单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
481	2025-05-23	Deciphering maternal-fetal cross-talk in the human placenta during parturition using single-cell RNA sequencing 2024-01-10, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adh8335 PMID:38198568	研究论文	利用单细胞RNA测序技术解析人类胎盘在分娩过程中的母胎交流	首次建立人类胎盘的单细胞图谱，揭示分娩过程中母体和胎儿细胞类型的转录组活性变化，并发现胎盘源性单细胞特征可用于无创预测早产	研究主要关注足月分娩，对早产的预测仍需进一步验证	解析分娩过程中母胎交流的细胞贡献和通讯机制	人类胎盘中的母体和胎儿细胞	单细胞转录组学	妊娠相关疾病	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	人类胎盘组织样本（具体数量未明确说明）
482	2025-05-23	Insights into midgut cell types and their crucial role in antiviral immunity in the lepidopteran model Bombyx mori 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1349428 PMID:38420120	review	该综述探讨了鳞翅目模型家蚕中肠细胞类型及其在抗病毒免疫中的关键作用	揭示了昆虫中肠细胞在免疫防御中的新机制，包括单细胞转录组学发现的新亚群以及昆虫与高等哺乳动物胃肠道的相似性	NA	阐明中肠细胞类型在昆虫免疫防御中的复杂作用	家蚕中肠细胞（柱状细胞、肠内分泌细胞、杯状细胞和再生细胞）	昆虫免疫学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
483	2025-05-23	Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from pregnant women with Systemic lupus erythematosus 2024, International reviews of immunology IF:4.3Q2 DOI:10.1080/08830185.2024.2376649 PMID:39066603	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了系统性红斑狼疮（SLE）孕妇外周血单个核细胞的免疫细胞组成和基因表达谱	首次在单细胞水平上比较了妊娠期活动性和非活动性SLE患者的免疫细胞类型比例和转录模式	样本量较小（仅12例患者），且未包含健康孕妇对照组	阐明妊娠期SLE患者的免疫细胞变化和分子机制	系统性红斑狼疮孕妇的外周血单个核细胞	数字病理学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序（10x Genomics技术）	NA	RNA测序数据	12例患者（分为4组，每组3人）
484	2025-05-23	Immune cell profiling of preeclamptic pregnant and postpartum women by single-cell RNA sequencing 2024, International reviews of immunology IF:4.3Q2 DOI:10.1080/08830185.2022.2144291 PMID:36369864	研究论文	通过单细胞RNA测序技术对先兆子痫孕妇及产后妇女的免疫细胞进行分析	首次在单细胞水平上描绘了先兆子痫患者母体免疫系统的景观和异质性	样本量较小（3例患者和2例对照）	研究先兆子痫与免疫系统改变的关系	先兆子痫孕妇及产后妇女的外周血单个核细胞（PBMCs）	单细胞转录组学	先兆子痫	单细胞RNA测序（10× genomics平台）	NA	单细胞转录组数据	3例早发型先兆子痫孕妇和2例健康对照的PBMCs样本，共获得80,429个单细胞转录组
485	2025-05-23	Chemokine receptors in primary and secondary lymphoid tissues 2024, International review of cell and molecular biology DOI:10.1016/bs.ircmb.2023.11.003 PMID:39260934	综述	本文综述了趋化因子受体在初级和次级淋巴组织中的存在和功能	详细讨论了常规趋化因子受体在免疫细胞中的关键作用及其在淋巴组织中的功能	主要关注常规趋化因子受体，对非典型趋化因子受体的讨论较少	探讨趋化因子受体在免疫细胞和淋巴组织中的作用	初级和次级淋巴组织中的免疫细胞	免疫学	NA	高维光谱流式细胞术、单细胞测序	NA	NA	NA
486	2025-05-23	YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulated bone development 2023-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.01.20.524918 PMID:36711590	research paper	该研究探讨了YAP和TAZ在胚胎骨骼发育中如何协调成骨前体细胞的动员与血管生成及机械刺激响应的机制	揭示了YAP/TAZ信号在胚胎骨骼发育中通过调控Cxcl12表达，将成骨前体细胞动员与血管生成空间耦联的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类细胞实验数据有限	阐明胚胎骨骼发育过程中成骨前体细胞动员与血管生成的协调机制	小鼠胚胎骨骼和人类间充质基质细胞	发育生物学	骨骼发育异常	单细胞RNA测序、3D血管网络形成实验	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、影像数据	未明确说明具体样本数量，使用基因工程小鼠模型和人类间充质基质细胞
487	2025-05-23	Single cell RNA-sequencing profiling to improve the translation between human IBD and in vivo models 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1291990 PMID:38179052	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在提高人类炎症性肠病（IBD）与体内模型之间转化研究中的应用	强调了scRNA-seq技术在识别IBD中新型细胞亚群及其在疾病过程中的重塑作用，以及如何利用该技术提高临床前模型的转化潜力	scRNA-seq技术在IBD临床前模型中的应用尚未广泛开展	提高人类IBD与体内模型之间的转化研究，选择最合适的模型来测试假设和新疗法	炎症性肠病（IBD）的临床前动物模型和人类IBD患者	数字病理学	炎症性肠病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
488	2025-05-23	Longitudinal Single-Cell Transcriptomics Reveals a Role for Serpina3n-Mediated Resolution of Inflammation in a Mouse Colitis Model 2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.004 PMID:33862275	研究论文	本研究通过单细胞转录组学揭示了小鼠结肠炎模型中炎症消退的动态变化及Serpina3n的作用	首次在单细胞水平揭示了结肠基质细胞群在炎症消退过程中的动态作用，并发现Serpina3n作为炎症消退的关键调节因子	研究仅基于小鼠模型，结果是否适用于人类仍需验证	阐明结肠炎炎症消退过程中的细胞类型变化及其相互作用机制	化学诱导结肠炎小鼠模型	单细胞转录组学	结肠炎	单细胞转录组测序	NA	基因表达数据	NA
489	2025-05-22	Deciphering the Premetastatic Lymphatic Niche of Oral Squamous Cell Carcinoma 2025-Jun, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345241307894 PMID:40082761	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了口腔鳞状细胞癌（OSCC）淋巴结转移前微环境中的细胞结构，特别是CD4+ Tex-pre细胞的作用	首次在淋巴结转移前微环境中鉴定出CD4+ Tex-pre细胞亚群，并揭示其在免疫抑制和促进淋巴结转移中的作用	研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，需要更大规模的临床验证	探索口腔鳞状细胞癌淋巴结转移前微环境的细胞组成和免疫抑制机制	口腔鳞状细胞癌患者的淋巴结组织和小鼠模型	数字病理学	口腔癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNAscope原位染色，批量RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据，图像数据	OSCC患者的淋巴结样本（包括转移前引流淋巴结和配对的对侧淋巴结）和小鼠模型
490	2025-05-22	Antioxidant interventions reduced cytokine-induced pyroptosis of peripheral MAIT cells in patients with HBV-related cirrhosis 2025-Jun-01, Hepatology communications IF:5.6Q1 DOI:10.1097/HC9.0000000000000714 PMID:40377492	研究论文	本研究探讨了HBV相关肝硬化患者外周MAIT细胞减少的特征及机制，发现抗氧化干预可减少细胞因子诱导的细胞焦亡	首次揭示了HBV相关肝硬化中MAIT细胞减少与细胞焦亡及氧化应激的关联，并证明抗氧化剂可有效减少这一过程	样本量较小（40例患者），且仅为体外实验验证	探究HBV相关肝硬化患者MAIT细胞减少的机制	HBV相关肝硬化患者的外周MAIT细胞	免疫学	肝硬化	流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫荧光、ELISA	NA	血液样本	20名健康对照和40名HBV相关肝硬化患者（20名代偿期和20名失代偿期）
491	2025-05-22	Single-cell analyses unravel ecosystem dynamics and intercellular crosstalk during gallbladder cancer malignant transformation 2025-Jun-01, Hepatology communications IF:5.6Q1 DOI:10.1097/HC9.0000000000000697 PMID:40377484	research paper	该研究通过单细胞RNA测序分析了胆囊癌恶性转化过程中的细胞生态系统动态和细胞间通讯	揭示了胆囊癌恶性转化过程中免疫微环境的变化，并鉴定了与预后不良相关的上皮亚型TOP2A+ Epi和免疫抑制性巨噬细胞TOP2A+ Macro	样本量相对较小，仅包括2个正常邻近组织、2个高级别上皮内瘤变和6个胆囊癌样本	理解胆囊癌恶性转化过程中的细胞和分子变化，以识别早期生物标志物和治疗靶点	胆囊癌患者的正常邻近组织、高级别上皮内瘤变组织和胆囊癌组织	digital pathology	gallbladder cancer	单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、多重免疫荧光染色	10种机器学习方法	RNA测序数据、图像数据	98,113个细胞，来自2个正常邻近组织、2个高级别上皮内瘤变和6个胆囊癌样本
492	2025-05-22	Immunopipe: a comprehensive and flexible scRNA-seq and scTCR-seq data analysis pipeline 2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1 DOI:10.1093/nargab/lqaf063 PMID:40391086	研究论文	介绍了一个名为immunopipe的综合灵活的单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)数据分析流程	提供了命令行工具和用户友好的网页界面，支持无编程经验的研究者进行数据分析和监控	未提及具体的技术验证或性能比较数据	增强对T细胞介导的免疫和免疫治疗的理解	单细胞RNA测序和T细胞受体测序数据	生物信息学	NA	scRNA-seq, scTCR-seq	NA	单细胞测序数据	NA
493	2025-05-22	Isolation of Mouse Bone Marrow Niche Cells for Single-Cell Sequencing 2025-May-22, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/7651_2025_630 PMID:40397275	研究论文	描述了从小鼠股骨和胫骨中分离骨髓微环境细胞用于单细胞RNA测序的方法	利用荧光激活细胞分选技术确保高活性和高纯度的骨髓微环境细胞分离	NA	研究骨髓微环境中的细胞群体	小鼠骨髓微环境细胞	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序, 荧光激活细胞分选	NA	RNA序列数据	小鼠股骨和胫骨中的骨髓微环境细胞
494	2025-05-22	The Landscape of SPP1+ Macrophages Across Tissues and Diseases: A Comprehensive Review 2025-May-21, Immunology IF:4.9Q2 DOI:10.1111/imm.13952 PMID:40395129	综述	本文全面综述了SPP1+巨噬细胞在不同组织和疾病中的分布及其功能	总结了SPP1+巨噬细胞在癌症和非癌症疾病中的功能异质性及其与微环境的相互作用	未提及具体的研究方法或数据来源的局限性	探讨SPP1+巨噬细胞在疾病进展中的作用及其潜在治疗靶点	SPP1+巨噬细胞	免疫学	多种疾病（包括癌症和非癌症疾病）	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
495	2025-05-22	A Single-Cell Atlas-Inspired Hitchhiking Therapeutic Strategy for Acute Pancreatitis by Restricting ROS in Neutrophils 2025-May-21, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202502200 PMID:40395143	研究论文	本研究通过单细胞测序技术揭示了急性胰腺炎中中性粒细胞的亚群组成和极化过程，并开发了一种基于二氧化锰纳米反应器的靶向治疗策略	首次提供了急性胰腺炎中中性粒细胞的单细胞图谱，并创新性地提出了一种基于纳米反应器的靶向治疗策略，通过限制中性粒细胞中的ROS来治疗急性胰腺炎	NA	开发针对急性胰腺炎的个性化治疗方案	中性粒细胞在急性胰腺炎中的极化过程	纳米医学	急性胰腺炎	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序数据	NA
496	2025-05-22	Aging Compromises Terminal Differentiation Program of Cytotoxic Effector Lineage and Promotes Exhaustion in CD8+ T Cells Responding to Coronavirus Infection 2025-May-21, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.70109 PMID:40396260	research paper	该研究探讨了衰老如何影响病毒特异性T细胞在感染过程中的分化程序，特别是在冠状病毒感染模型中	揭示了衰老通过失调定义谱系的转录因子表达，损害了病毒特异性CD8 T细胞的终末分化并促进其耗竭	研究基于小鼠冠状病毒感染模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	研究衰老对病毒特异性T细胞分化程序的影响	老年小鼠中的CD8和CD4 T细胞	免疫学	冠状病毒感染	bulk和单细胞转录组学	小鼠冠状病毒(MHV)感染模型	转录组数据	老年小鼠的CD8和CD4 T细胞
497	2025-05-22	Unraveling the cross-talk between a highly virulent PEDV strain and the host via single-cell transcriptomic analysis 2025-May-21, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.00555-25 PMID:40396761	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示高毒力PEDV毒株与宿主之间的相互作用	首次使用单细胞测序技术分析PEDV感染后的宿主细胞组成、基因表达和细胞间通讯的变化，并发现PEDV可在B和T淋巴细胞中启动复制但无法产生感染性子代	研究仅针对一种流行的高毒力PEDV毒株，未涵盖其他毒株的相互作用	探究PEDV与宿主的相互作用机制，为设计靶向抗病毒干预措施提供依据	猪流行性腹泻病毒(PEDV)及其感染的仔猪空肠细胞	病毒学	猪流行性腹泻	单细胞测序	NA	转录组数据	19,612个空肠细胞（来自PEDV感染和对照仔猪）
498	2025-05-22	Malvidin Alleviates Lipopolysaccharide-Induced Acute Lung Injury by Modulating JAK2/STAT3 Signaling to Inhibit Macrophage M1 Polarization and Oxidative Stress 2025-May-21, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.5c00077 PMID:40397040	研究论文	该研究探讨了锦葵色素（Malvidin）通过调节JAK2/STAT3信号通路抑制巨噬细胞M1极化和氧化应激，从而缓解脂多糖诱导的急性肺损伤的作用	首次揭示了锦葵色素在急性肺损伤中的保护作用及其通过JAK2/STAT3信号通路的作用机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证其效果	评估锦葵色素对急性肺损伤的治疗效果并探究其作用机制	脂多糖诱导的急性肺损伤小鼠模型	生物医学	急性肺损伤	单细胞转录组学、药物靶点预测、RNA测序、分子对接和动力学模拟、Western blot	小鼠模型	基因表达数据、蛋白质数据	未明确提及具体样本数量，但使用了小鼠模型和体外实验
499	2025-05-22	The Role of HbA1c in Parkinson's Disease: An Integrative Analysis by Single-Cell, Bulk Transcriptome and Mendelian Randomization 2025-May-21, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-025-05063-5 PMID:40397357	research paper	该研究通过单细胞、批量转录组和孟德尔随机化综合分析，探讨了HbA1c在帕金森病中的作用	首次将HbA1c与帕金森病预后关联，并通过多组学方法鉴定出5个潜在诊断靶点	研究依赖于公开数据库数据，可能存在样本选择偏差	探究HbA1c与帕金森病预后的因果关系及潜在诊断标志物	帕金森病患者和对照组的基因组和转录组数据	生物信息学	帕金森病	GWAS, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化	逆方差加权(IVW)方法, 机器学习	基因组数据, 转录组数据	223个独立SNPs, 625个基因, 842个差异表达基因
500	2025-05-22	Accurate Transcription Factor Activity Inference to Decipher Cell Identity from Single-Cell Transcriptomic Data with MetaTF 2025-May-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202410745 PMID:40397381	研究论文	本文介绍了一个名为metaTF的计算框架，用于从单细胞RNA测序数据中推断转录因子活性，以更好地理解细胞身份和功能	metaTF在估计转录因子活性方面优于现有方法，并在小鼠造血干细胞发育过程中展示了其在表征细胞身份方面的改进效果，同时还能更好地表征乳腺癌上皮细胞的功能身份，并识别出肿瘤免疫微环境中一种新型神经调节T细胞亚群	NA	通过推断转录因子活性来解密单细胞转录组数据中的细胞身份	单细胞RNA测序数据中的细胞	生物信息学	乳腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	metaTF	基因表达数据	NA