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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4961 - 4980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4961 | 2025-10-06 |
Accurate Transcription Factor Activity Inference to Decipher Cell Identity from Single-Cell Transcriptomic Data with MetaTF
2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410745
PMID:40397381
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研究论文 | 提出metaTF计算框架，用于从单细胞转录组数据推断转录因子活性以解析细胞身份 | 开发了优于现有方法的转录因子活性推断框架，能识别乳腺癌中神经调节T细胞新亚群 | NA | 通过推断转录因子活性来解析细胞身份和功能 | 小鼠造血干细胞、乳腺癌上皮细胞、肿瘤免疫微环境中的T细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4962 | 2025-10-06 |
Divergent Plastid Genomes in the Deepest-Branching Apicomplexan Parasites
2025-May-30, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaf117
PMID:40476362
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了最早期分支顶复门寄生虫中高度分化的质体基因组特征 | 首次系统表征了所有4个已知古簇虫谱系的质体基因组，填补了顶复门质体基因组多样性研究的关键空白 | 研究样本来自未培养的古簇虫代表种，可能限制了对更多遗传变异的全面分析 | 探究最早期分支顶复门寄生虫质体基因组的进化特征 | 顶复门寄生虫中的古簇虫亚群 | 基因组学 | 寄生虫感染 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 所有4个已知古簇虫谱系的未培养代表种 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4963 | 2025-10-06 |
Convergent and divergent immune aberrations in COVID-19, post-COVID-19-interstitial lung disease, and idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Jan-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00528.2024
PMID:39510135
|
研究论文 | 本研究通过分析循环免疫细胞的转录和表型变化，揭示了COVID-19、COVID-19后间质性肺病和特发性肺纤维化之间的免疫异常异同 | 首次发现50基因特征在单核细胞和T细胞亚群中的基因组失衡模式，并揭示该模式在COVID-19幸存者和IPF患者中的反向表达特征 | 样本量相对有限（227例），且为观察性研究，无法确定因果关系 | 研究循环免疫细胞变化与COVID-19死亡率、COVID-19后ILD肺纤维化消退及IPF持续性的关联 | 227名COVID-19患者、COVID-19后间质性肺病患者、特发性肺纤维化患者和对照受试者 | 免疫学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,基因表达分析,生物标志物检测 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据,蛋白质生物标志物数据 | 227名受试者 | Nanostring,10x Genomics,Luminex | 单细胞RNA测序,基因表达分析,多重蛋白检测 | nCounter,10x Chromium,Luminex | nCounter基因表达分析系统,10x Genomics单细胞RNA测序平台,Luminex多重检测平台 |
| 4964 | 2025-10-06 |
Periplakin Attenuates Liver Fibrosis via Reprogramming CD44Low Cells into CD44High Liver Progenitor Cells
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101498
PMID:40107450
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研究论文 | 本研究揭示了周斑蛋白通过将CD44Low细胞重编程为CD44High肝脏祖细胞来减轻肝纤维化的机制 | 首次发现PPL+CD44Low细胞可重分化为PPL+CD44High肝脏祖细胞，并证明其移植治疗肝纤维化的潜力 | 肝纤维化模型中肝脏祖细胞的来源机制仍需进一步阐明 | 探究周斑蛋白在肝纤维化中的作用机制及治疗潜力 | 肝纤维化患者、小鼠模型、肝脏祖细胞 | 单细胞测序 | 肝纤维化 | 单细胞测序、腺病毒过表达、细胞移植 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 肝纤维化患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4965 | 2025-10-06 |
THBS2 + cancer-associated fibroblasts promote EMT leading to oxaliplatin resistance via COL8A1-mediated PI3K/AKT activation in colorectal cancer
2024-Dec-28, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02180-y
PMID:39732719
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研究论文 | 本研究揭示THBS2+癌症相关成纤维细胞通过COL8A1介导的PI3K/AKT通路激活促进上皮间质转化，导致结直肠癌奥沙利铂耐药 | 首次发现THBS2+CAF亚群通过COL8A1-ITGB1相互作用激活PI3K/AKT通路促进EMT和奥沙利铂耐药的新机制 | NA | 探索特定CAF亚群促进结直肠癌奥沙利铂耐药的分子机制 | 结直肠癌细胞和癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4966 | 2025-10-06 |
Cholinergic Neuronal Activity Promotes Diffuse Midline Glioma Growth through Muscarinic Signaling
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.21.614235
PMID:39386427
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研究论文 | 本研究揭示了中脑胆碱能神经元通过M1和M3毒蕈碱受体促进弥漫性中线胶质瘤生长的机制 | 首次发现胆碱能神经元活动通过长程投射和毒蕈碱信号通路特异性促进DMG生长，并揭示了与健康少突胶质前体细胞的平行增殖效应 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养系统，在人类患者中的直接验证仍需进一步研究 | 探究胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其分子机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞、中脑胆碱能神经元、少突胶质前体细胞 | 神经肿瘤学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学刺激、单细胞RNA测序、体外共培养、药理学阻断 | 小鼠疾病模型、hiPSC衍生神经元模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据、电生理数据 | 原发性患者DMG样本、小鼠模型、体外共培养系统 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4967 | 2025-10-06 |
Distinct tumor-TAM interactions in IDH-stratified glioma microenvironments unveiled by single-cell and spatial transcriptomics
2024-08-16, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01837-5
PMID:39148129
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示IDH分层胶质瘤微环境中肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞的独特相互作用 | 首次在IDH定义的胶质瘤类别中系统比较肿瘤-TAM相互作用，发现IDH-WT胶质母细胞瘤中两个间充质表型TAM亚群与患者预后不良相关，并鉴定SLAMF9受体作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于转录组学分析，需要进一步的功能实验验证发现的相互作用机制 | 阐明IDH分层胶质瘤微环境中肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞的相互作用特征 | 胶质瘤患者肿瘤样本中的肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq, RT-qPCR, 基因调控网络推断 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4968 | 2025-10-06 |
Nanomedicine and Spleen-Targeting Strategies for Precision Immunomodulation: Advances, Challenges, and Future Perspectives
2025-Jun-27, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c04836
PMID:40576399
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综述 | 本文综述了基于纳米药物的脾脏靶向策略在精准免疫调节中的进展、挑战与未来前景 | 系统整合了脾脏靶向纳米策略与系统免疫学方法（包括空间转录组学）的协同应用 | NA | 探讨脾脏靶向纳米药物在免疫调节治疗中的潜力 | 脾脏免疫细胞及纳米药物递送系统 | 纳米医学 | 肿瘤、自身免疫疾病 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4969 | 2025-10-06 |
Anticancer Treatment Influences TREM2 in Tumor-Associated Macrophages in Lung Cancer
2025-Jun-23, Cancer research and treatment
IF:4.1Q2
DOI:10.4143/crt.2024.1245
PMID:40575951
|
研究论文 | 本研究探讨抗癌治疗对肺腺癌肿瘤微环境中TREM2表达巨噬细胞的影响 | 首次系统研究化疗药物对肿瘤相关巨噬细胞中TREM2表达的影响及其在肿瘤微环境重塑中的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步实验验证具体机制 | 探究抗癌治疗如何影响肺腺癌肿瘤微环境中TREM2表达巨噬细胞 | 人类和小鼠肺癌组织、THP-1细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 配对正常肺组织和肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4970 | 2025-10-06 |
Cross-cohort multi-omics analysis identifies novel clusters driven by EMT signatures in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1628005
PMID:40574852
|
研究论文 | 本研究通过整合五个单细胞RNA测序队列，系统分析了结直肠癌的肿瘤细胞异质性，建立了首个单细胞分辨率的分子分型系统 | 首次建立了结直肠癌单细胞分辨率分子分类系统，发现HOXC6是C3亚型的关键驱动因子，并验证了abemaciclib对HOXC6的靶向治疗潜力 | 研究样本量相对有限（70个样本），需要在更大队列中验证分类系统的普适性 | 系统表征结直肠癌肿瘤细胞异质性及其临床意义，开发精准治疗策略 | 结直肠癌患者肿瘤细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 70个结直肠癌样本，164,173个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4971 | 2025-10-06 |
Single cell dissection reveals SFRP2+ fibroblasts amplifying inflammatory responses in oral lichen planus
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1553963
PMID:40574847
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示SFRP2+成纤维细胞在口腔扁平苔藓中放大炎症反应的作用机制 | 首次鉴定出SFRP2+成纤维细胞是OLP中炎症性成纤维细胞的来源，并发现其通过Wnt5a表达与CD8+ T细胞相互作用放大局部免疫炎症 | 样本量相对有限（4例OLP患者和1例健康对照进行单细胞测序），需要更大样本验证 | 研究疾病特异性成纤维细胞在口腔扁平苔藓发病机制中的作用 | 口腔扁平苔藓患者和健康个体的口腔黏膜组织及原代成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 4例OLP患者和1例健康对照（单细胞测序），51例OLP患者和24例健康个体（原代成纤维细胞分析） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4972 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data reveals an EGFR signature for predicting immunotherapy response and prognosis in pan-cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1604394
PMID:40574864
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，开发了一个基于EGFR相关基因的免疫治疗反应预测标志物 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据，利用机器学习算法识别出具有泛癌应用价值的EGFR相关基因标志物 | NA | 开发能够预测免疫检查点抑制剂治疗反应和预后的新型生物标志物 | 泛癌患者样本 | 机器学习 | 泛癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 多种机器学习算法 | RNA测序数据 | 34个单细胞RNA测序队列和10个bulk RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4973 | 2025-10-06 |
Mapping CD4+ T cell diversity in CSF to identify endophenotypes of multiple sclerosis
2025, Brain communications
IF:4.1Q2
DOI:10.1093/braincomms/fcaf231
PMID:40574973
|
研究论文 | 通过光谱流式细胞术分析多发性硬化症患者脑脊液中的CD4+ T细胞多样性，识别疾病内表型 | 首次结合公共转录组数据和自身单细胞RNA测序设计标记物面板，识别与慢性神经炎症相关的CD4+ T细胞亚群特征 | 研究主要基于实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩大 | 确定脑脊液细胞光谱流式细胞术能否识别多发性硬化症中的致病性CD4+ T细胞亚群 | 多发性硬化症患者脑脊液中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 光谱流式细胞术, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 | 独立的多发性硬化症队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4974 | 2025-10-06 |
Regulatory B cells promote the immunosuppressive microenvironment and progression of clear cell renal cell carcinoma
2025, Immunotherapy advances
IF:4.1Q2
DOI:10.1093/immadv/ltaf013
PMID:40575014
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研究论文 | 本研究探讨了调节性B细胞在透明细胞肾细胞癌免疫抑制微环境形成和肿瘤进展中的关键作用 | 建立了基于机器学习的Breg特征模型(CMLBregS)，揭示了IRF4作为关键预后标志物，并发现高CMLBregS评分患者对免疫检查点阻断治疗反应较差 | 未明确说明样本量大小和研究队列的具体数量 | 探究调节性B细胞在透明细胞肾细胞癌中的预后价值和免疫抑制机制 | 透明细胞肾细胞癌患者样本和调节性B细胞 | 机器学习 | 肾癌 | 空间转录组学、多重免疫荧光、免疫组织化学、机器学习 | 机器学习分类模型 | 基因表达数据、空间定位数据、免疫染色数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4975 | 2025-10-06 |
Activation of the IDO1-GCN2-ATF4-CHOP Pathway During the Massive Generation of Antibody-Secreting Cells in Dengue Patients Through Single-Cell Transcriptomics
2025, International journal of tryptophan research : IJTR
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/11786469251340237
PMID:40575112
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示登革热患者抗体分泌细胞大量生成期间IDO1-GCN2-ATF4-CHOP通路的激活机制 | 首次通过单细胞转录组学发现CD14+单核细胞是IDO1和IDO2的主要表达者，并揭示色氨酸缺乏对B细胞命运的早期影响 | 需要进一步研究以完全理解这些发现对疾病进展的影响 | 研究登革热如何调节宿主代谢和B细胞反应 | 登革热患者的抗体分泌细胞和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 登革热 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自公共数据库的登革热患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4976 | 2025-10-06 |
Progress and applications of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptome technology in acute kidney injury research
2025-Sep-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102583
PMID:40568028
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综述 | 概述单细胞RNA测序和空间转录组技术在急性肾损伤研究中的进展与应用 | 整合单细胞转录组与空间组学数据，从多维度分析视角揭示急性肾损伤中细胞异质性和细胞间相互作用的动态过程 | 讨论了单细胞RNA测序与空间组学在急性肾损伤研究中当前存在的技术限制 | 探讨单细胞测序和空间转录组技术在急性肾损伤研究中的应用前景 | 急性肾损伤相关的细胞异质性和组织微环境 | 数字病理 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4977 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics and Lineage Tracing Unveil Parallels in Lymphatic Muscle and Venous Smooth Muscle Development, Identity, and Function
2025-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322567
PMID:40371470
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和谱系追踪揭示了淋巴管肌细胞与静脉平滑肌细胞在发育、特性和功能上的相似性 | 首次发现淋巴管肌细胞和静脉平滑肌细胞具有相似的转录组特征，并确定它们都来源于WT1+中胚层祖细胞 | 研究主要集中在小鼠后肢和腹股沟-腋窝区域，需要验证是否适用于其他解剖部位 | 探究淋巴管肌细胞的细胞和分子基础及其与静脉平滑肌细胞的发育关系 | 小鼠淋巴管肌细胞和静脉平滑肌细胞 | 单细胞生物学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪, 全标本免疫染色, 活体成像 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4978 | 2025-10-06 |
PRRX1 is a key regulator in the phenotypic transition between human normal dermal and keloid fibroblasts
2025-Jul, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2025.05.002
PMID:40517126
|
研究论文 | 本研究通过比较人类胎儿皮肤、出生后皮肤和瘢痕疙瘩组织，探索了PRRX1在调控正常皮肤和瘢痕疙瘩成纤维细胞表型转换中的关键作用 | 首次发现PRRX1阳性成纤维细胞比例从胎儿皮肤到出生后皮肤再到瘢痕疙瘩逐渐增加，并验证了PRRX1在调控瘢痕形成中的关键作用 | 研究样本类型和数量有限，需要进一步扩大验证 | 探索影响伤口愈合结果的关键因素，寻找促进无瘢痕愈合的潜在治疗靶点 | 人类胎儿皮肤、出生后皮肤和瘢痕疙瘩组织 | 空间转录组学 | 皮肤瘢痕 | 空间转录组学、组织学成像、三维人类瘢痕疙瘩模型 | NA | 空间转录组数据、组织图像 | 人类胎儿皮肤、出生后皮肤和瘢痕疙瘩组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4979 | 2025-10-06 |
Identification of two molecularly and prognostically distinct subtypes in acral melanoma using network prediction method
2025-Jul, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.20335
PMID:39282977
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和网络预测方法识别了肢端黑色素瘤的两种分子和预后显著不同的亚型 | 首次使用网络预测方法识别肢端黑色素瘤的两种分子亚型，并发现具有高区分度的生物标志物组合 | 研究结果需要在不同队列中进行进一步验证 | 阐明肢端黑色素瘤的分子景观及其亚型与临床特征的相关性 | 肢端黑色素瘤患者样本 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,多组学数据分析,网络预测算法 | 网络预测方法 | 单细胞RNA测序数据,临床样本数据 | 临床验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4980 | 2025-10-06 |
Integrated transcriptome analysis and combinatorial machine learning to construct a homeostatic model of acetylation for ccRCC and validate the key gene GCNT4
2025-Jun-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03837-4
PMID:40563096
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研究论文 | 通过整合转录组分析和组合机器学习构建ccRCC乙酰化稳态模型并验证关键基因GCNT4 | 首次从乙酰化角度构建ccRCC稳态模型，使用10种机器学习算法的101种组合进行预后分析，发现GCNT4通过调节O-GlcNAc修饰影响乙酰化的新机制 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 探索ccRCC中乙酰化的潜在生物学机制并构建预后风险模型 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者组织和肾癌细胞 | 机器学习 | 肾癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, GSEA, 细胞实验 | LASSO+RSF组合模型, 机器学习算法组合 | RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据, 临床信息 | 来自TCGA、ICGC和GEO数据库的ccRCC样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |