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当前共找到 40345 篇文献,本页显示第 4961 - 4980 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
4961 2026-04-13
Overcoming CXCR4-Mediated T-Cell Exclusion Potentiates Antitumor Cytotoxicity in Fibrolamellar Carcinoma
2026-Apr, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究探讨了纤维板层肝细胞癌中CXCR4介导的T细胞排斥如何限制抗肿瘤免疫,并通过联合CXCR4和PD-1阻断在人类肿瘤切片培养模型中增强抗肿瘤细胞毒性 首次在纤维板层肝细胞癌中利用单核RNA测序和肿瘤切片培养系统揭示CXCL12+肌成纤维细胞与CXCR4+淋巴细胞间的相互作用是T细胞排斥的关键机制,并证明联合CXCR4和PD-1阻断能协同克服免疫抵抗 研究基于人类肿瘤切片培养模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性;样本量可能受限于这种罕见癌症的稀缺性 探究纤维板层肝细胞癌对免疫疗法缺乏反应的机制,并开发有效的联合免疫治疗策略 纤维板层肝细胞癌患者的肿瘤组织及肿瘤免疫微环境 数字病理学 肝癌 单核RNA测序, 多重免疫组织化学, 活体成像, 单细胞测序, 空间蛋白质组学 人类肿瘤切片培养模型 RNA测序数据, 图像数据, 蛋白质组数据 NA NA 单核RNA测序, 单细胞测序, 空间蛋白质组学 NA NA
4962 2026-04-13
Using cell-specific late-phase asthma mRNA biomarkers to repurpose drugs that concurrently reverse disease signatures across multiple immune cell-types
2026-Apr, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本研究利用过敏原诱导的晚期哮喘反应(LAR)mRNA生物标志物,预测哮喘急性发作和严重程度,并通过单细胞RNA测序分析细胞特异性变化,识别潜在治疗药物 结合基线血液mRNA生物标志物与LAR相关标志物,形成109个LAR-mRNA生物标志物组合,首次在多个公共基因表达数据集中验证其预测能力,并利用单细胞扰动数据集进行药物签名匹配,识别出能逆转细胞特异性转录变化的化合物 生物标志物在男性中的预测性能优于女性,且样本主要来自轻度过敏性哮喘患者,可能无法完全代表所有哮喘亚型 研究晚期哮喘反应(LAR)的mRNA生物标志物在预测哮喘急性发作和严重程度中的作用,并探索潜在的治疗策略 轻度过敏性哮喘患者,以及公共基因表达数据集中的血液、气道、支气管肺泡灌洗液(BALF)和诱导痰样本 自然语言处理 哮喘 mRNA基因表达分析,单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA mRNA表达数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4963 2026-04-13
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies an EMT-Associated Prognostic Signature for Papillary Thyroid Cancer
2026-Apr, Cancer medicine IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习分析,识别了与上皮-间质转化相关的八个预后基因,并构建了用于甲状腺乳头状癌预后评估的风险模型 首次将单细胞RNA测序与101种机器学习算法组合相结合,系统识别甲状腺乳头状癌中与上皮-间质转化相关的预后基因,并构建了综合性的预后风险模型 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证,缺乏体内实验和更大规模的前瞻性临床队列验证 探究甲状腺乳头状癌中上皮-间质转化的分子机制,并开发预后评估的生物标志物 甲状腺乳头状癌患者组织样本和正常甲状腺组织 机器学习 甲状腺癌 单细胞RNA测序 Cox回归模型和多种机器学习算法组合 基因表达数据 未在摘要中明确说明具体样本数量,涉及内部验证队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4964 2026-04-13
A benchmark of semi-supervised scRNA-seq integration methods in real-world scenarios
2026-Mar, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文系统性地比较了半监督与无监督单细胞RNA-seq整合方法在真实世界场景下的性能 首次在真实条件下系统性地基准测试半监督单细胞RNA-seq整合方法,并考虑了多种不完美标签场景 研究仅基于六个数据集,且半监督方法在标签质量不确定时优势有限 评估半监督单细胞RNA-seq整合方法在真实世界场景中的性能和鲁棒性 单细胞RNA-seq数据整合方法 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq scANVI, ssSTACAS 单细胞RNA-seq数据 六个多样化数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4965 2026-04-13
Role of CTGF-LRP1 in impaired healing of cesarean section incisions
2026-Feb-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了剖宫产切口愈合不良(niche)的细胞微环境,揭示了LRP1缺陷在成纤维细胞中的作用及其与细胞外基质合成减少的关联 首次在单细胞水平上剖析了剖宫产切口愈合不良的微环境,并确定了LRP1缺陷在成纤维细胞中的关键作用,以及CTGF-LRP1轴通过ERK和WNT信号通路影响愈合的机制 研究样本量相对有限,且主要基于观察性数据和动物模型,需要进一步临床验证 探究剖宫产切口愈合不良(niche)的发病机制,并寻找潜在的治疗靶点 剖宫产切口愈合不良(niche)组织、邻近子宫肌层组织以及愈合良好的剖宫产瘢痕组织 数字病理学 妇科疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 135,793个单细胞(来自48,587个邻近组织细胞、47,653个对照组细胞和39,553个niche组织细胞),以及60个组织样本(30个非愈合组和30个愈合组) NA 单细胞RNA-seq NA NA
4966 2026-04-13
BrainConnect: processing brain connectivity and spatial transcriptomics data for integrative analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 开发了一个名为BrainConnect的软件,用于处理小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据,以进行整合分析并预测连接强度 首次提出一个方法,将不同类型的大脑连接数据与空间转录组学数据在一致的大脑区域格式下处理,利用LSTM网络从空间转录组学预测连接强度,并识别潜在的重要基因 方法目前仅应用于小鼠大脑数据,未在其他物种或更广泛的数据集上验证 整合大脑连接数据和空间转录组学数据,以预测和理解大脑连接性及其分子基础 小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据 数字病理学 NA 空间转录组学 LSTM 空间转录组学数据和大脑连接数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
4967 2026-04-13
Reconstructing single-cell resolution from spatial transcriptomics with CellRefiner
2026-Feb-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CellRefiner的物理模型方法,通过整合单细胞数据集与配对的空间数据集,在空间数据中重建单细胞分辨率 CellRefiner创新性地将细胞建模为通过力连接的粒子,并利用空间邻近约束、基因表达相似性和细胞间配体-受体相互作用来优化细胞位置,从而从非单细胞分辨率空间数据中恢复单细胞分辨率 NA 开发一种方法以从空间转录组数据中重建单细胞分辨率,以支持需要个体细胞分辨率和空间信息的下游分析 空间转录组数据,包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集,以及小鼠皮层和淋巴结组织 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 物理模型 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 多种模拟和真实数据集,包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集,以及小鼠皮层和淋巴结组织 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Visium空间转录组平台,用于生成空间数据集
4968 2026-04-13
Utilising Machine Learning and Single-Cell Analysis to Uncover SKCM Metastasis-Related Genes
2026 Jan-Dec, IET systems biology IF:1.9Q3
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和机器学习,揭示了皮肤黑色素瘤转移相关的核心基因及其调控机制 创新性地构建了结合粒子群优化算法和支持向量机的二元分类模型(PSO-SVM),用于准确预测肿瘤转移,并整合单细胞与转录组数据进行多维度分析 未明确说明样本的具体数量及来源,模型在其他癌症中的泛化能力有待进一步验证 阐明皮肤黑色素瘤(SKCM)转移的核心分子机制,寻找早期诊断和靶向治疗的潜在生物标志物 转移性皮肤黑色素瘤与原发性肿瘤细胞 机器学习 皮肤黑色素瘤 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) PSO-SVM(粒子群优化-支持向量机) 单细胞RNA测序数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4969 2026-04-13
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-12, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了疟原虫在按蚊中肠内的关键发育阶段转换和宿主-寄生虫相互作用 首次结合单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术,系统解析了疟原虫在按蚊中肠内的发育过程,并发现了PfSIP2转录因子在子孢子感染人肝细胞中的关键作用 研究主要基于实验室模型,尽管验证了野外来源的寄生虫,但实际自然环境中的复杂性可能未被完全覆盖 探究疟原虫在按蚊中肠内的发育机制和宿主-寄生虫相互作用,以寻找阻断传播的策略 恶性疟原虫和按蚊中肠细胞 单细胞组学 疟疾 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜 NA 单细胞转录组数据,图像数据 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫和蚊子细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4970 2026-04-13
Single-cell dissection of the genotype-immunophenotype relationship in glioblastoma
2025-Sep-03, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,系统性地解析了胶质母细胞瘤三种分子亚型中基因型与免疫表型之间的关系 首次在单细胞水平上,利用基因工程小鼠胶质母细胞瘤模型,系统地建立了人类相关驱动突变(EGFRvIII、PDGFB、NF1)与肿瘤微环境中免疫表型之间的关联分析平台 研究基于小鼠模型,虽然能有效模拟人类肿瘤的异质性,但仍需在人类临床样本中进行进一步验证 解析胶质母细胞瘤中基因驱动突变与肿瘤微环境免疫表型之间的因果关系,为个性化治疗提供新靶点 携带EGFRvIII、PDGFB和NF1驱动突变的基因工程小鼠胶质母细胞瘤模型 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 基因工程小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4971 2026-04-13
EVscope: A Comprehensive Bioinformatics Pipeline for Accurate and Robust Analysis of Total RNA Sequencing from Extracellular Vesicles
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个名为EVscope的开源生物信息学流程,专门用于处理细胞外囊泡RNA测序数据,以提高RNA生物标志物和细胞间通信研究的准确性和鲁棒性 EVscope采用优化的全基因组期望最大化算法,显著提高了单碱基分辨率下的多映射读段分配,并首次生成基于EM的BigWig文件用于下游分析,这是现有工具所不具备的功能 NA 开发一个标准化的计算工作流程,以应对细胞外囊泡RNA测序数据分析中的挑战,包括低丰度、片段化及污染问题 细胞外囊泡RNA测序数据集 生物信息学 NA 总RNA测序 期望最大化算法 RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
4972 2026-04-13
LncRNA MIR181A1HG Deficiency Attenuates Vascular Inflammation and Atherosclerosis
2025-Apr-11, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究揭示了长链非编码RNA MIR181A1HG通过诱骗Foxp1转录因子并激活NLRP3炎症小体,从而驱动血管炎症和动脉粥样硬化发生的关键作用 首次明确了MIR181A1HG在动脉粥样硬化血管炎症中的核心驱动作用,并阐明了其通过诱骗Foxp1(独立于miR-181a1/b1簇)激活NLRP3炎症小体的新分子机制 研究主要聚焦于内皮细胞中的机制,尽管排除了髓系细胞的作用,但其他细胞类型(如平滑肌细胞)中MIR181A1HG的功能尚未完全探索 探究长链非编码RNA MIR181A1HG在调控血管炎症和动脉粥样硬化中的作用及分子机制 人及小鼠的动脉粥样硬化病变组织、内皮细胞、MIR181A1HG-/-ApoE-/-基因敲除小鼠 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序、荧光素酶报告基因实验、染色质免疫共沉淀、功能获得与缺失研究、RNA-蛋白质相互作用分析 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 涉及人及小鼠的动脉粥样硬化病变样本,并使用MIR181A1HG-/-ApoE-/-基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4973 2026-04-13
Single-cell RNA sequencing combined with proteomics of infected macrophages reveals prothymosin-α as a target for treatment of apical periodontitis
2024-Dec, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序结合蛋白质组学,揭示了感染巨噬细胞中prothymosin-α(PTMA)的上调,并验证了其作为根尖周炎治疗靶点的潜力 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析根尖周炎中单核/巨噬细胞的异质性,并鉴定出PTMA作为新的治疗靶点 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,尚未进行人体临床试验 阐明单核/巨噬细胞在慢性根尖周炎进展中的作用,并寻找新的治疗靶点 慢性根尖周炎患者的根尖周病变组织、健康对照牙周组织、THP-1来源的巨噬细胞、小鼠和大鼠的根尖周炎模型 单细胞组学 口腔疾病 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 免疫荧光染色, 实时定量PCR NA 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 未明确说明具体样本数量,涉及患者组织样本、细胞系及动物模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4974 2026-04-13
Early concentrate starter introduction induces rumen epithelial parakeratosis by blocking keratinocyte differentiation with excessive ruminal butyrate accumulation
2024-Dec, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和代谢组学分析,探讨了早期引入浓缩饲料如何通过过量丁酸积累阻断角质细胞分化,从而诱导瘤胃上皮角化不全 首次利用单细胞RNA测序技术揭示了瘤胃上皮细胞异质性和分化轨迹,并建立了瘤胃器官样模型来验证丁酸在角化不全中的作用 研究仅基于新生羔羊模型,结果可能无法直接推广到其他反刍动物或不同年龄阶段 阐明瘤胃上皮角化过程及导致角化不全的关键瘤胃代谢物 24只14日龄羔羊的瘤胃组织和瘤胃液样本 单细胞组学 瘤胃上皮角化不全 单细胞RNA测序, 代谢组学, 免疫荧光, 实时定量PCR NA 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 基因表达数据 24只羔羊分为三组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4975 2026-04-12
Oxidative stress in neurodegeneration: from a simple insult to a dynamic regulator
2026-Dec-31, Redox report : communications in free radical research IF:5.2Q1
综述 本文综述了氧化应激在神经退行性疾病中的核心作用,将其重新定义为一种复杂的动态调控系统,并探讨了其分子机制及先进的抗氧化干预技术策略 将氧化应激重新定义为神经退行性疾病中一个复杂的动态调控系统,而非单一事件,并整合了亚细胞器靶向、纳米载体递送以及单细胞/空间组学等先进技术策略,为开发靶向和个性化治疗提供了新视角 本文是一篇综述,主要基于现有文献进行分析和整合,未报告新的原始实验数据或临床研究结果 评估氧化应激在神经退行性疾病中的核心作用,探索其动态调控特征、信号通路、分子机制以及先进的抗氧化干预技术策略 神经退行性疾病中的氧化应激过程及其调控 NA 神经退行性疾病 单细胞氧化还原组学,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞组学,空间转录组学 NA NA
4976 2026-04-12
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNF-α promotes glioblastoma proliferation and migration via CP-mediated KLF10 upregulation
2026-Apr-11, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
4977 2026-04-12
Tumor-infiltrating platelets recruit neutrophils to promote tumor growth through the 5-HIAA-GPR35-ERK1/2 axis in Hepatocellular Carcinoma
2026-Apr-10, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本文揭示了肝细胞癌中肿瘤浸润血小板通过5-HIAA-GPR35-ERK1/2轴招募中性粒细胞促进肿瘤生长的机制 首次发现血小板来源的5-HIAA通过GPR35受体激活ERK1/2通路,从而招募中性粒细胞促进肝癌生长 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限 探究肝细胞癌中肿瘤相关中性粒细胞与血小板相互作用的分子机制 肝细胞癌患者样本、Hepa1-6小鼠模型、血小板、中性粒细胞、肝癌细胞 肿瘤免疫学 肝细胞癌 多重免疫组化、Transwell迁移实验、代谢组学分析、单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA 图像数据、测序数据、实验数据 患者来源的HCC样本、小鼠模型 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
4978 2026-04-12
Cellular heterogeneity in hypertrophic burn scars in response to carbon dioxide laser therapy
2026-Apr-10, Communications medicine IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析烧伤后增生性疤痕在二氧化碳激光治疗前后的细胞异质性,揭示了治疗反应差异的分子机制 首次应用单细胞RNA测序技术探究二氧化碳激光治疗增生性疤痕的细胞机制,并识别出与良好治疗反应相关的再生性成纤维细胞亚群 样本量较小,且疤痕年龄分组基于6年阈值可能不够精确 探究二氧化碳激光治疗减轻增生性疤痕的细胞机制 烧伤幸存者的增生性疤痕组织 数字病理学 烧伤疤痕 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 烧伤幸存者的皮肤活检样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
4979 2026-04-12
Super-enhancer-driven recruitment of C/EBPβ by SULT1B1 is implicated in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease progression
2026-Apr-10, Clinical epigenetics IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了超级增强子驱动的H3K27ac/C/EBPβ/SULT1B1调控轴在代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)进展中的关键作用 首次在MASLD中鉴定出SULT1B1作为核心超级增强子相关基因,并阐明C/EBPβ通过H3K27ac修饰促进其转录的分子机制,同时通过单细胞分析将该调控轴定位于肝细胞 研究主要基于动物模型和细胞系,人类样本验证相对有限,且JQ1介导的超级增强子抑制在体内的长期疗效和安全性尚未评估 阐明超级增强子在MASLD发病机制中的调控作用 高脂饮食诱导的大鼠模型、MASLD患者样本、人及大鼠肝细胞系 表观遗传学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 ChIP-Seq, RNA-Seq, 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 组蛋白修饰分析 NA 基因组学数据, 转录组学数据, 表观基因组学数据 高脂饮食诱导的大鼠模型、MASLD患者样本、人及大鼠肝细胞系 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ChIP-seq NA NA
4980 2026-04-12
Evaluating genetic ancestry inference from single-cell transcriptomic datasets
2026-Apr-09, HGG advances
研究论文 本文提出一个评估从单细胞转录组数据推断遗传祖先方法的框架,并应用于人类细胞图谱数据集 首次系统评估单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法的准确性,并揭示现有数据集中祖先代表性的不平衡问题 评估主要基于模拟数据和现有数据集,未涵盖所有可能的祖先群体和测序技术 评估和改进单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法,以促进遗传多样性研究和减少分析偏差 单细胞转录组测序数据中的遗传多态性 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 ADMIXTURE等群体遗传学工具 测序reads中的遗传变异数据 来自10个人类细胞图谱数据集的401名供体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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