单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38610 篇文献，本页显示第 4921 - 4940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4921 | 2026-02-06 |
TMEM131-Mediated Soluble TRAIL Triggered Type II Alveolar Epithelial Cell Senescence in Radiation-Induced Lung Injury
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509973
PMID:41293955
|
研究论文 | 本研究揭示了TMEM131介导的可溶性TRAIL通过抑制线粒体自噬导致II型肺泡上皮细胞衰老，在辐射诱导的肺损伤发病机制中起关键作用 | 首次发现TMEM131介导TRAIL从内质网向高尔基体的运输过程，并阐明可溶性TRAIL通过死亡受体5激活mTOR通路抑制线粒体自噬的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证相对有限；TMEM131介导的运输机制在人体中的普适性需进一步验证 | 阐明辐射诱导肺损伤的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 辐射诱导肺损伤小鼠模型、II型肺泡上皮细胞、临床患者血浆样本 | 单细胞组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学, 免疫沉淀质谱 | 基因敲除小鼠模型 (Trail;Sftpc-Cre) | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 免疫荧光图像 | 未明确样本数量，包含小鼠模型和临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4922 | 2026-02-06 |
Retinoic Acid Reprograms Mast Cells Toward a Proinflammatory State to Enhance Antitumor Immunity
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509340
PMID:41309490
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了肥大细胞在肿瘤微环境中的异质性，并发现视黄酸信号可驱动肥大细胞向促炎表型极化，从而增强抗肿瘤免疫 | 首次系统性地描绘了十种癌症类型中肥大细胞的转录和空间异质性图谱，并鉴定出一个具有抗原呈递特征和免疫激活潜能的促炎性肥大细胞亚群，揭示了视黄酸-RARα-CIITA信号轴在肥大细胞重编程中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据，功能验证和机制细节仍需进一步实验确认；临床相关性分析为观察性结果，需前瞻性研究验证 | 探究肥大细胞在肿瘤微环境中的分子特征、功能多样性及其对抗肿瘤免疫的调控机制 | 十种人类癌症类型中的肥大细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据 | 十种癌症类型的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4923 | 2026-02-06 |
High-Dimensional Profiling of Circulating Dendritic Cells and Monocytes in Atopic Dermatitis Patients by Mass Cytometry
2026-Jan, Allergy, asthma & immunology research
DOI:10.4168/aair.2026.18.1.104
PMID:41345746
|
研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术分析了特应性皮炎患者外周血中树突状细胞和单核细胞的高维特征，揭示了cDC1频率降低和DC3特征增强的现象 | 首次利用质谱流式细胞术系统比较特应性皮炎患者与健康对照的循环树突状细胞和单核细胞亚群，并结合公共单细胞RNA测序数据和皮肤免疫荧光染色进行验证 | 样本量相对有限（48例患者和48例对照），且为横断面研究，无法确定因果关系 | 探究特应性皮炎中髓系细胞（特别是树突状细胞和单核细胞）在疾病发病机制中的作用 | 特应性皮炎患者和健康对照者的外周血单个核细胞，以及公共单细胞RNA测序数据和皮肤组织样本 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 细胞计数数据，基因表达数据，图像数据 | 48例特应性皮炎患者和48例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4924 | 2026-02-06 |
Targeting SH3GL1 for prognosis and immune response in breast cancer
2026-Jan, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2025.101377
PMID:41631242
|
研究论文 | 本研究识别了铜死亡相关基因SH3GL1作为乳腺癌进展和免疫调控的关键调节因子 | 首次将SH3GL1与乳腺癌的铜死亡过程、免疫微环境及免疫治疗反应联系起来，揭示了其在预后和免疫调节中的双重作用 | 研究主要基于公共数据集和体外实验，缺乏大规模临床队列验证和体内机制研究 | 探索SH3GL1在乳腺癌中的预后价值和免疫调控功能 | 乳腺癌肿瘤组织和细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 基因表达谱分析、meta分析、单细胞RNA测序、功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4925 | 2026-02-06 |
Advances in the diagnosis and treatment of oligoasthenozoospermia based on epigenetic regulation
2026 Jan-Dec, Therapeutic advances in urology
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/17562872251414924
PMID:41631254
|
综述 | 本文综述了基于表观遗传调控的少弱精子症诊断与治疗进展 | 整合基因组学、转录组学和单细胞研究，阐明DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA在少弱精子症中的作用，并评估单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序及整合多组学方法在解析细胞类型和阶段特异性调控中的应用 | NA | 提高对男性生殖细胞发育的理解，并改善生殖健康 | 少弱精子症患者及其表观遗传调控机制 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 整合多组学 | NA | 基因组, 转录组, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4926 | 2026-02-06 |
Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for the treatment of chronic active Epstein-Barr virus infection
2026 Jan-Dec, Cell transplantation
IF:3.2Q2
DOI:10.1177/09636897251414206
PMID:41618712
|
综述 | 本文综述了异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）治疗慢性活动性EB病毒感染（CAEBV）的现状、理论基础、临床挑战及未来研究方向 | 整合了最新的单细胞测序和嵌合体研究证据，明确了EBV感染的造血干细胞是CAEBV的“种子”细胞，并基于此系统论证了allo-HSCT作为唯一可能根治性策略的理论依据，同时前瞻性地提出了“移植前病毒载量降低-移植后复发预防”的综合策略新思路 | 本文是一篇综述，未报告原始临床研究数据，其结论和建议主要基于对现有文献的总结和分析 | 探讨异基因造血干细胞移植作为慢性活动性EB病毒感染潜在根治性治疗策略的有效性、挑战及未来优化方向 | 慢性活动性EB病毒感染（CAEBV）患者 | NA | 慢性活动性EB病毒感染 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4927 | 2026-02-06 |
VST-DAVis: an R Shiny application and web-browser for spatial transcriptomics data analysis and visualization
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag007
PMID:41640624
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为VST-DAVis的交互式R Shiny应用程序和网络浏览器，专为分析10x Genomics Visium HD平台生成的空间转录组学数据而设计 | 开发了一个用户友好的交互式工具，使无编程背景的研究者也能通过图形界面进行端到端的空间转录组学分析，并整合了多种流行的R分析包 | NA | 为空间转录组学数据分析提供一个直观、易用的分析平台 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10x Genomics Visium HD平台 |
| 4928 | 2026-02-06 |
Single-cell RNA sequencing revealed cell heterogeneity in sagittal suture mesenchyme
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1725375
PMID:41640972
|
研究论文 | 本研究通过整合10x Genomics和Smart-seq3单细胞转录组测序技术，首次识别了矢状缝间充质中的增殖性祖细胞群，揭示了其在颅骨快速发育中的关键作用 | 首次在发育中的颅缝生态位中识别出具有瞬时扩增细胞特征的增殖性祖细胞群，并阐明了SuSCs和TACs中的关键调控基因和信号网络 | NA | 探索颅缝间充质中细胞异质性及其在颅骨发育和稳态维持中的作用机制 | 矢状缝间充质细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷检测, 原位杂交, 谱系追踪 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Smart-seq3 | 10x Genomics单细胞转录组测序与Smart-seq3技术整合 |
| 4929 | 2026-02-06 |
TIMELESS Promotes LUAD Growth via Suppressing Transferrin-Mediated Ferroptosis and Reprograms the Tumor Microenvironment against Anti-PD-1 Immunotherapy
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0009
PMID:41641368
|
研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白TIMELESS通过招募CNOT3加速转铁蛋白mRNA降解，从而抑制铁死亡并促进肺腺癌生长，并重塑肿瘤微环境以抵抗抗PD-1免疫治疗的分子机制 | 首次发现TIMELESS通过招募CNOT3复合物降解转铁蛋白mRNA来调控铁死亡，并阐明了其在肺腺癌生长和抗PD-1免疫治疗抵抗中的双重作用 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床样本验证相对有限；TIMELESS/TF轴在其他癌症类型中的普适性未探讨 | 阐明高表达的RNA结合蛋白TIMELESS在肺腺癌进展中的分子网络和机制作用 | 肺腺癌细胞、小鼠原位肺癌模型、临床组织微阵列样本 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | PAR-CLIP测序, RNA测序, 免疫沉淀-质谱, GST pull-down, 免疫荧光-荧光原位杂交, RNA免疫沉淀, poly(A)尾分析, RNA稳定性检测, 流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质互作数据, 组织图像数据 | 来自TCGA-LUAD、GEO和单细胞RNA测序数据集的多个数据集，以及组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4930 | 2026-02-06 |
Research Progress of Interstitial Lung Disease Based on Single-Cell Sequencing Technology
2026, Canadian respiratory journal
IF:2.1Q3
DOI:10.1155/carj/8863968
PMID:41641446
|
综述 | 本文总结了基于单细胞测序技术在间质性肺病（ILD）研究中的最新进展，重点聚焦于特发性肺纤维化、尘肺病和结缔组织病相关ILD | 利用单细胞测序技术为揭示ILD的复杂发病机制提供了新视角，克服了传统研究方法的局限 | NA | 总结单细胞测序在ILD研究中的应用进展并展望未来研究方向 | 间质性肺病（ILD），包括特发性肺纤维化、尘肺病和结缔组织病相关ILD | 数字病理学 | 肺病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4931 | 2026-02-06 |
Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization and Colocalization Analyses Uncover Cell-Specific Mechanisms in Epigenetic Age Acceleration
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503032R
PMID:41378907
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞表达数量性状位点数据，结合孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析，揭示了免疫细胞特异性基因表达对四种主要表观遗传时钟的因果影响 | 首次在单细胞分辨率下，结合孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析，系统性地识别了影响表观遗传年龄加速的细胞特异性因果基因 | 研究主要聚焦于14种免疫细胞类型，可能未涵盖其他细胞类型对表观遗传年龄的影响 | 阐明表观遗传年龄加速背后的细胞特异性基因调控机制 | 14种免疫细胞类型中的基因表达与四种表观遗传时钟（IEAA, HannumAge, GrimAge, PhenoAge）的关联 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞表达数量性状位点分析, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位, 表型全基因组关联研究 | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位模型 | 单细胞RNA-seq数据, 表观遗传时钟数据, 全基因组关联研究数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4932 | 2026-02-06 |
MMP14-Dependent Activation of TGF-β Signaling Enhances Malignancies via Promoting Necroptosis in Glioblastoma
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501932R
PMID:41384860
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了MMP14通过激活TGF-β信号通路促进胶质母细胞瘤坏死性凋亡和恶性行为的机制 | 首次将MMP14鉴定为胶质母细胞瘤中与坏死性凋亡相关的枢纽基因，并阐明了其通过TGF-β-SMAD2-RIP1信号轴调控坏死性凋亡异质性的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内动物模型的直接验证 | 探究坏死性凋亡在胶质母细胞瘤恶性进展中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞及相关的分子信号通路 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 加权基因共表达网络分析，单细胞分析，空间转录组学 | NA | 转录组数据，单细胞数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4933 | 2026-02-06 |
Proton-Pump Inhibitor Use and Gastrointestinal Disease Risk: A Mendelian Randomization Study of Omics and Pharmacological Pathways
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503152R
PMID:41420535
|
研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化和多组学方法，系统评估了质子泵抑制剂（PPI）相关基因与24种胃肠道疾病风险的关联 | 首次整合PPI的直接作用靶点基因及其药代动力学相关基因，结合多祖先队列、单细胞测序和荟萃分析，揭示了PPI药理作用的组织特异性及其在胃肠道疾病中的双重（治疗/致癌）潜力 | 需要进一步研究PPI与良性胃肠道疾病的关系，且部分发现需在更多人群中验证 | 阐明质子泵抑制剂（PPI）使用与胃肠道疾病风险的潜在因果关系及分子机制 | 与PPI直接靶点、代谢和转运相关的基因，以及24种胃肠道疾病 | 生物信息学与多组学整合分析 | 胃肠道疾病（包括肝癌、胰腺癌、食管癌、结直肠癌、急慢性胰腺炎等） | 孟德尔随机化（两样本）、共定位分析、SMR分析、荟萃分析、单细胞测序、组织表达谱分析 | 孟德尔随机化模型、荟萃分析模型 | 基因组数据、表达数量性状位点（eQTL）数据、单细胞RNA测序数据、疾病关联统计数据 | 多祖先队列（UK Biobank 和 FinnGen） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4934 | 2026-02-06 |
Single-Cell Multi-Omics Reveals B2M-Mediated Myeloid Reprogramming and Constructs a Predictive Model for Early Hepatocellular Carcinoma Recurrence
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503144R
PMID:41427790
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了B2M介导的髓系重编程，并构建了早期肝细胞癌复发的预测模型 | 首次在单细胞分辨率下整合多组学数据探索早期HCC复发的分子机制，并识别出B2M相关的髓系细胞重编程作为关键驱动因素 | 预测模型的AUC仅大于0.65，性能中等，且研究样本量可能有限 | 探索早期肝细胞癌复发的分子机制并开发预测工具 | 肝细胞癌患者肿瘤组织及免疫微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 转录组学 | LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 转录组数据, 临床特征数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4935 | 2026-02-06 |
Pan cohort immune biomarker of CD8 lymphocyte activation enabling HGSOC outcome prediction and treatment response
2025-Dec-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04363-5
PMID:41474480
|
研究论文 | 本研究开发了一个与CD8⁺ T细胞激活相关的免疫预后特征（CIPS），用于预测晚期高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者的生存结局和治疗反应 | 通过整合机器学习方法，从多队列数据中识别出10个基因的CD8⁺ T细胞激活特征，该特征在预测生存和免疫治疗反应方面优于现有模型 | 研究主要基于转录组数据，未涉及蛋白质水平验证；样本来源为回顾性队列，需要前瞻性研究进一步验证 | 开发一个稳健的与CD8⁺ T细胞激活相关的生物标志物，以改善晚期HGSOC的预后预测和临床管理 | 晚期高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单样本基因集富集分析，加权基因共表达网络分析，单细胞RNA-seq分析 | 机器学习整合方法 | 转录组数据，临床数据 | 874名晚期HGSOC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4936 | 2026-02-06 |
Integrating multi-omics data and machine learning to identify endocrine disrupting chemicals targeting key ccRCC-related genes
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04138-y
PMID:41467947
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，识别了靶向关键ccRCC相关基因的内分泌干扰化学物及其相关基因 | 首次整合多组学数据与机器学习，系统识别与ccRCC相关的EDCs及其靶基因，并揭示了它们在肿瘤微环境中的相互作用 | 研究基于计算模型和现有数据集，需要实验验证EDCs与ccRCC之间的直接因果关系 | 识别与ccRCC发病机制相关的内分泌干扰化学物及其靶基因 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及相关内分泌干扰化学物 | 机器学习 | 肾细胞癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 机器学习算法（共评估101种） | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4937 | 2026-02-06 |
Machine learning-enabled spatial multi-omics uncovers lactate-driven targets and tumor microenvironmental reprogramming in cancer
2025-Dec-30, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-025-02286-7
PMID:41469480
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、空间转录组学、空间代谢组学、免疫荧光及TCGA生存数据，结合机器学习模型，揭示了乳酸在肺腺癌微环境中的空间分布、细胞类型特异性效应及其对血管生成、免疫抑制和预后分层的调控作用 | 首次将空间代谢组学与单细胞/空间转录组学、机器学习模型整合，系统解析了乳酸在肿瘤微环境中的空间分布模式及其细胞类型特异性调控网络，并建立了乳酸驱动型内皮细胞/成纤维细胞程序与临床预后的强关联 | 研究主要聚焦于肺腺癌，结论在其他癌种中的普适性需进一步验证；空间代谢组学的分辨率仍有提升空间；机器学习模型的生物学可解释性可进一步深化 | 揭示乳酸在肿瘤代谢重编程中的空间分布规律、细胞类型特异性效应及其对肿瘤微环境重塑和临床预后的影响机制 | 肺腺癌（LUAD）组织样本及其单细胞、空间多组学数据，TCGA临床生存数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、空间代谢组学、免疫荧光、生存分析 | 随机森林、弹性网络回归、SVM、ANN、决策树 | 转录组数据、代谢组数据、空间成像数据、临床生存数据 | 未明确具体样本数量（涉及TCGA队列及空间多组学样本） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 4938 | 2026-02-06 |
Directed and efficient generation of calretinin interneurons from human pluripotent stem cells
2025-Aug-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04603-z
PMID:40867008
|
研究论文 | 本研究建立了一种从人多能干细胞高效生成钙视网膜蛋白中间神经元的方法 | 开发了一种高效（约80%产率）的定向分化方案，首次实现了从人多能干细胞大规模生成钙视网膜蛋白中间神经元 | 研究主要基于体外分化和小鼠移植模型，尚未在更复杂的人体环境或疾病模型中验证其长期功能和整合效果 | 建立高效生成钙视网膜蛋白中间神经元的方案，以促进对其发育和功能的研究，并为再生医学、疾病建模和药物筛选提供工具 | 人多能干细胞（hPSCs）及其分化的神经上皮干细胞（NESCs）和钙视网膜蛋白中间神经元 | 再生医学与干细胞生物学 | 精神分裂症、自闭症、癫痫 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞移植 | NA | 基因表达数据（转录组）、电生理数据 | 未明确具体样本数量，涉及人多能干细胞来源的细胞群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4939 | 2026-02-06 |
Integration of phospho-signaling and transcriptomics in single cells reveals distinct Th17 cell fates
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116006
PMID:40674215
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Vivo-seq的创新平台，该平台整合了单细胞RNA测序和细胞内转录组及表位测序，以同时捕获单细胞中的转录和磷酸化信号状态 | 开发了Vivo-seq平台，首次在单细胞水平上同时捕获转录和磷酸化信号信息，揭示了Th17细胞分化中的关键信号通路和功能可塑性 | 未明确提及样本量或实验重复次数，可能限制统计效力；技术依赖于特定固定剂，可能影响某些生物分子的检测 | 研究Th17细胞分化过程中的信号网络和细胞状态，以理解其功能可塑性 | T辅助17（Th17）细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），细胞内转录组和表位测序 | NA | 转录组数据，磷酸化信号数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | Vivo-seq | Vivo-seq平台，使用深共熔溶剂固定细胞，整合scRNA-seq和细胞内索引测序 |
| 4940 | 2026-02-06 |
A multi-omics approach combining causal inference and in vivo validation identifies key protein drivers of alcohol-associated liver disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1714502
PMID:41497980
|
研究论文 | 本研究通过整合人类遗传学与多组学数据，结合因果推断和体内验证，识别并验证了酒精相关性肝病（ALD）的四个关键因果蛋白驱动因子 | 首次系统性地将孟德尔随机化（MR）因果推断框架与单细胞转录组学和体内小鼠模型验证相结合，以区分ALD的关联性生物标志物与因果驱动因子，并揭示了由促炎性髓系细胞与稳态肝细胞功能平衡调控的新型致病轴 | 研究主要基于欧洲血统人群的遗传和蛋白质组数据，其发现可能无法直接推广到其他人群；体内验证仅在小鼠模型中进行，需要在人类组织或临床试验中进一步确认 | 旨在揭示酒精相关性肝病（ALD）的分子致病机制，并识别潜在的治疗靶点 | 人类血浆蛋白质组数据、ALD全基因组关联研究（GWAS）数据、小鼠ALD模型的肝组织 | 生物信息学，多组学整合分析 | 酒精相关性肝病 | 孟德尔随机化（MR），单细胞RNA测序（scRNA-seq），功能富集分析，汇总数据孟德尔随机化（SMR） | 因果推断模型（两样本MR），小鼠慢性加暴饮乙醇喂养模型 | 蛋白质组数据，遗传关联数据，单细胞转录组数据 | 大规模血浆蛋白质组和ALD GWAS数据（具体样本数未在摘要中提供），以及小鼠模型数据 | NA | 血浆蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |