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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-06-05 |
SLC2A1-Dependent Ketone Metabolism Regulates Tumor Progression and Immunotherapy Efficacy in Lung Adenocarcinoma
2026, Critical reviews in immunology
IF:0.8Q4
|
研究论文 | 在肺腺癌中鉴定SLC2A1依赖性酮体代谢调控肿瘤进展和免疫治疗效果的机制 | 通过整合转录组数据、单细胞RNA-seq和功能实验,首次揭示SLC2A1介导的酮体代谢与AMPK/mTOR信号通路在肺腺癌中的交叉调控作用,并构建了生酮-免疫预后特征模型 | 未提供 | 鉴定肺腺癌中与生酮-免疫交叉相关的预后基因并验证其功能 | 肺腺癌患者组织样本、A549细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox回归模型 | RNA测序数据(RNA-seq data) | 肺腺癌患者批量RNA-seq数据来自TCGA和GEO数据库,单细胞RNA-seq数据来源未具体说明 | Illumina(推测基于TCGA和GEO数据来源) | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 482 | 2026-06-05 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing reveals programmed cell death-associated transcriptional programs in sepsis-induced acute lung injury
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0349288
PMID:42234716
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序,揭示脓毒症诱导的急性肺损伤中程序性细胞死亡相关的转录程序 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据,系统鉴定了脓毒症诱导的急性肺损伤中与程序性细胞死亡相关的8基因分类特征,并强调内皮细胞在其中的作用 | 未详细说明样本量大小和潜在的选择偏倚;外部验证队列可能有限;机制验证仅在动物模型中进行 | 识别脓毒症诱导的急性肺损伤中程序性细胞死亡相关的转录特征和潜在生物标志物 | 脓毒症诱导的急性肺损伤患者和CLP诱导的ALI大鼠模型 | 机器学习和生物信息学 | 脓毒症诱导的急性肺损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 随机森林, 梯度提升机 | 转录组数据 | NA(未明确提供样本量) | NA(未提及) | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA(未提及) | E-MTAB-5273(训练集),E-MTAB-5274(外部验证),GSE207651(单细胞数据) |
| 483 | 2026-06-05 |
Loss of KLF15 expression characterizes proximal tubule injury in cisplatin-induced acute kidney injury: A multi-omics study
2026, Current research in toxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.crtox.2026.100300
PMID:42238184
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析发现KLF15表达缺失是顺铂诱导急性肾损伤中近端肾小管损伤的特征,并筛选出潜在治疗药物 | 首次通过整合转录组学、蛋白质组学和单细胞RNA-seq等多组学数据,系统鉴定KLF15为顺铂诱导AKI中关键转录因子,并利用分子对接筛选出靶向KLF15的FDA approved药物 | 未在临床样本中验证KLF15的调控作用及药物疗效,分子对接仅为虚拟筛选,缺乏体内外实验验证 | 鉴定顺铂诱导急性肾损伤中关键转录因子并探索靶向治疗药物 | 顺铂诱导急性肾损伤的小鼠模型及公开的多组学数据集 | 机器学习, 数字病理学 | 急性肾损伤 | RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, Western blot, 分子对接 | 分子对接模型, 转录因子调控网络模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型:20mg/kg顺铂腹腔注射72小时 | NA | bulk RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 484 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptome delineating asymmetric dynamics of CD4+ T and CD8+ T cell lineage commitment in human prenatal thymus
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1823728
PMID:42238583
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据,解析人类产前胸腺中CD4+和CD8+ T细胞谱系决定的不对称动态过程 | 揭示人类胸腺CD4/CD8谱系决定是分阶段非对称动态过程,而非单一事件,并从信号、时间和微环境三个维度阐明了非对称性 | 研究基于已发表数据集的整合,可能受原始数据质量和批次效应影响;功能验证实验可能需要进一步补充 | 阐明人类产前胸腺中T细胞发育的细胞异质性和分子动力学,特别是CD4/CD8谱系决定的动态过程 | 人类产前胸腺细胞(孕7-23周) | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合5个已发表数据集,涵盖孕7-23周人类胸腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 485 | 2026-06-05 |
Exosomal POSTN from cancer-associated fibroblasts drives progression of microinvasive lung adenocarcinoma: insights from single-cell and tissue exosome sequencing analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1767771
PMID:42238572
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和组织外泌体RNA测序分析癌症相关成纤维细胞来源的外泌体POSTN在微浸润性肺腺癌进展中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和组织外泌体RNA测序,揭示了癌症相关成纤维细胞亚群中POSTN+ CAFs通过外泌体传递POSTN促进微浸润性肺腺癌进展的机制 | 未提及 | 阐明微浸润性肺腺癌的细胞生态系统及POSTN+ CAF来源外泌体在早期肺腺癌进展中的作用 | 四例原发性微浸润性肺腺癌病灶及其匹配的邻近肺组织 | 单细胞组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、组织外泌体RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、外泌体转录组数据 | 4例微浸润性肺腺癌患者的原发灶及匹配邻近肺组织 | NA | 单细胞RNA测序、外泌体RNA测序 | NA | NA |
| 486 | 2026-06-05 |
A tryptophan metabolism-related gene signature predicts prognosis and immune features in cutaneous melanoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1806319
PMID:42238596
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研究论文 | 本研究利用转录组和临床数据,构建了基于色氨酸代谢相关基因的预后风险模型,并揭示了其在预测皮肤黑色素瘤预后和免疫特征中的作用 | 首次系统分析了色氨酸代谢相关基因在皮肤黑色素瘤中的表达模式及其与预后和免疫微环境的关系,并构建了一个包含五个基因的风险模型,该模型在独立队列中验证有效 | 需要进一步在更大样本和前瞻性研究中验证该风险模型的临床实用性,以及深入探讨色氨酸代谢调控免疫的具体分子机制 | 探索色氨酸代谢相关基因在皮肤黑色素瘤中预测预后和反映免疫状态的价值 | 皮肤黑色素瘤患者 | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA-seq | Cox回归 | 转录组数据 | 457例皮肤黑色素瘤患者 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 487 | 2026-06-05 |
MAIT Cells Maintain Intestinal Homeostasis Through IL-22 in an Experimental Colitis
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S570529
PMID:42238773
|
研究论文 | 本研究探讨黏膜相关恒定T细胞在实验性结肠炎中通过IL-22维持肠道稳态的作用机制 | 首次发现MAIT细胞通过CCL2-AHR-IL-22调控轴协调IL-22依赖性黏膜修复,揭示了MAIT细胞作为上游协调因子而非仅效应细胞的新角色 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证该调控轴 | 阐明MAIT细胞在肠道稳态维持中的功能及分子机制 | 野生型与MR1基因敲除小鼠的结肠组织和免疫细胞 | 免疫学 | 肠道炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, DSS诱导结肠炎模型, FITC-葡聚糖通透性检测 | NA | 基因表达数据, 组织病理学图像 | 涉及野生型和MR1-/-小鼠的实验性结肠炎模型,具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 488 | 2026-06-05 |
Integrated multi-omics characterization of SPTBN2 overexpression reveals its pro-tumorigenic role and immune microenvironment remodeling in colorectal cancer
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1795514
PMID:42238893
|
研究论文 | 综合多组学特征分析显示SPTBN2在结直肠癌中过表达,揭示其促肿瘤作用和免疫微环境重塑 | 首次整合转录组学、DNA甲基化、单细胞RNA测序及空间转录组学等多组学数据,系统阐明SPTBN2在结直肠癌中的表达模式、表观遗传调控机制及其与免疫抑制微环境的潜在联系 | 缺乏SPTBN2的直接功能干扰实验和独立临床验证以建立因果机制及转化应用价值 | 探索SPTBN2在结直肠癌中的多组学特征及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 结直肠癌组织样本、TCGA和GEO数据库中的多组学数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 基于汇总数据的孟德尔随机化 | NA | 转录组数据、甲基化数据、单细胞测序数据、空间转录组数据 | 基于TCGA和GEO数据库中的公共数据集,具体样本数量未在摘要中明确提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 489 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptomics reveals keratinocyte dynamic processes associated with S100a4 expression in psoriasiform dermatitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1744860
PMID:41660613
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示S100a4在银屑病样皮炎中调控角质形成细胞动态过程的作用 | 首次通过S100a4基因敲除小鼠模型结合单细胞RNA测序,系统揭示了S100a4在银屑病发病中调控角质形成细胞异常增殖和分化的分子机制,并鉴定出Klf9介导的Krt15转录失调是角化过度关键驱动因素 | 未提及具体局限性 | 探究S100A4在银屑病发病中的具体功能和相关分子机制 | S100a4基因敲除小鼠及诱导的银屑病样皮炎模型 | 数字病理学 | 银屑病 | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | S100a4基因敲除小鼠与野生型小鼠(各处理组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 490 | 2026-06-05 |
SLC12A7 serves as a prognostic and immunotherapeutic biomarker identified by multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1712579
PMID:41668766
|
研究论文 | 通过多组学分析鉴定SLC12A7作为预后和免疫治疗生物标志物 | 首次系统揭示SLC12A7在多种癌症中的预后价值和免疫治疗潜力,尤其在肝细胞癌中通过体外实验验证其促癌功能 | 未明确说明具体局限性 | 评估SLC12A7在泛癌中的表达模式、预后意义及免疫相关性,并验证其在肝细胞癌中的致癌作用 | 多种癌症组织样本及肝细胞癌细胞系 | 机器学习和生物信息学 | 肝细胞癌,多种癌症 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | TCGA、GTEx、cBioPortal、TIMER 2.0和GEO数据库中的多种癌症样本 | NA | NA | NA | NA |
| 491 | 2026-06-04 |
The GATA1 N terminus coordinates metabolic reprogramming in erythropoiesis
2026-May-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030464
PMID:41587073
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术揭示GATA1 N端在红细胞生成中协调代谢重编程的分子机制 | 首次发现GATA1 N端缺失会导致糖酵解基因异常上调,并揭示GATA1直接调控PKM基因以及组蛋白乳酸化修饰在PKM启动子中的作用 | 未详细说明GATA1s对线粒体呼吸以外的代谢途径影响,以及DBA患者中其他突变可能存在的混杂因素 | 阐明GATA1 N端在红细胞生成中的分子功能及其与代谢重编程的关系 | Gata1突变胚胎的胎肝细胞、红系细胞以及携带RPS19突变的DBA患者 | 机器学习 | 唐氏综合征髓系白血病, Diamond-Blackfan贫血 | 单细胞RNA测序, 精确核运行测序, CUT&RUN | NA | 基因表达数据 | Gata1突变胚胎和野生型对照胚胎的胎肝细胞,还涉及RPS19突变DBA患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 492 | 2026-06-04 |
Mechanisms, precision therapies, and technological frontiers in coronary atherosclerosis: a comprehensive review
2026-May, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01729-x
PMID:41593207
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综述 | 全面综述冠状动脉粥样硬化的分子机制、精准治疗策略及前沿技术进展 | 系统整合了单细胞转录组学、多基因风险评分和人工智能斑块分析等前沿技术,并探讨了CRISPR-Cas9基因编辑、纳米药物递送和肠道菌群调节等新型治疗手段 | 技术可及性、健康公平性和临床实施方面仍存在挑战 | 综述冠状动脉粥样硬化的疾病机制及新兴治疗策略 | 冠状动脉粥样硬化患者及疾病模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 493 | 2026-06-04 |
Immunosuppressive immune microenvironment landscapes in VISTA-high gastric cancer
2026-Apr, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03290-0
PMID:41588173
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研究论文 | 本研究探讨了VISTA高表达胃癌中的免疫抑制微环境特征 | 首次在胃癌中系统描绘VISTA高表达肿瘤微环境的免疫景观,并揭示VISTA+单核-巨噬细胞通过LGALS9-PTPRC信号轴促进T细胞耗竭的机制 | 缺乏大规模临床验证队列,空间转录组学样本量较小(n=3) | 阐明VISTA在胃癌中的表达模式及其对肿瘤微环境免疫调节功能的影响 | 172例胃癌患者的肿瘤样本(多重免疫组化)、17例样本(单细胞RNA测序)和3例样本(空间转录组学) | 数字病理学 | 胃癌 | 多重免疫组化, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组序列数据 | 172例肿瘤样本(免疫组化)、17例(单细胞测序)、3例(空间转录组) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台, 10x Visium空间转录组学平台 |
| 494 | 2026-06-04 |
Engineered ETS1-Nanoconjugate Restores Immune Homeostasis through Dual Immune-Vascular Modulation in Relapsing and Progressive Multiple Sclerosis
2026-Apr, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202504951
PMID:41589763
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研究论文 | 本文开发了一种基于工程化ETS1纳米缀合物的双免疫-血管调节平台,用于恢复复发性和进行性多发性硬化症中的免疫稳态 | 首次通过单细胞RNA测序发现IL7R是内皮细胞和致病T细胞的共同靶点,并构建了多功能纳米递送平台(IMNP),实现同时调节内皮细胞和T淋巴细胞的双重血管-免疫调节 | 未在摘要中明确提及局限性 | 开发一种能够同时调节血管和免疫系统的新型纳米平台,用于治疗多发性硬化症 | 内皮细胞和致病T细胞,以及复发-缓解型多发性硬化症(RRMS)和继发性进行性多发性硬化症(SPMS)模型 | 纳米医学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 495 | 2026-06-04 |
Hist2Cell: Deciphering fine-grained cellular architectures from histology images
2026-Mar-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101137
PMID:41592568
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研究论文 | 提出Hist2Cell框架,从组织学图像直接解码精细细胞结构 | 首次利用视觉图变换器从组织学图像精确预测精细细胞类型,无需额外训练即可泛化到大规模TCGA数据集 | 未提及在除肺癌和乳腺癌外的其他癌症类型中的表现,也未讨论基因表达预测的准确性 | 开发一种从组织学图像预测细胞类型丰度的成本效益方法,用于大规模空间生物学研究和癌症预后 | 人类肺癌和乳腺癌组织学图像及空间转录组数据 | 计算机视觉 | 肺癌, 乳腺癌 | 空间转录组学, 组织学成像 | 视觉图变换器 | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 496 | 2026-06-04 |
RPS14 as an aging-related biomarker for early-onset alterations of testicular senescence-associated genes in spermatogenic dysfunction at childbearing age
2026-Mar-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glag020
PMID:41592225
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研究论文 | 将RPS14识别为儿童期生育年龄男性精子发生功能障碍中睾丸衰老相关基因早发表型变化的衰老相关生物标志物 | 首次发现RPS14作为衰老相关生物标志物,用于年轻男性精子发生功能障碍睾丸中衰老相关基因的及早变化,并揭示其在睾丸免疫微环境及与睾丸肥大细胞的显著相关性 | 研究未提供具体局限性信息 | 识别年轻男性精子发生功能障碍中睾丸衰老相关基因的衰老相关生物标志物及其功能 | 睾丸组织来自老年小鼠、老年男性、具有完整精子过程或精子发生功能障碍的生育年龄患者 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量微阵列、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、组织样本图像 | 包含两个scRNA-seq数据集、三个批量微阵列数据集以及多种睾丸组织样本 | 10x Genomics、Illumina | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序、Illumina NovaSeq批量RNA测序 |
| 497 | 2026-06-04 |
Phf6 truncating mutation drives leukemogenesis via disrupted epigenetic regulation in mice
2026-Mar, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02828-8
PMID:41588055
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研究论文 | 通过构建携带Phf6截短突变的转基因小鼠模型,揭示其通过破坏表观遗传调控驱动白血病发生的机制 | 首次证明PHF6截短突变通过获得功能效应驱动白血病发生,而非功能缺失,并发现KAT6B乙酰转移酶活性增强介导的H3K27ac全基因组分布改变 | 未提及具体局限性 | 阐明PHF6截短突变在白血病发生中的具体作用及潜在治疗靶点 | Phf6截短突变转基因小鼠及其造血干细胞/祖细胞 | 机器学习 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 转基因小鼠模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 498 | 2026-06-04 |
HFFST: A Hierarchical Feature Fusion Algorithm for Spatial Gene Expression Prediction Using Histopathology Images
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3658320
PMID:41591852
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research paper | 提出HFFST算法,从H&E染色的病理图像中预测空间基因表达,利用层次化特征融合方法提高预测性能 | 提出层次化特征融合算法,采用粗到细的回归框架,充分利用全切片图像的多级特征来预测空间转录组谱 | 研究未提及具体局限性 | 从H&E染色病理图像预测空间基因表达,降低空间转录组学的高成本和技术复杂性 | H&E染色的病理图像及对应的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 层次化特征融合算法 | 图像 | 五个公开数据集和10X Genomics的高分辨率Visium数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 高分辨率Visium数据 |
| 499 | 2026-06-04 |
Humoral IgG1 responses to tumor antigens underpin clinical outcomes in immune checkpoint blockade
2026-Mar, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-04177-6
PMID:41593194
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研究论文 | 本研究探讨了抗PD-1治疗肝细胞癌患者中IgG1浆细胞的体液免疫应答及其对临床结局的影响 | 首次揭示抗PD-1治疗诱导肿瘤特异性IgG1浆细胞反应,并与T细胞活性协同促进临床获益,建立了体液-细胞免疫轴的新机制 | 样本量较小(38例肝细胞癌患者),且主要基于新辅助治疗队列,可能无法完全代表晚期或不同治疗背景的患者群体 | 阐明抗PD-1免疫检查点抑制治疗中体液免疫应答(特别是IgG1浆细胞)的作用及其与临床结局的关系 | 接受新辅助抗PD-1治疗的肝细胞癌患者的肿瘤组织、血清及外周血样本 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、批量RNA测序、空间转录组学、血清学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据、蛋白质数据 | 38例肝细胞癌患者(主要队列),额外7个独立队列共500例单细胞/批量测序数据、7例空间转录组数据及1582例生存分析数据 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 500 | 2026-06-04 |
RORγt+ dendritic cells are a distinct lymphoid-derived lineage
2026-Feb-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aed7439
PMID:41591258
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研究论文 | 本文通过谱系追踪和单细胞转录组学,揭示了小鼠中RORγt+树突状细胞作为淋巴来源的独特谱系,对维持肠道免疫耐受至关重要 | 首次鉴定出RORγt+树突状细胞是淋巴来源的独特谱系,并发现其前体包括RORγt先天淋巴祖细胞和pre-RORγt树突状细胞前体,以及调控其发育的关键增强子和转录因子 | 研究主要基于小鼠模型,结论在人类中的适用性尚未验证;且未深入探讨RORγt树突状细胞在疾病状态下的功能变化 | 阐明耐受性树突状细胞谱系如何建立以维持肠道免疫稳态 | 小鼠骨髓中的树突状细胞及其前体细胞,以及RORγt+树突状细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠骨髓样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |