单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4961	2025-01-21	TRIM24 Cooperates with Ras Mutation to Drive Glioma Progression through snoRNA Recruitment of PHAX and DNA-PKcs 2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202400023 PMID:38828688	研究论文	本文揭示了表观遗传调节因子TRIM24在胶质瘤进展中的作用，特别是其与HRas突变共同驱动胶质瘤向类上皮性胶质母细胞瘤（Ep-GBM）转变的机制	首次发现TRIM24通过与HRas突变协同作用，通过snoRNA招募PHAX和DNA-PKcs，促进胶质瘤向Ep-GBM样肿瘤的转变	研究主要基于体外实验和动物模型，临床样本验证仍需进一步扩展	探讨TRIM24在胶质瘤进展中的分子机制及其潜在治疗策略	胶质瘤细胞、人类神经干细胞（hNSCs）、临床Ep-GBM样本	分子生物学	胶质瘤	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA测序数据	临床Ep-GBM样本及体外实验模型
4962	2025-01-21	ARID1B maintains mesenchymal stem cell quiescence via inhibition of BCL11B-mediated non-canonical Activin signaling 2024-May-30, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-48285-2 PMID:38816354	研究论文	本文探讨了ARID1B在间充质干细胞（MSCs）静息状态维持中的作用及其机制	揭示了ARID1B通过抑制BCL11B介导的非经典Activin信号通路来维持MSCs静息状态的新机制	研究主要基于小鼠切牙模型，尚未在人类细胞中验证	研究ARID1B在间充质干细胞静息状态维持中的作用及其分子机制	小鼠切牙模型中的GLI1+间充质干细胞	细胞生物学	NA	scRNA-seq, scATAC-seq	NA	单细胞RNA测序数据, 单细胞ATAC测序数据	小鼠切牙模型中的间充质干细胞
4963	2025-01-21	Triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2) regulates phagocytosis in glioblastoma 2024-05-03, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noad257 PMID:38237157	研究论文	本文研究了髓系细胞表达的触发受体2（TREM2）在胶质母细胞瘤中的吞噬作用调控机制	揭示了TREM2在胶质母细胞瘤中的吞噬作用而非免疫抑制功能，并提出了其作为脑肿瘤潜在治疗策略的可能性	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证	探讨TREM2在胶质母细胞瘤免疫病理和进展中的作用	胶质母细胞瘤中的髓系细胞	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序、流式细胞术	小鼠胶质瘤模型	RNA测序数据、流式细胞数据	未明确提及具体样本数量
4964	2024-08-13	Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal that Oncofetal Reprogramming of Fibroblasts Is Associated with Malignant Degeneration of Burn Scar 2025-Feb, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.07.022 PMID:39128494	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
4965	2025-01-20	Analysis of the effect of ALA-PDT on macrophages in footpad model of mice infected with Fonsecaea monophora based on single-cell sequencing 2025, Open medicine (Warsaw, Poland) DOI:10.1515/med-2024-1132 PMID:39822988	研究论文	本文通过单细胞测序技术分析了ALA-PDT治疗对感染Fonsecaea monophora的小鼠足垫模型中巨噬细胞免疫反应的影响	首次使用单细胞测序技术研究ALA-PDT对巨噬细胞免疫反应的影响，揭示了治疗后巨噬细胞抗原识别相关基因表达上调的机制	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类临床试验	探讨ALA-PDT治疗对感染Fonsecaea monophora的小鼠足垫模型中巨噬细胞免疫反应的影响	感染Fonsecaea monophora的小鼠足垫模型中的巨噬细胞	数字病理学	真菌感染	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	小鼠足垫模型
4966	2025-01-20	Single-cell RNA sequencing reveals the diversity of the immunological landscape response to genital herpes 2024-Dec, Virologica Sinica IF:4.3Q2 DOI:10.1016/j.virs.2024.10.003 PMID:39426602	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了生殖器疱疹（GH）患者免疫景观的多样性及其对HSV-2感染的反应	首次使用单细胞RNA测序技术详细描绘了GH患者的免疫细胞多样性及其在HSV-2感染和复发中的反应	研究主要依赖于外周血样本，可能无法完全代表局部感染部位的免疫反应	探讨HSV-2感染和复发的机制，特别是免疫细胞在其中的作用	健康个体和复发性GH患者的免疫细胞	生物信息学	生殖器疱疹	单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR），ELISA	NA	RNA序列数据	健康个体和复发性GH患者的外周血样本
4967	2025-01-20	Single-cell RNA-sequencing reveals a profound immune cell response in human cytomegalovirus-infected humanized mice 2024-Oct, Virologica Sinica IF:4.3Q2 DOI:10.1016/j.virs.2024.08.006 PMID:39153545	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了人巨细胞病毒（HCMV）感染的人源化小鼠中免疫细胞的深刻反应	利用单细胞RNA测序技术，首次在单细胞水平上研究了HCMV感染的人源化小鼠中PBMCs的基因表达变化	研究依赖于人源化小鼠模型，可能无法完全模拟人类体内的复杂环境	研究HCMV感染与宿主免疫反应之间的相互作用	人源化小鼠中的PBMCs	生物信息学	病毒感染	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
4968	2025-01-20	The bone marrow is the primary site of thrombopoiesis 2024-01-18, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2023020895 PMID:37879046	研究论文	本文研究了成年小鼠骨髓、脾脏和肺中巨核细胞的相对丰度及其对血小板生成的贡献	通过多种成像技术和单细胞RNA测序数据分析，揭示了骨髓是血小板生成的主要场所，而非脾脏或肺	研究主要基于小鼠模型，人类数据的直接适用性尚需进一步验证	探讨不同器官中巨核细胞的丰度及其对血小板生成的贡献	成年小鼠的骨髓、脾脏和肺	生物医学	NA	全组织光片成像、定量组织学成像、流式细胞术、活体成像、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	图像、RNA测序数据	成年小鼠的骨髓、脾脏和肺样本
4969	2025-01-19	Targeting MXD1 sensitises pancreatic cancer to trametinib 2025-Jan-16, Gut IF:23.0Q1 DOI:10.1136/gutjnl-2024-333408 PMID:39819860	研究论文	本研究揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）对trametinib耐药的分子机制，并确定了MXD1作为可药物靶点	发现了trametinib耐药PDAC中病毒模拟反应过度激活的癌细胞亚群，并证明MXD1作为组蛋白甲基转移酶的辅助因子，通过增加转座元件（TE）位点的H3K4三甲基化来增强染色质可及性，从而激活病毒模拟反应	研究主要基于患者来源的异种移植模型和原代细胞系，临床验证仍需进一步研究	阐明PDAC对trametinib耐药的机制，并识别与耐药相关的可药物靶点，以提高trametinib耐药PDAC的治疗效果	胰腺导管腺癌（PDAC）	癌症研究	胰腺癌	单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序、靶向切割和标记测序	患者来源的异种移植模型（PDX）	RNA测序数据、染色质可及性数据	患者来源的异种移植模型和原代细胞系
4970	2025-01-19	Elucidating stearoyl metabolism and NCOA4-mediated ferroptosis in gastric cancer liver metastasis through multi-omics single-cell integrative mendelian analysis: advancing personalized immunotherapy strategies 2025-Jan-15, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-01769-z PMID:39812999	研究论文	本研究通过多组学单细胞整合孟德尔分析，探讨了硬脂酰代谢和NCOA4介导的铁死亡在胃癌肝转移中的作用，推进了个性化免疫治疗策略	揭示了硬脂酰代谢在胃癌肝转移中的关键作用，并首次将NCOA4基因与铁死亡机制联系起来，为理解肿瘤微环境异质性提供了新视角	研究主要基于单细胞测序和空间转录组学数据，仍需进一步实验验证其生物学机制	探讨硬脂酰代谢和铁死亡在胃癌肝转移中的作用机制，为开发个性化免疫治疗策略提供依据	胃癌肝转移患者的肿瘤微环境	肿瘤生物学	胃癌	单细胞多组学技术、空间转录组学、孟德尔随机化分析	NA	单细胞测序数据、空间转录组数据	NA
4971	2025-01-19	Encompassing view of spatial and single-cell RNA sequencing renews the role of the microvasculature in human atherosclerosis 2025-Jan, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1 DOI:10.1038/s44161-024-00582-1 PMID:39715784	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，生成了人类动脉粥样硬化斑块的高分辨率图谱，揭示了细胞类型特异性和动脉粥样硬化特异性表达变化及空间受限的细胞间通讯改变	结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，首次生成了人类动脉粥样硬化斑块的高分辨率图谱，揭示了细胞类型特异性和动脉粥样硬化特异性表达变化及空间受限的细胞间通讯改变	样本量较小，仅包含12个人类标本	研究人类动脉粥样硬化的细胞类型特异性和空间受限的细胞间通讯变化	人类动脉粥样硬化斑块	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	RNA测序数据, 空间转录组数据	12个人类标本
4972	2025-01-19	Single-Cell RNA Sequencing before and after Light Chain Escape Reveals Intrapatient Multiple Myeloma Subpopulations with Divergent Osteolytic Gene Expression 2025-Jan-01, Cancer research communications IF:2.0Q3 DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0170 PMID:39699274	研究论文	本文使用单细胞RNA测序技术研究了一位具有高风险多发性骨髓瘤并伴有轻链逃逸（LCE）的患者，揭示了LCE与LAMP5过表达之间的新联系及其对骨溶解和预后的影响	通过单细胞RNA测序技术揭示了LCE与LAMP5过表达之间的新联系，并验证了其对骨溶解和预后的影响	研究仅基于一位患者的数据，样本量较小，可能影响结果的普遍性	研究高风险多发性骨髓瘤患者中LCE的分子机制及其对骨溶解和预后的影响	高风险多发性骨髓瘤患者	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	一位患者
4973	2025-01-19	Multinucleated giant cells are hallmarks of ovarian aging with unique immune and degradation-associated molecular signatures 2024-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.03.626649 PMID:39677686	研究论文	本研究通过先进成像技术和激光捕获显微切割技术，深入分析了多核巨细胞（MNGCs）在卵巢衰老中的存在及其独特的转录组特征	首次定义了卵巢MNGCs在不同年龄和物种中的存在，并揭示了其与降解过程、免疫功能和高代谢活性相关的分子特征	MNGCs的大尺寸限制了其通过单细胞RNA测序等技术进行分离和分析	研究卵巢衰老过程中多核巨细胞的功能和分子特征	小鼠和非人灵长类动物的卵巢	生物医学	老年疾病	激光捕获显微切割技术、先进成像技术	NA	图像、转录组数据	小鼠和非人灵长类动物的卵巢样本
4974	2025-01-19	Over Activation of IL-6/STAT3 Signaling Pathway in Juvenile Dermatomyositis 2024-Oct, Rheumatology and therapy IF:2.9Q2 DOI:10.1007/s40744-024-00699-6 PMID:39073510	研究论文	本研究探讨了IL-6/JAK/STAT3信号通路在青少年皮肌炎（JDM）中的异常激活及其在肌肉损伤中的作用	首次通过单细胞RNA测序和免疫组化技术揭示了JDM患者中IL-6/JAK/STAT3信号通路的异常激活，并发现IL-6通过触发钙超载和活性氧（ROS）产生参与肌肉损伤的发病机制	样本量较小，仅包括72名新诊断的JDM患者和两名患者的肌肉活检样本	阐明IL-6激活JAK/STAT3信号通路的机制及其在JDM发病中的作用	青少年皮肌炎（JDM）患者	生物医学	皮肌炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化、逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）	NA	血清样本、肌肉活检样本	72名新诊断的JDM患者和两名患者的肌肉活检样本
4975	2025-01-19	The architecture of silk-secreting organs during the final larval stage of silkworms revealed by single-nucleus and spatial transcriptomics 2024-07-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114460 PMID:38996068	研究论文	本文通过单核和空间转录组学技术，系统地绘制了桑蚕幼虫发育后期丝腺的细胞和空间组成	首次结合单核和空间转录组学技术，揭示了桑蚕丝腺的细胞类型和细胞状态动态，并识别了与高效丝蛋白合成相关的调控网络和细胞间通讯	研究主要集中在桑蚕幼虫发育后期的丝腺，未涉及其他发育阶段或其他物种	阐明丝腺的细胞和空间组织，以揭示高效丝蛋白合成的机制	桑蚕幼虫发育后期的丝腺	转录组学	NA	单核转录组学, 空间转录组学	NA	转录组数据	桑蚕幼虫发育后期的丝腺样本
4976	2025-01-19	The mechano-chemical circuit in fibroblasts and dendritic cells drives basal cell proliferation in psoriasis 2024-07-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114513 PMID:39003736	研究论文	本文研究了树突状细胞（DCs）与成纤维细胞之间的机械化学信号通路如何促进银屑病皮肤中基底细胞的增殖	揭示了DCs通过增加细胞外基质（ECM）表达来增强真皮硬度，进而促进基底表皮细胞过度增殖的新机制	研究主要依赖于小鼠银屑病模型和皮肤类器官模型，可能无法完全反映人类银屑病的复杂性	探讨DCs和成纤维细胞在银屑病进展中的作用	DCs、成纤维细胞和基底表皮细胞	生物医学	银屑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学、免疫染色和硬度测量	小鼠银屑病模型和皮肤类器官模型	基因表达数据、空间转录组数据、免疫染色图像和硬度测量数据	未明确提及具体样本数量
4977	2025-01-19	Identification and characterization of TM4SF1+ tumor self-seeded cells 2024-07-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114512 PMID:39003738	研究论文	本文通过光转换标记技术建立了一个精确的动物模型，以重现肿瘤自我播种的自发过程，并识别出具有增强侵袭性和生存能力的肿瘤自我播种细胞（TSCs）亚群	首次使用光转换标记技术精确识别和表征肿瘤自我播种细胞（TSCs），并确定TM4SF1作为TSCs的标志物	研究依赖于动物模型，尚未在人类患者中进行大规模验证	研究肿瘤自我播种细胞（TSCs）的详细性质和功能，以发现潜在的诊断、预后或治疗靶点	肿瘤自我播种细胞（TSCs）	肿瘤学	癌症	光转换标记技术、单细胞RNA测序	动物模型	单细胞RNA测序数据	NA
4978	2025-01-19	An atlas of GPCRs in dopamine neurons: Identification of the free fatty acid receptor 4 as a regulator of food and water intake 2024-07-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114509 PMID:39003735	研究论文	本文通过无偏qPCR阵列表达分析，绘制了多巴胺神经元中G蛋白偶联受体（GPCR）的图谱，并鉴定了自由脂肪酸受体4（FFAR4）作为食物和水摄入的调节因子	首次绘制了多巴胺神经元中GPCR的全面图谱，并鉴定了FFAR4在调节食物和水摄入中的功能	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	研究多巴胺神经元中GPCR的表达及其在代谢调节中的作用	多巴胺神经元	神经科学	NA	qPCR阵列表达分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据挖掘、离体钙成像	NA	基因表达数据、钙成像数据	Dat-eGFP小鼠的多巴胺神经元
4979	2025-01-19	Patterns of Unwanted Biological and Technical Expression Variation Among 49 Human Tissues 2024-06, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology DOI:10.1016/j.labinv.2024.102069 PMID:38670317	研究论文	本研究利用来自49种人体组织的17,282个样本，探讨了基因表达变异的原因和模式，旨在提高去除不想要的变异同时保留与生物学问题相关的变异的能力	这是对组织表达变异潜在来源的最大规模探索之一，揭示了基因表达变异的预期和意外原因，并展示了匹配的组织学标本的实用性	14%的变异原因尚不明确，且部分解释为低置信度	提高去除不想要的基因表达变异同时保留与生物学问题相关的变异的能力	49种人体组织的17,282个样本	生物信息学	NA	RNA-seq	NA	基因表达数据	17,282个样本
4980	2025-01-19	Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Heterogeneity and Transcriptional Dynamics in Porcine Circulating CD8+ T Cells 2024-04-16, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13080692 PMID:38667307	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了猪外周血循环CD8+ T细胞的异质性和转录动态	首次全面描述了猪CD8+ T细胞亚型的异质性和分化轨迹，并鉴定了潜在的转录调控因子	研究主要集中于猪的外周血样本，未涉及其他组织或疾病状态下的CD8+ T细胞	研究猪免疫系统中CD8+ T细胞的异质性和功能	猪外周血中的CD8+ T细胞	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	猪外周血样本