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当前共找到 39535 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-05-15 |
Endocrine therapy reprogramming of breast cancer facilitates metastatic escape via upregulation of P-Rex1/Rac1 signalling
2026-05-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70683-x
PMID:42115169
|
研究论文 | 本研究揭示内分泌治疗通过上调P-Rex1/Rac1信号通路促进乳腺癌转移逃逸的机制 | 首次发现内分泌治疗可重编程乳腺癌细胞，通过上调P-Rex1/Rac1信号轴促进晚期复发转移，并提出该通路作为潜在治疗靶点 | NA | 探究内分泌治疗后乳腺癌晚期复发的分子机制 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞及患者样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、活体成像 | NA | 基因表达数据、影像数据 | 临床队列样本及患者来源异种移植模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 转录组测序 |
| 482 | 2026-05-15 |
Single-cell and spatial omics in liver identify cell-cell communication regulators in aging and insulin resistance
2026-May-09, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156630
PMID:42114673
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq、ATAC-seq和空间转录组学技术，研究肝脏在衰老和胰岛素抵抗过程中细胞组成和分区的变化，并揭示细胞间通讯调节因子 | 首次结合单细胞RNA-seq、ATAC-seq和空间转录组学，系统解析了肝脏在衰老和胰岛素抵抗中的细胞组成和分区动态变化，并鉴定出肝细胞生长因子信号通路在其中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探究肝脏在衰老过程中如何调节胰岛素抵抗的细胞和分子机制 | 年轻胰岛素敏感小鼠和不同程度胰岛素抵抗的老年小鼠的肝脏组织 | 机器学习 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | 年轻胰岛素敏感小鼠和老年胰岛素抵抗小鼠（具体数量未提及） | 10x Genomics, NA, NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, NA | 10x Chromium用于单细胞RNA-seq和ATAC-seq，10x Visium用于空间转录组学 |
| 483 | 2026-05-15 |
A transcriptionally distinct population of human adipocytes with end-of-trajectory signature (hEOS) emerges during obesity to drive maladaptive inflammation
2026-May-08, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108240
PMID:42107509
|
研究论文 | 通过整合单核RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，确定了一个在肥胖中出现的具有终末轨迹特征的脂肪细胞群体hEOS，该群体与巨噬细胞形成空间单元，通过HIF1A-LAMA4-ITGB1-NF-κB轴驱动炎症 | 首次鉴定出肥胖相关的疾病特异性脂肪细胞群体hEOS，并揭示其与巨噬细胞共同形成的适应不良空间免疫代谢单元，以及LAMA4-整合素-NF-κB轴作为潜在治疗靶点 | 未提及明显局限性 | 研究肥胖相关脂肪组织微环境中脂肪细胞与免疫细胞的相互作用机制，寻找新的治疗靶点 | 人类白色脂肪组织中的脂肪细胞和巨噬细胞 | 自然语言处理 | 肥胖相关代谢疾病 | 单核RNA测序， 空间转录组学， 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据， 空间转录数据 | 489名个体的247,406个细胞核 | NA | 单核RNA-seq， 空间转录组学， 批量RNA-seq | NA | NA |
| 484 | 2026-05-15 |
A D-dimer and ADAMTS8 based multi-marker score for the diagnosis of acute aortic dissection
2026-05-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-51121-w
PMID:42098242
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学筛选和血浆蛋白验证，开发了一种基于D-二聚体和ADAMTS8的多标志物评分，用于急性主动脉夹层的诊断 | 首次利用空间转录组学技术筛选急性主动脉夹层相关基因，并构建了整合D-二聚体、ADAMTS8、身高、收缩压和年龄的多标志物诊断评分，实现了高灵敏度和特异性 | 样本量相对有限，独立验证集的代表性可能不足，评分在真实临床环境中的普适性需进一步验证 | 探索用于优化急性主动脉夹层诊断的生物标志物 | 急性主动脉夹层患者及对照人群的血浆样本和主动脉组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、血浆蛋白水平数据 | 302名参与者（173例急性主动脉夹层病例，129例对照） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 485 | 2026-05-15 |
Dynamic responses of cancer-associated fibroblasts to therapy in primary liver cancer
2026-May-05, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218566
PMID:42097494
|
综述 | 该综述全面总结了原发性肝癌中肿瘤相关成纤维细胞（CAF）的异质性、功能多样性及治疗反应中的动态变化 | 从空间分布和治疗响应角度系统整合CAF亚型在肝细胞癌和肝内胆管癌中的标记物与功能，并动态描绘化疗和免疫治疗下CAF亚型的变化及其对预后的影响 | CAF亚型鉴定缺乏统一标记物，且治疗诱导的可塑性机制尚不明确 | 概述原发性肝癌中CAF亚型在治疗（化疗、免疫治疗）中的动态响应及其对治疗结局的影响 | 原发性肝癌（肝细胞癌和肝内胆管癌）中的肿瘤相关成纤维细胞（CAF） | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间多组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics， Illumina | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | 10x Chromium， Illumina NovaSeq | 10x Chromium 单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学 |
| 486 | 2026-05-15 |
Benchmarking sketching methods on spatial transcriptomics data
2026-May-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag434
PMID:42109248
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研究论文 | 系统评估了多种采样方法在空间转录组数据中的应用效果，提出空间感知的采样策略以平衡转录组异质性和组织覆盖度 | 首次系统对比了基于表达空间、空间坐标和空间平滑嵌入三种输入表示下的多种采样方法，并提出了结合空间权重矩阵的随机奇异值分解基的杠杆分数采样，能够同时恢复稀有细胞状态、实现均匀组织覆盖并避免边缘效应 | 研究仅限于模拟和真实数据集中的特定组织类型，可能无法完全泛化到其他空间转录组技术或组织类型 | 评估并改进采样方法以应对大规模空间转录组数据分析中的计算瓶颈 | 鼠卵巢、MERFISH脑、人乳腺癌和肺组织等多个真实空间转录组数据集及模拟数据 | 数字病理学 | 肺癌， 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据， 空间坐标数据 | 多个空间转录组数据集，包括鼠卵巢、MERFISH脑、人乳腺癌和肺组织 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | NA |
| 487 | 2026-05-15 |
Nested co-expression network analysis identifies compact gene clusters in a black box
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag167
PMID:41934621
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研究论文 | 提出Nested-WGCNA算法，用于识别粗粒度和细粒度基因模块，并在免疫治疗响应数据中揭示预测和预后生物标志物 | 通过两阶段无监督网络分析算法，首次实现了在转录组数据中同时识别广域和嵌套的基因模块，能够捕捉到传统方法遗漏的、对应于特化细胞类型亚过程的紧凑基因集 | NA | 开发一种能够同时识别广域和嵌套基因模块的数字分析方法，以揭示生物系统中的功能异质性 | 基因共表达网络及免疫治疗响应数据集 | 机器学习 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | Nested-WGCNA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 488 | 2026-05-15 |
Belimumab modulates type I interferon signalling in the treatment of systemic lupus erythematosus
2026-05, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/03t59o
PMID:41328601
|
研究论文 | 贝利木单抗通过调节I型干扰素信号通路治疗系统性红斑狼疮的免疫图谱变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示贝利木单抗对SLE患者免疫图谱的调控机制，特别是对IFN刺激基因活性和特定免疫细胞亚群的抑制作用 | 样本量较小（仅6名患者），且对照组仅接受常规治疗，可能存在混杂因素影响结果解释 | 研究贝利木单抗对系统性红斑狼疮患者免疫细胞图谱的影响及其作用机制 | 6名活动性系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学， 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6名患者（3名接受贝利木单抗联合常规治疗，3名仅接受常规治疗） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 489 | 2026-05-15 |
GatorST: A Versatile Contrastive Meta-Learning Framework for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2026-May, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202600006
PMID:41947710
|
research paper | 提出一种名为GatorST的对比元学习框架，用于空间转录组数据分析，通过整合局部邻域和全局组织上下文生成空间信息表示 | 将图建模与元学习策略相结合，通过双跳子图捕捉细粒度空间上下文，并利用聚类产生伪标签进行弱监督学习，采用情景训练方法增强模型泛化能力 | 未提及具体局限性，但从方法描述看可能依赖邻域图构建的准确性，且伪标签质量可能影响弱监督学习效果 | 开发一种能够有效整合局部和全局空间信息，稳健生成空间转录组数据表示的通用框架 | 空间转录组数据中的基因表达谱及其空间背景信息 | machine learning | NA | 空间转录组学 | 对比学习，元学习，图神经网络 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 490 | 2026-05-15 |
A single-cell atlas of Toxoplasma sexual development in the feline intestinal tract
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02294-7
PMID:42020723
|
研究论文 | 对弓形虫在猫肠道内进行有性发育的单细胞图谱分析 | 首次通过单细胞转录组学解析弓形虫在猫肠道中的有性发育基因调控网络，并鉴定出AP2X6为大配子体发育的调控因子 | 数据主要来源于猫肠道样本，可能无法完全反映体外培养条件下的发育过程 | 探究弓形虫在猫肠道中的有性发育基因调控网络 | 从猫肠道中分离的弓形虫细胞 | 数字病理学 | 弓形虫病 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9 Perturb-seq | NA | 基因表达数据 | 2次实验中采集15,068个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 491 | 2026-05-15 |
Unravelling bacterial complexity at high resolution with single-cell transcriptomics
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02333-3
PMID:42067624
|
综述 | 综述细菌单细胞转录组学的高分辨率研究方法及其在理解细菌异质性、生理、代谢、抗生素耐药、致病性和微生物群落相互作用中的应用 | 系统梳理了细菌单细胞RNA测序的最新进展，包括开发的方法和从应用中获得的见解，强调该领域如何革新对细菌生理学、感染生物学和微生物群落相互作用的认知 | 讨论了技术上和计算上的挑战、标准化的必要性及实现方式 | 总结细菌单细胞RNA测序的最新进展和应用，展望未来发展 | 细菌单细胞转录组学研究 | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 492 | 2026-05-15 |
PEDF Prevents Corneal Endothelial Dysfunction of Fuchs Endothelial Corneal Dystrophy
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.2
PMID:42080792
|
研究论文 | 探索色素上皮衍生因子对Fuchs内皮角膜营养不良角膜内皮的保护作用 | 首次发现PEDF能通过抑制p53、TGF-β和Hippo信号通路预防FECD角膜内皮功能障碍 | 仅限于小鼠模型和体外细胞实验，缺乏人体临床试验数据 | 研究PEDF对FECD角膜内皮的保护机制 | FECD患者房水、人角膜内皮细胞、UVA诱导的FECD小鼠模型 | 机器学习 | Fuchs内皮角膜营养不良 | 酶联免疫吸附测定、免疫荧光染色、单细胞RNA测序、RNA测序、定量PCR、自动化简单Western分析 | NA | 图像、文本、数值 | FECD患者房水样本、培养的人角膜内皮细胞、UVA诱导的FECD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 493 | 2026-05-15 |
Suboptimal Responses to Anti-VEGF in Retinal Neurovascular Diseases: Linking Aging and Alternative Angioinflammatory Pathways
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.4
PMID:42080790
|
研究论文 | 采用系统生物学框架揭示视网膜神经血管疾病中抗VEGF治疗反应不佳的机制，关注衰老与替代性血管生成炎症通路 | 整合多组学数据集、网络机器学习与疾病特异性通路映射，识别了EGFR、HSP90AA1、SIRT1和STAT3作为中心耐药枢纽，并发现21条保守核心信号级联 | 结果需在疾病相关模型中进行验证 | 阐明抗VEGF治疗失败和疾病进展的共同机制 | 糖尿病视网膜病变、年龄相关性黄斑变性、视网膜色素变性、青光眼及衰老相关的眼部疾病 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | 网络机器学习 | 多组学数据 | 14个核心基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | AMD-RPE簇单细胞RNA测序 |
| 494 | 2026-05-15 |
MXRA5 is identified and validated as a key gene related to epithelial-mesenchymal transition in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes
2026-05, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/dt5mf6
PMID:41105461
|
研究论文 | 通过单细胞分析及机器学习方法识别并验证MXRA5为类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞中与上皮-间质转化相关的关键基因 | 首次结合单细胞分析及五种机器学习算法（XGBoost、Boruta、随机森林、LASSO、SVM-RFE）筛选出RA滑膜细胞中与EMT相关的关键基因MXRA5，并通过功能实验验证其作用 | 未提及具体局限性信息 | 利用单细胞分析及机器学习方法识别RA滑膜细胞中与EMT相关的重要基因并进行功能验证 | 类风湿关节炎患者的滑膜细胞，特别是成纤维样滑膜细胞 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | XGBoost，Boruta，随机森林，LASSO，SVM-RFE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 495 | 2026-05-12 |
Exceptional Longevity Modifying Allele APOE2 Promotes DNA Signaling Pathways Resisting Cellular Senescence in Human Neurons
2026-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70494
PMID:42103698
|
研究论文 | 研究发现长寿相关APOE2等位基因通过促进DNA修复和抑制细胞衰老途径，增强人类神经元的抗衰老能力 | 首次揭示APOE2通过促进DNA修复和信号通路而非单纯脂质代谢来抵抗神经元衰老，并在两种神经元亚型中验证了该机制 | 未提供 | 探究APOE2等位基因如何促进神经元长寿并提供神经保护 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）来源的GABA能神经元和谷氨酸能神经元，以及APOE靶向替换小鼠 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类iPSC来源的GABA能神经元和谷氨酸能神经元，以及APOE靶向替换小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 496 | 2026-05-15 |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus infection of the male reproductive tract induces pathology and inflammation
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02298-3
PMID:41882300
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研究论文 | 研究发现严重发热伴血小板减少综合征病毒（SFTSV）感染雄性生殖道，导致病理变化和炎症反应 | 首次揭示SFTSV对雄性生殖器官的广泛趋向性，发现病毒引起睾丸间质细胞凋亡、焦亡和炎症，破坏睾酮生成，并鉴定出CCR2和SPP1巨噬细胞表达的S100A4蛋白是附睾过度炎症和纤维化的关键驱动因子 | 未提及具体局限性 | 探究SFTSV是否感染雄性生殖道及其对生殖健康的影响 | 小鼠模型及感染患者（男性） | 数字病理学 | 发热伴血小板减少综合征 | single-cell RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠和感染患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chrome单细胞基因表达分析 |
| 497 | 2026-05-15 |
Transcriptional regulators predicted to drive macrophage dysregulation during impaired wound healing in diabetic mice
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.719960
PMID:42079057
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研究论文 | 通过时间序列单细胞RNA测序数据，识别驱动糖尿病小鼠伤口愈合过程中巨噬细胞失调的转录调控因子 | 将Lamian框架与伪时间图扩散新方法结合，使用BITFAM模型和CellOracle进行计算机扰动，系统预测调控不同细胞状态转换的转录因子群 | 研究发现主要基于计算机预测，虽然部分结果经实验数据验证，但尚缺乏全面的实验功能验证 | 揭示糖尿病伤口愈合中巨噬细胞失调的转录调控机制 | 非糖尿病和糖尿病小鼠伤口部位的巨噬细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型、图扩散模型 | 基因表达数据 | 非糖尿病和糖尿病小鼠的伤口巨噬细胞时间序列单细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 498 | 2026-05-15 |
Construction of a Prognostic Model for Hepatocellular Carcinoma Based on Cell Death-related Genes and Characterization of Immune Microenvironment
2026-Apr-22, Iranian journal of allergy, asthma, and immunology
DOI:10.18502/ijaai.v25i3.21259
PMID:42130143
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研究论文 | 基于细胞死亡相关基因构建肝细胞癌预后模型并表征免疫微环境 | 整合25种细胞死亡模式相关基因，通过多步骤分析筛选出6个预后基因并构建风险评分模型和列线图，结合单细胞RNA测序解析关键细胞类型和细胞间通讯 | 研究基于公开转录组数据集，样本规模有限，且单细胞分析结果需进一步实验验证 | 阐明与25种细胞死亡模式相关的基因在肝细胞癌发生发展中的作用，并构建预后模型 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, qRT-PCR | Cox比例风险模型，多变量回归模型 | 基因表达数据 | 多项公开数据集及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 499 | 2026-05-15 |
Deep single-cell decoding of human pancreatic islets reveals T2D β-cell gene expression defects
2026-Apr-15, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00744-w
PMID:41986506
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研究论文 | 对人类胰腺胰岛进行深度单细胞解码，揭示了2型糖尿病β细胞基因表达缺陷 | 首次对来自非糖尿病、糖尿病前期和2型糖尿病状态的48名供体的245,878个人类胰岛细胞进行全面的单细胞转录组分析，并识别出14种不同细胞类型，发现T2Dβ细胞中511个差异表达基因，包括维生素A代谢相关基因，并通过多模态功能验证与β细胞活力受损关联；整合T2D遗传学、蛋白质组学和小鼠模型代谢表型，确定了58个候选因果T2D基因 | 可能受限于样本来源和数量，尚未充分验证所有候选基因在T2D病理生理中的具体作用机制 | 揭示2型糖尿病中人类胰岛细胞类型特异性的改变及其基因表达缺陷 | 48名供体的人类胰岛细胞，包括非糖尿病、糖尿病前期和2型糖尿病状态 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 245,878个细胞来自48名供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 500 | 2026-05-15 |
Loss of MITF activity leads to emergent cell states from the melanocyte stem cell lineage
2026-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.23.695681
PMID:41993564
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研究论文 | 利用斑马鱼模型研究MITF活性缺失对黑素细胞干细胞谱系中细胞状态涌现的影响 | 首次通过活体成像结合单细胞转录组学和谱系追踪，揭示MITF活性缺失导致黑素细胞干细胞在胚胎发育过程中出现异常早期扩张及新的转录细胞状态 | 未明确说明研究的局限性 | 探究MITF在胚胎发育中保护黑素细胞干细胞及其成体色素生成潜能的作用机制 | 斑马鱼黑素细胞干细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪、活体成像 | NA | 单细胞转录组数据、活体成像数据 | 斑马鱼胚胎及幼体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |