单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 4941 - 4960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4941 | 2025-01-31 |
Upregulation of interferon-γ response genes in monocytes and T cells identified by single-cell transcriptomics in patients with anti-citrullinated peptide antibody-positive early rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1439082
PMID:39877346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了抗瓜氨酸肽抗体阳性早期类风湿性关节炎患者中单核细胞和T细胞中干扰素-γ反应基因的上调 | 首次在单细胞水平上比较了ACPA+和ACPA-早期类风湿性关节炎患者的免疫系统差异，并识别了IFITM2和IFITM3作为ACPA+ eRA的潜在关键标志物 | 样本量相对较小，且仅分析了外周血样本，未涉及关节组织 | 探讨抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性早期类风湿性关节炎患者免疫系统的差异 | 抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性早期类风湿性关节炎患者 | 单细胞转录组学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 37,318个细胞 |
| 4942 | 2025-01-30 |
Immunometabolic alterations in type 2 diabetes mellitus revealed by single-cell RNA sequencing: insights into subtypes and therapeutic targets
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1537909
PMID:39877357
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了2型糖尿病（T2DM）中的免疫代谢改变，并探讨了其亚型和治疗靶点 | 首次使用单细胞RNA测序技术对T2DM患者的免疫细胞进行详细分析，揭示了T细胞亚群的代谢异质性，并基于代谢特征对T2DM进行了亚型分类 | 样本量相对较小，仅包括37名T2DM患者和11名健康对照 | 揭示T2DM中的免疫代谢改变，并探索其亚型和潜在治疗靶点 | 2型糖尿病患者和健康对照的外周血单核细胞（PBMCs） | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 37名T2DM患者和11名健康对照 |
| 4943 | 2025-01-31 |
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to explore prognostic value and immune landscapes of methionine metabolism-related signature in breast cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1521269
PMID:39877420
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，探索了乳腺癌中甲硫氨酸代谢相关特征的预后价值和免疫景观 | 首次构建并验证了基于八个甲硫氨酸相关基因的乳腺癌预后模型，并揭示了APOC1基因在调节巨噬细胞极化和乳腺癌细胞行为中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏临床样本的直接验证 | 探索甲硫氨酸代谢相关基因在乳腺癌中的预后价值和免疫调节作用 | 乳腺癌患者和乳腺癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq），批量RNA测序 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），Cox回归 | RNA测序数据 | 基于TCGA和GEO数据库的乳腺癌患者数据，以及MDA-MB-231和MDA-MB-468乳腺癌细胞系 |
| 4944 | 2025-01-31 |
Revisiting the female germline cell development
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1525729
PMID:39877734
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综述 | 本文回顾了雌性生殖细胞发育的最新进展，探讨了关键基因调控网络、表观遗传途径、细胞周期调节因子和植物激素在这一过程中的作用 | 利用先进技术如smFISH、LCM、染色质免疫沉淀/测序和CRISPR基因编辑，揭示了雌性生殖细胞发育不同阶段的机制 | NA | 探索雌性生殖细胞发育的机制 | 雌性生殖细胞 | 植物生物学 | NA | smFISH, LCM, 染色质免疫沉淀/测序, CRISPR基因编辑, 单细胞转录组/空间转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA |
| 4945 | 2025-01-30 |
MAIT Cell-Mediated Immune Mechanisms of Dialysis-Induced Peritoneal Fibrosis and Therapeutic Targeting
2025-Jan-28, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000627
PMID:39874111
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研究论文 | 本研究探讨了MAIT细胞在长期腹膜透析诱导的腹膜纤维化中的免疫机制及治疗靶点 | 首次揭示了MAIT细胞通过MR1受体与间皮细胞相互作用，激活mTORC1信号通路，促进腹膜纤维化的机制，并提出了通过阻断MR1-MAIT相互作用来治疗纤维化的新策略 | 研究主要基于体外模型和Mr1基因敲除小鼠，尚未在人体临床试验中验证其治疗效果 | 探讨MAIT细胞在腹膜透析诱导的腹膜纤维化中的作用，并寻找潜在的治疗靶点 | 长期接受腹膜透析的患者及Mr1基因敲除小鼠 | 免疫学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术 | NA | RNA测序数据、流式细胞数据 | 长期腹膜透析患者及Mr1基因敲除小鼠 |
| 4946 | 2025-01-30 |
DDO1002, an NRF2-KEAP1 inhibitor, improves hematopoietic stem cell aging and stress response
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae043
PMID:39872153
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研究论文 | 本文研究了DDO1002作为NRF2-KEAP1抑制剂在改善造血干细胞衰老和应激反应中的作用 | 首次阐明了DDO1002通过激活NRF2-ARE信号通路来减少细胞内活性氧水平，从而延缓细胞衰老和改善造血功能 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探讨DDO1002在缓解全身照射后或衰老过程中造血功能下降的作用 | 造血干细胞（HSCs） | 生物医学 | 老年疾病 | 单细胞测序分析 | NA | NA | 老年小鼠 |
| 4947 | 2025-01-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals the intercellular crosstalk and the regulatory landscape of stromal cells during the whole life of the mouse ovary
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae041
PMID:39872151
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠卵巢整个生命周期中基质细胞的细胞间通讯和调控景观 | 首次整合了从胚胎期到成年期的单细胞RNA测序数据，揭示了卵巢基质细胞的动态变化和细胞间通讯网络，并识别了基质细胞的起源——间充质祖细胞（CD24） | 研究主要基于小鼠模型，人类卵巢中的相关机制仍需进一步验证 | 研究卵巢基质细胞的异质性、发育轨迹及细胞间通讯网络 | 小鼠卵巢中的基质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从E11.5（胚胎第11.5天）到M12（12月龄）的小鼠卵巢样本 |
| 4948 | 2025-01-30 |
Spatial multi-omics characterizes GPR35-relevant lipid metabolism signatures across liver zonation in MASLD
2024-Dec, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loae021
PMID:39873004
|
研究论文 | 本研究通过结合脂质代谢组学、空间转录组学（ST）和空间代谢组学（SM），旨在识别由GPR35调控的MASLD中不同肝脏分区的特定基因和代谢物的空间分布 | 首次在肝脏分区水平上揭示了GPR35在MASLD中的调控机制，特别是其对脂质代谢和炎症反应的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨GPR35在MASLD中的调控机制及其对肝脏分区的影响 | 小鼠肝脏 | 代谢组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 脂质代谢组学、空间转录组学（ST）、空间代谢组学（SM） | NA | 代谢物和基因表达数据 | NA |
| 4949 | 2025-01-30 |
The evolution of ovarian somatic cells characterized by transcriptome and chromatin accessibility across rodents, monkeys, and humans
2024-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae028
PMID:39872443
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和染色质可及性分析，揭示了人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子卵巢在进化过程中的保守性和差异性 | 首次通过单细胞转录组和染色质可及性联合分析，揭示了卵巢细胞在进化过程中的分子机制变化，并发现了跨物种的共同调控架构 | 研究主要依赖于非人类模型生物，可能无法完全反映人类卵巢的复杂性 | 研究卵巢细胞在进化过程中的分子机制变化，以理解人类卵巢生理和疾病 | 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢细胞样本 |
| 4950 | 2025-01-30 |
Comparative dissection of transcriptional landscapes of human iPSC-NK differentiation and NK cell development
2024-Aug, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae032
PMID:39872864
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研究论文 | 本文通过比较分析单细胞RNA测序数据，揭示了人类iPSC-NK细胞分化和NK细胞发育过程中的关键转录因子调控网络 | 通过单细胞RNA测序技术，识别了iPSC-NK细胞分化过程中缺乏的关键因子，并验证了STAT5A-iPSCs新细胞系的抗肿瘤功能 | 研究中未明确提及样本的具体数量，可能影响结果的普遍性 | 旨在深入理解iPSC-NK细胞的分化过程，以优化其生产和工程化 | 人类iPSC-NK细胞和胎儿肝脏NK细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 未明确说明 |
| 4951 | 2025-01-30 |
Integration of single-cell transcriptome and chromatin accessibility and its application on tumor investigation
2024-Apr, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae015
PMID:39872661
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综述 | 本文综述了单细胞转录组和染色质可及性测序方法的最新突破，并描述了整合这些单细胞测序数据的生物信息学策略及其在肿瘤研究中的应用 | 整合单细胞转录组和染色质可及性测序数据，以更深入地理解肿瘤发生和进展 | 讨论了该领域面临的挑战和预期发展，但未具体说明当前方法的局限性 | 总结单细胞测序方法的最新进展及其在肿瘤研究中的应用 | 单细胞转录组和染色质可及性测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 4952 | 2025-01-30 |
Generation of renal tubular organoids from adult SOX9+ kidney progenitor cells
2023-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnad047
PMID:39872058
|
研究论文 | 本文研究了从成年SOX9+肾脏祖细胞生成肾小管类器官的能力 | 首次研究了SOX9阳性肾脏祖细胞自主生成肾脏类器官的能力，并发现其具有更强的肾小管分化潜力 | SOX9肾脏祖细胞未能分化为肾小球细胞 | 研究SOX9阳性肾脏祖细胞的分化潜力及其在生成肾小管类器官中的应用 | 小鼠和人类的SOX9肾脏祖细胞 | 生物医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类的SOX9肾脏祖细胞 |
| 4953 | 2025-01-30 |
Modeling maternal cholesterol exposure reveals a reduction of neural progenitor proliferation using human cerebral organoids
2023-Apr, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnac034
PMID:39872117
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研究论文 | 本文通过构建胆固醇暴露模型，利用人类多能干细胞衍生的脑类器官，揭示了母体高胆固醇暴露可能导致后代神经发育障碍的机制 | 首次使用人类多能干细胞衍生的脑类器官构建胆固醇暴露模型，揭示了高胆固醇对神经祖细胞增殖的抑制作用及其与自闭症谱系障碍（ASD）的潜在关联 | 研究主要基于体外模型，未涉及动物或人体实验，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探讨母体高胆固醇暴露对后代神经发育的影响及其机制 | 人类多能干细胞衍生的脑类器官 | 神经发育生物学 | 自闭症谱系障碍（ASD） | 单细胞测序 | 脑类器官模型 | 基因表达数据 | NA |
| 4954 | 2025-01-30 |
Generation of blastoids from human parthenogenetic stem cells
2023-Feb, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnad006
PMID:39872951
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研究论文 | 本文通过两步诱导协议从人类孤雌生殖干细胞生成孤雌生殖胚泡，以研究基因组印记在胚胎发育中的作用 | 首次从孤雌生殖干细胞生成孤雌生殖胚泡，为研究基因组印记提供了新模型 | 由于发育缺陷和伦理限制，对孤雌生殖胚胎发育的全面理解仍不足 | 研究基因组印记在胚胎发育中的作用及父母起源偏差对人类发育和病理机制的影响 | 孤雌生殖干细胞（hPg-ESCs）及其衍生的扩展多能干细胞（hPg-EPSCs） | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4955 | 2025-01-30 |
Decoding liver fibrogenesis with single-cell technologies
2022-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnac040
PMID:39872749
|
review | 本文综述了单细胞RNA测序技术如何改变我们对肝纤维化调控机制的理解 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了肝纤维化过程中疾病相关细胞亚群、分子事件和细胞间相互作用 | 需要进一步努力以全面理解这些变化对肝纤维化的功能贡献，并将新知识转化为有效的治疗方法 | 探讨单细胞RNA测序技术在肝纤维化研究中的应用 | 肝细胞、肝窦内皮细胞、肌成纤维细胞和巨噬细胞 | 生物信息学 | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4956 | 2024-12-09 |
NLRP3 inflammasome mediates pyroptosis of alveolar macrophages to induce radiation lung injury
2025-Feb-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136740
PMID:39642726
|
研究论文 | 研究探讨了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用 | 首次揭示了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用，并提出了潜在的治疗策略 | NA | 探讨辐射诱导的肺损伤中肺泡巨噬细胞焦亡和炎症小体激活的机制 | 肺泡巨噬细胞、T细胞、B细胞和上皮细胞 | NA | 辐射诱导的肺损伤 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、共免疫沉淀和Duolink技术 | NA | 细胞和组织微环境数据 | NA |
| 4957 | 2025-01-29 |
Improving Spatial Transcriptomics with Membrane-Based Boundary Definition and Enhanced Single-Cell Resolution
2025-Jan-28, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401056
PMID:39871658
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研究论文 | 本文介绍了一种新的空间转录组学方法，通过使用基因编码的荧光蛋白标记细胞膜，精确索引切片上的测序点和细胞内的转录本 | 提出了一种基于细胞膜标记的新方法，相比基于细胞核的方法，显著提高了基因捕获数量，并实现了更一致的单细胞RNA测序数据表达谱 | 未提及具体的技术限制或挑战 | 改进空间转录组学技术，提高细胞边界定义的准确性和单细胞分辨率 | 小鼠和蝾螈的肝脏、大脑和肠道 | 空间转录组学 | NA | 基因编码的荧光蛋白标记 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠和蝾螈的肝脏、大脑和肠道样本 |
| 4958 | 2025-01-29 |
Human Dermal Microvascular Arterial and Venous Blood Endothelial Cells and Their Use in Bioengineered Dermo-Epidermal Skin Substitutes
2025-Jan-28, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401588
PMID:39871784
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4959 | 2024-12-24 |
Cholinergic waves have a modest influence on the transcriptome of retinal ganglion cells
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627027
PMID:39713433
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研究论文 | 研究了视网膜波对视网膜神经节细胞类型转录组变化的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了视网膜波对不同类型视网膜神经节细胞基因表达的微弱影响 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小 | 探讨视网膜波对视网膜神经节细胞基因表达的影响 | 视网膜神经节细胞的转录组变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和β2KO小鼠的视网膜神经节细胞 |
| 4960 | 2025-01-29 |
Distinct causes of three phenotypic hallmarks of hematopoietic aging
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.632900
PMID:39868295
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研究论文 | 本文探讨了造血衰老的三个表型特征的原因，特别是炎症如何促进这些衰老表型 | 提出了一个实验模型（IkappaBminus）来解析NFkappaB在造血衰老表型中的作用，并发现HSC自主的NFkappaB活动损害其功能，而骨髓环境中的炎症驱动髓系偏倚 | 研究主要基于实验模型，可能无法完全反映人类造血衰老的复杂性 | 解析造血衰老的三个表型特征的独立调控机制 | 造血干细胞（HSC）及其在衰老过程中的功能变化 | 生物医学 | 衰老相关疾病 | scRNA-seq | IkappaBminus模型 | 基因表达数据 | 小鼠和人类的HSC数据集 |