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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-03-29 |
Single-nucleus multiomic profiling of the aging mouse substantia nigra reveals conserved gene alterations linked to Parkinson's disease
2026-Mar-27, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281113.125
PMID:41781332
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研究论文 | 本研究通过对小鼠黑质进行单核多组学测序,揭示了衰老过程中与帕金森病相关的保守基因变化 | 首次使用单核多组学测序技术,在细胞类型特异性水平上描绘了小鼠黑质在整个生命周期中的转录组和表观基因组变化,并整合了多个公共PD单细胞RNA-seq数据集,识别出85个在衰老和PD中一致差异表达的基因 | 研究基于小鼠模型,其结果向人类PD的转化需要进一步验证;样本量相对有限 | 阐明衰老与帕金森病病理之间的具体联系机制 | 小鼠黑质中的细胞 | 单细胞基因组学 | 帕金森病 | 单核多组学测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 40,125个细胞 | NA | 单核多组学测序,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 482 | 2026-03-29 |
Application of GBD 2021 and multiple omics to reveal the association and potential mechanism between glycated hemoglobin and intervertebral disc degeneration
2026-Mar-27, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05208-w
PMID:41893906
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研究论文 | 本研究整合全球疾病负担数据、孟德尔随机化分析、多组学数据和单细胞转录组学,全面揭示了糖化血红蛋白与椎间盘退变之间的关联及潜在机制 | 首次通过整合全球流行病学数据、孟德尔随机化因果推断、多组学整合分析及单细胞转录组学,系统揭示了HbA1c与IVDD的因果关系,并鉴定了五个关键HbA1c相关基因及其在椎间盘退变中的细胞特异性作用 | 研究主要基于公共数据库和已有测序数据,缺乏实验验证;单细胞分析样本量有限;药物靶向预测需进一步实验确认 | 阐明糖化血红蛋白对椎间盘退变的因果影响,鉴定关键相关基因并探索其分子机制及潜在治疗靶点 | 全球人群糖尿病与腰痛流行病学数据、椎间盘退变相关基因组数据、人髓核组织单细胞转录组数据 | 生物信息学与多组学整合分析 | 椎间盘退变 | 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接 | NA | 流行病学数据、基因组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | 全球人群流行病学数据、大型GWAS汇总统计数据、单细胞RNA测序人髓核组织样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 483 | 2026-03-29 |
Analysis and validation of mast cells and enriched genes in colorectal cancer with liver metastasis by multi-omics data
2026-Mar-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04916-2
PMID:41894110
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析,探讨了肥大细胞在结直肠癌肝转移中的作用,并构建了基于肥大细胞富集基因的预测模型 | 首次结合bulk-seq和scRNA-seq数据,系统分析肥大细胞在结直肠癌肝转移中的比例变化,并鉴定出三个关键基因构建预测模型 | 样本量相对有限(223个样本),且未深入探讨肥大细胞影响肝转移的具体分子机制 | 确定肥大细胞及其富集基因在结直肠癌肝转移中的作用 | 结直肠癌患者组织样本(包括原发灶和肝转移灶) | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学数据分析、CIBERSORT算法、scRNA-seq、免疫组化 | 预测模型(基于基因表达) | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、临床数据 | 223个样本(来自四个bulk-seq数据集),外加scRNA-seq数据集和临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 484 | 2026-03-29 |
Hypergraph Representations of Single-Cell RNA Sequencing Data for Improved Cell Clustering
2026-Mar-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag148
PMID:41896196
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研究论文 | 本文提出了一种将单细胞RNA测序数据表示为超图的新方法,并开发了两种新的聚类算法,以提高细胞类型识别的准确性 | 首次将单细胞RNA测序数据表示为超图以捕获高阶信息,并提出了两种新的超图随机游走聚类算法(DIPHW和CoMem-DIPHW),其中CoMem-DIPHW整合了单细胞基因表达局部信息和共表达网络全局信息 | 未明确说明算法在超大规模数据集上的计算效率,且主要针对具有弱模块性的数据展示了最大改进 | 改进单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析,提高细胞类型分化的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 超图随机游走算法(DIPHW, CoMem-DIPHW) | 基因表达数据 | 多个真实世界数据集(人类胰腺、小鼠胰腺、人类大脑、小鼠大脑组织细胞)以及基于人类肺腺癌细胞系的真实标注数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 485 | 2026-03-29 |
Th17-driven CD8+ T cells in hUC-MSC and CAR T-cell dual immunotherapy for superior anti-tumor efficacy
2026-Mar-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08656-7
PMID:41896206
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研究论文 | 本研究开发了一种结合人脐带间充质干细胞与CD19 CAR-T细胞的双重细胞免疫疗法,以增强在高肿瘤负荷条件下的抗肿瘤疗效 | 首次提出并验证了hUC-MSCs与CAR-T细胞联合使用的双重免疫治疗策略,揭示了hUC-MSCs通过诱导Th17分化促进CD8+ NK样细胞毒性T淋巴细胞生成,从而增强CAR-T细胞功能并减轻CRS的新机制 | 研究主要在异种移植模型中进行,尚未在人体临床试验中验证;对hUC-MSCs作用的具体分子机制探索仍需深入 | 提高CAR-T细胞疗法在高肿瘤负荷血液恶性肿瘤中的疗效和安全性 | B细胞淋巴瘤异种移植模型、CD19 CAR-T细胞、人脐带间充质干细胞 | 细胞免疫治疗 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 486 | 2026-03-29 |
Single-bacterial cell insights into mechanisms of ceftriaxone resistance in Neisseria subflava
2026-Mar-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68621-y
PMID:41896210
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了奈瑟菌亚黄种在头孢曲松压力下的适应性机制,包括耐药性增强、生物膜形成和遗传重编程 | 整合实验进化和单细胞转录组学,首次在单细菌细胞水平上解析了奈瑟菌亚黄种从共生体向病原体转变的多维策略 | 研究主要基于实验室进化模型,临床样本验证有限,且未全面探讨其他环境因素对适应性的影响 | 探究抗生素压力如何驱动奈瑟菌亚黄种的适应性进化,以理解共生体向病原体转变的机制 | 奈瑟菌亚黄种(Neisseria subflava) | 微生物学与单细胞分析 | 慢性呼吸道疾病 | 全基因组测序,单细胞转录组学 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 实验进化菌株及临床分离株 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 487 | 2026-03-29 |
HIF1 inhibition targets tumoral and myeloid cells, and is a promising therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer
2026-Mar-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08590-8
PMID:41896221
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学等方法,揭示了缺氧诱导因子HIF1在转移性去势抵抗性前列腺癌中的作用,并证明其抑制是一种有前景的治疗策略 | 结合单细胞和空间转录组学揭示了Pten/Trp53缺失小鼠前列腺肿瘤的缺氧微环境及免疫细胞组成,并首次证明HIF1抑制可通过靶向肿瘤细胞和髓系细胞来克服去势抵抗并消除转移灶 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的直接转化仍需验证;HIF1抑制对上皮可塑性的影响有限 | 探究转移性去势抵抗性前列腺癌的分子和细胞机制,并评估HIF1抑制作为治疗策略的潜力 | Pten和Trp53失活的小鼠前列腺癌模型及其肝转移灶 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 流式细胞术, 免疫组织化学分析 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 488 | 2026-03-29 |
HarveST uses a heterogeneous graph learning framework to reveal spatial transcriptomics patterns
2026-Mar-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09841-2
PMID:41896336
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研究论文 | 本文提出了一个名为HarveST的异构图学习框架,用于整合空间、转录组和基因-基因相互作用数据,以识别空间转录组学中的空间域和标记基因 | 开发了一个统一的异构图计算模型,结合了自监督学习和部分监督细化策略,并采用带重启的随机游走算法识别空间域特异性可变基因,支持跨连续切片的一致功能域重建 | 未在摘要中明确说明 | 提高空间转录组学数据中空间域识别和标记基因检测的准确性和生物学意义 | 人类皮层组织、小鼠嗅球和肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 异构图学习框架 | 空间转录组数据、基因表达数据、空间位置数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 489 | 2026-03-29 |
Single-cell analysis of signalling and transcriptional responses to type I interferons
2026-Mar-27, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00750-3
PMID:41896367
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析,探究了人类免疫细胞对I型干扰素的信号传导和转录反应 | 首次在多种原代细胞类型中,结合质谱流式细胞术和单细胞RNA测序,系统比较了17种不同I型干扰素诱导的细胞特异性反应 | 未发现不同I型干扰素亚型之间存在质的差异反应,且研究主要基于体外刺激模型 | 阐明不同I型干扰素在人类免疫细胞中是否诱导不同的信号传导和转录反应 | 人类外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | NA | 质谱流式细胞术, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质磷酸化数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 490 | 2026-03-29 |
AI-driven body composition atlas reveals its association with NSCLC immunotherapy outcome and molecular background: a multicenter study
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01382-5
PMID:41896593
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研究论文 | 本研究利用深度学习算法从CT图像中自动提取身体成分参数,揭示了其与非小细胞肺癌免疫治疗结果及分子背景的关联 | 首次通过AI驱动的身体成分图谱进行多中心、多维度的综合分析,并提供了生物学解释,揭示了性别差异和位置特异性 | 研究主要基于回顾性队列,前瞻性单细胞RNA-seq队列样本量较小(n=23),且结果可能存在人群特异性 | 探索身体成分参数与NSCLC免疫治疗疗效及分子机制之间的关联 | 非小细胞肺癌患者 | 计算机视觉 | 肺癌 | 深度学习算法、单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | 深度学习 | 图像、RNA-seq数据 | 2,132名NSCLC患者,包括1,919名免疫检查点抑制剂预后队列、190名bulk RNA-seq队列和23名前瞻性单细胞RNA-seq队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 491 | 2026-03-29 |
Fibroblast-like cells accumulate late in human coronary atherosclerosis contributing to necrotic core formation
2026-Mar-26, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag002
PMID:41553378
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序验证的标记物,利用多重免疫染色和机器学习辅助细胞分类,分析了人类冠状动脉粥样硬化中不同间充质细胞亚型的时空分布及其与坏死核心形成的关系 | 首次在人类冠状动脉粥样硬化中详细绘制了间充质细胞亚型在疾病进展中的时空分布图,并揭示了成纤维样细胞在坏死核心形成中的关键作用 | 研究样本主要来自法医尸检和颈动脉内膜切除术,可能无法完全反映活体动态过程;样本量相对有限(44个动脉段) | 探究人类冠状动脉粥样硬化中不同间充质细胞亚型的积累时机、空间分布及其在疾病进程中的作用 | 人类左前降支动脉和颈动脉粥样硬化斑块样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 多重免疫染色,单细胞RNA测序验证,机器学习辅助细胞分类 | 机器学习辅助分类模型 | 组织切片图像 | 44个动脉段来自38个个体,涵盖正常内膜、适应性内膜增厚、病理性内膜增厚和纤维粥样斑块 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 492 | 2026-03-29 |
Microglia-mediated protection against Alzheimer's disease pathology and detrimental effects in white matter revealed by Ptpn6 deletion
2026-Mar-26, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2026.02.023
PMID:41895269
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研究论文 | 本研究通过删除Ptpn6基因,揭示了小胶质细胞在阿尔茨海默病中的保护作用及其在白质中的潜在有害影响 | 首次在全基因组CRISPR筛选中识别Ptpn6作为巨噬细胞存活的关键调节因子,并展示了其在阿尔茨海默病模型中对小胶质细胞的双重作用 | 研究主要基于TauPS2APP小鼠模型,可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性,且未详细探讨Ptpn6缺失在其他神经退行性疾病中的影响 | 探究Ptpn6基因在小胶质细胞功能中的作用及其对阿尔茨海默病病理的影响 | 小胶质细胞、巨噬细胞、TauPS2APP阿尔茨海默病小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | TauPS2APP小鼠模型 | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 493 | 2026-03-29 |
Circuit and molecular mechanisms underlying incubation of methamphetamine craving in the prelimbic cortex
2026-Mar-26, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2026.02.017
PMID:41895270
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研究论文 | 本研究揭示了前边缘皮层中生长抑素和钙结合蛋白中间神经元在甲基苯丙胺渴求孵化中的时间和环路特异性作用 | 首次阐明了前边缘皮层中不同中间神经元亚型在药物渴求不同阶段的特异性贡献,并识别出KCNC2作为潜在的阶段特异性治疗靶点 | 研究主要基于动物模型,尚未在人类中进行验证 | 探究甲基苯丙胺使用障碍中渴求孵化的神经机制 | 前边缘皮层的生长抑素和钙结合蛋白中间神经元 | 神经科学 | 甲基苯丙胺使用障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 494 | 2026-03-29 |
SPTEdU-seq enables parallel optics-free newborn cell tracking and spatial total transcriptional dynamics in intact microenvironments
2026-Mar-26, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.03.001
PMID:41895283
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研究论文 | 本文介绍了SPTEdU-seq技术,该技术整合了空间总转录组学和5-乙炔基-2'-脱氧尿苷追踪,用于同时分析基因表达和增殖动态 | SPTEdU-seq实现了超高的编码和非编码转录本及剪接异构体检测灵敏度,并通过单分子探针设计消除了光学成像需求,能够在完整微环境中并行追踪新生细胞和空间总转录动态 | NA | 研究生物过程中增殖和转录动态的时空映射 | 小鼠大脑(发育和成年)、小鼠缺血性中风模型、小鼠和人类肾脏肿瘤 | 空间转录组学 | 缺血性中风、肾脏肿瘤 | 空间总转录组学、5-乙炔基-2'-脱氧尿苷追踪 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间总转录组学 | NA | NA |
| 495 | 2026-03-29 |
Multi-omics reveal vitamin D regulation of immune-gut microbiome interactions and tolerogenic pathways in inflammatory bowel disease
2026-Mar-26, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102703
PMID:41895287
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探究了维生素D对炎症性肠病患者免疫-肠道微生物组相互作用的影响,揭示了维生素D促进免疫耐受的机制 | 首次结合IgA-seq、IgG-seq、血液单细胞RNA测序和免疫组库测序等多组学技术,系统分析维生素D对IBD患者免疫-肠道微生物组互作的调节作用 | 研究样本量较小,且为短期干预(12周),长期效果和机制需进一步验证 | 探究维生素D如何调节炎症性肠病患者的免疫-肠道微生物组相互作用及耐受性通路 | 炎症性肠病患者 | 多组学分析 | 炎症性肠病 | IgA-seq、IgG-seq、16S rRNA测序、单细胞RNA测序、免疫组库测序 | NA | 测序数据、临床数据 | 未明确样本数量,但涉及IBD患者进行12周维生素D干预 | NA | 单细胞RNA测序、免疫组库测序、16S rRNA测序 | NA | NA |
| 496 | 2026-03-29 |
Exploring cell types and their dynamic states in adipose tissue
2026-Mar-26, Trends in endocrinology and metabolism: TEM
DOI:10.1016/j.tem.2026.01.012
PMID:41896071
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综述 | 本文综述了脂肪组织中细胞类型及其动态状态的研究现状,包括单细胞转录组学在识别新型细胞类型和状态方面的应用 | 整合了单细胞转录组学技术的最新进展,系统性地描述了脂肪组织中多种细胞类型(如脂肪细胞、免疫细胞等)的动态状态变化及其在病理生理刺激下的可塑性机制 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献总结,可能未覆盖所有最新研究 | 探索脂肪组织中细胞类型的异质性及其动态功能状态,以理解脂肪组织的功能可塑性 | 脂肪组织中的细胞类型,包括脂肪细胞、脂肪干细胞和祖细胞、免疫细胞、血管细胞和间皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 497 | 2026-03-29 |
Nuclear prostaglandin E synthase 3 promotes hepatocellular carcinoma growth with immunosuppressive macrophage polarization via the SP1/TGF-β axis
2026-Mar-25, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-026-00431-6
PMID:41880053
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研究论文 | 本研究揭示了前列腺素E合成酶3(PTGES3)在肝细胞癌(HCC)中的非经典核功能,它通过SP1/TGF-β轴同时促进肿瘤生长和免疫抑制性巨噬细胞极化 | 首次定义了PTGES3的非经典核功能,发现其作为连接肿瘤内在生长与外在免疫重塑的双功能调节因子,并阐明了其通过结合SP1启动子驱动TGF-β分泌的具体分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证相对有限;免疫抑制微环境的其他细胞成分(如T细胞)的作用未深入探讨 | 探究PTGES3在肝细胞癌进展和免疫微环境重塑中的作用机制 | 肝细胞癌(HCC)细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAM)、DEN诱导的HCC小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、电泳迁移率变动分析(EMSA)、CUT&Tag、组织学分析 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | DEN诱导的HCC小鼠模型及人类HCC样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 498 | 2026-03-29 |
Oligodendrocyte precursor cells-microglia crosstalk via BMP4 drives microglial neuroprotective response and mitigates Alzheimer's disease
2026-Mar-25, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02620-9
PMID:41881962
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研究论文 | 本研究揭示了在阿尔茨海默病中,少突胶质前体细胞通过分泌BMP4调控小胶质细胞神经保护程序的新机制 | 首次发现晚期少突胶质前体细胞(COPs)产生的BMP4是调控小胶质细胞神经保护程序的关键信号,并阐明其通过Smad1/5/8-Trem2通路发挥作用 | 研究主要基于5xFAD小鼠模型,在人类患者中的验证仍需进一步探索 | 探究少突胶质前体细胞与小胶质细胞在阿尔茨海默病中的相互作用机制 | 5xFAD转基因小鼠模型、少突胶质前体细胞、小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、基因敲除、腺相关病毒递送 | 动物模型(5xFAD小鼠) | 基因表达数据、组织病理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 499 | 2026-03-29 |
Subtypes estimation in single-cell multi-omics data via S-multi-SNE
2026-Mar-25, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2026.112442
PMID:41895518
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研究论文 | 本文提出S-multi-SNE方法,用于单细胞多组学数据的细胞亚型估计和可视化 | 将多视图降维方法multi-SNE和S-multi-SNE应用于单细胞RNA测序数据,能够整合不同个体、物种和测序技术的信息进行细胞亚型识别,并在多组学数据整合中表现优异 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞亚型可视化和分类的重要挑战 | 单细胞RNA测序数据和单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | multi-SNE, S-multi-SNE | mRNA计数矩阵, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 500 | 2026-03-29 |
Hh and EGFR-Ras signaling promote distinct steps of tumor progression in the Drosophila follicle epithelium
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70844-y
PMID:41876551
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学与遗传学及成像分析,探究了EGFR-Ras和Hedgehog信号通路在果蝇卵泡干细胞谱系稳态中的作用 | 首次揭示Hedgehog信号通路同时促进未分化状态并通过激活Zfh1诱导分化的双重功能,并阐明EGFR-Ras与Hedgehog通路在转录水平协同驱动肿瘤样生长的机制 | 研究基于果蝇模型,其结论在哺乳动物系统中的普适性仍需验证 | 探究EGFR-Ras和Hedgehog信号通路在组织稳态维持和肿瘤发生中的作用机制 | 果蝇卵泡上皮细胞及其干细胞谱系 | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 果蝇遗传模型 | 转录组数据、成像数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |