回归)与乳酰化基因结合,鉴定出MPHOSPH6、ENO1、MKI67和FABP5作为银屑病诊断和治疗的新型生物标志物,并通过孟德尔随机化分析揭示了其因果关联 | 研究主要基于公开数据库分析和动物模型验证,缺乏大规模临床样本的验证 | 识别银屑病中与乳酰化相关的生物标志物,探索其在诊断和治疗中的潜在价值 | 银屑病患者和健康对照的基因表达数据、小鼠银屑病模型 | 机器学习 | 银屑病 | NA | 随机森林、LASSO回归 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 484 | 2026-04-29 |
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces wide-spread changes in gene expression across diverse cell types
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.19.695600
PMID:41497643
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研究论文 | 本研究通过感染小鼠适应型SARS-CoV-2病毒,探究其对5xFAD阿尔茨海默病小鼠模型神经病理学的影响 | 首次使用小鼠适应型SARS-CoV-2病毒(MA10)在5xFAD小鼠模型中系统评估病毒对阿尔茨海默病神经病理的直接作用 | 未检测到中枢神经系统内病毒RNA,且未观察到明显的胶质细胞激活或神经炎症反应 | 阐明SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病神经病理学的潜在分子机制 | 10-14月龄的5xFAD和野生型C57BL/6小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 新冠肺炎 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 感染后第7天和21天的小鼠脑样本,具体数量未提供 | Illumina | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq | NA |
| 485 | 2026-04-29 |
UV induces common cutaneous amyloid-like melanosomal protein aggregates
2025-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.17.689083
PMID:41446198
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研究论文 | 研究表明紫外线诱导黑色素细胞中α-突触核蛋白等形成类淀粉样蛋白聚集体,导致常见色素性疾病和光老化 | 发现紫外线以类朊病毒方式诱导黑色素体蛋白自传播聚集,并首次将黑色素体蛋白病与常见色素异常和光老化联系起来 | 未提及具体局限性 | 阐明紫外线诱导黑色素体蛋白聚集的机制及其在色素性疾病中的作用 | 黑色素细胞、小鼠模型、临床色素性病变样本 | 数字病理学 | 色素性疾病, 帕金森病, 光老化 | RT-QuIC, CUT&RUN, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 电子显微镜 | NA | 图像, 文本 | 多种临床色素性病变样本、原代黑色素细胞和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 486 | 2026-04-29 |
Multi-omics reveals changes in astrocyte fatty acid metabolism during early stages of Alzheimer's disease
2025-11, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106049
PMID:40889558
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示阿尔茨海默病早期星形胶质细胞脂肪酸代谢的变化 | 首次通过多组学(转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学)联合分析,系统描述了阿尔茨海默病早期星形胶质细胞中脂肪酸代谢的动态变化,并利用人类单细胞RNA测序数据验证了这些变化的临床相关性 | 尚未说明具体局限性 | 探究阿尔茨海默病早期星形胶质细胞中脂肪酸代谢的分子动态变化及其与疾病进展的关系 | 阿尔茨海默病模型APP/PS1小鼠和野生型小鼠的星形胶质细胞,以及人脑样本中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 多组学(转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学)、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢物空间分布数据、单细胞转录组数据 | APP/PS1和WT小鼠在5个时间点(2、4、6、9、12月龄)的星形胶质细胞样本;人脑单细胞核RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | NA |
| 487 | 2026-04-29 |
Dynamic interaction of oligodendrocyte precursor cells with other cell types in the central nervous system
2025-11, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106050
PMID:40930164
|
综述 | 系统梳理少突胶质前体细胞与中枢神经系统中其他细胞类型的动态相互作用机制 | 利用单细胞测序和体内成像等新技术,揭示了OPC在神经发育、组织稳态维持和病理微环境重塑中与多种CNS细胞群进行广泛动态相互作用的功能可塑性 | NA | 综合OPC多模式功能的现有证据,评估非成髓鞘贡献,并探讨神经再生医学的有前景治疗靶点 | 少突胶质前体细胞(OPCs)及其与神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞和血管内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 多发性硬化症、脑缺血 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 488 | 2026-04-29 |
Glutamine synthetase loss in β-catenin-mutant hepatocellular carcinoma promotes tumor burden through macrophage metabolic reprogramming
2025-Oct-23, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001591
PMID:41129335
|
研究论文 | 探讨β-连环蛋白突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失通过巨噬细胞代谢重编程促进肿瘤负荷的机制 | 首次揭示β-连环蛋白突变肝癌中谷氨酰胺合成酶缺失后,巨噬细胞通过代谢适应从免疫监视转向免疫抑制,并证明巨噬细胞谷氨酰胺合成酶条件性删除可减轻肿瘤负荷 | 研究主要基于小鼠模型和TCGA数据分析,人类患者样本的验证可能有限 | 研究β-连环蛋白突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失对肿瘤发展的影响 | β-连环蛋白突变肝细胞癌患者和小鼠模型 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞空间转录组学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据 | TCGA数据库包含CTNNB1突变肝癌患者样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 489 | 2026-04-29 |
Integrated single-cell whole genome sequencing and spatial transcriptomics reveal latent intra-tumoral heterogeneity in ovarian cancer
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.676897
PMID:41279090
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研究论文 | 通过整合单细胞全基因组测序和空间转录组学,揭示卵巢癌中隐藏的肿瘤内异质性 | 首次将单细胞全基因组测序与空间转录组学联合应用于卵巢癌,在细胞、克隆和亚克隆水平全面解析肿瘤内异质性,并发现驱动突变的自发逆转等复杂进化事件 | 样本量仅5例,且未提及对低丰度亚克隆的检测灵敏度或空间分辨率的限制 | 揭示卵巢癌肿瘤内异质性的分子特征和进化关系,以解释疾病复发和治疗失败的原因 | 5例上皮性卵巢癌组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞全基因组测序、空间转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、空间表达数据 | 5例卵巢癌组织样本 | 10x Genomics | 单细胞全基因组测序、空间转录组学 | 10x Chromium Smart-seq2、10x Visium | 10x Chromium单细胞全基因组测序试剂盒,10x Visium空间转录组试剂盒 |
| 490 | 2026-04-29 |
Comparative transcriptomics reveals shifts in cortical architecture at the metatherian/eutherian transition
2025-Oct-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.03.680397
PMID:41256371
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研究论文 | 通过比较转录组学揭示有袋类/真兽类过渡期皮层结构的演变 | 首次利用单核RNA测序和空间转录组学比较有袋类与真兽类哺乳动物初级视皮层的细胞类型和层状结构,揭示皮层柱在进化中的重塑特征 | 仅比较两个物种(小鼠和一种有袋类),样本代表性有限;未直接验证功能差异 | 探究有袋类与真兽类哺乳动物分叉后皮层柱细胞类型特异性组织的变化 | 有袋类动物(具体物种未提及)和小鼠的初级视皮层 | 神经科学 | NA | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 两种哺乳动物物种(有袋类和小鼠)的初级视皮层样本 | 10x Genomics, Illumina | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3', Illumina NovaSeq测序平台 |
| 491 | 2026-04-29 |
scTWAS: A powerful statistical framework for single-cell transcriptome-wide association studies
2025-Sep-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6531106/v1
PMID:41256005
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研究论文 | 提出scTWAS统计方法,利用单细胞数据进行细胞类型特异性转录组关联研究 | 创新采用潜变量模型和矩估计方法,解决单细胞数据的高噪声、高稀疏性和技术变异,实现细胞类型特异性TWAS分析 | 未在正文中明确说明,推测可能依赖于基因型数据的可用性和单细胞数据的质量 | 开发一种能够利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型特异性转录组关联研究的统计方法 | 血液和脑组织中的细胞类型,以及29种血液性状、3种免疫相关疾病和阿尔茨海默病 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 潜变量模型 | 基因表达数据 | 未在标题和摘要中明确提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 492 | 2026-04-29 |
CD1d+ Goblet Cells Expand Colon-Resident Immature, Intermediate and Differentiated iNKT Cells to Limit Colitis
2025-Sep-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7603392/v1
PMID:41041542
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现,结肠中存在类似胸腺未成熟和中间前体状态的iNKT细胞群,并且CD1d+杯状细胞通过形成抗原通道扩增这些细胞以限制结肠炎 | 颠覆了结肠iNKT细胞在断奶后固定不变的经典观点,首次证明成年结肠中存在具有可塑性的iNKT细胞亚群,并揭示杯状细胞作为非传统抗原呈递细胞调控iNKT细胞扩增的新机制 | 未明确说明 | 探究结肠iNKT细胞的异质性及其在结肠炎中的调控机制 | 人类和小鼠结肠中的iNKT细胞及CD1d+杯状细胞 | 单细胞转录组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠结肠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 493 | 2026-04-29 |
Lymphatic dysfunction is linked to disease pathogenesis in Duchenne muscular dystrophy animal models
2025-Sep-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2505656122
PMID:40966282
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研究论文 | 探究迪谢内肌营养不良动物模型中淋巴功能异常与疾病发病机制的关系 | 首次证明淋巴系统功能障碍与DMD发病机制相关,并揭示肌营养不良蛋白在淋巴肌细胞中的表达及淋巴管生成异常 | 结果主要基于动物模型,需在DMD患者中进一步验证 | 研究DMD动物骨骼肌中淋巴系统是否失调及其在疾病进展中的作用 | 小鼠模型、黄金猎犬肌营养不良犬模型、小鼠和大鼠淋巴肌细胞 | 数字病理学 | 迪谢内肌营养不良 | 单细胞RNA测序、微淋巴管造影、磁共振淋巴管成像、免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据、成像数据 | 多种动物模型(小鼠、犬)及相关细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 494 | 2026-04-29 |
Protocol for predicting single- and multiple-dose-dependent gene expression using deep generative learning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103932
PMID:40650899
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协议 | 提出了一种使用深度生成学习预测单剂量和多剂量依赖性基因表达的协议 | 利用变分自编码器建模单细胞RNA测序数据中的剂量依赖性化学扰动效应,实现基因表达预测 | NA | 开发并验证一种预测化学扰动后基因表达的计算协议 | 单细胞基因表达数据及剂量响应 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 495 | 2026-04-29 |
Integrated 'omics analysis reveals human milk oligosaccharide biosynthesis programs in human lactocytes
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113269
PMID:40894860
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序数据分析揭示了人类泌乳细胞中母乳低聚糖(HMO)的生物合成程序 | 首次通过单细胞RNA测序技术结合HMO浓度测量,揭示母乳低聚糖在乳腺上皮细胞亚型中的差异表达模式及潜在调控基因 | 信息不足,无法确定 | 研究人类乳腺中母乳低聚糖的生物合成途径及其细胞类型特异性 | 人类乳腺上皮细胞亚型(泌乳细胞) | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 信息不足,无法确定 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 496 | 2026-04-29 |
Patterns of Mitochondrial ATP Predict Tissue Folding
2025-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.31.673364
PMID:40909554
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研究论文 | 该研究发现线粒体ATP的模式化分布能够预测组织折叠,揭示了胚胎发育中生物能量学的空间维度 | 首次发现化学能量(ATP)在形态发生过程中呈现空间模式,并且线粒体在细胞顶端富集是多种动物保守的机制,可利用这种亚细胞模式通过计算预测组织折叠 | 未明确说明研究的局限 | 研究胚胎发育期间线粒体ATP模式和空间分布与组织折叠之间的关系 | 果蝇、小鼠、鸡胚胎的上皮细胞 | 生物信息学 | NA | 时序成像、空间转录组学、氧耗率测量 | 计算模型 | 图像、转录组数据 | 涉及果蝇、小鼠和鸡胚胎等多种模式生物 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 497 | 2026-04-29 |
A STAT3/integrin axis accelerates pancreatic cancer initiation and progression
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116010
PMID:40701148
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研究论文 | 研究发现STAT3/整合素轴通过调控ITGB3表达促进胰腺导管腺癌的发生和进展 | 首次揭示STAT3通过染色质可及性调控ITGB3增强子的机制,并建立18基因特征以分层胰腺癌生存结局 | 未提及具体局限(摘要中无明确信息) | 探索STAT3在胰腺癌进展中的下游靶基因及调控机制 | 胰腺导管腺癌细胞和患者样本 | 机器学习 | 胰腺癌 | ChIP-seq, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | Illumina, 10x Genomics | ChIP-seq, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | ChIP-seq在缺氧或抑瘤素M处理的PDAC细胞上进行;单细胞转录组学分析使用10x Chromium平台 |
| 498 | 2026-04-29 |
A Spatially Coordinated Keratinocyte-Fibroblast Circuit Recruits MMP9+ Myeloid Cells to Drive IFN-I-Driven Inflammation in Photosensitive Autoimmunity
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.19.670635
PMID:40894544
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序、空间转录组学等技术,揭示了一个由角化细胞、成纤维细胞和MMP9+ CD14+髓系细胞组成的空间协调炎症回路,驱动光敏性自身免疫中的IFN-I介导的皮肤炎症 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学(seqFISH+)、体内UVB激发和体外模型,系统阐明了角化细胞-成纤维细胞-髓系细胞轴向在光敏性皮肤病中的致病机制,并确定了MMP9+ CD14+髓系细胞作为光敏性的核心效应细胞和潜在治疗靶点 | 研究主要基于人类样本和体外模型,缺乏体内动物模型的直接验证;样本量有限,可能无法完全代表所有患者亚群;机制细节(如细胞间相互作用的具体分子通路)仍需进一步深入解析 | 阐明紫外线B(UVB)暴露与组织特异性自身免疫(特别是光敏性皮肤损伤)之间的联系机制 | 皮肤红斑狼疮(CLE)和皮肌炎(DM)患者皮肤样本,包括病变皮肤和非病变皮肤 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮, 皮肌炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 体外模型 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确说明具体数量,但包括CLE和DM患者及健康对照的皮肤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, seqFISH+ | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,seqFISH+用于空间转录组学分析 |
| 499 | 2026-04-29 |
Macrophages drive a fibrogenic gene program of periductal fibroblasts in pediatric primary sclerosing cholangitis
2025-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.14.670195
PMID:40894696
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研究论文 | 本研究通过多组学方法,整合MERSCOPE空间转录组学、bulk RNA-seq和SomaScan蛋白质组学,揭示巨噬细胞与肝星状细胞在原发性硬化性胆管炎中驱动导管周围纤维化的细胞串扰机制 | 首次采用多组学整合分析(空间转录组、批量RNA-seq和蛋白质组)系统描绘PSC中导管周围纤维化区域的细胞-细胞相互作用,并鉴定出巨噬细胞中17个纤维化驱动基因和肝星状细胞中6个效应基因 | NA | 阐明儿童原发性硬化性胆管炎中导管周围纤维化的细胞串扰和分子机制 | 儿童原发性硬化性胆管炎患者肝组织和血浆样本 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 空间转录组学、bulk RNA-seq、SomaScan蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | MERSCOPE | MERSCOPE空间转录组平台 |
| 500 | 2026-04-29 |
Identification of immune signatures associated with both SARS-CoV-2 infection and lung transplantation
2025-Aug-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102262
PMID:40749682
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研究论文 | 通过分析新冠感染合并肺移植患者的免疫特征,发现其RBD特异性抗体显著降低,并利用单细胞RNA测序和多重细胞因子分析揭示了特定的细胞扩增和细胞因子变化 | 首次在COVID-19相关肺损伤合并肺移植患者中全面描述免疫特征,包括RBD抗体水平、单细胞转录组和细胞因子谱的综合分析 | 样本量有限且仅关注循环血液中的免疫细胞,未涉及肺部局部免疫环境 | 探究新冠感染合并肺移植患者的免疫学特征及其与疾病进展的关系 | COVID-19相关肺损伤接受肺移植的患者、非移植新冠患者、血清阴性对照 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序、多重细胞因子分析 | NA | 单细胞转录组数据、细胞因子表达数据 | 多项组群对比研究,具体样本量未详细说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于白细胞单细胞RNA测序 |