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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4941 | 2025-10-06 |
Congestion Enriches Intra-hepatic Macrophages Through Reverse Zonation of CXCL9 in Liver Sinusoidal Endothelial Cells
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101475
PMID:39923846
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研究论文 | 本研究揭示了肝脏充血通过肝窦内皮细胞中CXCL9的反向分区化富集肝内巨噬细胞的机制 | 首次发现肝窦内皮细胞中CXCL9的反向分区化现象及其在充血性肝病中调控巨噬细胞募集的新机制 | 研究样本量有限,且动物模型可能无法完全模拟人类疾病的所有特征 | 探究充血性肝病中肝窦免疫细胞空间分布变化及其在肝纤维化和门脉高压中的作用 | 充血性肝病患者组织样本、Fontan相关肝病患者组织样本、小鼠pIVCL模型 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 成像质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,RNA原位杂交 | NA | 图像,单细胞转录组数据 | 人类患者组织样本和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
4942 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals distinct metabolic "microniches" and close host-symbiont interactions in deep-sea chemosynthetic tubeworm
2024-07-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3053
PMID:39047091
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示深海化能合成管虫体内代谢微环境及其与内共生菌的相互作用机制 | 首次在深海化能合成生态系统中应用原位单细胞固定技术,发现管虫通过控制化学合成气体和代谢物可用性在共生器官中维持两种不同的代谢微环境 | 研究仅针对一种冷泉管虫物种,尚未验证在其他化能合成生态系统中的普适性 | 阐明深海管虫与内共生菌之间的分子相互作用机制 | 冷泉管虫及其硫氧化γ-变形菌内共生体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 冷泉管虫共生器官组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 深海原位单细胞固定技术 |
4943 | 2025-10-06 |
Macrophage Dysfunction in Respiratory Disease
2024, Results and problems in cell differentiation
DOI:10.1007/978-3-031-65944-7_9
PMID:39406908
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综述 | 本文探讨肺巨噬细胞在呼吸系统疾病中的功能障碍及其机制 | 整合谱系追踪和单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞在肺部疾病中的代谢特征和线粒体活性变化 | 未涉及具体实验验证和临床干预研究 | 解析巨噬细胞功能障碍在呼吸系统疾病发病机制中的作用 | 肺巨噬细胞(包括肺泡巨噬细胞和组织驻留细胞) | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4944 | 2025-10-06 |
Amelioration of Liver Fibrosis via In Situ Hepatic Stellate Cell Conversion Through Co-Inhibition of TGF-β and GSK-3 Signalling
2025-Jul, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70187
PMID:40575954
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研究论文 | 本研究评估了通过同时抑制TGF-β和GSK-3信号通路的小分子鸡尾酒疗法SBCH,在多种肝纤维化模型中改善纤维化并促进肝脏修复的效果 | 首次发现SBCH联合疗法不仅能抑制肝星状细胞活化,还能诱导活化的肝星状细胞转分化为肝细胞样细胞(ciHeps) | 研究仅在动物模型中进行,尚未进行临床试验验证 | 开发治疗肝纤维化和肝硬化的新型治疗策略 | 肝星状细胞(HSCs)和肝纤维化模型 | 肝脏疾病研究 | 肝纤维化、肝硬化 | 单细胞RNA测序、体内示踪、表型分析 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、组织学数据 | 三种肝纤维化模型:CCl4诱导、胆管结扎(BDL)和非酒精性脂肪性肝炎(NASH)伴二乙基亚硝胺(DEN)模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4945 | 2025-10-06 |
Oral immunotherapy directs systemic transcriptomic changes in children with hen's egg allergy
2025-Jun-22, Asian Pacific journal of allergy and immunology
IF:2.3Q3
DOI:10.12932/AP-011124-1965
PMID:40544372
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析鸡蛋过敏儿童口服免疫治疗期间的系统性转录组变化 | 首次在鸡蛋过敏儿童中应用单细胞RNA测序技术揭示口服免疫治疗引起的系统性免疫细胞转录组变化 | 样本量较小(16名儿童),仅分析了治疗前后的两个时间点 | 研究鸡蛋过敏儿童的系统性免疫表型及口服免疫治疗期间的转录组变化 | 3-12岁被诊断为鸡蛋过敏的儿童 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16名鸡蛋过敏儿童 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4946 | 2025-10-06 |
scRepertoire 2: Enhanced and efficient toolkit for single-cell immune profiling
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012760
PMID:40577285
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研究论文 | 介绍scRepertoire 2工具包,这是一个用于分析和可视化单细胞免疫受体数据的R软件包的重大更新 | 引入克隆型追踪、受体库多样性指标和新可视化模块等增强功能,性能优化使速度提升85.1%,内存使用减少91.9% | NA | 开发高效的单细胞免疫分析工具,促进健康和疾病状态下的免疫动态研究 | 单细胞适应性免疫受体序列数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 免疫相关疾病 | 单细胞适应性免疫受体测序(scAIRR-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫受体测序 | NA | NA |
4947 | 2025-10-06 |
Viral tropism in plants, reproductive tissues, and seeds
2025-May-23, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04353-9
PMID:40404962
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综述 | 本文系统阐述了植物病毒趋向性的分子与细胞决定因素及其在生殖组织与种子中的感染机制 | 整合超分辨率显微镜和单细胞组学技术揭示病毒-宿主互作新机制,提出植物病毒在靶向递送领域的应用潜力 | 未涉及具体作物品种的实证研究数据 | 解析植物病毒趋向性的分子机制及其生物技术应用 | 植物病毒在特定细胞类型、组织和宿主中的感染特性 | 植物病理学 | 植物病毒病 | 超分辨率显微镜, 单细胞转录组学, 蛋白质组学 | NA | 文献综述 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4948 | 2025-10-06 |
Huanglian Jiedu Decoction Treats Ischemic Stroke by Regulating Pyroptosis: Insights from Multi-Omics and Drug-Target Relationship Analysis
2025-May-23, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18060775
PMID:40573172
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研究论文 | 本研究通过多组学和药物-靶点关系分析探讨黄连解毒汤通过调节细胞焦亡治疗缺血性中风的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学系统揭示黄连解毒汤通过NLRP3炎症小体通路调节细胞焦亡的分子机制 | 研究仅使用雄性小鼠模型,缺乏雌性动物验证;样本量相对有限 | 探究黄连解毒汤治疗缺血性中风的作用机制 | 8周龄雄性小鼠 | 多组学分析 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 分子对接, 表面等离子共振, 液相色谱-质谱联用, 分子动力学 | NA | 多组学数据, 生理学数据, 组织病理学数据 | 小鼠分为6组(假手术组、模型组、阳性药物组、黄连解毒汤低中高剂量组) | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
4949 | 2025-10-06 |
Desmosome mutations impact the tumor microenvironment to promote melanoma proliferation
2025-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02163-9
PMID:40240879
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研究论文 | 本研究揭示了桥粒基因突变通过改变肿瘤微环境促进黑色素瘤增殖的新机制 | 首次发现桥粒基因在人类癌症中的高频突变,并证明这些突变通过影响角质形成细胞间接促进黑色素瘤增殖 | 研究主要基于原发性和转移性黑色素瘤活检样本,需要进一步验证其他癌症类型 | 探究桥粒基因突变在黑色素瘤发生发展中的作用机制 | 人类黑色素瘤样本和角质形成细胞 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、蛋白质免疫荧光、基因敲低、共培养实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质定位数据、细胞增殖数据 | 人类原发性和转移性黑色素瘤活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
4950 | 2025-10-06 |
Advances and challenges in cell-cell communication inference: a comprehensive review of tools, resources, and future directions
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf280
PMID:40536815
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综述 | 本文全面回顾了基于单细胞和空间转录组数据的细胞间通讯推断工具、资源及未来发展方向 | 系统整合了100多种生物信息学工具和近50种资源,创建了集中式网络平台CCC-Catalog | 未开发新的计算方法,主要侧重于现有工具和资源的系统性评述 | 评估细胞间通讯推断领域的现状、挑战和未来方向 | 细胞间通讯推断工具、配体-受体数据库和相关资源 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4951 | 2025-10-06 |
Evaluating discrepancies in dimensionality reduction for time-series single-cell RNA-sequencing data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf287
PMID:40576031
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研究论文 | 评估时间序列单细胞RNA测序数据降维中不同技术产生的差异 | 提出基于变分自编码器生成合成时间序列scRNA-seq数据的方法来评估降维技术差异 | 研究中使用的合成数据可能无法完全代表真实生物系统的复杂性 | 评估不同降维技术在时间序列单细胞RNA测序数据分析中的一致性和可靠性 | 时间序列单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器, PCA, t-SNE, UMAP, scVI | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4952 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics predict novel potential regulators of acute epithelial restitution in the ischemia-injured intestine
2025-Mar-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00194.2024
PMID:39853303
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研究论文 | 通过单细胞转录组学预测缺血损伤肠道中急性上皮修复的新型潜在调节因子 | 首次在猪模型中通过单细胞转录组学识别出表达细胞迁移通路的吸收性肠细胞亚群,并预测CSF-1作为年龄依赖性修复反应的上游调节因子 | 研究基于猪模型,需进一步验证在人类中的适用性;初步体外实验需要更深入的体内验证 | 探索缺血损伤肠道上皮修复的年龄依赖性机制,识别潜在治疗靶点 | 幼年和新生猪的缺血损伤肠道黏膜上皮细胞 | 单细胞生物学 | 肠道缺血损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 幼猪缺血空肠恢复期黏膜上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4953 | 2025-10-06 |
The brain microvasculature is a primary mediator of interferon-α neurotoxicity in human cerebral interferonopathies
2024-07-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.05.017
PMID:38878770
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研究论文 | 本研究揭示大脑微血管是干扰素-α神经毒性的主要介导者,为Aicardi-Goutières综合征提供了新的治疗靶点 | 首次证实大脑是神经毒性IFN-α的主要来源,并确定脑内皮细胞中的IFNAR信号通路是导致脑血管疾病的关键机制 | 动物模型与人类疾病存在差异,需要进一步验证治疗策略的临床适用性 | 探究Aicardi-Goutières综合征中神经毒性IFN-α的来源和作用机制 | Aicardi-Goutières综合征患者和小鼠模型 | 神经科学 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 磁共振成像, 单分子ELISA | NA | 基因表达数据, 影像数据, 蛋白质检测数据 | 人类患者和小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4954 | 2025-10-06 |
SH3GLB1-related autophagy mediates mitochondrial metabolism to acquire resistance against temozolomide in glioblastoma
2022-Jul-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02429-8
PMID:35831908
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研究论文 | 本研究揭示了SH3GLB1通过调控自噬介导线粒体代谢从而促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的机制 | 首次发现SH3GLB1通过自噬调控线粒体代谢功能介导胶质母细胞瘤对TMZ的耐药性 | 机制研究主要基于体外实验,临床转化价值需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系、动物模型和临床肿瘤样本 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA干扰、基因扩增、单细胞转录组分析、细胞分子检测 | NA | RNA转录组数据、蛋白质表达数据 | 临床肿瘤样本和细胞系,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4955 | 2025-10-06 |
Molecular characterization of benign intracranial glioependymal and arachnoid cysts suggest heterogeneous mechanisms of action
2025-Jul-01, Journal of neuropathology and experimental neurology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jnen/nlaf029
PMID:40197611
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研究论文 | 本研究通过分子特征分析揭示了良性颅内神经胶质室管膜囊肿和蛛网膜囊肿的异质性发病机制 | 首次通过单细胞测序和RNA表达谱比较揭示两种囊肿具有不同的细胞谱系和分子特征,并提出了不同的发病机制假说 | 样本量较小(仅16例患者),仅对部分样本进行了囊肿壁病理分析(n=8)和囊肿液检测(n=4) | 探究良性颅内囊肿的形成和生长机制 | 接受手术治疗的良性颅内囊肿患者及其囊肿组织样本 | 神经病理学 | 颅内囊肿 | 单细胞测序, RNA表达谱分析, H&E染色, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞测序数据, RNA表达数据, 病理图像数据 | 16例患者,8例囊肿壁样本,4例囊肿液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4956 | 2025-10-06 |
Skeletal site-specific variations in myeloid cells: insights from single-cell RNA sequencing of the mandible and femur
2025-Jul, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf074
PMID:40486046
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较小鼠下颌骨和股骨骨髓中CD11b+髓系细胞的转录组差异 | 首次从单细胞水平揭示下颌骨来源的髓系细胞具有独特的炎症基因特征,并发现KLF4基因在下颌骨细胞分化中的特异性作用 | 研究仅使用2月龄C57BL/6小鼠,样本来源和年龄范围有限 | 探究不同骨骼部位(下颌骨与股骨)髓系细胞的转录组差异 | 2月龄C57BL/6小鼠下颌骨和股骨骨髓中的CD11b+髓系细胞 | 单细胞组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, ATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | C57BL/6小鼠下颌骨和股骨骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4957 | 2025-10-06 |
Regional differences in progenitor metabolism shape brain growth during development
2025-Jun-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.04.003
PMID:40300602
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研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率的小鼠大脑发育图谱揭示了前脑与后脑神经发生的区域差异,并发现线粒体蛋白FAM210B通过调节代谢影响神经前体细胞增殖的机制 | 首次提供了小鼠大脑单细胞分辨率的发育时间图谱,揭示了区域特异性神经发生模式,并鉴定出线粒体蛋白FAM210B作为调节神经前体细胞代谢和增殖的关键因子 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的保守性需要进一步验证 | 探究哺乳动物大脑区域发育差异的分子机制 | 小鼠大脑发育过程中的神经前体细胞 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序,功能获得和功能缺失实验 | NA | 单细胞转录组数据,发育时间序列数据 | 小鼠大脑发育不同阶段的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4958 | 2025-10-06 |
Advantages of cell proliferation and immune regulation in CD146+NESTIN+ HUMSCs: insights from single-cell RNA sequencing
2025-Jun-24, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae063
PMID:39428975
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析不同胎龄人脐带间充质干细胞中CD146+NESTIN+亚群的增殖和免疫调节优势 | 首次在单细胞水平揭示早产HUMSCs中CD146+Nestin+亚群具有更高的增殖能力和免疫调节功能 | 样本量较小(仅3个供体),需要更大规模研究验证 | 探究不同胎龄HUMSCs的细胞异质性及其功能差异 | 人脐带间充质干细胞(HUMSCs)和骨髓间充质干细胞(BMSCs) | 单细胞组学 | 干细胞治疗 | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 3个不同胎龄HUMSCs供体(22+5周、28周、39周)和2个公共数据库BMSCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4959 | 2025-10-06 |
Heterologous prime-boost with an mRNA vaccine and an oncolytic virus enhances tumor regression through overcoming intratumoral immune suppression
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115745
PMID:40411783
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研究论文 | 本研究开发了一种通过mRNA疫苗与溶瘤病毒异源初免-加强策略增强HPV相关肿瘤消退的方法 | 首次将mRNA疫苗与HSV-1溶瘤病毒结合使用,通过异源初免-加强策略协同激活系统性和肿瘤内免疫反应 | 研究基于小鼠同系肿瘤模型,尚未在人类临床试验中验证 | 开发克服肿瘤内免疫抑制的新型联合免疫疗法 | HPV相关癌症模型 | 免疫治疗 | HPV相关癌症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | 小鼠同系肿瘤模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4960 | 2025-10-06 |
RORγt is crucial for gut homeostasis by regulating the expression of HB-EGF rather than IL-22 in activated ILC3s
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115793
PMID:40478733
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了RORγt在活化ILC3细胞中的关键作用,特别是对HB-EGF表达的调控 | 发现RORγt缺失后ILC3细胞仍能产生足够IL-22维持肠道健康,但HB-EGF产生受损,这为理解RORγt功能提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型,人类ILC3细胞中RORγt功能是否相同尚需验证 | 阐明RORγt在3型先天淋巴样细胞(ILC3s)中的具体功能机制 | IL-22命运示踪小鼠模型中的ILC3细胞 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,命运示踪技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |