单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4921 - 4940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4921 | 2025-10-06 |
Role of stem-like cells in chemotherapy resistance and relapse in pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Jun-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61222-1
PMID:40579412
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究儿童T细胞急性淋巴细胞白血病中干细胞样细胞在化疗耐药和复发中的作用 | 首次在T-ALL中通过纵向单细胞研究鉴定出具有干细胞特征的耐药细胞亚群 | 样本量相对有限（13对匹配样本+5例非复发患者） | 探究T-ALL复发和化疗耐药的机制 | 儿童T细胞急性淋巴细胞白血病患者样本 | 单细胞测序分析 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例样本（13对匹配诊断-复发样本+5例非复发诊断样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4922 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial analyses of the GDF family in tumors, with a focus on the prognostic and biological role of GDF15 in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-27, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01431-9
PMID:40579699
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析GDF家族在肿瘤中的作用，重点关注GDF15在肝细胞癌中的预后和生物学功能 | 首次基于单细胞和空间转录组对GDF亚家族进行系统性泛癌分析，揭示了GDF15在肝细胞癌肿瘤微环境中的新作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于肝细胞癌细胞系 | 系统分析GDF亚家族在多种癌症中的表达特征及其临床意义 | 33种癌症类型，重点关注肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 功能获得和缺失实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 细胞系实验数据 | 33种癌症类型的数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 4923 | 2025-10-06 |
ETMR stem-like state and chemo-resistance are supported by perivascular cells at single-cell resolution
2025-Jun-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60442-9
PMID:40562749
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胚胎性多层菊形团肿瘤的异质性及肿瘤微环境中周细胞对肿瘤干细胞状态和化疗耐药性的支持作用 | 首次在单细胞水平系统揭示ETMR肿瘤微环境中PDGFRβ周细胞通过细胞外基质相互作用支持肿瘤干细胞信号传导和化疗耐药性 | 研究主要基于模型系统，需要在更多临床样本中验证 | 探究ETMR肿瘤异质性及肿瘤微环境中的细胞通讯机制 | 人类和小鼠原代ETMR肿瘤细胞、体外培养细胞、3D前脑类器官ETMR模型 | 单细胞生物学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 空间转录组学 | 3D类器官模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 约250,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4924 | 2025-10-06 |
Reduction of NFX1-123 and HPV 16 E6 and E7 Decreased Telomerase and CENP-F in Cervical Cancer Cell Lines
2025-Jun-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17122044
PMID:40563693
|
研究论文 | 本研究通过敲除NFX1-123和HPV 16 E6/E7，探讨了它们在宫颈癌细胞系中对端粒酶和CENP-F的调控作用 | 首次在HPV相关癌症中研究NFX1-123对端粒酶活性的调控作用，并发现其与HPV 16致癌基因在调控hTERT、端粒酶和CENP-F中的共同作用 | 研究仅限于宫颈癌细胞系，需要进一步在更多细胞模型和体内实验中验证 | 研究NFX1-123在HPV相关癌症中对端粒酶活性的调控机制 | 宫颈癌细胞系（CaSki和SiHa细胞）以及TCGA数据库中的宫颈癌和HPV阳性头颈癌原发肿瘤数据 | 癌症生物学 | 宫颈癌 | 基因敲除、单细胞RNA测序、基因敲低 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据、临床数据库数据 | 宫颈癌细胞系和TCGA数据库中的原发肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4925 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Reveals Regional and Temporal Dynamics of Gene Expression in the Mouse Brain Across Development and Aging
2025-Jun-18, Biology
DOI:10.3390/biology14060717
PMID:40563967
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析小鼠大脑在发育和衰老过程中的区域特异性基因表达动态 | 首次通过空间转录组学直接比较大脑发育与衰老的分子机制，建立了新颖的空间转录组参考数据集 | 研究仅针对三个特定时间点，可能无法完全捕捉连续的变化过程；研究局限于小鼠模型 | 探究大脑在发育和衰老过程中区域特异性基因表达的动态变化 | 小鼠大脑在不同发育阶段（P21、3月龄、28月龄）的基因表达 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 三个关键时间点的小鼠大脑样本（P21、3月龄、28月龄） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4926 | 2025-10-06 |
Multi-omics analyses of the heterogenous immune microenvironment in triple-negative breast cancer implicate UQCRFS1 potentiates tumor progression
2025-Jun-16, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00672-1
PMID:40524231
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示三阴性乳腺癌异质性免疫微环境，发现UQCRFS1促进肿瘤进展 | 首次通过单细胞RNA测序系统分析TNBC免疫微环境异质性，建立恶性细胞指数模型并验证UQCRFS1的促癌功能 | 样本量较小（仅9例初治TNBC患者），需更大队列验证 | 解析三阴性乳腺癌免疫微环境异质性及其与肿瘤进展的关系 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 蛋白质组, qRT-PCR, 蛋白质印迹 | LASSO-Cox回归, CellChat算法, 伪时序分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 9例初治三阴性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 4927 | 2025-10-06 |
Next generation genetic screens in kinetoplastids
2025-Jun-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf515
PMID:40530689
|
综述 | 本文综述了动质体寄生虫中遗传筛选技术的发展与应用 | 探讨了将基于图像的筛选和单细胞测序技术与遗传筛选相结合的新方法 | NA | 系统理解基因组功能元件及其扰动对细胞功能的影响 | 动质体寄生虫的编码和非编码基因组区域 | 基因组学 | 寄生虫病 | 遗传筛选, CRISPR-Cas技术, 单细胞测序, 图像分析 | NA | 基因组数据, 图像数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4928 | 2025-10-06 |
Macrophage polarization, inflammatory monocytes, and impaired MDSCs are associated with murine and human immune aplastic anemia
2025-Jun-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf073
PMID:40411822
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型和人类样本探讨骨髓源性细胞在免疫性再生障碍性贫血发病机制中的作用 | 首次揭示CSF-1R抑制会加剧骨髓衰竭并促进M1巨噬细胞极化，同时发现JAK抑制剂可缓解疾病进程 | 研究样本量有限，人类样本仅针对严重AA患者 | 探索骨髓衰竭疾病中髓系细胞的免疫病理机制 | 小鼠骨髓衰竭模型和人类再生障碍性贫血患者样本 | 免疫学 | 再生障碍性贫血 | 流式细胞术, 细胞因子分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞群体数据 | CByB6F1小鼠和严重AA患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4929 | 2025-10-06 |
Plin2 Coordinates Immune and Metabolic Reprogramming in Lacrimal Gland Aging
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.79
PMID:40569117
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析和单细胞测序技术，揭示了Plin2在泪腺衰老过程中协调免疫和代谢重编程的核心调控作用 | 首次发现Plin2作为泪腺衰老的核心枢纽基因，完美区分年轻与衰老状态(AUC=1.00)，并阐明其在免疫-代谢轴中的调控机制 | 研究仅限于C57BL/6小鼠模型，尚未在人类样本中验证；样本数量未明确说明 | 鉴定泪腺衰老的核心分子调控因子，阐明其在免疫失衡和代谢功能障碍中的作用 | 年轻和年老C57BL/6小鼠的泪腺组织 | 生物信息学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | LASSO回归, 支持向量机-递归特征消除 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4930 | 2025-10-06 |
ScInfeR: an efficient method for annotating cell types and sub-types in single-cell RNA-seq, ATAC-seq, and spatial omics
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf253
PMID:40471991
|
研究论文 | 提出一种基于图结构的细胞类型注释方法ScInfeR，能够高效注释单细胞RNA测序、ATAC测序和空间组学数据中的细胞类型和亚型 | 结合scRNA-seq参考数据和标记基因集，采用分层框架和图神经网络消息传递机制，支持加权正负标记基因，并开发了包含329种细胞类型参考数据的交互式数据库 | NA | 开发高效的细胞类型注释方法，解决单细胞和空间组学数据分析中的细胞类型识别难题 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学数据集中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，空间转录组学 | 图神经网络 | 基因表达数据，染色质可及性数据，空间坐标信息 | 在100多个细胞类型预测任务中评估，包含28种组织类型的人类和植物数据 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 4931 | 2025-10-06 |
The Dyson equalizer: adaptive noise stabilization for low-rank signal detection and recovery
2025-Mar, Information and inference : a journal of the IMA
DOI:10.1093/imaiai/iaae036
PMID:39830802
|
研究论文 | 本文开发了一种自适应噪声稳定化方法，用于异方差噪声下的低秩信号检测与恢复 | 提出基于Dyson方程的自适应归一化程序，能够均衡数据矩阵行列间的平均噪声方差，支持广泛的噪声分布和信号结构 | NA | 解决异方差噪声环境下低秩信号的检测与恢复问题 | 含噪声数据矩阵中的低秩信号 | 机器学习 | NA | 随机矩阵理论 | Dyson均衡器 | 矩阵数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4932 | 2025-10-06 |
Fucosylated haptoglobin promotes inflammation via Mincle in sepsis: an observational study
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56524-3
PMID:39904983
|
观察性研究 | 本研究揭示了败血症患者血浆中岩藻糖基化结合珠蛋白通过Mincle受体促进炎症反应的作用机制 | 首次发现败血症患者血浆中Hp在Asn207和Asn211位点的末端岩藻糖基化水平升高，并阐明其通过Mincle受体激活炎症反应的分子机制 | 观察性研究设计，无法确定因果关系；样本量未明确说明；动物模型结果需要进一步验证 | 探究岩藻糖基化结合珠蛋白在败血症炎症反应中的作用机制 | 败血症患者血浆样本、小鼠模型、巨噬样细胞群体 | 分子生物学 | 败血症 | 单细胞RNA测序，蛋白质纯化，细胞因子检测 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4933 | 2025-10-06 |
Identification of a distinctive gene signature in granulomatous myositis
2025-Jan-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.12.27.24319708
PMID:40568658
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了肉芽肿性肌炎的特异性基因特征 | 首次系统定义了肉芽肿性肌炎的特异性转录组特征，发现CHIT1作为最显著上调基因与疾病严重程度相关 | 样本量相对有限（38例GM患者），需更大规模研究验证 | 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制 | 肌肉活检样本（包括GM患者、其他肌病患者和健康对照） | 数字病理学 | 肉芽肿性肌炎 | RNA测序，空间转录组学，免疫组织化学 | 支持向量机 | RNA测序数据，空间转录组数据，免疫组化图像 | 722例肌肉活检（含38例GM患者） | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4934 | 2025-10-06 |
Congestion Enriches Intra-hepatic Macrophages Through Reverse Zonation of CXCL9 in Liver Sinusoidal Endothelial Cells
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101475
PMID:39923846
|
研究论文 | 本研究揭示了肝脏充血通过肝窦内皮细胞中CXCL9的反向分区化富集肝内巨噬细胞的机制 | 首次发现肝窦内皮细胞中CXCL9的反向分区化现象及其在充血性肝病中调控巨噬细胞募集的新机制 | 研究样本量有限，且动物模型可能无法完全模拟人类疾病的所有特征 | 探究充血性肝病中肝窦免疫细胞空间分布变化及其在肝纤维化和门脉高压中的作用 | 充血性肝病患者组织样本、Fontan相关肝病患者组织样本、小鼠pIVCL模型 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 成像质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,RNA原位杂交 | NA | 图像,单细胞转录组数据 | 人类患者组织样本和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 4935 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals distinct metabolic "microniches" and close host-symbiont interactions in deep-sea chemosynthetic tubeworm
2024-07-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3053
PMID:39047091
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示深海化能合成管虫体内代谢微环境及其与内共生菌的相互作用机制 | 首次在深海化能合成生态系统中应用原位单细胞固定技术，发现管虫通过控制化学合成气体和代谢物可用性在共生器官中维持两种不同的代谢微环境 | 研究仅针对一种冷泉管虫物种，尚未验证在其他化能合成生态系统中的普适性 | 阐明深海管虫与内共生菌之间的分子相互作用机制 | 冷泉管虫及其硫氧化γ-变形菌内共生体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 冷泉管虫共生器官组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 深海原位单细胞固定技术 |
| 4936 | 2025-10-06 |
Macrophage Dysfunction in Respiratory Disease
2024, Results and problems in cell differentiation
DOI:10.1007/978-3-031-65944-7_9
PMID:39406908
|
综述 | 本文探讨肺巨噬细胞在呼吸系统疾病中的功能障碍及其机制 | 整合谱系追踪和单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞在肺部疾病中的代谢特征和线粒体活性变化 | 未涉及具体实验验证和临床干预研究 | 解析巨噬细胞功能障碍在呼吸系统疾病发病机制中的作用 | 肺巨噬细胞（包括肺泡巨噬细胞和组织驻留细胞） | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4937 | 2025-10-06 |
Amelioration of Liver Fibrosis via In Situ Hepatic Stellate Cell Conversion Through Co-Inhibition of TGF-β and GSK-3 Signalling
2025-Jul, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70187
PMID:40575954
|
研究论文 | 本研究评估了通过同时抑制TGF-β和GSK-3信号通路的小分子鸡尾酒疗法SBCH，在多种肝纤维化模型中改善纤维化并促进肝脏修复的效果 | 首次发现SBCH联合疗法不仅能抑制肝星状细胞活化，还能诱导活化的肝星状细胞转分化为肝细胞样细胞(ciHeps) | 研究仅在动物模型中进行，尚未进行临床试验验证 | 开发治疗肝纤维化和肝硬化的新型治疗策略 | 肝星状细胞(HSCs)和肝纤维化模型 | 肝脏疾病研究 | 肝纤维化、肝硬化 | 单细胞RNA测序、体内示踪、表型分析 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、组织学数据 | 三种肝纤维化模型：CCl4诱导、胆管结扎(BDL)和非酒精性脂肪性肝炎(NASH)伴二乙基亚硝胺(DEN)模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4938 | 2025-10-06 |
Oral immunotherapy directs systemic transcriptomic changes in children with hen's egg allergy
2025-Jun-22, Asian Pacific journal of allergy and immunology
IF:2.3Q3
DOI:10.12932/AP-011124-1965
PMID:40544372
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析鸡蛋过敏儿童口服免疫治疗期间的系统性转录组变化 | 首次在鸡蛋过敏儿童中应用单细胞RNA测序技术揭示口服免疫治疗引起的系统性免疫细胞转录组变化 | 样本量较小（16名儿童），仅分析了治疗前后的两个时间点 | 研究鸡蛋过敏儿童的系统性免疫表型及口服免疫治疗期间的转录组变化 | 3-12岁被诊断为鸡蛋过敏的儿童 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16名鸡蛋过敏儿童 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4939 | 2025-10-06 |
scRepertoire 2: Enhanced and efficient toolkit for single-cell immune profiling
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012760
PMID:40577285
|
研究论文 | 介绍scRepertoire 2工具包，这是一个用于分析和可视化单细胞免疫受体数据的R软件包的重大更新 | 引入克隆型追踪、受体库多样性指标和新可视化模块等增强功能，性能优化使速度提升85.1%，内存使用减少91.9% | NA | 开发高效的单细胞免疫分析工具，促进健康和疾病状态下的免疫动态研究 | 单细胞适应性免疫受体序列数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 免疫相关疾病 | 单细胞适应性免疫受体测序(scAIRR-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫受体测序 | NA | NA |
| 4940 | 2025-10-06 |
Viral tropism in plants, reproductive tissues, and seeds
2025-May-23, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04353-9
PMID:40404962
|
综述 | 本文系统阐述了植物病毒趋向性的分子与细胞决定因素及其在生殖组织与种子中的感染机制 | 整合超分辨率显微镜和单细胞组学技术揭示病毒-宿主互作新机制，提出植物病毒在靶向递送领域的应用潜力 | 未涉及具体作物品种的实证研究数据 | 解析植物病毒趋向性的分子机制及其生物技术应用 | 植物病毒在特定细胞类型、组织和宿主中的感染特性 | 植物病理学 | 植物病毒病 | 超分辨率显微镜, 单细胞转录组学, 蛋白质组学 | NA | 文献综述 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |