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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-05-21 |
Depicting the dynamic transcriptional and epigenetic landscape of testis development in pubertal Simmental cattle
2026-May-18, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01406-x
PMID:42144636
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和单核ATAC测序揭示了青春期西门塔尔牛睾丸发育中的动态转录和表观遗传图谱 | 首次整合scRNA-seq和sNucATAC-seq技术系统解析青春期前后西门塔尔牛睾丸发育中生殖细胞命运转变的调控网络,并鉴定出跨物种保守的转录因子E2F1、BCLAF1和YY1 | 未明确提及样本量局限性或技术验证不足等限制 | 阐明牛睾丸发育中生殖细胞命运转变的调控机制 | 西门塔尔牛睾丸组织(出生后、青春期前和青春期三个阶段) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核ATAC测序(sNucATAC-seq) | NA | 基因表达数据、染色质开放性数据 | 西门塔尔牛睾丸组织样本覆盖三个发育阶段(出生后、青春期前、青春期) | NA | 单细胞RNA测序、单核ATAC测序 | NA | NA |
| 482 | 2026-05-21 |
Single-cell profiling and machine learning identify cuproptosis-related fibroblast subpopulations and fibrogenesis modulator AEBP1 in endometriosis
2026-05-18, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02342-x
PMID:42149287
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和机器学习,鉴定子宫内膜异位症中与铜死亡相关的成纤维细胞亚群和纤维化调节因子AEBP1 | 首次将铜死亡与子宫内膜异位症的成纤维细胞介导的纤维化进程关联,并利用机器学习和网络分析优先筛选出关键枢纽基因AEBP1 | 铜死亡相关分子机制与纤维化进展的因果关联仍需进一步验证,且目前仅限于体外和动物模型 | 阐明铜死亡在子宫内膜异位症成纤维细胞介导的纤维化进程中的作用 | 正常、在位和异位子宫内膜组织、子宫内膜基质细胞、子宫内膜异位症小鼠模型 | 单细胞分析、机器学习 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 正常、在位和异位子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 483 | 2026-05-21 |
PSD3 links autophagic flux to MHC-I-associated immune modulation in esophageal squamous cell carcinoma
2026-05-18, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02345-8
PMID:42149295
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研究论文 | PSD3连接食管鳞状细胞癌中的自噬通量与MHC-I相关免疫调控 | 首次发现PSD3在食管鳞状细胞癌中上调且与不良预后相关,并揭示其通过自噬通量调控MHC-I分子表达及免疫细胞浸润的机制 | 需要进一步研究明确通路层级和抗原呈递功能的关系 | 探究PSD3在食管鳞状细胞癌中连接自噬过程与免疫调控的分子机制 | 食管鳞状细胞癌组织、小鼠及人ESCC模型细胞(如KYSE150) | 机器学习 | 食管鳞状细胞癌 | 共免疫沉淀、蛋白质印迹、串联荧光LC3报告基因、免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 食管鳞状细胞癌组织样本及小鼠/人细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序试剂盒 |
| 484 | 2026-05-21 |
FastGxC: Fast and powerful context-specific eQTL mapping in bulk and single-cell data
2026-May-18, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2026.101250
PMID:42155441
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research paper | FastGxC是一种快速且强大的方法,用于在bulk和单细胞数据中映射上下文特异性eQTLs,通过利用多组织bulk和单细胞RNA测序研究中的相关性结构,效率和灵敏度显著优于现有方法 | 通过利用相关性结构实现上下文特异性eQTL的高效映射,模拟中效力提升9倍、速度提升10倍,计算时间从年缩减到分钟,同时提高精度和扩展候选因果基因 | NA | 开发一种快速且强大的方法,用于高效映射上下文特异性eQTLs,以增进对复杂性状基因调控机制的理解 | bulk多组织RNA测序数据集(n=698)和外周血单个核细胞(PBMC)单细胞RNA测序数据集(n=1,218) | machine learning | NA | RNA-seq | NA | bulk RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | bulk多组织数据集698个样本,PBMC单细胞数据集1,218个样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 485 | 2026-05-21 |
Selenium-GPX4 Axis Orchestrates Intestinal Arachidonic Acid Metabolic Reprogramming to Mitigate Inflammation
2026-May-18, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 通过小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示硒-GPX4轴通过重编程肠道花生四烯酸代谢来缓解炎症的机制 | 首次阐明硒通过上调GPX4调控花生四烯酸代谢重编程以缓解肠道炎症的分子机制,并发现IEC-GPX4在调控oxylipin谱和巨噬细胞极化中的核心作用 | 未提及具体局限性 | 探究硒-GPX4轴在调控花生四烯酸代谢重编程中缓解肠道炎症的机制 | 脂多糖诱导和饮食AA喂养的小鼠模型,以及肠上皮细胞(IEC)-巨噬细胞共培养体系 | 数字病理学 | 肠道炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 基因敲除, 共培养实验 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型,具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 486 | 2026-05-21 |
Clinical outcomes and spatial transcriptomic profiles of CD19/20 CAR-T therapy in relapsed or refractory B-cell non-Hodgkin's lymphoma
2026-May-17, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015114
PMID:42144261
|
研究论文 | 本文报道了CD19/20双特异性CAR-T细胞治疗复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤的临床结果和空间转录组学特征 | 首次将空间分辨单细胞转录组学应用于双特异性CD19/20 CAR-T治疗的临床评估,揭示肿瘤内在和微环境因素与治疗反应的关联 | 样本量较小(仅5例患者进行空间转录组分析),未详细说明长期随访数据及其他潜在偏差 | 评估CD19/20双特异性CAR-T细胞治疗复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤的疗效和安全性,并探索影响临床反应的空间转录组学特征 | 32例复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者(包括24例弥漫性大B细胞淋巴瘤),其中5例患者治疗前肿瘤活检样本 | 数字病理学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | CAR-T细胞治疗,空间单细胞转录组测序 | NA | 空间转录组数据,临床数据 | 32例患者(31例可评估),5例患者治疗前肿瘤活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 487 | 2026-05-21 |
Single-cell multi-omics analysis reveals two molecular subtypes of human male breast cancer with distinct neuroendocrine and immune characteristics
2026-May-16, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.05.041
PMID:42144060
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示人类男性乳腺癌的两种分子亚型,具有不同的神经内分泌和免疫特征 | 首次在单细胞分辨率下解析男性乳腺癌的分子亚型,发现神经内分泌状态与免疫微环境的关键关联,并鉴定出DLX2转录因子和NPY+/NPY1R+细胞通讯在神经内分泌特征中的调控作用 | 未指定 | 解析男性乳腺癌在单细胞水平的分子机制,为分子分型和新治疗策略提供依据 | 男性乳腺癌患者的多组学数据集 | 单细胞组学 | 男性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、成像质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据、蛋白质成像数据 | 未指定 | 未指定 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 未指定 | 未指定 |
| 488 | 2026-05-21 |
SENP1 facilitates the adaptation of colonic non-lymphoid tissue Treg cells and restrains intestinal inflammation
2026-May-16, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2026.100349
PMID:42144108
|
研究论文 | 本研究鉴定SUMO特异性蛋白酶1(SENP1)为结肠调节性T细胞功能及肠道免疫稳态的关键调节因子 | 首次揭示SENP1通过调控CD25表达影响结肠Treg细胞的组织适应性和抗炎功能 | 未阐明SENP1在人类结肠Treg细胞中的具体作用机制及临床相关性 | 探究SENP1对结肠非淋巴组织Treg细胞适应性的调节作用及其在肠道炎症中的功能 | Treg特异性Senp1基因敲除小鼠 | 机器学习 | 肠道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠结肠组织样本,具体数量未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 489 | 2026-05-21 |
Identification of Poor Prognosis-Associated Fibroblast Subpopulation Signature Genes Utilizing the Scissor Algorithm to Classify Colorectal Cancer Subtypes and Evaluate the Immune Landscape
2026-May-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl250363
PMID:41787974
|
研究论文 | 利用Scissor算法识别与不良预后相关的成纤维细胞亚群标志基因,对结直肠癌亚型进行分类并评估免疫景观 | 首次利用Scissor算法整合单细胞和 bulk 转录组数据,鉴定与结直肠癌预后显著相关的成纤维细胞亚群及其标志基因 | 未提及具体局限性 | 探讨结直肠癌微环境中成纤维细胞亚群与预后的关系,并基于此进行亚型分类和免疫景观评估 | 结直肠癌患者样本的转录组数据和临床信息 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Scissor算法 | 转录组数据 | 未提及具体样本量 | 未提及 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 490 | 2026-05-21 |
Linking Genetic Risk to Disease-Relevant Cellular States via Metacell-Informed Modeling with ICePop
2026-May-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715877
PMID:41959181
|
研究论文 | 提出ICePop方法,通过元细胞分辨率解决GWAS与单细胞转录组整合中的统计效力与异质性检测之间的权衡 | 首次提出元细胞分辨率的疾病-细胞类型关联框架,在保持与细胞类型水平方法相当统计效力的同时,能检测细胞类型内部的异质性疾病信号 | 未提及方法的局限性 | 解释遗传风险如何通过特定细胞状态影响疾病,实现细胞状态水平的疾病关联分析 | 从Tabula Muris数据集获取的81种性状和120种细胞类型,以及自闭症谱系障碍相关数据 | 机器学习 | 复杂疾病(溃疡性结肠炎、自闭症谱系障碍等) | 单细胞RNA测序 | ICePop(元细胞建模框架) | 单细胞转录组数据、GWAS汇总统计数据 | 包含81种性状和120种细胞类型的Tabula Muris数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 491 | 2026-05-21 |
Fibroblast Heterogeneity in Colorectal Cancer: Insights from Integrative Single-Cell Transcriptomics
2026-May-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl260162
PMID:42137937
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 492 | 2026-05-21 |
Targeting CD74 may mitigate immune-escape features and enhance BCMA CAR-T activity in preclinical models of relapsed/refractory multiple myeloma
2026-May-14, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013255
PMID:42134899
|
研究论文 | 本研究探讨了靶向CD74在复发/难治性多发性骨髓瘤中减轻免疫逃逸特征并增强BCMA CAR-T活性的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示BCMA CAR-T治疗后残留骨髓瘤细胞中CD74的上调,并验证靶向CD74可增强CAR-T疗效 | 未详细说明CD74抑制在临床样本中的长期效果及潜在副作用 | 阐明复发/难治性多发性骨髓瘤中免疫逃逸和CAR-T耐药性的分子机制,并探索CD74作为治疗靶点的可行性 | 复发/难治性多发性骨髓瘤患者的骨髓样本,以及体外和体内模型中的骨髓瘤细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 配对骨髓样本(治疗前后) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 493 | 2026-05-21 |
Differential traction forces underlie spatial heterogeneity in early differentiation of human embryonic stem cell clones
2026-May-14, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2026.05.022
PMID:42140565
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研究论文 | 探究人胚胎干细胞克隆在早期分化过程中空间异质性的力学调控机制 | 首次揭示牵引力差异通过β-整合素-F-肌动蛋白-YAP轴调控人胚胎干细胞克隆周边与内部区域的分化异质性,并整合单细胞转录组学、牵引力显微镜和高分辨率成像技术 | 未提供具体局限性信息 | 阐明细胞-基质粘附及力学转导通路在人类胚胎干细胞早期分化中调控空间异质性的作用 | 人类胚胎干细胞H1克隆 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、牵引力显微镜、高分辨率成像 | NA | 图像、文本 | 人类胚胎干细胞H1克隆,样本量未具体说明 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 494 | 2026-05-15 |
First-in-human single-cell and TCR atlas reveals peripheral immune remodeling before and after irreversible electroporation in prostate cancer
2026-May-13, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014288
PMID:42128518
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研究论文 | 首次在人体中通过单细胞和TCR图谱揭示不可逆电穿孔治疗前列腺癌前后的外周免疫重塑 | 首次利用单细胞RNA测序和TCR谱分析绘制前列腺癌IRE治疗后系统性免疫应答的时空动态图谱 | 样本量较小(仅5例患者),且仅收集了治疗前和治疗后第7天的外周血样本,尚缺乏更长时间点及组织层面的数据 | 探究不可逆电穿孔(IRE)治疗前列腺癌后系统性免疫应答的机制和时间动态 | 5例局限性前列腺癌患者(T2a-T2c期) | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、T细胞受体(TCR)谱分析 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 5例前列腺癌患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞TCR分析 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序和TCR谱分析平台 |
| 495 | 2026-05-21 |
Synthetic DNA vaccine platform elicits potent immunity where electroporated naked-mRNA is non-immunogenic
2026-May-13, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013812
PMID:42128520
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研究论文 | 开发基于线性发夹DNA(hpDNA)的合成DNA疫苗平台,在电穿孔递送下诱导强效免疫应答,而修饰mRNA在该条件下无免疫原性 | 首次证明电穿孔递送的非包封修饰mRNA无法诱导可检测的T细胞免疫,而hpDNA疫苗能在相同条件下引发有效炎症反应和持久免疫记忆 | 研究仅在小鼠模型中进行,未在人体中验证;mRNA疫苗仅测试电穿孔递送,未包含脂质纳米颗粒等其他递送系统 | 开发临床可扩展的个性化新抗原癌症疫苗平台 | MC38和CT26肿瘤小鼠模型的新抗原特异性T细胞免疫应答 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、酶联免疫斑点检测、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组、T细胞受体序列 | 小鼠模型:MC38和CT26荷瘤小鼠的多组实验(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞5'基因表达与V(D)J测序 |
| 496 | 2026-05-21 |
Single-cell analysis reveals the role of interleukins in impairing osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells and promoting osteoporosis
2026-May-13, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/h7t1u6
PMID:42154637
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术,揭示白细胞介素在骨质疏松症中如何损害间充质干细胞成骨分化并促进疾病进展的机制 | 首次通过单细胞转录组学系统解析骨质疏松微环境中白细胞介素信号调控间充质干细胞命运的新机制,并发现IL34-CSF1R轴作为潜在治疗靶点 | 样本来源为公共数据集,缺乏独立验证队列;仅分析了骨关节和骨质疏松样本,未纳入健康对照组 | 阐明白细胞介素在骨质疏松症发生发展中对间充质干细胞成骨分化调控的分子机制 | 人骨质疏松症和骨关节炎患者的骨髓间充质干细胞样本 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自GSE147287数据集的多例骨质疏松和骨关节炎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 497 | 2026-05-21 |
Engineering of Immunoactive Hydrogels Complements Tumor-Treating Fields for Glioblastoma Therapy
2026-May-12, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c00361
PMID:42054424
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研究论文 | 本研究揭示肿瘤治疗电场(TTF)通过鞘脂代谢相关通路介导的内质网应激触发免疫原性细胞死亡,并设计ATP响应性水凝胶佐剂与TTF协同,实现抗原和CpG的时空控释,重激活髓系细胞相互作用网络,增强抗肿瘤免疫反应 | 首次在单细胞RNA测序分辨率下揭示TTF触发GBM免疫原性细胞死亡的分子机制,并开发ATP响应性水凝胶佐剂与TTF协同治疗新策略 | NA | 开发TTF联合免疫活性水凝胶佐剂的GBM治疗新策略,并阐明其免疫激活机制 | 多形性胶质母细胞瘤(GBM)大鼠模型 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | GBM荷瘤大鼠(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 498 | 2026-05-21 |
Developmental landmarks and cellular transitions during extravillous trophoblast cell differentiation
2026-May-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2529836123
PMID:42090250
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研究论文 | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析,定义了人类滋养层干细胞向绒毛外滋养层细胞分化过程中的发育标志和细胞转变 | 首次系统描述了EVT细胞分化的时间动态转录组图谱,识别了分化早期(第3天)的关键转变点及独特细胞群体,并阐明了cyclin B1、C/EBPβ和ADAMTS20等关键调控因子的功能作用 | 未提及研究的局限性 | 阐明人滋养层干细胞向绒毛外滋养层细胞分化的调控机制 | 人滋养层干细胞及其向EVT细胞分化过程中的细胞 | 机器学习和生物信息学 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 转录本数据 | 未明确说明样本数量,分析包括干细胞状态及分化第3、6、8天的样本 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 499 | 2026-05-21 |
CXCL16-driven CD4+ T cells orchestrate immunosurveillance against MHC-I-deficient hepatocellular tumors
2026-May-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012347
PMID:42120180
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研究论文 | 研究CXCL16驱动的CD4+ T细胞在MHC-I缺陷肝肿瘤中的免疫监视作用 | 发现MHC-I缺失对肿瘤生长的影响具有情境依赖性,揭示CXCL16和CD4+ T细胞在抗MHC-I缺陷肿瘤免疫中的核心调控作用 | 主要基于小鼠模型,与人类肿瘤的差异可能需要进一步验证 | 阐明MHC-I缺失如何通过趋化因子CXCL16调控CD4+ T细胞介导的免疫监视,影响肿瘤生长 | MHC-I缺陷的肝癌细胞(Hepa1-6)及其他肿瘤细胞(MC38、AKR、LLC1) | 数字病理学 | 肝癌 | CRISPR/Cas9基因敲除,单细胞RNA测序,流式细胞术,ELISA | NA | 基因表达数据,免疫细胞表型数据 | 多种小鼠模型(皮下和原位移植瘤),具体样本量未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 500 | 2026-05-21 |
Pancreatic tumor microenvironment reprogramming via alloantigen-expressing virotherapy elicits tumor rejection and improves immunotherapy response
2026-May-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013671
PMID:42120181
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研究论文 | 通过表达同种异体抗原的溶瘤病毒疗法重塑胰腺癌肿瘤微环境,诱导肿瘤排斥并改善免疫治疗反应 | 首次利用重组溶瘤病毒rVMG载体表达小鼠同种异体抗原H-2Kb或H-2Kk,通过诱导肿瘤特异性抗原错配反应来激活急性移植排斥机制,将免疫冷肿瘤转化为免疫热肿瘤 | rVMG-H-2Kk治疗会诱导补偿性免疫抑制通路,包括抗病毒应答基因和免疫检查点受体(如PD-L2)的上调 | 开发一种新型免疫治疗平台,通过同种异体抗原递送重塑胰腺导管腺癌的免疫抑制性肿瘤微环境 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤模型及肿瘤免疫微环境 | 机器学习 | 胰腺癌 | 溶瘤病毒疗法、空间转录组学、多重免疫组化、免疫表型分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | 两种免疫活性PDAC小鼠模型,具体样本量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |