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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4921 - 4940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 4921 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics at the brain-electrode interface in rat motor cortex and the relationship to recording quality
2024-07-31, Journal of neural engineering
IF:3.7Q2
DOI:10.1088/1741-2552/ad5936
PMID:38885679
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析大鼠运动皮层中电极植入引起的基因表达变化及其与记录质量的关系 | 首次将空间转录组学应用于脑电极界面研究，识别出与记录质量相关的潜在生物标志物基因 | 研究仅在大鼠模型中进行，样本数量有限，需要进一步验证 | 探究脑部电极植入引起的组织反应及其对设备功能的影响 | 大鼠运动皮层中植入的密歇根式微电极阵列 | 空间转录组学 | 神经植入物相关组织反应 | 空间转录组学，免疫标记，电生理记录 | 回归分析 | 基因表达数据，电生理信号，免疫组织化学图像 | 大鼠脑组织切片，植入后24小时、1周和6周时间点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4922 | 2025-10-06 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics reveals tumor heterogeneity and intercellular networks in colorectal cancer
2024-05-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06598-6
PMID:38729966
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学技术，揭示了结直肠癌肿瘤微环境中的细胞异质性和细胞间相互作用网络 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学技术结合应用于结直肠癌研究，识别了恶性细胞亚型并发现了肿瘤-基质区域间的关键配体-受体相互作用 | 样本量相对较小（仅3对结直肠癌肿瘤-正常-血液样本），研究结果需要在更大队列中验证 | 探索结直肠癌肿瘤微环境中的细胞异质性和细胞间通讯机制 | 结直肠癌患者的肿瘤组织、正常组织和血液样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 3对结直肠癌肿瘤-正常-血液样本，共41,700个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4923 | 2025-10-06 |
Modeling acute myocardial infarction and cardiac fibrosis using human induced pluripotent stem cell-derived multi-cellular heart organoids
2024-05-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06703-9
PMID:38693114
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研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞开发了包含多种细胞类型的心脏类器官，用于模拟急性心肌梗死和心脏纤维化 | 首次开发了包含心肌细胞、成纤维细胞和内皮细胞的自组织心脏类器官，能够准确模拟成人心脏疾病状态 | 类器官模型仍无法完全复制体内心脏的复杂生理环境 | 建立临床相关的体外心脏疾病模型以替代动物实验 | 人诱导多能干细胞衍生的心脏类器官 | 干细胞与组织工程 | 心血管疾病 | 免疫组织化学、流式细胞术、q-PCR、单细胞RNA测序 | 心脏类器官模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、功能测定数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4924 | 2025-10-06 |
MitoTracer facilitates the identification of informative mitochondrial mutations for precise lineage reconstruction
2023-Nov-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.22.568285
PMID:38045409
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研究论文 | 开发了一种名为MitoTracer的开源计算算法，用于从单细胞测序数据中准确识别信息性线粒体突变并进行谱系重建 | 首次提供自动识别信息性线粒体突变的计算工具，在灵敏度和特异性方面优于现有方法 | NA | 开发用于单细胞谱系重建的计算工具 | 线粒体突变、单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 计算算法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 4925 | 2025-10-06 |
Single-Nucleus Transcriptome Profiling of Dorsolateral Prefrontal Cortex: Mechanistic Roles for Neuronal Gene Expression, Including the 17q21.31 Locus, in PTSD Stress Response
2023-10-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220478
PMID:37491937
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研究论文 | 首次使用单核RNA测序技术研究创伤后应激障碍和重度抑郁症患者背外侧前额叶皮层的细胞类型特异性转录组机制 | 首次在PTSD中进行死后脑组织的单核RNA测序研究，揭示了细胞类型特异性机制，特别是在兴奋性和抑制性神经元中发现的17q21.31基因座相关差异表达基因 | 样本量相对有限（11例PTSD，10例MDD，11例对照），且为死后脑组织研究 | 阐明PTSD和MDD在背外侧前额叶皮层的细胞类型特异性转录组病理机制 | 人类死后背外侧前额叶皮层样本，包括PTSD患者、MDD患者和对照受试者 | 单细胞转录组学 | 创伤后应激障碍,重度抑郁症 | 单核RNA测序,诱导多能干细胞分化 | 差异基因表达分析 | 单核RNA测序数据 | 32个DLPFC样本（约415K细胞核），复制样本15个DLPFC样本（约160K细胞核） | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 4926 | 2025-10-06 |
PIK3R1 and G0S2 are human placenta-specific imprinted genes associated with germline-inherited maternal DNA methylation
2025-Dec, Epigenetics
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/15592294.2025.2523191
PMID:40568952
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研究论文 | 本研究通过全基因组筛选发现并表征了两个人类胎盘特异性印记基因PIK3R1和G0S2 | 首次识别出胎盘特异性印记基因，这些基因与仅在胚胎植入前和胚外谱系中存在的瞬时种系DMRs相关 | 未发现这些基因在宫内生长受限或先兆子痫的胎盘样本中存在甲基化和表达差异 | 扩展胎盘特异性印记基因列表并研究其特性 | 人类胎盘组织、配子、囊胚和各种体细胞组织 | 表观遗传学 | 妊娠并发症 | 全基因组甲基化测序、单细胞RNA测序 | NA | 甲基化数据、RNA-seq数据 | 多种组织类型样本（包括配子、囊胚、胎盘等） | NA | 单细胞RNA-seq、全基因组甲基化分析 | NA | NA |
| 4927 | 2025-10-06 |
Development and Validation of a Flow-Dependent Endothelialized 3D Model of Intracranial Atherosclerotic Disease
2025-Aug, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01310-4
PMID:39537986
|
研究论文 | 开发并验证了一种基于患者特异性成像的流动依赖性内皮化3D颅内动脉粥样硬化疾病模型 | 首次创建了基于患者特异性神经影像的可内皮化并承受流动力的可重复ICAD模型，结合单细胞RNA测序分析流动依赖性内皮基因表达 | 依赖于神经影像数据的质量，模型复杂度可能限制高通量应用 | 开发用于研究颅内动脉粥样硬化疾病机制和治疗方法的实验模型 | 大脑中动脉的3D模型和人类内皮细胞 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，计算流体动力学，共聚焦显微镜 | 3D生物模型 | 图像，基因表达数据 | 使用SAMMPRIS临床试验的影像数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4928 | 2025-10-06 |
Role of stem-like cells in chemotherapy resistance and relapse in pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Jun-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61222-1
PMID:40579412
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究儿童T细胞急性淋巴细胞白血病中干细胞样细胞在化疗耐药和复发中的作用 | 首次在T-ALL中通过纵向单细胞研究鉴定出具有干细胞特征的耐药细胞亚群 | 样本量相对有限（13对匹配样本+5例非复发患者） | 探究T-ALL复发和化疗耐药的机制 | 儿童T细胞急性淋巴细胞白血病患者样本 | 单细胞测序分析 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例样本（13对匹配诊断-复发样本+5例非复发诊断样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4929 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial analyses of the GDF family in tumors, with a focus on the prognostic and biological role of GDF15 in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-27, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01431-9
PMID:40579699
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析GDF家族在肿瘤中的作用，重点关注GDF15在肝细胞癌中的预后和生物学功能 | 首次基于单细胞和空间转录组对GDF亚家族进行系统性泛癌分析，揭示了GDF15在肝细胞癌肿瘤微环境中的新作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于肝细胞癌细胞系 | 系统分析GDF亚家族在多种癌症中的表达特征及其临床意义 | 33种癌症类型，重点关注肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 功能获得和缺失实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 细胞系实验数据 | 33种癌症类型的数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 4930 | 2025-10-06 |
ETMR stem-like state and chemo-resistance are supported by perivascular cells at single-cell resolution
2025-Jun-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60442-9
PMID:40562749
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胚胎性多层菊形团肿瘤的异质性及肿瘤微环境中周细胞对肿瘤干细胞状态和化疗耐药性的支持作用 | 首次在单细胞水平系统揭示ETMR肿瘤微环境中PDGFRβ周细胞通过细胞外基质相互作用支持肿瘤干细胞信号传导和化疗耐药性 | 研究主要基于模型系统，需要在更多临床样本中验证 | 探究ETMR肿瘤异质性及肿瘤微环境中的细胞通讯机制 | 人类和小鼠原代ETMR肿瘤细胞、体外培养细胞、3D前脑类器官ETMR模型 | 单细胞生物学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 空间转录组学 | 3D类器官模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 约250,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4931 | 2025-10-06 |
Reduction of NFX1-123 and HPV 16 E6 and E7 Decreased Telomerase and CENP-F in Cervical Cancer Cell Lines
2025-Jun-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17122044
PMID:40563693
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研究论文 | 本研究通过敲除NFX1-123和HPV 16 E6/E7，探讨了它们在宫颈癌细胞系中对端粒酶和CENP-F的调控作用 | 首次在HPV相关癌症中研究NFX1-123对端粒酶活性的调控作用，并发现其与HPV 16致癌基因在调控hTERT、端粒酶和CENP-F中的共同作用 | 研究仅限于宫颈癌细胞系，需要进一步在更多细胞模型和体内实验中验证 | 研究NFX1-123在HPV相关癌症中对端粒酶活性的调控机制 | 宫颈癌细胞系（CaSki和SiHa细胞）以及TCGA数据库中的宫颈癌和HPV阳性头颈癌原发肿瘤数据 | 癌症生物学 | 宫颈癌 | 基因敲除、单细胞RNA测序、基因敲低 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据、临床数据库数据 | 宫颈癌细胞系和TCGA数据库中的原发肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4932 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Reveals Regional and Temporal Dynamics of Gene Expression in the Mouse Brain Across Development and Aging
2025-Jun-18, Biology
DOI:10.3390/biology14060717
PMID:40563967
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析小鼠大脑在发育和衰老过程中的区域特异性基因表达动态 | 首次通过空间转录组学直接比较大脑发育与衰老的分子机制，建立了新颖的空间转录组参考数据集 | 研究仅针对三个特定时间点，可能无法完全捕捉连续的变化过程；研究局限于小鼠模型 | 探究大脑在发育和衰老过程中区域特异性基因表达的动态变化 | 小鼠大脑在不同发育阶段（P21、3月龄、28月龄）的基因表达 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 三个关键时间点的小鼠大脑样本（P21、3月龄、28月龄） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4933 | 2025-10-06 |
Multi-omics analyses of the heterogenous immune microenvironment in triple-negative breast cancer implicate UQCRFS1 potentiates tumor progression
2025-Jun-16, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00672-1
PMID:40524231
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研究论文 | 通过多组学分析揭示三阴性乳腺癌异质性免疫微环境，发现UQCRFS1促进肿瘤进展 | 首次通过单细胞RNA测序系统分析TNBC免疫微环境异质性，建立恶性细胞指数模型并验证UQCRFS1的促癌功能 | 样本量较小（仅9例初治TNBC患者），需更大队列验证 | 解析三阴性乳腺癌免疫微环境异质性及其与肿瘤进展的关系 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 蛋白质组, qRT-PCR, 蛋白质印迹 | LASSO-Cox回归, CellChat算法, 伪时序分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 9例初治三阴性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 4934 | 2025-10-06 |
Next generation genetic screens in kinetoplastids
2025-Jun-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf515
PMID:40530689
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综述 | 本文综述了动质体寄生虫中遗传筛选技术的发展与应用 | 探讨了将基于图像的筛选和单细胞测序技术与遗传筛选相结合的新方法 | NA | 系统理解基因组功能元件及其扰动对细胞功能的影响 | 动质体寄生虫的编码和非编码基因组区域 | 基因组学 | 寄生虫病 | 遗传筛选, CRISPR-Cas技术, 单细胞测序, 图像分析 | NA | 基因组数据, 图像数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4935 | 2025-10-06 |
Macrophage polarization, inflammatory monocytes, and impaired MDSCs are associated with murine and human immune aplastic anemia
2025-Jun-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf073
PMID:40411822
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型和人类样本探讨骨髓源性细胞在免疫性再生障碍性贫血发病机制中的作用 | 首次揭示CSF-1R抑制会加剧骨髓衰竭并促进M1巨噬细胞极化，同时发现JAK抑制剂可缓解疾病进程 | 研究样本量有限，人类样本仅针对严重AA患者 | 探索骨髓衰竭疾病中髓系细胞的免疫病理机制 | 小鼠骨髓衰竭模型和人类再生障碍性贫血患者样本 | 免疫学 | 再生障碍性贫血 | 流式细胞术, 细胞因子分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞群体数据 | CByB6F1小鼠和严重AA患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4936 | 2025-10-06 |
Plin2 Coordinates Immune and Metabolic Reprogramming in Lacrimal Gland Aging
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.79
PMID:40569117
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和单细胞测序技术，揭示了Plin2在泪腺衰老过程中协调免疫和代谢重编程的核心调控作用 | 首次发现Plin2作为泪腺衰老的核心枢纽基因，完美区分年轻与衰老状态(AUC=1.00)，并阐明其在免疫-代谢轴中的调控机制 | 研究仅限于C57BL/6小鼠模型，尚未在人类样本中验证；样本数量未明确说明 | 鉴定泪腺衰老的核心分子调控因子，阐明其在免疫失衡和代谢功能障碍中的作用 | 年轻和年老C57BL/6小鼠的泪腺组织 | 生物信息学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | LASSO回归, 支持向量机-递归特征消除 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4937 | 2025-10-06 |
ScInfeR: an efficient method for annotating cell types and sub-types in single-cell RNA-seq, ATAC-seq, and spatial omics
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf253
PMID:40471991
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研究论文 | 提出一种基于图结构的细胞类型注释方法ScInfeR，能够高效注释单细胞RNA测序、ATAC测序和空间组学数据中的细胞类型和亚型 | 结合scRNA-seq参考数据和标记基因集，采用分层框架和图神经网络消息传递机制，支持加权正负标记基因，并开发了包含329种细胞类型参考数据的交互式数据库 | NA | 开发高效的细胞类型注释方法，解决单细胞和空间组学数据分析中的细胞类型识别难题 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学数据集中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，空间转录组学 | 图神经网络 | 基因表达数据，染色质可及性数据，空间坐标信息 | 在100多个细胞类型预测任务中评估，包含28种组织类型的人类和植物数据 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 4938 | 2025-10-06 |
The Dyson equalizer: adaptive noise stabilization for low-rank signal detection and recovery
2025-Mar, Information and inference : a journal of the IMA
DOI:10.1093/imaiai/iaae036
PMID:39830802
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研究论文 | 本文开发了一种自适应噪声稳定化方法，用于异方差噪声下的低秩信号检测与恢复 | 提出基于Dyson方程的自适应归一化程序，能够均衡数据矩阵行列间的平均噪声方差，支持广泛的噪声分布和信号结构 | NA | 解决异方差噪声环境下低秩信号的检测与恢复问题 | 含噪声数据矩阵中的低秩信号 | 机器学习 | NA | 随机矩阵理论 | Dyson均衡器 | 矩阵数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4939 | 2025-10-06 |
Fucosylated haptoglobin promotes inflammation via Mincle in sepsis: an observational study
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56524-3
PMID:39904983
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观察性研究 | 本研究揭示了败血症患者血浆中岩藻糖基化结合珠蛋白通过Mincle受体促进炎症反应的作用机制 | 首次发现败血症患者血浆中Hp在Asn207和Asn211位点的末端岩藻糖基化水平升高，并阐明其通过Mincle受体激活炎症反应的分子机制 | 观察性研究设计，无法确定因果关系；样本量未明确说明；动物模型结果需要进一步验证 | 探究岩藻糖基化结合珠蛋白在败血症炎症反应中的作用机制 | 败血症患者血浆样本、小鼠模型、巨噬样细胞群体 | 分子生物学 | 败血症 | 单细胞RNA测序，蛋白质纯化，细胞因子检测 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4940 | 2025-10-06 |
Identification of a distinctive gene signature in granulomatous myositis
2025-Jan-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.12.27.24319708
PMID:40568658
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了肉芽肿性肌炎的特异性基因特征 | 首次系统定义了肉芽肿性肌炎的特异性转录组特征，发现CHIT1作为最显著上调基因与疾病严重程度相关 | 样本量相对有限（38例GM患者），需更大规模研究验证 | 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制 | 肌肉活检样本（包括GM患者、其他肌病患者和健康对照） | 数字病理学 | 肉芽肿性肌炎 | RNA测序，空间转录组学，免疫组织化学 | 支持向量机 | RNA测序数据，空间转录组数据，免疫组化图像 | 722例肌肉活检（含38例GM患者） | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |